Result of FASTA (omim) for
pF1KA0408
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0408, 947 aa
1>>>pF1KA0408 947 - 947 aa - 947 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9910+/-0.000471; mu= -16.3018+/- 0.029
mean_var=635.4394+/-128.455, 0's: 0 Z-trim(124.3): 13 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.050879
statistics sampled from 45692 (45710) to 45692 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.793), E-opt: 0.2 (0.536), width: 16
Scan time: 18.240
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005258156 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule (1905) 1526 128.0 4.6e-28
XP_011523943 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule (1946) 1526 128.0 4.7e-28
XP_005258155 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule (1970) 1526 128.0 4.7e-28
NP_056025 (OMIM: 615766) microtubule cross-linking (1586) 1353 115.2 2.7e-24
XP_016881164 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule (1689) 1353 115.2 2.8e-24
XP_011523942 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule (2047) 834 77.2 9.5e-13
XP_016881160 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule (1766) 704 67.6 6.4e-10
XP_016881162 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule (1715) 661 64.4 5.6e-09
XP_016881161 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule (1715) 661 64.4 5.6e-09
XP_016881163 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule (1715) 661 64.4 5.6e-09
>>XP_005258156 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule cro (1905 aa)
initn: 1537 init1: 780 opt: 1526 Z-score: 624.8 bits: 128.0 E(85289): 4.6e-28
Smith-Waterman score: 2199; 45.9% identity (68.1% similar) in 947 aa overlap (5-892:7-893)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSQPPIGGAAPATAAASPAAAATEARLHPEGSSRKQQRAQSPARPRDSSLRQTIAATR
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XP_005 METLNGPAGGGAPDAKLQPPGQHHRHHHLHPVAERRRLHRAPSPARPFLKDLHAR-----
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
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60 70 80 90 100
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pF1KA0 Q---PVAGAEAAPAATLAALGGRRPG--PPEEPPRELESVPSKLGEPPPLGEGGGGGGEG
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240 250 260 270 280 290
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210 220 230 240
300 310 320 330
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pF1KA0 TFFEEDACQLQEMRHELERANKNCRILQYRLRKAERKRLRYAQTGEIDGELLRSLEQDLK
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XP_005 SYLEEDVYQLQELRRELDRANKNCRILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRSLEQDLK
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450 460 470 480 490 500
pF1KA0 VAKDVSVRLHHELENVEEKRTTTEDENEKLRQQLIEVEIAKQALQNELEKMKELSLKRRG
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XP_005 VAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAEDENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKESSLKRRS
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pF1KA0 SKDLPKSEKKAQQTPTEEDNEDLKCQLQFVKEEAALMRKKMAKIDKEKDRFEHELQKYRS
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XP_005 TREMYK-EKK---TFNQDDSADLRCQLQFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDELEQELQKYKS
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 FYGDLDSPLPKGEAGGPPSTREAELKLRLRLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAELDDL
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XP_005 LYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAELKLRLKLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAEMEDM
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660 670
pF1KA0 RGD--------DFNGS--ANPLMREQSESLSELRQHLQLVEDETELLRRNVADLEEQNKR
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XP_005 RGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFG-DSLESSTELRRHLQFVEEEAELLRRSISEIEDHNRQ
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680 690 700 710 720
pF1KA0 ITAELNKYKYKS----GGHDSARHHDNAKTEALQEELKAARLQINELSGKVMQLQYENRV
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XP_005 LTHELSKFKFEPPREPGWLGEGASPGAGGGAPLQEELKSARLQISELSGKVLKLQHENHA
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pF1KA0 LMSNMQRYDLASHLGIRG-SPRDSDAESDAGKKESD-DDSRPPHRKREGPIGGESDSEEV
