FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0308, 2012 aa
1>>>pF1KA0308 2012 - 2012 aa - 2012 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5957+/-0.00122; mu= 0.5719+/- 0.074
mean_var=272.6237+/-57.071, 0's: 0 Z-trim(109.6): 98 B-trim: 179 in 1/53
Lambda= 0.077677
statistics sampled from 10880 (10974) to 10880 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 5.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 13244 1499.5 0
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 9601 1091.3 0
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 4742 546.8 5e-154
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 4722 544.5 1.9e-153
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 4722 544.5 2.1e-153
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 4418 510.4 3.9e-143
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905) 1464 179.3 1.3e-43
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912) 1464 179.3 1.3e-43
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 1449 177.6 4.3e-43
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 1449 177.6 4.4e-43
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 1449 177.6 4.5e-43
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1 (1954) 1441 176.7 8.1e-43
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054) 1014 128.7 1.2e-28
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1070) 1014 128.7 1.2e-28
CCDS83299.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 ( 948) 988 125.8 8.5e-28
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 908 116.9 6.4e-25
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 908 116.9 6.5e-25
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 886 114.5 3.6e-24
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 886 114.5 3.6e-24
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 886 114.5 3.6e-24
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 886 114.5 3.6e-24
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 882 114.0 5e-24
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514) 779 102.5 1.4e-20
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1493) 722 96.1 1.2e-18
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 705 94.2 5.1e-18
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 694 93.0 1.1e-17
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 677 91.0 2.9e-17
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 654 88.4 1.7e-16
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 700) 591 81.2 1.6e-14
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 714) 591 81.2 1.7e-14
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 740) 591 81.2 1.7e-14
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 838) 591 81.3 1.9e-14
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 884) 591 81.3 2e-14
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 616) 564 78.2 1.2e-13
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 693) 564 78.2 1.3e-13
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 797) 564 78.2 1.5e-13
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 897) 564 78.3 1.6e-13
CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1 ( 747) 527 74.1 2.5e-12
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556) 515 72.9 1.2e-11
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 511 72.6 2.9e-11
>>CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897 aa)
initn: 8771 init1: 8771 opt: 13244 Z-score: 8028.1 bits: 1499.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13244; 99.9% identity (100.0% similar) in 2012 aa overlap (1-2012:887-2897)
10 20 30
pF1KA0 MGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GNQLREYQLEGLNWLLFNWYNRRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAP
860 870 880 890 900 910
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 LSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTF
920 930 940 950 960 970
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 EMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEEL
980 990 1000 1010 1020 1030
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 FSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEET
1040 1050 1060 1070 1080 1090
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEK
1100 1110 1120 1130 1140 1150
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 ILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED
1160 1170 1180 1190 1200 1210
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 YLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF
1220 1230 1240 1250 1260 1270
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG
1280 1290 1300 1310 1320 1330
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 RESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEG
1340 1350 1360 1370 1380 1390
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 RGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRP
1400 1410 1420 1430 1440 1450
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 FSATKDELAELSEAESEGDEKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FSATKDELAELSEAESEGDEKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILSH
1460 1470 1480 1490 1500 1510
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 GRFKRQLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GRFKRQLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLSA
1520 1530 1540 1550 1560 1570
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 PVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLYY
1580 1590 1600 1610 1620 1630
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 LKQEVIGNECQKVFDGVDASDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LKQEVIGNECQKVFDGVDASDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKYN
1640 1650 1660 1670 1680 1690
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 TIRADPALCFLERVGKPDEKAVAAEQRANDYMDGDVEDPEYKPAPAIFKDDIEDDVSSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TIRADPALCFLERVGKPDEKAVAAEQRANDYMDGDVEDPEYKPAPAIFKDDIEDDVSSPG
1700 1710 1720 1730 1740 1750
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 DLVIADGDGQLMEGDKVYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNKNRQIQQIQPTFSVPTSVMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DLVIADGDGQLMEGDKVYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNKNRQIQQIQPTFSVPTSVMQ
