FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0382, 1544 aa
1>>>pF1KA0382 1544 - 1544 aa - 1544 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9437+/-0.00122; mu= 12.1761+/- 0.074
mean_var=172.8320+/-34.539, 0's: 0 Z-trim(107.8): 131 B-trim: 156 in 1/50
Lambda= 0.097558
statistics sampled from 9693 (9833) to 9693 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16
Scan time: 3.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1544) 10158 1443.5 0
CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1525) 9750 1386.1 0
CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1441) 9491 1349.6 0
CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1522) 1687 251.3 1.8e-65
CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1562) 1682 250.6 2.9e-65
CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 879) 1259 190.8 1.6e-47
CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 912) 1259 190.9 1.6e-47
CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 927) 1259 190.9 1.6e-47
CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 958) 519 86.7 3.8e-16
CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 985) 519 86.7 3.9e-16
CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 986) 519 86.7 3.9e-16
CCDS57967.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 ( 930) 497 83.6 3.2e-15
CCDS79.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 (1006) 497 83.6 3.4e-15
CCDS41241.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 (1062) 497 83.7 3.5e-15
CCDS57968.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 (1075) 497 83.7 3.5e-15
CCDS41240.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 (1083) 497 83.7 3.6e-15
CCDS57969.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 (1085) 497 83.7 3.6e-15
CCDS45946.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1173) 496 83.5 4.2e-15
CCDS12177.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1015) 493 83.1 5e-15
CCDS73778.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (1434) 487 82.3 1.2e-14
CCDS32319.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2813) 487 82.6 2e-14
CCDS32320.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2817) 487 82.6 2e-14
CCDS58957.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1392) 471 80.1 5.5e-14
CCDS54870.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1705) 471 80.1 6.4e-14
CCDS47231.2 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1731) 471 80.2 6.5e-14
CCDS1711.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1670) 442 76.1 1.1e-12
CCDS1710.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1697) 442 76.1 1.1e-12
CCDS82664.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1716) 441 75.9 1.2e-12
CCDS33545.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1721) 441 75.9 1.2e-12
>>CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1544 aa)
initn: 10158 init1: 10158 opt: 10158 Z-score: 7732.4 bits: 1443.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10158; 100.0% identity (100.0% similar) in 1544 aa overlap (1-1544:1-1544)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSGTQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTDSSSKKTKSSSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSGTQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTDSSSKKTKSSSEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SRSEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SRSEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 ASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RPSSDNADSPKSGPKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RPSSDNADSPKSGPKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 IFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 EDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LPANSMSSVASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LPANSMSSVASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 VQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 LKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 KKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 IHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 KLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 PIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 GKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 QLLVQQLGLTEKSVQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QLLVQQLGLTEKSVQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 DIATCYSPRTSTESFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DIATCYSPRTSTESFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 FFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 PMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540
pF1KA0 SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
1510 1520 1530 1540
>>CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1525 aa)
initn: 10035 init1: 9737 opt: 9750 Z-score: 7422.2 bits: 1386.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10001; 98.8% identity (98.8% similar) in 1544 aa overlap (1-1544:1-1525)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSGTQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTDSSSKKTKSSSEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSGTQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPT-------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SRSEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ------GLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 ASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDAS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RPSSDNADSPKSGPKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RPSSDNADSPKSGPKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGT
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRR
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 IFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHL
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 EDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDK
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSI
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGY
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LPANSMSSVASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LPANSMSSVASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQ
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 VQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLG
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 LKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQ
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKS
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKV
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 KKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKM
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 IHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QLLVQQLGLTEKSVQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DIATCYSPRTSTESFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQ
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CCDS55 PMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ
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CCDS55 SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHCRQILNY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRDLFVAER
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTGDIATCYSPRTSTE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDENP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVESTHQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQSQIMEYIHKIEAD
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CCDS76 LEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
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CCDS11 MSVRLPQSIDRLSS--LSSLGDSAPERKSPSHHRQP
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:: ::::::::::::..:::.::::: :.::::. ::::.:::. :::::::::
CCDS11 SDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNG
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pF1KA0 TLVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSP
:.::.:.:::::::::::.:::::. : :.: : ... :. ... .. :: :
CCDS11 TMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPP
100 110 120 130 140 150
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pF1KA0 GASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEI
.:::.: . .. :... ..:::.::..:...:: . :. : .::
CCDS11 PPLPPPQRITGPKPL--QDPEVQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLYGDT-SQR----P
160 170 180 190 200
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pF1KA0 QEAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDA
.:.. . :. :. :.. : : ..::. . ..::
CCDS11 SEGRLSLD------SQEGDSGLDSG--TERFP-----SLSESLMNRNSVL----------
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pF1KA0 SRPSSDNADSPKSGP--KERIYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDD
:. . :::...: :. .. . :.. . .: :.. ::. : ::: :.:
CCDS11 ---SDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----PLIIGPEED
250 260 270 280 290
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pF1KA0 -DFGTEHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNS
: : ... . ::..: ::::::::.:::... :: ::. :: :: ...:....
