Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0404
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0404, 1938 aa
1>>>pF1KA0404 1938 - 1938 aa - 1938 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4297+/-0.000849; mu= 16.4154+/- 0.052
mean_var=143.2803+/-28.607, 0's: 0 Z-trim(112.2): 21 B-trim: 149 in 1/52
Lambda= 0.107147
statistics sampled from 13023 (13028) to 13023 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.712), E-opt: 0.2 (0.4), width: 16
Scan time: 5.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31602.1 ATG2A gene_id:23130|Hs108|chr11 (1938) 13101 2037.9 0
CCDS9944.2 ATG2B gene_id:55102|Hs108|chr14 (2078) 2274 364.3 2.8e-99
>>CCDS31602.1 ATG2A gene_id:23130|Hs108|chr11 (1938 aa)
initn: 13101 init1: 13101 opt: 13101 Z-score: 10941.3 bits: 2037.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13101; 99.9% identity (99.9% similar) in 1938 aa overlap (1-1938:1-1938)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSRWLWPWSNCVKERVCRYLLHHYLGHFFQEHLSLDQLSLDLYKGSVALRDIHLEIWSVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSRWLWPWSNCVKERVCRYLLHHYLGHFFQEHLSLDQLSLDLYKGSVALRDIHLEIWSVN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EVLESMESPLELVEGFVGSIEVAVPWAALLTDHCTVRVSGLQLTLQPRRGPAPGAADSQS
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CCDS31 EVLESMESPLELVEGFVGSIEVAVPWAALLTDHCTVRVSGLQLTLQPRRGPAPGAADSQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 WASCMTTSLQLAQECLRDGLPEPSEPPQPLEGLEMFAQTIETVLRRIKVTFLDTVVRVEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WASCMTTSLQLAQECLRDGLPEPSEPPQPLEGLEMFAQTIETVLRRIKVTFLDTVVRVEH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SPGDGERGVAVEVRVQRLEYCDEAVRDPSQAPPVDVHQPPAFLHKLLQLAGVRLHYEELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SPGDGERGVAVEVRVQRLEYCDEAVRDPSQAPPVDVHQPPAFLHKLLQLAGVRLHYEELP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 AQEEPPEPPLQIGSCSGYMELMVKLKQNEAFPGPKLEVAGQLGSLHLLLTPRQLQQLQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AQEEPPEPPLQIGSCSGYMELMVKLKQNEAFPGPKLEVAGQLGSLHLLLTPRQLQQLQEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LSAVSLTDHEGLADKLNKSRPLGAEDLWLIEQDLNQQLQAGAVAEPLSPDPLTNPLLNLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSAVSLTDHEGLADKLNKSRPLGAEDLWLIEQDLNQQLQAGAVAEPLSPDPLTNPLLNLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NTDLFFSMAGLTSSVASALSELSLSDVDLASSVRSDMASRRLSAQAHPAGKMAPNPLLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NTDLFFSMAGLTSSVASALSELSLSDVDLASSVRSDMASRRLSAQAHPAGKMAPNPLLDT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 MRPDSLLKMTLGGVTLTLLQTSAPSSGPPDLATHFFTEFDATKDGPFGSRDFHHLRPRFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRPDSLLKMTLGGVTLTLLQTSAPSSGPPDLATHFFTEFDATKDGPFGSRDFHHLRPRFQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RACPCSHVRLTGTAVQLSWELRTGSRGRRTTSMEVHFGQLEVLECLWPRGTSEPEYTEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RACPCSHVRLTGTAVQLSWELRTGSRGRRTTSMEVHFGQLEVLECLWPRGTSEPEYTEIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 TFPGTLGSQASARPCAHLRHTQILRRVPKSRPRRSVACHCHSELALDLANFQADVELGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TFPGTLGSQASARPCAHLRHTQILRRVPKSRPRRSVACHCHSELALDLANFQADVELGAL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DRLAALLRLATVPAEPPAGLLTEPLPAMEQQTVFRLSAPRATLRLRFPIADLRPERDPWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS31 