Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0296
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0296, 1829 aa
1>>>pF1KA0296 1829 - 1829 aa - 1829 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9645+/-0.00114; mu= 8.8639+/- 0.067
mean_var=330.1259+/-78.066, 0's: 0 Z-trim(112.6): 647 B-trim: 774 in 1/50
Lambda= 0.070589
statistics sampled from 12501 (13304) to 12501 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.409), width: 16
Scan time: 6.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10702.1 ZNF646 gene_id:9726|Hs108|chr16 (1832) 12751 1314.6 0
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 597 76.4 5e-13
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 541 70.7 2.5e-11
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 541 70.8 2.7e-11
>>CCDS10702.1 ZNF646 gene_id:9726|Hs108|chr16 (1832 aa)
initn: 12751 init1: 12751 opt: 12751 Z-score: 7032.9 bits: 1314.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12751; 100.0% identity (100.0% similar) in 1793 aa overlap (1-1793:1-1793)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MEDTPPSLSCSDCQRHFPSLPELSRHRELLHPSPNQDSEEADSIPRPYRCQQCGRGYRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MEDTPPSLSCSDCQRHFPSLPELSRHRELLHPSPNQDSEEADSIPRPYRCQQCGRGYRHP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GSLVNHRRTHETGLFPCTTCGKDFSNPMALKSHMRTHAPEGRRRHRPPRPKEATPHLQGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSLVNHRRTHETGLFPCTTCGKDFSNPMALKSHMRTHAPEGRRRHRPPRPKEATPHLQGE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 TVSTDSWGQRLGSSEGWENQTKHTEETPDCESVPDPRAASGTWEDLPTRQREGLASHPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TVSTDSWGQRLGSSEGWENQTKHTEETPDCESVPDPRAASGTWEDLPTRQREGLASHPGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EDGADGWGPSTNSARAPPLPIPASSLLSNLEQYLAESVVNFTGGQEPTQSPPAEEERRYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EDGADGWGPSTNSARAPPLPIPASSLLSNLEQYLAESVVNFTGGQEPTQSPPAEEERRYK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 CSQCGKTYKHAGSLTNHRQSHTLGIYPCAICFKEFSNLMALKNHSRLHAQYRPYHCPHCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CSQCGKTYKHAGSLTNHRQSHTLGIYPCAICFKEFSNLMALKNHSRLHAQYRPYHCPHCP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RVFRLPRELLEHQQSHEGERQEPRWEEKGMPTTNGHTDESSQDQLPSAQMLNGSAELSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVFRLPRELLEHQQSHEGERQEPRWEEKGMPTTNGHTDESSQDQLPSAQMLNGSAELSTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GELEDSGLEEYRPFRCGDCGRTYRHAGSLINHRKSHQTGVYPCSLCSKQLFNAAALKNHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GELEDSGLEEYRPFRCGDCGRTYRHAGSLINHRKSHQTGVYPCSLCSKQLFNAAALKNHV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RAHHRPRQGVGENGQPSVPPAPLLLAETTHKEEEDPTTTLDHRPYKCSECGRAYRHRGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RAHHRPRQGVGENGQPSVPPAPLLLAETTHKEEEDPTTTLDHRPYKCSECGRAYRHRGSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VNHRHSHRTGEYQCSLCPRKYPNLMALRNHVRVHCKAARRSADIGAEGAPSHLKVELPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VNHRHSHRTGEYQCSLCPRKYPNLMALRNHVRVHCKAARRSADIGAEGAPSHLKVELPPD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PVEAEAAPHTDQDHVCKHEEEATDITPAADKTAAHICSICGLLFEDAESLERHGLTHGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PVEAEAAPHTDQDHVCKHEEEATDITPAADKTAAHICSICGLLFEDAESLERHGLTHGAG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 