Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0305
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0305, 1539 aa
1>>>pF1KA0305 1539 - 1539 aa - 1539 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5683+/-0.00119; mu= 12.9227+/- 0.071
mean_var=116.4626+/-24.352, 0's: 0 Z-trim(104.3): 61 B-trim: 21 in 1/51
Lambda= 0.118845
statistics sampled from 7786 (7846) to 7786 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16
Scan time: 4.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4050.1 ZFYVE16 gene_id:9765|Hs108|chr5 (1539) 10095 1743.2 0
CCDS564.1 ZFYVE9 gene_id:9372|Hs108|chr1 (1366) 1962 348.7 7.3e-95
CCDS563.1 ZFYVE9 gene_id:9372|Hs108|chr1 (1425) 1962 348.7 7.6e-95
>>CCDS4050.1 ZFYVE16 gene_id:9765|Hs108|chr5 (1539 aa)
initn: 10095 init1: 10095 opt: 10095 Z-score: 9352.0 bits: 1743.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10095; 99.8% identity (99.9% similar) in 1539 aa overlap (1-1539:1-1539)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDSYFKAAVSDLDKLLDDFEQNPDEQDYLQDVQNAYDSNHCSVSSELASSQRTSLLPKDQ
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CCDS40 MDSYFKAAVSDLDKLLDDFEQNPDEQDYLQDVQNAYDSNHCSVSSELASSQRTSLLPKDQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ECVNSCASSETSYGTNESSLNEKTLKGLTSIQNEKNVTGLDLLSSVDGGTSDEIQPLYMG
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CCDS40 ECVNSCASSETSYGTNESSLNEKTLKGLTSIQNEKNVTGLDLLSSVDGGTSDEIQPLYMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 RCSKPICDLISDMGNLVHATNSEEDIKKLLPDDFKSNADSLIGLDLSSVSDTPCVSSTDH
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CCDS40 RCSKPICDLISDMGNLVHATNSEEDIKKLLPDDFKSNADSLIGLDLSSVSDTPCVSSTDH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DSDTVREQQNDTSSELQNREIGGIKELGIKVDTTLSDSYNYSGTENLKDKKIFNQLESIV
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CCDS40 DSDTVREQQNDISSELQNREIGGIKELGIKVDTTLSDSYNYSGTENLKDKKIFNQLESIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 DFNMSSALTRQSSKMFHAKDKLQHKSQPCGLLKDVGLVKEEVDVAVITAAECLKEEGKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 DFNMSSALTRQSSKMFHAKDKLQHKSQPCGLLKDVGLVKEEVDVAVITAAECLKEEGKTS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ALTCSLPKNEDLCLNDSNSRDENFKLPDFSFQEDKTVIKQSAQEDSKSLDLKDNDVIQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ALTCSLPKNEDLCLNDSNSRDENFKLPDFSFQEDKTVIKQSAQEDSKSLDLKDNDVIQDS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SSALHVSSKDVPSSLSCLPASGSMCGSLIESKARGDFLPQHEHKDNIQDAVTIHEEIQNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SSALHVSSKDVPSSLSCLPASGSMCGSLIESKARGDFLPQHEHKDNIQDAVTIHEEIQNS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VVLGGEPFKENDLLKQEKCKSILLQSLIEGMEDRKIDPDQTVIRAESLDGGDTSSTVVES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VVLGGEPFKENDLLKQEKCKSILLQSLIEGMEDRKIDPDQTVIRAESLDGGDTSSTVVES
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QEGLSGTHVPESSDCCEGFINTFSSNDMDGQDLDYFNIDEGAKSGPLISDAELDAFLTEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 QEGLSGTHVPESSDCCEGFINTFSSNDMDGQDLDYFNIDEGAKSGPLISDAELDAFLTEQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 YLQTTNIKSFEENVNDSKSQMNQIDMKGLDDGNINNIYFNAEAGAIGESHGINIICETVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS40 YLQTTNIKSFEENVNDSKSQMNQIDMKGLDDGNINNIYFNAEAGAIGESHGINIICEIVD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 KQNTIENGLSLGEKSTIPVQQGLPTSKSEITNQLSVSDINSQSVGGARPKQLFSLPSRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KQNTIENGLSLGEKSTIPVQQGLPTSKSEITNQLSVSDINSQSVGGARPKQLFSLPSRTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SSKDLNKPDVPDTIESEPSTADTVVPITCAIDSTADPQVSFNSNYIDIESNSEGGSSFVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SSKDLNKPDVPDTIESEPSTADTVVPITCAIDSTADPQVSFNSNYIDIESNSEGGSSFVT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 