Result of FASTA (omim) for
pF1KA0324
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0324, 2752 aa
1>>>pF1KA0324 2752 - 2752 aa - 2752 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 22.3076+/-0.000591; mu= -55.5382+/- 0.037
mean_var=953.4460+/-196.034, 0's: 0 Z-trim(124.5): 302 B-trim: 0 in 0/58
Lambda= 0.041536
statistics sampled from 46053 (46404) to 46053 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.544), width: 16
Scan time: 28.800
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057417 (OMIM: 606032) serine/arginine repetitiv (2752) 18025 1097.4 0
XP_005255283 (OMIM: 606032) PREDICTED: serine/argi (2751) 18008 1096.4 0
XP_006720937 (OMIM: 606032) PREDICTED: serine/argi ( 291) 1820 126.1 7.3e-28
NP_001291288 (OMIM: 158373) mucin-5AC precursor [H (5654) 1014 78.1 4e-12
NP_001157934 (OMIM: 604609) mucin-12 precursor [Ho (5335) 911 72.0 2.7e-10
NP_002448 (OMIM: 158370) mucin-2 precursor [Homo s (5289) 853 68.5 3e-09
XP_016855508 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 901) 793 64.7 7e-09
XP_016855513 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 832) 743 61.7 5.2e-08
XP_016855501 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 876) 743 61.7 5.5e-08
XP_005245777 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 915) 743 61.7 5.7e-08
NP_919262 (OMIM: 613103) serine/arginine repetitiv ( 611) 626 54.7 5e-06
NP_060876 (OMIM: 158372) mucin-4 isoform a precurs (5412) 664 57.2 7.9e-06
NP_002007 (OMIM: 135940,146700,605803) filaggrin [ (4061) 652 56.4 9.9e-06
NP_001309397 (OMIM: 158372) mucin-4 isoform f prec (7418) 654 56.6 1.6e-05
NP_001035194 (OMIM: 608424) mucin-17 precursor [Ho (4493) 625 54.8 3.3e-05
XP_011538784 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 833) 581 52.0 4.4e-05
NP_001290378 (OMIM: 605975) serine/arginine repeti ( 877) 581 52.0 4.6e-05
NP_001290377 (OMIM: 605975) serine/arginine repeti ( 916) 581 52.0 4.8e-05
XP_016855512 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 834) 572 51.5 6.3e-05
XP_011538783 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 835) 572 51.5 6.4e-05
XP_011538782 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 835) 572 51.5 6.4e-05
XP_011538781 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 835) 572 51.5 6.4e-05
XP_016855500 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 878) 572 51.5 6.7e-05
XP_011538780 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 879) 572 51.5 6.7e-05
XP_005245775 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 917) 572 51.5 6.9e-05
XP_005245774 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 918) 572 51.5 6.9e-05
XP_016855518 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 819) 543 49.7 0.00021
XP_016855517 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 819) 543 49.7 0.00021
XP_016855504 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 863) 543 49.7 0.00022
XP_005245778 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 902) 543 49.7 0.00023
XP_016855516 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 820) 534 49.2 0.0003
XP_016855514 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 821) 534 49.2 0.0003
XP_016855515 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 821) 534 49.2 0.0003
XP_016855503 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 864) 534 49.2 0.00032
XP_016855502 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 865) 534 49.2 0.00032
XP_016855507 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 903) 534 49.2 0.00033
NP_005830 (OMIM: 605975) serine/arginine repetitiv ( 904) 534 49.2 0.00033
XP_011513272 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre ( 829) 528 48.8 0.00039
XP_016866922 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre ( 867) 528 48.8 0.00041
XP_016866921 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre ( 867) 528 48.8 0.00041
