Result of FASTA (omim) for
pF1KA0541
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0541, 1490 aa
1>>>pF1KA0541 1490 - 1490 aa - 1490 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7707+/-0.000392; mu= 16.8052+/- 0.025
mean_var=118.4860+/-24.737, 0's: 0 Z-trim(114.7): 91 B-trim: 348 in 1/54
Lambda= 0.117826
statistics sampled from 24680 (24771) to 24680 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 13.030
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_006722494 (OMIM: 613473) PREDICTED: WD repeat-c (1490) 9959 1705.3 0
NP_056100 (OMIM: 613473) WD repeat-containing prot (1490) 9959 1705.3 0
XP_011524190 (OMIM: 613473) PREDICTED: WD repeat-c (1396) 9271 1588.4 0
NP_443066 (OMIM: 613473) WD repeat-containing prot (1457) 6376 1096.3 0
XP_016881171 (OMIM: 613473) PREDICTED: WD repeat-c (1457) 6376 1096.3 0
XP_016881172 (OMIM: 613473) PREDICTED: WD repeat-c ( 982) 6367 1094.6 0
XP_011519737 (OMIM: 613211,613214) PREDICTED: WD r (1102) 2063 363.0 7.3e-99
XP_011519735 (OMIM: 613211,613214) PREDICTED: WD r (1102) 2063 363.0 7.3e-99
NP_877435 (OMIM: 613211,613214) WD repeat-containi (1102) 2063 363.0 7.3e-99
XP_016877550 (OMIM: 613211,613214) PREDICTED: WD r (1102) 2063 363.0 7.3e-99
XP_011519738 (OMIM: 613211,613214) PREDICTED: WD r (1096) 1790 316.6 6.8e-85
XP_011519739 (OMIM: 613211,613214) PREDICTED: WD r (1062) 678 127.6 5.3e-28
NP_620640 (OMIM: 601787) transcription initiation ( 745) 183 43.3 0.0085
NP_008882 (OMIM: 601787) transcription initiation ( 800) 183 43.4 0.009
>>XP_006722494 (OMIM: 613473) PREDICTED: WD repeat-conta (1490 aa)
initn: 9959 init1: 9959 opt: 9959 Z-score: 9147.9 bits: 1705.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9959; 100.0% identity (100.0% similar) in 1490 aa overlap (1-1490:1-1490)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAGNSLVLPIVLWGRKAPTHCISAVLLTDDGATIVTGCHDGQICLWDLSVELQINPRALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MAGNSLVLPIVLWGRKAPTHCISAVLLTDDGATIVTGCHDGQICLWDLSVELQINPRALL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 FGHTASITCLSKACASSDKQYIVSASESGEMCLWDVSDGRCIEFTKLACTHTGIQFYQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FGHTASITCLSKACASSDKQYIVSASESGEMCLWDVSDGRCIEFTKLACTHTGIQFYQFS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VGNQREGRLLCHGHYPEILVVDATSLEVLYSLVSKISPDWISSMSIIRSHRTQEDTVVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VGNQREGRLLCHGHYPEILVVDATSLEVLYSLVSKISPDWISSMSIIRSHRTQEDTVVAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SVTGILKVWIVTSEISDMQDTEPIFEEESKPIYCQNCQSISFCAFTQRSLLVVCSKYWRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SVTGILKVWIVTSEISDMQDTEPIFEEESKPIYCQNCQSISFCAFTQRSLLVVCSKYWRV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 FDAGDYSLLCSGPSENGQTWTGGDFVSSDKVIIWTENGQSYIYKLPASCLPASDSFRSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FDAGDYSLLCSGPSENGQTWTGGDFVSSDKVIIWTENGQSYIYKLPASCLPASDSFRSDV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GKAVENLIPPVQHILLDRKDKELLICPPVTRFFYGCREYFHKLLIQGDSSGRLNIWNISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GKAVENLIPPVQHILLDRKDKELLICPPVTRFFYGCREYFHKLLIQGDSSGRLNIWNISD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 