1760 1770 1780 1790 1800 1810
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 PIYEEATLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVSTFGVVFDPDRGQFDWTKFRAMARLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PIYEEATLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVSTFGVVFDPDRGQFDWTKFRAMARLH
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 KKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPNIFIQPITEERASRTLYRIELLRKVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPNIFIQPITEERASRTLYRIELLRKVRE
1880 1890 1900 1910 1920 1930
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 QALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRDLLIGAAKHGVSRTDYHILRDPELSFMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRDLLIGAAKHGVSRTDYHILRDPELSFMA
1940 1950 1960 1970 1980 1990
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 AQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQVALSASPLTSLPRLLDAKGIILEEMKVKSENLKEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQVALSASPLTSLPRLLDAKGIILEEMKVKSENLKEEP
2000 2010 2020 2030 2040 2050
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 QSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQATGDQKSGGKCETDRRMVAARTEPLTPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQATGDQKSGGKCETDRRMVAARTEPLTPNP
2060 2070 2080 2090 2100 2110
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 ASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSSSSSSSSSCSHSRSGSSSSSSSSCSSASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSSSSSSSSSCSHSRSGSSSSSSSSCSSASS
2120 2130 2140 2150 2160 2170
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA0 SSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRAESTTHMKAYDEESVASLSTTQDETQDSFQ
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKR-ESTTHMKAYDEESVASLSTTQDETQDSFQ
2180 2190 2200 2210 2220 2230
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA0 MNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTVASF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTVASF
2240 2250 2260 2270 2280 2290
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pF1KA0 YTTKLLDSPGAATEYSEPSVPTPPGAGVKEEHDQSTQMSKVKKHVREKEFTVKIKDEGGL
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YTTKLLDSPGAATEYSDPSVPTPPGAGVKEEHDQSTQMSKVKKHVREKEFTVKIKDEGGL
2300 2310 2320 2330 2340 2350
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA0 KLTFQKQGLAQKRPFDGEDGALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNFPKSIPVSGTSIQPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KLTFQKQGLAQKRPFDGEDGALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNFPKSIPVSGTSIQPTL
2360 2370 2380 2390 2400 2410
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA0 GANGVILDNQPIVKKRRGRRKNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GANGVILDNQPIVKKRRGRRKNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYT
2420 2430 2440 2450 2460 2470
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA0 QPQGIPDTESPVPVINLKDGTRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQLHEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QPQGIPDTESPVPVINLKDGTRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQLHEG
2480 2490 2500 2510 2520 2530
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA0 RPKQKRHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RPKQKRHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGV
2540 2550 2560 2570 2580 2590
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA0 APEWGDVVKQSGFLPESMYERILTGPVVREEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 APEWGDVVKQSGFLPESMYERILTGPVVREEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSG
2600 2610 2620 2630 2640 2650
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA0 NPLLANGLLPGVDLTTLQALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPSGGEAKNMAAMFPMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NPLLANGLLPGVDLTTLQALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPSGGEAKNMAAMFPMLL
2660 2670 2680 2690 2700 2710
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KA0 SGMAGLPNLLGMGGLLTKPTESGTEDKKGSDSKESEGKTERTESQSSENGGENSVSSSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SGMAGLPNLLGMGGLLTKPTESGTEDKKGSDSKESEGKTERTESQSSENGGENSVSSSPS
2720 2730 2740 2750 2760 2770
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KA0 TSSTAALNTAAAANPLALNPLLLSNILYPGMLLTPGLNLHIPTLSQSNTFDVQNKNSDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TSSTAALNTAAAANPLALNPLLLSNILYPGMLLTPGLNLHIPTLSQSNTFDVQNKNSDLG
2780 2790 2800 2810 2820 2830
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KA0 SSKSVEVKEEDSRIKDQEDKGGTEPSPLNENSTDEGSEKADASSGSDSTSSSSEDSDSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSKSVEVKEEDSRIKDQEDKGGTEPSPLNENSTDEGSEKADASSGSDSTSSSSEDSDSSN
2840 2850 2860 2870 2880 2890
pF1KA0 ED
::
CCDS76 ED
>>CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881 aa)
initn: 8952 init1: 8771 opt: 9601 Z-score: 5821.8 bits: 1091.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13102; 99.1% identity (99.2% similar) in 2012 aa overlap (1-2012:887-2881)
10 20 30
pF1KA0 MGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GNQLREYQLEGLNWLLFNWYNRRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAP
860 870 880 890 900 910
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 LSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTF
920 930 940 950 960 970
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 EMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEEL
980 990 1000 1010 1020 1030
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 FSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEET
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG
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CCDS45 RESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEG
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CCDS45 RGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FSATKDELAELSEAESEGDEKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILSH
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CCDS45 PVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLYY
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CCDS45 DLVIADGDGQLMEGDKVYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNKNRQIQQIQPTFSVPTSVMQ
