Result of FASTA (omim) for
pF1KA0309
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0309, 3049 aa
1>>>pF1KA0309 3049 - 3049 aa - 3049 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.4589+/-0.0005; mu= -29.2669+/- 0.031
mean_var=825.1155+/-170.774, 0's: 0 Z-trim(124.8): 449 B-trim: 0 in 0/62
Lambda= 0.044650
statistics sampled from 46527 (47065) to 46527 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.785), E-opt: 0.2 (0.552), width: 16
Scan time: 27.910
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006653 (OMIM: 136140,611421) helicase SRCAP [Ho (3230) 12906 849.1 0
NP_056224 (OMIM: 606265) E1A-binding protein p400 (3123) 1623 122.3 1.3e-25
XP_011519987 (OMIM: 610169) PREDICTED: DNA helicas (1209) 957 79.1 5e-13
NP_003592 (OMIM: 603375) SWI/SNF-related matrix-as (1052) 919 76.6 2.5e-12
XP_016885240 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1036) 916 76.4 2.8e-12
XP_016885239 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1042) 916 76.4 2.8e-12
XP_006724845 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1042) 916 76.4 2.8e-12
XP_005262519 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1048) 916 76.4 2.8e-12
XP_005262518 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1054) 916 76.4 2.8e-12
NP_003060 (OMIM: 300012) probable global transcrip (1054) 916 76.4 2.8e-12
NP_001269804 (OMIM: 300012) probable global transc (1058) 916 76.4 2.8e-12
NP_001269803 (OMIM: 300012) probable global transc (1070) 916 76.4 2.8e-12
NP_620614 (OMIM: 600014,601358) probable global tr (1572) 848 72.1 8e-11
NP_001276325 (OMIM: 600014,601358) probable global (1590) 848 72.1 8.1e-11
NP_003061 (OMIM: 600014,601358) probable global tr (1590) 848 72.1 8.1e-11
NP_001122320 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1613) 822 70.4 2.6e-10
XP_016882657 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1613) 822 70.4 2.6e-10
XP_016882656 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1614) 822 70.4 2.6e-10
NP_001122319 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1614) 822 70.4 2.6e-10
XP_016882655 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1616) 822 70.4 2.6e-10
NP_001122318 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1616) 822 70.4 2.6e-10
XP_016882654 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1617) 822 70.4 2.6e-10
NP_001122317 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1617) 822 70.4 2.6e-10
XP_016882653 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1645) 822 70.5 2.6e-10
XP_016882651 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1646) 822 70.5 2.6e-10
XP_016882652 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1646) 822 70.5 2.6e-10
NP_003063 (OMIM: 603254,613325,614609) transcripti (1647) 822 70.5 2.6e-10
NP_001122316 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1647) 822 70.5 2.6e-10
XP_016882650 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1650) 822 70.5 2.6e-10
XP_016882649 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1678) 822 70.5 2.7e-10
XP_006722909 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 822 70.5 2.7e-10
XP_011526500 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 822 70.5 2.7e-10
NP_001122321 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1679) 822 70.5 2.7e-10
XP_006722908 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 822 70.5 2.7e-10
XP_011519988 (OMIM: 610169) PREDICTED: DNA helicas ( 906) 692 61.9 5.5e-08
NP_060023 (OMIM: 610169) DNA helicase INO80 [Homo (1556) 692 62.1 8.4e-08
NP_004275 (OMIM: 613039) chromodomain-helicase-DNA ( 897) 659 59.8 2.4e-07
XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2078) 658 60.0 4.8e-07
XP_006719475 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 658 60.0 4.8e-07
XP_006719476 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 658 60.0 4.8e-07
XP_006719477 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 658 60.0 4.8e-07
NP_001290161 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 (1361) 622 57.5 1.7e-06
NP_001121182 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 (1270) 601 56.1 4.2e-06
XP_016855492 (OMIM: 208250,604283) PREDICTED: prot (1270) 601 56.1 4.2e-06
XP_016855491 (OMIM: 208250,604283) PREDICTED: prot (1311) 601 56.1 4.3e-06
NP_001121181 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 (1311) 601 56.1 4.3e-06
NP_001121180 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 (1363) 601 56.2 4.4e-06
NP_005798 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 iso (1404) 601 56.2 4.5e-06
XP_016858347 (OMIM: 613039) PREDICTED: chromodomai ( 825) 591 55.4 4.7e-06