TADKQGSEEGLAMTTSISLQEAFDKLNPCPAGIIDQLSVIPNSNEPLKVTASVYIPAHGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TADKQGSEEGLAMTTSISLQEAFDKLNPCPAGIIDQLSVIPNSNEPLKVTASVYIPAHGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LVCGREDGSIVIVPATQTAIVQLLQGEHMLRRGWPPHRTLRGHRNKVTCLLYPHQVSARY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LVCGREDGSIVIVPATQTAIVQLLQGEHMLRRGWPPHRTLRGHRNKVTCLLYPHQVSARY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DQRYLISGGVDFSVIIWDIFSGEMKHIFCVHGGEITQLLVPPENCSARVQHCICSVASDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DQRYLISGGVDFSVIIWDIFSGEMKHIFCVHGGEITQLLVPPENCSARVQHCICSVASDH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SVGLLSLREKKCIMLASRHLFPIQVIKWRPSDDYLVVGCSDGSVYVWQMDTGALDRCVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SVGLLSLREKKCIMLASRHLFPIQVIKWRPSDDYLVVGCSDGSVYVWQMDTGALDRCVMG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ITAVEILNACDEAVPAAVDSLSHPAVNLKQAMTRRSLAALKNMAHHKLQTLATNLLASEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ITAVEILNACDEAVPAAVDSLSHPAVNLKQAMTRRSLAALKNMAHHKLQTLATNLLASEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SDKGNLPKYSHNSLMVQAIKTNLTDPDIHVLFFDVEALIIQLLTEEASRPNTALISPENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SDKGNLPKYSHNSLMVQAIKTNLTDPDIHVLFFDVEALIIQLLTEEASRPNTALISPENL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QKASGSSDKGGSFLTGKRAAVLFQQVKETIKENIKEHLLDDEEEDEEIMRQRREESDPEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QKASGSSDKGGSFLTGKRAAVLFQQVKETIKENIKEHLLDDEEEDEEIMRQRREESDPEY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 RSSKSKPLTLLEYNLTMDTAKLFMSCLHAWGLNEVLDEVCLDRLGMLKPHCTVSFGLLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RSSKSKPLTLLEYNLTMDTAKLFMSCLHAWGLNEVLDEVCLDRLGMLKPHCTVSFGLLSR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 GGHMSLMLPGYNQPACKLSHGKTEVGRKLPASEGVGKGTYGVSRAVTTQHLLSIISLANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GGHMSLMLPGYNQPACKLSHGKTEVGRKLPASEGVGKGTYGVSRAVTTQHLLSIISLANT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LMSMTNATFIGDHMKKGPTRPPRPSTPDLSKARGSPPTSSNIVQGQIKQVAAPVVSARSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LMSMTNATFIGDHMKKGPTRPPRPSTPDLSKARGSPPTSSNIVQGQIKQVAAPVVSARSD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 ADHSGSDPPSAPALHTCFLVNEGWSQLAAMHCVMLPDLLGLDKFRPPLLEMLARRWQDRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ADHSGSDPPSAPALHTCFLVNEGWSQLAAMHCVMLPDLLGLDKFRPPLLEMLARRWQDRC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 LEVREAAQALLLAELRRIEQAGRKEAIDAWAPYLPQYIDHVISPGVTSEAAQTITTAPDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LEVREAAQALLLAELRRIEQAGRKEAIDAWAPYLPQYIDHVISPGVTSEAAQTITTAPDA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SGPEAKVQEEEHDLVDDDITTGCLSSVPQMKKISTSYEERRKQATAIVLLGVIGAEFGAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SGPEAKVQEEEHDLVDDDITTGCLSSVPQMKKISTSYEERRKQATAIVLLGVIGAEFGAE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 IEPPKLLTRPRSSSQIPEGFGLTSGGSNYSLARHTCKALTFLLLQPPSPKLPPHSTIRRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IEPPKLLTRPRSSSQIPEGFGLTSGGSNYSLARHTCKALTFLLLQPPSPKLPPHSTIRRT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 AIDLIGRGFTVWEPYMDVSAVLMGLLELCADAEKQLANITMGLPLSPAADSARSARHALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AIDLIGRGFTVWEPYMDVSAVLMGLLELCADAEKQLANITMGLPLSPAADSARSARHALS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 LIATARPPAFITTIAKEVHRHTALAANTQSQQNMHTTTLARAKGEILRVIEILIEKMPTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LIATARPPAFITTIAKEVHRHTALAANTQSQQNMHTTTLARAKGEILRVIEILIEKMPTD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 VVDLLVEVMDIIMYCLEGSLVKKKGLQECFPAICRFYMVSYYERNHRIAVGARHGSVALY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VVDLLVEVMDIIMYCLEGSLVKKKGLQECFPAICRFYMVSYYERNHRIAVGARHGSVALY
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 DIRTGKCQTIHGHKGPITAVAFAPDGRYLATYSNTDSHISFWQMNTSLLGSIGMLNSAPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DIRTGKCQTIHGHKGPITAVAFAPDGRYLATYSNTDSHISFWQMNTSLLGSIGMLNSAPQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 LRCIKTYQVPPVQPASPGSHNALKLARLIWTSNRNVILMAHDGKEHRFMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LRCIKTYQVPPVQPASPGSHNALKLARLIWTSNRNVILMAHDGKEHRFMV
