Result of FASTA (omim) for
pF1KA0412
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0412, 627 aa
1>>>pF1KA0412 627 - 627 aa - 627 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7117+/-0.000695; mu= 15.5003+/- 0.044
mean_var=314.0516+/-60.666, 0's: 0 Z-trim(114.0): 2045 B-trim: 26 in 1/52
Lambda= 0.072373
statistics sampled from 21254 (23575) to 21254 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 7.290
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003408 (OMIM: 604668) zinc finger protein 264 [ ( 627) 4432 477.9 4.6e-134
XP_011525824 (OMIM: 604668) PREDICTED: zinc finger ( 595) 3851 417.2 8.2e-116
NP_998763 (OMIM: 616847) zinc finger protein 543 [ ( 600) 3112 340.0 1.4e-92
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1685 191.1 1e-47
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1685 191.1 1e-47
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1685 191.1 1e-47
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1685 191.1 1e-47
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1685 191.1 1e-47
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1685 191.1 1e-47
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1685 191.1 1e-47
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1685 191.1 1e-47
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1685 191.1 1e-47
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1685 191.1 1.1e-47
NP_060770 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 [H ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001264876 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001099021 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001264881 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001264875 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001264877 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001099019 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
XP_016882440 (OMIM: 194558) PREDICTED: zinc finger ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001264874 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001264880 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001264878 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001099022 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001099020 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1676 190.0 1.8e-47
NP_001317551 (OMIM: 604755) zinc finger protein 46 ( 521) 1667 189.1 3.4e-47
XP_016881665 (OMIM: 604755) PREDICTED: zinc finger ( 555) 1667 189.1 3.5e-47
NP_006626 (OMIM: 604755) zinc finger protein 460 i ( 562) 1667 189.1 3.5e-47
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1665 189.1 4.8e-47
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1665 189.1 4.8e-47
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1665 189.1 4.8e-47
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1665 189.2 4.9e-47
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 1665 189.2 5e-47
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 1650 187.3 1.2e-46
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 1650 187.3 1.2e-46
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 1650 187.3 1.2e-46
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1650 187.4 1.2e-46
>>NP_003408 (OMIM: 604668) zinc finger protein 264 [Homo (627 aa)
initn: 4432 init1: 4432 opt: 4432 Z-score: 2527.8 bits: 477.9 E(85289): 4.6e-134
Smith-Waterman score: 4432; 100.0% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMSPECDGLGTADGVCSRIGQEQVSPGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMSPECDGLGTADGVCSRIGQEQVSPGD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RVRSHNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RVRSHNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 IKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 HQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 KPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 CSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTE
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KA0 ANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
:::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
610 620
>>XP_011525824 (OMIM: 604668) PREDICTED: zinc finger pro (595 aa)
initn: 3851 init1: 3851 opt: 3851 Z-score: 2200.1 bits: 417.2 E(85289): 8.2e-116
Smith-Waterman score: 4110; 94.9% identity (94.9% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-595)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQEVMLENCGLLVSLG------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 --------------------------DKGKPKTTEPTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVD
60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMSPECDGLGTADGVCSRIGQEQVSPGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMSPECDGLGTADGVCSRIGQEQVSPGD
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RVRSHNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RVRSHNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTF
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 IKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRS
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMW
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 HQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRI
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGE
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 KPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYK
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 CSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTE
510 520 530 540 550 560
610 620
pF1KA0 ANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
:::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
570 580 590
>>NP_998763 (OMIM: 616847) zinc finger protein 543 [Homo (600 aa)
initn: 3993 init1: 2518 opt: 3112 Z-score: 1783.1 bits: 340.0 E(85289): 1.4e-92
Smith-Waterman score: 3112; 72.4% identity (88.4% similar) in 595 aa overlap (10-603:5-599)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKA
:::::::.:::::::.::::::: ::::::::::::.::::.:::::. :
NP_998 MAASAQVSVTFEDVAVTFTQEEWGQLDAAQRTLYQEVMLETCGLLMSLGCPLFKP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVD
::: .:.: :: : .::::.. :::. :::::::: . :: : . :: :.::: : .
