Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0580
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0580, 1704 aa
1>>>pF1KA0580 1704 - 1704 aa - 1704 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7460+/-0.00151; mu= 17.0925+/- 0.090
mean_var=115.3897+/-23.890, 0's: 0 Z-trim(102.0): 152 B-trim: 298 in 2/47
Lambda= 0.119396
statistics sampled from 6609 (6777) to 6609 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.554), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16
Scan time: 6.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3441.1 ARAP2 gene_id:116984|Hs108|chr4 (1704) 11202 1942.5 0
CCDS8217.2 ARAP1 gene_id:116985|Hs108|chr11 (1205) 2749 486.4 2.5e-136
CCDS41687.1 ARAP1 gene_id:116985|Hs108|chr11 (1450) 2749 486.5 2.9e-136
CCDS44671.1 ARAP1 gene_id:116985|Hs108|chr11 (1133) 1831 328.3 9.6e-89
CCDS4266.1 ARAP3 gene_id:64411|Hs108|chr5 (1544) 1700 305.8 7.7e-82
CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 ( 836) 340 71.3 1.5e-11
CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 (1192) 340 71.4 2.1e-11
CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10 ( 663) 326 68.9 6.8e-11
CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10 ( 686) 324 68.5 8.9e-11
CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 804) 325 68.7 9e-11
CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 857) 325 68.8 9.5e-11
>>CCDS3441.1 ARAP2 gene_id:116984|Hs108|chr4 (1704 aa)
initn: 11202 init1: 11202 opt: 11202 Z-score: 10427.9 bits: 1942.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11202; 99.9% identity (100.0% similar) in 1704 aa overlap (1-1704:1-1704)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSVSEVNVDIKDFLMSINLEQYLLHFHESGFTTVKDCAAINDSLLQKIGISPTGHRRRI
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CCDS34 MSSVSEVNVDIKDFLMSINLEQYLLHFHESGFTTVKDCAAINDSLLQKIGISPTGHRRRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LKQLQIILSKMQDIPIYANVHKTKKNDDPSKDYHVPSSDQNICIELSNSGSVQTSSPPQL
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CCDS34 LKQLQIILSKMQDIPIYANVHKTKKNDDPSKDYHVPSSDQNICIELSNSGSVQTSSPPQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ETVRKNLEDSDASVERSQYPQSDDKLSPPKRDFPTAEEPHLNLGSLNDSLFGSDNIKIES
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CCDS34 ETVRKNLEDSDASVERSQYPQSDDKLSPPKRDFPTAEEPHLNLGSLNDSLFGSDNIKIES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LITKKTVDHTVEEQQTEKVKLITENLSKLPNADSECLSFVGCSTSGTNSGNGTNGLLEGS
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CCDS34 LITKKTVDHTVEEQQTEKVKLITENLSKLPNADSECLSFVGCSTSGTNSGNGTNGLLEGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 PPSPFFKFQGEMIVNDLYVPSSPILAPVRSRSKLVSRPSRSFLLRHRPVPEIPGSTKGVS
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CCDS34 PPSPFFKFQGEMIVNDLYVPSSPILAPVRSRSKLVSRPSRSFLLRHRPVPEIPGSTKGVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GSYFRERRNVATSTEKSVAWQNSNEENSSSIFPYGETFLFQRLENSKKRSIKNEFLTQGE
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CCDS34 GSYFRERRNVATSTEKSVAWQNSNEENSSSIFPYGETFLFQRLENSKKRSIKNEFLTQGE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 ALKGEAATATNSFIIKSSIYDNRKEKISEDKVEDIWIPREDKNNFLIDTASESEYSTVEE
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CCDS34 ALKGEAATATNSFIIKSSIYDNRKEKISEDKVEDIWIPREDKNNFLIDTASESEYSTVEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 CFQSLRRKNSKASKSRTQKALILDSVNRHSYPLSSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGAS
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CCDS34 CFQSLRRKNSKASKSRTQKALILDSVNRHSYPLSSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AKKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSISYYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRVQGD
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CCDS34 AKKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSISYYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRVQGD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 NKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNDWISILLNALKSQSLTSQSQAVVTPEKCGYLELRGYK
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CCDS34 NKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNDWISILLNALKSQSLTSQSQAVVTPEKCGYLELRGYK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 AKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFT
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CCDS34 AKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 AETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVIC
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CCDS34 AETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVIC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMD
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CCDS34 KKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 SPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMC
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CCDS34 SPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 ATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESSQSTFLCDFLY
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CCDS34 ATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESSQSTFLCDFLY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 QAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVICLAIHKED
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CCDS34 QAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVICLAIHKED
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 FYLNTGPIFIFEIYLPSERVFLFGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPLFAENLTEADYDLIGQ
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CCDS34 FYLNTGPIFIFEIYLPSERVFLFGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPLFAENLTEADYDLIGQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 LFYKDCHALDQWRKGWFAMDKSSLHFCLQMQEVQGDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDV
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CCDS34 LFYKDCHALDQWRKGWFAMDKSSLHFCLQMQEVQGDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 LLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTVWHTAIEKAAGTDGNALQDQQLSKNDVPIIVNSCIAFVT
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CCDS34 LLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTVWHTAIEKAAGTDGNALQDQQLSKNDVPIIVNSCIAFVT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 QYGLGCKYIYQKNGDPLHISELLESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDAL
