Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0324
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0324, 2752 aa
1>>>pF1KA0324 2752 - 2752 aa - 2752 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 18.8766+/-0.00131; mu= -34.9711+/- 0.080
mean_var=759.0940+/-156.330, 0's: 0 Z-trim(115.9): 125 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.046551
statistics sampled from 16402 (16517) to 16402 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.507), width: 16
Scan time: 10.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32373.1 SRRM2 gene_id:23524|Hs108|chr16 (2752) 18025 1227.5 0
CCDS76369.1 MUC5AC gene_id:4586|Hs108|chr11 (5654) 1014 85.2 1.1e-14
CCDS55139.1 MUC12 gene_id:10071|Hs108|chr7 (5335) 911 78.3 1.3e-12
CCDS46095.1 SRRM5 gene_id:100170229|Hs108|chr19 ( 715) 824 72.1 1.3e-11
>>CCDS32373.1 SRRM2 gene_id:23524|Hs108|chr16 (2752 aa)
initn: 18025 init1: 18025 opt: 18025 Z-score: 6556.0 bits: 1227.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 18025; 100.0% identity (100.0% similar) in 2752 aa overlap (1-2752:1-2752)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MYNGIGLPTPRGSGTNGYVQRNLSLVRGRRGERPDYKGEEELRRLEAALVKRPNPDILDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MYNGIGLPTPRGSGTNGYVQRNLSLVRGRRGERPDYKGEEELRRLEAALVKRPNPDILDH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ERKRRVELRCLELEEMMEEQGYEEQQIQEKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ERKRRVELRCLELEEMMEEQGYEEQQIQEKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 THQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREAKQPAPEPPKPYSLVRESSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 THQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREAKQPAPEPPKPYSLVRESSSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALAGRSPSPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALAGRSPSPAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GRRGEGDAPFSEPGTTSTQRPSSPETATKQPSSPYEDKDKDKKEKSATRPSPSPERSSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GRRGEGDAPFSEPGTTSTQRPSSPETATKQPSSPYEDKDKDKKEKSATRPSPSPERSSTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PEPPAPTPLLAERHGGSPQPLATTPLSQEPVNPPSEASPTRDRSPPKSPEKLPQSSSSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEPPAPTPLLAERHGGSPQPLATTPLSQEPVNPPSEASPTRDRSPPKSPEKLPQSSSSES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SPPSPQPTKVSRHASSSPESPKPAPAPGSHREISSSPTSKNRSHGRAKRDKSHSHTPSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPPSPQPTKVSRHASSSPESPKPAPAPGSHREISSSPTSKNRSHGRAKRDKSHSHTPSRR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 MGRSRSPATAKRGRSRSRTPTKRGHSRSRSPQWRRSRSAQRWGRSRSPQRRGRSRSPQRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGRSRSPATAKRGRSRSRTPTKRGHSRSRSPQWRRSRSAQRWGRSRSPQRRGRSRSPQRP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 GWSRSRNTQRRGRSRSARRGRSHSRSPATRGRSRSRTPARRGRSRSRTPARRRSRSRTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GWSRSRNTQRRGRSRSARRGRSHSRSPATRGRSRSRTPARRGRSRSRTPARRRSRSRTPT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RRRSRSRTPARRGRSRSRTPARRRSRTRSPVRRRSRSRSPARRSGRSRSRTPARRGRSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RRRSRSRTPARRGRSRSRTPARRRSRTRSPVRRRSRSRSPARRSGRSRSRTPARRGRSRS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 RTPARRGRSRSRTPARRSGRSRSRTPARRGRSRSRTPRRGRSRSRSLVRRGRSHSRTPQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RTPARRGRSRSRTPARRSGRSRSRTPARRGRSRSRTPRRGRSRSRSLVRRGRSHSRTPQR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 RGRSGSSSERKNKSRTSQRRSRSNSSPEMKKSRISSRRSRSLSSPRSKAKSRLSLRRSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RGRSGSSSERKNKSRTSQRRSRSNSSPEMKKSRISSRRSRSLSSPRSKAKSRLSLRRSLS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GSSPCPKQKSQTPPRRSRSGSSQTKAKSRTPPRRSRSSSSPPPKQKSKTPSRQSHSSSSP
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GSSPCPKQKSQTPPRRSRSGSSQPKAKSRTPPRRSRSSSSPPPKQKSKTPSRQSHSSSSP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 HPKVKSGTPPRQGSITSPQANEQSVTPQRRSCFESSPDPELKSRTPSRHSCSGSSPPRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HPKVKSGTPPRQGSITSPQANEQSVTPQRRSCFESSPDPELKSRTPSRHSCSGSSPPRVK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SSTPPRQSPSRSSSPQPKVKAIISPRQRSHSGSSSPSPSRVTSRTTPRRSRSVSPCSNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSTPPRQSPSRSSSPQPKVKAIISPRQRSHSGSSSPSPSRVTSRTTPRRSRSVSPCSNVE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 SRLLPRYSHSGSSSPDTKVKPETPPRQSHSGSISPYPKVKAQTPPGPSLSGSKSPCPQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SRLLPRYSHSGSSSPDTKVKPETPPRQSHSGSISPYPKVKAQTPPGPSLSGSKSPCPQEK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 SKDSLVQSCPGSLSLCAGVKSSTPPGESYFGVSSLQLKGQSQTSPDHRSDTSSPEVRQSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SKDSLVQSCPGSLSLCAGVKSSTPPGESYFGVSSLQLKGQSQTSPDHRSDTSSPEVRQSH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SESPSLQSKSQTSPKGGRSRSSSPVTELASRSPIRQDRGEFSASPMLKSGMSPEQSRFQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SESPSLQSKSQTSPKGGRSRSSSPVTELASRSPIRQDRGEFSASPMLKSGMSPEQSRFQS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 DSSSYPTVDSNSLLGQSRLETAESKEKMALPPQEDATASPPRQKDKFSPFPVQDRPESSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSSSYPTVDSNSLLGQSRLETAESKEKMALPPQEDATASPPRQKDKFSPFPVQDRPESSL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VFKDTLRTPPRERSGAGSSPETKEQNSALPTSSQDEELMEVVEKSEEPAGQILSHLSSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VFKDTLRTPPRERSGAGSSPETKEQNSALPTSSQDEELMEVVEKSEEPAGQILSHLSSEL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KEMSTSNFESSPEVEERPAVSLTLDQSQSQASLEAVEVPSMASSWGGPHFSPEHKELSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEMSTSNFESSPEVEERPAVSLTLDQSQSQASLEAVEVPSMASSWGGPHFSPEHKELSNS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 PLRENSFGSPLEFRNSGPLGTEMNTGFSSEVKEDLNGPFLNQLETDPSLDMKEQSTRSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLRENSFGSPLEFRNSGPLGTEMNTGFSSEVKEDLNGPFLNQLETDPSLDMKEQSTRSSG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HSSSELSPDAVEKAGMSSNQSISSPVLDAVPRTPSRERSSSASSPEMKDGLPRTPSRRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HSSSELSPDAVEKAGMSSNQSISSPVLDAVPRTPSRERSSSASSPEMKDGLPRTPSRRSR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SGSSPGLRDGSGTPSRHSLSGSSPGMKDIPRTPSRGRSECDSSPEPKALPQTPRPRSRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGSSPGLRDGSGTPSRHSLSGSSPGMKDIPRTPSRGRSECDSSPEPKALPQTPRPRSRSP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 SSPELNNKCLTPQRERSGSESSVDQKTVARTPLGQRSRSGSSQELDVKPSASPQERSESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSPELNNKCLTPQRERSGSESSVDQKTVARTPLGQRSRSGSSQELDVKPSASPQERSESD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 SSPDSKAKTRTPLRQRSRSGSSPEVDSKSRLSPRRSRSGSSPEVKDKPRAAPRAQSGSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSPDSKAKTRTPLRQRSRSGSSPEVDSKSRLSPRRSRSGSSPEVKDKPRAAPRAQSGSDS