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CCDS45 PIYEEATLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVSTFGVVFDPDRGQFDWTKFRAMARLH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPNIFIQPITEERASRTLYRIELLRKVRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRDLLIGAAKHGVSRTDYHILRDPELSFMA
1940 1950 1960 1970 1980 1990
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pF1KA0 AQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQVALSASPLTSLPRLLDAKGIILEEMKVKSENLKEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQVALSASPLTSLPRLLDAKGIILEEMKVKSENLKEEP
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CCDS45 QSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQATGDQKSGGKCETDRRMVAARTEPLTPNP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSSSSSSSSSCSHSRSGSSSSSSSSCSSASS
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CCDS45 SSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKR-ESTTHMKAYDEESVASLSTTQDETQDSFQ
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pF1KA0 MNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTVASF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTVASF
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pF1KA0 YTTKLLDSPGAATEYSEPSVPTPPGAGVKEEHDQSTQMSKVKKHVREKEFTVKIKDEGGL
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CCDS45 YTTKLLDSPGAATEYSDPSVPTPPGAGVKEEHDQSTQMSK----------------EGGL
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pF1KA0 KLTFQKQGLAQKRPFDGEDGALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNFPKSIPVSGTSIQPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KLTFQKQGLAQKRPFDGEDGALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNFPKSIPVSGTSIQPTL
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pF1KA0 GANGVILDNQPIVKKRRGRRKNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GANGVILDNQPIVKKRRGRRKNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYT
2400 2410 2420 2430 2440 2450
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pF1KA0 QPQGIPDTESPVPVINLKDGTRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQLHEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QPQGIPDTESPVPVINLKDGTRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQLHEG
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pF1KA0 RPKQKRHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RPKQKRHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGV
2520 2530 2540 2550 2560 2570
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pF1KA0 APEWGDVVKQSGFLPESMYERILTGPVVREEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 APEWGDVVKQSGFLPESMYERILTGPVVREEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSG
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pF1KA0 NPLLANGLLPGVDLTTLQALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPSGGEAKNMAAMFPMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NPLLANGLLPGVDLTTLQALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPSGGEAKNMAAMFPMLL
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pF1KA0 SGMAGLPNLLGMGGLLTKPTESGTEDKKGSDSKESEGKTERTESQSSENGGENSVSSSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SGMAGLPNLLGMGGLLTKPTESGTEDKKGSDSKESEGKTERTESQSSENGGENSVSSSPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TSSTAALNTAAAANPLALNPLLLSNILYPGMLLTPGLNLHIPTLSQSNTFDVQNKNSDLG
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CCDS45 SSKSVEVKEEDSRIKDQEDKGGTEPSPLNENSTDEGSEKADASSGSDSTSSSSEDSDSSN
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CCDS45 ED
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10 20 30
pF1KA0 MGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAP
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CCDS47 EMILTDCPELRNIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEEL
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CCDS47 FSLLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEET
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CCDS47 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEK
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:: ::..:.: . ::.::::::.:::::::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS47 ILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILED
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:::..:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KA0 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG
:::::::::::::::::::::.:.::.:::.:::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS47 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSG
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pF1KA0 RESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEG
::. ..:.:::::::::::::.:::::.:.:::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS47 RENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITIESEG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KA0 RGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRP
.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:..:::.:::::::.:::::
CCDS47 KGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KA0 FSATK-DELAELSEAESEGDEKP--KLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREI
.::.: ::: :.:. ::...::: : ::: :.:.::.:.::::::::::::::::: .:
CCDS47 YSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDI
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pF1KA0 LSHGRFKRQLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLG
:::::.::::.:.::: :::..:.::: ::.:::.::.::::::::: ::::: : :: :
CCDS47 LSHGRYKRQLTEQDVETICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALVNHSG
1630 1640 1650 1660 1670 1680
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CCDS47 LSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPVVQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRM
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::::.:::::.. .:...:.:.:. :::.::: :.::::.::: .:::::::::::::::
CCDS47 LYYLRQEVIGDQADKILEGADSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFKHGYE
1750 1760 1770 1780 1790 1800
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pF1KA0 KYNTIRADPALCFLERVGKPDEKAVAAEQRANDYM-DG--------DVEDPEYKPAPAIF
:::..::::::::::::: :: ::.:::::..:.. :: . :::::::. . :
CCDS47 KYNSMRADPALCFLERVGMPDAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDEDPEYKPTRTPF
1810 1820 1830 1840 1850 1860
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::.:.. ..::.. . . :. :.. ..:::. :.::::::::::::::.