1450 1460 1470 1480 1490
>>NP_056100 (OMIM: 613473) WD repeat-containing protein (1490 aa)
initn: 9959 init1: 9959 opt: 9959 Z-score: 9147.9 bits: 1705.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9959; 100.0% identity (100.0% similar) in 1490 aa overlap (1-1490:1-1490)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAGNSLVLPIVLWGRKAPTHCISAVLLTDDGATIVTGCHDGQICLWDLSVELQINPRALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MAGNSLVLPIVLWGRKAPTHCISAVLLTDDGATIVTGCHDGQICLWDLSVELQINPRALL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 FGHTASITCLSKACASSDKQYIVSASESGEMCLWDVSDGRCIEFTKLACTHTGIQFYQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FGHTASITCLSKACASSDKQYIVSASESGEMCLWDVSDGRCIEFTKLACTHTGIQFYQFS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VGNQREGRLLCHGHYPEILVVDATSLEVLYSLVSKISPDWISSMSIIRSHRTQEDTVVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VGNQREGRLLCHGHYPEILVVDATSLEVLYSLVSKISPDWISSMSIIRSHRTQEDTVVAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SVTGILKVWIVTSEISDMQDTEPIFEEESKPIYCQNCQSISFCAFTQRSLLVVCSKYWRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SVTGILKVWIVTSEISDMQDTEPIFEEESKPIYCQNCQSISFCAFTQRSLLVVCSKYWRV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 FDAGDYSLLCSGPSENGQTWTGGDFVSSDKVIIWTENGQSYIYKLPASCLPASDSFRSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FDAGDYSLLCSGPSENGQTWTGGDFVSSDKVIIWTENGQSYIYKLPASCLPASDSFRSDV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GKAVENLIPPVQHILLDRKDKELLICPPVTRFFYGCREYFHKLLIQGDSSGRLNIWNISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GKAVENLIPPVQHILLDRKDKELLICPPVTRFFYGCREYFHKLLIQGDSSGRLNIWNISD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 TADKQGSEEGLAMTTSISLQEAFDKLNPCPAGIIDQLSVIPNSNEPLKVTASVYIPAHGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TADKQGSEEGLAMTTSISLQEAFDKLNPCPAGIIDQLSVIPNSNEPLKVTASVYIPAHGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LVCGREDGSIVIVPATQTAIVQLLQGEHMLRRGWPPHRTLRGHRNKVTCLLYPHQVSARY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LVCGREDGSIVIVPATQTAIVQLLQGEHMLRRGWPPHRTLRGHRNKVTCLLYPHQVSARY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DQRYLISGGVDFSVIIWDIFSGEMKHIFCVHGGEITQLLVPPENCSARVQHCICSVASDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DQRYLISGGVDFSVIIWDIFSGEMKHIFCVHGGEITQLLVPPENCSARVQHCICSVASDH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SVGLLSLREKKCIMLASRHLFPIQVIKWRPSDDYLVVGCSDGSVYVWQMDTGALDRCVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SVGLLSLREKKCIMLASRHLFPIQVIKWRPSDDYLVVGCSDGSVYVWQMDTGALDRCVMG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ITAVEILNACDEAVPAAVDSLSHPAVNLKQAMTRRSLAALKNMAHHKLQTLATNLLASEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ITAVEILNACDEAVPAAVDSLSHPAVNLKQAMTRRSLAALKNMAHHKLQTLATNLLASEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SDKGNLPKYSHNSLMVQAIKTNLTDPDIHVLFFDVEALIIQLLTEEASRPNTALISPENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SDKGNLPKYSHNSLMVQAIKTNLTDPDIHVLFFDVEALIIQLLTEEASRPNTALISPENL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QKASGSSDKGGSFLTGKRAAVLFQQVKETIKENIKEHLLDDEEEDEEIMRQRREESDPEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QKASGSSDKGGSFLTGKRAAVLFQQVKETIKENIKEHLLDDEEEDEEIMRQRREESDPEY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 RSSKSKPLTLLEYNLTMDTAKLFMSCLHAWGLNEVLDEVCLDRLGMLKPHCTVSFGLLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RSSKSKPLTLLEYNLTMDTAKLFMSCLHAWGLNEVLDEVCLDRLGMLKPHCTVSFGLLSR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 GGHMSLMLPGYNQPACKLSHGKTEVGRKLPASEGVGKGTYGVSRAVTTQHLLSIISLANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GGHMSLMLPGYNQPACKLSHGKTEVGRKLPASEGVGKGTYGVSRAVTTQHLLSIISLANT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LMSMTNATFIGDHMKKGPTRPPRPSTPDLSKARGSPPTSSNIVQGQIKQVAAPVVSARSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LMSMTNATFIGDHMKKGPTRPPRPSTPDLSKARGSPPTSSNIVQGQIKQVAAPVVSARSD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 