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 SPEPKAPAPRALPRRSRSGSSSKGRGPSPEGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRSSPEPKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPEPKAPAPRALPRRSRSGSSSKGRGPSPEGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRSSPEPKT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 KSRTPPRRRSSRSSPELTRKARLSRRSRSASSSPETRSRTPPRHRRSPSVSSPEPAEKSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KSRTPPRRRSSRSSPELTRKARLSRRSRSASSSPETRSRTPPRHRRSPSVSSPEPAEKSR
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 SSRRRRSASSPRTKTTSRRGRSPSPKPRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSRRRRSASSPRTKTTSRRGRSPSPKPRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRR
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 RQRSRSRSRVTRRRRGGSGYHSRSPARQESSRTSSRRRRGRSRTPPTSRKRSRSRTSPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RQRSRSRSRVTRRRRGGSGYHSRSPARQESSRTSSRRRRGRSRTPPTSRKRSRSRTSPAP
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 WKRSRSRASPATHRRSRSRTPLISRRRSRSRTSPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WKRSRSRASPATHRRSRSRTPLISRRRSRSRTSPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSR
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 RRSRSRTPPVTRRRSRSRTPTTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTSPITRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RRSRSRTPPVTRRRSRSRTPTTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTSPITRR
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 RSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSRSRTPLLPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSRSRTPLLPRK
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 RSRSRSPLAIRRRSRSRTPRTARGKRSLTRSPPAIRRRSASGSSSDRSRSATPPATRNHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RSRSRSPLAIRRRSRSRTPRTARGKRSLTRSPPAIRRRSASGSSSDRSRSATPPATRNHS
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 GSRTPPVALNSSRMSCFSRPSMSPTPLDRCRSPGMLEPLGSSRTPMSVLQQAGGSMMDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GSRTPPVALNSSRMSCFSRPSMSPTPLDRCRSPGMLEPLGSSRTPMSVLQQAGGSMMDGP
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 GPRIPDHQRTSVPENHAQSRIALALTAISLGTARPPPSMSAAGLAARMSQVPAPVPLMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GPRIPDHQRTSVPENHAQSRIALALTAISLGTARPPPSMSAAGLAARMSQVPAPVPLMSL
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA0 RTAPAANLASRIPAASAAAMNLASARTPAIPTAVNLADSRTPAAAAAMNLASPRTAVAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RTAPAANLASRIPAASAAAMNLASARTPAIPTAVNLADSRTPAAAAAMNLASPRTAVAPS
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA0 AVNLADPRTPTAPAVNLAGARTPAALAALSLTGSGTPPTAANYPSSSRTPQAPASANLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVNLADPRTPTAPAVNLAGARTPAALAALSLTGSGTPPTAANYPSSSRTPQAPASANLVG
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KA0 PRSAHATAPVNIAGSRTAAALAPASLTSARMAPALSGANLTSPRVPLSAYERVSGRTSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PRSAHATAPVNIAGSRTAAALAPASLTSARMAPALSGANLTSPRVPLSAYERVSGRTSPP
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KA0 LLDRARSRTPPSAPSQSRMTSERAPSPSSRMGQAPSQSLLPPAQDQPRSPVPSAFSDQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLDRARSRTPPSAPSQSRMTSERAPSPSSRMGQAPSQSLLPPAQDQPRSPVPSAFSDQSR
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KA0 CLIAQTTPVAGSQSLSSGAVATTTSSAGDHNGMLSVPAPGVPHSDVGEPPASTGAQQPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CLIAQTTPVAGSQSLSSGAVATTTSSAGDHNGMLSVPAPGVPHSDVGEPPASTGAQQPSA
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KA0 LAALQPAKERRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGSSSSDSEGSSLPVQPEVALKRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAALQPAKERRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGSSSSDSEGSSLPVQPEVALKRVP
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KA0 SPTPAPKEAVREGRPPEPTPAKRKRRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPTPAPKEAVREGRPPEPTPAKRKRRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KA0 SSSSSSSSPSPAKPGPQALPKPASPKKPPPGERRSRSPRKPIDSLRDSRSLSYSPVERRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSSSSSSSPSPAKPGPQALPKPASPKKPPPGERRSRSPRKPIDSLRDSRSLSYSPVERRR
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2710 2720 2730 2740 2750
pF1KA0 PSPQPSPRDQQSSSSERGSRRGQRGDSRSPSHKRRRETPSPRPMRHRSSRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSPQPSPRDQQSSSSERGSRRGQRGDSRSPSHKRRRETPSPRPMRHRSSRSP
2710 2720 2730 2740 2750
>>CCDS76369.1 MUC5AC gene_id:4586|Hs108|chr11 (5654 aa)
initn: 203 init1: 128 opt: 1014 Z-score: 376.8 bits: 85.2 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 1283; 21.7% identity (47.3% similar) in 2523 aa overlap (230-2678:2236-4597)
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 SESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKSKDKKRKRS---RSTTPAPK
:. .: .. .: .:.: . ::: .:.
CCDS76 NYEVRVLCCETPKGCPVTSTPVTAPSTPSGRATSPTQSTSSWQKSRTTTLVTTSTTSTPQ
2210 2220 2230 2240 2250 2260
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 SRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALAGRSPSPASGRRGEGDAPFSEPGTT
. .. :. :..:. :.:. : : :.:: : :::: : :..: : :.
CCDS76 TSTTYAHTT--STTSAPTARTTS---APTTRTT-----SASPASTTSGPGNTPSPVPTTS
2270 2280 2290 2300 2310
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 STQRPSSPETATKQPSSPYEDKDKDKKEKS-ATRPSPSPERS-STGPEPP---APTPLLA
. . :.. . :. :.. . .. .. .: ::: : : ...: ::: .