NP_998 ELIYQLDHRQELWMATKDLSQSSYPGDNTKPKTTEPTFSHLALPEEVLLQEQLTQGASKN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KA0 SQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQE-KSPGKMSPECDGLGTADGVCSRIGQEQVSPG
:::::..:::: ::::: :.. :: ::. : ::: : ::::. ::::..: :.:::
NP_998 SQLGQSKDQDGPSEMQEVHLKIGIGPQRGKLLEKMSSERDGLGSDDGVCTKITQKQVSTE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DRVRSHNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKT
. .: : .:.::.:..:: ::::::.:. ::. ::.::. ::::::::::::
NP_998 GDLYECDSHGPVTDALIREEKNSYKCEECGKVFKKNALLVQHERIHTQVKPYECTECGKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHR
: :::::::: .:::::.::.::::::::::.:.::.:::::::::::::.:::::::::
NP_998 FSKSTHLLQHLIIHTGEKPYKCMECGKAFNRRSHLTRHQRIHSGEKPYKCSECGKAFTHR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLM
:.::::.: ::::: ::: :::..:: ::::.:::..:.::.::::.::::.:..::::
NP_998 STFVLHHRSHTGEKPFVCKECGKAFRDRPGFIRHYIIHTGEKPYECIECGKAFNRRSYLT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 WHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQR
:::: ::: ::.::.::::.: ::: ::.::.:::::::..:.:::::::.::.::.:::
NP_998 WHQQIHTGVKPFECNECGKAFCESADLIQHYIIHTGEKPYKCMECGKAFNRRSHLKQHQR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 IHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTG
:::::::. ::::::::::::::.::::.::::::.::::::::::.: :::::::::::
NP_998 IHTGEKPYECSECGKAFTHCSTFVLHKRTHTGEKPYECKECGKAFSDRADLIRHFSIHTG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPY
:::::::::::::.: : ::::..::.:::::::..:::.:: :.:::::.:::::::::
NP_998 EKPYECVECGKAFNRSSHLTRHQQIHTGEKPYECIQCGKAFCRSANLIRHSIIHTGEKPY
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 KCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTT
.::::::::.:.::::.:::.:::.:: :::::::: ..::::...::::::.:::.::
NP_998 ECSECGKAFNRGSSLTHHQRIHTGRNPTIVTDVGRPFMTAQTSVNIQELLLGKEFLNITT
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KA0 EANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
: :.
NP_998 EENLW
600
>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (616 aa)
initn: 1677 init1: 1677 opt: 1685 Z-score: 977.8 bits: 191.1 E(85289): 1e-47
Smith-Waterman score: 1697; 45.7% identity (71.5% similar) in 536 aa overlap (66-587:24-555)
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 RTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTE
::. : :. . : : . : . .::. .
NP_001 MLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKV-K
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 PTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVDS-QLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKM
.. . ..:: :: . ... :. ..:: .: : . .. : .: :
NP_001 LSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVK-
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200
pF1KA0 SP-----ECDGLGTADGVCSRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESGK--DP---MIQE---EEN
.: . .:.: .. . .. ..: .: :. :: : ..:. .:.
NP_001 TPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTP-ERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEK
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 NFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYEC
.::.::::.:... : :.. :.: .:::: :: : : .:. : .:. :::::.::.:
NP_001 PYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKC
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 MECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECG
.::..::. . : :::: :.:::::.:.::::.:. ::.: :.: ::::: . :.:::
NP_001 TQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECG
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 QVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFL
..::. . .: .:.::.::.: ::::.:.: : : ::. ::::::::: ::::.:
NP_001 KAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFT
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 ESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCST
. . ::.: ::::::.:: ::::::.. . : .:.::::::::. :.::::.:.: :.
