Result of FASTA (omim) for
pF1KA0599
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0599, 1340 aa
1>>>pF1KA0599 1340 - 1340 aa - 1340 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6204+/-0.000386; mu= -2.3784+/- 0.024
mean_var=265.0501+/-53.149, 0's: 0 Z-trim(121.5): 332 B-trim: 0 in 0/60
Lambda= 0.078779
statistics sampled from 37863 (38207) to 37863 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.448), width: 16
Scan time: 19.110
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016882640 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1371) 1151 145.2 3.1e-33
XP_016882639 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1374) 1128 142.6 1.9e-32
XP_005259220 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1386) 1128 142.6 1.9e-32
NP_073746 (OMIM: 611893,616763) pleckstrin homolog (1386) 1128 142.6 1.9e-32
XP_011525534 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1387) 1128 142.6 1.9e-32
XP_006723397 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1327) 1100 139.4 1.7e-31
XP_005263745 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 487 69.5 6.8e-11
XP_011509579 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 487 69.5 6.8e-11
XP_005263746 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 487 69.5 6.8e-11
XP_011509578 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 487 69.5 6.8e-11
XP_005263744 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 567) 487 69.5 7.8e-11
NP_127462 (OMIM: 605216) rho guanine nucleotide ex ( 670) 487 69.5 9e-11
NP_056135 (OMIM: 605216) rho guanine nucleotide ex ( 690) 487 69.5 9.2e-11
XP_011509576 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine (1870) 487 69.8 2.1e-10
XP_005263738 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine (1876) 487 69.8 2.1e-10
XP_016884869 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 305) 441 64.1 1.7e-09
NP_001166950 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 463) 445 64.7 1.8e-09
XP_016884868 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 344) 441 64.1 1.9e-09
XP_016884867 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 362) 441 64.2 2e-09
XP_016884866 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 365) 441 64.2 2e-09
XP_016884865 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 375) 441 64.2 2.1e-09
XP_016884864 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 385) 441 64.2 2.1e-09
XP_011529194 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 456) 441 64.2 2.4e-09
NP_001317424 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 495) 441 64.2 2.6e-09
XP_016884856 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 495) 441 64.2 2.6e-09
XP_005262308 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 495) 441 64.2 2.6e-09
XP_005262307 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 495) 441 64.2 2.6e-09
XP_016884857 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 495) 441 64.2 2.6e-09
NP_056000 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nucleo ( 516) 441 64.2 2.7e-09
XP_016884855 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 516) 441 64.2 2.7e-09
XP_016884854 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 516) 441 64.2 2.7e-09
XP_011529192 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 516) 441 64.2 2.7e-09
XP_016884852 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 521) 441 64.2 2.7e-09
XP_016884853 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 521) 441 64.2 2.7e-09
XP_005262306 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 523) 441 64.2 2.7e-09
XP_016865292 (OMIM: 601893,617061) PREDICTED: trip (2612) 456 66.3 3.2e-09
XP_016865291 (OMIM: 601893,617061) PREDICTED: trip (2880) 456 66.4 3.5e-09
XP_011512412 (OMIM: 601893,617061) PREDICTED: trip (3038) 456 66.4 3.7e-09
XP_011512411 (OMIM: 601893,617061) PREDICTED: trip (3048) 456 66.4 3.7e-09
XP_011512410 (OMIM: 601893,617061) PREDICTED: trip (3058) 456 66.4 3.7e-09
XP_011512409 (OMIM: 601893,617061) PREDICTED: trip (3076) 456 66.4 3.7e-09
XP_016865290 (OMIM: 601893,617061) PREDICTED: trip (3093) 456 66.4 3.7e-09
NP_009049 (OMIM: 601893,617061) triple functional (3097) 456 66.4 3.7e-09
NP_001166951 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 414) 431 63.1 4.9e-09
XP_016884862 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 414) 431 63.1 4.9e-09
NP_001273724 (OMIM: 613324) spermatogenesis-associ ( 574) 434 63.5 5.1e-09
NP_001273723 (OMIM: 613324) spermatogenesis-associ ( 596) 434 63.5 5.3e-09
NP_694568 (OMIM: 613324) spermatogenesis-associate ( 652) 434 63.5 5.7e-09
NP_001273722 (OMIM: 613324) spermatogenesis-associ ( 512) 425 62.4 9.5e-09
NP_001159743 (OMIM: 613324) spermatogenesis-associ (1277) 434 63.7 1e-08
>>XP_016882640 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: pleckstr (1371 aa)
initn: 1133 init1: 441 opt: 1151 Z-score: 717.6 bits: 145.2 E(85289): 3.1e-33
Smith-Waterman score: 1304; 29.3% identity (53.5% similar) in 1341 aa overlap (27-1230:29-1332)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHL
:. :..:.: :.. . :.:: :
XP_016 MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTA--APAAPTMASPRGSGSSTSLST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KA0 ----------PNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMY
:. ..: . :: .. .. :. . : : ::.:::::::: :
XP_016 VGSEGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 VQDLRSIVEDYLLKIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVA
:.:::::::::: ..: : :. :::..::.:::.:: ..:.::.::.. .:. ..:
XP_016 VRDLRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLEN-SSSAGGIA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 SCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKP
:::.::..::::: :: :::.:.: : : . : ....:: :.::::: :.::::
XP_016 ECFVQRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VQRILKYHLLLQEIAKHFDEEED--GFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEI
:::::::::::::..::. : : :.::.:: .:: ::::::::::..:::.::::.
XP_016 VQRILKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KA0 QSLLINWKGPDLTTYGELVLEGTFRVH-----RVRN-ERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVY
: : .: ::.:...:::::::.:: :.:. :: .:::.. ::..:.:: ...:
XP_016 QRRLGGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 KGNIPCSSLMLIESTRDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHA
::.: : .: . :: :: : : :. :... .:::. :::: : : ..::..::: :
XP_016 KGHIFCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSP------ERLKKAWSS-QDEVSTNVRQGRRQSEPTK
.:: :::...:: : .:.: : : .: . . . . :::..::.:
XP_016 SIPAKAKQVLLE------NSLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTEPVK
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 HLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLD-FGQPSRTRGLQPEA-EGATQEEEEEEEEVVEEE
.. ..:. :.::::: : : .:: . . :: : : . . ::
XP_016 DPYVMFPQNAKP-GFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGPPTLDPSGTSITEE
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550
pF1KA0 EEEEEEEQAFQ---VSLEDLTGHEGNEKGAGPEP-------PG--SEEEEEEQEESLAVA
: ...... : .:. :. . : :. : :::::.::.: .