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CCDS34 QYGLGCKYIYQKNGDPLHISELLESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDAL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 LTKELYPYWISALDTQDDKERIKKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRVQKCSEINHMN
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CCDS34 LTKELYPYWISALDTQDDKERIKKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRVQKCSEINHMN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 AHNLALVFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWKDT
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CCDS34 AHNLALVFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWKDT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 QVSQAGDLLIEVYVERKEPDCSIIIRISPVMEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVI
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CCDS34 QVSQAGDLLIEVYVERKEPDCSIIIRISPVMEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVI
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 ENEELERPLHYKENVLEQVLRWSSLAEPGSAYLVVKRFLTADTIKHCSDRSTLGSIKEGI
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CCDS34 ENEELERPLHYKENVLEQVLRWSSLAEPGSAYLVVKRFLTADTIKHCSDRSTLGSIKEGI
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 LKIKEEPSKILSGNKFQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSKHDKMFSLSSMKFYRGVKKKMKP
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CCDS34 LKIKEEPSKILSGNKFQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSKHDKMFSLSSMKFYRGVKKKMKP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 PTSWGLTAYSEKHHWHLCCDSSQTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERKRSITKNPKIG
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CCDS34 PTSWGLTAYSEKHHWHLCCDSSRTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERKRSITKNPKIG
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 GLPLIPIQHEGNATLARKNIESARAELERLRLSEKCDKESVDSSLKERASMVAHCLEHKD
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CCDS34 GLPLIPIQHEGNATLARKNIESARAELERLRLSEKCDKESVDSSLKERASMVAHCLEHKD
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 DKLRNRPRKHRSFNCLEDTEPEAPLGQPKGHKGLKTLRKTEDRNSKATLDSDHKLPSRVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DKLRNRPRKHRSFNCLEDTEPEAPLGQPKGHKGLKTLRKTEDRNSKATLDSDHKLPSRVI
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700
pF1KA0 EELNVVLQRSRTLPKELQDEQILK
::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EELNVVLQRSRTLPKELQDEQILK
1690 1700
>>CCDS8217.2 ARAP1 gene_id:116985|Hs108|chr11 (1205 aa)
initn: 2581 init1: 1026 opt: 2749 Z-score: 2560.9 bits: 486.4 E(32554): 2.5e-136
Smith-Waterman score: 2904; 41.7% identity (70.6% similar) in 1143 aa overlap (484-1591:84-1203)
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 SSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGASAKKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSIS
.:.::::: :::. ..:::::..: .
CCDS82 SSLSLSLPSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLR
60 70 80 90 100 110
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 YYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRVQGDNKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNDWISILLNAL
:....:. ::: .: .. :: : . ::.::::.:..:::.::.:.. ::..:.. : .:.
CCDS82 YFDSNKDAYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDVERKEWMQALQQAM
120 130 140 150 160 170
580 590 600 610 620
pF1KA0 KSQSLTSQ-SQAVVT-------PEKCGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGL
: .. :.: . :.. : :::::.: :..... :..: : :: .... :.
CCDS82 AEQRARARLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGI
180 190 200 210 220 230
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 GITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDY
:::.: :.:.:::.::: .::.. :::: :::.:..: ::..:.::.: .:::.::
CCDS82 GITFIDMSVGNVKEVDR---RSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTS
240 250 260 270 280 290
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 EVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDAS
::::.:: :: :::: ::.::::::::::::::.:::.::.:: ::::::::: .
CCDS82 EVAERIWAAAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRK
300 310 320 330 340 350
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 IWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLA
.:.. :::::. .:: .: :::.:. .: :. .: :. . ::.:::.:.
CCDS82 VWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPSTRRCHLEAKYREGKYRRYHPL
360 370 380 390 400 410
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 SLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEF
..:::.:::::::. :. ::.::: :: . : .::: :: ::..:::.:::::
CCDS82 FGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEF
420 430 440 450 460 470
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 LYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESS---QSTFLCDFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKK
: .:. .. :. : : : .. : .. :::.. ::. :: .... :: ...
CCDS82 LRNNRTTEVPRLD--SMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAG-KLLQDRRAREEFSRR
480 490 500 510 520
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 WCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVICLAIHKEDFYLNTGPIFIFEIYLPSERVFL
:::: : :::.::....:::: : .:..:::. : . : ::.: .::..:
CCDS82 WCVLGDGVLSYFENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTH---GFEHTFEVYTEGERLYL
530 540 550 560 570 580
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 FGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPLFAENLTEADYDLIGQLFYKDCHALDQWRKGWFAMDKS
:: :... ..:.. ::: ::: .::.: :.. .:.: :: .:.. ..:::... :
CCDS82 FGLESAEQAHEWVKCIAKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLSLQRAQEGWFSLSGS
590 600 610 620 630 640
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 SLHFCLQMQEVQGDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDVLLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTV
:. . . . ..::.::::.: :. . .::.:::. :::::.:. .:::
CCDS82 ELRAVFPEGPCE-EPLQLRKLQELSI----QGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMG
650 660 670 680 690
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 WHTAIEKAAGTDGNALQDQQLSKNDVPIIVNSCIAFVTQYGLGCKYIYQKNGDPLHISEL
: ::.:::.. :..:..:::. .:.:.:: :. ..:: :: . ::.: :. . ..:
CCDS82 WLGAIQKAAASMGDTLSEQQLGDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQTSKTQRL
700 710 720 730 740 750
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 LESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERI
:::...:::: .:. :.....::...:: :: :. :.:.:. :. : . .:..:..