CCDS11 YDPGYFNNESD---IIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASP
300 310 320 330 340 350
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pF1KA0 KETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPE
:..: . .. ..::...: :.:..:. ..:....: . :: : . :: . ::
CCDS11 KDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLCEAQEAAMPE
360 370 380 390 400 410
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pF1KA0 VQRHLEDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQA
.:....:.: ::..:: .: :: . : : :: ::. .: . ..: .
CCDS11 IQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAALGDIL---SK
420 430 440 450 460
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pF1KA0 VEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKE--PRNLEHKRGR-------IGFLPKIKQSM--KK
:::.:. :.... ::.: :....: : : .: . :.:: :.: ::
CCDS11 YEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKK
470 480 490 500 510 520
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pF1KA0 DKEGEEKGKRRGFPSILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLSTPSSV-SPEP
.:.. : :: . . .: :. :. .:.. ..:. .:. . .. .:::
CCDS11 EKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEP
530 540 550 560 570 580
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pF1KA0 QDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKE--------------NDTG
. .: ... .. .. .: : . : : : .: .: .:.
CCDS11 -GTQRLSTGSFPEDLLESD----SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVD
590 600 610 620 630
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pF1KA0 SKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDS
..:.. .. ... .:.: .. : ::. . .. ... .: : .
CCDS11 MDAAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSIESPSLGFCT
640 650 660 670 680
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pF1KA0 VAFGESQSEDEQFE-NDLETDPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAH
.. ::. . .::: .: :::. :...:. :: :: ::::::::: :: .:
CCDS11 DTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASH
690 700 710 720 730 740
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pF1KA0 VRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVRKRNETSVID
.:::.::: .::::...:... :: ..: :: .....: . : :: .:. : .:
CCDS11 LRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLRE--EGPIIK
750 760 770 780 790 800
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pF1KA0 QIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCR
.:.. .:. :.::..:.:...:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:.:::.: ::
CCDS11 EISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCR
810 820 830 840 850 860
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pF1KA0 RLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEA
::::.:.: ..:::::::::::..: :.:: : :.::. .: :.::.::.:::.:::..
CCDS11 RLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQT
870 880 890 900 910 920
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pF1KA0 ENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTL
::..::: ::.:::...:. . : . :...:::: :::::::::.:....:::.::..:
CCDS11 ENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVL
930 940 950 960 970 980
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pF1KA0 LLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVIS
::::.::::::::..:.:.:::: ....:::.:::::.::..::.:.::::..:.:.:
CCDS11 LLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIIC
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KA0 MSDNGA-QIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMA-ASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDP
: : ::::::: : :.:..:..:. . . .... .. :.:. :: . .. :
CCDS11 TSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGP
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA0 SKLKEEQHGISVT-GLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSL----STSGKSEVRDLFVAERQ
. . : .: : :.. : .. . . . : :..: ..: :
CCDS11 TPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLP--
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KA0 FAKEQHTDGTLKEVG--EDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQL--GLT
:: . . . ..:.: :. : : .::... :..:.. .: : :
CCDS11 -CPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHT
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KA0 --EKSVQE---DWQHFPRYRTASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EGHMPFRTGTG
...:: : : .... : . .. ..:. .. .: ::. : .