ADHSGSDPPSAPALHTCFLVNEGWSQLAAMHCVMLPDLLGLDKFRPPLLEMLARRWQDRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ADHSGSDPPSAPALHTCFLVNEGWSQLAAMHCVMLPDLLGLDKFRPPLLEMLARRWQDRC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 LEVREAAQALLLAELRRIEQAGRKEAIDAWAPYLPQYIDHVISPGVTSEAAQTITTAPDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LEVREAAQALLLAELRRIEQAGRKEAIDAWAPYLPQYIDHVISPGVTSEAAQTITTAPDA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SGPEAKVQEEEHDLVDDDITTGCLSSVPQMKKISTSYEERRKQATAIVLLGVIGAEFGAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SGPEAKVQEEEHDLVDDDITTGCLSSVPQMKKISTSYEERRKQATAIVLLGVIGAEFGAE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 IEPPKLLTRPRSSSQIPEGFGLTSGGSNYSLARHTCKALTFLLLQPPSPKLPPHSTIRRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 IEPPKLLTRPRSSSQIPEGFGLTSGGSNYSLARHTCKALTFLLLQPPSPKLPPHSTIRRT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 AIDLIGRGFTVWEPYMDVSAVLMGLLELCADAEKQLANITMGLPLSPAADSARSARHALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 AIDLIGRGFTVWEPYMDVSAVLMGLLELCADAEKQLANITMGLPLSPAADSARSARHALS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 LIATARPPAFITTIAKEVHRHTALAANTQSQQNMHTTTLARAKGEILRVIEILIEKMPTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LIATARPPAFITTIAKEVHRHTALAANTQSQQNMHTTTLARAKGEILRVIEILIEKMPTD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 VVDLLVEVMDIIMYCLEGSLVKKKGLQECFPAICRFYMVSYYERNHRIAVGARHGSVALY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VVDLLVEVMDIIMYCLEGSLVKKKGLQECFPAICRFYMVSYYERNHRIAVGARHGSVALY
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 DIRTGKCQTIHGHKGPITAVAFAPDGRYLATYSNTDSHISFWQMNTSLLGSIGMLNSAPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DIRTGKCQTIHGHKGPITAVAFAPDGRYLATYSNTDSHISFWQMNTSLLGSIGMLNSAPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LRCIKTYQVPPVQPASPGSHNALKLARLIWTSNRNVILMAHDGKEHRFMV
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XP_011 DIRTGKCQALYQAKER
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 RSSKSKPLTLLEYNLTMDTAKLFMSCLHAWGLNEVLDEVCLDRLGMLKPHCTVSFGLLSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 GGHMSLMLPGYNQPACKLSHGKTEVGRKLPASEGVGKGTYGVSRAVTTQHLLSIISLANT
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 LMSMTNATFIGDHMKKGPTRPPRPSTPDLSKARGSPPTSSNIVQGQIKQ-----------
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 LEVREAAQALLLAELRRIEQAGRKEAIDAWAPYLPQYIDHVISPGVTSEAAQTITTAPDA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 SGPEAKVQEEEHDLVDDDITTGCLSSVPQMKKISTSYEERRKQATAIVLLGVIGAEFGAE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 AIDLIGRGFTVWEPYMDVSAVLMGLLELCADAEKQLANITMGLPLSPAADSARSARHALS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 LIATARPPAFITTIAKEVHRHTALAANTQSQQNMHTTTLARAKGEILRVIEILIEKMPTD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA0 DIRTGKCQTIHGHKGPITAVAFAPDGRYLATYSNTDSHISFWQMNTSLLGSIGMLNSAPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 DIRTGKCQTIHGHKGPITAVAFAPDGRYLATYSNTDSHISFWQMNTSLLGSIGMLNSAPQ
1350 1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KA0 LRCIKTYQVPPVQPASPGSHNALKLARLIWTSNRNVILMAHDGKEHRFMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 LRCIKTYQVPPVQPASPGSHNALKLARLIWTSNRNVILMAHDGKEHRFMV
1410 1420 1430 1440 1450
>>XP_016881171 (OMIM: 613473) PREDICTED: WD repeat-conta (1457 aa)
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XP_016 MAGNSLVLPIVLWGRKAPTHCISAVLLTDDGATIVTGCHDGQICLWDLSVELQINPRALL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FGHTASITCLSKACASSDKQYIVSASESGEMCLWDVSDGRCIEFTKLACTHTGIQFYQFS