DRLAALLRLATVPAEPPAGLLTEPLPAMEQQTVFRLSAPRATLRLRFPIADLRPEPDPWA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GQAVRAEQLRLELSEPQFRSELSSGPGPPVPTHLELTCSDLHGIYEDGGKPPVPCLRVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GQAVRAEQLRLELSEPQFRSELSSGPGPPVPTHLELTCSDLHGIYEDGGKPPVPCLRVSK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 ALDPKSTGRKYFLPQVVVTVNPQSSSTQWEVAPEKGEELELSVESPCELREPEPSPFSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALDPKSTGRKYFLPQVVVTVNPQSSSTQWEVAPEKGEELELSVESPCELREPEPSPFSSK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 RTMYETEEMVIPGDPEEMRTFQSRTLALSRCSLEVILPSVHIFLPSKEVYESIYNRINND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RTMYETEEMVIPGDPEEMRTFQSRTLALSRCSLEVILPSVHIFLPSKEVYESIYNRINND
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LLMWEPADLLPTPDPAAQPSGFPGPSGFWHDSFKMCKSAFKLANCFDLTPDSDSDDEDAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LLMWEPADLLPTPDPAAQPSGFPGPSGFWHDSFKMCKSAFKLANCFDLTPDSDSDDEDAH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 FFSVGASGGPQAAAPEAPSLHLQSTFSTLVTVLKGRITALCETKDEGGKRLEAVHGELVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFSVGASGGPQAAAPEAPSLHLQSTFSTLVTVLKGRITALCETKDEGGKRLEAVHGELVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 DMEHGTLFSVSQYCGQPGLGYFCLEAEKATLYHRAAVDDYPLPSHLDLPSFAPPAQLAPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DMEHGTLFSVSQYCGQPGLGYFCLEAEKATLYHRAAVDDYPLPSHLDLPSFAPPAQLAPT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 IYPSEEGVTERGASGRKGQGRGPHMLSTAVRIHLDPHKNVKEFLVTLRLHKATLRHYMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IYPSEEGVTERGASGRKGQGRGPHMLSTAVRIHLDPHKNVKEFLVTLRLHKATLRHYMAL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 PEQSWHSQLLEFLDVLDDPVLGYLPPTVITILHTHLFSCSVDYRPLYLPVRVLITAETFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PEQSWHSQLLEFLDVLDDPVLGYLPPTVITILHTHLFSCSVDYRPLYLPVRVLITAETFT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 LSSNIIMDTSTFLLRFILDDSALYLSDKCEVETLDLRRDYVCVLDVDLLELVIKTWKGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSSNIIMDTSTFLLRFILDDSALYLSDKCEVETLDLRRDYVCVLDVDLLELVIKTWKGST
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 EGKLSQPLFELRCSNNVVHVHSCADSCALLVNLLQYVMSTGDLHPPPRPPSPTEIAGQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EGKLSQPLFELRCSNNVVHVHSCADSCALLVNLLQYVMSTGDLHPPPRPPSPTEIAGQKL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 SESPASLPSCPPVETALINQRDLADALLDTERSLRELAQPSGGHLPQASPISVYLFPGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SESPASLPSCPPVETALINQRDLADALLDTERSLRELAQPSGGHLPQASPISVYLFPGER
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 SGAPPPSPPVGGPAGSLGSCSEEKEDEREEEGDGDTLDSDEFCILDAPGLGIPPRDGEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SGAPPPSPPVGGPAGSLGSCSEEKEDEREEEGDGDTLDSDEFCILDAPGLGIPPRDGEPV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 VTQLHPGPIVVRDGYFSRPIGSTDLLRAPAHFPVPSTRVVLREVSLVWHLYGGRDFGPHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VTQLHPGPIVVRDGYFSRPIGSTDLLRAPAHFPVPSTRVVLREVSLVWHLYGGRDFGPHP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 GHRARTGLSGPRSSPSRCSGPNRPQNSWRTQGGSGRQHHVLMEIQLSKVSFQHEVYPAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GHRARTGLSGPRSSPSRCSGPNRPQNSWRTQGGSGRQHHVLMEIQLSKVSFQHEVYPAEP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 ATGPAAPSQELEERPLSRQVFIVQELEVRDRLASSQINKFLYLHTSERMPRRAHSNMLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ATGPAAPSQELEERPLSRQVFIVQELEVRDRLASSQINKFLYLHTSERMPRRAHSNMLTI