XP_016 ILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGDSETLTFQALPSRDSSEEEEEEEEGLEMD
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 EQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSRSSRR---PSG-RSPTSTE
:. . : : .:. . : . : . : . . : : : : :. ..
XP_016 ER----GPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRCEIPEGSRLPSLSD
600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 KRMSFE--SISSLPEVEPDPEAGSEQEVF--SAVEGPSAEETPSDTESPEVLETQLDAHQ
:: . ..: : : .: . : ..:: : . . . :.. ..
XP_016 ISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPATRRELFS---GSNP
650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 GLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPPSVLDQASVIAERF
: :: : : :: :.:: .. . .:... . . . .: :
XP_016 GKLGEPPSGG-------------KAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQHQGFPDE--LAFRS
710 720 730 740
740 750 760 770 780
pF1KA0 VSSF-SRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHGSATDSLSCQLSPE
: . : ... : . :: : :. ..:.. . :: :. : . : : .:.
XP_016 CSEIRSAWQALEQGQLARPGFPEPLLILEDSDLGGDSGSGKAGAPSSERTASRVRELARL
750 760 770 780 790 800
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VDISVGVATEDSPSVNGMEPPS-PGCPVEPDRSSCKKKESA----LSTRDRLLLDKIKSY
. . . ... : : ..:. : : .:.: : . ..:. ..
XP_016 YSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLPAFGHVLVCELAFP
810 820 830 840 850 860
850 860 870 880 890
pF1KA0 YENAEHH-DAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSIS-RFNSLPRPDPEPV--------PPVGS
:.. : .: . .. .: .. . . ..::. : . : :.
XP_016 LTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGIHVSAATLLPEQGG
870 880 890 900 910 920
900 910 920 930 940
pF1KA0 KRQVGSRPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDA---EFR-P-SSEIVKIWEGMESSGGSP
.:.: . :.. : . :: . .:: :.. : .. . . : . :
XP_016 SRHVQA-PAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLPEHRSHMVIPAPST
930 940 950 960 970 980
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 GKGPGQGQANGFDLHEPLFILEEHELGA-ITEESATASPESSSPTEGRSPAHL-------
. : ::. :.: : .:. . .: .: :.. . ...::...
XP_016 AFCPEQGHCA--DIHVPTTPALPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDSESPTNIPLTKQGG
990 1000 1010 1020 1030 1040
1010 1020 1030 1040
pF1KA0 ARELK-------ELVKELS---SSTQ----GELVAPLHPRIVQLS-------HVMDSHVS
.:... . .. :: :: . :. . :: .. .:. . ::..
XP_016 SRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQGPGDTLPPLPCHLPDLQIPGTSPLPAHGSHLD
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 ERVK-NKVYQLARQY-SLRIKSNKPVMARPPLQ---WEKVAPE--RDGKSPTV--PCLQE
.:. : .:... . .. .. : . : . : .. : ..:. : . :
XP_016 HRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTP-LPLPQVLTDIWVQALPTSPKQGSLPDIQGPAAAP
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 EAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSP---PKPSSAGEMSPQRFFFNPSAVSQRTT
:: . . . .. ..:. . : : : : .: .. : . .: ... .
XP_016 PLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLI-DAHVPAATPLPERGGSLDIQGLSPTPVQTTMVLS
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1150 1160 1170 1180
pF1KA0 SPGGRPSAW------SPLSPTET-------FSWPDV----RELCSKYASRDEARRAG--G
.::: .. : :.: .. . :.. : : ..: :.. ::: : :
XP_016 KPGGSLASHVARLESSDLTPPHSPPPSSRQLLGPNAAALSRYLAASYISQSLARRQGPGG
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA0 GRP---RGP----PVNRSHSVP-ENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGRGGGEAAQSPGPLP
: : :: :..:. : : . . :: . :.. ... . : ::
XP_016 GAPAASRGSWSSAPTSRASSPPPQPQPPPPPARRLSYATTVNIHVGGGGRLRPAKAQVRL
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA0 QSKPDGGETLYVTADLTLEDNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGPSSPVALLGQVQDF
XP_016 NHPALLASTQESMGLHRAQGAPDAPFHM
1350 1360 1370
>>XP_016882639 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: pleckstr (1374 aa)
initn: 1120 init1: 441 opt: 1128 Z-score: 703.4 bits: 142.6 E(85289): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1295; 29.1% identity (53.4% similar) in 1343 aa overlap (27-1230:29-1335)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHL
:. :..:.: :.. . :.:: :
XP_016 MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTA--APAAPTMASPRGSGSSTSLST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KA0 ----------PNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMY
:. ..: . :: .. .. :. . : : ::.:::::::: :
XP_016 VGSEGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 VQDLRSIVEDYLLKIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVA
:.:::::::::: ..: : :. :::..::.:::.:: ..:.::.::.. .:. ..:
XP_016 VRDLRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLEN-SSSAGGIA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 SCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKP
:::.::..::::: :: :::.:.: : : . : ....:: :.::::: :.::::
XP_016 ECFVQRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VQRILKYHLLLQEIAKHFDEEED--GFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEI
:::::::::::::..::. : : :.::.:: .:: ::::::::::..:::.::::.
XP_016 VQRILKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KA0 QSLLINWKGPDLTTYGELVLEGTFRVH-----RVRN-ERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVY
: : .: ::.:...:::::::.:: :.:. :: .:::.. ::..:.:: ...:
XP_016 QRRLGGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 KGNIPCSSLMLIESTRDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHA
::.: : .: . :: :: : : :. :... .:::. :::: : : ..::..::: :
XP_016 KGHIFCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSP------ERLKKAWSS-QDEVSTNVRQGRRQSEPTK
.:: :::...:: : .:.: : : .: . . . . :::.. :.