CCDS76 TISAPTT--SITSAPTTSTTSAPTSSTTSGPGTTPSPVPTTSITSAPTTSTTSAPTTSTT
2320 2330 2340 2350 2360 2370
380 390 400 410 420
pF1KA0 ERHGGSPQPLATTPLSQEPVNPPSEASPTRDRSPPKSPEKLPQSSSSESSPPS-----PQ
. .: .:: . : . :: . : : . ..:. :.: : ::
CCDS76 SARTSSTTSATTTSRISGPETTPSPVPTTSTTSATTTSTTSAPTTSTTSAPTSSTTSSPQ
2380 2390 2400 2410 2420 2430
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PTKVSRHASSSPESPKPAPAPGSHREISSSPTSKNRSHGRAKRDKSHSHTPSRRMGRSRS
. .: ..:. .: .:.: .:.::... : .. : : . . . .
CCDS76 TSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTRTTSAPKS------STTSAATTSTTSG
2440 2450 2460 2470 2480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PATAKRGRSRSRTPTKRGHSRSRSPQWRRSRSAQRWGRSRSPQRRGRSRSPQRPGWSRSR
: :. : . : .. : . .: . :: : . : . .:. : . :
CCDS76 PETTPRPVPTTSTTSSPTTSTTSAPT-TSTTSA-----STTSTTSGAGTTPS-PVPTTST
2490 2500 2510 2520 2530 2540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 NTQRRGRSRSARRGRSHSRSPATRGRSRSRTPARRGRSRSRTPARRRSRSRTPTRRRSRS
.. . :: : . : . : . : . . .:. : . .:: . .
CCDS76 TSAPTTSTTSA---------PISSTTSATTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSG
2550 2560 2570 2580 2590
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 --RTPARRGRSRSRTPARRRSRTRSPVRRRSRSRSPARRSGRSRSRTPARRGRSRSRTPA
::. . : : : : . .:. . . . .: :: . .:. . . : . .
CCDS76 PGTTPSAVPTT-SITSAPTTSTNSAPISSTTSATTTSRISGPETTPSPVPTASTTSASTT
2600 2610 2620 2630 2640 2650
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 RRGRSRSRTPARRSGRSRSRTPARRGRSRSRTPRRGRSRSRSLVRRGRSHSRTPQRRGRS
. . ::. : .:. : : : . : . . : . : .: .
CCDS76 STTSGPGTTPSPVPTTSTISVPTTSTTSASTTSTTSASTTSTTSGPGTTPSPVP-----T
2660 2670 2680 2690 2700
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GSSSERKNKSRTSQRRSRSNSSPEMKKSRISSRRSRSLSSPRSKAKSRLSLRRSLSGSSP
:.. . : :: . . :.: . . .. . : .:: . : . . :.
CCDS76 TSTTSAPTTSTTSAPTTSTISAPTTSTTSATTTSTTSAPTPRRTSAPTTSTISASTTSTT
2710 2720 2730 2740 2750 2760
790 800 810 820 830
pF1KA0 CPKQKSQTPPRRSRSGSSQTKAKSRTPPRRSRSSS-----SPPPKQKSKTPSRQSHSSSS
: : . . :. : . . .: . :.. : : .. ..:: :. ..:.
CCDS76 SATTTSTTSATTTSTISAPTTSTTLSPTTSTTSTTITSTTSAPISSTTSTP--QTSTTSA
2770 2780 2790 2800 2810 2820
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 PHPKVKSGTPPRQGSITSPQANEQSVTPQRRSCFESSPDPELKSRTPSRHSCSGSSPPRV
: .. :: : :. .:: . :.: . :.: .:: : . : .: .
CCDS76 PTTSTTSG--P--GTTSSP-VPTTSTTSAPTTSTTSAPT----TRTTSVPTSSTTSTATT
2830 2840 2850 2860 2870
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 KSSTPPRQSPSRSSSPQPKVKAIISPRQRSHSGSSSPSPSRVTSRTTPRRSRSVSPCSNV
.... : .:: : : ... .: :. :. .. . : :. :: . :.. ...
CCDS76 STTSGPGTTPS----PVPTTSTTSAPTTRTTSAPTTSTTSAPTTSTTSAPTSSTTSATTT
2880 2890 2900 2910 2920 2930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 ESRLLPRYSHSGSSSPDTKVKPETPPRQSHS-GSISPYPKVKAQTPPGPSLSGSKSPCPQ
. .: . : .: : : .: .: .. : . : ..: ::. . : : .
CCDS76 STISVP--TTSTTSVPGTTPSP-VPTTSTISVPTTSTTSASTTSTTSGPGTTPSPVPTTS
2940 2950 2960 2970 2980
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 EKSKDSLVQSCPGSLSLCAGVKSSTPPGESYFGVSSLQLKGQSQTSPDHRSDTSSPEVRQ
: . . . : .. .::: . . .:. : :: : ::.:
CCDS76 TTSAPTTSTTSAPTTSTISAPTTSTPSAPT---TSTTLAPTTSTTSAPTTSTTSTPTSST
2990 3000 3010 3020 3030 3040
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 SHSESPSLQSKSQTSPKGGRSRSSSPVTELASRSPIRQDRGEFSASPMLKSGMSPEQSRF
. : . : : : :: .: . . ::: .. : . ... ... . :
CCDS76 TSSPQTSTTSASTTSITSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSAATTSTISAPTTSTTSAP
3050 3060 3070 3080 3090 3100
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 QSDSSSYPTVDSNSLLGQSRLETAESKEKMALPPQEDATASPPRQKDK---FSPFPVQDR
....: :....: :: . . . . :: ..:.. .: . .: ::
CCDS76 TTSTTSASTASKTSGLGTT--PSPIPTTSTTSPPTTSTTSASTASKTSGPGTTPSPV---
3110 3120 3130 3140 3150
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 PESSLVFKDTLRTPPRERSGAGSSPETKEQNSALPTSSQ---DEELMEVVEKSEEPAGQI
: .: .: :: : ....: : .::.: .. : :. .:
CCDS76 PTTSTIFAP--RTSTTSASTTSTTPGPGTTPSPVPTTSTASVSKTSTSHVSISKTTHSQP
3160 3170 3180 3190 3200 3210
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA0 LS---HLSSELKEMSTSNFES-SPEVEERPAVSLTLDQSQSQASLEAVEVPSMAS-SWGG
.. :: . .: : .:. .. . . .. .: . . :. . . .
CCDS76 VTRDCHLRCTWTKWFDIDFPSPGPHGGDKETYN-NIIRSGEKICRRPEEITRLQCRAESH
3220 3230 3240 3250 3260 3270
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA0 PHFSPEHKELSNSPLRENSFGSPLEFRNS---GPLGTEMNTGFSSEVKEDLNG-PFLNQL
:. : :: . ::.. : ::. ::. .: : .: : .
CCDS76 PEVSIEHLGQVVQCSREEG----LVCRNQDQQGPFKMCLNYEVRVLCCETPKGCPVTSTP
3280 3290 3300 3310 3320 3330
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KA0 ETDPSLDMKEQSTRSSGHSSSELSPDAVEKAGMSSNQSISSPVLDAVPRTPSRERSSSAS
: :: : :... ..: : . . . . .... :.: .. .:. .:. .