NP_001 QITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSS
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 FILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRH
. :.:.::::::.::..::::: . : .: :::::::::: .:::::.. :.::.:
NP_001 LSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKH
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 KRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMH
.:::.::::::: .::..: . ::.: ::::::::.:..::.:::.:: : .:::.:
NP_001 QRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIH
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 TGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRET
: ..: . .. :. : : ..:.. .:
NP_001 TKEKPYGCNECGKSF-SHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGE
540 550 560 570 580
>--
initn: 549 init1: 314 opt: 314 Z-score: 204.1 bits: 47.9 E(85289): 0.00012
Smith-Waterman score: 314; 70.5% identity (83.6% similar) in 61 aa overlap (503-563:556-616)
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 HFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAII
: :.::::::: .::::: ::.: .: :
NP_001 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 HTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGK
::::::: : .:::::..:::::.::: :::
NP_001 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
590 600 610
600 610 620
pF1KA0 DFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (621 aa)
initn: 1677 init1: 1677 opt: 1685 Z-score: 977.7 bits: 191.1 E(85289): 1e-47
Smith-Waterman score: 1687; 56.3% identity (78.9% similar) in 398 aa overlap (168-563:235-621)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 GHFRPGIDPQEKSPGKMSPECDGLGTADGVCSRIGQ--EQVSPGDRVRSHNSCESGKDPM
:.. :. .:..: . .:. ..:. :
XP_016 YECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAP---LIQHQRTHTGEKP-
210 220 230 240 250 260
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 IQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTG
..:::::: :. . .. ::. :.: :::::.::::.: .: :: :: ::::
XP_016 -------YECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTG
270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 ERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSF
:.::.: ::::::...: ::.:::::.:::::.:.:::::::. . .. :.: ::::: .
XP_016 EKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPY
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 VCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSE
: :::..: . . .: .:.::.:: : ::::.:.: : : :..:::::::::::.
XP_016 ECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQ
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 CGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKA
:::.: .:. : .: :::::::.:: .:::::.: : : .::::::::::. :..::.:
XP_016 CGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRA
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 FTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRM
:.. . .: :.: ::::::.::..::.:::. . ::.: ::: :::: : ::::.:..
XP_016 FSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHS
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 SGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLT
:.:..:.: :.::::::: .::::: ::.: .: :::::::: : .:::::..:::::
XP_016 SSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLT
560 570 580 590 600 610
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 QHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQ
.::: :::
XP_016 KHQRTHTG
620
>--
initn: 838 init1: 305 opt: 309 Z-score: 201.3 bits: 47.4 E(85289): 0.00018
Smith-Waterman score: 309; 50.5% identity (67.4% similar) in 95 aa overlap (194-288:142-234)
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 ADGVCSRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEK
:: :... . :: .: : .:
XP_016 FTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGK--REKPDLNVLQK
120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 IHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSG
:::.: ::::.: .:. :..:: ::::::::: :: :.: .: ::.:::::.:
XP_016 TCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTG
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 EKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPY
:::::
XP_016 EKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPY
230 240 250 260 270 280
>>XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (628 aa)
initn: 1677 init1: 1677 opt: 1685 Z-score: 977.7 bits: 191.1 E(85289): 1e-47
Smith-Waterman score: 1687; 56.3% identity (78.9% similar) in 398 aa overlap (168-563:242-628)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 GHFRPGIDPQEKSPGKMSPECDGLGTADGVCSRIGQ--EQVSPGDRVRSHNSCESGKDPM
:.. :. .:..: . .:. ..:. :
XP_016 YECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAP---LIQHQRTHTGEKP-
220 230 240 250 260
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 IQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTG
..:::::: :. . .. ::. :.: :::::.::::.: .: :: :: ::::
XP_016 -------YECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTG
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 ERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSF
:.::.: ::::::...: ::.:::::.:::::.:.:::::::. . .. :.: ::::: .
XP_016 EKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPY
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 VCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSE
: :::..: . . .: .:.::.:: : ::::.:.: : : :..:::::::::::.