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XP_005 LLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDSDAESDAGKKESDGEESRLPQPKREGPVGGESDSEEM
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790 800 810 820 830 840
pF1KA0 ----RNIRCLTPTRSFYPAPGPWPKSFSDRQQMKDIRSEAERLGKTIDRLIADTSTIITE
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XP_005 FEKTSGFGSGKPSEASEPCPTELLKAREDSEYLVTLKHEAQRLERTVERLITDTDSFLHD
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850 860 870 880 890
pF1KA0 ARIYVANGDLFG--LMDEEDDG-SRIREHELLYRINAQMKAFRKELQTFIDRLEVPKSAD
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XP_005 AGLR-GGAPLPGPGLQGEEEQGEGDQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIGDGL
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pF1KA0 DRGAEEPISVSQMFQPIILLILILVLFSSLSYTTIFKLVFLFTLFFVL
XP_005 SPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSPIGNLGKELGPDLQSRLKEQLEWQLGPARGDERESLR
910 920 930 940 950 960
>>XP_011523943 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule cro (1946 aa)
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Smith-Waterman score: 2199; 45.9% identity (68.1% similar) in 947 aa overlap (5-892:7-893)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSQPPIGGAAPATAAASPAAAATEARLHPEGSSRKQQRAQSPARPRDSSLRQTIAATR
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pF1KA0 GGAGGGSGEREGGAPQPPPPRGWRGKGVRAQQRGGSGGEGASPSPSSSSAGKTPGTGSRN
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pF1KA0 ARIYVANGDLFG--LMDEEDDG-SRIREHELLYRINAQMKAFRKELQTFIDRLEVPKSAD
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XP_011 AGLR-GGAPLPGPGLQGEEEQGEGDQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIGDGL
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pF1KA0 DRGAEEPISVSQMFQPIILLILILVLFSSLSYTTIFKLVFLFTLFFVL
XP_011 SPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSPIGNLGKELGPDLQSRLKEQLEWQLGPARGDERESLR
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>>XP_005258155 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule cro (1970 aa)
initn: 1537 init1: 780 opt: 1526 Z-score: 624.6 bits: 128.0 E(85289): 4.7e-28
Smith-Waterman score: 2199; 45.9% identity (68.1% similar) in 947 aa overlap (5-892:7-893)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSQPPIGGAAPATAAASPAAAATEARLHPEGSSRKQQRAQSPARPRDSSLRQTIAATR
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pF1KA0 SPVGAGTKLNSVRQQQLQQQQQQGNKTGSRTGPPASIRGGGGGAEKATPLAPKGAAPGAV
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pF1KA0 GGAGGGSGEREGGAPQPPPPRGWRGKGVRAQQRGGSGGEGASPSPSSSSAGKTPGTGSRN
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850 860 870 880 890
pF1KA0 ARIYVANGDLFG--LMDEEDDG-SRIREHELLYRINAQMKAFRKELQTFIDRLEVPKSAD
: . ... : : :. ::..: . .: .:: :::.::::.::::.:....
XP_005 AGLR-GGAPLPGPGLQGEEEQGEGDQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIGDGL
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940
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910 920 930 940 950 960
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pF1KA0 QEQEEMQEEMEKLREENETLKNEIDELRTEMDEMRDTFFEEDACQLQEMRHELERANKNC
:.::::...:::. ::::.:.::.::::::
NP_056 MEEMRDSYLEEDVYQLQELRRELDRANKNC
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:::::::::::.: :. :.::..::::.:::::::::::::::::::::..:::::. .:
NP_056 RILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAE
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pF1KA0 DENEKLRQQLIEVEIAKQALQNELEKMKELSLKRRGSKDLPKSEKKAQQTPTEEDNEDLK
:::: ::::.:::::.:::::::::..:: :::::..... : ::: : ...:. ::.
NP_056 DENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKESSLKRRSTREMYK-EKK---TFNQDDSADLR
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pF1KA0 CQLQFVKEEAALMRKKMAKIDKEKDRFEHELQKYRSFYGDLDSPLPKGEAGGPPSTREAE
:::::.:::: ::::::::. .:::..:.:::::.:.:::.::::: :::::::::::::
NP_056 CQLQFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDELEQELQKYKSLYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAE
150 160 170 180 190 200
590 600 610 620 630
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:::::.::::::::::::::::::::::::::..:.::. : : ..:.
NP_056 LKLRLKLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAEMEDMRGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFG-
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pF1KA0 EQSESLSELRQHLQLVEDETELLRRNVADLEEQNKRITAELNKYKYKS----GGHDSARH
.. :: .:::.:::.::.:.:::::.....:..:...: ::.:.:.. : .