EKENSRTETTMSPPRAFACRDCGKSYRHSGSLINHRQTHQTGDFSCGACAKHFHTMAAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EKENSRTETTMSPPRAFACRDCGKSYRHSGSLINHRQTHQTGDFSCGACAKHFHTMAAMK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 NHLRRHSRRRSRRHRKRAGGASGGREAKLLAAESWTRELEDNEGLESPQDPSGESPHGAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NHLRRHSRRRSRRHRKRAGGASGGREAKLLAAESWTRELEDNEGLESPQDPSGESPHGAE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GNLESDGDCLQAESEGDKCGLERDETHFQGDKESGGTGEGLERKDASLLDNLDIPGEEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GNLESDGDCLQAESEGDKCGLERDETHFQGDKESGGTGEGLERKDASLLDNLDIPGEEGG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GTHFCDSLTGVDEDQKPATGQPNSSSHSANAVTGWQAGAAHTCSDCGHSFPHATGLLSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTHFCDSLTGVDEDQKPATGQPNSSSHSANAVTGWQAGAAHTCSDCGHSFPHATGLLSHR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 PCHPPGIYQCSLCPKEFDSLPALRSHFQNHRPGEATSAQPFLCCLCGMIFPGRAGYRLHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PCHPPGIYQCSLCPKEFDSLPALRSHFQNHRPGEATSAQPFLCCLCGMIFPGRAGYRLHR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RQAHSSSGMTEGSEEEGEEEGVAEAAPARSPPLQLSEAELLNQLQREVEALDSAGYGHIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RQAHSSSGMTEGSEEEGEEEGVAEAAPARSPPLQLSEAELLNQLQREVEALDSAGYGHIC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 GCCGQTYDDLGSLERHHQSQSSGTTADKAPSPLGVAGDAMEMVVDSVLEDIVNSVSGEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GCCGQTYDDLGSLERHHQSQSSGTTADKAPSPLGVAGDAMEMVVDSVLEDIVNSVSGEGG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 DAKSQEGAGTPLGDSLCIQGGESLLEAQPRPFRCNQCGKTYRHGGSLVNHRKIHQTGDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DAKSQEGAGTPLGDSLCIQGGESLLEAQPRPFRCNQCGKTYRHGGSLVNHRKIHQTGDFL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 CPVCSRCYPNLAAYRNHLRNHPRCKGSEPQVGPIPEAAGSSELQVGPIPEGGSNKPQHMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CPVCSRCYPNLAAYRNHLRNHPRCKGSEPQVGPIPEAAGSSELQVGPIPEGGSNKPQHMA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 EEGPGQAEVEKLQEELKVEPLEEVARVKEEVWEETTVKGEEIEPRLETAEKGCQTEASSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EEGPGQAEVEKLQEELKVEPLEEVARVKEEVWEETTVKGEEIEPRLETAEKGCQTEASSE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 RPFSCEVCGRSYKHAGSLINHRQSHQTGHFGCQACSKGFSNLMSLKNHRRIHADPRRFRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RPFSCEVCGRSYKHAGSLINHRQSHQTGHFGCQACSKGFSNLMSLKNHRRIHADPRRFRC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 SECGKAFRLRKQLASHQRVHMERRGGGGTRKATREDRPFRCGQCGRTYRHAGSLLNHRRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SECGKAFRLRKQLASHQRVHMERRGGGGTRKATREDRPFRCGQCGRTYRHAGSLLNHRRS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 HETGQYSCPTCPKTYSNRMALKDHQRLHSENRRRRAGRSRRTAVRCALCGRSFPGRGSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HETGQYSCPTCPKTYSNRMALKDHQRLHSENRRRRAGRSRRTAVRCALCGRSFPGRGSLE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 RHLREHEETEREPANGQGGLDGTAASEANLTGSQGLETQLGGAEPVPHLEDGVPRPGERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RHLREHEETEREPANGQGGLDGTAASEANLTGSQGLETQLGGAEPVPHLEDGVPRPGERS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 QSPIRAASSEAPEPLSWGAGKAGGWPVGGGLGNHSGGWVPQFLTRSEEPEDSVHRSPCHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QSPIRAASSEAPEPLSWGAGKAGGWPVGGGLGNHSGGWVPQFLTRSEEPEDSVHRSPCHA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 