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pF1KA0 VGNQREGRLLCHGHYPEILVVDATSLEVLYSLVSKISPDWISSMSIIRSHRTQEDTVVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGNQREGRLLCHGHYPEILVVDATSLEVLYSLVSKISPDWISSMSIIRSHRTQEDTVVAL
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pF1KA0 SVTGILKVWIVTSEISDMQDTEPIFEEESKPIYCQNCQSISFCAFTQRSLLVVCSKYWRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVTGILKVWIVTSEISDMQDTEPIFEEESKPIYCQNCQSISFCAFTQRSLLVVCSKYWRV
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pF1KA0 FDAGDYSLLCSGPSENGQTWTGGDFVSSDKVIIWTENGQSYIYKLPASCLPASDSFRSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDAGDYSLLCSGPSENGQTWTGGDFVSSDKVIIWTENGQSYIYKLPASCLPASDSFRSDV
250 260 270 280 290 300
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pF1KA0 GKAVENLIPPVQHILLDRKDKELLICPPVTRFFYGCREYFHKLLIQGDSSGRLNIWNISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GKAVENLIPPVQHILLDRKDKELLICPPVTRFFYGCREYFHKLLIQGDSSGRLNIWNISD
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TADKQGSEEGLAMTTSISLQEAFDKLNPCPAGIIDQLSVIPNSNEPLKVTASVYIPAHGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LVCGREDGSIVIVPATQTAIVQLLQGEHMLRRGWPPHRTLRGHRNKVTCLLYPHQVSARY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVCGREDGSIVIVPATQTAIVQLLQGEHMLRRGWPPHRTLRGHRNKVTCLLYPHQVSARY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DQRYLISGGVDFSVIIWDIFSGEMKHIFCVHGGEITQLLVPPENCSARVQHCICSVASDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DQRYLISGGVDFSVIIWDIFSGEMKHIFCVHGGEITQLLVPPENCSARVQHCICSVASDH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SVGLLSLREKKCIMLASRHLFPIQVIKWRPSDDYLVVGCSDGSVYVWQMDTGALDRCVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVGLLSLREKKCIMLASRHLFPIQVIKWRPSDDYLVVGCSDGSVYVWQMDTGALDRCVMG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ITAVEILNACDEAVPAAVDSLSHPAVNLKQAMTRRSLAALKNMAHHKLQTLATNLLASEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ITAVEILNACDEAVPAAVDSLSHPAVNLKQAMTRRSLAALKNMAHHKLQTLATNLLASEA
610 620 630 640 650 660
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pF1KA0 SDKGNLPKYSHNSLMVQAIKTNLTDPDIHVLFFDVEALIIQLLTEEASRPNTALISPENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDKGNLPKYSHNSLMVQAIKTNLTDPDIHVLFFDVEALIIQLLTEEASRPNTALISPENL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QKASGSSDKGGSFLTGKRAAVLFQQVKETIKENIKEHLLDDEEEDEEIMRQRREESDPEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QKASGSSDKGGSFLTGKRAAVLFQQVKETIKENIKEHLLDDEEEDEEIMRQRREESDPEY
730 740 750 760 770 780
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pF1KA0 RSSKSKPLTLLEYNLTMDTAKLFMSCLHAWGLNEVLDEVCLDRLGMLKPHCTVSFGLLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSSKSKPLTLLEYNLTMDTAKLFMSCLHAWGLNEVLDEVCLDRLGMLKPHCTVSFGLLSR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 GGHMSLMLPGYNQPACKLSHGKTEVGRKLPASEGVGKGTYGVSRAVTTQHLLSIISLANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGHMSLMLPGYNQPACKLSHGKTEVGRKLPASEGVGKGTYGVSRAVTTQHLLSIISLANT
850 860 870 880 890 900
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pF1KA0 LMSMTNATFIGDHMKKGPTRPPRPSTPDLSKARGSPPTSSNIVQGQIKQVAAPVVSARSD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LMSMTNATFIGDHMKKGPTRPPRPSTPDLSKARGSPPTSSNIVQGQIKQ-----------
910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 ADHSGSDPPSAPALHTCFLVNEGWSQLAAMHCVMLPDLLGLDKFRPPLLEMLARRWQDRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ----------------------GWSQLAAMHCVMLPDLLGLDKFRPPLLEMLARRWQDRC
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 LEVREAAQALLLAELRRIEQAGRKEAIDAWAPYLPQYIDHVISPGVTSEAAQTITTAPDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEVREAAQALLLAELRRIEQAGRKEAIDAWAPYLPQYIDHVISPGVTSEAAQTITTAPDA