ANEDSVPENTCKEGLVLGQKQPTWVPDSEAPNCMNCQVKFTFTKRRHHCRACGKVFCGVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ANEDSVPENTCKEGLVLGQKQPTWVPDSEAPNCMNCQVKFTFTKRRHHCRACGKVFCGVC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 CNRKCKLQYLEKEARVCVVCYETISKAQAFERMMSPTGSNLKSNHSDECTTVQPPQENQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 CNRKCKLQYLEKEARVCVVCYETISKAQAFERMMSPTGSNLKSNHSDECTTVQPPQENQT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SSIPSPATLPVSALKQPGVEGLCSKEQKRVWFADGILPNGEVADTTKLSSGSKRCSEDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SSIPSPATLPVSALKQPGVEGLCSKEQKRVWFADGILPNGEVADTTKLSSGSKRCSEDFS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 PLSPDVPMTVNTVDHSHSTTVEKPNNETGDITRNEIIQSPISQVPSVEKLSMNTGNEGLP
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CCDS40 PLSPDVPMTVNTVDHSHSTTVEKPNNETGDITRNEIIQSPISQVPSVEKLSMNTGNEGLP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 TSGSFTLDDDVFAETEEPSSPTGVLVNSNLPIASISDYRLLCDINKYVCNKISLLPNDED
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CCDS40 TSGSFTLDDDVFAETEEPSSPTGVLVNSNLPIASISDYRLLCDINKYVCNKISLLPNDED
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 SLPPLLVASGEKGSVPVVEEHPSHEQIILLLEGEGFHPVTFVLNANLLVNVKFIFYSSDK
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CCDS40 SLPPLLVASGEKGSVPVVEEHPSHEQIILLLEGESFHPVTFVLNANLLVNVKFIFYSSDK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 YWYFSTNGLHGLGQAEIIILLLCLPNEDTIPKDIFRLFITIYKDALKGKYIENLDNITFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 YWYFSTNGLHGLGQAEIIILLLCLPNEDTIPKDIFRLFITIYKDALKGKYIENLDNITFT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 ESFLSSKDHGGFLFITPTFQKLDDLSLPSNPFLCGILIQKLEIPWAKVFPMRLMLRLGAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ESFLSSKDHGGFLFITPTFQKLDDLSLPSNPFLCGILIQKLEIPWAKVFPMRLMLRLGAE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 YKAYPAPLTSIRGRKPLFGEIGHTIMNLLVDLRNYQYTLHNIDQLLIHMEMGKSCIKIPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 YKAYPAPLTSIRGRKPLFGEIGHTIMNLLVDLRNYQYTLHNIDQLLIHMEMGKSCIKIPR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KKYSDVMKVLNSSNEHVISIGASFSTEADSHLVCIQNDGIYETQANSATGHPRKVTGASF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KKYSDVMKVLNSSNEHVISIGASFSTEADSHLVCIQNDGIYETQANSATGHPRKVTGASF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 VVFNGALKTSSGFLAKSSIVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDAVDLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VVFNGALKTSSGFLAKSSIVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDAVDLRE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 YVDICWVDAEEKGNKGVISSVDGISLQGFPSEKIKLEADFETDEKIVKCTEVFYFLKDQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 YVDICWVDAEEKGNKGVISSVDGISLQGFPSEKIKLEADFETDEKIVKCTEVFYFLKDQD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 LSILSTSYQFAKEIAMACSAALCPHLKTLKSNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQAGSEGQLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LSILSTSYQFAKEIAMACSAALCPHLKTLKSNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQAGSEGQLLP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530
pF1KA0 QHYLNDLDSALIPVIHGGTSNSSLPLEIELVFFIIEHLF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 QHYLNDLDSALIPVIHGGTSNSSLPLEIELVFFIIEHLF
1510 1520 1530
>>CCDS564.1 ZFYVE9 gene_id:9372|Hs108|chr1 (1366 aa)
initn: 2006 init1: 1072 opt: 1962 Z-score: 1816.5 bits: 348.7 E(32554): 7.3e-95
Smith-Waterman score: 2407; 34.6% identity (60.1% similar) in 1597 aa overlap (1-1538:1-1365)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MDSYFKAAVSDLDKLLDDFEQNPDE--QDYLQDVQ--NAYD--SNHCSVSSELASSQRTS
:..::.: . .:::.::.:::: :: .. : :.. . : :.. : . ::: ....
CCDS56 MENYFQAEAYNLDKVLDEFEQNEDETVSSTLLDTKWNKILDPPSHRLSFNPTLASVNESA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KA0 LLPKDQECVNSCASSETSYGTNE-----SSLNEKTLKG-LTSIQNEKNVTGLDLLSSVDG
. ..: .. . .... :.: .. .. .:. .... ..:... : : . .
