Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0369
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0369, 729 aa
1>>>pF1KA0369 729 - 729 aa - 729 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8172+/-0.00133; mu= -5.4145+/- 0.079
mean_var=315.6678+/-69.389, 0's: 0 Z-trim(109.8): 653 B-trim: 158 in 1/51
Lambda= 0.072187
statistics sampled from 10416 (11146) to 10416 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9354.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 729) 4795 513.9 3.4e-145
CCDS81762.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 740) 4490 482.1 1.3e-135
CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 422) 2768 302.6 7.9e-82
CCDS34076.1 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 766) 2485 273.3 9.4e-73
CCDS55895.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 433) 2463 270.9 2.9e-72
CCDS47142.2 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 783) 2433 267.9 4.1e-71
CCDS14557.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX ( 360) 1678 189.1 1e-47
CCDS14558.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX ( 365) 1674 188.7 1.4e-47
CCDS83483.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX ( 366) 1674 188.7 1.4e-47
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 1063 125.2 3.1e-28
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 851 102.9 8.8e-22
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 850 102.8 9.6e-22
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 851 103.0 1e-21
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 841 101.9 1.8e-21
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 841 101.9 1.9e-21
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 790 96.7 8.9e-20
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 761 93.7 7.2e-19
CCDS7337.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 527) 744 91.9 2.7e-18
CCDS73153.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 539) 744 91.9 2.7e-18
CCDS7336.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 495) 738 91.3 3.9e-18
CCDS7338.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 556) 738 91.3 4.3e-18
CCDS43386.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 478) 735 90.9 4.7e-18
CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 489) 735 91.0 4.8e-18
CCDS82948.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 512) 722 89.6 1.3e-17
CCDS82949.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 533) 722 89.6 1.3e-17
CCDS5489.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 449) 720 89.4 1.3e-17
CCDS5488.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 479) 720 89.4 1.4e-17
CCDS5487.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 492) 720 89.4 1.4e-17
CCDS5486.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 503) 720 89.4 1.5e-17
CCDS43573.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 517) 720 89.4 1.5e-17
CCDS5485.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 518) 720 89.4 1.5e-17
CCDS5484.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 542) 720 89.4 1.5e-17
CCDS5483.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 666) 720 89.5 1.8e-17
CCDS47127.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 492) 714 88.8 2.2e-17
CCDS83147.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 644) 716 89.1 2.4e-17
CCDS3704.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 712 88.6 2.5e-17
CCDS43263.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 712 88.6 2.5e-17
CCDS54797.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 489) 712 88.6 2.5e-17
CCDS82950.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 498) 712 88.6 2.6e-17
CCDS3703.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 499) 712 88.6 2.6e-17
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 716 89.1 2.6e-17
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 716 89.1 2.6e-17
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 716 89.1 2.7e-17
CCDS82776.1 CAMKV gene_id:79012|Hs108|chr3 ( 470) 705 87.8 4.1e-17
CCDS33762.1 CAMKV gene_id:79012|Hs108|chr3 ( 501) 705 87.8 4.3e-17
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 703 87.6 4.4e-17
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 704 87.9 6.3e-17
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 698 87.2 9.4e-17
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 698 87.2 9.6e-17
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 698 87.2 9.7e-17
>>CCDS9354.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 (729 aa)
initn: 4795 init1: 4795 opt: 4795 Z-score: 2720.1 bits: 513.9 E(32554): 3.4e-145
Smith-Waterman score: 4795; 100.0% identity (100.0% similar) in 729 aa overlap (1-729:1-729)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSFGRDMELEHFDERDKAQRYSRGSRVNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQTLSSEKKAKKVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MSFGRDMELEHFDERDKAQRYSRGSRVNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQTLSSEKKAKKVR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 FYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGVRTIYTIDGLKKISSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 FYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGVRTIYTIDGLKKISSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSSLATAKGSPSEVRENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSSLATAKGSPSEVRENK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIKLDSGVVKRLYTLDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIKLDSGVVKRLYTLDGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRYQDDFLLDESECRVVKSTSYTKIASSSRRSTTKSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 QVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRYQDDFLLDESECRVVKSTSYTKIASSSRRSTTKSPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 PSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQRSSQHGGSSTSLASTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 PSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQRSSQHGGSSTSLASTK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 IKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 IKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITST
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 NKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 NKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSGDDQEVLFDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSGDDQEVLFDQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVNDDGLPENEHQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVNDDGLPENEHQLS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 VAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIALDHGFTIKRSGSLDYYQQPGMYWIRPPLLIRRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIALDHGFTIKRSGSLDYYQQPGMYWIRPPLLIRRGR
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 FSDEDATRM
:::::::::
CCDS93 FSDEDATRM
>>CCDS81762.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 (740 aa)
initn: 4489 init1: 4489 opt: 4490 Z-score: 2548.3 bits: 482.1 E(32554): 1.3e-135
Smith-Waterman score: 4490; 96.3% identity (97.0% similar) in 723 aa overlap (1-715:1-718)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSFGRDMELEHFDERDKAQRYSRGSRVNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQTLSSEKKAKKVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MSFGRDMELEHFDERDKAQRYSRGSRVNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQTLSSEKKAKKVR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 FYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGVRTIYTIDGLKKISSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGVRTIYTIDGLKKISSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSSLATAKGSPSEVRENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSSLATAKGSPSEVRENK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIKLDSGVVKRLYTLDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIKLDSGVVKRLYTLDGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRYQDDFLLDESECRVVKSTSYTKIASSSRRSTTKSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRYQDDFLLDESECRVVKSTSYTKIASSSRRSTTKSPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 PSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQRSSQHGGSSTSLASTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQRSSQHGGSSTSLASTK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 IKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITST
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 NKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSGDDQEVLFDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSGDDQEVLFDQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVNDDGLPENEHQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVNDDGLPENEHQLS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KA0 VAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIA---LDHGFTI-KRSGSLD----YYQQPGMYWIRP
:::::::::::::::::::::::::: ::. . .: . : : ::. :
CCDS81 VAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIATTALDKERQVFRRRRNQDVRSRYKAQPA-----P
670 680 690 700 710
720
pF1KA0 PLLIRRGRFSDEDATRM
: :
CCDS81 PELNSESEDYSPSSSETVRSPNSPF
720 730 740
>>CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 (422 aa)
initn: 2768 init1: 2768 opt: 2768 Z-score: 1582.5 bits: 302.6 E(32554): 7.9e-82
Smith-Waterman score: 2768; 100.0% identity (100.0% similar) in 416 aa overlap (314-729:7-422)
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 YTKIASSSRRSTTKSPGPSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MLELIEVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRK
10 20 30
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 QRSSQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QRSSQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAV
40 50 60 70 80 90
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 VKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYL
100 110 120 130 140 150
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 VMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQ
160 170 180 190 200 210
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 DGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCG
220 230 240 250 260 270
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 FPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLE
280 290 300 310 320 330
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 HPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIALDHGFTIKRSGSLDYYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIALDHGFTIKRSGSLDYYQ
340 350 360 370 380 390
710 720
pF1KA0 QPGMYWIRPPLLIRRGRFSDEDATRM
::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QPGMYWIRPPLLIRRGRFSDEDATRM
400 410 420
>>CCDS34076.1 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 (766 aa)
initn: 2255 init1: 1497 opt: 2485 Z-score: 1419.6 bits: 273.3 E(32554): 9.4e-73
Smith-Waterman score: 3194; 68.8% identity (85.3% similar) in 733 aa overlap (1-712:1-720)
10 20 30 40
pF1KA0 MSFGRDMELEHFDERDKAQR--------------YSRGSRVNGL-PSPTHSAHCSFYRTR
:. :..:::::.:::: : : : . ::: :::.:::::::::::
CCDS34 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 TLQTLSSEKKAKKVRFYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGV
:::.:::::::::.::::::::::::.:.::: ::::::.::: .:::.:::::::::::
CCDS34 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 RTIYTIDGLKKISSLDQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSS
:::::::: .:..:::.:.:::::::.: :::.:..::::.:::::::.: ..:::
CCDS34 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKG-GTSRA---
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 LATAKGSPSEVRENKDFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIK
::.:.. :::.:.::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS34 LAAASSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 LDSGVVKRLYTLDGKQVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRY-QDDFLLDESECRVVKSTSY
::::::::: ::::::: ::::::::::.::::::::::: ::::.::.:::::.:: ::
CCDS34 LDSGVVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKS-SY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 TKIASSSRRSTTKSPGPSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQ
.. .:. . : .:::::::::::::: :::::.::::::.: :: : :::::::.:
CCDS34 SR-SSAVKYSGSKSPGPSRRSKSPAS---VNGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPTSPGSFRGL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 RS-SQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAV
.. : :: ::... . .:. .: : :. . . .:. :.::.:..::::::::
CCDS34 KQISAHGRSSSNVNGGP---ELDRCISP-EGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDGNFAV
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 VKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYL
::::..:::..:.::::: :.:: ::::.:.::::::::::::::..:.:::.. :::.:
CCDS34 VKECIDRSTGKEFALKIIDKAKCCGKEHLIENEVSILRRVKHPNIIMLVEEMETATELFL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 VMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQ
::::::::::::::::..::::::.:.:.::::.:..:::.:.::::::::::::: :.
