Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0339
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0339, 1707 aa
1>>>pF1KA0339 1707 - 1707 aa - 1707 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.0405+/-0.00124; mu= -20.0421+/- 0.076
mean_var=777.4952+/-158.373, 0's: 0 Z-trim(117.7): 55 B-trim: 53 in 1/53
Lambda= 0.045997
statistics sampled from 18449 (18499) to 18449 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.787), E-opt: 0.2 (0.568), width: 16
Scan time: 5.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32435.1 SETD1A gene_id:9739|Hs108|chr16 (1707) 11558 783.5 0
CCDS53838.1 SETD1B gene_id:23067|Hs108|chr12 (1923) 1561 120.2 7.2e-26
>>CCDS32435.1 SETD1A gene_id:9739|Hs108|chr16 (1707 aa)
initn: 11558 init1: 11558 opt: 11558 Z-score: 4163.9 bits: 783.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11558; 100.0% identity (100.0% similar) in 1707 aa overlap (1-1707:1-1707)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDQEGGGDGQKAPSFQWRNYKLIVDPALDPALRRPSQKVYRYDGVHFSVNDSKYIPVEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDQEGGGDGQKAPSFQWRNYKLIVDPALDPALRRPSQKVYRYDGVHFSVNDSKYIPVEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QDPRCHVRSKNRDFSLPVPKFKLDEFYIGQIPLKEVTFARLNDNVRETFLKDMCRKYGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QDPRCHVRSKNRDFSLPVPKFKLDEFYIGQIPLKEVTFARLNDNVRETFLKDMCRKYGEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EEVEILLHPRTRKHLGLARVLFTSTRGAKETVKNLHLTSVMGNIIHAQLDIKGQQRMKYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EEVEILLHPRTRKHLGLARVLFTSTRGAKETVKNLHLTSVMGNIIHAQLDIKGQQRMKYY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 ELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQGSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQGSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTPQSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTPQSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SENSYQDAFSRRHFSASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SENSYQDAFSRRHFSASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SSDANYPAYYESWNRYQRHTSYPPRRATREEPPGAPFAENTAERFPPSYTSYLPPEPSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSDANYPAYYESWNRYQRHTSYPPRRATREEPPGAPFAENTAERFPPSYTSYLPPEPSRP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 TDQDYRPPASEAPPPEPPEPGGGGGGGGPSPEREEVRTSPRPASPARSGSPAPETTNESV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDQDYRPPASEAPPPEPPEPGGGGGGGGPSPEREEVRTSPRPASPARSGSPAPETTNESV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLASDTEEEEENSSMVLGARDTGSEVPSGSGHGPCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLASDTEEEEENSSMVLGARDTGSEVPSGSGHGPCT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PPPAPANFEDVAPTGSGEPGATRESPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSPPPAPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPPAPANFEDVAPTGSGEPGATRESPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSPPPAPTP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PQQPPPPPPPPPPPPPYLASLPLGYPPHQPAYLLPPRPDGPPPPEYPPPPPPPPHIYDFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PQQPPPPPPPPPPPPPYLASLPLGYPPHQPAYLLPPRPDGPPPPEYPPPPPPPPHIYDFV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 NSLELMDRLGAQWGGMPMSFQMQTQMLTRLHQLRQGKGLIAASAGPPGGAFGEAFLPFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NSLELMDRLGAQWGGMPMSFQMQTQMLTRLHQLRQGKGLIAASAGPPGGAFGEAFLPFPP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PQEAAYGLPYALYAQGQEGRGAYSREAYHLPMPMAAEPLPSSSVSGEEARLPPREEAELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PQEAAYGLPYALYAQGQEGRGAYSREAYHLPMPMAAEPLPSSSVSGEEARLPPREEAELA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EGKTLPTAGTVGRVLAMLVQEMKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGKTLPTAGTVGRVLAMLVQEMKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 AKQQAKEEDKEKTKLKEPGLLSLVDWAKSGGTTGIEAFAFGSGLRGALRLPSFKVKRKEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AKQQAKEEDKEKTKLKEPGLLSLVDWAKSGGTTGIEAFAFGSGLRGALRLPSFKVKRKEP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SEISEASEEKRPRPSTPAEEDEDDPEQEKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEISEASEEKRPRPSTPAEEDEDDPEQEKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LDSEGEEASQESSSEKDEEDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESDSSSKCSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDSEGEEASQESSSEKDEEDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESDSSSKCSLY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 ADSDGENDSTSDSESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEDEEEEERPAALPSASPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADSDGENDSTSDSESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEDEEEEERPAALPSASPP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 PREVPVPTPAPVEVPVPERVAGSPVTPLPEQEASPARPAGPTEESPPSAPLRPPEPPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PREVPVPTPAPVEVPVPERVAGSPVTPLPEQEASPARPAGPTEESPPSAPLRPPEPPAGP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 PAPAPRPDERPSSPIPLLPPPKKRRKTVSFSAIEVVPAPEPPPATPPQAKFPGPASRKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PAPAPRPDERPSSPIPLLPPPKKRRKTVSFSAIEVVPAPEPPPATPPQAKFPGPASRKAP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 RGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVLADLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVLADLA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 LTPARRGLPALPAVEDSEATETSDEAERPRPLLSHILLEHNYALAVKPTPPAPALRPPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTPARRGLPALPAVEDSEATETSDEAERPRPLLSHILLEHNYALAVKPTPPAPALRPPEP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 VPAPAALFSSPADEVLEAPEVVVAEAEEPKPQQLQQQREEGEEEGEEEGEEEEEESSDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPAPAALFSSPADEVLEAPEVVVAEAEEPKPQQLQQQREEGEEEGEEEGEEEEEESSDSS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 SSSDGEGALRRRSLRSHARRRRPPPPPPPPPPRAYEPRSEFEQMTILYDIWNSGLDSEDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSSDGEGALRRRSLRSHARRRRPPPPPPPPPPRAYEPRSEFEQMTILYDIWNSGLDSEDM
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVHHTITNLTTPKRKRRPQDGPREHQTGSARSEGYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVHHTITNLTTPKRKRRPQDGPREHQTGSARSEGYY
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 PISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQGTNRVLSERRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQGTNRVLSERRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 NQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIG
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 SSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEI
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700
pF1KA0 TYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
1690 1700
>>CCDS53838.1 SETD1B gene_id:23067|Hs108|chr12 (1923 aa)
initn: 2636 init1: 919 opt: 1561 Z-score: 577.9 bits: 120.2 E(32554): 7.2e-26
Smith-Waterman score: 3088; 38.5% identity (55.5% similar) in 1816 aa overlap (176-1707:185-1923)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 RGAKETVKNLHLTSVMGNIIHAQLDIKGQQRMKYYELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQ
::..:::.:.: :::::.:.: .
CCDS53 RGAKDAVQHLHSTSVMGNIIHVELDTKGETRMRFYELLVTGRYTPQTLPVGELDAVSPIV
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 GSGAATETAESRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNGTPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTP
. : .: .... .:. .:...: ..::: ::::..:: : :::.:.::
CCDS53 NETLQLSDALKRLKDGGLSAGCGSGSSSVTPNSGGTPFSQDTAYSSCRLDTPNSYGQ---
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310
pF1KA0 QSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTS----------FKPRRSENSYQDAFSRRHFS
::: : : .::.::::.::: . : :: :: :... ::..:::
CCDS53 ----GTPLTPRLGTPFSQDSSYSSRQPTPSYLFSQDPAVTFKARRHESKFTDAYNRRHEH
280 290 300 310 320
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 ASSASTTASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFRSSDANYPAYYESWNR
.. : ::.:..::: .:: .. .....::. :... . ..
CCDS53 HYVHNSPAVTAVAGATAAFRGSSDLPF---GAVGGTGGSSGPPFKAQPQDSATFA-----
330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
pF1KA0 YQRHTSYPPRRATREEPPG-----APFAENTAERFPPSYTSYLPPEPS-------RPTDQ
:: :: .:: :: .:. .:. ::: : ::. : . .
CCDS53 ---HTP-PPAQAT--PAPGFKSAFSPYQTPVAH-FPPP-----PEEPTATAAFGARDSGE
380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KA0 DYRPPASEAPPPEPP-EPGG----GGGGGGPSPEREEVRTSPRPA---SPARSGSPAPET
: :: ::: :: :: . : : : :. . .. . ::. :: ::. :
CCDS53 FRRAPA---PPPLPPAEPLAKEKPGTPPGPPPPDTNSMELGGRPTFGWSPEPCDSPGTPT
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 TNESV--PFAQHSSLDSRIEMLLKEQRSKFSFLA---SDTEEEEENSSMVLGARDTGSEV
. : : :.::::::::::::::.:. :: :::: . :.: . .. . . .