XP_016 SIPAKAKQVLLE------NSLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KA0 --HLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLD-FGQPSRTRGLQPEA-EGATQEEEEEEEEVVE
..:. ... :.::::: : : .:: . . :: : : . .
XP_016 GPSVIRRGRRQSAKPGFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGPPTLDPSGTSIT
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KA0 EEEEEEEEEQAFQ---VSLEDLTGHEGNEKGAGPEP-------PG--SEEEEEEQEESLA
:: : ...... : .:. :. . : :. : :::::.::.:
XP_016 EEILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGDSETLTFQALPSRDSSEEEEEEEEGLE
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 VAEQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSRSSRR---PSG-RSPTS
. :. . : : .:. . : . : . : . . : : : : :.
XP_016 MDER----GPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRCEIPEGSRLPSL
600 610 620 630 640
620 630 640 650 660
pF1KA0 TEKRMSFE--SISSLPEVEPDPEAGSEQEVF--SAVEGPSAEETPSDTESPEVLETQLDA
.. :: . ..: : : .: . : ..:: : . . . :.. .
XP_016 SDISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPATRRELFS---GS
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 HQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPPSVLDQASVIAE
. : :: : : :: :.:: .. . .:... . . . .:
XP_016 NPGKLGEPPSGG-------------KAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQHQGFPDE--LAF
710 720 730 740
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 RFVSSF-SRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHGSATDSLSCQLS
: : . : ... : . :: : :. ..:.. . :: :. : . : : .:.
XP_016 RSCSEIRSAWQALEQGQLARPGFPEPLLILEDSDLGGDSGSGKAGAPSSERTASRVRELA
750 760 770 780 790 800
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 PEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPS-PGCPVEPDRSSCKKKESA----LSTRDRLLLDKIK
. . . ... : : ..:. : : .:.: : . ..:. ..
XP_016 RLYSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLPAFGHVLVCELA
810 820 830 840 850 860
850 860 870 880 890
pF1KA0 SYYENAEHH-DAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSIS-RFNSLPRPDPEPV--------PPV
:.. : .: . .. .: .. . . ..::. : . :
XP_016 FPLTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGIHVSAATLLPEQ
870 880 890 900 910 920
900 910 920 930 940
pF1KA0 GSKRQVGSRPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDA---EFR-P-SSEIVKIWEGMESSGG
:..:.: . :.. : . :: . .:: :.. : .. . . : .
XP_016 GGSRHVQA-PAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLPEHRSHMVIPAP
930 940 950 960 970 980
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 SPGKGPGQGQANGFDLHEPLFILEEHELGA-ITEESATASPESSSPTEGRSPAHL-----
: . : ::. :.: : .:. . .: .: :.. . ...::...
XP_016 STAFCPEQGHCA--DIHVPTTPALPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDSESPTNIPLTKQ
990 1000 1010 1020 1030 1040
1010 1020 1030
pF1KA0 --ARELK-------ELVKELS---SSTQ----GELVAPLHPRIVQLS-------HVMDSH
.:... . .. :: :: . :. . :: .. .:. . ::
XP_016 GGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQGPGDTLPPLPCHLPDLQIPGTSPLPAHGSH
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 VSERVK-NKVYQLARQY-SLRIKSNKPVMARPPLQ---WEKVAPE--RDGKSPTV--PCL
...:. : .:... . .. .. : . : . : .. : ..:. : . :
XP_016 LDHRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTP-LPLPQVLTDIWVQALPTSPKQGSLPDIQGPAA
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 QEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSP---PKPSSAGEMSPQRFFFNPSAVSQR
:: . . . .. ..:. . : : : : .: .. : . .: ...
XP_016 APPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLI-DAHVPAATPLPERGGSLDIQGLSPTPVQTTMV
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1150 1160 1170 1180
pF1KA0 TTSPGGRPSAW------SPLSPTET-------FSWPDV----RELCSKYASRDEARRAG-
..::: .. : :.: .. . :.. : : ..: :.. ::: :
XP_016 LSKPGGSLASHVARLESSDLTPPHSPPPSSRQLLGPNAAALSRYLAASYISQSLARRQGP
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 -GGRP---RGP----PVNRSHSVP-ENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGRGGGEAAQSPGP
:: : :: :..:. : : . . :: . :.. ... . : ::
XP_016 GGGAPAASRGSWSSAPTSRASSPPPQPQPPPPPARRLSYATTVNIHVGGGGRLRPAKAQV
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 LPQSKPDGGETLYVTADLTLEDNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGPSSPVALLGQVQ
XP_016 RLNHPALLASTQESMGLHRAQGAPDAPFHM
1350 1360 1370
>>XP_005259220 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: pleckstr (1386 aa)
initn: 1176 init1: 441 opt: 1128 Z-score: 703.4 bits: 142.6 E(85289): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1306; 29.4% identity (53.1% similar) in 1354 aa overlap (27-1230:29-1347)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHL
:. :..:.: :.. . :.:: :
XP_005 MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTA---PAAPTMASPRGSGSSTSLST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KA0 ----------PNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMY
:. ..: . :: .. .. :. . : : ::.:::::::: :
XP_005 VGSEGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 VQDLRSIVEDYLLKIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVA
:.:::::::::: ..: : :. :::..::.:::.:: ..:.::.::.. .:. ..:
XP_005 VRDLRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLEN-SSSAGGIA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 SCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKP
:::.::..::::: :: :::.:.: : : . : ....:: :.::::: :.::::
XP_005 ECFVQRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VQRILKYHLLLQEIAKHFDEEED--GFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEI
:::::::::::::..::. : : :.::.:: .:: ::::::::::..:::.::::.