XP_016858348 (OMIM: 613039) PREDICTED: chromodomai ( 825) 591 55.4 4.7e-06
>>NP_006653 (OMIM: 136140,611421) helicase SRCAP [Homo s (3230 aa)
initn: 20042 init1: 12890 opt: 12906 Z-score: 4508.7 bits: 849.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 19181; 94.8% identity (94.9% similar) in 3081 aa overlap (127-3049:150-3230)
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 SLKRLPKVPEPPRPKGHWDYLCEEMQWLSADFAQERRWKRGVARKVVRMVIRHHEEQRQK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SLKRLPKVPEPPRPKGHWDYLCEEMQWLSADFAQERRWKRGVARKVVRMVIRHHEEQRQK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 EERARREEQAKLRRIASTMAKDVRQFWSNVEKVVQFKQQSRLEEKRKKALDLHLDFIVGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EERARREEQAKLRRIASTMAKDVRQFWSNVEKVVQFKQQSRLEEKRKKALDLHLDFIVGQ
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 TEKYSDLLSQSLNQPLTSSKAGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEDEEEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TEKYSDLLSQSLNQPLTSSKAGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEDEEEDD
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 EETIEVEEQQEGNDAEAQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSSPSQTPSSHDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EETIEVEEQQEGNDAEAQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSSPSQTPSSHDS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 DTRDGPEEGAEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEEEAEDEEDTIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DTRDGPEEGAEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEEEAEDEEDTIAA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 EEQLEGEVDHAMELSELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EEQLEGEVDHAMELSELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 EGPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSASEESESEESEDAQSQSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EGPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSASEESESEESEDAQSQSQ
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ADEEEEDDDFGVEYLLARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ADEEEEDDDFGVEYLLARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGY
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 TLATTQVKTPIPLLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TLATTQVKTPIPLLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAH
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 LACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFH
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 VCITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VCITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQ
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 NSLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NSLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLR
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 RVKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RVKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRK
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 VCNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VCNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYE
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 ADTFLPRHRLSRRVLLEVATAPDPPPRPKPVKMKVNRMLQPVPKQEGRTVVVVNNPRAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ADTFLPRHRLSRRVLLEVATAPDPPPRPKPVKMKVNRMLQPVPKQEGRTVVVVNNPRAPL
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 GPVPVRPPPGPELSAQPTPGPVPQVLPASLMVSASPAGPPLIPASRPPGPVLLPPLQPNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GPVPVRPPPGPELSAQPTPGPVPQVLPASLMVSASPAGPPLIPASRPPGPVLLPPLQPNS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1060
pF1KA0 GSLPQ-------------------------------------------------------
:::::
NP_006 GSLPQVLPSPLGVLSGTSRPPTPTLSLKPTPPAPVRLSPAPPPGSSSLLKPLTVPPGYTF
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1070 1080
pF1KA0 -----------------------------------------AGEVVSIGQLASLAQRPVA
.::::::::::::::::::
NP_006 PPAAATTTSTTTATATTTAVPAPTPAPQRLILSPDMQARLPSGEVVSIGQLASLAQRPVA
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1090 1100 1110
pF1KA0 NAGGSKPLTFQIQGNKLTLTGAQVRQLAVGQPRPLQ------------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NAGGSKPLTFQIQGNKLTLTGAQVRQLAVGQPRPLQRNVVHLVSAGGQHHLISQPAHVAL
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1120 1130
pF1KA0 --------------------------------------MPPTMVNNTGVVKIVVRQAPRD
.:::::::::::::::::::::
NP_006 IQAVAPTPGPTPVSVLPSSTPSTTPAPTGLSLPLAANQVPPTMVNNTGVVKIVVRQAPRD