CCDS34 VMELVKGGDLFDAITSSTKYTERDGSAMVYNLANALRYLHGLSIVHRDIKPENLLVCEYP
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 DGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCG
::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DGTKSLKLGDFGLATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCG
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 FPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLE
:::::. .. :: :::::: :...::.:::::..:::::::..:: :.:. : .: :.:
CCDS34 FPPFRSENNLQEDLFDQILAGKLEFPAPYWDNITDSAKELISQMLQVNVEARCTAGQILS
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690
pF1KA0 HPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTG-PKPNSTAAGVSVI---ALDHGFTIKRSGSL
::::.::. ::. : :.::.:.:::.. :: :::..::::: :::. : :
CCDS34 HPWVSDDASQENNMQAEVTGKLKQHFNNALPKQNSTTTGVSVIMNTALDKEGQIFCSKHC
650 660 670 680 690 700
700 710 720
pF1KA0 DYYQQPGMYWIRPPLLIRRGRFSDEDATRM
. .::: : :
CCDS34 QDSGRPGMEPISPVPPSVEEIPVPGEAVPAPTPPESPTPHPPPAAPGGERAGTWRRHRD
710 720 730 740 750 760
>>CCDS55895.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 (433 aa)
initn: 2462 init1: 2462 opt: 2463 Z-score: 1410.7 bits: 270.9 E(32554): 2.9e-72
Smith-Waterman score: 2463; 93.4% identity (94.6% similar) in 410 aa overlap (314-715:7-411)
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 YTKIASSSRRSTTKSPGPSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MLELIEVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRK
10 20 30
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 QRSSQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QRSSQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAV
40 50 60 70 80 90
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 VKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYL
100 110 120 130 140 150
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 VMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQ
160 170 180 190 200 210
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 DGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCG
220 230 240 250 260 270
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 FPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLE
280 290 300 310 320 330
650 660 670 680 690
pF1KA0 HPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIA---LDHGFTI-KRSGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::. . .: .
CCDS55 HPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIATTALDKERQVFRRRRNQ
340 350 360 370 380 390
700 710 720
pF1KA0 D----YYQQPGMYWIRPPLLIRRGRFSDEDATRM
: : ::. :: :
CCDS55 DVRSRYKAQPA-----PPELNSESEDYSPSSSETVRSPNSPF
400 410 420 430
>>CCDS47142.2 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 (783 aa)
initn: 2256 init1: 1498 opt: 2433 Z-score: 1390.2 bits: 267.9 E(32554): 4.1e-71
Smith-Waterman score: 3176; 67.6% identity (83.9% similar) in 747 aa overlap (1-712:1-737)
10 20 30 40
pF1KA0 MSFGRDMELEHFDERDKAQR--------------YSRGSRVNGL-PSPTHSAHCSFYRTR
:. :..:::::.:::: : : : . ::: :::.:::::::::::
CCDS47 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 TLQTLSSEKKAKKVRFYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGV
:::.:::::::::.::::::::::::.:.::: ::::::.::: .:::.:::::::::::
CCDS47 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 RTIYTIDGLKKISSLDQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSS
:::::::: .:..:::.:.:::::::.: :::.:..::::.:::::::.: ..:::
CCDS47 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKG-GTSRA---
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 LATAKGSPSEVRENKDFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIK
::.:.. :::.:.::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS47 LAAASSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 LDSGVVKRLYTLDGKQVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRY-QDDFLLDESECRVVKSTSY
::::::::: ::::::: ::::::::::.::::::::::: ::::.::.:::::.:: ::
CCDS47 LDSGVVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKS-SY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KA0 TKIASSSRRSTTKSPGPSRRSKSPAST--------------SSVNGTPGSQLSTPRSGKS
.. .:. . : .::::::::::::::. : :::::.::::::.: ::
CCDS47 SR-SSAVKYSGSKSPGPSRRSKSPASVKRGGHYSSAYSTAKSPVNGTPSSQLSTPKSTKS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KA0 PSPSPTSPGSLRKQRS-SQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITER
: :::::::.: .. : :: ::... . .:. .: : :. . . .:. :.
