FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0481, 709 aa
1>>>pF1KA0481 709 - 709 aa - 709 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3892+/-0.000905; mu= 8.4435+/- 0.055
mean_var=191.1903+/-38.091, 0's: 0 Z-trim(113.9): 23 B-trim: 113 in 1/51
Lambda= 0.092756
statistics sampled from 14445 (14461) to 14445 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.444), width: 16
Scan time: 4.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30984.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1 ( 709) 4609 629.2 6.3e-180
CCDS55676.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1 ( 631) 4079 558.3 1.3e-158
CCDS81418.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1 ( 514) 2960 408.4 1.3e-113
CCDS73010.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1 ( 469) 2942 406.0 6.5e-113
CCDS76257.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1 ( 484) 2942 406.0 6.7e-113
CCDS33855.1 TMCC1 gene_id:23023|Hs108|chr3 ( 653) 1964 275.2 2.1e-73
CCDS31877.1 TMCC3 gene_id:57458|Hs108|chr12 ( 477) 1574 222.9 8.5e-58
CCDS73506.1 TMCC3 gene_id:57458|Hs108|chr12 ( 446) 1555 220.4 4.7e-57
>>CCDS30984.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1 (709 aa)
initn: 4609 init1: 4609 opt: 4609 Z-score: 3343.7 bits: 629.2 E(32554): 6.3e-180
Smith-Waterman score: 4609; 100.0% identity (100.0% similar) in 709 aa overlap (1-709:1-709)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKRCRSDELQQQQGEEDGAGLEDAASHLPGADLRPGETTGANSAGGPTSDAGAAAAPNPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKRCRSDELQQQQGEEDGAGLEDAASHLPGADLRPGETTGANSAGGPTSDAGAAAAPNPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PRSKPPDLKKIQQLSEGSMFGHGLKHLFHSRRRSREREHQTSQDSQQHQQQQGMSDHDSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PRSKPPDLKKIQQLSEGSMFGHGLKHLFHSRRRSREREHQTSQDSQQHQQQQGMSDHDSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DEKERSPEMHRVSYAMSLHDLPARPTAFNRVLQQIRSRPSIKRGASLHSSSGGGSSGSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DEKERSPEMHRVSYAMSLHDLPARPTAFNRVLQQIRSRPSIKRGASLHSSSGGGSSGSSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RRTKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRSSSTTDTALLLADGSNVYLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RRTKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRSSSTTDTALLLADGSNVYLLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKIT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 EQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KA0 VSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS
670 680 690 700
>>CCDS55676.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1 (631 aa)
initn: 4079 init1: 4079 opt: 4079 Z-score: 2961.1 bits: 558.3 E(32554): 1.3e-158
Smith-Waterman score: 4079; 100.0% identity (100.0% similar) in 631 aa overlap (79-709:1-631)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 SDAGAAAAPNPGPRSKPPDLKKIQQLSEGSMFGHGLKHLFHSRRRSREREHQTSQDSQQH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MFGHGLKHLFHSRRRSREREHQTSQDSQQH
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 QQQQGMSDHDSPDEKERSPEMHRVSYAMSLHDLPARPTAFNRVLQQIRSRPSIKRGASLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QQQQGMSDHDSPDEKERSPEMHRVSYAMSLHDLPARPTAFNRVLQQIRSRPSIKRGASLH
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 SSSGGGSSGSSSRRTKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRSSSTTDTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSSGGGSSGSSSRRTKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRSSSTTDTAL
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 LLADGSNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLADGSNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAA
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 IDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIA
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 QLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKG
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 SLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLV
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 SSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKE
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 GQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELA
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 SMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFIN
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 VILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLP
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 S
:
CCDS55 S
>>CCDS81418.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1 (514 aa)
initn: 2949 init1: 2949 opt: 2960 Z-score: 2153.1 bits: 408.4 E(32554): 1.3e-113
Smith-Waterman score: 2960; 94.5% identity (96.8% similar) in 495 aa overlap (216-709:22-514)
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRS-SSTTDTALLLADGSNVYLLAEEAE
: : . ....:. : : :.. :. :
CCDS81 MAAAESGNSGTPARSPVLPRVCDPGGLTQSADSWGLRAPGTSSP--ARLRE
10 20 30 40
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIK
. .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TVPTQVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIK
50 60 70 80 90 100
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 IEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEI
110 120 130 140 150 160
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSK
170 180 190 200 210 220
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASA
230 240 250 260 270 280
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQL
290 300 310 320 330 340
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 QRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARD
350 360 370 380 390 400
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 IQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVFVSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVFVSTI
410 420 430 440 450 460
670 680 690 700
pF1KA0 ANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS
470 480 490 500 510
>>CCDS73010.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1 (469 aa)
initn: 2942 init1: 2942 opt: 2942 Z-score: 2140.6 bits: 406.0 E(32554): 6.5e-113
Smith-Waterman score: 2942; 100.0% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (250-709:10-469)
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 SSSTTDTALLLADGSNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MKSKEEETAVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGA
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 PDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKK
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 NQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFG
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 GGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAAR
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 ALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDAL
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNE
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 MTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANA
340 350 360 370 380 390
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLT
400 410 420 430 440 450
700
pF1KA0 YLLEHVLLPS
::::::::::
CCDS73 YLLEHVLLPS
460
>>CCDS76257.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1 (484 aa)
initn: 2942 init1: 2942 opt: 2942 Z-score: 2140.4 bits: 406.0 E(32554): 6.7e-113
Smith-Waterman score: 2942; 100.0% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (250-709:25-484)
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 SSSTTDTALLLADGSNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MNQVVQPLMSRHSACRGSQAHLSWVDKGDLVALSLPAGHGDTDGPISLDVPDGA
10 20 30 40 50
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 PDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKK
60 70 80 90 100 110
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 NQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFG
120 130 140 150 160 170
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 GGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNIAHLKDPLEDGPPEEAAR
180 190 200 210 220 230
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 ALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNLDAL
240 250 260 270 280 290
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNE
300 310 320 330 340 350
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 MTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANA
360 370 380 390 400 410
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLT
420 430 440 450 460 470
700
pF1KA0 YLLEHVLLPS
::::::::::
CCDS76 YLLEHVLLPS
480
>>CCDS33855.1 TMCC1 gene_id:23023|Hs108|chr3 (653 aa)
initn: 1984 init1: 862 opt: 1964 Z-score: 1431.3 bits: 275.2 E(32554): 2.1e-73
Smith-Waterman score: 2132; 55.2% identity (75.6% similar) in 685 aa overlap (47-703:3-646)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 DGAGLEDAASHLPGADLRPGETTGANSAGGPTSDAGAAAAPNPGPRSKPPDLKKI----Q
:... :.:: .:. . .: :
CCDS33 MEPSGSEQLFEDPDPGGKSQDAEARKQTESEQ
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KA0 QLSEGS--------MFGHGLKHLF-HSRRRSREREHQTSQDSQQHQQQQGMSDHDSPDEK
.::. . ..:.:::::: :.:::: : : :: : . :.
CCDS33 KLSKMTHNALENINVIGQGLKHLFQHQRRRSSVSPH----DVQQIQAD--------PE--
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CCDS33 ---PEMDLESQNACAEIDGVPTHPTALNRVLQQIRVPPKMKRGTSLHS-----------R
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: : : .:::.. ::. :. ..:.... ::::::::: .:.. : .
CCDS33 RGKP---EAPKGSPQINRKSGQE--MTAVMQSG--RPRSSSTTDAPTSSAMMEIACAAAA
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CCDS33 LQQKILKLTEQIKIAQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQ
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CCDS33 KKLEHYHRKLREVEQNGIPRQPKDVFRDMHQGLKDVGAKV----TGFSEGVVDSVKGGFS
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CCDS33 SFSQATHSAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQ
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CCDS33 SMEEKIAYQSYERARDIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLIN
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CCDS33 ILLAVMAVLLVFVSTVANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSS
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pF1KA0 S
CCDS33 PR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]