XP_016 ECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQ
390 400 410 420 430 440
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 CGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKA
:::.: .:. : .: :::::::.:: .:::::.: : : .::::::::::. :..::.:
XP_016 CGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRA
450 460 470 480 490 500
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 FTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRM
:.. . .: :.: ::::::.::..::.:::. . ::.: ::: :::: : ::::.:..
XP_016 FSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHS
510 520 530 540 550 560
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 SGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLT
:.:..:.: :.::::::: .::::: ::.: .: :::::::: : .:::::..:::::
XP_016 SSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLT
570 580 590 600 610 620
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 QHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQ
.::: :::
XP_016 KHQRTHTG
>--
initn: 1093 init1: 305 opt: 362 Z-score: 231.2 bits: 52.9 E(85289): 3.9e-06
Smith-Waterman score: 362; 34.3% identity (56.3% similar) in 254 aa overlap (43-288:1-241)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 SVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEP
::.. ::::.: .:: ..: ::. :
XP_016 MLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAEL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 WTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCE--PALSEGISLQGQVTQGNSVDSQLGQAEDQD
:. . : : . : ::. . . : : .. .. :: ... : . : . :
XP_016 WAVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPKVKLSVLKQG-ISEEISNSVILVERFLWD
40 50 60 70 80
140 150 160 170 180
pF1KA0 GL----SEMQEGHFRPGIDPQEK--SPGKMSPECDGLGTADGVCSRIGQEQVSPGDRVRS
:: .: :::.. . . :. : ..: . : . .. . :. . :
XP_016 GLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTP------VKTPVLEQ--WQRNGFGENI-S
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 HNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKST
: . ..:: :... . :: .: : .: :::.: ::::.: .:.
XP_016 LNP-DLPHQPMTPERQSPHTWGTRGK--REKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSS
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 HLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVL
:..:: ::::::::: :: :.: .: ::.:::::.::::::
XP_016 ALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQ
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 HNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQT
XP_016 HQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRI
260 270 280 290 300 310
>>XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (658 aa)
initn: 1677 init1: 1677 opt: 1685 Z-score: 977.5 bits: 191.1 E(85289): 1e-47
Smith-Waterman score: 1697; 45.7% identity (71.5% similar) in 536 aa overlap (66-587:66-597)
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 RTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTE
::. : :. . : : . : . .::. .
XP_016 RTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKV-K
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 PTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVDS-QLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKM
.. . ..:: :: . ... :. ..:: .: : . .. : .: :
XP_016 LSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVK-
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200
pF1KA0 SP-----ECDGLGTADGVCSRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESGK--DP---MIQE---EEN
.: . .:.: .. . .. ..: .: :. :: : ..:. .:.
XP_016 TPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTP-ERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEK
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 NFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYEC
.::.::::.:... : :.. :.: .:::: :: : : .:. : .:. :::::.::.:
XP_016 PYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKC
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 MECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECG
.::..::. . : :::: :.:::::.:.::::.:. ::.: :.: ::::: . :.:::
XP_016 TQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECG
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 QVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFL
..::. . .: .:.::.::.: ::::.:.: : : ::. ::::::::: ::::.:
XP_016 KAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFT
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 ESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCST
. . ::.: ::::::.:: ::::::.. . : .:.::::::::. :.::::.:.: :.
XP_016 QITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSS
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 FILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRH
. :.:.::::::.::..::::: . : .: :::::::::: .:::::.. :.::.:
XP_016 LSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKH
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 KRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMH
.:::.::::::: .::..: . ::.: ::::::::.:..::.:::.:: : .:::.:
XP_016 QRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIH
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 TGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRET
: ..: . .. :. : : ..:.. .:
XP_016 TKEKPYGCNECGKSF-SHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGE
580 590 600 610 620 630
>--
initn: 549 init1: 314 opt: 314 Z-score: 203.9 bits: 48.0 E(85289): 0.00013
Smith-Waterman score: 314; 70.5% identity (83.6% similar) in 61 aa overlap (503-563:598-658)
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 HFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAII
: :.::::::: .::::: ::.: .: :
XP_016 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
570 580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 HTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGK
::::::: : .:::::..:::::.::: :::
XP_016 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
630 640 650
600 610 620
pF1KA0 DFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (658 aa)
initn: 1677 init1: 1677 opt: 1685 Z-score: 977.5 bits: 191.1 E(85289): 1e-47
Smith-Waterman score: 1697; 45.7% identity (71.5% similar) in 536 aa overlap (66-587:66-597)
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 RTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTE
::. : :. . : : . : . .::. .