CCDS56 VSNESQPQLKVFSLAHSAPLTTEEEDHCANGQDCNLNPEIATMWIDENAVAEDQLIKRNY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 GTSDEIQPLYMG--RCSKPICDLISDMGNLVHATNSEEDIKKLLPDDFK--SNADSLIGL
. .:. . . .: .:.. : : .. . :: :. . : :. : .:.. .: .: .
CCDS56 SWDDQCSAVEVGEKKCGNLAC-LPDEKNVLVVAVMHNCD-KRTLQNDLQDCNNYNSQSLM
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KA0 DLSSVSDTPCVSSTDHDSDTVREQ-QNDTSSELQNREIGGIKELGIKVD---TTLSDSY-
: : : .::. : .. :. ..: .:: : .. : : .:. : :::
CCDS56 DAFSCSLDNENRQTDQFSFSINESTEKDMNSEKQMDPLNRPKTEGRSVNHLCPTSSDSLA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 NYSGTENLKDKKIFNQLESIVDFNMSSALTRQSSKMFHAKDKLQHKSQPCGLLKDVGLVK
. . .::: ... : .::. . .... .. .. : .: :
CCDS56 SVCSPSQLKDDGSIGR-----DPSMSAITSLTVDSVISSQG-----TDGCPAVK-----K
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 EEVDVAVITAAECLKEEGKTSALTCSLPKNEDLCLNDSNSRDENFKLPDFSFQEDKTVIK
.: . : : :: :. :... :.. :: :: . . ..:
CCDS56 QENYI----PDEDLT--GKISS-----PRTD---LGSPNS---------FSHMSEGILMK
290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 QSAQEDSKSLDLKDNDVIQDSSSALHVSSK-DVPSSLSCLPASGSMCGS-LIESKARGDF
. :.: . . . :.: . : :.:.. : . :.. :. ...:.:
CCDS56 KEPAEESTTEE--------SLRSGLPLLLKPDMPNG-SGRNNDCERCSDCLVPNEVRADE
330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 LPQHEHKDNIQDAVTIHEEIQNSVVLGGEPFKENDLLKQEKCKSILLQSLIEGMEDRKID
.::.... . :. : . : :.:.. . . : : .: : :.: ...
CCDS56 NEGYEHEETLGTT-----EFLNMT----EHFSESQDMTNWK-----LTKLNE-MNDSQVN
380 390 400 410
460 470 480 490 500
pF1KA0 PDQT----VIRAESLDGGDTSSTVVESQEGLS--GTHVPESSDC-CEGFINTFSSNDM-D
.. . . :. .: . .. : .. ::. :: . :: .: :.: ..: . .
CCDS56 EEKEKFLQISQPEDTNGDSGGQCVGLADAGLDLKGTCISESEECDFSTVIDTPAANYLSN
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 GQDLDYFNIDEGAKSGPLISDAELDAFLTEQYLQTTNIKSFEENVNDSKSQMNQIDMKGL
: : .: : :.. : .. :. .::. : .::. .. : : ...:
CCDS56 GCD-SYGMQDPGVSFVPKTLPSKEDS-VTEE-------KEIEESKSECYS--NIYEQRGN
480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 DDGNINNIYFNAEAGAIGESHGINIICETVDKQNTIENGLSLGEKSTIPVQQGLPTSKSE
. . ... .:. .: . ... .. .: : . ::. :. : .::.
CCDS56 EATEGSGLLLNS-TGDLMKKNYLHNFCSQVPS--------VLGQ-SSPKVVASLPS----
530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 ITNQLSVSDINSQSVGGARPKQLFSLPSRT-RSSKDLNKPDVPDTIESEPSTADTVVPIT
.:: ::::::: .: . . .: . : : . .. .. . .. .
CCDS56 ----ISV------PFGGARPKQPSNLKLQIPKPLSDHLQNDFPANSGNNTKNKNDILGKA
580 590 600 610 620
690 700 710 720 730
pF1KA0 CAIDSTADPQVSFN-SNYIDIESNSEGGSSF---------VTANEDSVPENTCKEG----
...: : . .: ....:.: :. .. :: :.: . :
CCDS56 KLGENSATNVCSPSLGNISNVDTNGEHLESYEAEISTRPCLALAPDS-PDNDLRAGQFGI
630 640 650 660 670 680
740 750 760 770 780
pF1KA0 ------LVLGQKQPTWVPDSEAPNCMNCQVKFTFTKRRHHCRACGKVFCGVCCNRKCKLQ
.::. :.:::::.:::::.:...::::::::::::::::::. ::. ::::
CCDS56 SARKPFTTLGEVAPVWVPDSQAPNCMKCEARFTFTKRRHHCRACGKVFCASCCSLKCKLL
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 YLE-KEARVCVVCYETISKAQAFERMMSPTGSNLKSNHSDECTTVQPPQENQTSSIPSPA
:.. :::::::.: :: ...::
CCDS56 YMDRKEARVCVIC------------------------HSVLMNVAQP-------------
750 760
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TLPVSALKQPGVEGLCSKEQKRVWFADGILPNGEVADTTKLS-SGSKRCSEDFSPLSPDV
.::.::::::::::::::::..::. .:..