XP_016866924 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre ( 867) 528 48.8 0.00041
XP_016866923 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre ( 867) 528 48.8 0.00041
XP_016866913 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre (1007) 528 48.8 0.00047
XP_016866920 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre (1007) 528 48.8 0.00047
XP_016866902 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre (1007) 528 48.8 0.00047
XP_016866915 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre (1007) 528 48.8 0.00047
XP_016866909 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre (1007) 528 48.8 0.00047
XP_016866911 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre (1007) 528 48.8 0.00047
XP_016866904 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre (1007) 528 48.8 0.00047
XP_016866918 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre (1007) 528 48.8 0.00047
>>NP_057417 (OMIM: 606032) serine/arginine repetitive ma (2752 aa)
initn: 18025 init1: 18025 opt: 18025 Z-score: 5853.0 bits: 1097.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 18025; 100.0% identity (100.0% similar) in 2752 aa overlap (1-2752:1-2752)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MYNGIGLPTPRGSGTNGYVQRNLSLVRGRRGERPDYKGEEELRRLEAALVKRPNPDILDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MYNGIGLPTPRGSGTNGYVQRNLSLVRGRRGERPDYKGEEELRRLEAALVKRPNPDILDH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ERKRRVELRCLELEEMMEEQGYEEQQIQEKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ERKRRVELRCLELEEMMEEQGYEEQQIQEKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 THQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREAKQPAPEPPKPYSLVRESSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 THQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREAKQPAPEPPKPYSLVRESSSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALAGRSPSPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 KDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALAGRSPSPAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GRRGEGDAPFSEPGTTSTQRPSSPETATKQPSSPYEDKDKDKKEKSATRPSPSPERSSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GRRGEGDAPFSEPGTTSTQRPSSPETATKQPSSPYEDKDKDKKEKSATRPSPSPERSSTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PEPPAPTPLLAERHGGSPQPLATTPLSQEPVNPPSEASPTRDRSPPKSPEKLPQSSSSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 PEPPAPTPLLAERHGGSPQPLATTPLSQEPVNPPSEASPTRDRSPPKSPEKLPQSSSSES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SPPSPQPTKVSRHASSSPESPKPAPAPGSHREISSSPTSKNRSHGRAKRDKSHSHTPSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SPPSPQPTKVSRHASSSPESPKPAPAPGSHREISSSPTSKNRSHGRAKRDKSHSHTPSRR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 MGRSRSPATAKRGRSRSRTPTKRGHSRSRSPQWRRSRSAQRWGRSRSPQRRGRSRSPQRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MGRSRSPATAKRGRSRSRTPTKRGHSRSRSPQWRRSRSAQRWGRSRSPQRRGRSRSPQRP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 GWSRSRNTQRRGRSRSARRGRSHSRSPATRGRSRSRTPARRGRSRSRTPARRRSRSRTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GWSRSRNTQRRGRSRSARRGRSHSRSPATRGRSRSRTPARRGRSRSRTPARRRSRSRTPT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RRRSRSRTPARRGRSRSRTPARRRSRTRSPVRRRSRSRSPARRSGRSRSRTPARRGRSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RRRSRSRTPARRGRSRSRTPARRRSRTRSPVRRRSRSRSPARRSGRSRSRTPARRGRSRS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 RTPARRGRSRSRTPARRSGRSRSRTPARRGRSRSRTPRRGRSRSRSLVRRGRSHSRTPQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RTPARRGRSRSRTPARRSGRSRSRTPARRGRSRSRTPRRGRSRSRSLVRRGRSHSRTPQR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 RGRSGSSSERKNKSRTSQRRSRSNSSPEMKKSRISSRRSRSLSSPRSKAKSRLSLRRSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RGRSGSSSERKNKSRTSQRRSRSNSSPEMKKSRISSRRSRSLSSPRSKAKSRLSLRRSLS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GSSPCPKQKSQTPPRRSRSGSSQTKAKSRTPPRRSRSSSSPPPKQKSKTPSRQSHSSSSP