NP_056 DSLESSTELRRHLQFVEEEAELLRRSISEIEDHNRQLTHELSKFKFEPPREPGWLGEGAS
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pF1KA0 HDNAKTEALQEELKAARLQINELSGKVMQLQYENRVLMSNMQRYDLASHLGIRG-SPRDS
. ::::::.:::::.::::::..::.::..:.::.:: :::.:::.:. :::::
NP_056 PGAGGGAPLQEELKSARLQISELSGKVLKLQHENHALLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDS
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pF1KA0 DAESDAGKKESD-DDSRPPHRKREGPIGGESDSEEV----RNIRCLTPTRSFYPAPGPWP
:::::::::::: ..:: :. :::::.::::::::. .. :... : :
NP_056 DAESDAGKKESDGEESRLPQPKREGPVGGESDSEEMFEKTSGFGSGKPSEASEPCPTELL
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pF1KA0 KSFSDRQQMKDIRSEAERLGKTIDRLIADTSTIITEARIYVANGDLFG--LMDEEDDG-S
:. : . . .. ::.:: .:..:::.::.... .: . ... : : :. ::..: .
NP_056 KAREDSEYLVTLKHEAQRLERTVERLITDTDSFLHDAGLR-GGAPLPGPGLQGEEEQGEG
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pF1KA0 RIREHELLYRINAQMKAFRKELQTFIDRLEVPKSADDRGAEEPISVSQMFQPIILLILIL
.: .:: :::.::::.::::.:....
NP_056 DQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIGDGLSPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSP
510 520 530 540 550 560
>>XP_016881164 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule cro (1689 aa)
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Smith-Waterman score: 1906; 58.8% identity (82.2% similar) in 539 aa overlap (377-892:1-533)
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 QEQEEMQEEMEKLREENETLKNEIDELRTEMDEMRDTFFEEDACQLQEMRHELERANKNC
:.::::...:::. ::::.:.::.::::::
XP_016 MEEMRDSYLEEDVYQLQELRRELDRANKNC
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pF1KA0 RILQYRLRKAERKRLRYAQTGEIDGELLRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELENVEEKRTTTE
:::::::::::.: :. :.::..::::.:::::::::::::::::::::..:::::. .:
XP_016 RILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAE
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470 480 490 500 510 520
pF1KA0 DENEKLRQQLIEVEIAKQALQNELEKMKELSLKRRGSKDLPKSEKKAQQTPTEEDNEDLK
:::: ::::.:::::.:::::::::..:: :::::..... : ::: : ...:. ::.
XP_016 DENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKESSLKRRSTREMYK-EKK---TFNQDDSADLR
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pF1KA0 CQLQFVKEEAALMRKKMAKIDKEKDRFEHELQKYRSFYGDLDSPLPKGEAGGPPSTREAE
:::::.:::: ::::::::. .:::..:.:::::.:.:::.::::: :::::::::::::
XP_016 CQLQFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDELEQELQKYKSLYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAE
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pF1KA0 LKLRLRLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAELDDLRGD--------DFNGS--ANPLMR
:::::.::::::::::::::::::::::::::..:.::. : : ..:.
XP_016 LKLRLKLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAEMEDMRGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFG-
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pF1KA0 EQSESLSELRQHLQLVEDETELLRRNVADLEEQNKRITAELNKYKYKS----GGHDSARH
.. :: .:::.:::.::.:.:::::.....:..:...: ::.:.:.. : .
XP_016 DSLESSTELRRHLQFVEEEAELLRRSISEIEDHNRQLTHELSKFKFEPPREPGWLGEGAS
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pF1KA0 HDNAKTEALQEELKAARLQINELSGKVMQLQYENRVLMSNMQRYDLASHLGIRG-SPRDS
. ::::::.:::::.::::::..::.::..:.::.:: :::.:::.:. :::::
XP_016 PGAGGGAPLQEELKSARLQISELSGKVLKLQHENHALLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDS
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:::::::::::: ..:: :. :::::.::::::::. .. :... : :
XP_016 DAESDAGKKESDGEESRLPQPKREGPVGGESDSEEMFEKTSGFGSGKPSEASEPCPTELL
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pF1KA0 KSFSDRQQMKDIRSEAERLGKTIDRLIADTSTIITEARIYVANGDLFG--LMDEEDDG-S
:. : . . .. ::.:: .:..:::.::.... .: . ... : : :. ::..: .