XP_005 VQRILKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KA0 QSLLINWKGPDLTTYGELVLEGTFRVH-----RVRN-ERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVY
: : .: ::.:...:::::::.:: :.:. :: .:::.. ::..:.:: ...:
XP_005 QRRLGGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 KGNIPCSSLMLIESTRDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHA
::.: : .: . :: :: : : :. :... .:::. :::: : : ..::..::: :
XP_005 KGHIFCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KA0 TIPQKAKEAILE-------------------MDSYYPNRYRC-SPERLKKAWSSQDEVST
.:: :::...:: . : : : .: : . : : :
XP_005 SIPAKAKQVLLENSLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSPGPSV--
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 NVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLD-FGQPSRTRGLQPEA-EGATQ
.:.:::::::.: .. ..:. :.::::: : : .:: . . :: : :
XP_005 -IRRGRRQSEPVKDPYVMFPQNAKP-GFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGP
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KA0 EEEEEEEEVVEEEEEEEEEEQAFQ---VSLEDLTGHEGNEKGAGPEP-------PG--SE
. . :: : ...... : .:. :. . : :. :
XP_005 PTLDPSGTSITEEILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGDSETLTFQALPSRDSS
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EEEEEQEESLAVAEQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSRSSRR-
:::::.::.: . :. . : : .:. . : . : . : . . :
XP_005 EEEEEEEEGLEMDER----GPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRC
600 610 620 630 640
610 620 630 640 650
pF1KA0 --PSG-RSPTSTEKRMSFE--SISSLPEVEPDPEAGSEQEVF--SAVEGPSAEETPSDTE
: : : :. .. :: . ..: : : .: . : ..:: : . . .
XP_005 EIPEGSRLPSLSDISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPAT
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 SPEVLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPP
:.. .. : :: : : :: :.:: .. . .:...
XP_005 RRELFS---GSNPGKLGEPPSGG-------------KAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQH
710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 SVLDQASVIAERFVSSF-SRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHG
. . . .: : : . : ... : . :: : :. ..:.. . :: :. : .
XP_005 QGFPDE--LAFRSCSEIRSAWQALEQGQLARPGFPEPLLILEDSDLGGDSGSGKAGAPSS
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 SATDSLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPS-PGCPVEPDRSSCKKKESA----LS
: : .:. . . . ... : : ..:. : : .:.: :
XP_005 ERTASRVRELARLYSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLP
820 830 840 850 860 870
840 850 860 870 880
pF1KA0 TRDRLLLDKIKSYYENAEHH-DAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSIS-RFNSLPRPDPEPV
. ..:. .. :.. : .: . .. .: .. . . ..::. : .
XP_005 AFGHVLVCELAFPLTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGI
880 890 900 910 920 930
890 900 910 920 930
pF1KA0 --------PPVGSKRQVGSRPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDA---EFR-P-SSEIV
: :..:.: . :.. : . :: . .:: :.. : .. .
XP_005 HVSAATLLPEQGGSRHVQA-PAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLP
940 950 960 970 980
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 KIWEGMESSGGSPGKGPGQGQANGFDLHEPLFILEEHELGA-ITEESATASPESSSPTEG
. : . : . : ::. :.: : .:. . .: .: :.. . ..
XP_005 EHRSHMVIPAPSTAFCPEQGHCA--DIHVPTTPALPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDS
990 1000 1010 1020 1030 1040
1000 1010 1020 1030
pF1KA0 RSPAHL-------ARELK-------ELVKELS---SSTQ----GELVAPLHPRIVQLS--
.::... .:... . .. :: :: . :. . :: .. .:.
XP_005 ESPTNIPLTKQGGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQGPGDTLPPLPCHLPDLQIP
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 -----HVMDSHVSERVK-NKVYQLARQY-SLRIKSNKPVMARPPLQ---WEKVAPE--RD
. ::...:. : .:... . .. .. : . : . : .. : ..
XP_005 GTSPLPAHGSHLDHRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTP-LPLPQVLTDIWVQALPTSPKQ
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 GKSPTV--PCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSP---PKPSSAGEMSPQR
:. : . : :: . . . .. ..:. . : : : : .: .. :
XP_005 GSLPDIQGPAAAPPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLI-DAHVPAATPLPERGGSLDIQG
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1140 1150 1160 1170
pF1KA0 FFFNPSAVSQRTTSPGGRPSAW------SPLSPTET-------FSWPDV----RELCSKY
. .: ... ..::: .. : :.: .. . :.. : : ..:
XP_005 LSPTPVQTTMVLSKPGGSLASHVARLESSDLTPPHSPPPSSRQLLGPNAAALSRYLAASY
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 ASRDEARRAG--GGRP---RGP----PVNRSHSVP-ENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGR
:.. ::: : :: : :: :..:. : : . . :: . :.. ... . :
XP_005 ISQSLARRQGPGGGAPAASRGSWSSAPTSRASSPPPQPQPPPPPARRLSYATTVNIHVGG
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 GGGEAAQSPGPLPQSKPDGGETLYVTADLTLEDNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGP
::
XP_005 GGRLRPAKAQVRLNHPALLASTQESMGLHRAQGAPDAPFHM
1350 1360 1370 1380
>>NP_073746 (OMIM: 611893,616763) pleckstrin homology do (1386 aa)
initn: 1176 init1: 441 opt: 1128 Z-score: 703.4 bits: 142.6 E(85289): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1306; 29.4% identity (53.1% similar) in 1354 aa overlap (27-1230:29-1347)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHL
:. :..:.: :.. . :.:: :
NP_073 MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTA---PAAPTMASPRGSGSSTSLST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KA0 ----------PNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMY
:. ..: . :: .. .. :. . : : ::.:::::::: :
NP_073 VGSEGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 VQDLRSIVEDYLLKIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVA
:.:::::::::: ..: : :. :::..::.:::.:: ..:.::.::.. .:. ..:
NP_073 VRDLRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLEN-SSSAGGIA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 SCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKP
:::.::..::::: :: :::.:.: : : . : ....:: :.::::: :.::::
NP_073 ECFVQRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VQRILKYHLLLQEIAKHFDEEED--GFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEI
:::::::::::::..::. : : :.::.:: .:: ::::::::::..:::.::::.