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KA0 SGPEAKVQEEEHDLVDDDITTGCLSSVPQMKKISTSYEERRKQATAIVLLGVIGAEFGAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGPEAKVQEEEHDLVDDDITTGCLSSVPQMKKISTSYEERRKQATAIVLLGVIGAEFGAE
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KA0 IEPPKLLTRPRSSSQIPEGFGLTSGGSNYSLARHTCKALTFLLLQPPSPKLPPHSTIRRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IEPPKLLTRPRSSSQIPEGFGLTSGGSNYSLARHTCKALTFLLLQPPSPKLPPHSTIRRT
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 AIDLIGRGFTVWEPYMDVSAVLMGLLELCADAEKQLANITMGLPLSPAADSARSARHALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AIDLIGRGFTVWEPYMDVSAVLMGLLELCADAEKQLANITMGLPLSPAADSARSARHALS
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KA0 LIATARPPAFITTIAKEVHRHTALAANTQSQQNMHTTTLARAKGEILRVIEILIEKMPTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIATARPPAFITTIAKEVHRHTALAANTQSQQNMHTTTLARAKGEILRVIEILIEKMPTD
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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pF1KA0 VVDLLVEVMDIIMYCLEGSLVKKKGLQECFPAICRFYMVSYYERNHRIAVGARHGSVALY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVDLLVEVMDIIMYCLEGSLVKKKGLQECFPAICRFYMVSYYERNHRIAVGARHGSVALY
1290 1300 1310 1320 1330 1340
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pF1KA0 DIRTGKCQTIHGHKGPITAVAFAPDGRYLATYSNTDSHISFWQMNTSLLGSIGMLNSAPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DIRTGKCQTIHGHKGPITAVAFAPDGRYLATYSNTDSHISFWQMNTSLLGSIGMLNSAPQ
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pF1KA0 LRCIKTYQVPPVQPASPGSHNALKLARLIWTSNRNVILMAHDGKEHRFMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRCIKTYQVPPVQPASPGSHNALKLARLIWTSNRNVILMAHDGKEHRFMV
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>>XP_016881172 (OMIM: 613473) PREDICTED: WD repeat-conta (982 aa)
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Smith-Waterman score: 6367; 100.0% identity (100.0% similar) in 965 aa overlap (526-1490:18-982)
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 IWDIFSGEMKHIFCVHGGEITQLLVPPENCSARVQHCICSVASDHSVGLLSLREKKCIML
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSSEDRLQTPFSNSTYMSARVQHCICSVASDHSVGLLSLREKKCIML
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pF1KA0 ASRHLFPIQVIKWRPSDDYLVVGCSDGSVYVWQMDTGALDRCVMGITAVEILNACDEAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASRHLFPIQVIKWRPSDDYLVVGCSDGSVYVWQMDTGALDRCVMGITAVEILNACDEAVP
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pF1KA0 AAVDSLSHPAVNLKQAMTRRSLAALKNMAHHKLQTLATNLLASEASDKGNLPKYSHNSLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAVDSLSHPAVNLKQAMTRRSLAALKNMAHHKLQTLATNLLASEASDKGNLPKYSHNSLM
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pF1KA0 VQAIKTNLTDPDIHVLFFDVEALIIQLLTEEASRPNTALISPENLQKASGSSDKGGSFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VQAIKTNLTDPDIHVLFFDVEALIIQLLTEEASRPNTALISPENLQKASGSSDKGGSFLT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GKRAAVLFQQVKETIKENIKEHLLDDEEEDEEIMRQRREESDPEYRSSKSKPLTLLEYNL
230 240 250 260 270 280
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pF1KA0 TMDTAKLFMSCLHAWGLNEVLDEVCLDRLGMLKPHCTVSFGLLSRGGHMSLMLPGYNQPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TMDTAKLFMSCLHAWGLNEVLDEVCLDRLGMLKPHCTVSFGLLSRGGHMSLMLPGYNQPA
290 300 310 320 330 340
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pF1KA0 CKLSHGKTEVGRKLPASEGVGKGTYGVSRAVTTQHLLSIISLANTLMSMTNATFIGDHMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CKLSHGKTEVGRKLPASEGVGKGTYGVSRAVTTQHLLSIISLANTLMSMTNATFIGDHMK
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pF1KA0 KGPTRPPRPSTPDLSKARGSPPTSSNIVQGQIKQVAAPVVSARSDADHSGSDPPSAPALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGPTRPPRPSTPDLSKARGSPPTSSNIVQGQIKQVAAPVVSARSDADHSGSDPPSAPALH