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GSSPCPKQKSQTPPRRSRSGSSQPKAKSRTPPRRSRSSSSPPPKQKSKTPSRQSHSSSSP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 HPKVKSGTPPRQGSITSPQANEQSVTPQRRSCFESSPDPELKSRTPSRHSCSGSSPPRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 HPKVKSGTPPRQGSITSPQANEQSVTPQRRSCFESSPDPELKSRTPSRHSCSGSSPPRVK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SSTPPRQSPSRSSSPQPKVKAIISPRQRSHSGSSSPSPSRVTSRTTPRRSRSVSPCSNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SSTPPRQSPSRSSSPQPKVKAIISPRQRSHSGSSSPSPSRVTSRTTPRRSRSVSPCSNVE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 SRLLPRYSHSGSSSPDTKVKPETPPRQSHSGSISPYPKVKAQTPPGPSLSGSKSPCPQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SRLLPRYSHSGSSSPDTKVKPETPPRQSHSGSISPYPKVKAQTPPGPSLSGSKSPCPQEK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 SKDSLVQSCPGSLSLCAGVKSSTPPGESYFGVSSLQLKGQSQTSPDHRSDTSSPEVRQSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SKDSLVQSCPGSLSLCAGVKSSTPPGESYFGVSSLQLKGQSQTSPDHRSDTSSPEVRQSH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SESPSLQSKSQTSPKGGRSRSSSPVTELASRSPIRQDRGEFSASPMLKSGMSPEQSRFQS
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NP_057 SESPSLQSKSQTSPKGGRSRSSSPVTELASRSPIRQDRGEFSASPMLKSGMSPEQSRFQS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 DSSSYPTVDSNSLLGQSRLETAESKEKMALPPQEDATASPPRQKDKFSPFPVQDRPESSL
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NP_057 DSSSYPTVDSNSLLGQSRLETAESKEKMALPPQEDATASPPRQKDKFSPFPVQDRPESSL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VFKDTLRTPPRERSGAGSSPETKEQNSALPTSSQDEELMEVVEKSEEPAGQILSHLSSEL
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NP_057 VFKDTLRTPPRERSGAGSSPETKEQNSALPTSSQDEELMEVVEKSEEPAGQILSHLSSEL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KEMSTSNFESSPEVEERPAVSLTLDQSQSQASLEAVEVPSMASSWGGPHFSPEHKELSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 KEMSTSNFESSPEVEERPAVSLTLDQSQSQASLEAVEVPSMASSWGGPHFSPEHKELSNS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 PLRENSFGSPLEFRNSGPLGTEMNTGFSSEVKEDLNGPFLNQLETDPSLDMKEQSTRSSG
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NP_057 PLRENSFGSPLEFRNSGPLGTEMNTGFSSEVKEDLNGPFLNQLETDPSLDMKEQSTRSSG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HSSSELSPDAVEKAGMSSNQSISSPVLDAVPRTPSRERSSSASSPEMKDGLPRTPSRRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 HSSSELSPDAVEKAGMSSNQSISSPVLDAVPRTPSRERSSSASSPEMKDGLPRTPSRRSR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SGSSPGLRDGSGTPSRHSLSGSSPGMKDIPRTPSRGRSECDSSPEPKALPQTPRPRSRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SGSSPGLRDGSGTPSRHSLSGSSPGMKDIPRTPSRGRSECDSSPEPKALPQTPRPRSRSP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 SSPELNNKCLTPQRERSGSESSVDQKTVARTPLGQRSRSGSSQELDVKPSASPQERSESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SSPELNNKCLTPQRERSGSESSVDQKTVARTPLGQRSRSGSSQELDVKPSASPQERSESD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 SSPDSKAKTRTPLRQRSRSGSSPEVDSKSRLSPRRSRSGSSPEVKDKPRAAPRAQSGSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SSPDSKAKTRTPLRQRSRSGSSPEVDSKSRLSPRRSRSGSSPEVKDKPRAAPRAQSGSDS
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 SPEPKAPAPRALPRRSRSGSSSKGRGPSPEGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRSSPEPKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SPEPKAPAPRALPRRSRSGSSSKGRGPSPEGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRSSPEPKT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 KSRTPPRRRSSRSSPELTRKARLSRRSRSASSSPETRSRTPPRHRRSPSVSSPEPAEKSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 KSRTPPRRRSSRSSPELTRKARLSRRSRSASSSPETRSRTPPRHRRSPSVSSPEPAEKSR
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 SSRRRRSASSPRTKTTSRRGRSPSPKPRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SSRRRRSASSPRTKTTSRRGRSPSPKPRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRR
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 RQRSRSRSRVTRRRRGGSGYHSRSPARQESSRTSSRRRRGRSRTPPTSRKRSRSRTSPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RQRSRSRSRVTRRRRGGSGYHSRSPARQESSRTSSRRRRGRSRTPPTSRKRSRSRTSPAP
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 WKRSRSRASPATHRRSRSRTPLISRRRSRSRTSPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 WKRSRSRASPATHRRSRSRTPLISRRRSRSRTSPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSR
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 RRSRSRTPPVTRRRSRSRTPTTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTSPITRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RRSRSRTPPVTRRRSRSRTPTTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTSPITRR
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 RSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSRSRTPLLPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSRSRTPLLPRK
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 RSRSRSPLAIRRRSRSRTPRTARGKRSLTRSPPAIRRRSASGSSSDRSRSATPPATRNHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_005 GSRTPPVALNSSRMSCFSRPSMSPTPLDRCRSPGMLEPLGSSRTPMSVLQQAGGSMMDGP
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XP_006 ERKRRVELRCLELEEMMEEQGYEEQQIQEKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTE
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pF1KA0 PHPKVKSGTPPRQGSITSPQANEQSVTPQRRSCFESSPDPELKSRTPSRHSCSGSSPPRV
: .. :: : :. .:: . :.: . :.: .:: : . : .: .
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. : . : : : :: .: . . ::: .. : . ... ... . :
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....: :....: :: . . . . :: ..:.. .: . .: ::
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: .: .: :: : ....: : .::.: .. : :. .:
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.. :: . .: : .:. .. . . .. .: . . :. . . .
NP_001 VTRDCHLRCTWTKWFDIDFPSPGPHGGDKETYN-NIIRSGEKICRRPEEITRLQCRAESH
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:. : :: . ::.. : ::. ::. .: : .: : .
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: :: : :... ..: : . . . . .... :.: .. .:. .:. .
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. . : : . : :: . ...:. ..:. . .. . : : : : :.
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. . . ..: :: : :: :: : . :. :: . . ..:.: : .:
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:: . . .: :.: : :.: : . : :.:. ...:::: . : .
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:. . . :: . .. :: . : : . : . :..: . . ..
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. . .: . . :. . . : : . . ::. :. .
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. :..: . .. :. .. .: :. . : . . : . ::.: . .
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: . . :. . :. :.. :: : . ::. : .::.. : : :...
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. . : .: .. . .: :: :. . ::.: : : .:.. .: . ..::.. :
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... .:. ::. ::. : : . : :: .. :: :. . . : :.:
NP_001 GTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTS------TTSAPIT--STTSGPGSTP
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: :: . .:.. .: . : : ::::.. .: : .
NP_001 SPVPTTSTTS-APTTSTTSASTASTTSGPGTTP-SPVPTT-----------STTSAPTTR
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.:...:.:::. : :.:.: :: ... :.. . .: .. :.
NP_001 TTSASTASTTSGPG------STPSP-VPTTSTTSAPTTRTTPASTASTTSGPGTTPSPVP
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pF1KA0 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGSSSSDSEGSSLPVQPEVALKRVPSPTPAPKEAVRE--
..:..:.:..:. : ..:..:. .: . : . .: . . . .:: . :
NP_001 TTSTTSASTTSTISLPTTSTTSAPITSMTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSASTAST
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pF1KA0 ----GRPPEPTPAKRKRRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS---SSSSSSSSSSSSSSSS
: : :.:. . ..:..:.:..:..:. ..: : ..:..:. ..:..:.