NP_073 VQRILKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KA0 QSLLINWKGPDLTTYGELVLEGTFRVH-----RVRN-ERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVY
: : .: ::.:...:::::::.:: :.:. :: .:::.. ::..:.:: ...:
NP_073 QRRLGGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 KGNIPCSSLMLIESTRDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHA
::.: : .: . :: :: : : :. :... .:::. :::: : : ..::..::: :
NP_073 KGHIFCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KA0 TIPQKAKEAILE-------------------MDSYYPNRYRC-SPERLKKAWSSQDEVST
.:: :::...:: . : : : .: : . : : :
NP_073 SIPAKAKQVLLENSLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSPGPSV--
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 NVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLD-FGQPSRTRGLQPEA-EGATQ
.:.:::::::.: .. ..:. :.::::: : : .:: . . :: : :
NP_073 -IRRGRRQSEPVKDPYVMFPQNAKP-GFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGP
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KA0 EEEEEEEEVVEEEEEEEEEEQAFQ---VSLEDLTGHEGNEKGAGPEP-------PG--SE
. . :: : ...... : .:. :. . : :. :
NP_073 PTLDPSGTSITEEILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGDSETLTFQALPSRDSS
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EEEEEQEESLAVAEQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSRSSRR-
:::::.::.: . :. . : : .:. . : . : . : . . :
NP_073 EEEEEEEEGLEMDER----GPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRC
600 610 620 630 640
610 620 630 640 650
pF1KA0 --PSG-RSPTSTEKRMSFE--SISSLPEVEPDPEAGSEQEVF--SAVEGPSAEETPSDTE
: : : :. .. :: . ..: : : .: . : ..:: : . . .
NP_073 EIPEGSRLPSLSDISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPAT
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 SPEVLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPP
:.. .. : :: : : :: :.:: .. . .:...
NP_073 RRELFS---GSNPGKLGEPPSGG-------------KAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQH
710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 SVLDQASVIAERFVSSF-SRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHG
. . . .: : : . : ... : . :: : :. ..:.. . :: :. : .
NP_073 QGFPDE--LAFRSCSEIRSAWQALEQGQLARPGFPEPLLILEDSDLGGDSGSGKAGAPSS
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 SATDSLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPS-PGCPVEPDRSSCKKKESA----LS
: : .:. . . . ... : : ..:. : : .:.: :
NP_073 ERTASRVRELARLYSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLP
820 830 840 850 860 870
840 850 860 870 880
pF1KA0 TRDRLLLDKIKSYYENAEHH-DAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSIS-RFNSLPRPDPEPV
. ..:. .. :.. : .: . .. .: .. . . ..::. : .
NP_073 AFGHVLVCELAFPLTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGI
880 890 900 910 920 930
890 900 910 920 930
pF1KA0 --------PPVGSKRQVGSRPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDA---EFR-P-SSEIV
: :..:.: . :.. : . :: . .:: :.. : .. .
NP_073 HVSAATLLPEQGGSRHVQA-PAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLP
940 950 960 970 980
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 KIWEGMESSGGSPGKGPGQGQANGFDLHEPLFILEEHELGA-ITEESATASPESSSPTEG
. : . : . : ::. :.: : .:. . .: .: :.. . ..
NP_073 EHRSHMVIPAPSTAFCPEQGHCA--DIHVPTTPALPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDS
990 1000 1010 1020 1030 1040
1000 1010 1020 1030
pF1KA0 RSPAHL-------ARELK-------ELVKELS---SSTQ----GELVAPLHPRIVQLS--
.::... .:... . .. :: :: . :. . :: .. .:.
NP_073 ESPTNIPLTKQGGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQGPGDTLPPLPCHLPDLQIP
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 -----HVMDSHVSERVK-NKVYQLARQY-SLRIKSNKPVMARPPLQ---WEKVAPE--RD
. ::...:. : .:... . .. .. : . : . : .. : ..
NP_073 GTSPLPAHGSHLDHRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTP-LPLPQVLTDIWVQALPTSPKQ
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 GKSPTV--PCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSP---PKPSSAGEMSPQR
:. : . : :: . . . .. ..:. . : : : : .: .. :
NP_073 GSLPDIQGPAAAPPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLI-DAHVPAATPLPERGGSLDIQG
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1140 1150 1160 1170
pF1KA0 FFFNPSAVSQRTTSPGGRPSAW------SPLSPTET-------FSWPDV----RELCSKY
. .: ... ..::: .. : :.: .. . :.. : : ..:
NP_073 LSPTPVQTTMVLSKPGGSLASHVARLESSDLTPPHSPPPSSRQLLGPNAAALSRYLAASY
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 ASRDEARRAG--GGRP---RGP----PVNRSHSVP-ENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGR
:.. ::: : :: : :: :..:. : : . . :: . :.. ... . :
NP_073 ISQSLARRQGPGGGAPAASRGSWSSAPTSRASSPPPQPQPPPPPARRLSYATTVNIHVGG
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 GGGEAAQSPGPLPQSKPDGGETLYVTADLTLEDNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGP
::
NP_073 GGRLRPAKAQVRLNHPALLASTQESMGLHRAQGAPDAPFHM
1350 1360 1370 1380
>>XP_011525534 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: pleckstr (1387 aa)
initn: 1176 init1: 441 opt: 1128 Z-score: 703.4 bits: 142.6 E(85289): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1307; 29.4% identity (53.1% similar) in 1354 aa overlap (27-1230:29-1348)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHL
:. :..:.: :.. . :.:: :
XP_011 MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTA--APAAPTMASPRGSGSSTSLST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KA0 ----------PNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMY
:. ..: . :: .. .. :. . : : ::.:::::::: :
XP_011 VGSEGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 VQDLRSIVEDYLLKIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVA
:.:::::::::: ..: : :. :::..::.:::.:: ..:.::.::.. .:. ..:
XP_011 VRDLRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLEN-SSSAGGIA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 SCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKP
:::.::..::::: :: :::.:.: : : . : ....:: :.::::: :.::::
XP_011 ECFVQRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VQRILKYHLLLQEIAKHFDEEED--GFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEI
:::::::::::::..::. : : :.::.:: .:: ::::::::::..:::.::::.