CCDS76 VTAPSTP----SGRATSPTQSTSSWQKSRTTTLVTTSTTSTP-QTSTTSAPTTSTTSAPT
3340 3350 3360 3370 3380
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KA0 SPEMKDGLPRTPSRRSRSGSSPGLRDGSGTPSRHSLSGSSPGMKDIPRTPSRGRSECDSS
. . : : . : :: . ...:. ..:. . .. . : : : : :.
CCDS76 TSTTSAPTTSTTSTPQTSISSAPTSSTTSAPTSSTISARTTSIISAPTT-STTSSPTTST
3390 3400 3410 3420 3430 3440
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA0 PEPKALPQTPRPRSRSPSSPELNNKCLTPQRERSGSESS------VDQKTVARTPLGQRS
. : : : . :.:. .. . . ::: .. .. .:..: .. :
CCDS76 TSATTTSTTSAPTSSTTSTPQTSKTSAATSSTTSGSGTTPSPVTTTSTASVSKTSTSHVS
3450 3460 3470 3480 3490 3500
1540 1550 1560 1570 1580
pF1KA0 RSGS--SQEL--DVKPSASPQERSESD-SSPDSKAKTRTPLRQRSRSGSS----PEVDSK
: . :: . : .: . . . : :: .. . . ::: . ::
CCDS76 VSKTTHSQPVTRDCHPRCTWTKWFDVDFPSPGPHGGDKETYNNIIRSGEKICRRPE--EI
3510 3520 3530 3540 3550 3560
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KA0 SRLSPRRSRSGSSPEVK----DKPRAAPRAQSGSDSSPEPKAPAPRALPRRSRSGSSSKG
.:: . :. : :::. . : .. . . ..: : . :
CCDS76 TRL---QCRAKSHPEVSIEHLGQVVQCSREEGLVCRNQDQQGPFKMCLNYEVRVLCCETP
3570 3580 3590 3600 3610 3620
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KA0 RGPSPEGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRSSPEPKTKSRTPPRRRSSRSSPELTRKARLS
.: : :.:. ..: : :. : :: . :::: :: .: : .
CCDS76 KG-CPVTSTSV-TAPSTPSGRATSPTQSTSSWQ---KSRTTTLVTSSITSTTQTSTTSAP
3630 3640 3650 3660 3670
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KA0 RRSRSASSSPETRSRTPPRHRRSPSVSSPE-PAEKSRSSRRRRSASSPRTKTTSRRGRSP
: . .: : : : .:..:. :. .. :. . ..:.: ..::: :
CCDS76 TTSTTPASIPSTTSAPTTSTTSAPTTSTTSAPTTSTTSTPQTTTSSAPTSSTTSAPTTST
3680 3690 3700 3710 3720 3730
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KA0 --SPKPRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRRRQRSRSRSRVTRRRRGGSGYH
.: .. . . : .: : :: :. . . . . :.
CCDS76 ISAPTTSTISAPTTSTTSAPTASTTSAPTSTSSAPTTNTTSAPTTSTTSAPITSTISAPT
3740 3750 3760 3770 3780 3790
1830 1840 1850 1860 1870 1880
pF1KA0 SRSPARQESSRTSSRRRRGRSRTPPTSRKRS-RSRTSPAPWKRSRSRASPATHRRSRSRT
. . . ..: :: : :: :: : . :. :: . . ..:.: : .:
CCDS76 TSTTSTPQTSTISSPTTSTTS-TPQTSTTSSPTTSTTSAP--TTSTTSAPTTSTTSTPQT
3800 3810 3820 3830 3840 3850
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KA0 PLISRRRSRSRTSPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTP
. : : . ..:.. : ::.: .. : .:: . : . . : : . : . .
CCDS76 SISSAPTSSTTSAPTASTISAPTTSTTSFHTTSTTSPPT---SSTSSTPQTSKTSAATSS
3860 3870 3880 3890 3900 3910
1950 1960 1970 1980 1990
pF1KA0 TTRRRSRSRTP-PVTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTSPITRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTS
:: . . .: :.: : :.: : . : :.:. ...:::: . : .
CCDS76 TTSGSGTTPSPVPTTSTASVSKTS--TSHVSVSKTT---------HSQPVTRD-CHPRCT
3920 3930 3940 3950
2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KA0 PVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSR-SRTPL-LPRKRSRSRSPLAIRRRSRSR
:. . . :: . .. :: . : : . : . :..: . . ..
CCDS76 -WTKWFDVDFPSPGPHGGDKETYNNIIRSGEKICRRPEEITRLQCRAESHPEVSIEHLGQ
3960 3970 3980 3990 4000 4010
2060 2070 2080 2090 2100 2110
pF1KA0 TPRTARGKRSLTRSPPAIRRRSASGSSSDRSRSATPPATRNHSGSRTPPVALNSSRMSCF
. . .: . . :. . . : : . . ::. :. .
CCDS76 VVQCSREEGLVCRNQDQQGPFKMCLNYEVRVLCCETP---KGCPVTSTPVTAPSTPSGRA
4020 4030 4040 4050 4060 4070
2120 2130 2140 2150 2160 2170
pF1KA0 SRPSMSPTPLDRCRSPGMLEPLGSSRTPMSVLQQAGGSMMDGPGPRIPDHQRTSVPENHA
. :..: . .. :. .. .: :. . : . . : . ::.: . .
CCDS76 TSPTQSTSSWQKSRTTTLVTTSTTSTPQTSTTSAPTTSTIPASTP-----STTSAPTTST
4080 4090 4100 4110 4120
2180 2190 2200 2210 2220 2230
pF1KA0 QSRIALALTAISLGTARPPPSMSAAGLAARMSQVPAPVPLMSLRTAPAANLASRIPAASA
: . . :. . :. :.. :: : . ::. : .::.. : : :...
CCDS76 TSAPTTSTTSAPTHRTTSGPTTSTT-LAPTTSTTSAPTT--STNSAPTT---STISASTT
4130 4140 4150 4160 4170 4180
2240 2250 2260 2270 2280 2290
pF1KA0 AAMNLASARTPAIPTAVNLADSRTPAAAAAMNLASPRTAVAPSAVNLADPRTPTAPAVNL
.... .. : . ::. . . .: ..:: . .. ....:: : ::. ...
CCDS76 STISAPTTSTISSPTSSTTSTPQTSKTSAATSSTTSGSGTTPSPV-------PTTSTTSA
4190 4200 4210 4220 4230
2300 2310 2320 2330 2340 2350
pF1KA0 AGARTPAALAALSLTGSGTPPTAANYPSSSRTPQAPASANLVGPRSAHATAPVNIAGSRT
. . : .: .. . .: :: :. . ::.: : : .:.. .: . ..::.. :
CCDS76 STTSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPV--PSTSTTSAATTSTT-SAPTTRTTSAPTSSMTSGP
4240 4250 4260 4270 4280 4290
2360 2370 2380 2390 2400 2410
pF1KA0 AAALAPASLTSARMAPALS---GANLTSPRVPLSAYERVSGRTSPPLLDRARSRTPPSAP
... .:. ::. ::. : : . : :: .. :: :. . . : :.:
CCDS76 GTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTS------TTSAPIT--STTSGPGSTP
4300 4310 4320 4330 4340
2420 2430 2440 2450 2460 2470
pF1KA0 SQSRMTSERAPSPSSRMGQAPSQSLLPPAQDQPRSPVPSAFSDQSRCLIAQTTPVAGSQS
: :: . .:.. .: . : : ::::.. .: : .