XP_016 KAREDSEYLVTLKHEAQRLERTVERLITDTDSFLHDAGLR-GGAPLPGPGLQGEEEQGEG
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pF1KA0 RIREHELLYRINAQMKAFRKELQTFIDRLEVPKSADDRGAEEPISVSQMFQPIILLILIL
.: .:: :::.::::.::::.:....
XP_016 DQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIGDGLSPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSP
510 520 530 540 550 560
>>XP_011523942 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule cro (2047 aa)
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pF1KA0 MSQPPIGGAAPATAAASPAAAATEARLHPEGSSRKQQRAQSPARPRDSSLRQTIAATR
: ::.:: . :. . .::: . :. .:: ::::: ..:.
XP_011 METLNGPAGGGAPDAKLQPPGQHHRHHHLHPVAERRRLHRAPSPARPFLKDLHAR-----
10 20 30 40 50
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pF1KA0 SPVGAGTKLNSVRQQQLQQQQQQGNKTGSRTGPPASIRGGGGGAEKATPLAPKGAAPGAV
:.. : . : . .. : .:. :.:. . : .... :..:::
XP_011 -PAAPGPAVPSSGRAPAPAAPRSPNLAGKAPPSPGSLAAPGRLSRRS------GGVPGAK
60 70 80 90 100
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pF1KA0 Q---PVAGAEAAPAATLAALGGRRPG--PPEEPPRELESVPSKLGEPPPLGEGGGGGGEG
. : :::.:: .: ::::.:: . : :: :. :.:: .: .....:
XP_011 DKPPPGAGARAAGGAK-AALGSRRAARVAPAEPL-------SRAGKPPG-AEPPSAAAKG
110 120 130 140 150
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pF1KA0 GGAGGGSGEREGGAPQPPPPRGWRGKGVRAQQRGGSGGEGASPSPSSSSAGKTPGTGSRN
: :: . . :: : ..: : .: :: .:. ::
XP_011 RKAKRGSRAPPARTVGPPTP------AARIP---------AVTLAVTSVAG-SPARCSRI
160 170 180 190 200
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pF1KA0 SGSGVAGGGSGGGGSYWKEGCLQSELIQFHLKKERAAAAAAAAQMHAKNGGGSSSRSSPV
: . .. : : :: :. :. ::... :..: :::.: :
XP_011 SHTDSSSDLSD---------C-PSE----PLSDEQRLLPAASSD--AESGTGSSDREPPR
210 220 230 240
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pF1KA0 SGP----------PAVCETLAVASASPMAAAAEGPQQSAEGSASGG--------GMQAAA
..: :. : :. :.:.::.: .: ...::: ... .
XP_011 GAPTPSPAARGAPPGSPEPPALL-AAPLAAGACPGGRSIPSGVSGGFAGPGVAEDVRGRS
250 260 270 280 290 300
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pF1KA0 PPS----SQPHPQQLQEQ---------EEMQEEMEKLREENETLKNEIDELRTEMDEMRD
:: . :. .: :: ::. .:::.:: ::. ::.:.::::.::.::::
XP_011 PPERPVPGTPKEPSLGEQSRLVPAAEEEELLREMEELRSENDYLKDELDELRAEMEEMRD
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pF1KA0 TFFEEDACQLQEMRHELERANKNCRILQYRLRKAERKRLRYAQTGEIDGELLRSLEQDLK
...:::. ::::.:.::.:::::::::::::::::.: :. :.::..::::.::::::::
XP_011 SYLEEDVYQLQELRRELDRANKNCRILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRSLEQDLK
370 380 390 400 410 420
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pF1KA0 VAKDVSVRLHHELENVEEKRTTTEDENEKLRQQLIEVEIAKQALQNELEKMKELSLKRRG
:::::::::::::..:::::. .::::: ::::.:::::.:::::::::..:: :::::.
