Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0411, 1075 aa
1>>>pF1KA0411 1075 - 1075 aa - 1075 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4089+/-0.00113; mu= 9.0796+/- 0.068
mean_var=230.6844+/-47.814, 0's: 0 Z-trim(109.6): 132 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.084443
statistics sampled from 10846 (10978) to 10846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 3.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1075) 7085 877.4 0
CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1099) 3938 494.0 7.3e-139
CCDS76262.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 (1070) 3367 424.5 6.2e-118
CCDS73017.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 (1071) 3355 423.0 1.7e-117
CCDS76261.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 ( 789) 2848 361.1 5.4e-99
CCDS8967.1 SRGAP1 gene_id:57522|Hs108|chr12 (1085) 2427 310.0 1.9e-83
CCDS81365.1 SRGAP2B gene_id:647135|Hs108|chr1 ( 305) 1212 161.4 2.7e-39
CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX ( 946) 1091 147.1 1.7e-34
CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX ( 986) 1091 147.2 1.7e-34
CCDS81364.1 SRGAP2C gene_id:653464|Hs108|chr1 ( 459) 936 128.0 4.9e-29
>>CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1075 aa)
initn: 7085 init1: 7085 opt: 7085 Z-score: 4678.6 bits: 877.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7085; 100.0% identity (100.0% similar) in 1075 aa overlap (1-1075:1-1075)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQFKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQFKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDIF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKCTKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKCTKAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 NDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRHEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRHEGLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELLMRYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELLMRYH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAASETYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAASETYM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECGTTRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECGTTRG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 VDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 TIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 EQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 DAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTEHISDYGFGGVMGRVRLRSDGAAIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTEHISDYGFGGVMGRVRLRSDGAAIP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 RRRSGGDTHSPPRGLGPSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTRGRIESPEKRRMATFGSAGSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RRRSGGDTHSPPRGLGPSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTRGRIESPEKRRMATFGSAGSIN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 YPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKTMSTALHELRELERQNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKTMSTALHELRELERQNTV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 KQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSSEPASPLHTIVIRDPDAAMRRSSSSSTEMMTTFKPALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSSEPASPLHTIVIRDPDAAMRRSSSSSTEMMTTFKPALS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 ARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSSSSSGVGSPAVTPTEKMFPNSSADKSGTM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSSSSSGVGSPAVTPTEKMFPNSSADKSGTM
1030 1040 1050 1060 1070
>>CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1099 aa)
initn: 7006 init1: 3938 opt: 3938 Z-score: 2606.5 bits: 494.0 E(32554): 7.3e-139
Smith-Waterman score: 6961; 97.1% identity (97.4% similar) in 1099 aa overlap (1-1075:1-1099)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQFKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQFKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDIF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKCTKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKCTKAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 NDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRHEGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 NDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRHEGLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELLMRYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELLMRYH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAASETYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 QLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAASETYM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECGTTRG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECGTTRP
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KA0 -------RRNARTRN-----------------QDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGI
.. : : .:::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PCLPPKPQKMRRPRPLSVYSHKLFNGSMEAFIKDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGI
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 FRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 FRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDL
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 ISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFG
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 PTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPH
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 SEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASED
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 WWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 WWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTE
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 HISDYGFGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRSGGDTHSPPRGLGPSIDTPPRAAACPSSPHKIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 HISDYGFGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRSGGDTHSPPRGLGPSIDTPPRAAACPSSPHKIP
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 LTRGRIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LTRGRIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEAL
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 AEDIEKTMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSSEPASPLHTIVIRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 AEDIEKTMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSSEPASPLHTIVIRD
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 PDAAMRRSSSSSTEMMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSSSSSGVGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PDAAMRRSSSSSTEMMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSSSSSGVGSPA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060 1070
pF1KA0 VTPTEKMFPNSSADKSGTM
:::::::::::::::::::
CCDS25 VTPTEKMFPNSSADKSGTM
1090
>>CCDS76262.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 (1070 aa)
initn: 2985 init1: 1331 opt: 3367 Z-score: 2230.7 bits: 424.5 E(32554): 6.2e-118
Smith-Waterman score: 4225; 59.8% identity (84.1% similar) in 1093 aa overlap (1-1075:1-1070)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
:.: .::::::::::::..:.::::.::.::.:::.:: : :.:::::::.:::.:::::
CCDS76 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQFKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDIF
..:::.:::::::: .: ::....:::::: .::::::: :.:.:..::::::.::.::.
CCDS76 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESK
.::.: :. :.::: ::::::::.: :....:.:: ::::.::::::::.:.::::.::
CCDS76 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KA0 LKEAEKQEEKQFNKS-----------GDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::..:: : . :. : :.. :::::::::::::::::::
CCDS76 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANV-RIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 SENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEY
.::::: ::::.::: : ::::.. ::::::.::::::::::.:::: :..::.::::
CCDS76 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 NLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQ
::: :.:::::.:::::.:::. :::. .:.: :.:::::.:::::::::: . :. :::
CCDS76 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 PVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTE
:::.::..: .::::::.:::::::::.::..::.::.::..::::::::: ::.: : :
CCDS76 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 SVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGE
::::..:::.::: .::::::::::::.:::::.:::..: :::::::::::::..::::
CCDS76 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 GERAECGTTRGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDI
..:..:. .: :.. .:.:::.::::::::::::.:. .:::..::::: :::::::::
CCDS76 SQRTDCSLAR--RSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDI
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 KNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLISTIKLENPAERV
::.::::::::. :::..:..:.::::::::::::.:::::. :.::.. . ..: ::.