CCDS76 SPVPTTSTTS-APTTSTTSASTASTTSGPGTTP-SPVPTT-----------STTSAPTTR
4350 4360 4370 4380 4390
2480 2490 2500 2510 2520 2530
pF1KA0 LSSGAVATTTSSAGDHNGMLSVPAPGVPHSDVGEPPASTGAQQPSALAALQPAKERRSSS
.:...:.:::. : :.:.: :: ... :.. . .: .. :.
CCDS76 TTSASTASTTSGPG------STPSP-VPTTSTTSAPTTRTTPASTASTTSGPGTTPSPVP
4400 4410 4420 4430 4440
2540 2550 2560 2570 2580 2590
pF1KA0 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGSSSSDSEGSSLPVQPEVALKRVPSPTPAPKEAVRE--
..:..:.:..:. : ..:..:. .: . : . .: . . . .:: . :
CCDS76 TTSTTSASTTSTISLPTTSTTSAPITSMTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSASTAST
4450 4460 4470 4480 4490 4500
2600 2610 2620 2630 2640
pF1KA0 ----GRPPEPTPAKRKRRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS---SSSSSSSSSSSSSSSS
: : :.:. . ..:..:.:..:..:. ..: : ..:..:. ..:..:.
CCDS76 TSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSASTASTTSGPGTSLSPVPTTSTTSAPTTSTTSGP
4510 4520 4530 4540 4550 4560
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KA0 SSSPSPAKPGPQALPKPASPKKPPPGERRSRSPRKPIDSLRDSRSLSYSPVERRRPSPQP
...:::. : .. :.. :: : :
CCDS76 GTTPSPV-PTTSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTPVSKTSTSHLSVSKTTHSQPVT
4570 4580 4590 4600 4610 4620
2710 2720 2730 2740 2750
pF1KA0 SPRDQQSSSSERGSRRGQRGDSRSPSHKRRRETPSPRPMRHRSSRSP
CCDS76 SDCHPLCAWTKWFDVDFPSPGPHGGDKETYNNIIRSGEKICRRPEEITRLQCRAESHPEV
4630 4640 4650 4660 4670 4680
>>CCDS55139.1 MUC12 gene_id:10071|Hs108|chr7 (5335 aa)
initn: 318 init1: 118 opt: 911 Z-score: 339.8 bits: 78.3 E(32554): 1.3e-12
Smith-Waterman score: 1119; 22.4% identity (49.2% similar) in 2739 aa overlap (165-2751:2088-4688)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 LRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREAKQPAPEPPKPYSL-VRESSS-SRSP--TPKQKKK
: ::. . :.::.. ::: :: .
CCDS55 TTLSPASSTSPGLQGESTAFQTHPASTHTTPSPPSTATAPVEESTTYHRSPGSTPTTHFP
2060 2070 2080 2090 2100 2110
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 KKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKSKDKKRKRSRS
.. :. ::.:. . .: ..: .. : . : : . . : . . .
CCDS55 ASSTTSGH-SEKSTIFHSSPDASGTTPSSAHSTTSGRGE-STTSRISPGSTEITTLPGST
2120 2130 2140 2150 2160 2170
260 270 280 290
pF1KA0 TTP-----------APKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALAGRSPSPA
::: .:.: . : .. .. . . ::: ..::.:. . . .:
CCDS55 TTPGLSEASTTFYSSPRSPTTTLSPASMTSLGVGEESTTSRSQPGSTHSTVSPASTTTP-
2180 2190 2200 2210 2220 2230
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SGRRGEGDAPFSE-PGTT-STQRPSSPETATK--QPSSPYEDKDKDKKEKSATRPSPSP-
: :. . .: ::.: .: : .: :... .:.. .... . . :. : .
CCDS55 -GLSEESTTVYSSSPGSTETTVFPRTPTTSVRGEEPTT-FHSRPASTHTTLFTEDSTTSG
2240 2250 2260 2270 2280 2290
360 370 380 390 400
pF1KA0 --ERSSTGPEPPAPTPLLAERHGGSPQPLATTPLSQEPVNPPSEA-------SPTRDRSP
:.:.. : :: : . : : :.:. :..: .. :: . ::.:. .
CCDS55 LTEESTAFPGSPAST------QTGLPATLTTADLGEESTTFPSSSGSTGTTLSPARSTTS
2300 2310 2320 2330 2340
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 ----PKSPEKL-PQSSSSESSPPSPQPTKVSRHASSSPESPKPAPAPGSHREISSSPTSK
..: .: :.:. . . : :: ..:..... ::. : : .:: .:.
CCDS55 GLVGESTPSRLSPSSTETTTLPGSPTTPSLSEKSTTFYTSPRSPDATLSPATTTSSGVSE
2350 2360 2370 2380 2390 2400
470 480 490 500 510
pF1KA0 NRSHGRAKRDKSHSHT-PSRRM--GRSRSPATAKRGRSRSRTPTKRGHSRSRSPQWRRSR
. : .... ..:. . :. : :: .:.. . . . : . . . .:. . .
CCDS55 ESSTSHSQPGSTHTTAFPDSTTTPGLSRHSTTSHSSPGSTDTTLLPASTTTSGPSQESTT
2410 2420 2430 2440 2450 2460
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 SAQRWGRSRSPQRRGRSRSPQRPGWSRSRNTQRRGRSRSARRGRSHSRS-PATRGRSRSR
: . :: : . . :: . . . ... . . : .:. : . :
CCDS55 SHS------SP---GSTDTALSPGSTTALSFGQESTTFHSSPGSTHTTLFPDSTTSSGIV
2470 2480 2490 2500 2510
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 TPARRGRSRSRTPARRRSRSRTPTRRRSRSRTPARRGRSRS--RTPARRRSRTRSPVRRR
. : .: . .: :: : . : .:. .:.: . :: .. :
CCDS55 EASTRVHSSTGSP-------RT-TLSPASSTSPGLQGESTTFQTHPASTHTTPSPP----
2520 2530 2540 2550 2560
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 SRSRSPARRSG---RSRSRTPARRGRSRSRTPARRGRSRSRTPARRSGRSRSRTPARRGR
: . .:...: :: . ::. . . : : :.:.. : . : . . ::.
CCDS55 STATAPVEESTTYHRSPGSTPTTHFPASSTTS---GHSEKSTIFHSSPDASGTTPSS---
2570 2580 2590 2600 2610
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 SRSRTPRRGRSRSRSLVRRGRSHSRTPQRRGRSGSSSERKNKSRTSQRRSRSNSSPEMKK
..: : ::.: . : . : .. : . . :: .. .: : .. ::
CCDS55 AHSTTSGRGES-TTSRISPGSTEITTLPGSTTTPGLSEASTTFYSSPRSPTTTLSPASMT
2620 2630 2640 2650 2660 2670
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 SRISSRRSRSLSSPRSKAKSRLSLRRSLSGSSPCPKQKSQTPPRRSRSGSSQTKAKSRTP
: ...: .. ::. : : : ..: ...: : : ::..: . :.