CCDS47 KDEIDEFANSPSEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAYQRSY
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: .:..: . ... .: : .:. . : : :..:.::::::::::::::::::
CCDS47 KRQQMRQ-EALMKTDRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGV
1930 1940 1950 1960 1970 1980
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 VFDPDRGQFDWTKFRAMARLHKKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPNI--FI
.::: . ::::..:::.::: ::.:.:::::. :..:::::::.: : . :.. .:
CCDS47 IFDPVKQQFDWNQFRAFARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSII
1990 2000 2010 2020 2030 2040
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 QPITEERASRTLYRIELLRKVREQALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRDLLIG
.:::::::::::::::::::.:::.:.:::: ::::::.:. ::: ::::: ::::::.:
CCDS47 EPITEERASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLGERLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDLLVG
2050 2060 2070 2080 2090 2100
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:::::::::::::: ::::::. :..:..:.. : . .: .::
CCDS47 AAKHGVSRTDYHILNDPELSFLDAHKNFAQNRGAGNTSSL------------NPL-----
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pF1KA0 LLDAKGIILEEMKVKSENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQATGDQK
: :.. ..: ....: :.: ..:
CCDS47 ---AVGFVQTPPVISSAHIQDE--------------RVLEQAE-----------------
2150 2160 2170
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pF1KA0 SGGKCETDRRMVAARTEPLTPNPASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSSSSSSS
:: : :: :::.:. . .:.: ..:.....:. .. .:: .
CCDS47 --GKVE----------EP--ENPAAKE---KCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASSVK
2180 2190 2200 2210
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pF1KA0 SSCSHSRSGSSSSSSSSCSSASSSSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRAESTTHM
. . . :....:.: : ..: . . :..:..:: .: .: ....
CCDS47 NELKGVEVGADTGSKSI----------SEKGSEEDEEEKLEDDDKSEESSQPEAGAVSRG
2220 2230 2240 2250 2260
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pF1KA0 KAYDEESVASLSTTQDETQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSIC
: .:::: ::.::..:::.:.: :..: : : .:. .: :.::::::::::::.::
CCDS47 KNFDEESNASMSTARDETRDGFYMEDGDPSVAQLLHE-RTFAFSFWPKDRVMINRLDNIC
2270 2280 2290 2300 2310 2320
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 QTVLKGKWPSARRS-YDANTVASFYTTKLLDSPGAATEYSEPSVPTPPGAGVKEEHDQST
..::::::: ::. .: . . :: .::: ..: :. . . .:. :
CCDS47 EAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLIPGYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSP
2330 2340 2350 2360 2370 2380
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 QMSK-------VKKHVREKEFTVKIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFD--GEDGALGQQQY
:.:: : .. :... ..:. : . : . .:: : . .:.: :.
CCDS47 QLSKEDALNLSVPRQRRRRRRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENG----QEK
2390 2400 2410 2420 2430 2440
1500 1510 1520 1530
pF1KA0 LTRLRELQSASETSLVNF---------PK-SIPVS------------GTSIQPTLGA-NG
.. : . . . .: :: :. : ::: : : :: ::
CCDS47 VVDLSKASREATSSTSNFSSLSSKFILPNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLLNG
2450 2460 2470 2480 2490 2500
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pF1KA0 VILDNQPIVKKRRGRRKNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQG
..:..: .:.::::::::::.:..:..... .::. ..... ... . ..
CCDS47 SLVDGEPPMKRRRGRRKNVEGLDLLFMSHKR----TSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRN
2510 2520 2530 2540 2550
1600 1610 1620 1630 1640
pF1KA0 IP-----DTESPVPVINLKDGTRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQ--L
:: : .. .:::::.:::::.:.:::: ::: .::: :: :. :. ...:. :
CCDS47 IPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRLVGEDAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVL
2560 2570 2580 2590 2600 2610
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pF1KA0 HEG--RPKQKRHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKEN
. .:::::::::::::::.:.::::::: ..:.::..:.:::.:::.::: :.:.::
CCDS47 FSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEEN
2620 2630 2640 2650 2660 2670
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KA0 SEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMYERILTGPVVREE-VSRRGRRPKSGIAKATAAAAAAS
:..:::.: :.::::::.::::..:.::::::: : .::::::::: ::.:.:::::..