CCDS47 SSSSPTSPGSFRGLKQISAHGRSSSNVNGGP---ELDRCISP-EGVNGNRCSESSTLLEK
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 YKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIV
::.:..::::::::::::..:::..:.::::: :.:: ::::.:.::::::::::::::.
CCDS47 YKIGKVIGDGNFAVVKECIDRSTGKEFALKIIDKAKCCGKEHLIENEVSILRRVKHPNII
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 LLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVH
.:.:::.. :::.:::::::::::::::::..::::::.:.:.::::.:..:::.:.:::
CCDS47 MLVEEMETATELFLVMELVKGGDLFDAITSSTKYTERDGSAMVYNLANALRYLHGLSIVH
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 RDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVD
:::::::::: :. ::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDIKPENLLVCEYPDGTKSLKLGDFGLATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVD
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 IWAAGVITYILLCGFPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLL
:::::::::::::::::::. .. :: :::::: :...::.:::::..:::::::..::
CCDS47 IWAAGVITYILLCGFPPFRSENNLQEDLFDQILAGKLEFPAPYWDNITDSAKELISQMLQ
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 VDVDQRFSAVQVLEHPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTG-PKPNSTAAGVSVI---
:.:. : .: :.: ::::.::. ::. : :.::.:.:::.. :: :::..:::::
CCDS47 VNVEARCTAGQILSHPWVSDDASQENNMQAEVTGKLKQHFNNALPKQNSTTTGVSVIMNT
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720
pF1KA0 ALDHGFTIKRSGSLDYYQQPGMYWIRPPLLIRRGRFSDEDATRM
:::. : : . .::: : :
CCDS47 ALDKEGQIFCSKHCQDSGRPGMEPISPVPPSVEEIPVPGEAVPAPTPPESPTPHPPPAAP
720 730 740 750 760 770
>>CCDS14557.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX (360 aa)
initn: 1145 init1: 846 opt: 1678 Z-score: 970.0 bits: 189.1 E(32554): 1e-47
Smith-Waterman score: 1678; 74.3% identity (90.2% similar) in 346 aa overlap (7-345:1-342)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSFGRDMELE--HFDERDKAQRYSRGSRVNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQTLSSEKKAKK
:::. :::::::..: ::::.:::::::::::::::::::::.::.::::::
CCDS14 MELDFGHFDERDKTSRNMRGSRMNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQALSNEKKAKK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 VRFYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGVRTIYTIDGLKKIS
:::::::::::::::::.: ::::::.::::::::.::::.::::::: :::::: .::.
CCDS14 VRFYRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGVRYIYTIDGSRKIG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 SLDQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSSLATAKGSPSEVRE
:.:.: :::::::.: . :::.::::::::::::::::.. .: .:::..... ..::
CCDS14 SMDELEEGESYVCSSDNFFKKVEYTKNVNPNWSVNVKTSANMKAPQSLASSNSA--QARE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 NKDFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIKLDSGVVKRLYTLD
::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::..::::.:::::
CCDS14 NKDFVRPKLVTIIRSGVKPRKAVRVLLNKKTAHSFEQVLTDITEAIKLETGVVKKLYTLD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GKQVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRY-QDDFLLDESECRVVK----STSYTKIASSSRR
:::: ::.:::::::.::::::::::: :::: :::.::::.: .:. : . . ..
CCDS14 GKQVTCLHDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFSLDENECRVMKGNPSATAGPKASPTPQK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STTKSPGPSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQRSSQHGGSS
...::::: :::::::. :.::: .::::::.: .:: .:::::::::..
