FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0533, 3690 aa
1>>>pF1KA0533 3690 - 3690 aa - 3690 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5352+/-0.000548; mu= 8.9920+/- 0.034
mean_var=371.0560+/-74.919, 0's: 0 Z-trim(118.0): 324 B-trim: 122 in 1/56
Lambda= 0.066582
statistics sampled from 30177 (30551) to 30177 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.358), width: 16
Scan time: 29.310
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005551 (OMIM: 601033) laminin subunit alpha-5 p (3695) 26126 2527.2 0
XP_006723859 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3700) 25328 2450.6 0
XP_011527120 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3654) 20630 1999.3 0
XP_011527121 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3609) 20470 1983.9 0
XP_006723861 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (2300) 16921 1642.8 0
XP_011524281 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3339) 2829 289.3 8.5e-76
XP_011524284 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3243) 2824 288.8 1.2e-75
XP_011524280 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3342) 2824 288.8 1.2e-75
XP_011524282 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3336) 2782 284.8 1.9e-74
XP_011524283 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3298) 2686 275.6 1.1e-71
NP_001121189 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l (3277) 2681 275.1 1.6e-71
NP_937762 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) lami (3333) 2681 275.1 1.6e-71
XP_016881232 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (2626) 2626 269.7 5.4e-70
NP_001289925 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l ( 488) 1991 207.8 4.3e-52
NP_000218 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) lami (1724) 1743 184.7 1.4e-44
XP_011523958 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (2561) 1449 156.6 5.7e-36
XP_011523959 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (2489) 1432 155.0 1.7e-35
NP_005550 (OMIM: 150320,615960) laminin subunit al (3075) 1432 155.1 2e-35
XP_011523957 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (3085) 1432 155.1 2e-35
NP_001121190 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l (1668) 1380 149.8 4.3e-34
XP_016866342 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (1916) 1329 144.9 1.4e-32
NP_001073291 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit (3118) 1329 145.2 1.9e-32
NP_000417 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit al (3122) 1329 145.2 1.9e-32
XP_005267039 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3206) 1329 145.2 2e-32
XP_011534122 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3208) 1329 145.2 2e-32
XP_005267038 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3210) 1329 145.2 2e-32
XP_016866340 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3212) 1324 144.7 2.7e-32
XP_016881233 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (1856) 1210 133.5 3.8e-29
NP_005520 (OMIM: 142461,224410,255800) basement me (4391) 1148 128.0 4.1e-27
NP_001278789 (OMIM: 142461,224410,255800) basement (4392) 1148 128.0 4.1e-27
XP_016856611 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4438) 1148 128.0 4.1e-27
XP_016856610 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4439) 1148 128.0 4.1e-27
XP_016856609 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4456) 1148 128.0 4.1e-27
XP_011539620 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4574) 1148 128.0 4.2e-27
XP_011516423 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1581) 1125 125.2 9.9e-27
NP_006050 (OMIM: 604349,614115) laminin subunit ga (1575) 1104 123.2 4e-26
XP_006716984 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1259) 1074 120.2 2.6e-25
XP_006721658 (OMIM: 601614) PREDICTED: netrin-1 is ( 604) 901 103.2 1.6e-20
NP_004813 (OMIM: 601614) netrin-1 precursor [Homo ( 604) 901 103.2 1.6e-20
NP_002281 (OMIM: 600133,615235) laminin subunit al (1816) 864 100.2 3.8e-19
XP_016866343 (OMIM: 600133,615235) PREDICTED: lami (1816) 864 100.2 3.8e-19
NP_001098677 (OMIM: 600133,615235) laminin subunit (1816) 864 100.2 3.8e-19
XP_005267040 (OMIM: 600133,615235) PREDICTED: lami (1823) 849 98.8 1e-18
NP_001098676 (OMIM: 600133,615235) laminin subunit (1823) 849 98.8 1e-18
XP_005267041 (OMIM: 600133,615235) PREDICTED: lami (1823) 849 98.8 1e-18
NP_000219 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) lami (1172) 823 96.1 4.4e-18
NP_001017402 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172) 823 96.1 4.4e-18
NP_001121113 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172) 823 96.1 4.4e-18
XP_005273181 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) P (1172) 823 96.1 4.4e-18
XP_016856762 (OMIM: 150292,226650,226700) PREDICTE ( 742) 810 94.6 7.8e-18
>>NP_005551 (OMIM: 601033) laminin subunit alpha-5 precu (3695 aa)
initn: 25346 init1: 25346 opt: 26126 Z-score: 13575.6 bits: 2527.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 26126; 99.7% identity (99.8% similar) in 3695 aa overlap (1-3690:1-3695)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAHPASNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAHPASNA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDFGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDFGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLVNGRPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLVNGRPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 AMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDISIGGRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDISIGGRC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANECQSCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANECQSCN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 CYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRSPNHPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRSPNHPL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSND
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 TREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 CQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 EAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAGGLCRCRPGYTGTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAGGLCRCRPGYTGTA
610 620 630 640 650 660
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pF1KA0 CQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRCDTCVPGAYNFPYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRCDTCVPGAYNFPYC
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pF1KA0 EAGSCHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGCTRCSCDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EAGSCHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGCTRCSCDL
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pF1KA0 RGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDIGGALGQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDIGGALGQS
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pF1KA0 CEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAMRFGFNPLEFEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
NP_005 CEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAVRFGFNPLEFEN
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pF1KA0 FSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVREEGRSATCANC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVREEGRSATCANC
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pF1KA0 TAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRVEAEGVLLDYVVLLPSAYYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRVEAEGVLLDYVVLLPSAYYEA
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pF1KA0 ALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCRQDNSLPRPCPTEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCRQDNSLPRPCPTEQL
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pF1KA0 SPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTPQRAPQQGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTPQRAPQQGLL
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pF1KA0 SLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFV
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NP_005 SLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFV
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 EPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSP
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NP_005 EPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSP
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pF1KA0 AGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAHPTFPVEVLIN
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NP_005 AGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAHPTFPVEVLIN
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pF1KA0 AGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPEGRWLWLDYVLVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_005 AGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPKGRWLWLDYVLVVP
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pF1KA0 ENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGC
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pF1KA0 HEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARLCDELTGQCIC
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NP_005 HEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARLCDELTGQCIC
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pF1KA0 PPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KA0 CDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAA
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pF1KA0 NPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRH
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1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 VPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGN
1690 1700 1710 1720 1730 1740
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pF1KA0 QMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFS
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 QISSAVSLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDVKGLFLGR
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QISSAVFLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDVKGLFLGR
1810 1820 1830 1840 1850 1860
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pF1KA0 CVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDPSAPCVSCPCPLSVP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_005 CVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFVSSRDDPSAPCVSCPCPLSVP
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NP_005 YCGCMRRLAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
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XP_006 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAHPASNA
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XP_006 EPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSP
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XP_011 CQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAGGLCRCRPGYTGTA
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XP_011 CQECSPGFHGFPSCVP--------------------------------------------
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDIGGALGQS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
XP_011 CEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAVRFGFNPLEFEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 SPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTPQRAPQQGLL
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XP_011 SLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFV
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pF1KA0 EPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSP
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 AGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAHPTFPVEVLIN
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XP_011 AGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAHPTFPVEVLIN
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 AGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPEGRWLWLDYVLVVP
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XP_011 AGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPKGRWLWLDYVLVVP
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 ENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGC
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XP_011 ENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGC
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 HEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARLCDELTGQCIC
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XP_011 HEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARLCDELTGQCIC
1400 1410 1420 1430 1440 1450
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pF1KA0 PPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRR
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XP_011 PPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRR
1460 1470 1480 1490 1500 1510
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pF1KA0 CDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAA
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XP_011 CDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAA
1520 1530 1540 1550 1560 1570
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pF1KA0 NPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRH
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XP_011 NPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRH
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pF1KA0 VPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGN
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XP_011 VPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGN
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pF1KA0 QMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFS
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XP_011 QMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFS
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pF1KA0 QISSAVSLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDVKGLFLGR
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QISSAVFLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDVKGLFLGR
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_011 CVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFVSSRDDPSAPCVSCPCPLSVP
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pF1KA0 SNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLL
1880 1890 1900 1910 1920 1930
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 FSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPRSGHC
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XP_011 FSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPHSGHC
1940 1950 1960 1970 1980 1990
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 LCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCR
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XP_011 LCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCR
2000 2010 2020 2030 2040 2050
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pF1KA0 ECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGH
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XP_011 ECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGH
2060 2070 2080 2090 2100 2110
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pF1KA0 SIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNASIADLQSQLR
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XP_011 SIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNASIADLQSQLR
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pF1KA0 SPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEATLGHAKTLLA
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPLGPRHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEATLGHAKTLLA
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pF1KA0 AIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARDLGAPQAAAEA
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XP_011 AIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARDLGAPQAAAEA
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pF1KA0 ELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDATREAQE
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XP_011 ELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDATREAQE
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pF1KA0 LNSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEELERLAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEELERLAAS
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pF1KA0 LDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQDRLTQRAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQDRLTQRAIE
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pF1KA0 ASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLLANSTALEEAMLQEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLLANSTALEEAMLQEQ
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pF1KA0 QRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETSKKIAHAKAVAAEAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETSKKIAHAKAVAAEAQ
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pF1KA0 DTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSIL
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pF1KA0 ENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSGVQLRTPRDLADLAAYT
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XP_011 ENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSGVQLRTPRDLADLAAYT
2660 2670 2680 2690 2700 2710
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pF1KA0 ALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKKVHWVYQLGEAGPAVLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKKVHWVYQLGEAGPAVLSI
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pF1KA0 DEDIGEKFAAVSLDRTLQFGHMSVTVERQMIQETKGDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGG
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DEDIGEQFAAVSLDRTLQFGHMSVTVERQMIQETKGDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGG
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pF1KA0 YPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWL
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pF1KA0 TDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVL
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XP_011 TDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVL
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pF1KA0 LYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGGSRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELA
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XP_011 LYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGGSRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELA
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pF1KA0 DAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFPTGGSVRGCVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLL
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XP_011 DAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFPTGGSVRGCVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLL
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pF1KA0 VGRAMTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNVYSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGR
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XP_011 VGRAMTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNVYSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGR
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pF1KA0 VSLQLLRTEVKTQAGFADGAPHYVAFYSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSLQLLRTEVKTQAGFADGAPHYVAFYSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEG
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pF1KA0 PPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQRLLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTGCAPALQAQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQRLLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTGCAPALQAQT
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pF1KA0 PGLGPRGLQATARK-----ASRRSRQPARHPACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFVG
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGLGPRGLQATARKVGTPGASRRSRQPARHPACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFVG
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pF1KA0 ILARHRNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILARHRNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQ
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pF1KA0 SRQRSRPGRWHKVSVRWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRQRSRPGRWHKVSVRWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPAS
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pF1KA0 SHSSKLPVTVGFSGCVKRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SHSSKLPVTVGFSGCVKRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDL
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pF1KA0 PGATLPDVGLELEVRPLAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQV-----LLRADDGAGEFSTSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
XP_011 PGATLPDVGLELEVRPLAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQVTEKQVLLRADDGAGEFSTSVT
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pF1KA0 RPSVLCDGQWHRLAVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQ
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XP_011 RPSVLCDGQWHRLAVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQ
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pF1KA0 PWPPAYCGCMRRLAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
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XP_011 PWPPAYCGCMRRLAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
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>>XP_011527121 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin subunit (3609 aa)
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Smith-Waterman score: 25180; 97.1% identity (97.2% similar) in 3700 aa overlap (1-3690:1-3609)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAHPASNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAHPASNA
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pF1KA0 IDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDFGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDFGR
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pF1KA0 TYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLVNGRPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLVNGRPG
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pF1KA0 AMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDISIGGRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDISIGGRC
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pF1KA0 VCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANECQSCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANECQSCN
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pF1KA0 CYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRSPNHPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRSPNHPL
370 380 390 400 410 420
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pF1KA0 DSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSND
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pF1KA0 TREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQP
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pF1KA0 CQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCD
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:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQA-----------------------------
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XP_011 ------------------------------------------------------------
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 --GSCHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGCTRCSCDL
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pF1KA0 RGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDIGGALGQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDIGGALGQS
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pF1KA0 CEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAMRFGFNPLEFEN
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XP_011 CEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAVRFGFNPLEFEN
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pF1KA0 FSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVREEGRSATCANC
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XP_011 FSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVREEGRSATCANC
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pF1KA0 TAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRVEAEGVLLDYVVLLPSAYYEA
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XP_011 TAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRVEAEGVLLDYVVLLPSAYYEA
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XP_011 ALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCRQDNSLPRPCPTEQL
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XP_011 SPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTPQRAPQQGLL
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XP_011 SLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFV
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pF1KA0 EPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSP
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XP_011 EPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSP
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pF1KA0 AGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAHPTFPVEVLIN
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XP_011 AGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAHPTFPVEVLIN
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pF1KA0 AGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPEGRWLWLDYVLVVP
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XP_011 AGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPKGRWLWLDYVLVVP
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pF1KA0 ENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGC
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XP_011 ENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGC
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pF1KA0 HEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARLCDELTGQCIC
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XP_011 HEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARLCDELTGQCIC
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pF1KA0 PPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRR
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XP_011 PPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRR
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pF1KA0 CDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAA
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XP_011 CDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAA
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pF1KA0 NPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRH
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XP_011 NPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRH
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pF1KA0 VPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGN
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XP_011 VPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGN
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pF1KA0 QMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFS
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XP_011 QMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFS
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pF1KA0 QISSAVSLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDVKGLFLGR
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XP_011 QISSAVFLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDVKGLFLGR
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pF1KA0 CVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDPSAPCVSCPCPLSVP
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XP_011 CVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFVSSRDDPSAPCVSCPCPLSVP
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pF1KA0 SNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLL
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XP_011 SNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLL
1830 1840 1850 1860 1870 1880
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 FSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPRSGHC
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XP_011 FSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPHSGHC
1890 1900 1910 1920 1930 1940
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 LCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCR
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XP_011 LCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCR
1950 1960 1970 1980 1990 2000
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 ECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGH
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XP_011 ECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGH
2010 2020 2030 2040 2050 2060
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 SIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNASIADLQSQLR
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XP_011 SIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNASIADLQSQLR
2070 2080 2090 2100 2110 2120
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pF1KA0 SPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEATLGHAKTLLA
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XP_011 SPLGPRHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEATLGHAKTLLA
2130 2140 2150 2160 2170 2180
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pF1KA0 AIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARDLGAPQAAAEA
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XP_011 AIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARDLGAPQAAAEA
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pF1KA0 ELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDATREAQE
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XP_011 ELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDATREAQE
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pF1KA0 LNSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEELERLAAS
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XP_011 LNSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEELERLAAS
2310 2320 2330 2340 2350 2360
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pF1KA0 LDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQDRLTQRAIE
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XP_011 LDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQDRLTQRAIE
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pF1KA0 ASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLLANSTALEEAMLQEQ
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XP_011 ASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLLANSTALEEAMLQEQ
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pF1KA0 QRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETSKKIAHAKAVAAEAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETSKKIAHAKAVAAEAQ
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pF1KA0 DTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSIL
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XP_011 DTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSIL
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pF1KA0 ENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSGVQLRTPRDLADLAAYT
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XP_011 ENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSGVQLRTPRDLADLAAYT
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pF1KA0 ALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKKVHWVYQLGEAGPAVLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKKVHWVYQLGEAGPAVLSI
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pF1KA0 DEDIGEKFAAVSLDRTLQFGHMSVTVERQMIQETKGDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGG
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XP_011 DEDIGEQFAAVSLDRTLQFGHMSVTVERQMIQETKGDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGG
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pF1KA0 YPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWL
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pF1KA0 TDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVL
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XP_011 TDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGGSRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELA
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pF1KA0 DAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFPTGGSVRGCVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLL
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XP_011 DAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFPTGGSVRGCVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLL
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pF1KA0 VGRAMTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNVYSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGR
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XP_011 VGRAMTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNVYSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGR
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pF1KA0 VSLQLLRTEVKTQAGFADGAPHYVAFYSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSLQLLRTEVKTQAGFADGAPHYVAFYSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEG
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pF1KA0 PPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQRLLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTGCAPALQAQT
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XP_011 PPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQRLLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTGCAPALQAQT
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pF1KA0 PGLGPRGLQATARK-----ASRRSRQPARHPACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFVG
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XP_011 PGLGPRGLQATARKVGTPGASRRSRQPARHPACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFVG
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pF1KA0 ILARHRNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQ
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XP_011 ILARHRNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQ
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pF1KA0 SRQRSRPGRWHKVSVRWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPAS
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XP_011 SRQRSRPGRWHKVSVRWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPAS
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pF1KA0 SHSSKLPVTVGFSGCVKRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SHSSKLPVTVGFSGCVKRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
XP_011 PGATLPDVGLELEVRPLAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQVTEKQVLLRADDGAGEFSTSVT
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pF1KA0 RPSVLCDGQWHRLAVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RPSVLCDGQWHRLAVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQ
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pF1KA0 PWPPAYCGCMRRLAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PWPPAYCGCMRRLAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA
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>>XP_006723861 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin subunit (2300 aa)
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Smith-Waterman score: 16921; 99.7% identity (100.0% similar) in 2291 aa overlap (1-2291:1-2291)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA
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pF1KA0 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAHPASNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAHPASNA
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 IDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDFGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDFGR
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pF1KA0 TYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLVNGRPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLVNGRPG
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pF1KA0 AMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDISIGGRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDISIGGRC
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pF1KA0 VCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANECQSCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANECQSCN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRSPNHPL
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pF1KA0 DSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSND
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pF1KA0 NGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDIS
:::::: ::..: :::::::::.::::::::::::::..:: :::::::::::::::::
XP_011 NGRPGAKNFTFSHTLREFTKATNIRLRFLRTNTLLGHLISKAQRDPTVTRRYYYSIKDIS
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 IGGRCVCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANE
:::.:::.:::..:. ..: :: : :::.::: :::::: :.::. :.::. ....:
XP_011 IGGQCVCNGHAEVCNINNPEKLFR--CECQHHTCGETCDRCCTGYNQRRWRPAAWEQSHE
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pF1KA0 CQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRS
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XP_011 CEACNCHGHASNCYYDPDVERQQASLNTQGIYAGGGVCINCQHNTAGVNCEQCAKGYYRP
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:.:. :: .:. . : : :. :.:
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:: :: :::::.: ::.:: :: :...:: :::: :
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.. . . : .... : ::.:::... : ....:...: ..:...: ...:::.:: :
XP_011 NVKSSGSVLAGQVNIYSCNYSVLCRSAVIDHMSRIAMYELLADADIQLKGHMARFLLHQV
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. : : .: : . : : . :. :: :.. .:: ::::.:..: ::
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XP_011 GKSLVLVRVLVVPAENYDYQILHKKSMDKSLEFITNCGKNSFYLDPQTASRFCKNSARSL
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XP_011 GQCRCKPRITGRQCDRCASGFYRFPECVPCNCNRDGTEPGVCDPGTGACLCKENVEGTEC
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.... ::..:: :: .. : ....: ::.. :.:.:. . : .: . .:. :
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... . :: : . :. : :.. :..: .: : .: ..:::. . : ::..:..
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:: :..:. ...:. ::..: :: :.::. .:.. .. . : .: ..: ..
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:. ......: :.:::::. :: : .... .: ...: ::: :: ::..: .:: .:
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:. : :: :. .... . ::: .::: : : . :. ...:..
XP_011 PVASPRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQTT
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