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 GLTPVPPLAPAPRPPSSGLPAVLNPRPTLTPGRLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GLTPVPPLAPAPRPPSSGLPAVLNPRPTLTPGRLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVH
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 SPSPEVSASAPGAAPLTISSPLHVPSSLPGPASSPMPIPNSSPLASPVSSTVSVPLSSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SPSPEVSASAPGAAPLTISSPLHVPSSLPGPASSPMPIPNSSPLASPVSSTVSVPLSSSL
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 PISVPTTLPAPASAPLTIPISAPLTVSASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PISVPTTLPAPASAPLTIPISAPLTVSASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGAS
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 PSASALTLGLATAPSLSSSQTPGHPLLLAPTSSHVPGLNSTVAPACSPVLVPASALASPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PSASALTLGLATAPSLSSSQTPGHPLLLAPTSSHVPGLNSTVAPACSPVLVPASALASPF
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA0 PSAPNPAPAQASLLAPASSASQALATPLAPMAAPQTAILAPSPAPPLAPLPVLAPSPGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PSAPNPAPAQASLLAPASSASQALATPLAPMAAPQTAILAPSPAPPLAPLPVLAPSPGAA
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 PVLASSQTPVPVMAPSSTPGTSLASASPVPAPTPVLAPSSTQTMLPAPVPSPLPSPASTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PVLASSQTPVPVMAPSSTPGTSLASASPVPAPTPVLAPSSTQTMLPAPVPSPLPSPASTQ
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 TLALAPALAPTLGGSSPSQTLSLGTGNPQGPFPTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TLALAPALAPTLGGSSPSQTLSLGTGNPQGPFPTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPP
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 LGPTQTLSLAPAPPLAPASPVGPAPAHTLTLAPASSSASLLAPASVQTLTLSPAPVPTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LGPTQTLSLAPAPPLAPASPVGPAPAHTLTLAPASSSASLLAPASVQTLTLSPAPVPTLG
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 PAAAQTLALAPASTQSPASQASSLVVSASGAAPLPVTMVSRLPVSKDEPDTLTLRSGPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PAAAQTLALAPASTQSPASQASSLVVSASGAAPLPVTMVSRLPVSKDEPDTLTLRSGPPS
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KA0 PPSTATSFGGPRPRRQPPPPPRSPFYLDSLEEKRKRQRSERLERIFQLSEAHGALAPVYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PPSTATSFGGPRPRRQPPPPPRSPFYLDSLEEKRKRQRSERLERIFQLSEAHGALAPVYG
1860 1870 1880 1890 1900 1910
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KA0 TEVLDFCTLPQPVASPIGPRSPGPSHPTFWTYTEAAHRAVLFPQQRLDQLSEIIERFIFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TEVLDFCTLPQPVASPIGPRSPGPSHPTFWTYTEAAHRAVLFPQQRLDQLSEIIERFIFV
1920 1930 1940 1950 1960 1970
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KA0 MPPVEAPPPSLHACHPPPWLAPRQAAFQEQLASELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRLIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MPPVEAPPPSLHACHPPPWLAPRQAAFQEQLASELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRLIQ
1980 1990 2000 2010 2020 2030
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KA0 YDCGKLQTLAVLLRQLKAEGHRVLIFTQMTRMLDVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YDCGKLQTLAVLLRQLKAEGHRVLIFTQMTRMLDVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQ
2040 2050 2060 2070 2080 2090
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KA0 ALMERFNADKRIFCFILSTRSGGVGVNLTGADTVVFYDSDWNPTMDAQAQDRCHRIGQTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ALMERFNADKRIFCFILSTRSGGVGVNLTGADTVVFYDSDWNPTMDAQAQDRCHRIGQTR
2100 2110 2120 2130 2140 2150
1980 1990 2000 2010 2020 2030
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DVHIYRLISERTVEENILKKANQKRMLGDMAIEGGNFTTAYFKQQTIRELFDMPLEEPSS
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2040 2050 2060 2070 2080 2090
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SSVPSAPEEEEETVASKQTHILEQALCRAEDEEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EEEGDGTPRRRPGPRRLVGTTNQGDQRILRSSAPPSLAGPAVSHRGRKAKT
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>--
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Smith-Waterman score: 876; 100.0% identity (100.0% similar) in 126 aa overlap (1-126:24-149)
10 20 30
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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40 50 60 70 80 90
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PGPPDGATVPLEGFSLSQAADLANKGPKWEKSHAEIAEQAKHEAEIETRIAELRKEGFWS
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:::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LKRLPKVPEPPRPKGHWDYLCEEMQWLSADFAQERRWKRGVARKVVRMVIRHHEEQRQKE
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Smith-Waterman score: 2501; 27.1% identity (48.4% similar) in 3030 aa overlap (6-2968:663-2924)
10 20 30
pF1KA0 MTGSNPVSPASSSSPASSGAGGISPQHIAQDSSLD
:.: .:: .:.:... : :: :..: ..