NP_001 TSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSASTASTTSGPGTSLSPVPTTSTTSAPTTSTTSGP
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pF1KA0 SSSPSPAKPGPQALPKPASPKKPPPGERRSRSPRKPIDSLRDSRSLSYSPVERRRPSPQP
...:::. : .. :.. :: : :
NP_001 GTTPSPV-PTTSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTPVSKTSTSHLSVSKTTHSQPVT
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pF1KA0 SPRDQQSSSSERGSRRGQRGDSRSPSHKRRRETPSPRPMRHRSSRSP
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.. :. ::.:. . .: ..: .. : . : : . . : . . .
NP_001 ASSTTSGH-SEKSTIFHSSPDASGTTPSSAHSTTSGRGE-STTSRISPGSTEITTLPGST
2120 2130 2140 2150 2160 2170
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. : .... ..:. . :. : :: .:.. . . . : . . . .:. . .
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.. ... .:. . .... . ::. . : ..:.: . : ...: .:
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pF1KA0 GQILSHLSSELKEMST--SNFESSPEVEERPAVSLTLDQSQSQASLEAVEVPSMASSWGG
:: :. . .. ..:.: : : ..: :.. ... ::: .: . :: .
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:: . .. . ..: : ... : ...: . ..: . :
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. .. .:: .:. . ... ... .:.:.. : :. : .: . :..:
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. .:: : : : :: ::. . . . :::: ...
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: :: . .. . : : : .:: . .:. :..:.: .
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: ...: .::: . ::: : : : .: : :: : : .. :: : ... . :
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. : . : .. : ::: . :: .:. ::: :...: ::
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. . : . .: .. : . :. : .. . : : .:...:: :.
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: ::.... : ... . . . : : : : .. :::. :
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: . .. ::. . : ::.. :... .:..: .: : :: . :. .
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: : . :.: :. . . . . . . ::..:.. . . : :
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: :.: ..: . : .: ... . : : : :.: . . : :: :
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: .:.. . :.. . . : . .: : : . . .. :: .::
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:: .. . . :: : : ..: :: : . :. . . .::. . :
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:: . ..:: : . : : . :.. .:. . : . ..: .: ..:. : . ..
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. . : : :: : : : : . .. ..:: : . : .:.. : .. : :
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:: :. : : ..::: . : . : : :.:. .. :. .....
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. ::. .: . . .:. .... . :: ::. : ::... . :.: .
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:. .:: . : : .: .... :: :.:. .:::.. : : ..:. . ::
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..:. :.: : :..: . .: : :. .: : :. : .: : :.:
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.... : :. .. : ... . . .:.. . : : :.. :. : :
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.. . : :::: :. .:.. :.:. :. .:. :: ... . .:
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:. : ..:. :.. :: .:... ::...... .. . . . :: .
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pF1KA0 PKEAVREGRPPEPTPAKRKRRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS-
. :.: . .:.. .::..:. : :..: ::...... . :..:
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. :. :: . : .. :.: : .:. . :::.: .: . . : : : ..
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: : . . . :. . .: .. : .: : . : ::: . :
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. .:.:. .. :.: .. .. :. . . ....:. :::.. . . ::. . .
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. .: :. ...... :::. ...:. : .... . ::. :: .. .
NP_002 GTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGTQSTTLTPITTTTTVTPIPTPTGTQTPTSTPITTTI
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2330 2340 2350 2360 2370 2380
pF1KA0 SRTPQ-APASANLVGPRSAHATAPVNIA----GSRTAAALAPASLTSARMAPALSGANLT
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NP_002 TVTPTPTPTGTQTPTPTPISTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGTQ-T
2940 2950 2960 2970 2980 2990
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pF1KA0 SPRVPLSAYERVSGRTSPPLLDRARSRTPPSAPSQSRMTSERAPSPSSRMGQAPSQSLLP
.:.:. :. .: . ..:: :.: . :. .:.:. :.:. . .