XP_011 VQRILKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KA0 QSLLINWKGPDLTTYGELVLEGTFRVH-----RVRN-ERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVY
: : .: ::.:...:::::::.:: :.:. :: .:::.. ::..:.:: ...:
XP_011 QRRLGGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 KGNIPCSSLMLIESTRDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHA
::.: : .: . :: :: : : :. :... .:::. :::: : : ..::..::: :
XP_011 KGHIFCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KA0 TIPQKAKEAILE-------------------MDSYYPNRYRC-SPERLKKAWSSQDEVST
.:: :::...:: . : : : .: : . : : :
XP_011 SIPAKAKQVLLENSLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSPGPSV--
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 NVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLD-FGQPSRTRGLQPEA-EGATQ
.:.:::::::.: .. ..:. :.::::: : : .:: . . :: : :
XP_011 -IRRGRRQSEPVKDPYVMFPQNAKP-GFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGP
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KA0 EEEEEEEEVVEEEEEEEEEEQAFQ---VSLEDLTGHEGNEKGAGPEP-------PG--SE
. . :: : ...... : .:. :. . : :. :
XP_011 PTLDPSGTSITEEILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGDSETLTFQALPSRDSS
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EEEEEQEESLAVAEQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSRSSRR-
:::::.::.: . :. . : : .:. . : . : . : . . :
XP_011 EEEEEEEEGLEMDER----GPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRC
600 610 620 630 640
610 620 630 640 650
pF1KA0 --PSG-RSPTSTEKRMSFE--SISSLPEVEPDPEAGSEQEVF--SAVEGPSAEETPSDTE
: : : :. .. :: . ..: : : .: . : ..:: : . . .
XP_011 EIPEGSRLPSLSDISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPAT
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 SPEVLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPP
:.. .. : :: : : :: :.:: .. . .:...
XP_011 RRELFS---GSNPGKLGEPPSGG-------------KAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQH
710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 SVLDQASVIAERFVSSF-SRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHG
. . . .: : : . : ... : . :: : :. ..:.. . :: :. : .
XP_011 QGFPDE--LAFRSCSEIRSAWQALEQGQLARPGFPEPLLILEDSDLGGDSGSGKAGAPSS
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 SATDSLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPS-PGCPVEPDRSSCKKKESA----LS
: : .:. . . . ... : : ..:. : : .:.: :
XP_011 ERTASRVRELARLYSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLP
820 830 840 850 860 870
840 850 860 870 880
pF1KA0 TRDRLLLDKIKSYYENAEHH-DAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSIS-RFNSLPRPDPEPV
. ..:. .. :.. : .: . .. .: .. . . ..::. : .
XP_011 AFGHVLVCELAFPLTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGI
880 890 900 910 920 930
890 900 910 920 930
pF1KA0 --------PPVGSKRQVGSRPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDA---EFR-P-SSEIV
: :..:.: . :.. : . :: . .:: :.. : .. .
XP_011 HVSAATLLPEQGGSRHVQA-PAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLP
940 950 960 970 980 990
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 KIWEGMESSGGSPGKGPGQGQANGFDLHEPLFILEEHELGA-ITEESATASPESSSPTEG
. : . : . : ::. :.: : .:. . .: .: :.. . ..
XP_011 EHRSHMVIPAPSTAFCPEQGHCA--DIHVPTTPALPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDS
1000 1010 1020 1030 1040
1000 1010 1020 1030
pF1KA0 RSPAHL-------ARELK-------ELVKELS---SSTQ----GELVAPLHPRIVQLS--
.::... .:... . .. :: :: . :. . :: .. .:.
XP_011 ESPTNIPLTKQGGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQGPGDTLPPLPCHLPDLQIP
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 -----HVMDSHVSERVK-NKVYQLARQY-SLRIKSNKPVMARPPLQ---WEKVAPE--RD
. ::...:. : .:... . .. .. : . : . : .. : ..
XP_011 GTSPLPAHGSHLDHRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTP-LPLPQVLTDIWVQALPTSPKQ
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 GKSPTV--PCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSP---PKPSSAGEMSPQR
:. : . : :: . . . .. ..:. . : : : : .: .. :
XP_011 GSLPDIQGPAAAPPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLI-DAHVPAATPLPERGGSLDIQG
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1140 1150 1160 1170
pF1KA0 FFFNPSAVSQRTTSPGGRPSAW------SPLSPTET-------FSWPDV----RELCSKY
. .: ... ..::: .. : :.: .. . :.. : : ..:
XP_011 LSPTPVQTTMVLSKPGGSLASHVARLESSDLTPPHSPPPSSRQLLGPNAAALSRYLAASY
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 ASRDEARRAG--GGRP---RGP----PVNRSHSVP-ENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGR
:.. ::: : :: : :: :..:. : : . . :: . :.. ... . :
XP_011 ISQSLARRQGPGGGAPAASRGSWSSAPTSRASSPPPQPQPPPPPARRLSYATTVNIHVGG
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 GGGEAAQSPGPLPQSKPDGGETLYVTADLTLEDNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGP
::
XP_011 GGRLRPAKAQVRLNHPALLASTQESMGLHRAQGAPDAPFHM
1350 1360 1370 1380
>>XP_006723397 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: pleckstr (1327 aa)
initn: 1169 init1: 434 opt: 1100 Z-score: 686.5 bits: 139.4 E(85289): 1.7e-31
Smith-Waterman score: 1278; 30.1% identity (53.6% similar) in 1279 aa overlap (92-1230:42-1288)
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMYVQDLRSIVEDYLL
: : ::.:::::::: ::.::::::::::
XP_006 KPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTGSARPSRLERVAREIVETERAYVRDLRSIVEDYLG
20 30 40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVASCFVERSQEFDIY
..: : :. :::..::.:::.:: ..:.::.::.. .:. ..: :::.::..::::
XP_006 PLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLEN-SSSAGGIAECFVQRSEDFDIY
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQE
: :: :::.:.: : : . : ....:: :.::::: :.:::::::::::::::::
XP_006 TLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKPVQRILKYHLLLQE
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290
pF1KA0 IAKHFDEEED--GFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLT
..::. : : :.::.:: .:: ::::::::::..:::.::::.: : .: ::.:.