CCDS11 METQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQE---
1230 1240 1250 1260 1270
1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 DIATC----YSPRTSTESF--APRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGL
:.. : ::: . .. .:. . .:: .:..... ... :. . .:
CCDS11 DMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPAL
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1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA0 DDSGEHFFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVA
.::. :. .: : .:.. . .:: . .. . .::::. :
CCDS11 PESGQ---------SEPGPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEA
1340 1350 1360 1370
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::. : .: : :: . : .: : .::
CCDS11 ------PMSP-PQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS-----------------RSPP
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pF1KA0 SCADSQ-SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS
: : . ..:.. :... :..:: .: .. : . :.:
CCDS11 SLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWT
1420 1430 1440 1450 1460 1470
CCDS11 DGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASPGP
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CCDS11 MSVRLPQSIDRLSS--LSSLGDSAPERKSPSHHRQP
10 20 30
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:: ::::::::::::..:::.::::: :.::::. ::::.:::. :::::::::
CCDS11 SDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNG
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120 130 140 150 160 170
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CCDS11 TMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPP
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CCDS11 PPLPPPQRITGPKPL--QDPEVQKHATQILRNMLRQEEKELQRICEVYSRNPASLLEEQI
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. :.... ::: .... ::.. : . : .:: :... : : : : :
CCDS11 EGARRRVTQLQLKIQQETGGSVDILPLYGDTSQRPSEGRLSLDSQEGDSGLDSGTERFPS
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CCDS11 LSESLMNRNSVLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----
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: ::: :.: : : ... . ::..: ::::::::.:::... :: ::. :: ::
CCDS11 PLIIGPEEDYDPGYFNNESD---IIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLC
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...:.... :..: . .. ..::...: :.:..:. ..:....: . :: : .
CCDS11 AEVYQQASPKDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLC
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:: . ::.:....:.: ::..:: .: :: . : : :: ::. .: .
CCDS11 EAQEAAMPEIQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAAL
450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KA0 EEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKE--PRNLEHKRGR-------IGFLPK
..: . :::.:. :.... ::.: :....: : : .: . :.::
CCDS11 GDIL---SKYEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPK
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pF1KA0 IKQSM--KKDKEGEEKGKRRGFPSILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLST
:.: ::.:.. : :: . . .: :. :. .:.. ..:. .:. .
CCDS11 TKKSSNSKKEKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFEN
560 570 580 590 600 610
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.. .::: . .: ... .. .. .: : . : : : .: .:
CCDS11 NQQYDAPEP-GTQRLSTGSFPEDLLESD----SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAEN
620 630 640 650 660
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pF1KA0 -----NDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGT
.:. ..:.. .. ... .:.: .. : ::. . .. ...
CCDS11 VPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSI
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.: : . .. ::. . .::: .: :::. :...:. :: :: ::::::
CCDS11 ESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVIN
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::: :: .:.:::.::: .::::...:... :: ..: :: .....: . : :: .:
CCDS11 ELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLR
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. : .: .:.. .:. :.::..:.:...:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:
CCDS11 E--EGPIIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQ
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.:::.: ::::::.:.: ..:::::::::::..: :.:: : :.::. .: :.::.::.
CCDS11 EAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILK
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:::.:::..::..::: ::.:::...:. . : . :...:::: :::::::::.:....
CCDS11 YVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISK
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CCDS11 DKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVAT
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CCDS11 DKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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. .. :. . : .: : :.. : .. . . . : :..:
CCDS11 PREPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEE
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..: : :: . . . ..:.: :. : : .::... :..:.
CCDS11 EELGVLP---CPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLI
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. .: : : ...:: : : .... : . .. ..:. .. .: ::
CCDS11 LWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEG
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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. : . :.. : ::: . .. .:. . .:: .:..... ... :.
CCDS11 ERPEQE---DMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEV
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pF1KA0 PTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQ
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CCDS11 AGSKVVPALPESGQ---------SEPGPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPP
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.::::. : ::. : .: : :: . : .: :
CCDS11 DSSTDHSEA------PMSP-PQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS------------
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.:: : : . ..:.. :... :..:: .: .. : . :.:
CCDS11 -----RSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGS
1460 1470 1480 1490 1500
CCDS11 FHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASPGP
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CCDS12 KRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLV---------------------------------LRV
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:: ... .:.. : .:: ::..:...: . . . : :.:::::.:: ::.: :.::
CCDS12 PVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQEL
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CCDS12 AQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTI-STDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGV
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CCDS12 RTKSG---DKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTK---KGLSSILDAARWNRGEPQVPDFR
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: .. . :..: . ..:. :. :. ... : :. :. :. .
CCDS12 HLKAEVD-------AEKPGATDRKGGVG-MPS-----RDRNIGAPGQDT---PGVSLHPL
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: : ..: : . ..:..: : : .:... :: :. : :
CCDS12 -SLDSPDREPGADAPL---ELGDSSPQG------PMSLESL--APPESTDEGAETE----
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pF1KA0 RVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQ
.:.: : :.: : : : ::.:..:: ..: .: ..:::
CCDS12 ------SPEP---GDEGEPGRSGLELEPEE------PPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQ
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pF1KA0 EVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSP-SELRKIFSNLEDILQLH-IGLNE
:::.::. :: :::: :.:: ..:.: .. : .. : ::..:: .:......: . :..