XP_011 VAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAEDENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKESSLKRRS
430 440 450 460 470 480
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pF1KA0 SKDLPKSEKKAQQ--------------TPTE--------EDNEDLKCQLQFVKEEAALMR
.... : .: .: : :. .:. ::.:::::.:::: :::
XP_011 TREMYKEKKTFNQQNGGMERPGNCRPATKTQRKLAPRRKDDSADLRCQLQFAKEEAFLMR
490 500 510 520 530 540
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pF1KA0 KKMAKIDKEKDRFEHELQKYRSFYGDLDSPLPKGEAGGPPSTREAELKLRLRLVEEEANI
:::::. .:::..:.:::::.:.:::.::::: ::::::::::::::::::.::::::::
XP_011 KKMAKLGREKDELEQELQKYKSLYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAELKLRLKLVEEEANI
550 560 570 580 590 600
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pF1KA0 LGRKIVELEVENRGLKAELDDLRGD--------DFNGS--ANPLMREQSESLSELRQHLQ
::::::::::::::::::..:.::. : : ..:. .. :: .:::.:::
XP_011 LGRKIVELEVENRGLKAEMEDMRGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFG-DSLESSTELRRHLQ
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pF1KA0 LVEDETELLRRNVADLEEQNKRITAELNKYKYKS----GGHDSARHHDNAKTEALQEELK
.::.:.:::::.....:..:...: ::.:.:.. : . . ::::::
XP_011 FVEEEAELLRRSISEIEDHNRQLTHELSKFKFEPPREPGWLGEGASPGAGGGAPLQEELK
670 680 690 700 710 720
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pF1KA0 AARLQINELSGKVMQLQYENRVLMSNMQRYDLASHLGIRG-SPRDSDAESDAGKKESD-D
.:::::.::::::..::.::..:.::.:: :::.:::.:. ::::::::::::::::: .
XP_011 SARLQISELSGKVLKLQHENHALLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDSDAESDAGKKESDGE
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pF1KA0 DSRPPHRKREGPIGGESDSEEV----RNIRCLTPTRSFYPAPGPWPKSFSDRQQMKDIRS
.:: :. :::::.::::::::. .. :... : : :. : . . ..
XP_011 ESRLPQPKREGPVGGESDSEEMFEKTSGFGSGKPSEASEPCPTELLKAREDSEYLVTLKH
790 800 810 820 830 840
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pF1KA0 EAERLGKTIDRLIADTSTIITEARIYVANGDLFG--LMDEEDDG-SRIREHELLYRINAQ
::.:: .:..:::.::.... .: . ... : : :. ::..: . .: .:: :::.
XP_011 EAQRLERTVERLITDTDSFLHDAGLR-GGAPLPGPGLQGEEEQGEGDQQEPQLLGTINAK
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 MKAFRKELQTFIDRLEVPKSADDRGAEEPISVSQMFQPIILLILILVLFSSLSYTTIFKL
::::.::::.:....
XP_011 MKAFKKELQAFLEQVNRIGDGLSPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSPIGNLGKELGPDLQS
910 920 930 940 950 960
>>XP_016881160 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule cro (1766 aa)
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pF1KA0 PPSSQPHPQQLQEQEEMQEEMEKLREENETLKNEIDELRTEMDEMRDTFFEEDACQLQEM
...:.::::.::.::::...:::. ::::.
XP_016 RLPLLLQLRKELGALRVSWAPTSRVEGAAPFSDELDELRAEMEEMRDSYLEEDVYQLQEL
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pF1KA0 RHELERANKNCRILQYRLRKAERKRLRYAQTGEIDGELLRSLEQDLKVAKDVSVRLHHEL
:.::.:::::::::::::::::.: :. :.::..::::.:::::::::::::::::::::
XP_016 RRELDRANKNCRILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRSLEQDLKVAKDVSVRLHHEL
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pF1KA0 ENVEEKRTTTEDENEKLRQQLIEVEIAKQALQNELEKMKELSLKRRGSKDLPKSEKKAQQ
..:::::. .::::: ::::.:::::.:::::::::..:: :::::..... : .: .:
XP_016 KTVEEKRAKAEDENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKESSLKRRSTREMYKEKKTFNQ
140 150 160 170 180 190
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pF1KA0 --------------TPTE--------EDNEDLKCQLQFVKEEAALMRKKMAKIDKEKDRF
: :. .:. ::.:::::.:::: ::::::::. .:::..