CCDS76 KNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERA
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 HQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPV
.:...:..::......:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: .:.:.: :
CCDS76 LHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQV
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 SCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGG--EEYCDSPHSEPGAIDEVDH
:::::.::.::::::.:: ::::::::::::: . :: :.::::::.: .... .
CCDS76 SCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSR---GGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQ
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 DNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDG
: .: ::::.: : :::::::::.::. ::::::::::::::.:::.:::::::::.::
CCDS76 DVTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDG
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
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::::::::::: .:. . : :.. :. : : ..:.... . :. :..: ....
CCDS76 LIPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPP-EEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANI
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.. : : ....: :. .:.:. .: : ..: .:.: ::: . . . :.:
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1070
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CCDS76 LIPHQYIVVQDTLIS
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CCDS89 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHI-RLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKA
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CCDS89 RNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGL
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CCDS89 LSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTR
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CCDS89 LISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICF
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CCDS89 YSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASE
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CCDS89 DRHPD----GYLARQRKRGEPPP-PVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLA--
840 850 860 870 880 890
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 SSPHKIPLTRG-RIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDH
: :. . .:: .:::.:: :: .:. :. .. .: . .: ......::
CCDS89 SHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDH
900 910 920 930 940 950
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 KSLEAEALAEDIEKTMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSS-EPAS
: :. :..:.:::.::.:::.::::::::.:.:.:::::::::: .:: : :..: : :
CCDS89 KPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLS
960 970 980 990 1000 1010
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 PLHTIVIRDPDAAMRRSSSSSTEMMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSS
:::....:. . .:::.:::.. :.:::: .. :. :.::.:: .:: .:.: ... .
CCDS89 PLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRM-GVQLKPPALRP-KPAVLPKTNPT
1020 1030 1040 1050 1060
1050 1060 1070
pF1KA0 SSSGVGSPAVTPTEKMFPNSSADKSGTM
: . : ::.:
CCDS89 --IGPAPPPQGPTDKSCTM
1070 1080
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130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESKLKE
.:: ::::.::::::::.:.::::.:::::
CCDS81 MKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSKLKE
10 20 30
190 200 210 220 230
pF1KA0 AEKQEEKQFNKS-----------GDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSEN
::::::::..:: : . :. : :.. :::::::::::::::::::.::
CCDS81 AEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANV-RIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYTEN
40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 KLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLE
::: ::::.::: : ::::.. ::::::.::::::::::.:::: :..::.:::: :::
CCDS81 KLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAELNLE
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 TSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQ
:.:::::.:::::.:::. :::. .:.: :.:::::.:::::::::: . :. ::::::
CCDS81 QSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQPVQ
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 TELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVK
.:::.: .::::::.:::::::::.::..::.::.::..::::::::: ::.: : ::::
CCDS81 SELLQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSMESVK
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 SAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGER
:..:::.::: .::::::::::::.::::
CCDS81 STVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTVRECYGF
270 280 290 300
>>CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX (946 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
:... :..... . ::::.:.::.: :: ::..::: :.: : .:::.: ::.::.::.:
CCDS14 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA0 LEYSRSLEKLAERFSSK---IRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATL
:::::.::::::::::. . :::::: :.:. ::::..:: ..:..::..::. :.:
CCDS14 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESIS
.... . . :::.:.::: :: :::... :...:::.:..:: :. :::. :: ::..
CCDS14 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 AESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKC
::.::.:::.::::. ..: . : : :.::.:: .. ::::::. :.::::
CCDS14 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKC
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRH
:::::.:::.::..:::.:.::.::: ::.:::: ::: .:....:.: .:: ..:.
CCDS14 TKARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 EGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELL
.:: .:.::. :: .:: :... ::::::.:...:: :::: .. ... .. :.:
CCDS14 QGLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEIL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 MRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAAS
: ...:::: ::.::: ::: ::.:.: .... .: :: :.:: : ::::.::..:
CCDS14 PRAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECG
. . . .::..::::: ::.::..::..: ....::::::. :...: .:.. :
CCDS14 DPGSRQAG--RRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KA0 TT----RGRRNARTRN--------------------QDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQ
.. :. ..:. :.::: .:::::::::.::: :::
CCDS14 VSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQ
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 QQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKER
..::::: :.:..:..:...:::::::::. . .:..:::::::::::.:: :::: .
CCDS14 HEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDL
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 FQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLA
: .:... .:: ::::......: :: :.::.::::.:::::.::::::::::::::
CCDS14 FGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLA
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 ICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYC
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CCDS14 VCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASC
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 --DSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLY
:. :: .: . . . : :. .::.: : : ::. .::::..: : :.