CCDS47 PEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFDRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVA
2680 2690 2700 2710 2720 2730
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KA0 ATSVSGNPLLANGLLPGVDLTTLQALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPS----GGEAK
.:: . ::::.:.:. :.:::.:: :::::::::. :::::.: :: . ::.::
CCDS47 STS-GINPLLVNSLFAGMDLTSLQ----NLQNLQSLQL-AGLMGFPPGLATAATAGGDAK
2740 2750 2760 2770 2780 2790
1830 1840 1850 1860 1870
pF1KA0 NMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMGGLLTKPTESGTEDKKGSDSK-ESEGKTERTESQSSEN
: ::..:..: :::::::..:.::::..: ..: . ..:. : : .: . : ...::
CCDS47 NPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNNPLSAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNEN
2800 2810 2820 2830 2840 2850
1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 GGEN--------SVSSSPSTSSTAALNTAAA---ANPLALNPLLLSNI----LYPGMLLT
:: .::.. :...... :: : .::::.::.:::.. .::.:.:
CCDS47 EDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAATAPAGLPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLP
2860 2870 2880 2890 2900 2910
1930 1940 1950 1960 1970
pF1KA0 PGLN-LHIPTLS-----QSNTFDVQNKNSDLGSSKSVEVKE--EDSRIKDQEDKGGTEPS
:::. : .: . :. . . ..: .: . . . : : : ... :: : :
CCDS47 PGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGSSEEKAADKAEGGPFKDGETLEGSDAEESLDK--TAES
2920 2930 2940 2950 2960
1980 1990 2000 2010
pF1KA0 PLNENSTDEGSEKADASSGSDSTSSSSEDSDSSNED
: :. .: :. :. .:.: .. .:
CCDS47 SLLEDEIAQG-EELDSLDGGDEIENNENDE
2970 2980 2990
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10 20 30
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::::.:::::: :::..:..:::::: ::::::::::: .::.::.: :::.:.:.::::
CCDS45 LSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTF
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::::. : :: ::::::::::::::::.:::::..:: :.:::::::::::::::::::
CCDS45 EMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEEL
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::::::::: .::::: :...:::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
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::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::.::::::::::::::::.:::::
CCDS45 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEK
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pF1KA0 ILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED
:: :::.. . :::::::..::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED
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:::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF
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pF1KA0 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG
:::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS45 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSG
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pF1KA0 RESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEG
:..:. ::::.::::::::::.:::.:::::.::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS45 RDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KA0 RGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRP
.:::::::::::: ::::::::::::::::::::..:.. ....:.:::::::.:::::
CCDS45 KGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRH
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KA0 FSATKDE-LAELSEAESEGDEKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILS
::. ::. :.:.:. ::: ::.:. :: :: ..::::.::::::.::::::::::.:::
CCDS45 FSTLKDDDLVEFSDLESEDDERPRSRRH-DRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KA0 HGRFKRQLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLS
::::::...:.::: ::::.:.:::.::::::.:::::::::.:.:.:.:.::::: :::
CCDS45 HGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLS
1190 1200 1210 1220 1230 1240
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pF1KA0 APVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLY
::::::::::::.: :.:::.::.:.:::::. :.:::.::::.::.::::::::::::
CCDS45 IPVPRGRKGKKVKSQ-STFDIHKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLY
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pF1KA0 YLKQEVIGNECQKVFDGVDASDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKY
::.:::::.. .::. :. ::.::.: : :. :::. ::: .:::::::::::::::::
CCDS45 YLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKY
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pF1KA0 NTIRADPALCFLERVGKPDEKAVAAEQRA----NDYMDG-----DVEDPEYKPAPAIFKD
::.::::::::::..:.::.::.:::.:. .: ..: : ::::::: . ::
CCDS45 NTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKD
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pF1KA0 DIEDDVSSPGDLVIADGDGQLMEGDK---------VYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNK
.:: ..: :.. : . ....::. ..:: ::::.:::::.:::::. :
CCDS45 --QDDEGDP--LMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYK
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.:.. :. .. . . ::... : :. :.::::::::..::::::::::: .
CCDS45 REQMK-IE---AAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARREKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEY
1490 1500 1510 1520 1530
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::: :: : .::..::: ::::.:: ::...:..:::.::::: . .: :::.::.:
CCDS45 DPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEP
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:::::::::::::::::..:::.: :: : .:: ::.: .:.:: ::: :: .:: ::
CCDS45 ITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGA
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pF1KA0 AKHGVSRTDYHILRDPELSFMAAQRNYSQSKMAH------SRTSTPLLQQYQVALSASPL
:.::::.:: .:..::..::.::. :: :...: :: :::::.: .. .::::
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1660 1670 1680 1690 1700 1710
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: :: ... :. . . . :.:. :: . : .. ::
CCDS45 PLRP---DAP-------------VEKSPEETATQ-VPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQ-
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pF1KA0 TGDQKSGGKCETDRRMVAARTEPLTPNPASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSS
. . :. . : ::. . . : :. :. .::::. . :. :
CCDS45 ----------DYEMRVSPSDTTPLV---SRSVPPVKL---EDEDDSDSELDLSKLSP---
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pF1KA0 SSSSSSSCSHSRSGSSSSSSSSCSSASSSSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRAE
:::.::::::::::..::. ::.: . .