XP_016 QNGGMERPGNCRPATKTQRKLAPRRKDDSADLRCQLQFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDEL
200 210 220 230 240 250
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pF1KA0 EHELQKYRSFYGDLDSPLPKGEAGGPPSTREAELKLRLRLVEEEANILGRKIVELEVENR
:.:::::.:.:::.::::: ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
XP_016 EQELQKYKSLYGDVDSPLPTGEAGGPPSTREAELKLRLKLVEEEANILGRKIVELEVENR
260 270 280 290 300 310
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pF1KA0 GLKAELDDLRGD--------DFNGS--ANPLMREQSESLSELRQHLQLVEDETELLRRNV
:::::..:.::. : : ..:. .. :: .:::.:::.::.:.:::::..
XP_016 GLKAEMEDMRGQQEREGPGRDHAPSIPTSPFG-DSLESSTELRRHLQFVEEEAELLRRSI
320 330 340 350 360
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pF1KA0 ADLEEQNKRITAELNKYKYKS----GGHDSARHHDNAKTEALQEELKAARLQINELSGKV
...:..:...: ::.:.:.. : . . ::::::.:::::.::::::
XP_016 SEIEDHNRQLTHELSKFKFEPPREPGWLGEGASPGAGGGAPLQEELKSARLQISELSGKV
370 380 390 400 410 420
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pF1KA0 MQLQYENRVLMSNMQRYDLASHLGIRG-SPRDSDAESDAGKKESD-DDSRPPHRKREGPI
..::.::..:.::.:: :::.:::.:. ::::::::::::::::: ..:: :. :::::.
XP_016 LKLQHENHALLSNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDSDAESDAGKKESDGEESRLPQPKREGPV
430 440 450 460 470 480
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pF1KA0 GGESDSEEV----RNIRCLTPTRSFYPAPGPWPKSFSDRQQMKDIRSEAERLGKTIDRLI
::::::::. .. :... : : :. : . . .. ::.:: .:..:::
XP_016 GGESDSEEMFEKTSGFGSGKPSEASEPCPTELLKAREDSEYLVTLKHEAQRLERTVERLI
490 500 510 520 530 540
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pF1KA0 ADTSTIITEARIYVANGDLFG--LMDEEDDG-SRIREHELLYRINAQMKAFRKELQTFID
.::.... .: . ... : : :. ::..: . .: .:: :::.::::.::::.:..
XP_016 TDTDSFLHDAGLR-GGAPLPGPGLQGEEEQGEGDQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLE
550 560 570 580 590 600
900 910 920 930 940
pF1KA0 RLEVPKSADDRGAEEPISVSQMFQPIILLILILVLFSSLSYTTIFKLVFLFTLFFVL
..
XP_016 QVNRIGDGLSPLPHLTESSSFLSTVTSVSRDSPIGNLGKELGPDLQSRLKEQLEWQLGPA
610 620 630 640 650 660
>>XP_016881162 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule cro (1715 aa)
initn: 1862 init1: 661 opt: 661 Z-score: 282.2 bits: 64.4 E(85289): 5.6e-09
Smith-Waterman score: 1869; 56.5% identity (79.1% similar) in 561 aa overlap (377-892:1-559)
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 QEQEEMQEEMEKLREENETLKNEIDELRTEMDEMRDTFFEEDACQLQEMRHELERANKNC
:.::::...:::. ::::.:.::.::::::
XP_016 MEEMRDSYLEEDVYQLQELRRELDRANKNC
10 20 30
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 RILQYRLRKAERKRLRYAQTGEIDGELLRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELENVEEKRTTTE
:::::::::::.: :. :.::..::::.:::::::::::::::::::::..:::::. .:
XP_016 RILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAE
40 50 60 70 80 90
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pF1KA0 DENEKLRQQLIEVEIAKQALQNELEKMKELSLKRRGSKDLPKSEKKAQQ-----------
:::: ::::.:::::.:::::::::..:: :::::..... : .: .:
XP_016 DENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKESSLKRRSTREMYKEKKTFNQQNGGMERPGNC
100 110 120 130 140 150
520 530 540 550 560
pF1KA0 ---TPTE--------EDNEDLKCQLQFVKEEAALMRKKMAKIDKEKDRFEHELQKYRSFY
: :. .:. ::.:::::.:::: ::::::::. .:::..:.:::::.:.:
XP_016 RPATKTQRKLAPRRKDDSADLRCQLQFAKEEAFLMRKKMAKLGREKDELEQELQKYKSLY
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570 580 590 600 610 620
pF1KA0 GDLDSPLPKGEAGGPPSTREAELKLRLRLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAELDDLRG
::.::::: ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:.::
XP_016 GDVDSPLPTGEAGGPPSTREAELKLRLKLVEEEANILGRKIVELEVENRGLKAEMEDMRG
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630 640 650 660 670
pF1KA0 D--------DFNGS--ANPLMREQSESLSELRQHLQLVEDETELLRRNVADLEEQNKRIT
. : : ..:. .. :: .:::.:::.::.:.:::::.....:..:...:
XP_016 QQEREGPGRDHAPSIPTSPFG-DSLESSTELRRHLQFVEEEAELLRRSISEIEDHNRQLT
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pF1KA0 AELNKYKYKS----GGHDSARHHDNAKTEALQEELKAARLQINELSGKVMQLQYENRVLM
::.:.:.. : . . ::::::.:::::.::::::..::.::..:.