CCDS14 TSAKSPGPMRRSKSPAD--SANGTSSSQLSTPKSKQSPISTPTSPGSLRKHKDLYLPLSL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 TSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTA
CCDS14 DDSDSLGDSM
360
>>CCDS14558.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX (365 aa)
initn: 1626 init1: 846 opt: 1674 Z-score: 967.7 bits: 188.7 E(32554): 1.4e-47
Smith-Waterman score: 1674; 73.4% identity (90.0% similar) in 349 aa overlap (7-345:1-347)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSFGRDMELE--HFDERDKAQRYSRGSRVNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQTLSSEKKAKK
:::. :::::::..: ::::.:::::::::::::::::::::.::.::::::
CCDS14 MELDFGHFDERDKTSRNMRGSRMNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQALSNEKKAKK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 VRFYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGVRTIYTIDGLKKIS
:::::::::::::::::.: ::::::.::::::::.::::.::::::: :::::: .::.
CCDS14 VRFYRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGVRYIYTIDGSRKIG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 SLDQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSSLATAKGSPSEVRE
:.:.: :::::::.: . :::.::::::::::::::::.. .: .:::..... ..::
CCDS14 SMDELEEGESYVCSSDNFFKKVEYTKNVNPNWSVNVKTSANMKAPQSLASSNSA--QARE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 NKDFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIKLDSGVVKRLYTLD
::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::..::::.:::::
CCDS14 NKDFVRPKLVTIIRSGVKPRKAVRVLLNKKTAHSFEQVLTDITEAIKLETGVVKKLYTLD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GKQVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRY-QDDFLLDESECRVVK----STSYTKIASSSRR
:::: ::.:::::::.::::::::::: :::: :::.::::.: .:. : . . ..
CCDS14 GKQVTCLHDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFSLDENECRVMKGNPSATAGPKASPTPQK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STTKSPGPSRRSKSPASTSS---VNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQRSSQHG
...::::: :::::::.... .::: .::::::.: .:: .:::::::::..
CCDS14 TSAKSPGPMRRSKSPADSGNDQDANGTSSSQLSTPKSKQSPISTPTSPGSLRKHKDLYLP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 GSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVER
CCDS14 LSLDDSDSLGDSM
360
>>CCDS83483.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX (366 aa)
initn: 1700 init1: 846 opt: 1674 Z-score: 967.7 bits: 188.7 E(32554): 1.4e-47
Smith-Waterman score: 1674; 73.4% identity (90.0% similar) in 349 aa overlap (7-345:1-347)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSFGRDMELE--HFDERDKAQRYSRGSRVNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQTLSSEKKAKK
:::. :::::::..: ::::.:::::::::::::::::::::.::.::::::
CCDS83 MELDFGHFDERDKTSRNMRGSRMNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQALSNEKKAKK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 VRFYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGVRTIYTIDGLKKIS
:::::::::::::::::.: ::::::.::::::::.::::.::::::: :::::: .::.
CCDS83 VRFYRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGVRYIYTIDGSRKIG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 SLDQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSSLATAKGSPSEVRE
:.:.: :::::::.: . :::.::::::::::::::::.. .: .:::..... ..::
CCDS83 SMDELEEGESYVCSSDNFFKKVEYTKNVNPNWSVNVKTSANMKAPQSLASSNSA--QARE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 NKDFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIKLDSGVVKRLYTLD
::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::..::::.:::::
CCDS83 NKDFVRPKLVTIIRSGVKPRKAVRVLLNKKTAHSFEQVLTDITEAIKLETGVVKKLYTLD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GKQVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRY-QDDFLLDESECRVVK----STSYTKIASSSRR
:::: ::.:::::::.::::::::::: :::: :::.::::.: .:. : . . ..
CCDS83 GKQVTCLHDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFSLDENECRVMKGNPSATAGPKASPTPQK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STTKSPGPSRRSKSPASTSS---VNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQRSSQHG
...::::: :::::::.... .::: .::::::.: .:: .:::::::::..
CCDS83 TSAKSPGPMRRSKSPADSGNDQDANGTSSSQLSTPKSKQSPISTPTSPGSLRKHKVDLYL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 GSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVER
CCDS83 PLSLDDSDSLGDSM
360
>>CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 (648 aa)
initn: 1031 init1: 1031 opt: 1063 Z-score: 620.3 bits: 125.2 E(32554): 3.1e-28
Smith-Waterman score: 1063; 52.7% identity (79.6% similar) in 294 aa overlap (382-674:348-641)
360 370 380 390 400 410
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