NP_001 RTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKV-K
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 PTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVDS-QLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKM
.. . ..:: :: . ... :. ..:: .: : . .. : .: :
NP_001 LSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVK-
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200
pF1KA0 SP-----ECDGLGTADGVCSRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESGK--DP---MIQE---EEN
.: . .:.: .. . .. ..: .: :. :: : ..:. .:.
NP_001 TPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTP-ERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEK
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 NFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYEC
.::.::::.:... : :.. :.: .:::: :: : : .:. : .:. :::::.::.:
NP_001 PYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKC
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 MECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECG
.::..::. . : :::: :.:::::.:.::::.:. ::.: :.: ::::: . :.:::
NP_001 TQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECG
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 QVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFL
..::. . .: .:.::.::.: ::::.:.: : : ::. ::::::::: ::::.:
NP_001 KAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFT
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 ESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCST
. . ::.: ::::::.:: ::::::.. . : .:.::::::::. :.::::.:.: :.
NP_001 QITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSS
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 FILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRH
. :.:.::::::.::..::::: . : .: :::::::::: .:::::.. :.::.:
NP_001 LSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKH
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 KRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMH
.:::.::::::: .::..: . ::.: ::::::::.:..::.:::.:: : .:::.:
NP_001 QRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIH
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 TGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRET
: ..: . .. :. : : ..:.. .:
NP_001 TKEKPYGCNECGKSF-SHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGE
580 590 600 610 620 630
>--
initn: 549 init1: 314 opt: 314 Z-score: 203.9 bits: 48.0 E(85289): 0.00013
Smith-Waterman score: 314; 70.5% identity (83.6% similar) in 61 aa overlap (503-563:598-658)
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 HFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAII
: :.::::::: .::::: ::.: .: :
NP_001 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
570 580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 HTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGK
::::::: : .:::::..:::::.::: :::
NP_001 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
630 640 650
600 610 620
pF1KA0 DFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
>>XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (670 aa)
initn: 1677 init1: 1677 opt: 1685 Z-score: 977.5 bits: 191.1 E(85289): 1e-47
Smith-Waterman score: 1697; 45.7% identity (71.5% similar) in 536 aa overlap (66-587:78-609)
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 RTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTE
::. : :. . : : . : . .::. .
XP_005 RTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKV-K
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 PTTCEPALSEGISLQGQVTQGNSVDS-QLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKM
.. . ..:: :: . ... :. ..:: .: : . .. : .: :
XP_005 LSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVK-
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200
pF1KA0 SP-----ECDGLGTADGVCSRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESGK--DP---MIQE---EEN
.: . .:.: .. . .. ..: .: :. :: : ..:. .:.
XP_005 TPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTP-ERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEK
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 NFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYEC
.::.::::.:... : :.. :.: .:::: :: : : .:. : .:. :::::.::.:
XP_005 PYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKC
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 MECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECG
.::..::. . : :::: :.:::::.:.::::.:. ::.: :.: ::::: . :.:::
XP_005 TQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECG
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 QVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFL
..::. . .: .:.::.::.: ::::.:.: : : ::. ::::::::: ::::.:
XP_005 KAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFT
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 ESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCST
. . ::.: ::::::.:: ::::::.. . : .:.::::::::. :.::::.:.: :.