CCDS12 EVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMA-ECLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDR
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:: :... .:..::. ::. :.: ... .. ::: : ::::..:..:.:: :
CCDS12 LMK--RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPR
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: .:::.::: : ::::::::.:::.:::::::::::..:.. :: :::::::. ::. :
CCDS12 FCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECC
510 520 530 540 550 560
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:.::..:::::.. :. ::.::::::: : :. : : . :..:::.::.:..:::::.
CCDS12 REILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLT
570 580 590 600 610 620
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:.:..::......:::.:.:.:::.::.::.:. ::. :. : :.: . ::..:.....
CCDS12 WRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMT
630 640 650 660 670 680
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pF1KA0 RQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQS
:.::::.::..:. :. :::::::::::::. : :: . :.:.: . : :.
CCDS12 REVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRP
690 700 710 720 730 740
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pF1KA0 TPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRD
.:
CCDS12 SPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLK
750 760 770 780 790 800
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CCDS12 MEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQV
10 20 30 40 50
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pF1KA0 KSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKV
: ::::: ..:.::. ::.:. ::: :..:. . ::... ::.:.. ::...: :.:
CCDS12 KRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLEKTAVLRV
60 70 80 90 100 110
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pF1KA0 SVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAESEL
:: ... .:.. : .:: ::..:...: . . . : :.:::::.:: ::.: :.::
CCDS12 PVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQEL
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 TKLDAERDKDRLTLE-KERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHLGV
..:.: .:: . : .:: ::... ..::. : ...:.::... .: .::.::::
CCDS12 AQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTI-STDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGV
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 KVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSIL-------GPPRRPS-R
..: ..: :: : :. . ..:. .. : .:. ::: : :. :. :
CCDS12 RTKSG---DKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTK---KGLSSILDAARWNRGEPQVPDFR
240 250 260 270 280
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: .. . :..: . ..:. :. :. ... : :. :. :. .
CCDS12 HLKAEVD-------AEKPGATDRKGGVG-MPS-----RDRNIGAPGQDT---PGVSLHPL
290 300 310 320
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pF1KA0 ASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVE
: : ..: : . ..:..: : : .:... :: :. : :
CCDS12 -SLDSPDREPGADAPL---ELGDSSPQG------PMSLESL--APPESTDEGAETE----
330 340 350 360 370
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 RVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQ
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CCDS12 ------SPEP---GDEGEPGRSGLELEPEE------PPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQ
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790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSP-SELRKIFSNLEDILQLH-IGLNE
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CCDS12 EVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMA-ECLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDR
420 430 440 450 460 470
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pF1KA0 QMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSR
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CCDS12 LMK--RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPR
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pF1KA0 FQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHC
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CCDS12 FCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECC
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pF1KA0 RQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLV
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CCDS12 REILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLT
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pF1KA0 WKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLV
:.:..::......:::.:.:.:::.::.::.:. ::. :. : :.: . ::..:.....
CCDS12 WRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMT
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pF1KA0 RQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQS
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CCDS12 REVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRP
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.:
CCDS12 SPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLK
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CCDS12 MASLSTWSSPAEPREMEDFARGAASPGPSRPGLVPVSI
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CCDS12 IGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADM
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CCDS12 LGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVV
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CCDS12 QSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEE
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. : ...:.::... .: .::.::::..: ..: :: : :. . ..:. .
CCDS12 MQHTI-STDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSG---DKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPA
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CCDS12 KTK---KGLSSILDAARWNRGEPQVPDFRHLKAEVD-------AEKPGATDRKGGVGMPS
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CCDS12 RD----RNIG--APGQDT---PGVSLHPL-SLDSPDREPGADAPL---ELGDSSPQG---
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: .:... :: :. : : .:.: : :.: : : :
CCDS12 ---PMSLESL--APPESTDEGAETE----------SPEPG---DEGEPGRSGLELEPEE-
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::.:..:: ..: .: ..::::::.::. :: :::: :.:: ..:.: .. :
CCDS12 -----PPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMA-E
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.. : ::..:: .:......: . :.. :: :... .:..::. ::. :.:
CCDS12 CLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMK--RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGS
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... .. ::: : ::::..:..:.:: :: .:::.::: : ::::::::.:::.:::::
CCDS12 WFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLT
530 540 550 560 570 580
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pF1KA0 KYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSS
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CCDS12 KYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSH
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pF1KA0 LKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLV
:. : : . :..:::.::.:..:::::.:.:..::......:::.:.:.:::.::.::.