CCDS45 ------------------------------SSSSSSSSSSSSSSTDESE-DEKEEKLTDQ
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pF1KA0 STTHMKAYDEESVASLSTTQD--ETQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMI
: . : :::::. ::. .:: ..:. :: ::: .:: :: ::::::.:
CCDS45 SRS--KLYDEESLLSLTMSQDGFPNEDGEQM---TPE-LLLLQ--ERQRASEWPKDRVLI
1840 1850 1860 1870 1880
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pF1KA0 NRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTVASFYT-TKLLDSPGAAT-EYSEPSVPTP---PG
::.: .::.::.:::::.::: . : . . ..:::::. . ::.. :::: .
CCDS45 NRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSSA
1890 1900 1910 1920 1930 1940
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pF1KA0 AGVKEEHDQST-----QMSKVKKHVREKEFTVKIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFDGEDG
:.. ::. ... :..:... . ::::::.:::: ::::::::. :
CCDS45 ASMAEEEASAVSTAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKDEEGLKLTFQKHKLM----------
1950 1960 1970 1980 1990
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pF1KA0 ALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNFPKSIPVSGTSIQPTLGANGVILDNQPIVKKRRGRR
::::. :..:. .:..: :
CCDS45 -----------------------------------------ANGVMGDGHPLFHKKKGNR
2000 2010
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pF1KA0 KNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGIPDTESPVPVINLKDG
:.. ... . . :::... : :. .:::: ::
CCDS45 KKLVELEVECM---EEPNHLDV------------------------DLETRIPVINKVDG
2020 2030 2040
1620 1630 1640 1650 1660
pF1KA0 TRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPR-MQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVNS
: :.:.:::.: .:: ::. :: .. : :: . : : ::: .::.. :: ..:
CCDS45 TLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVD-----PRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAELNC
2050 2060 2070 2080 2090
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pF1KA0 LTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMY
: : : :: : ::..: : :...
CCDS45 L-GMEPVQTANSRNGKK-----------------------------------GHHTETVF
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pF1KA0 ERILTGPVVREEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSGNPLLANGLLPGVDLTTLQA
.:.: ::.. : ..:.:: . ..: : ..:. :.: . . .. . : ....
CCDS45 NRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTFQHS---SSGLQSVSS
2130 2140 2150 2160 2170 2180
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KA0 LQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPSGGEAKNMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMGGLLTKP
: .. . :: .:: : ::
CCDS45 LGHSSATSASLPFMPFVMG---GAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHHHPGLRAPGY
2190 2200 2210 2220 2230
>>CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581 aa)
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10 20 30
pF1KA0 MGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAP
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CCDS53 RNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSIAFLQEVYNVGIHGPFLVIAP
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pF1KA0 LSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTF
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CCDS53 LSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTF
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pF1KA0 EMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEEL
::::. : :: ::::::::::::::::.:::::..:: :.:::::::::::::::::::
CCDS53 EMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEEL
930 940 950 960 970 980
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pF1KA0 FSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEET
::::::::: .::::: :...:::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
CCDS53 FSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQET
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pF1KA0 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEK
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CCDS53 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEK
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pF1KA0 ILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED
:: :::.. . :::::::..::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS53 ILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED
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pF1KA0 YLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF
:::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF
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pF1KA0 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG
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CCDS53 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSG
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:..:. ::::.::::::::::.:::.:::::.::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS53 RDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEG
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.:::::::::::: ::::::::::::::::::::..:.. ....:.:::::::.:::::
CCDS53 KGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRH
1350 1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KA0 FSATKDE-LAELSEAESEGDEKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILS
::. ::. :.:.:. ::: ::.:. :: :: ..::::.::::::.::::::::::.:::
CCDS53 FSTLKDDDLVEFSDLESEDDERPRSRRH-DRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILS
1410 1420 1430 1440 1450 1460
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pF1KA0 HGRFKRQLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLS
::::::...:.::: ::::.:.:::.::::::.:::::::::.:.:.:.:.::::: :::
CCDS53 HGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLS
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pF1KA0 APVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLY
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CCDS53 IPVPRGRKGKKVKSQ-STFDIHKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLY
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pF1KA0 YLKQEVIGNECQKVFDGVDASDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKY
::.:::::.. .::. :. ::.::.: : :. :::. ::: .:::::::::::::::::
CCDS53 YLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKY
1590 1600 1610 1620 1630 1640
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pF1KA0 NTIRADPALCFLERVGKPDEKAVAAEQRA----NDYMDG-----DVEDPEYKPAPAIFKD
::.::::::::::..:.::.::.:::.:. .: ..: : ::::::: . ::
CCDS53 NTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKD
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.:: ..: :.. : . ....::. ..:: ::::.:::::.:::::. :
CCDS53 --QDDEGDP--LMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYK
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.:.. :. .. . . ::... : :. :.::::::::..::::::::::: .