CCDS53 LESSPAGPEKPHDSLDSRIEMLLKEQRTKLLFLREPDSDTELQMEGSPISSSSSQLSPLA
490 500 510 520 530 540
540 550 560
pF1KA0 PSGSGHGPC----TPP---PAPANFEDVAPT-------------GSG-----EPGA----
: :.. : ::: :. ...::..:: : : :::
CCDS53 PFGTNSQPGFRGPTPPSSRPSSTGLEDISPTPLPDSDEDEELDLGLGPRPPPEPGPPDPA
550 560 570 580 590 600
570 580 590
pF1KA0 -----TRE---------SPKANGQNQASPCSSGDDMEISDDDRGGSP------P------
: : .: .. ..... :::.:::::::. ..: :
CCDS53 GLLSQTAEVALDLVGDRTPTSEKMDEGQQ-SSGEDMEISDDEMPSAPITSADCPKPMVVT
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630
pF1KA0 ----------------PAPTPPQQPP-PPPPPPPPP------PPYLASLPLGYPPHQPAY
: : :: :: ::::::::: :: : : :: .::
CCDS53 PGAAAVAAPSVLAPTLPLPPPPGFPPLPPPPPPPPPQPGFPMPPPLPPPPPPPPPAHPAV
670 680 690 700 710 720
640 650 660 670 680
pF1KA0 LLPP----RPDG-PPPPEYPPPPPPPPHIYDFVNSLELMDRLGAQWGGMPMSFQMQTQML
.:: : : :::: :: :: :: .. : .... ::.::::::::::::::.:
CCDS53 TVPPPPLPAPPGVPPPPILPPLPPFPPGLFP-VMQVDMSHVLGGQWGGMPMSFQMQTQVL
730 740 750 760 770 780
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 TRLHQLRQGKG------LIAASAGPPGGAFGEAFLPFPPPQEAAYGLPYALYAQGQEGRG
.:: :.: ..::.:. ... : :. .:: : :..: .: :::
CCDS53 SRLMT---GQGACPYPPFMAAAAA--AASAGLQFVNLPP-----YRGPFSLSNSGP-GRG
790 800 810 820 830
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 AYSREAYHLPMPMAAEPLPSSSVSGEEARLPPREEAELAEGKTLPTAGTVGRVLAMLVQE
: : :::. . : ::.: : .:: :: ....:
CCDS53 Q------HWP------PLPKFDPSVPPPGYMPRQED--------PHKATVDGVLLVVLKE
840 850 860 870
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 MKSIMQRDLNRKMVENVAFGAFDQWWESKEEKAKPFQNAAKQ-QAKEEDKEKTKLKEPGL
.:.::.::::::::: ::: :::.::..::. :: . .:. . :.::. : : . .
CCDS53 LKAIMKRDLNRKMVEVVAFRAFDEWWDKKERMAKASLTPVKSGEHKDEDRPKPKDRIASC
880 890 900 910 920 930
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 LSLVDWAKSGGTTGIEAFAFGSGLRGALRLPSFKVKRKEPSEISEASEEKRPRPSTPAEE
: : .:.:. : : :....: :::::.:::::::::::: . . ....:: :::: ..:
CCDS53 L-LESWGKGEGL-GYEGLGLGIGLRGAIRLPSFKVKRKEPPDTTSSGDQKRLRPSTSVDE
940 950 960 970 980
930 940 950 960 970
pF1KA0 DEDDPEQEKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFALDSEGEEASQESSSEKDE--
.... :.:.. : . ::: . .. . . . ::: ::: .:: ::..:
CCDS53 EDEESERERDRDMADTP-CELAKRDPKGVGVRRRPARPLELDSGGEEDEKESLSEEQEST
990 1000 1010 1020 1030 1040
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 EDDEEDEEDEDREEAVDTTKKETEVSDGEDEESD-SSSKCSLYADSDGENDS---TSDSE
:..:: ::.:..:. : . . . :...::.. : .. . .::: :. :: .:
CCDS53 EEEEEAEEEEEEEDDDDDDSDDRDESENDDEDTALSEASEKDEGDSDEEETVSIVTSKAE
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1040 1050 1060 1070
pF1KA0 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSES-----SSEDEEEEER-------------P-----
..::: :: :: ::: :: ::::. . :.:::::. :
CCDS53 ATSSSESSESSEFESSSESSPSSSEDEEEVVAREEEEEEEEEEMVAEESMASAGPEDFEQ
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1080 1090 1100
pF1KA0 ----AALPSASPP------------------PREVPV---PTPAPVEVPVPERVAGSPVT
::: ..: :.: : : :: : : :
CCDS53 DGEEAALAPGAPAVDSLGMEEEVDIETEAVAPEERPSMLDEPPLPVGVEEPADSREPPEE
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 PLPEQEA----SPARPAGPTEESPPSAPLR-P-------PEPPAGPPAPAPRPDERPSSP
: ::. :: :: .: :: .: : : :::: : : : : :