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: . . : :. . . . .:. .: .: . ..:. ..:: : ... ::
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pF1KA0 AELRKEGFWSLKRLPKVPEPPRPKGHWDYLCEEMQWLSADFAQERRWKRGVARKVVRMVI
::::: :.:: .::::. : ::::.::::: :::::...::::::::: ..:.:.:: :.
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:::::.. .:::...:::..:::::.. :.... ::::.:.::..: . .:::::::::.
NP_056 RHHEEKQLREERGKKEEQSRLRRIAASTAREIECFWSNIEQVVEIKLRVELEEKRKKALN
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pF1KA0 LHLDFIVGQTEKYSDLLSQSLNQPLTSSKAGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQ
: .: :
NP_056 L---------QKVS----------------------------------------------
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pF1KA0 PQEDEEEDDEETIEVEEQQEGNDAEAQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSSP
:: :: : .: :.:
NP_056 ---------------------------RRGKEL-RPKGFDALQE----------------
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pF1KA0 SQTPSSHDSDTRDGPEEGAEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEEEA
:: :: ... :... .. ...:.
NP_056 ----SSLDS-------------------------GMSGRKRKA--------SISLTDDEV
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pF1KA0 EDEEDTIAAEEQLEGEVDHAMELSELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEV
.:::.:: :: :: ::: :::.::.:.:: . .:.. : ::. :.:
NP_056 DDEEETIEEEEANEGVVDHQTELSNLAKEAELPLLDLMKLYEGAFLPSS-----------
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pF1KA0 DANSSDCEPEGPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSASEESESEE
. : :. :. :.::: ::
NP_056 ---------QWPR-----PKPDG---------------------EDTSG---------EE
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pF1KA0 SEDAQSQSQADEEEEDDDFGVEYLLARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAA
. : . .:.: . : .. :. :. .. . : :. :.:.:..:.
NP_056 DAD---DCPGDRESRKDLVLIDSLFIMDQFKAAERMNIGKPNA--------KDIADVTAV
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pF1KA0 AESLQPKGYTLATTQVKTPIPLLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKT
::.. ::: . .::.:: : :: : ::.::.::::::. .:.:.:::::::: :::::
NP_056 AEAILPKGSARVTTSVKFNAPSLLYGALRDYQKIGLDWLAKLYRKNLNGILADEAGLGKT
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pF1KA0 IQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQ
.: :...:::::..:::::::..: . .:.::.:::::::..:::.: :...: : :::
NP_056 VQIIAFFAHLACNEGNWGPHLVVVRSCNILKWELELKRWCPGLKILSYIGSHRELKAKRQ
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pF1KA0 GWTKPNAFHVCITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRR
:..::.:::::::: .. :: : :. :..:: : .:.. ..:.......::.:
NP_056 EWAEPNSFHVCITSYTQFFRGLTAFTRVRWKCLVIDEMQRVKGMTERHWEAVFTLQSQQR
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pF1KA0 LLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLH
::: .::.:...:::...:::.: . . ..:.:: . : ::.: . .: :::
NP_056 LLLIDSPLHNTFLELWTMVHFLVPGI------SRPYLSSPLRAPSEESQDYYHKVVIRLH
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pF1KA0 KVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGHFMSV
.: .::.:::.: :::::. ::::::..::::.::. ::.: . : :.:.: .:::..:
NP_056 RVTQPFILRRTKRDVEKQLTKKYEHVLKCRLSNRQKALYEDVILQPGTQEALKSGHFVNV
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pF1KA0 INILMQLRKVCNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIG
..::..:...::::.: .:: : ... . . .:::.:.: . .. :.. :::::
NP_056 LSILVRLQRICNHPGLVEPRHPGSSYVAGPLEYPSASLILKALERDFWKEADLSMFDLIG
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::....:.::. .: .... :... :..:. : :: .:.:..:..::: : :::
NP_056 LENKITRHEAE-LLSKKKIPRKLMEEISTSAAPAARPAAAKLKASRLFQPVQYGQKPEGR
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pF1KA0 TVVVVNNPRAPLGPVPVRPPPGPELSAQPTPGPVPQVLPASLMVSASPAGPPLIPASRPP
::. : :: .: :: . ::.: :: .:::
NP_056 TVA-----------FPSTHPPR---TAAPTTA------------SAAPQGP---LRGRPP
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pF1KA0 GPVLLPPLQPNSGSLPQAGEVVSIGQLASLAQRPVANAGGSKPLTFQIQGNKLTLTGAQV
.:... : :.:...