XP_016 HELSKFKFEPPREPGWLGEGASPGAGGGAPLQEELKSARLQISELSGKVLKLQHENHALL
330 340 350 360 370 380
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pF1KA0 SNMQRYDLASHLGIRG-SPRDSDAESDAGKKESD-DDSRPPHRKREGPIGGESDSEEV--
::.:: :::.:::.:. ::::::::::::::::: ..:: :. :::::.::::::::.
XP_016 SNIQRCDLAAHLGLRAPSPRDSDAESDAGKKESDGEESRLPQPKREGPVGGESDSEEMFE
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pF1KA0 --RNIRCLTPTRSFYPAPGPWPKSFSDRQQMKDIRSEAERLGKTIDRLIADTSTIITEAR
.. :... : : :. : . . .. ::.:: .:..:::.::.... .:
XP_016 KTSGFGSGKPSEASEPCPTELLKAREDSEYLVTLKHEAQRLERTVERLITDTDSFLHDAG
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pF1KA0 IYVANGDLFG--LMDEEDDG-SRIREHELLYRINAQMKAFRKELQTFIDRLEVPKSADDR
. ... : : :. ::..: . .: .:: :::.::::.::::.:....
XP_016 LR-GGAPLPGPGLQGEEEQGEGDQQEPQLLGTINAKMKAFKKELQAFLEQVNRIGDGLSP
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:.::::...:::. ::::.:.::.::::::
XP_016 MEEMRDSYLEEDVYQLQELRRELDRANKNC
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pF1KA0 RILQYRLRKAERKRLRYAQTGEIDGELLRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELENVEEKRTTTE
:::::::::::.: :. :.::..::::.:::::::::::::::::::::..:::::. .:
XP_016 RILQYRLRKAEQKSLKVAETGQVDGELIRSLEQDLKVAKDVSVRLHHELKTVEEKRAKAE
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:::: ::::.:::::.:::::::::..:: :::::..... : .: .:
XP_016 DENETLRQQMIEVEISKQALQNELERLKESSLKRRSTREMYKEKKTFNQQNGGMERPGNC
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: :. .:. ::.:::::.:::: ::::::::. .:::..:.:::::.:.:
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. : : ..:. .. :: .:::.:::.::.:.:::::.....:..:...:
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::.:.:.. : . . ::::::.:::::.::::::..::.::..:.
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pF1KA0 SNMQRYDLASHLGIRG-SPRDSDAESDAGKKESD-DDSRPPHRKREGPIGGESDSEEV--
::.:: :::.:::.:. ::::::::::::::::: ..:: :. :::::.::::::::.
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.. :... : : :. : . . .. ::.:: .:..:::.::.... .:
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. ... : : :. ::..: . .: .:: :::.::::.::::.:....
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>>XP_016881163 (OMIM: 615766) PREDICTED: microtubule cro (1715 aa)
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Smith-Waterman score: 1869; 56.5% identity (79.1% similar) in 561 aa overlap (377-892:1-559)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]