XP_006 LGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEVQRRLGGWTGPELS
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 TYGELVLEGTFRVH-----RVRN-ERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVYKGNIPCSSLMLIE
..:::::::.:: :.:. :: .:::.. ::..:.:: ...:::.: : .: . :
XP_006 AFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTYKGHIFCCNLSVSE
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 STRDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILE-
: :: : : :. :... .:::. :::: : : ..::..::: :.:: :::...::
XP_006 SPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPASIPAKAKQVLLEN
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450
pF1KA0 ------------------MDSYYPNRYRC-SPERLKKAWSSQDEVSTNVRQGRRQSEPTK
. : : : .: : . : : : .:.:::::::.:
XP_006 SLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSPGPSV---IRRGRRQSEPVK
380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 HLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLD-FGQPSRTRGLQPEA-EGATQEEEEEEEEVVEEE
.. ..:. :.::::: : : .:: . . :: : : . . ::
XP_006 DPYVMFPQNAKP-GFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGPPTLDPSGTSITEE
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550
pF1KA0 EEEEEEEQAFQ---VSLEDLTGHEGNEKGAGPEP-------PG--SEEEEEEQEESLAVA
: ...... : .:. :. . : :. : :::::.::.: .
XP_006 ILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGDSETLTFQALPSRDSSEEEEEEEEGLEMD
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 EQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSRSSRR---PSG-RSPTSTE
:. . : : .:. . : . : . : . . : : : : :. ..
XP_006 ER----GPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRCEIPEGSRLPSLSD
550 560 570 580 590 600
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 KRMSFE--SISSLPEVEPDPEAGSEQEVF--SAVEGPSAEETPSDTESPEVLETQLDAHQ
:: . ..: : : .: . : ..:: : . . . :.. ..
XP_006 ISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPATRRELFS---GSNP
610 620 630 640 650
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 GLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPPSVLDQASVIAERF
: :: : : :: :.:: .. . .:... . . . .: :
XP_006 GKLGEPPSGG-------------KAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQHQGFPDE--LAFRS
660 670 680 690 700
740 750 760 770 780
pF1KA0 VSSF-SRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHGSATDSLSCQLSPE
: . : ... : . :: : :. ..:.. . :: :. : . : : .:.
XP_006 CSEIRSAWQALEQGQLARPGFPEPLLILEDSDLGGDSGSGKAGAPSSERTASRVRELARL
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VDISVGVATEDSPSVNGMEPPS-PGCPVEPDRSSCKKKESA----LSTRDRLLLDKIKSY
. . . ... : : ..:. : : .:.: : . ..:. ..
XP_006 YSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLPAFGHVLVCELAFP
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890
pF1KA0 YENAEHH-DAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSIS-RFNSLPRPDPEPV--------PPVGS
:.. : .: . .. .: .. . . ..::. : . : :.
XP_006 LTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGIHVSAATLLPEQGG
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940
pF1KA0 KRQVGSRPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDA---EFR-P-SSEIVKIWEGMESSGGSP
.:.: . :.. : . :: . .:: :.. : .. . . : . :
XP_006 SRHVQA-PAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLPEHRSHMVIPAPST
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 GKGPGQGQANGFDLHEPLFILEEHELGA-ITEESATASPESSSPTEGRSPAHL-------
. : ::. :.: : .:. . .: .: :.. . ...::...
XP_006 AFCPEQGHCA--DIHVPTTPALPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDSESPTNIPLTKQGG
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040
pF1KA0 ARELK-------ELVKELS---SSTQ----GELVAPL--HPRIVQLSHV-----MDSHVS
.:... . .. :: :: . :. . :: : .:. . ::..
XP_006 SRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQGPGDTLPPLPCHLPDLQIPGTSPLPAHGSHLD
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 ERVK-NKVYQLARQY-SLRIKSNKPVMARPPLQ---WEKVAPE--RDGKSPTV--PCLQE
.:. : .:... . .. .. : . : . : .. : ..:. : . :
XP_006 HRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTP-LPLPQVLTDIWVQALPTSPKQGSLPDIQGPAAAP
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 EAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSP---PKPSSAGEMSPQRFFFNPSAVSQRTT
:: . . . .. ..:. . : : : : .: .. : . .: ... .
XP_006 PLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLI-DAHVPAATPLPERGGSLDIQGLSPTPVQTTMVLS
1130 1140 1150 1160 1170
1150 1160 1170 1180
pF1KA0 SPGGRPSAW------SPLSPTET-------FSWPDV----RELCSKYASRDEARRAG--G
.::: .. : :.: .. . :.. : : ..: :.. ::: : :
XP_006 KPGGSLASHVARLESSDLTPPHSPPPSSRQLLGPNAAALSRYLAASYISQSLARRQGPGG
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA0 GRP---RGP----PVNRSHSVP-ENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGRGGGEAAQSPGPLP
: : :: :..:. : : . . :: . :.. ... . : ::
XP_006 GAPAASRGSWSSAPTSRASSPPPQPQPPPPPARRLSYATTVNIHVGGGGRLRPAKAQVRL
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA0 QSKPDGGETLYVTADLTLEDNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGPSSPVALLGQVQDF
XP_006 NHPALLASTQESMGLHRAQGAPDAPFHM
1300 1310 1320
>>XP_005263745 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine nuc (483 aa)
initn: 463 init1: 185 opt: 487 Z-score: 316.5 bits: 69.5 E(85289): 6.8e-11
Smith-Waterman score: 501; 31.3% identity (61.0% similar) in 364 aa overlap (74-412:56-414)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 APAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLS---YLGRVVRE
::. :: : : :. . : . :. :
XP_005 WGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAG-NSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINE
30 40 50 60 70 80
110 120 130 140 150
pF1KA0 IVETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS-C
:. ::: :.. ::.: : :. . ... ::. ..:::::.:: .. ... :..
XP_005 ILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRF
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 NSD-P--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH
: . : ...::.:.. .:.::..::::.::. . :.. . .. . :: . .:::.
XP_005 NRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFF-EACRLLQK
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 --SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKR
.. : ..:: :::.: :: : : :. :. .. :. :: :. .: :: ::. ::
XP_005 MIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKR
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KA0 RHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYG-ELVLEGTF-RVHRVR---NERTFFLFDKTLLI
: :. .. . :: . .:.: :: . . ::. : . :: . . ..: :::::. :.