410 420 430 440 450 460
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pF1KA0 TCFLVNEGWSQLAAMHCVMLPDLLGLDKFRPPLLEMLARRWQDRCLEVREAAQALLLAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TCFLVNEGWSQLAAMHCVMLPDLLGLDKFRPPLLEMLARRWQDRCLEVREAAQALLLAEL
470 480 490 500 510 520
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pF1KA0 RRIEQAGRKEAIDAWAPYLPQYIDHVISPGVTSEAAQTITTAPDASGPEAKVQEEEHDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRIEQAGRKEAIDAWAPYLPQYIDHVISPGVTSEAAQTITTAPDASGPEAKVQEEEHDLV
530 540 550 560 570 580
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pF1KA0 DDDITTGCLSSVPQMKKISTSYEERRKQATAIVLLGVIGAEFGAEIEPPKLLTRPRSSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDDITTGCLSSVPQMKKISTSYEERRKQATAIVLLGVIGAEFGAEIEPPKLLTRPRSSSQ
590 600 610 620 630 640
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pF1KA0 IPEGFGLTSGGSNYSLARHTCKALTFLLLQPPSPKLPPHSTIRRTAIDLIGRGFTVWEPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPEGFGLTSGGSNYSLARHTCKALTFLLLQPPSPKLPPHSTIRRTAIDLIGRGFTVWEPY
650 660 670 680 690 700
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pF1KA0 MDVSAVLMGLLELCADAEKQLANITMGLPLSPAADSARSARHALSLIATARPPAFITTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MDVSAVLMGLLELCADAEKQLANITMGLPLSPAADSARSARHALSLIATARPPAFITTIA
710 720 730 740 750 760
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA0 KEVHRHTALAANTQSQQNMHTTTLARAKGEILRVIEILIEKMPTDVVDLLVEVMDIIMYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEVHRHTALAANTQSQQNMHTTTLARAKGEILRVIEILIEKMPTDVVDLLVEVMDIIMYC
770 780 790 800 810 820
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA0 LEGSLVKKKGLQECFPAICRFYMVSYYERNHRIAVGARHGSVALYDIRTGKCQTIHGHKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEGSLVKKKGLQECFPAICRFYMVSYYERNHRIAVGARHGSVALYDIRTGKCQTIHGHKG
830 840 850 860 870 880
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA0 PITAVAFAPDGRYLATYSNTDSHISFWQMNTSLLGSIGMLNSAPQLRCIKTYQVPPVQPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PITAVAFAPDGRYLATYSNTDSHISFWQMNTSLLGSIGMLNSAPQLRCIKTYQVPPVQPA
890 900 910 920 930 940
1460 1470 1480 1490
pF1KA0 SPGSHNALKLARLIWTSNRNVILMAHDGKEHRFMV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPGSHNALKLARLIWTSNRNVILMAHDGKEHRFMV
950 960 970 980
>>XP_011519737 (OMIM: 613211,613214) PREDICTED: WD repea (1102 aa)
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pF1KA0 MAGNSLVLPIVLWGRKAPTHCISAVLLTDDGATIVTGCHDGQICLWDLSVELQINPRALL
..:::.::: : :.:...::: ::::: ..::.:::.:: ::.:. . ::
XP_011 MRTSLQAVALWGQKAPPHSITAIMITDDQRTIVTGSQEGQLCLWNLSHELKISAKELL
10 20 30 40 50
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pF1KA0 FGHTASITCLSKACASSDKQYIVSASESGEMCLWDVSDGRCIEFTKLACTHTGIQFYQFS
:::.::.:::..: : . :::::.:.::::.:.:..:.:.: . : ::.: .:. :
XP_011 FGHSASVTCLARARDFSKQPYIVSAAENGEMCVWNVTNGQCMEKATLPYRHTAICYYHCS
60 70 80 90 100 110
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pF1KA0 VGNQREGRLLCHGHYPEILVVDATSLEVLYSLVSKISPDWISSMSIIRSHRTQEDTVVAL
:: ::: :.: ..:..:: .: :..:. :. ::::. : :..: : :::.....
XP_011 FRMTGEGWLLCCGEYQDVLIIDAKTLAVVHSFRSSQFPDWINCMCIVHSMRIQEDSLLVV
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 SVTGILKVWIVTSEISDMQDTEPIFEEESKPIYCQNCQSISFCAFTQRSLLVVCSKYWRV
::.: :::: ..: :...:. . ..:.::: . :::.: ::..:.: :::: :: :.:
XP_011 SVAGELKVWDLSSSINSIQEKQDVYEKESKFLESLNCQTIRFCTYTERLLLVVFSKCWKV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 FDAGDYSLLCSGPSENGQTWTGGDFVSSDKVIIWTENGQSYIYKLPASCLPASDSFRSDV
.: :.::: . :.::: ..::. ... ...::::.:.::::.: : : : :.
XP_011 YDYCDFSLLLTEVSRNGQFFAGGEVIAAHRILIWTEDGHSYIYQLLNSGL--SKSIYPAD
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KA0 GKAVENLIPPVQHILLD---RKDKELLICPPVTRFFYGCREYFHKLLIQGDSSGRLNIWN
:..... : : :.: . ...:: : : .. .: :.:.:..:. :::...:.