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pF1KA0 PAQDQPRSPVPSAFSDQSRCLIAQTTPVA------GSQSLSSGAVATTTS---SAGDHNG
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NP_002 TTTTVTPTPTPTGTQTPTSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTPTPITTTTTVTPTPTPTGT
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pF1KA0 MLSVPAPGVPHSDVGEPPASTGAQQPSAL-----AALQPAKERRSSSSSSSSSSSSSSSS
. . .: . . : :. ::.: :.. ... :. ...:.. . .....
NP_002 QTPTSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGTQSTTLTPITTTTTV
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pF1KA0 SSSSSSSSSGSSSSDSEGSSLPVQPEVALKRVPSPTPAPKEAVREGRPPEPTPAKRKRRS
. . . ... . .: .. : : . ..:.::: .. : :::
NP_002 TPTPTPTGTQTPTSTPITTTTTVTPTPTGTQTPTPTPI---STTTTVTPTPTP-------
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pF1KA0 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPSPAKPGPQALPKPASPKK
..... . . ..... . . . ..... ... :.... .:.:. : : .: .
NP_002 TGTQTPTMTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPISTTTTVTPTPTPTGTQ------TPTS
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: . .: : . ... . .:. .: :.: ::.. .
NP_002 TPITTTTTVTPT-PTPT--GTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGTQSTTLTPITTTTTVTP
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pF1KA0 SRSPSHKRRRETPSPRPMRHRSSRSP
. .:. .::.: :. .. .:
NP_002 TPTPTGT---QTPTPTPISTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPT
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: . : .:: : . ..:: : ::::: :
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. .. . .:.:: : :.: .:..: : :: .:... .. :
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. ..:.. : :.. : :. :: . .. ::... . . . : .::. :..:
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: . : :. :: .:::: : : : :::. : :. :: : :
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: :. .::.: ::: ::: :. .. : :::: ..: :. .:::. : :::.
XP_016 PPPRHRRSRSPVRRRR-RSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKPPKRTSSPPRKTRRLSPSA
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: :. :. . . : . .:. .. .:..: : :: .. . .. .::. .
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. . :.: .. . . . : ::. .. .: : . . :: . : .:.. ..
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..:.: : ::. ::.: ::.. ..:: :: :: .: .::: .: ::: :.
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520 530 540 550 560
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: :: :: :.: :.::.:.::: : .: . : ::.. .: . .: ::
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: :. : .:: .:: . : .: :..: : : ::: : :::. . :.. . :
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: ..:: :.: :: :..: ::... .:: ..:. : :.. :. .
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.:: : : : . :..::. . :.. . ..: . . :..: .
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... : .:. :. : :: : .. ::
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XP_016 QS
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: . : .:: : . ..:: : ::::: :
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. .. . .:.:: : :.: .:..: : :: .:... .. :
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: :. :. . . : . .:. .. .:..: : :: : .: .. .: :
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: : .. .:..: ...:...::: :. .. . ..:. ... : :. ...
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pF1KA0 RTSSRRRRGRSRTP-PTSRKRSRSRTSPAPWKRSRSRASPATH--RRSRSRTPLISRRRS
... :::.. ::. :. :::.. .::: . .. ::.:. :: :: .: .:::
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pF1KA0 RSRTSPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSRRRS---RSRTPPVTRRRSRSRTPTTRRR
.: ::: :. : :::. :: :::: : .::. :: : : : .::
XP_016 SPSPAPPPRRR-RTPTPPPRRRT---PSPPPRRRSPSPRRYSPPIQRRYSPS--PPPKRR
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pF1KA0 SRSRTPPVTRRRSRSRTPPVTRRRSRS-----RTSPITRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSP
. : :: :: : : :: :: :.: :.::.:.::: : .: . : ::..