CCDS55 SLGVGEES---TTSRSQPGSTHSTVSPASTTTPGLSEES-TTVYSSSPGSTETTVFPRST
2680 2690 2700 2710 2720 2730
820 830 840 850 860
pF1KA0 PRRSRSSSSPPPKQKSKTPSRQSHSSSSPHPKVKSGTPPRQGSITSPQANEQSVTP----
:. : .:. : .:.. . .. :: .. .. . :. :. :
CCDS55 TTSVRGE--EPTTFHSRPAS--THTTLFTEDSTTSGLTEESTAFPGSPASTQTGLPATLT
2740 2750 2760 2770 2780 2790
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 -----QRRSCFESSPDPELKSRTPSRHSCSGSSPPRVKSSTPPRQSPSRS-SSPQPKVKA
.. . : :: . .:.: . :: : ::: : ::: . .. : .
CCDS55 TADLGEESTTFPSSSGSTGTTLSPARSTTSGL----VGESTPSRLSPSSTETTTLPGSPT
2800 2810 2820 2830 2840
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 IISPRQRSHSGSSSP-SPSRVTSRTTPRRSRSVSPCSNVESRLLPRYSHSGSSSPDTKVK
: ..: . .:: ::. . : .: : .:: :.. :. : .:. .. ::. .
CCDS55 TPSLSEKSTTFYTSPRSPDATLSPATTTSS-GVSEESST-SHSQPGSTHT-TAFPDSTTT
2850 2860 2870 2880 2890 2900
990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 P--ETPPRQSHSGSISPYPKVKAQTPPGPSLSGSKSPCPQEKSKDSLVQSCPGSLSLCAG
: :::.. : .. . . :: :..: . . :. . : . .. .:
CCDS55 SGLSQEPTASHSSQGSTEATLSPGSTTASSL-GQQSTTFHSSPGDTETTLLPDD-TITSG
2910 2920 2930 2940 2950 2960
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 VKSSTPPGESYFGVSSLQLKGQSQTSPDHRSDTSSPEVRQSHSESPSLQSKSQTSPKGGR
. .. : .: : : :.:: . .... :: :: .: . :: :
CCDS55 LVEASTPTHSSTGSLHTTLTPASSTSAGLQEESTT---FQSW---PS-SSDTTPSPPGTT
2970 2980 2990 3000 3010
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 SRSSSPVTELASRSPIRQDRGEFSASPMLKSGMSPEQSRFQSDSSS-----YPTVDSNSL
. : :: : .:::: : : :.. .:. .. .:: ...:.
CCDS55 AAPVEVSTTYHSR-PSSTPTTHFSASSTTL-GRSEESTTVHSSPGATGTALFPTRSATSV
3020 3030 3040 3050 3060 3070
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA0 L-GQSRLE--TAESKEKMALPPQEDATASPPRQKDKFSPFPVQDRPESSLVFKDTLRTPP
: :. .. : : ::: . .::. ... : : . :...: .: .
CCDS55 LVGEPTTSPISSGSTETTALPGST-TTAGLSEKSTTFYSSPRS--PDTTLSPASTTSSGV
3080 3090 3100 3110 3120
1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 RERSGAGSSPETKEQNSALPTSSQDEELMEVVEKSEEPAGQILSHLS------SELKEMS
:.: .. : . ...:.: :. . . :. :. . :: : : :
CCDS55 SEESTTSHSRPGSTHTTAFPGSTTMPGVSQESTASHSSPGSTDTTLSPGSTTASSLGPES
3130 3140 3150 3160 3170 3180
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 TSNFESSPEVEERPAVSLTLDQSQSQASLEAVEVPSMASSWGGPHFSPEHKELSNSPLRE
:. :.:.: : ..: :.. ... ::: .: . :: :.:: . .. .
CCDS55 TT-FHSGPGSTE---TTLLPDNTTASGLLEA-STP-VHSSTGSPHTTLSPAGSTTRQGES
3190 3200 3210 3220 3230 3240
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 NSFGSPLEFRNSGPLGTEMNTGFSSEVKEDLNGPFLNQLETDPSLDMKEQSTRSSGHSSS
..: : . ... : ...: :.. .: .:: :: .. :.:
CCDS55 TTFQSWPNSKDTTPAPPTTTSAFV-ELSTTSHG--------SPS------STPTTHFSAS
3250 3260 3270 3280
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 ELSPDAVEKAGMSSNQSISSPVLDAVPRTPSRERSSSASSPEMKDGLPRTP-SRRSRSGS
. :. :. :::: :. ::: ::.... : . .: : ..
CCDS55 STTLGRSEE----STTVHSSPV--ATATTPSPARSTTSGLVEESTTYHSSPGSTQTMHFP
3290 3300 3310 3320 3330 3340
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SPGLRDGSGTPSRHSLSGSSPGMKDIPRTPSRGRSECDS-SPEPKALPQTPRPRSRSPSS
.: : : : :... ... : : : : : : . : : : . :.
CCDS55 ESDTTSGRGEESTTSHSSTTHTISSAPSTTSALVEEPTSYHSSPGSTATTHFPDSSTTSG
3350 3360 3370 3380 3390 3400
1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 PELNNKCLTPQRERSGSESSVDQKTVARTPLGQRSRS---GSSQELDVKP--SASP--QE
.. ... .:. . .... . ::. . : ..:.: . : ...: .:
CCDS55 RSEESTASHSSQDATGT-IVLPARSTTSVLLGESTTSPISSGSMETTALPGSTTTPGLSE
3410 3420 3430 3440 3450 3460
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 RSES-DSSPDSKAKTRTPLRQRSRSGSSPEVDSKSRLSPRRSRSGSSPEVKDKPRAAPRA
.: . ::: : : : .: : :: : : .. :. : ... . :. : . :
CCDS55 KSTTFHSSPRSPATTLSPASTTS-SGVSEE-STTSHSRPGSTHTTAFPDSTTTP-GLSRH
3470 3480 3490 3500 3510
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 QSGSDSSPEPKAPAPRALPRRSRSGSSSKGRGPSPEGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRS
.. : :: : . :: . ...::. : .:.::... : : :: :
CCDS55 STTSHSS--PGSTDTTLLPASTTTSGSSQESTTSHSSSGSTDTA--LSPGSTTAL----S
3520 3530 3540 3550 3560 3570
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KA0 SPEPKTKSRTPPRRRSSRSSPELTRKARL---SRRSRSASSSPETRSRTPPRHRRSPSVS
. .: .. : . :. : .. . : : .:...:: :. : ::...
