Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0405
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0405, 660 aa
1>>>pF1KA0405 660 - 660 aa - 660 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4606+/-0.00119; mu= 6.1641+/- 0.072
mean_var=201.8805+/-40.803, 0's: 0 Z-trim(109.9): 149 B-trim: 167 in 1/50
Lambda= 0.090267
statistics sampled from 11054 (11205) to 11054 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 3.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9877.1 FLRT2 gene_id:23768|Hs108|chr14 ( 660) 4435 590.7 2.1e-168
CCDS8057.1 FLRT1 gene_id:23769|Hs108|chr11 ( 674) 1835 252.1 1.8e-66
CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20 ( 649) 1684 232.4 1.5e-60
CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 ( 545) 485 76.2 1.3e-13
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 462 73.3 1.1e-12
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 462 73.3 1.1e-12
CCDS55601.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 519) 427 68.7 2.4e-11
CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 642) 427 68.7 2.8e-11
CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 661) 427 68.8 2.8e-11
CCDS7270.1 LRRTM3 gene_id:347731|Hs108|chr10 ( 581) 414 67.0 8.3e-11
>>CCDS9877.1 FLRT2 gene_id:23768|Hs108|chr14 (660 aa)
initn: 4435 init1: 4435 opt: 4435 Z-score: 3136.7 bits: 590.7 E(32554): 2.1e-168
Smith-Waterman score: 4435; 100.0% identity (100.0% similar) in 660 aa overlap (1-660:1-660)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGLQTTKWPSHGAFFLKSWLIISLGLYSQVSKLLACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLG
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CCDS98 MGLQTTKWPSHGAFFLKSWLIISLGLYSQVSKLLACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 IPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHLQENN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 IPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHLQENN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 IQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 DLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 SLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDNLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 NLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 PTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 ISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDTICSEATTHASYLNNGSNTASSHEQTTSHSMGSP
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CCDS98 VNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDTICSEATTHASYLNNGSNTASSHEQTTSHSMGSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 FLLAGLIGGAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRRKDDYCEAGTKKDNSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 FLLAGLIGGAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRRKDDYCEAGTKKDNSIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 EMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPIYTPNGGINYTDCHIPNNMRYCNSSVPDLEHCHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 EMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPIYTPNGGINYTDCHIPNNMRYCNSSVPDLEHCHT
610 620 630 640 650 660
>>CCDS8057.1 FLRT1 gene_id:23769|Hs108|chr11 (674 aa)
initn: 1879 init1: 1332 opt: 1835 Z-score: 1306.7 bits: 252.1 E(32554): 1.8e-66
Smith-Waterman score: 1835; 43.6% identity (73.8% similar) in 660 aa overlap (16-660:31-674)
10 20 30 40
pF1KA0 MGLQTTKWPSHGAFFLKSWLIISLGLYSQVSKLL---ACPSVCRC
:..::.. :: . ..... .:::::::
CCDS80 MVVAHPTATATTTPTATVTATVVMTTATMDLRDWLFLCYGLIAFLTEVIDSTTCPSVCRC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 DRNFVYCNERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDE
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CCDS80 DNGFIYCNDRGLTSIPADIPDDATTLYLQNNQINNAGIPQDLKTKVNVQVIYLYENDLDE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 FPMNLPKNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLK
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CCDS80 FPINLPRSLRELHLQDNNVRTIARDSLARIPLLEKLHLDDNSVSTVSIEEDAFADSKQLK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 LLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIA
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CCDS80 LLFLSRNHLSSIPSGLPHTLEELRLDDNRISTIPLHAFKGLNSLRRLVLDGNLLANQRIA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 EGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLD
. :::.: .: :.:.:::::. :: .::..:: .:::::: :.::: ......:.:::::
CCDS80 DDTFSRLQNLTELSLVRNSLAAPPLNLPSAHLQKLYLQDNAISHIPYNTLAKMRELERLD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 ISNNQLRMLTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGP
.:::.: : .:.::.:.:: :: ::::::: :.. :. .:.: . .::::.:::::
CCDS80 LSNNNLTTLPRGLFDDLGNLAQLLLRNNPWFCGCNLMWLRDWVKARAAVVNVRGLMCQGP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 EQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTT
:.:::::..... .. : : : . ..:. :: : .:. :
CCDS80 EKVRGMAIKDITSEMDECFETGPQ----GGVANAAAKTTASNHASATTPQGSLFT---LK
370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KA0 SKLP--TIPDWD-GRERVTPPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGH
.: : .:: . .: .. . . .. .. ::...: . . . ...:.:...::
CCDS80 AKRPGLRLPDSNIDYPMATGDGAKTLAIHVKALTADSIRITWKATLPASSFRLSWLRLGH
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 SLVGGIVQERIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFN-YRAVEDTICSEATTHASY
: . : . : .:.:.: . :. :::.::: ::.: ... : : : : .:..: : ::
CCDS80 SPAVGSITETLVQGDKTEYLLTALEPKSTYIICMVTMETSNAYVADETPVCAKAETADSY
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LNNGSNTASSHEQTTSHSMGSPFLLAGLIGGAVIFVLVVL-LSVFCWHMHKKGRYTSQKW
: .:. ..::... . : :::.::::: .:.. : :...::..:. :. ...