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pF1KA0 VTRR-RSRSRTSPVTRRRS--RSRTPPAIRRRSRSRTPLLPRKRSRSRSPLAIRRRSRSR
.: . .: :: : :. : .:: .:: . : .: :..: : : ::: : :
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::. . :.. . :: ..:: :.: :: :..: ::... .:: ..:. :
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:.. :. . .:: : : : . :..::. . :.. . ..:
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. . :..: . ... : .:. :. : :: : .. ::
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XP_016 EKALRSMRKAQVSPQS
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>>XP_016855501 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine (876 aa)
initn: 493 init1: 272 opt: 743 Z-score: 264.4 bits: 61.7 E(85289): 5.5e-08
Smith-Waterman score: 899; 31.3% identity (54.6% similar) in 802 aa overlap (1475-2228:115-852)
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pF1KA0 PGLRDGSGTPSRHSLSGSSPGMKDIPRTPSRGRSECDSSPEPKALPQTPRPR-SRSPSSP
: . : .:: : . ..:: : ::::: :
XP_016 LELKKEEIKQRQIEQEKLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRERSRSPRRRKSRSPS-P
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pF1KA0 ELNNKCLTPQRERSGSESSVDQKTVARTPLGQRSRSGSSQELDVKPSASPQERSESDSSP
. .. . .:.:: : :.: .:..: : :: .:... .. :
XP_016 RRRSSPVRRERKRSHS----------RSPR-HRTKSRS-------PSPAPEKKEKTPELP
150 160 170 180
1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 DSKAKTRTPLRQRSRSGSS------PE-VDSKSRLSPRRSRSGSSPEVKDKPRAAPRAQS
. ..:.. : :.. : :. :: . .. ::... . . . : .::. :..:
XP_016 EPSVKVKEPSVQEATSTSDILKVPKPEPIPEPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKS
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pF1KA0 GSDS-SPEPKAPAPRALPRRSRSGSSSKGRGPSPEGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRSS
: . : :. :: .:::: : : : :::. : :. :: : :
XP_016 RSRTRSRSPSHTRPRRR-HRSRSRSYSPRRRPSPRRRPS--------PRRRTPPR--RMP
250 260 270 280 290
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pF1KA0 PEPK-TKSRTPPRRRSSRSSPELT--RKARLSRRSRSASSSPETRSRTPPRHRR--SPSV
: :. .::.: ::: ::: :. .. : :::: ..: :. .:::. : :::.
XP_016 PPPRHRRSRSPVRRRR-RSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKPPKRTSSPPRKTRRLSPSA
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: :. :. . . : . .:. .. .:..: : :: : .: .. .: :
XP_016 SPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSRVSVSPGRTSVTKHKGTEKRESPSPA
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pF1KA0 EKTRT---TRRRDRSG---SSQSTSRRRQRSRSRSRVTRRRRGGSGYHSRSPARQ--ESS
: : .. .:..: ...:...::: :. .. . ..:. ... : :. ...
XP_016 PKPRKVELSESEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQQSSSDSGSSSSSEDERPKRSHVKNG
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pF1KA0 RTSSRRRRGRSRTP-PTSRKRSRSRTSPAPWKRSRSRASPATH--RRSRSRTPLISRRRS
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XP_016 EVGRRRRHSPSRSASPSPRKRQK-ETSPR-MQMGKRWQSPVTKSGRRRRSPSPPPTRRRR
480 490 500 510 520 530
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pF1KA0 RSRTSPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSRRRS---RSRTPPVTRRRSRSRTPTTRRR
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XP_016 EARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVRRGA-SSSP--QRRQSPSPSTRPIRRVS--R
650 660 670 680 690
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::. . :.. . :: ..:: :.: :: :..: ::... .:: ..:. :
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:.. :. . .:: : : : . :..::. . :.. . ..:
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760 770 780 790 800
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. . :..: . ... : .:. :. : :: : .. ::
XP_016 KKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKETESEAEDNLDDLEKHLR
810 820 830 840 850 860
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XP_016 EKALRSMRKAQVSPQS
870
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