GDCQLNGPTLSHMDSWDNRDNSSQLQPGSHSSCSQCGKTYCQSGSLLNHNTNKTDRHYCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GDCQLNGPTLSHMDSWDNRDNSSQLQPGSHSSCSQCGKTYCQSGSLLNHNTNKTDRHYCL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 LCSKEFLNPVATKSHSHNHIDAQTFACPDCGKAFESHQELASHLQAHARGHSQVPAQMEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LCSKEFLNPVATKSHSHNHIDAQTFACPDCGKAFESHQELASHLQAHARGHSQVPAQMEE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 ARDPKAGTGEDQVVLPGQGKAQEAPSETPRGPGESVERARGGQAVTSMAAEDKERPFRCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ARDPKAGTGEDQVVLPGQGKAQEAPSETPRGPGESVERARGGQAVTSMAAEDKERPFRCT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 QCGRSYRHAGSLLNHQKAHTTGLYPCSLCPKLLPNLLSLKNHSRTHTDPKRHCCSICGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QCGRSYRHAGSLLNHQKAHTTGLYPCSLCPKLLPNLLSLKNHSRTHTDPKRHCCSICGKA
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 FRTAARLEGHGRVHAPREGPFTCPHCPRHFRRRISFVQHQQQHQEEWTVAGSGRGHEGSQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FRTAARLEGHGRVHAPREGPFTCPHCPRHFRRRISFVQHQQQHQEEWTVAGSGAPVAPVT
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820
pF1KA0 EEVGTQWRGKSSPKVGGGARSERREPRGF
CCDS10 GRGDLPLPPPPTPTTPLLDPSPQWPADLSFSL
1810 1820 1830
>>CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 (855 aa)
initn: 660 init1: 244 opt: 597 Z-score: 347.4 bits: 76.4 E(32554): 5e-13
Smith-Waterman score: 882; 27.1% identity (52.9% similar) in 741 aa overlap (1052-1783:242-850)
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 AKSQEGAGTPLGDSLCIQGGESLLEAQPRPFRCNQCGKTYRHGGSLVNHRKIHQTGDFLC
. : .:::.. . .:: ::...: :
CCDS46 AHYSCGESMKHFSTKHILSQHQRLLTREECYVCCECGKSFSKYASLSNHQRVHTEKKHEC
220 230 240 250 260 270
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 PVCSRCYPNLAAYRNHLRNHPRCKGSEPQVGP-IPEAAGSSELQVGPIPEGGSNKPQHMA
:.. . . ... :: : : . : . : . . .. :. : . : ..: . .
CCDS46 GECGKSFSKYVSFSNHQRVHTEKKHECGECGKSFSKYVSFSNHQR--VHTG--KRPYECG
280 290 300 310 320
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 EEGPGQAEVEKLQEELKVEPLEEVARVKEEVWEETTVKGEEIEPRLETAEKGCQTEASSE
: : . .. ..... .:. :. : :. . . ... : ...
CCDS46 ECGKSFSKYASFSNHQRVHT--------EKKHYECGECGKSFSKYVSFSNH--QRVHTGK
330 340 350 360 370
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 RPFSCEVCGRSYKHAGSLINHRQSH-QTGHFGCQACSKGFSNLMSLKNHRRIHADPRRFR
::. : ::.:... .:. ::.. : . :. : :.:.::. :: .:.:.:. . .
CCDS46 RPYECGECGKSFSKYASFSNHQRVHTDKKHYECGECGKSFSQKSSLIQHQRFHTGEKPYG
380 390 400 410 420 430
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 CSECGKAFRLRKQLASHQRVHMERRGGGGTRKATREDRPFRCGQCGRTYRHAGSLLNHRR
: ::::.: . .: :::::: .: .:::.::.: ... : ::..:.:
CCDS46 CEECGKSFSSEGHLRSHQRVH----AG---------ERPFKCGECVKSFSHKRSLVHHQR
440 450 460 470 480
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 SHETGQ--YSCPTCPKTYSNRMALKDHQRLHSENRRRRAGRSRRTAVRCALCGRSFPGRG
: .:. :.: : :..:.. : :::.:. : .:. ::.:: ..:
CCDS46 VH-SGERPYQCGECGKSFSQKGNLVLHQRVHTGAR----------PYECGECGKSFSSKG
490 500 510 520 530
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA0 SLERHLREHEETEREPANGQGGLDGTAASEANLTGSQGLETQLGGAEPVPHLEDGVPRPG
:::.:.. . . : : . :. :. :. .. : ::
CCDS46 ----HLRNHQQIHTGDRLYECGECGKSFSHK---GTLILHQRV-------H-----PR--
540 550 560 570
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 ERSQSPIRAASSEAPEPLSWGAGKAG-GWPVGGGLGNHSGGWVPQFLTRSEEPEDSVHRS
::: .: :. : .. : : .: : . .:.: .