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 KALHVAPTTNLGGPECCLRVSLMPLRLNVDQDALFFLKDFFTSLVAGINPVVPGETSAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KALHVAPTTNLGGPECCLRVSLMPLRLNVDQDALFFLKDFFTSLVAGINPVVPGETSAEA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 RPETRAQPSSPLEGQAEGVETTGSQEAPGGGHSPSPPDQQPIYFREFRFTSEVPIWLDYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RPETRAQPSSPLEGQAEGVETTGSQEAPGGGHSPSPPDQQPIYFREFRFTSEVPIWLDYH
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 GKHVTMDQVGTFAGLLIGLAQLNCSELKLKRLCCRHGLLGVDKVLGYALNEWLQDIRKNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GKHVTMDQVGTFAGLLIGLAQLNCSELKLKRLCCRHGLLGVDKVLGYALNEWLQDIRKNQ
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 LPGLLGGVGPMHSVVQLFQGFRDLLWLPIEQYRKDGRLMRGLQRGAASFGSSTASAALEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LPGLLGGVGPMHSVVQLFQGFRDLLWLPIEQYRKDGRLMRGLQRGAASFGSSTASAALEL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 SNRLVQAIQATAETVYDILSPAAPVSRSLQDKRSARRLRRGQQPADLREGVAKAYDTVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SNRLVQAIQATAETVYDILSPAAPVSRSLQDKRSARRLRRGQQPADLREGVAKAYDTVRE
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 GILDTAQTICDVASRGHEQKGLTGAVGGVIRQLPPTVVKPLILATEATSSLLGGMRNQIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GILDTAQTICDVASRGHEQKGLTGAVGGVIRQLPPTVVKPLILATEATSSLLGGMRNQIV
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930
pF1KA0 PDAHKDHALKWRSDSAQD
::::::::::::::::::
CCDS31 PDAHKDHALKWRSDSAQD
1930
>>CCDS9944.2 ATG2B gene_id:55102|Hs108|chr14 (2078 aa)
initn: 4373 init1: 951 opt: 2274 Z-score: 1895.8 bits: 364.3 E(32554): 2.8e-99
Smith-Waterman score: 4656; 42.6% identity (67.4% similar) in 2022 aa overlap (98-1932:95-2074)
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SPLELVEGFVGSIEVAVPWAALLTDHCTVRVSGLQLTLQPRRGPAPGAADSQSWASCMTT
: ::.....:: :: :. . . :.: ::.
CCDS99 APLEVTEGFIQSISLSVPWGSLLQDNCALEVRGLEMVFRPRPRPATGS-EPMYWSSFMTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SLQLAQECLRDGLP-EPSEPPQPLEGLEMFAQTIETVLRRIKVTFLDTVVRVEHSPGDGE
:.:::.::: . : : .: ::.:::: ::.::::::::.::::.:::.:.:: : ...
CCDS99 SMQLAKECLSQKLTDEQGEGSQPFEGLEKFAETIETVLRRVKVTFIDTVLRIEHVPENSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KA0 RGVAVEVRVQRLEYCDEAVRDPSQAPPVDVHQPPAFLHKLLQLAGVRLHYEEL-------
:.:.:.:..: ::::.. : :.. ..:::: :: ::::::.:: : ..:.
CCDS99 TGTALEIRIERTVYCDETA-DESSG--INVHQPTAFAHKLLQLSGVSLFWDEFSASAKSS
190 200 210 220 230 240
240 250 260
pF1KA0 ------PAQEEP-------------PEP-------------PLQIGSCSGYMELMVKLKQ
:.. :: :.: :.::: : .:: . :::
CCDS99 PVCSTAPVETEPKLSPSWNPKIIYEPHPQLTRNLPEIAPSDPVQIGRLIGRLELSLTLKQ
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 NEAFPGPKLEVAGQLGSLHLLLTPRQLQQLQELLSAVSLTDHE---GLADKLNKSRPLGA
::..:: ::.: ::. :.::::.:::.. : ..:.:.. .. :::.: :.::.
CCDS99 NEVLPGAKLDVDGQIDSIHLLLSPRQVHLLLDMLAAIAGPENSSKIGLANKDRKNRPMQQ
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370
pF1KA0 EDLWLIEQDLNQ------QLQAGAVAEPLSPDPLTNPLLNLDNTDLFFSMAGLTSSVASA
:: . :...::. .:..:. .: . : . . ..::::: . ... .
CCDS99 EDEYRIQMELNRYYLRKDSLSVGVSSEQSFYETETARTPSSREEEVFFSMADM--DMSHS
370 380 390 400 410
380 390 400
pF1KA0 LSELS-LSD---VDLASSVRSDM----ASRRLSAQA----------H-----------PA
:: : :.: .:: :. : . :. ::: . : :.
CCDS99 LSSLPPLGDPPNMDLELSLTSTYTNTPAGSPLSATVLQPTWGEFLDHHKEQPVRGSTFPS
420 430 440 450 460 470
410 420 430 440 450
pF1KA0 GKMAPNPL-----------LDTMRPDSLLKMTLGGVTLTLLQTSAPSSGPPD--------
. . :.:: .: ::. ......: ....:. . : : ::.
CCDS99 NLVHPTPLQKTSLPSRSVSVDESRPELIFRLAVGTFSISVLHID-PLS-PPETSQNLNPL
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500
pF1KA0 --LATHFFTEFDATKDGPFGSRDFHHLRPRFQRACPCSHVRLTGTAVQLSWELRTGSRGR
.:. ::: .. . :...::. .: : .:: .:.:. ::....:.: : : .