XP_005 QITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSS
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 FILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRH
. :.:.::::::.::..::::: . : .: :::::::::: .:::::.. :.::.:
XP_005 LSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKH
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 KRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMH
.:::.::::::: .::..: . ::.: ::::::::.:..::.:::.:: : .:::.:
XP_005 QRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIH
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 TGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRET
: ..: . .. :. : : ..:.. .:
XP_005 TKEKPYGCNECGKSF-SHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGE
590 600 610 620 630 640
>--
initn: 549 init1: 314 opt: 314 Z-score: 203.8 bits: 48.0 E(85289): 0.00013
Smith-Waterman score: 314; 70.5% identity (83.6% similar) in 61 aa overlap (503-563:610-670)
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 HFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAII
: :.::::::: .::::: ::.: .: :
XP_005 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
580 590 600 610 620 630
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 HTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGK
::::::: : .:::::..:::::.::: :::
XP_005 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650 660 670
600 610 620
pF1KA0 DFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
>>XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (670 aa)
initn: 1677 init1: 1677 opt: 1685 Z-score: 977.5 bits: 191.1 E(85289): 1e-47
Smith-Waterman score: 1687; 56.3% identity (78.9% similar) in 398 aa overlap (168-563:284-670)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 GHFRPGIDPQEKSPGKMSPECDGLGTADGVCSRIGQ--EQVSPGDRVRSHNSCESGKDPM
:.. :. .:..: . .:. ..:. :
XP_006 YECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAP---LIQHQRTHTGEKP-
260 270 280 290 300
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 IQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTG
..:::::: :. . .. ::. :.: :::::.::::.: .: :: :: ::::
XP_006 -------YECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTG
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 ERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSF
:.::.: ::::::...: ::.:::::.:::::.:.:::::::. . .. :.: ::::: .
XP_006 EKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPY
370 380 390 400 410 420
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 VCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSE
: :::..: . . .: .:.::.:: : ::::.:.: : : :..:::::::::::.
XP_006 ECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQ
430 440 450 460 470 480
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 CGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKA
:::.: .:. : .: :::::::.:: .:::::.: : : .::::::::::. :..::.:
XP_006 CGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRA
490 500 510 520 530 540
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 FTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRM
:.. . .: :.: ::::::.::..::.:::. . ::.: ::: :::: : ::::.:..
XP_006 FSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHS
550 560 570 580 590 600
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 SGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLT
:.:..:.: :.::::::: .::::: ::.: .: :::::::: : .:::::..:::::
XP_006 SSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLT
610 620 630 640 650 660
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 QHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQ
.::: :::
XP_006 KHQRTHTG
670
>--
initn: 1052 init1: 305 opt: 501 Z-score: 309.3 bits: 67.5 E(85289): 1.7e-10
Smith-Waterman score: 501; 38.0% identity (59.2% similar) in 292 aa overlap (5-288:7-283)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVP
: :: :: ::.::.: :..:::::: ::::::..:::.. ::::.: .:
XP_006 MTPGVRVSTDPEQV--TFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 KAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCE--PALSEGISLQGQVTQG
: ..: ::. : :. . : : . : ::. . . : : .. .. :: ...
XP_006 KPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPKVKLSVLKQG-ISEE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NSVDSQLGQAEDQDGL----SEMQEGHFRPGIDPQEK--SPGKMSPECDGLGTADGVCSR
: . : . ::: .: :::.. . . :. : ..: . : .
XP_006 ISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTP------VKTPVLEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 IGQEQVSPGDRVRSHNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKP
.. . :. . : : . ..:: :... . :: .: : .: ::
XP_006 --WQRNGFGENI-SLNP-DLPHQPMTPERQSPHTWGTRGK--REKPDLNVLQKTCVKEKP
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 YECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCN
:.: ::::.: .:. :..:: ::::::::: :: :.: .: ::.:::::.::::::
XP_006 YKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGK
XP_006 QCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGK
290 300 310 320 330 340
627 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 18:51:33 2016 done: Wed Nov 2 18:51:34 2016
Total Scan time: 7.290 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]