CCDS53 REQMK-IE---AAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARREKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEY
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pF1KA0 DPDRGQFDWTKFRAMARLHKKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLP--SKEELVDPNIFIQP
::: :: : .::..::: ::::.:: ::...:..:::.::::: . .: :::.::.:
CCDS53 DPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEP
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:::::::::::::::::..:::.: :: : .:: ::.: .:.:: ::: :: .:: ::
CCDS53 ITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGA
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:.::::.:: .:..::..::.::. :: :...: :: :::::.: .. .::::
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: :: ... :. . . . :.:. :: . : .. ::
CCDS53 PLRP---DAP-------------VEKSPEETATQ-VPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQ-
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. . :. . : ::. . . : :. :. .::::. . :. :
CCDS53 ----------DYEMRVSPSDTTPLV---SRSVPPVKL---EDEDDSDSELDLSKLSP---
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:::.::::::::::..::. ::.: . .
CCDS53 ------------------------------SSSSSSSSSSSSSSTDESE-DEKEEKLTDQ
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pF1KA0 STTHMKAYDEESVASLSTTQD--ETQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMI
: . : :::::. ::. .:: ..:. :: ::: .:: :: ::::::.:
CCDS53 SRS--KLYDEESLLSLTMSQDGFPNEDGEQM---TPE-LLLLQ--ERQRASEWPKDRVLI
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pF1KA0 NRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTVASFYT-TKLLDSPGAAT-EYSEPSVPTP---PG
::.: .::.::.:::::.::: . : . . ..:::::. . ::.. :::: .
CCDS53 NRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSSA
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pF1KA0 AGVKEEHDQST-----QMSKVKKHVREKEFTVKIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFDGEDG
:.. ::. ... :..:... . ::::::.:::: ::::::::. :
CCDS53 ASMAEEEASAVSTAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKDEEGLKLTFQKHKLM----------
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pF1KA0 ALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNFPKSIPVSGTSIQPTLGANGVILDNQPIVKKRRGRR
::::. :..:. .:..: :
CCDS53 -----------------------------------------ANGVMGDGHPLFHKKKGNR
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pF1KA0 KNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGIPDTESPVPVINLKDG
:.. ... . . :::... : :. .:::: ::
CCDS53 KKLVELEVECM---EEPNHLDV------------------------DLETRIPVINKVDG
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pF1KA0 TRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPR-MQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVNS
: :.:.:::.: .:: ::. :: .. : :: . : : ::: .::.. :: ..:
CCDS53 TLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVD-----PRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAELNC
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pF1KA0 LTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMY
: : : :: : ::..: : :...
CCDS53 L-GMEPVQTANSRNGKK-----------------------------------GHHTETVF
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.:.: ::.. : ..:.:: . ..: : ..:. :.: . . .. . : ....
CCDS53 NRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTFQHS---SSGLQSVSS
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: .. . :: .:: : ::
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10 20 30
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CCDS13 YLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF
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:::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::.:::::::::::::...
CCDS13 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDIN-
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:.....:.::::: :.:::::.:::::.:.::::::::::::::::: :::.::::.:::
CCDS13 RKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITIQSEG
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.::::::::::::::::::::::::::::::: ::.: :: . ..::::: ::.::::.
CCDS13 KGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKH
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... .::: :.:: .:..::.: . :: :.. : :.::::::::::..:::::..::
CCDS13 YNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWGRWKDIL
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.::::: .:::.:.:.::::::.::. ::.::::::.:::.:::::.:::.. :::: ::
CCDS13 THGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQNHSGL
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pF1KA0 SAPVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRML
::::::::::::.:.: ... :.:: ::: .:.:.:::::.:.::::::::::::
CCDS13 SAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRML
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CCDS13 YYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDWWDAEADKSLLIGVFKHGYER
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::..::::::::::.:: ::::...::: .. :: . :: . .:. :: :
CCDS13 YNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVT---DGTSDIPERGNTDK--EDNAEDKVDG
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:. :: :.. : . ..: :: ::..::::.:::::.:.::: :..