CCDS99 TPMAVAFFTCIEKIDPARFSTEDFKSFRAVFAEACSHDHLRFIGTGIKVSYEQRQRS-AS
540 550 560 570 580 590
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 RTTSMEVHFGQLEVLECLWPRG--TSEPEYTEILTFPGTLGSQASARPCAHLRHTQILRR
: : .. .::.: ::::.: . :.:::.::: . . . . : .:.. . :
CCDS99 RYFSTDMSIGQMEFLECLFPTDFHSVPPHYTELLTFHSKEETGSHSPVCLQLHYKHSENR
600 610 620 630 640 650
570 580 590 600 610
pF1KA0 VPKSRPRRSVACHCHSELALDLANFQADVELGALDRLAALL---RLATVPA---------
:.. : . ..:: . : ..... .::: .:: .::::
CCDS99 GPQGNQARLSSVPHKAELQIKLNPVCCELDISIVDRLNSLLQPQKLATVEMMASHMYTSY
660 670 680 690 700 710
620 630 640 650 660
pF1KA0 EPPAGL---LTEPL------PAMEQQTVFRLSAPRATLRLRFPIADLRP--ERDPWAGQA
. .: .:: . :: . .: ....: .: .:::: ::: :: :: ..
CCDS99 NKHISLHKAFTEVFLDDSHSPANCRISV-QVATPALNLSVRFPIPDLRSDQERGPWFKKS
720 730 740 750 760 770
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 VRAEQLRLELSEPQFRSELSSGPGPPVPTHLELTCSDLHGIY-EDGGKPPVPCLRVSKAL
.. : : : ... .:..:. .: . : .:::: .: : . :. : : . ..::...
CCDS99 LQKEILYLAFTDLEFKTEFIGG-STPEQIKLELTFRELIGSFQEEKGDPSIKFFHVSSGV
780 790 800 810 820 830
730 740 750 760
pF1KA0 DPKSTGRKYF-LPQVVVTVNPQSSSTQWE-VAPEKGEELE-----------LSVESPCEL
: .:. : :..:. .:: . . : .: :. :: . :... :.:
CCDS99 DGDTTSSDDFDWPRIVLKINPPAMHSILERIAAEEEEENDGHYQEEEEGGAHSLKDVCDL
840 850 860 870 880 890
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 REPEPSPFSSKRTMYETEEMVIPGDPEEMRTFQSRTLALSRCSLEVILPSVHIFLPSKEV
:.: ::::::.:.:.:.:.::.:::: :: ::..... :. ::. ::.... ::.:
CCDS99 RRPAPSPFSSRRVMFENEQMVMPGDPVEMTEFQDKAISNSHYVLELTLPNIYVTLPNKSF
900 910 920 930 940 950
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 YESIYNRINNDLLMWEPADLLPTP----DPAAQPSGFPGPSG----FWHDSFKMCKSAFK
::..:::: ::::.:::. :.: . . :. : : .::: ::::
CCDS99 YEKLYNRIFNDLLLWEPTA--PSPVETFENISYGIGLSVASQLINTFNKDSF----SAFK
960 970 980 990 1000
890 900 910 920 930
pF1KA0 LANCFDLTPDSDSDDEDAHFFSVGASG--GPQAAAPEAPSLHLQSTFSTLVTVLKGRITA
: .: .: :..: ..::. . . . .. . . :: .:.:... .: :..
CCDS99 SAVHYD--EESGSEEETLQYFSTVDPNYRSRRKKKLDSQNKNSQSFLSVLLNINHGLIAV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 LCETKDEGGKRLEAVHGELVLDMEHGTLFSVSQYCGQPGLGYFCLEAEKATLYHRAAVDD
. ..:...: :: :::. :... :.:: :..: : :.::.. . .:::.. :.
CCDS99 FTDVKQDNGDLLENKHGEFWLEFNSGSLFCVTKYEGFDDKHYICLHSSSFSLYHKGIVNG
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 YPLPSHLDLPSFAPPAQLAPTIYPSEE-GVTERGASGRKGQGRGPHMLSTAVRIHLDPHK
::.. ::: . : : :::: ::: :... ...: :.. .:::.::.: : .
CCDS99 VILPTETRLPSSTRPHWLEPTIYSSEEDGLSKTSSDGVGGDSL--NMLSVAVKILSDKSE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 -NVKEFLVTLRLHKATLRHYMALPEQ-SWHSQLLEFLDVLDDPVLGYLPPTVITILHTHL
:.::::... :. :::.: : :: ::: :.: ::.. :.::::: ::: .: .:.::
CCDS99 SNTKEFLIAVGLKGATLQHRM-LPSGLSWHEQILYFLNIADEPVLGYNPPTSFTTFHVHL
1190 1200 1210 1220 1230 1240
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CCDS99 PDVRQDESQKWRHGDD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]