CCDS55 FGQESTTFHSSPGSTHTTLFPDSTTSSGIVEASTRVHSSTGSP--RTTLSPASSTSPGLQ
3580 3590 3600 3610 3620
1740 1750 1760 1770 1780
pF1KA0 SPEPAEKSRSSRRRRSASSPRTKT-----TSRRGRSPSPKPRGL--QRSRSRSRREKTRT
. : ... . . . : : : : .. :::. : : . .. ::.
CCDS55 GESTAFQTHPASTHTTPSPPSTATAPVEESTTYHRSPGSTPTTHFPASSTTSGHSEKSTI
3630 3640 3650 3660 3670 3680
1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA0 TRRR-DRSGSSQSTSRRRQRSRSRSRVTRRRRGGSGY-----HSRSPARQESSRT--SSR
. : ::.. :... .:..: ..: :.. . .:. .:.: : ::
CCDS55 FHSSPDASGTTPSSAHSTTSGRGESTTSRISPGSTEITTLPGSTTTPGLSEASTTFYSSP
3690 3700 3710 3720 3730 3740
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KA0 RRRGRSRTPPT------SRKRSRSRTSPAPWKRSRSRASPATHRRSRSRTPLISRRRSRS
: . .: . ... . ::..:. . . : :: .: :. : . : . .
CCDS55 RSPTTTLSPASMTSLGVGEESTTSRSQPGSTHSTVSPASTTTPGLSEESTTVYSSSPGST
3750 3760 3770 3780 3790 3800
1900 1910 1920 1930 1940
pF1KA0 RTS--PVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSRRRSRSRTPPVTRRRSR-SRTPTTRRRSR
.:. : : : : : .:: .. .. : : .:.. . .:.. . .
CCDS55 ETTVFPRSTTTSVRREEPTTFHSRPASTHTTLFTEDSTTSGLTEESTAFPGSPASTQTGL
3810 3820 3830 3840 3850 3860
1950 1960 1970 1980 1990 2000
pF1KA0 SRTPPVTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTSPITRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSR
: .. .: : : . . .. :: .:: :: .. . . :: :: . . .
CCDS55 PATLTTADLGEESTTFPSSSGSTGTKLSP-----ARSTTSGLVGESTPSRLSPSSTETTT
3870 3880 3890 3900 3910 3920
2010 2020 2030 2040 2050 2060
pF1KA0 SRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSRSRTPLLPRKRSRSRSPLAIRRRSRSRTPRTARGKRS
::.: :.. ..: . ::. . . :: . . :. :.... .
CCDS55 LPGSPTT---------PSLSEKS-TTFYTSPRSPDATLSPATTTSSGVSEESSTSHSQPG
3930 3940 3950 3960 3970
2070 2080 2090 2100 2110 2120
pF1KA0 LTRSPPAIRRRSASGSSSDRSRSATPPATRNHSGS--RTPPVALNSSRMSCFSRPSMSPT
:.. ..:: :.. . : . .. . . : : .:... . : :. . :
CCDS55 STHTTAFPDSTTTSGLSQEPTTSHSSQGSTEATLSPGSTTASSLGQQSTTFHSSPGDTET
3980 3990 4000 4010 4020 4030
2130 2140 2150 2160 2170 2180
pF1KA0 PL--DRCRSPGMLE---PLGSSRTPMSVLQQAGGSMMDGPGPRIPDHQRTSVPENHAQSR
: : . :..: : :: . . ..: : . : . . :
CCDS55 TLLPDDTITSGLVEASTPTHSSTGSLHTTLTPASSTSTGLQEESTTFQSWPSSSDTTPSP
4040 4050 4060 4070 4080 4090
2190 2200 2210 2220 2230
pF1KA0 IALALTAISLGTARP--PPSMSAAGLAARMSQVPAPVPLMSLRTAPAANLASRIPAASAA
. . . . ..:. : : .. ..: . . .....:.:. .. .:. ::.
CCDS55 PSTTAVPVEVSTTYHSRPSSTPTTHFSASSTTLGRSEESTTVHSSPGATGTALFPTRSAT
4100 4110 4120 4130 4140 4150
2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA0 A----------MNLASARTPAIPTAVNLADSRTPAAAAAMNLASPRTAVAPSAVNLADPR
. .. .:..: :.: ... : ... . :: :...:.... .
CCDS55 SVLVGEPTTSPISSGSTETTALPGSTTTAGLSEKSTTFYSSPRSPDTTLSPASTTSSGVS
4160 4170 4180 4190 4200 4210
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA0 TPTAPAVNLAGA-RTPAALAALSLTGSGTPPTAANY-PSSSRTPQAPAS--ANLVGPRSA
.. . . :. .: : .. .. : . ::.. :.:. : .:.: :. .::.:.
CCDS55 EESTTSHSRPGSMHTTAFPSSTTMPGVSQESTASHSSPGSTDTTLSPGSTTASSLGPEST
4220 4230 4240 4250 4260 4270
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KA0 -HATAPVNIAGSRTAAALAPASLTSARMAPALSGANLT--SPRVPLS-AYERVSGRTSPP
..: :: : ..: : . :.. . : . .. . ::.. :: : . :
CCDS55 TFHSSP----GS-TETTLLPDNTTASGLLEASTPVHSSTGSPHTTLSPAGSTTRQGESTT
4280 4290 4300 4310 4320
2410 2420 2430 2440 2450
pF1KA0 LLDRARSR-TPPSAPSQSRMTSERAPSPSSRMGQAPSQSLLPPAQDQPRSPVPSAFSDQS
. . :. : :. :. . : . . . ...:. . . :: .. .:
CCDS55 FQSWPNSKDTTPAPPTTTSAFVELSTTSHGSPSSTPTTHFSASSTTLGRSEESTTV--HS
4330 4340 4350 4360 4370 4380
2460 2470 2480 2490 2500 2510
pF1KA0 RCLIAQTTPVAGSQSLSSGAVATTT---SSAGDHNGMLSVPAPGVPHSDVGEPPAS----
. . ::: . ..: .:: : .: :: :. . : : .. : :: ..
CCDS55 SPVATATTP-SPARSTTSGLVEESTTYHSSPGSTQTM-HFPESNTT-SGRGEESTTSHSS
4390 4400 4410 4420 4430 4440
2520 2530 2540 2550 2560
pF1KA0 ---TGAQQPSALAAL--QPAKERRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGSSSSDSEGS-
: .. ::. .:: .:.. . : .:.... .::..:. : :... ::.:. :.
CCDS55 TTHTISSAPSTTSALVEEPTSYHSSPGSTATTHFPDSSTTSGRSEESTASHSSQDATGTI
4450 4460 4470 4480 4490 4500
2570 2580 2590 2600 2610 2620
pF1KA0 SLPVQPEVALKRVPSPTPAPKEAVREGR--PPEPTPAKRKRRSSSSSSSSSSSSSSSSSS
::.. ... : : . . : : : ...:.. :: ::. .. :.
CCDS55 VLPARSTTSVLLGESTTSPISSGSMETTALPGSTTTPGLSEKSTTFHSSPSSTPTTHFSA
4510 4520 4530 4540 4550 4560
2630 2640 2650 2660 2670 2680
pF1KA0 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPSPAKPGPQALPKPASPKKPPPGERRSRS-PRKPID
::.. . : :.. :: .....::::. ..: . .. . :: .. :..