CCDS46 ERS----------------YGCGECGKSFSSIGHLRSH------QRVHTGERPYE-----
580 590 600
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 PCHAGDCQLNGPTLSHMDSWDNRDNSSQLQPGSHS-SCSQCGKTYCQSGSLLNHN-TNKT
: :.: : ..:: : ... ... : . .:..:::.. ..: : ::. .. :
CCDS46 -C--GEC---GKSFSHKRSLVHHQ---RMHTGERPYKCGDCGKSFNEKGHLRNHQRVHTT
610 620 630 640 650
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 DRHY-CLLCSKEFLNPVATKSHSHNHIDAQTFACPDCGKAFESHQELASHLQAHARGHSQ
.: . : :.: : . :.:.: . ..: .::: :... ::: .: : :.
CCDS46 ERPFKCGECGKCFSHKGNLILHQHGHTGERPYVCRECGKLFKKK----SHLLVHQRIHN-
660 670 680 690 700 710
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 VPAQMEEARDPKAGTGEDQVVLPGQGKAQEAPSETPRGPGESVERARGGQAVTSMAAEDK
:: . : :: .. :. . . . : ..
CCDS46 ---------------GE-------KPYACEACQKFFRNKYQLIAHQR---------VHTG
720 730 740
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KA0 ERPFRCTQCGRSYRHAGSLLNHQKAHT-TGLYPCSLCPKLLPNLLSLKNHSRTHTDPKRH
:::..:..::.:. :.... :.. :: : :: : : . . :. .:.:.:: : .
CCDS46 ERPYECNDCGKSFTHSSTFCVHKRIHTGEKPYECSECGKSFAESSSFTKHKRVHTGEKPY
750 760 770 780 790 800
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KA0 CCSICGKAFRTAARLEGHGRVHAPREGPFTCPHCPRHFRRRISFVQHQQQHQEEWTVAGS
:: :::.: .. : : :::. : :. : .: . : .. .. ::..:
CCDS46 ECSECGKSFAESSSLTKHKRVHTG-EKPYKCEKCGKLFNKKSHLLVHQSSHWRKAI
810 820 830 840 850
1800 1810 1820
pF1KA0 GRGHEGSQEEVGTQWRGKSSPKVGGGARSERREPRGF
>>CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 (808 aa)
initn: 367 init1: 164 opt: 541 Z-score: 316.8 bits: 70.7 E(32554): 2.5e-11
Smith-Waterman score: 761; 28.3% identity (50.5% similar) in 598 aa overlap (1201-1786:199-702)
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 VWEETTVKGEEIEPRLETAEKGCQTEASSERPFSCEVCGRSYKHAGSLINHRQSHQTGH-
.:..:.:::: ... ..:.:::.:: ::
CCDS82 TEKPYRCNESGKAFHRGSLLTVHQIVHTRGKPYQCDVCGRIFRQNSDLVNHRRSH-TGDK
170 180 190 200 210 220
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 -FGCQACSKGFSNLMSLKNHRRIHADPRRFRCSECGKAFRLRKQLASHQRVHMERRGGGG
. :. :.:.::. : :.:::. . ..:..::: : ..::.:: :: :
CCDS82 PYICNECGKSFSKSSHLAVHQRIHTGEKPYKCNRCGKCFSQSSSLATHQTVHT---G---
230 240 250 260 270 280
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA0 TRKATREDRPFRCGQCGRTYRHAGSLLNHRRSHETGQ-YSCPTCPKTYSNRMALKDHQRL
:.:..:..::.:... .:: :. : . :.: .: :.. . : :: .