CCDS12 LRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLL
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CCDS12 LKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVS
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pF1KA0 EKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPD
:. : :: . :.:.: . : :. .:
CCDS12 ERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTER
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pF1KA0 RDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPD
CCDS12 ILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSPAR
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. . :. . . .:.:. :. : : .: : ... :. .... :: .
CCDS11 S----RRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRRILSQSTDSLN-MRNRTLSVESLI
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pF1KA0 EHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVI
. . : ..: .:. :. :.:. .: .:. :. : : .:.:.::
CCDS11 D----------EEVIYSELMSDFEMDEKDFAAD--SWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVI
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::. :: ::::::.. ..: . .: : :. .. .: .... ..: . :.
CCDS11 YELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLER
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:.. ... :: ..:. :.. ::::. :.. .. . ::: . ::.. : .:.
CCDS11 RRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDK
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::: :.. . . .: ... : ::.::::::.. : .... ::. . :
CCDS11 RFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALG
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pF1KA0 HCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGP
...:. :.... . :. ::.. :.: . . :. . .: .::.::.:
CCDS11 LVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQ--TPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGC
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:.::. . :. .::. :.::.::..:.. .. : :. :..:...
CCDS11 LLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIF--------PTLDKPS----VVSLQNL
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.::..:...:..:.:: . ..::. . . .....: .: .::.. :
CCDS11 IVRDIANQEKGMFLISAAP--PEMYEVHTASRDDRSTWIRVI--------QQSVRTCPSR
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.. : .:: ..: : ::. :: :
CCDS11 EDFPLIETEDEAYLRRIKME--------LQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGG
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pF1KA0 RDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQ
CCDS11 SGMALPTLPRGLFRSESLESPRGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLE
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>>CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 (985 aa)
initn: 420 init1: 203 opt: 519 Z-score: 403.2 bits: 86.7 E(32554): 3.9e-16
Smith-Waterman score: 592; 25.5% identity (57.3% similar) in 546 aa overlap (643-1181:107-603)
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pF1KA0 SAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASG
:..::.. : ... :..:. . :
CCDS53 NRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIRERPSSAIYPSDSFRQSLLG
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pF1KA0 ASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVERVT
. . :. . . .:.:. :. : : .: : ... :. .... :: .
CCDS53 S----RRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRRILSQSTDSLN-MRNRTLSVESLI
140 150 160 170 180 190
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 EHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVI
. . : ..: .:. :. :.:. .: .:. :. : : .:.:.::
CCDS53 D----------EEVIYSELMSDFEMDEKDFAAD--SWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVI
200 210 220 230
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 NELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAV
::. :: ::::::.. ..: . .: : :. .. .: .... ..: . :.
CCDS53 YELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLER
240 250 260 270 280 290
860 870 880 890 900
pF1KA0 RKR------NETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDS
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CCDS53 RRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDK
300 310 320 330 340 350
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEW-PTEREKVKKAAD
::: :.. . . .: ... : ::.::::::.. : .... ::. . :
CCDS53 RFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALG
360 370 380 390 400 410
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 HCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGP
...:. :.... . :. ::.. :.: . . :. . .: .::.::.:
CCDS53 LVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQ--TPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGC
420 430 440 450 460 470
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 LVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTV
:.::. . :. .::. :.::.::..:.. .. : :. :..:...
CCDS53 LLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIF--------PTLDKPS----VVSLQNL
480 490 500 510 520
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 LVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLP
.::..:...:..:.:: . ..::. . . .....: .: .::.. :
CCDS53 IVRDIANQEKGMFLISAAP--PEMYEVHTASRDDRSTWIRVI--------QQSVRTCPSR
530 540 550 560 570
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 QSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEV
.. : .:: ..: : ::. :: :
CCDS53 EDFPLIETEDEAYLRRIKME--------LQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGG
580 590 600 610 620
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CCDS53 SGMALPTLPRGLFRSESLESPRGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLE
630 640 650 660 670 680
1544 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 06:41:23 2016 done: Sat Nov 5 06:41:23 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]