CCDS55 SSTTLGRSEESTTVHSSPVATATTPSPARSTTSGLVEESTAYHSSPGSTQTMHFPESSTA
4570 4580 4590 4600 4610 4620
2690 2700 2710 2720 2730 2740
pF1KA0 SLRDSRS-LSYSPVERRRPSPQPSPRDQQSSSSERGSRRGQRGDSRSPSHKRRRETPSPR
: :. .: :.: . . :: :: :. :. . . : . .: . : : :
CCDS55 SGRSEESRTSHSSTTHTISSP-PST---TSALVEEPTSYHSSPGSIATTHFPESSTTSGR
4630 4640 4650 4660 4670
2750
pF1KA0 PMRHRSSRSP
. .:.:
CCDS55 SEESTASHSSPDTNGITPLPAHFTTSGRIAESTTFYISPGSMETTLASTATTPGLSAKST
4680 4690 4700 4710 4720 4730
>>CCDS46095.1 SRRM5 gene_id:100170229|Hs108|chr19 (715 aa)
initn: 933 init1: 360 opt: 824 Z-score: 322.0 bits: 72.1 E(32554): 1.3e-11
Smith-Waterman score: 921; 34.2% identity (55.9% similar) in 728 aa overlap (1451-2159:7-682)
1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA0 SASSPEMKDGLPRTPSRRSRSGSSPGLRDGSGTPSRHSL--SGSSPGMKDIPRTPSRGRS
:. :: :: :::: : :. :. .:
CCDS46 MSSPKRSSKPS-MSLAPSGSSMPTAD-PKPPASLKS
10 20 30
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA0 ECDSSPEPKALPQTP---RPRSRSPSSPELNNKCLTPQRERSGSESSVDQ-KTVARTPLG
...:. . .: : : :::: . ..: . .: :. :: .. .. ::::
CCDS46 TKSATPNRSLVPTKPATSRNSVMSPSSSK-STKSTSTKRAPSNRPSSRSRVRSKARTP--
40 50 60 70 80 90
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA0 QRSRSGSSQELDVKPSASPQERSESDSSPDSKAKTRTPLRQRSRSGSSPEVDSKSRLS-P
:: :.. : : . . : .. . :.. ::: :. :::.. : :: : :
CCDS46 --SRV-STDTRTSKASKASDVRCHQRRGTHSRG--RTPGRRGSRSSKR----SPSRASTP
100 110 120 130 140
1600 1610 1620 1630 1640
pF1KA0 RRSRS-GSSPEVKDKPRAAPRAQSGSDSSPEPKAPAPRALPRRSRSGSSSKG---RGPSP
: :. :. : . .. :. :.:: .. . ::. : :: :. .. .. :
CCDS46 GRIRTHGARPGMASRVRTPTSQQKGSRGKSYGR---PRT-SNRERSDSQPRNLSKKSYRP
150 160 170 180 190
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KA0 EGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRSSPEPKTKSRTPPRRRSSRSSPELTRKARLSRRSRS
:.:. : : ::. . .. : :: .: : :: .. ... ::
CCDS46 PGGSGIGRSSELAVTPSTAKCQTPTGIPSKEKSDNP----SPSSSRKVKSYGQMIIPSRE
200 210 220 230 240 250
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KA0 ASSSPETRSRTPPRHRRSPSVSSPEPAEKSRSSRRRRSASSPRTKTTSRRGRSPSPKPRG
: :: : . .. . : :. .::: :: ::.:. ::.. : :: : : :.
CCDS46 KSYSPTEMSSRVKSYNQASTRSRPQSHSQSRSPRRSRSGSQKRTHS---RVRSHSWK-RN
260 270 280 290 300 310
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KA0 LQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRRRQRSRSRSRVTRRRRGGSGYHSRSPARQE
.:.:::.:. :. ::: :. . .:...::. :: : : ::.:....
CCDS46 HSRARSRTRKGILSQMGRH-----SQSRSHSKGKSQNQSRTPRR--GRSHNWSRNPSKER
320 330 340 350 360
1830 1840 1850 1860 1870 1880
pF1KA0 S---SRTSSRRRRGRSRTPPTSRKRSRSRTSPAPWKR---SRSRASPATHRRSRSRTPLI
: ::.::..: :. . : ::.: : .: :. ::::. .. :::::.:
CCDS46 SHSHSRSSSKERDHRGSSSP--RKESGRSQSGSPNKQRDHSRSRSPNKARDRSRSRSPYK
370 380 390 400 410 420
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KA0 SRRRSRSRTSPVSRRRSRSRTSV-TRRRSRSRASPVSRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTPTT
.: :::::. .: ::::. .: :::::. .: .::::.: .: :::::.:.
CCDS46 ARDRSRSRSPNKARDCSRSRSPYKARDRSRSRSPNKARDHSRSRSPNKARDRSRSRSPSK
430 440 450 460 470 480
1950 1960 1970 1980 1990 2000
pF1KA0 RR-RSRSRTPPVTRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTSPITRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSPV
.: .:. .: : . :::.: :. .::.: : . :::. :.: .::.
CCDS46 ERDHSQLGSPSKERDHRRSRSPSKERQCRQSRSSSKERDHRRSRSPSKERQRRQSRSPNK
490 500 510 520 530 540
2010 2020 2030 2040 2050 2060
pF1KA0 TRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSRSRTPLLPRKRSRSRSPLAIRRRSRSRTPRT
: ::.::. :.. .::.: : : : :.: :.: .::: : .::::.:
CCDS46 ERDRSQSRSPSEEREHRQSRSPSKERDRRRWRSPSKERERRQSRSSSEERDHSRSRSPNK
550 560 570 580 590 600
2070 2080 2090 2100 2110 2120
pF1KA0 ARGKRSLTRSPPAIRRRSASGSSSDRSRSATPPATRNHSGSRTPPVALNSSRMSCFSRPS
: : ::.. . .::: :: ::: ::: ::. : :. .
CCDS46 QSG----------YSRPRASSKEKAHSRSRTPSKEGNHSQSRT------SSKESDPSQST
610 620 630 640
2130 2140 2150 2160 2170 2180
pF1KA0 MSPTPLDRCRSPGMLEPLGSSRTPMSVLQQAGGSMMDGPGPRIPDHQRTSVPENHAQSRI
. .: : ::: :...::: .. ... ... .:
CCDS46 VPRSP-DWKRSPTRTSSLSQNRTPSKTSSHSPSTFPSGGQTLSQDDSQADATTSKATLPG
650 660 670 680 690 700
2190 2200 2210 2220 2230 2240
pF1KA0 ALALTAISLGTARPPPSMSAAGLAARMSQVPAPVPLMSLRTAPAANLASRIPAASAAAMN
CCDS46 ERSSSSSSKLA
710
2752 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:20:24 2016 done: Thu Nov 3 09:20:26 2016
Total Scan time: 10.430 Total Display time: 1.220
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]