CCDS82 -------DKPYKCNECGKTFKRNSSLTAHHIIHAGKKPYTCDVCGKVFYQNSQLVRHQII
290 300 310 320 330
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA0 HSENRRRRAGRSRRTAVRCALCGRSFPGRGSLERHLREHEETEREPANGQGGLDGTAASE
:. : .: .: ::. : :. : : : : . : : . ...
CCDS82 HT-------G---ETPYKCNECGKVFFQRSRLAGHRRIHTGEKPYKCNECGKV---FSQH
340 350 360 370 380
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KA0 ANLTGSQGLETQLGGAEPVPHLEDGVPRP-GERSQSPIRAASSEAPEPLSWGAGKAGGWP
..:. : ..: : .: : : : : ..: : .
CCDS82 SHLAVHQRVHT---GEKPYKCNECGKAFNWGSLLTVHQRIHTGEKPYKCN----------
390 400 410 420
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KA0 VGGGLGNHSGGWVPQFLTRSEEPEDSVHRSPCHAGD----CQLNGPTLSHMDSWDNRDNS
: : . :. ::.. ::: ::.:. :. : ...... ..
CCDS82 VCGKVFNY-GGYL------------SVHMR-CHTGEKPLHCNKCGMVFTYYSCLARHQ--
430 440 450 460 470
1530 1540 1550 1560 1570
pF1KA0 SQLQPGSHS-SCSQCGKTYCQSGSLLNHNTNKTDRH--YCLLCSKEFLNPVATKSHSHNH
... : . .:. :::.. .::.: : ..: .. : :.: : : . :
CCDS82 -RMHTGEKPYKCNVCGKVFIDSGNLSIHRRSHTGEKPFQCNECGKVFSYYSCLARHRKIH
480 490 500 510 520 530
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KA0 IDAQTFACPDCGKAFESHQELASHLQAHARGHSQVPAQMEEARDPKAGTGEDQVVLPGQG
. . : :::::. ... :..:: : :::. :
CCDS82 TGEKPYKCNDCGKAYTQRSSLTKHLVIH--------------------TGENPYHCNEFG
540 550 560 570
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KA0 KAQEAPSETPRGPGESVERARGGQAVTSMAAEDKERPFRCTQCGRSYRHAGSLLNHQKAH
.: :. : .: : :.: .:..:::.. : ::. ::. :
CCDS82 EAFIQSSKLAR-----YHRNPTG-----------EKPHKCSECGRTFSHKTSLVYHQRRH
580 590 600 610
1700 1710 1720 1730 1740 1750
pF1KA0 TTGL-YPCSLCPKLLPNLLSLKNHSRTHTDPKRHCCSICGKAFRTAARLEGHGRVHAPRE
: . : : : :.. . .: : : :: : . :. :::.:: . : : .:. :
CCDS82 TGEMPYKCIECGKVFNSTTTLARHRRIHTGEKPYKCNECGKVFRYRSGLARHWSIHTG-E
620 630 640 650 660 670
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA0 GPFTCPHCPRHFRRRISFVQHQQQHQEEWTVAGSGRGHEGSQEEVGTQWRGKSSPKVGGG
:. : .: . :: : ...::..: :
CCDS82 KPYKCNECGKAFRVRSILLNHQMMHTGEKPYKCNECGKAFIERSNLVYHQRNHTGEKPYK
680 690 700 710 720 730
>>CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 (924 aa)
initn: 367 init1: 164 opt: 541 Z-score: 316.2 bits: 70.8 E(32554): 2.7e-11
Smith-Waterman score: 761; 28.3% identity (50.5% similar) in 598 aa overlap (1201-1786:315-818)
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 VWEETTVKGEEIEPRLETAEKGCQTEASSERPFSCEVCGRSYKHAGSLINHRQSHQTGH-
.:..:.:::: ... ..:.:::.:: ::
CCDS46 TEKPYRCNESGKAFHRGSLLTVHQIVHTRGKPYQCDVCGRIFRQNSDLVNHRRSH-TGDK
290 300 310 320 330 340
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 -FGCQACSKGFSNLMSLKNHRRIHADPRRFRCSECGKAFRLRKQLASHQRVHMERRGGGG
. :. :.:.::. : :.:::. . ..:..::: : ..::.:: :: :
CCDS46 PYICNECGKSFSKSSHLAVHQRIHTGEKPYKCNRCGKCFSQSSSLATHQTVHT---G---
350 360 370 380 390
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA0 TRKATREDRPFRCGQCGRTYRHAGSLLNHRRSHETGQ-YSCPTCPKTYSNRMALKDHQRL
:.:..:..::.:... .:: :. : . :.: .: :.. . : :: .