XP_011 GRVLKETIYP--HLLCSTSVQENKEQSR-PFVMGYMNERKEPFYKVLFSGEVSGRITLWH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 ISDTADKQ--GSEEGLAMTTSISLQEAFDKLNPCPAGIIDQLSVIPNSNEPLKVTASVYI
: :. .. :: . . .:.. .::. ::: . .::: .: . .. ::.: ::
XP_011 IPDVPVSKFDGSPREIPVTATWTLQDNFDKHDTMSQSIIDYFSGLKDGAGTAVVTSSEYI
360 370 380 390 400 410
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pF1KA0 PAHGRLVCGREDGSIVIVPATQTAIVQLLQGEHMLRRGWPPHRTLRGHRNKVTCLLYPHQ
:. .:.:: :::.:.:. : ..: ..::.: ... . :::..:.::...:: :::::
XP_011 PSLDKLICGCEDGTIIITQALNAAKARLLEGGSLVKDS-PPHKVLKGHHQSVTSLLYPHG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 VSARYDQRYLISGGVDFSVIIWDIFSGEMKHIFCVHGGEITQLLVPPENCSARVQHCICS
.:.. :: ...:: .: ::.::::. :. : : ...: .:.::. ::. . : .. ::
XP_011 LSSKLDQSWMLSGDLDSCVILWDIFTEEILHKFFLEAGPVTSLLMSPEKFKLRGEQIICC
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 VASDHSVGLLSLREKKCIMLASRHLFPIQVIKWRPSDDYLVVGCSDGSVYVWQMDTGALD
: .::::.:: :. :.:.. : .::::...:::.: ...:.:::.: :::.:...::.:.
XP_011 VCGDHSVALLHLEGKSCLLHARKHLFPVRMIKWHPVENFLIVGCADDSVYIWEIETGTLE
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KA0 RCVMGITAVEILNACDEA------VPAAVDSLSHPAVNLKQAMTRRSLAALKNMAHHKLQ
: : : ::: ::.. .: : ..:.: ... ... . ..:
XP_011 RHETGERARIILNCCDDSQLVKSVLPIASETLKHKSIEQRSS------------SPYQLG
600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 TLATNLLASEASDKGNLPKYSHNSLMVQAIKTNLTDPDIHVLFFDVEALIIQLLTEEASR
: : :.: : . :. . : .::. .. .:.:.::.: :. :: :
XP_011 PLPCPGLQVESSCKVTDAKFCPRPFNVLPVKTKWSNVGFHILLFDLENLVELLLPTPLSD
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 --PNTALISPENLQKASGSSDKGGSFLTGKRAA-------VLFQQVKETIKENIKEHLLD
.... . : :..:... .: : ...: .: . . :.. .. .. .
XP_011 VDSSSSFYGGEVLRRAKSTVEKKTLTLRKSKTACGPLSAEALAKPITESLAQG--DNTIK
710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 DEEEDEEIMRQRREESDPEYRSSKSKPLTLLEYNLTMDTAKLFMSCLHAWGLNEVLDEVC
::.. : ::.. . . .. . :: .. .::.::::::.::: ::... :: .:
XP_011 FSEENDGIKRQKKMKIS---KKMQPKPSRKVDASLTIDTAKLFLSCLLPWGVDKDLDYLC
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860
pF1KA0 LDRLGMLKPHCTVSFGLLSRGGHMSLMLPGY---NQPACKLSHGKTEVGRK---------
. .:..:: . .:.:. ..::::::. :. : : . .::
XP_011 IKHLNILKLQGPISLGISLNEDNFSLMLPGWDLCNSGMIKDYSGVNLFSRKVLDLSDKYT
820 830 840 850 860 870
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 --LPASEGVGKGTYG----VSRAVTTQHLLSIISLANTLMSMTNATFIGDHMKKGPTRPP
:: . :. .: . . .. : .::: . :.: :..:
XP_011 ATLPNQVGIPRGLENNCDSLRESDTIVYLLSRLFLVNKLVNMPLELACRVGSSFRMESIH
880 890 900 910 920 930
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 RPSTPDLSKARGSPPTSSNIVQGQIKQVAAPVVSARSDADHSGSDPPSAPALHTCFLVNE
XP_011 NKMRGAGNDILNMSSFYSCLRNGKNESHVPEADLSLLKLISCWRDQSVQVTEAIQAVLLA
940 950 960 970 980 990
>>XP_011519735 (OMIM: 613211,613214) PREDICTED: WD repea (1102 aa)
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Smith-Waterman score: 2074; 37.4% identity (67.5% similar) in 933 aa overlap (10-904:8-917)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAGNSLVLPIVLWGRKAPTHCISAVLLTDDGATIVTGCHDGQICLWDLSVELQINPRALL
..:::.::: : :.:...::: ::::: ..::.:::.:: ::.:. . ::
XP_011 MRTSLQAVALWGQKAPPHSITAIMITDDQRTIVTGSQEGQLCLWNLSHELKISAKELL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 FGHTASITCLSKACASSDKQYIVSASESGEMCLWDVSDGRCIEFTKLACTHTGIQFYQFS
:::.::.:::..: : . :::::.:.::::.:.:..:.:.: . : ::.: .:. :
XP_011 FGHSASVTCLARARDFSKQPYIVSAAENGEMCVWNVTNGQCMEKATLPYRHTAICYYHCS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VGNQREGRLLCHGHYPEILVVDATSLEVLYSLVSKISPDWISSMSIIRSHRTQEDTVVAL
:: ::: :.: ..:..:: .: :..:. :. ::::. : :..: : :::.....
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