CCDS13 LQKQTESSSDGGDGVFSEKKDDSRAAQDGSDPDKSPWPVSSALTARLRRLVTVYQRCNRK
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. .: . : . . :: : . . : : :.::::::.:::::.::.:::
CCDS13 ---ELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINK-EAQKRWTRREQADFYRTVSSFGV
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:.: .. ::::.:: ..:: ::.:.:::.:.:.:..::: :::::. .. :. :..
CCDS13 VYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTWKDGGPPDTTIYV
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.:::::::.:::::::::::::::.:. ::: :::.::.:. :::::::: ::::::::
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.::::..::: .:. ::.:::. : :::.: : . ... : ::. .:. :
CCDS13 TAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCCLYQTNSKLYESLTYSQ
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CCDS13 MSRTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVISINHDESLLPESLESMM
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.. :..::.: .: ...:.: . . .: :. . : :. ..:
CCDS13 YGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISISKDGNCQSGGPEAEIASGPTFMGSLEAG
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: ... . : .. : . :...: ... . :.::.
CCDS13 GVAQANIKNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPENIGQLEAKCLASPSLNPGNESGFVDMC
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pF1KA0 SDSDSDSERSSCS---------SRSSSSSSSSSCSHS-----------------------
: : ::.:. : ..: :. : .::
CCDS13 SLSVCDSKRNLSSDQQLIDLLENKSLESKLILSQNHSDEEEEEEENEEENLAMAVGMGER
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..:: . .. .:
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:.... . . .. :
CCDS13 HGLENDEFEIEKPKAYIPDLFKSKTNTIAMEGEPTAIPSQPFKVKHELLKEPWKESAEGQ
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pF1KA0 ----------SSSSSEESDSDEEEAQKRAESTTHMKAY-----DEESVASLSTTQDETQD
: .::. : .... : ... : . : .::: .: : . :
CCDS13 NVFPTYPLEGSELKSEDMDFENKDDYDR-DGNCHSQDYPGKYSEEESKSSTSGITGDIGD
2010 2020 2030 2040 2050 2060
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pF1KA0 SFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTV
.: . : : .:: . . : ::::::.:::::.::..::::::::... ..:.
CCDS13 ELQEARA-PTIAQLLQEKTLYSFSEWPKDRVIINRLDNICHVVLKGKWPSSQQYEPSGTL
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pF1KA0 ASFYTTKLLDSPGAATEYSEPSVPTPP---GAGVKEEHDQSTQMSKV-----KKHVREKE
: : .: :. : ::: . ::.. . . . .. : .:: : :
CCDS13 P---TPVLTSSAGSRTSLSEPEAAEHSFSNGAALAAQIHKESFLAPVFTKDEQKHRRPYE
2130 2140 2150 2160 2170 2180
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pF1KA0 FTVKIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFDGEDGALGQQQYLTRLRELQSASETS---LVNFP
: :. .: . .:: : :. . . . .:. .:: : ::
CCDS13 FEVE-RDA-------KARGLEQFSATHGHTPIILNGWHGESAMDLSCSSEGSPGATSPFP
2190 2200 2210 2220 2230
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pF1KA0 --KSIPVSG--TSIQPTLG-------------------ANGVILDNQPIVKKRRGRRKNV
: : : .:.: .:: .:: . .. ...::::::.:
CCDS13 VSASTPKIGAISSLQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRRKHV
2240 2250 2260 2270 2280 2290
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pF1KA0 EG-VDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGI-PDTESPVPVINLKDGT
:: .:..:.... .. :. . . : . .:: :.:.: : : .: :. ..
CCDS13 EGGMDLIFLKEQT----LQAGILEVHEDPG-QATLSTTHPEGPGPATSAPEPATA---AS
2300 2310 2320 2330 2340
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 RLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVNSLT
: . :. :.: ::... : .. .: .. .:::.: ::..:.::::.::.
CCDS13 SQAEKSIPS-KSLLDWLRQQADYSLEVPGFGANFS---DKPKQRRPRCKEPGKLDVSSLS
2350 2360 2370 2380 2390 2400
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KA0 GEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMYER
::::: : .. : :. :::::. ...
CCDS13 GEERVPAIPKE----------PGLR-------------------------GFLPENKFNH
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CCDS32 DERPEGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDA
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CCDS32 FTTQWLVRDLRGKTEKEFKA--YVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRI
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CCDS32 GVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCT
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pF1KA0 PLSTIANWEREFRTWTD-INVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYR------
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CCDS32 PLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREAQ
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CCDS32 VKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTG
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pF1KA0 TPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDV
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CCDS32 TPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADV
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pF1KA0 EKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFL-SKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCN
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CCDS32 FKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGG--NQVSLLNIMMDLKKCCN
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CCDS32 QMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGI
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