CCDS46 -------DKPYKCNECGKTFKRNSSLTAHHIIHAGKKPYTCDVCGKVFYQNSQLVRHQII
400 410 420 430 440 450
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA0 HSENRRRRAGRSRRTAVRCALCGRSFPGRGSLERHLREHEETEREPANGQGGLDGTAASE
:. : .: .: ::. : :. : : : : . : : . ...
CCDS46 HT-------G---ETPYKCNECGKVFFQRSRLAGHRRIHTGEKPYKCNECGKV---FSQH
460 470 480 490
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KA0 ANLTGSQGLETQLGGAEPVPHLEDGVPRP-GERSQSPIRAASSEAPEPLSWGAGKAGGWP
..:. : ..: : .: : : : : ..: : .
CCDS46 SHLAVHQRVHT---GEKPYKCNECGKAFNWGSLLTVHQRIHTGEKPYKCN----------
500 510 520 530 540
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KA0 VGGGLGNHSGGWVPQFLTRSEEPEDSVHRSPCHAGD----CQLNGPTLSHMDSWDNRDNS
: : . :. ::.. ::: ::.:. :. : ...... ..
CCDS46 VCGKVFNY-GGYL------------SVHMR-CHTGEKPLHCNKCGMVFTYYSCLARHQ--
550 560 570 580
1530 1540 1550 1560 1570
pF1KA0 SQLQPGSHS-SCSQCGKTYCQSGSLLNHNTNKTDRH--YCLLCSKEFLNPVATKSHSHNH
... : . .:. :::.. .::.: : ..: .. : :.: : : . :
CCDS46 -RMHTGEKPYKCNVCGKVFIDSGNLSIHRRSHTGEKPFQCNECGKVFSYYSCLARHRKIH
590 600 610 620 630 640
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KA0 IDAQTFACPDCGKAFESHQELASHLQAHARGHSQVPAQMEEARDPKAGTGEDQVVLPGQG
. . : :::::. ... :..:: : :::. :
CCDS46 TGEKPYKCNDCGKAYTQRSSLTKHLVIH--------------------TGENPYHCNEFG
650 660 670 680
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KA0 KAQEAPSETPRGPGESVERARGGQAVTSMAAEDKERPFRCTQCGRSYRHAGSLLNHQKAH
.: :. : .: : :.: .:..:::.. : ::. ::. :
CCDS46 EAFIQSSKLAR-----YHRNPTG-----------EKPHKCSECGRTFSHKTSLVYHQRRH
690 700 710 720 730
1700 1710 1720 1730 1740 1750
pF1KA0 TTGL-YPCSLCPKLLPNLLSLKNHSRTHTDPKRHCCSICGKAFRTAARLEGHGRVHAPRE
: . : : : :.. . .: : : :: : . :. :::.:: . : : .:. :
CCDS46 TGEMPYKCIECGKVFNSTTTLARHRRIHTGEKPYKCNECGKVFRYRSGLARHWSIHTG-E
740 750 760 770 780 790
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA0 GPFTCPHCPRHFRRRISFVQHQQQHQEEWTVAGSGRGHEGSQEEVGTQWRGKSSPKVGGG
:. : .: . :: : ...::..: :
CCDS46 KPYKCNECGKAFRVRSILLNHQMMHTGEKPYKCNECGKAFIERSNLVYHQRNHTGEKPYK
800 810 820 830 840 850
1829 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 09:12:55 2016 done: Sat Nov 5 09:12:56 2016
Total Scan time: 6.880 Total Display time: 0.310
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]