NP_056 --------------------------IATFSANPEAKAAAA-------------------
1480
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pF1KA0 RQLAVGQPRPLQMPPTMVNNTGVVKIVVRQAPRDGLTPVPPLAPAPRPPSSGLPAVLNPR
:.: . :: : :::
NP_056 ---------PFQ---------------TSQAS----------ASAPR-------------
1490
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pF1KA0 PTLTPGRLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVHSPSPEVSASAPGAAPLTISSPLHVPS
:.:. :::. : .:: :
NP_056 ---------------------------------HQPA---SASS------TAASPAH---
1500 1510
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pF1KA0 SLPGPASSPMPIPNSSPLASPVSSTVSVPLSSSLPISVPTTLPAPASAPLTIPISAPLTV
::. . : :.
NP_056 ----PAK----------------------------------------------LRAQTTA
1520
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pF1KA0 SASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGASPSASALTLGLATAPSLSSSQTPGHPL
.:: :. :: : : :.:.:
NP_056 QASTPG-----QPP--------PQP----------------------------QAPSH--
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pF1KA0 LLAPTSSHVPGLNSTVAPACSPVLVPASALASPFPSAPNPAPAQASLLAPASSASQALAT
: .: .: . ...:..: : .::. ::
NP_056 --AAGQSALP----------QRLVLPSQAQAR-LPSGEVVKIAQ----------------
1550 1560 1570
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:: ...::. . : :: :. .:. :: . . : . :. :
NP_056 -LASITGPQSRVAQPET-------PVTLQFQGSKFTLSHSQLRQLTAGQPLQLQGSVLQI
1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KA0 ASPVPAPTPVLAPSSTQTMLPAPVPSPLPSPASTQTLALAPALAPTLGGSSPSQTLSLGT
.: ::. : .: :: .:. ::.. : :. .:: :.:
NP_056 VS---------APG--QPYLRAP------GPVVMQTVSQAGAVHGALG-SKP--------
1630 1640 1650
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pF1KA0 GNPQGPFPTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPPLGPTQTLSLAPAPPLAPASPVGPAP
: : :.:: ::.: ::
NP_056 --PAGG---------------PSPA-----------------------PLTPQ--VG---
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:: : .:...::..
NP_056 ------------------------------VP--GRVAVNALAVG---------------
1680
1650 1660 1670 1680 1690 1700
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:: : : : :: .:::
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.:.. : .:::..:. ..: . . ::::: ..: .:.:: : .: : :
NP_056 -----QEEKTRLLKERLDQIYLVNERRCSQAPVYGRDLLRICALPSHGRVQWRGSLDGRR
1710 1720 1730 1740 1750
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. ::.: .. . .:. . .: . ..:...:.: ::.::: : ::::.. .:::
NP_056 GKEAGPAH-SYTSSSESPSELMLTLCRCGESLQDVIDRVAFVIPPVVAAPPSLRVPRPPP
1760 1770 1780 1790 1800 1810
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pF1KA0 WLAPRQAAFQEQLASELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRLIQYDCGKLQTLAVLLRQLKA
. :. ... : . : . :.. . :::.:::.:.: :::..::.::..::.