CCDS80 ---GPTTTLNQEQNAGPMASLP--LAGIIGGAVALVFLFLVLGAICWYVHQAGELLTRER
540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 KYNRG-RRKDDYCEAGTKKDNSILEMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPIYTPNGGINY
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CCDS80 AYNRGSRKKDDYMESGTKKDNSILEIRGPGLQMLPINPYRA-KEEYVVHTIFPSNGS---
590 600 610 620 630 640
640 650 660
pF1KA0 TDCHIPNNMRYCNS------SVPDLEHCHT
. :. ... : .. ..::... .:
CCDS80 SLCKATHTIGYGTTRGYRDGGIPDIDYSYT
650 660 670
>>CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20 (649 aa)
initn: 1873 init1: 1395 opt: 1684 Z-score: 1200.6 bits: 232.4 E(32554): 1.5e-60
Smith-Waterman score: 1989; 47.1% identity (75.2% similar) in 649 aa overlap (24-660:15-649)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MGLQTTKWPSHGAFFLKSWLIISLGLYSQVSKLL----ACPSVCRCDRNFVYCNERSLTS
.::. ::. : .:::::::: .:.:::.: :::
CCDS13 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 VPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHL
.: :::: .:.:::.::::::::.:..:.:. .:. .::: :.::::: :::: :. :::
CCDS13 IPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 QENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPV
:::::.::. .:... ::::::::::.:.:..:.::::.. :.:::::.::::..:
CCDS13 QENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFS
::: ..:::.:.:::..::. ..:.::::.::..:::::.:.:... .: .:..: :.:
CCDS13 GLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 IVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVF
.:::::. : .::::.: .::::::.::..: .::: ::.: :::.:::.: : ::.:
CCDS13 LVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 DNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMN
:.:.:. :: :::::.: :..::: .::. .: ..::::.:::.::.:::::...:: .
CCDS13 DDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 LLSCPTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTI--PDWDGR
:..: . :. :: . :: :. : .. :.:.: : : : :
CCDS13 LFDCKDS--GIV------STIQITTAIPNTVYPAQGQW---PAPVT-KQPDIKNPKLTKD
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ERVT-PPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSG
...: : . : .... :.. .:..:: . . : .:.:.:.::: . : . : ::.:
CCDS13 HQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTG
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDT-ICSEATTHASYLNNGSNTASSHEQT
:... .. ::: : :..:.::... : ..: .: :. : . : ..: . ...
CCDS13 ERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEK
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 TSHSMGSPFL-LAGLIGGAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRR-KDDYCE
.. .: : ::..::::: .: ..::.. ::..:..: :.. :..::: :::: :
CCDS13 EPYK--NPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAE
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640
pF1KA0 AGTKKDNSILEMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPIYTPNGGINYTDCHIPN--NMRYC
:::::::::::. :::::.. ..:. . : .: .. :. ::: : . : . : :
CCDS13 AGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYR
580 590 600 610 620 630
650 660
pF1KA0 NSSVPDLEHCHT
.:..:: .: :.
CCDS13 DSGIPDSDHSHS
640
>>CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 (545 aa)
initn: 497 init1: 283 opt: 485 Z-score: 357.8 bits: 76.2 E(32554): 1.3e-13
Smith-Waterman score: 485; 30.3% identity (63.8% similar) in 343 aa overlap (50-377:129-464)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 LIISLGLYSQVSKLLACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLGIPEGVTVL---YLHNNQIN
: : ..: :. . ...: .:..::..
CCDS33 LEDLEVTGSSFLNLSTNIFSNLTSLGKLTLNFNMLEALPEGLFQHLAALESLHLQGNQLQ
100 110 120 130 140 150
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 NAGFPAELHN-VQSVHTVYLYGNQLDEFPMNL--P-KNVRVLHLQENNIQTISRAALAQL
..: .: . . ..:. : : : ..: .: : ....:.:..: .. . ......:
CCDS33 --ALPRRLFQPLTHLKTLNLAQNLLAQLPEELFHPLTSLQTLKLSNNALSGLPQGVFGKL
160 170 180 190 200 210
140 150 160 170 180
pF1KA0 LKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELR---VDE
.:.:: ::.:.:: . . .: . . :. :.:..: .. .:... ..: .: ..
CCDS33 GSLQELFLDSNNISELPPQ--VFSQLFCLERLWLQRNAITHLPLSIFASLGNLTFLSLQW
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPPPDL
: . :. : . : : . : : . .:::::.::..:. . . :...: : .
CCDS33 NMLRVLPAGLFAHTPCLVGLSLTHNQLET--VAEGTFAHLSNLRSLMLSYNAITHLPAGI
280 290 300 310 320 330
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 --PGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDNLSNLKQLTA
.:..::: .:... . . :.:: ::: :..:.::: : .:.::. :: .:.