CCDS53 PGLSQEGAMLLSPEPPAKEVEARPPLSPERAPEHDLEVEPEPPMMLPLPLQPPLPPPRPP
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1160 1170 1180 1190
pF1KA0 IPLLPPPKKRRKTVSFSAIEVVP-APEPPPATP----PQAK---------FPG--PASRK
: :::. . .: .. : : . :: :: :: :: :
CCDS53 RPPSPPPEPETTDASHPSVPPEPLAEDHPPHTPGLCGSLAKSQSTETVPATPGGEPPLSG
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 APRGVERTIRNLPLDHASLVKSWPEEVSRGGRSRAGGRGRLTEEEEAEPGTEVDLAVL--
. :. . ..: . : : .: :: :. :: .::. . : :
CCDS53 GSSGLSLSSPQVPGSPFSYPAPSPS-LSSGGLPRTPGRDFSFTPTFSEPSGPLLLPVCPL
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1260 1270 1280 1290
pF1KA0 ---------ADLALTPA--RRGLP-----------ALPAVEDSEATETSDEAERPRP-LL
. :: .:. . ::: ::::: ..: .: : : ::
CCDS53 PTGRRDERSGPLA-SPVLLETGLPLPLPLPLPLPLALPAVLRAQA-----RAPTPLPPLL
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1300 1310 1320 1330
pF1KA0 SHILLEHNYALAVKP-----TPPA------PALRPPE-----------PVPAPAALFSSP
: . :: .::. : .::: : . .: :
CCDS53 PAPLASCPPPMKRKPGRPRRSPPSMLSLDGPLVRPPAGAALGRELLLLPGQPQTPVFPST
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1340 1350 1360 1370
pF1KA0 ADEV----------LEAPEVVVAEAEEPKP-----QQLQQQREEGEEEGEEEGEEEEEES
: . :: . : : . . .: ... :. ..
CCDS53 HDPRTVTLDFRNAGIPAPPPPLPPQPPPPPPPPPVEPTKLPFKELDNQWPSEAIPPGPRG
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA0 SDSSSSSDGEGALRRRSLRSHARRRRP---PPPPPP---PPPRAYEPRSEFEQMTILYDI
: . : : : : ..:. :: : :: ..::::::.:::::::
CCDS53 RDEVTEEYMELAKSRGPWRRPPKKRHEDLVPPAGSPELSPPQPLFRPRSEFEEMTILYDI
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 WNSGLDSEDMSYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVHHTITNLTTPKRKRRPQDGPREHQ
::.:.: ::. .: .:::::::: .: :::::: ::.: :.:.. :.:.: .:: :::
CCDS53 WNGGIDEEDIRFLCVTYERLLQQDNGMDWLNDTLWVYHPSTSLSSAKKKKR-DDGIREHV
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1500 1510 1520 1530 1540
pF1KA0 TGSARSEGYYPISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQG---------TNRVLSERRSEQR
:: :::::.: :.::.: .::. .:. . .:::: ..:. ::::::::
CCDS53 TGCARSEGFYTIDKKDKLRYLNSSRASTDE-PPADTQGMSIPAQPHASTRAGSERRSEQR
1710 1720 1730 1740 1750
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KA0 RLLSAIGTSAIMDSDLLKLNQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQN
::::.. : ::::::.::::::::::.: .:.::.::::::::::::::::::::::
CCDS53 RLLSSFTGSC--DSDLLKFNQLKFRKKKLKFCKSHIHDWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQN
1760 1770 1780 1790 1800 1810
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KA0 IRQMVADMREKRYVQEGIGSSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIE
:::..:::::::: .:::::::.::::::::::::::::.:::::: :.:::::::::.:
CCDS53 IRQVIADMREKRYEDEGIGSSYMFRVDHDTIIDATKCGNFARFINHSCNPNCYAKVITVE
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1670 1680 1690 1700
pF1KA0 SQKKIVIYSKQPIGVDEEITYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN
::::::::::: :.:.::::::::::.:: :::::::.:.:::.::
CCDS53 SQKKIVIYSKQHINVNEEITYDYKFPIEDVKIPCLCGSENCRGTLN
1880 1890 1900 1910 1920
1707 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 18:38:51 2016 done: Wed Nov 2 18:38:53 2016
Total Scan time: 5.890 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]