NP_056 LYSHRMRILRQGLREHAAPYFQQLRQTTAPRLLQFPELRLVQFDSGKLEALAILLQKLKS
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::.::::..:: :::.::.::..: :.:.: .. :::: ::. :: :.:::: :::
NP_056 EGRRVLILSQMILMLDILEMFLNFHYLTYVRIDENASSEQRQELMRSFNRDRRIFCAILS
1880 1890 1900 1910 1920 1930
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:.: .:.::. ::::::::.: ::.:::.::. : :::. .:.:::::.: ..::..:
NP_056 THSRTTGINLVEADTVVFYDNDLNPVMDAKAQEWCDRIGRCKDIHIYRLVSGNSIEEKLL
1940 1950 1960 1970 1980 1990
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pF1KA0 KKANQKRMLGDMAIEGGNFTTAYFKQQTIRELFDM--PLEE---PSSSS---VPSAPEEE
:... : .. ..: .:.... :.. :.::.:::.. :... : .. : :
NP_056 KNGT-KDLIREVAAQGNDYSMAFLTQRTIQELFEVYSPMDDAGFPVKAEEFVVLSQEPSV
2000 2010 2020 2030 2040 2050
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pF1KA0 EETVASKQTHILEQALCRAED-EEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPAGEGEEAGRP
::.: : .. . .:: : ::: . ..: . : ......:
NP_056 TETIAPKIARPFIEALKSIEYLEEDAQKSAQEGVLGPHTDALSSDSENMPC---------
2060 2070 2080 2090 2100
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pF1KA0 GAEDEEMSRAEQEIAALVEQLTPIERYAMKFLEASLEEVSREELKQAEEQVEAARKDLD-
::: :. : :.: ..:::::::.::...:: . .:. ...:. : .: . .
NP_056 ---DEEPSQLE-ELADFMEQLTPIEKYALNYLELFHTSIEQEKERNSEDAVMTAVRAWEF
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: .: .:: ::: : :.. : . . : :
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. : . . :. .:: : . :. : : . :. :.
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:.:: : : ..:. .: .. . . . . : : :. . : :.
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:.. . :: . .. :.. .... : . :. .: .... : . .:
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. ..: :. :. . . ....: . : : .. .. :.. .:
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.. . .. . ..:: :.. :.:: :. .:.... : ..
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.: :. :: : : :.: ::.. . .. :. ::: :: .
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.. : . . . . : :...... :. .::.. : . ..::
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:.: :: .:. .: : . ::..: : .. : : :
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:. ::: : .:. . . :.:. : . . :. : : :. ::
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:. :. ..:.. . . . .. .. . ..... : . . .:
NP_056 QATGVQLPGKTITPAHFQLLRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQTTTTSQVQVP
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. :. : : . :.: ::. :: :. .. : ...: :
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. :: :. . . . . :: . :.. : . :.. : : ...
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:. . :. :::::. . :. :: . :... . :.: :: : ..:
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..:.::. .... : : .. :.:. ::
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:..::...::. .:::::::::::::.:.:.:::::: ... ::: ::: :.:.. ::
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. :.:..::. :: .:.. .. . : . :..:..::.:::::::.::
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. . . :::
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:.::::::... .. :::...:: :.. :: :.::: :... . : ...:
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. :. . ::.:::.........:.. :::::..:::. ::: ::. . . .:..
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:::::::::::.: :::::..::.: ::.: .: ::. :. :.:. ::.::
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: :::::::::.:.::::..: : : : ::: :: : .: . .. . :
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..:::::::: :::: ::: :. :
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: : ...:. : .. ... :...: ... .. .. :::...: .
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:: . : :.: .. ::. .:....:.. :.. . : :.. : .:
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.:: ..: . : .: . . ... :: :. .: .. : . : . . :..
NP_003 KIA-FTEWIEPPKRE--RKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPR
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..... . . .. . .::.: . . . . .::. .. :.:: . : .
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: ..: ::.:: ::.::...::. .:::::::::::::.:::.::..: .
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:..:......:.. .::::..:::. ::: ::. . . .:.: :::::::::::.: :
XP_016 YEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHE
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:::..: : : : ::: :: : .. . ..: ..:.. : ..:::::::: :
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::: ::: :. :
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. ::. .: :: .:: .: :::::.::::
XP_016 MQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTR
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