XP_005 RLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIY
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370
pF1KA0 TKK---RGDHFVYKGNIPCSSLMLI--ESTRD-SLCFTVT-----HYKHSKQQYSIQAKT
:: : : . ::: . ..: .. :. .: .: .. : . ... . ..
XP_005 CKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRK
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
:.:. : .: . : ... . :.. .: :.
XP_005 PEQKQRW---LKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKAVGRPCY
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 TNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLDFGQPSRTRGLQPEAEGATQE
XP_005 LTRQKHPALPSNRPQQQVLVLAEPRRKPSTFWHSISRLAPFRK
450 460 470 480
>>XP_011509579 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine nuc (483 aa)
initn: 463 init1: 185 opt: 487 Z-score: 316.5 bits: 69.5 E(85289): 6.8e-11
Smith-Waterman score: 501; 31.3% identity (61.0% similar) in 364 aa overlap (74-412:56-414)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 APAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLS---YLGRVVRE
::. :: : : :. . : . :. :
XP_011 WGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAG-NSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINE
30 40 50 60 70 80
110 120 130 140 150
pF1KA0 IVETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS-C
:. ::: :.. ::.: : :. . ... ::. ..:::::.:: .. ... :..
XP_011 ILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRF
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 NSD-P--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH
: . : ...::.:.. .:.::..::::.::. . :.. . .. . :: . .:::.
XP_011 NRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFF-EACRLLQK
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 --SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKR
.. : ..:: :::.: :: : : :. :. .. :. :: :. .: :: ::. ::
XP_011 MIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKR
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KA0 RHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYG-ELVLEGTF-RVHRVR---NERTFFLFDKTLLI
: :. .. . :: . .:.: :: . . ::. : . :: . . ..: :::::. :.
XP_011 RLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIY
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370
pF1KA0 TKK---RGDHFVYKGNIPCSSLMLI--ESTRD-SLCFTVT-----HYKHSKQQYSIQAKT
:: : : . ::: . ..: .. :. .: .: .. : . ... . ..
XP_011 CKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRK
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
:.:. : .: . : ... . :.. .: :.
XP_011 PEQKQRW---LKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKAVGRPCY
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 TNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLDFGQPSRTRGLQPEAEGATQE
XP_011 LTRQKHPALPSNRPQQQVLVLAEPRRKPSTFWHSISRLAPFRK
450 460 470 480
>>XP_005263746 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine nuc (483 aa)
initn: 463 init1: 185 opt: 487 Z-score: 316.5 bits: 69.5 E(85289): 6.8e-11
Smith-Waterman score: 501; 31.3% identity (61.0% similar) in 364 aa overlap (74-412:56-414)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 APAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLS---YLGRVVRE
::. :: : : :. . : . :. :
XP_005 WGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAG-NSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINE
30 40 50 60 70 80
110 120 130 140 150
pF1KA0 IVETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS-C
:. ::: :.. ::.: : :. . ... ::. ..:::::.:: .. ... :..
XP_005 ILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRF
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 NSD-P--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH
: . : ...::.:.. .:.::..::::.::. . :.. . .. . :: . .:::.
XP_005 NRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFF-EACRLLQK
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 --SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKR
.. : ..:: :::.: :: : : :. :. .. :. :: :. .: :: ::. ::
XP_005 MIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKR
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KA0 RHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYG-ELVLEGTF-RVHRVR---NERTFFLFDKTLLI
: :. .. . :: . .:.: :: . . ::. : . :: . . ..: :::::. :.
XP_005 RLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIY
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370
pF1KA0 TKK---RGDHFVYKGNIPCSSLMLI--ESTRD-SLCFTVT-----HYKHSKQQYSIQAKT
:: : : . ::: . ..: .. :. .: .: .. : . ... . ..
XP_005 CKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRK
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
:.:. : .: . : ... . :.. .: :.
XP_005 PEQKQRW---LKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKAVGRPCY
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 TNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLDFGQPSRTRGLQPEAEGATQE
XP_005 LTRQKHPALPSNRPQQQVLVLAEPRRKPSTFWHSISRLAPFRK
450 460 470 480
>>XP_011509578 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine nuc (483 aa)
initn: 463 init1: 185 opt: 487 Z-score: 316.5 bits: 69.5 E(85289): 6.8e-11
Smith-Waterman score: 501; 31.3% identity (61.0% similar) in 364 aa overlap (74-412:56-414)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 APAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLS---YLGRVVRE
::. :: : : :. . : . :. :
XP_011 WGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAG-NSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINE
30 40 50 60 70 80
110 120 130 140 150
pF1KA0 IVETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS-C
:. ::: :.. ::.: : :. . ... ::. ..:::::.:: .. ... :..
XP_011 ILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRF
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 NSD-P--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH
: . : ...::.:.. .:.::..::::.::. . :.. . .. . :: . .:::.
XP_011 NRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFF-EACRLLQK
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 --SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKR
.. : ..:: :::.: :: : : :. :. .. :. :: :. .: :: ::. ::
XP_011 MIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKR
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KA0 RHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYG-ELVLEGTF-RVHRVR---NERTFFLFDKTLLI
: :. .. . :: . .:.: :: . . ::. : . :: . . ..: :::::. :.
XP_011 RLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIY
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370
pF1KA0 TKK---RGDHFVYKGNIPCSSLMLI--ESTRD-SLCFTVT-----HYKHSKQQYSIQAKT
:: : : . ::: . ..: .. :. .: .: .. : . ... . ..
XP_011 CKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRK
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
:.:. : .: . : ... . :.. .: :.
XP_011 PEQKQRW---LKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKAVGRPCY
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 TNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLDFGQPSRTRGLQPEAEGATQE
XP_011 LTRQKHPALPSNRPQQQVLVLAEPRRKPSTFWHSISRLAPFRK
450 460 470 480
1340 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:52:29 2016 done: Thu Nov 3 09:52:32 2016
Total Scan time: 19.110 Total Display time: 0.370
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]