CCDS14 LGDAQLESLGADNEPELE-AEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLH
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800
pF1KA0 HRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGP--LLDDKASSK
.::: :::.:.:::. :::::.::.. . . . .. .:..:.: :: .. .
CCDS14 ERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHR
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850
pF1KA0 NDLQSPTEHISDYG-----FGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRSG-----GDTHSPPRGLGPS
. . : .. : . . . ... : :. : : : : .::::.
CCDS14 PEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKT-SVRQGLGPA
840 850 860 870 880 890
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 IDTPPRAAACPSSPHKIPLTR-GRIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTC
: : . : ::. : .: ::
CCDS14 STTSPSPG--PRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
900 910 920 930 940
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 QTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIELEY
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CCDS55 HGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVELEY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA0 SRSLEKLAERFSSK---IRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDI
::.::::::::::. . :::::: :.:. ::::..:: ..:..::..::. :.:...
CCDS55 SRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAALSEV
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pF1KA0 FMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAES
. . . :::.:.::: :: :::... :...:::.:..:: :. :::. :: ::..::.
CCDS55 LAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVNAEA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KA0 KLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKK----IEKM--------------
::.:::.::::. ..: . : : :.::.:: .::.
CCDS55 KLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKLWPPQRPVAASSCAP
190 200 210 220 230 240
230 240 250
pF1KA0 ----------------------KEKRQAKYSENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYI
..::::. :.:::::::::.:::.::..:::.:.::.
CCDS55 VCWLQAGFLVHPPWWGAMCAPSTHQRQAKFMEHKLKCTKARNEYLLSLASVNAAVSNYYL
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 HDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVM
::: ::.:::: ::: .:....:.: .:: ..:. .:: .:.::. :: .:: :.
CCDS55 HDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQGLGSLEEAVEALDPPGDKAKVL
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 DMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKT
.. ::::::.:...:: :::: .. ... .. :.: : ...:::: ::.::: ::
CCDS55 EVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILPRAQNIQSRLDRQTIETEEVNKT
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 LDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFY
: ::.:.: .... .: :: :.:: : ::::.::..:. . . .::..::::: ::
CCDS55 LKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDPGSRQAG--RRRGQQQETETFY
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480
pF1KA0 FTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECGTT----RGRRNARTRN-------
.::..::..: ....::::::. :...: .:.. : .. :. ..:.
CCDS55 LTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQY
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530
pF1KA0 -------------QDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFER
:.::: .:::::::::.::: :::..::::: :.:..:..:...:::
CCDS55 NQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFER
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 GEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQI
::::::. . .:..:::::::::::.:: :::: . : .:... .:: ::::......
CCDS55 GEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRL
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 LVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHI
: :: :.::.::::.:::::.::::::::::::::.::::::. .: :::::. :...
CCDS55 LWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRV
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 NEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYC--DSPHSEPGAIDEVDHDNGTEP
:....:.:.. . .:: : ::::::::: : :. :: .: . . . :
CCDS55 NQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELE-AEMP
730 740 750 760 770
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 HTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQY
:. .::.: : : ::. .::::..: : :..::: :::.:.:::. :::::.:
CCDS55 AQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKY
780 790 800 810 820 830
780 790 800 810 820
pF1KA0 IVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGP--LLDDKASSKNDLQSPTEHISDYG-----FGGV
:.. . . . .. .:..:.: :: .. . . . : .. : . .
CCDS55 ITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRPEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPA
840 850 860 870 880 890
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 MGRVRLRSDGAAIPRRRSG-----GDTHSPPRGLGPSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTR-G
. ... : :. : : : : .::::. : : . : ::. : .: :
CCDS55 SPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKT-SVRQGLGPASTTSPSPG--PRSPKAPPSSRLG
900 910 920 930 940 950
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 RIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDI
:
CCDS55 RNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
960 970 980
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pF1KA0 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
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CCDS81 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQFKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDIF
..:::.::::::.: .: ::....:::::: .::::::: :.:.:.. :::::.::.::.
CCDS81 MDYSRNLEKLAEHFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKWESRDHTTLSDIY
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 MNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESK
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CCDS81 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KA0 LKEAEKQEEKQFNKS-----------GDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::..:: : . :. : :.. ::::::::::::::.::::
CCDS81 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPCSPDSTANV-RIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKHQAKY
190 200 210 220 230
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pF1KA0 SENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLID-CCDLGFHASLARTFRTYLSAE
.::::: ::.:.::: : ::::.. ::::::.::::: :::::.:::: :..::.::::
CCDS81 TENKLKAIKAQNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
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290 300 310 320 330 340
pF1KA0 YNLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQ
::: :.:::::.:::::.:::. :::. .:.: :.:::::.:::::::::: . :. ::
CCDS81 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 QPVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRST
::::.::..: .::::::.:::::::::.::..::.::.::..::::::::: ::.: :
CCDS81 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 ESVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLG
:::::..:::.::: .::::::::::::.::::
CCDS81 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTVRECYGF
420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 EGERAECGTTRGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVND
1075 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 18:50:15 2016 done: Wed Nov 2 18:50:15 2016
Total Scan time: 3.400 Total Display time: 0.300
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]