CCDS82 LESLRQDARSVHLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASEIEDEEEKV
760 770 780 790 800 810
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 KKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLALVFSSCLFQTKGQTSEE
..: .. :: :::::. :.: ::: :: :. :.::.::::.::. :::: :: .
CCDS82 SRYRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKA
820 830 840 850 860 870
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA0 VNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWK----DTQVSQAGDLLIEVYVERKE
:.:::::.:: .: : :...... : . :.: . . ...:::.. ::.:.:.
CCDS82 GRVVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKK
880 890 900 910 920 930
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA0 PDCSIIIRISPVMEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVIENEELERPLHYKENVLEQ
. :.. : ::::: .:: .:. . : :. ::: : :: :::::. :.::
CCDS82 AETEQHIKVPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLP-
940 950 960 970 980 990
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA0 VLRWSSLAEPGSAYLVVKRFLTADTIKHCSDRSTLGSIKEGILKIKEEPSKI---LSGNK
.:. .:. ...::::. . ... : .:. :.:..:..:. : . : ..
CCDS82 ILH--GLGT--DSHLVVKKHQAMEAML-LYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGG
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 FQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSK---------H--DKMFSLSSMKFYRGVKKKMKPPTSW
:.::::.: .. : :::.:.:.. : .: . ..:.: : :::::..::: :
CCDS82 FHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSGAPETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCW
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 GLTAY--SEKH---HWHLCCDSSQTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERKRSITKNPKI
:.:. .::: .:.::::... ::.......::. .:: .. .:.. . ..
CCDS82 GFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEV-RL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1560 1570 1580 1590 1600 1610
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CCDS41 GSVSLIPLR--GSENEMRRSVAAFTADPLSLLRNV
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CCDS44 AEQRARARLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGI
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CCDS44 GITFIDMSVGNVKEVDR---RSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTS
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CCDS44 EVAERIWAAAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRK
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pF1KA0 IWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLA
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CCDS44 VWTETLIE----------------------------------------------------
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CCDS44 ELRAVFPEGPCE-EPLQLRKLQELSI----QGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMG
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CCDS44 AETEQHIKVPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLP-
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CCDS44 FHDRYFILNSSCLRLYKEVRSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKH
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pF1KA0 ---HWHLCCDSSQTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERKRSITKNPKIGGLPLIPIQHE
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CCDS44 EKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEV-RLGSVSLIPLR--
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CCDS44 GSENEMRRSVAAFTADPLSLLRNV
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CCDS42 RGVCQGRAEHRLSRQDLEAREDAGYASLELPGDSTLLSPTLETEETSDDLISPYASFSFT
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CCDS42 ADRLTPLLSGWLDKLSPQGNYVFQRRFVQFNGRSLMYFGSDKDPFPKGVIPLTAIEMTRS
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CCDS42 GLHPDATPGPRGEFISRKYRLGLFRKPHPQYPDHSQLLQALCAAVARPNLLKNMTQLLCV
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..:. ::: .: : . : .. . . :::: :. : .. ...: : . :. .
CCDS42 RATY-SGFLYCSPVSNKAGPSPPRRGRDAPPRLWCVL-GAALEMFASENSPEPLSLIQPQ
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CCDS42 SQGSVEEQEELEEPVYEEPVYEEVGAFPELIQDTSTSFSTTREWTVKPENPLTSQKSLDQ
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CCDS42 PFLSKSSTLGQEERPPEPPPGPPSKSSPQARGSLEEQLLQELSSLILRKGETTAGLGSPS
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CCDS44 QAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLG
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CCDS44 QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
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CCDS44 QGQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEE----KLFLAPLPCTELSLGQQLLRATADEDLQTAI
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CCDS44 LLLAHGSCEEVNETCGEGDGC-TALHLACRKGNVVLAQLLIWYG--VDVMARDAHGNTAL
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pF1KA0 S---QESSQSTFLCDFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTP
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CCDS44 TYARQASSQECINVLLQYGCPDECV
670 680
>>CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 (804 aa)
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CCDS25 SPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWV
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CCDS25 QAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLG
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CCDS25 ALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDD--WPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTK
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CCDS25 PSVDSTREEKERWIRAKYEQ----KLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAH
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CCDS25 GSRDEVNETCGEGDG-RTALHLACRKGNVVLAQLLIWYG--VDVTARDAHGNTALAYARQ
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CCDS25 ASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]