CCDS33 FRDLEELVKLYLGSNNLTALHPALFQNLSKLELLSLSKNQLTTLPEGIFDTNYNLFNLAL
340 350 360 370 380 390
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RNNPWFCDCSIKWVTEWLK-YIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTP-
..::: ::: . .. .::. : ::.. . : :: ..:..: :: . : ::.:
CCDS33 HGNPWQCDCHLAYLFNWLQQYTDRLLNIQTY-CAGPAYLKGQVVPALNEKQLVCPVTRDH
400 410 420 430 440 450
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 -GLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPPISER
:. . : : :
CCDS33 LGFQVTWPDESKAGGSWDLAVQERAARSQCTYSNPEGTVVLACDQAQCRWLNVQLSPQQG
460 470 480 490 500 510
>>CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 (581 aa)
initn: 388 init1: 188 opt: 462 Z-score: 341.2 bits: 73.3 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 462; 29.2% identity (60.7% similar) in 377 aa overlap (54-414:161-527)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 LGLYSQVSKLLACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLGIPE---GVTVLYLHNNQINNAGF
: .: : . :.: : : .:.... .
CCDS33 LLSSNQLLQIQPAHFSQCSNLKELQLHGNHLEYIPDGAFDHLVGLTKLNLGKNSLTHIS-
140 150 160 170 180
90 100 110 120 130
pF1KA0 PAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPK---NVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEE
: .... ..... :: :.: ..::. :.. : ::.:.: .: . . . .:..
CCDS33 PRVFQHLGNLQVLRLYENRLTDIPMGTFDGLVNLQELALQQNQIGLLSPGLFHNNHNLQR
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 LHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGL--PV-DLQELRVDENRIAV
:.:..: :: . ..: . .:. : : : :. . :. :. .:.:: . .:.:.
CCDS33 LYLSNNHISQL--PPSVFMQLPQLNRLTLFGNSLKELSPGIFGPMPNLRELWLYDNHISS
250 260 270 280 290 300
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 ISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPPPDLPGT--
. : .:.:: .:. ::.. : .. :. :.:. ::.:.:.:. :.:. :: :.
CCDS33 LPDNVFSNLRQLQVLILSRNQISF--ISPGAFNGLTELRELSLHTNALQ----DLDGNVF
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300
pF1KA0 ----HLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDNLSNLKQLTAR
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370 380 390 400 410 420
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CCDS46 RMLANLQNISLQNNRLRQLPGNIFANVNGLMAIQLQNNQLENLPLGIFDHLGKLCELRLY
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CCDS46 PSYPETPWYPDTPSYPDTTSVSSTTE-LTSPVEDYTDLTTIQVTDDRSVWGMTQAQSGLA
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CCDS46 IAAIVIGIVALACSLAACVGCCCCKKRSQAVLMQMKAPNEC
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pF1KA0 DDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAF
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pF1KA0 DNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRM--LTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCSI
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CCDS55 DRGRLGKEKEEEEEEEEEEEETR
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pF1KA0 DNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRM--LTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCSI
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CCDS57 NNKISAVPANAFDSTPNLKGIFLRFNKLAVGSVVDSAFRRLKHLQVLDIEGNLEFGDISK
580 590 600 610 620 630
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CCDS57 DRGRLGKEKEEEEEEEEEEEETR
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CCDS72 MGFNVIRLLSGSAVALVIAPTVLLTMLSSAER--GCPKGCRCEGKMVYCESQKLQEIPSS
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CCDS72 ISAGCLGLSLRYNSLQKLKY-NQFKGLNQLTWLYLDHNHISNIDENAFNGIRRLKELILS
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CCDS72 SNRISYFLNNTFRPVTNLRNLDLSYNQLHSLGSEQ--FRGLRKLLSLHLRSNSLRTIPVR
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CCDS72 IFQDCRNLELLDLGYNRIRSLARNVFAGMIRLKELHLEHNQFSKLNLA--LFPRLVSLQN
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CCDS72 LYLQWNKISVIGQTMSWTWSSLQRLDLSGNEIEAFSGP-SVFQCVPNLQRLNLDSNKLTF
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. : : .: : : . .:: .: ..: :.. :: : ::.
CCDS72 IDAVKNYSICGKSTT--ERFDLARALPKPTFKP---KLPRPKHESKPPLP-----PTV--
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pF1KA0 WDGRERVTPPISERIQ-LSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQER
: . : . . .:.: . :. . : ... ..: .. :. .:.:
CCDS72 --GATEPGPETDADAEHISFHKIIAGSVALFLSVLVILLVIYVSWKRYPASMKQ--LQQR
400 410 420 430 440 450
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pF1KA0 IV---SGEKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDTICSEATTHASYLNNGSNTA
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CCDS72 SLMRRHRKKKRQSLKQMTPSTQEFYVDYKPTNTETSEMLLNGTGPCTYNKSGSRECEIPL
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660 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]