CCDS56 -----------------REQRRVWFADGILPNGEVADAAKLTMNGTS-------------
770 780 790
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 PMTVNTVDHSHSTTVEKPNNETGDITRNEIIQSPISQVPSVEKLSMNTGNEGLPTSGSFT
...:. ::. . :: . ::. :. . . :::.:
CCDS56 --SAGTLAVSHDPV--KP-----------VTTSPL---PAETDICL--------FSGSIT
800 810 820
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LDDDVFAETEEPSSPTGVLVNSNLPIASISDYRLLCDINKYVCNKISLLPNDEDSLPPLL
. .::.: .: :.: ::.:::.:
CCDS56 ----------QVGSPVGSAMN--------------------------LIP--EDGLPPIL
830 840
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 VASGEKGSVPVVEEHPSHEQIILLLEGEGFHPVTFVLNANLLVNVKFIFYSSDKYWYFST
...: ::. .:::.::. ... :: : :..:::::::: ::.. : . : : :.:
CCDS56 ISTGVKGDY-AVEEKPSQISVMQQLEDGGPDPLVFVLNANLLSMVKIVNYVNRKCWCFTT
850 860 870 880 890 900
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 NGLHGLGQAEIIILLLCLPNEDTIPKDIFRLFITIYKDALKGKYIENLDNITFTESFLSS
.:.:..::.::.::: :::.: .::::: :. .:.::: :. . :: . :..:::.:
CCDS56 KGMHAVGQSEIVILLQCLPDEKCLPKDIFNHFVQLYRDALAGNVVSNLGHSFFSQSFLGS
910 920 930 940 950 960
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 KDHGGFLFITPTFQKLDDLSLPSNPFLCGILIQKLEIPWAKVFPMRLMLRLGAEYKAYPA
:.:::::..: :.:.:.:: ::. :.: :::::: : :::::::.::::::::::. ::
CCDS56 KEHGGFLYVTSTYQSLQDLVLPTPPYLFGILIQKWETPWAKVFPIRLMLRLGAEYRLYPC
970 980 990 1000 1010 1020
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 PLTSIRGRKPLFGEIGHTIMNLLVDLRNYQYTLHNIDQLLIHMEMGKSCIKIPRKKYSDV
:: :.: ::::::: ::::::::.:.::::::: .. :.. ::. :. :::: ..:...
CCDS56 PLFSVRFRKPLFGETGHTIMNLLADFRNYQYTLPVVQGLVVDMEVRKTSIKIPSNRYNEM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 MKVLNSSNEHVISIGASFSTEADSHLVCIQND-GIYETQANSATGHPRKVTGASFVVFNG
::..:.:::::.. :: :. .:::::::.::: : :.::: : ..::::::::: ::.:
CCDS56 MKAMNKSNEHVLAGGACFNEKADSHLVCVQNDDGNYQTQAISIHNQPRKVTGASFFVFSG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 ALKTSSGFLAKSSIVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDAVDLREYVDIC
:::.:::.::::::::::.::::: :.:..:: ::::.::: :::::.:: . .:.. :
CCDS56 ALKSSSGYLAKSSIVEDGVMVQITAENMDSLRQALREMKDFTITCGKADAEEPQEHIHIQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 WVDAEEKGNKGVISSVDGISLQGFPSEKIKLEADFETDEKIVKCTEVFYFLKDQDLSILS
::: ... .:::.: .:: :.. . . :: ...... :... ::::.. .:.. . ::
CCDS56 WVDDDKNVSKGVVSPIDGKSMETITNVKIFHGSEYKANGKVIRWTEVFFLENDDQHNCLS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 TSYQFAK---EIAMACSAALCPHLKTLKSNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQAGSEGQLLPQH
. .. ..: : ::::::: :: .::.:.::::..:.:.: .::::.:: ::..
CCDS56 DPADHSRLTEHVAKAFCLALCPHLKLLKEDGMTKLGLRVTLDSDQVGYQAGSNGQPLPSQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1510 1520 1530
pF1KA0 YLNDLDSALIPVIHGGTSN-SSLPLEIELVFFIIEHLF
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