Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0294
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0294, 1344 aa
1>>>pF1KA0294 1344 - 1344 aa - 1344 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8046+/-0.000985; mu= 11.6634+/- 0.059
mean_var=149.5898+/-30.645, 0's: 0 Z-trim(109.5): 95 B-trim: 5 in 1/49
Lambda= 0.104863
statistics sampled from 10806 (10902) to 10806 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16
Scan time: 4.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34794.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1344) 8918 1362.1 0
CCDS78296.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1368) 8887 1357.4 0
CCDS78297.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1306) 6762 1035.9 0
CCDS182.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1279) 2353 368.9 5e-101
CCDS30617.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1240) 2126 334.5 1.1e-90
CCDS8221.1 ARHGEF17 gene_id:9828|Hs108|chr11 (2063) 530 93.2 7.8e-18
CCDS3220.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 883) 406 74.2 1.7e-12
CCDS58860.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 914) 406 74.2 1.8e-12
>>CCDS34794.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1344 aa)
initn: 8918 init1: 8918 opt: 8918 Z-score: 7294.5 bits: 1362.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8918; 100.0% identity (100.0% similar) in 1344 aa overlap (1-1344:1-1344)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDQREPLPPAPAENEMKYDTNNNEEEEGEQFDFDSGDEIPEADRQAPSAPETGGAGASEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MDQREPLPPAPAENEMKYDTNNNEEEEGEQFDFDSGDEIPEADRQAPSAPETGGAGASEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PAPTGGEDGAGAETTPVAEPTKLVLPMKVNPYSVIDITPFQEDQPPTPVPSAEEENVGLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PAPTGGEDGAGAETTPVAEPTKLVLPMKVNPYSVIDITPFQEDQPPTPVPSAEEENVGLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VPCGYLVPVPCGYAVPSNLPLLLPAYSSPVIICATSLDEEETPEVTEDRQPNSLSSEEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VPCGYLVPVPCGYAVPSNLPLLLPAYSSPVIICATSLDEEETPEVTEDRQPNSLSSEEPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TSEDQVGREDSALARWAADPANTAWMENPEEAIYDDVPRENSDSEPDEMIYDDVENGDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSEDQVGREDSALARWAADPANTAWMENPEEAIYDDVPRENSDSEPDEMIYDDVENGDEG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGIPRSFLRSNHKKQLSHDLTRLKEHYEKKMRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGIPRSFLRSNHKKQLSHDLTRLKEHYEKKMRDL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 MASTVGVVEIQQLRQKHELKMQKLVKAAKDGTKDGLERTRAAVKRGRSFIRTKSLIAQDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MASTVGVVEIQQLRQKHELKMQKLVKAAKDGTKDGLERTRAAVKRGRSFIRTKSLIAQDH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 RSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVDALKRILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVDALKRILE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 FSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQEASPDRTTLYSLMMKPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQEASPDRTTLYSLMMKPIQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEVKQIAKAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEVKQIAKAI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSHD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNLNQSVAHDWTSGLQRLILKKEDEIRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNLNQSVAHDWTSGLQRLILKKEDEIRA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 ADCCRIQLQLPGKQDKSGRPTFFTAVFNTFTPAIKESWVNSLQMAKLALEEENHMGWFCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ADCCRIQLQLPGKQDKSGRPTFFTAVFNTFTPAIKESWVNSLQMAKLALEEENHMGWFCV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 EDDGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQEFKIECAAYNPEPYLNNESQPDSFSTAHGFLWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EDDGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQEFKIECAAYNPEPYLNNESQPDSFSTAHGFLWI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 GSCTHQMGQIAIVSFQNSTPKVIECFNVESRILCMLYVPVEEKRREPGAPPDPETPAVRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSCTHQMGQIAIVSFQNSTPKVIECFNVESRILCMLYVPVEEKRREPGAPPDPETPAVRA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 SDVPTICVGTEEGSISIYKSSQGSKKVRLQHFFTPEKSTVMSLACTSQSLYAGLVNGAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SDVPTICVGTEEGSISIYKSSQGSKKVRLQHFFTPEKSTVMSLACTSQSLYAGLVNGAVA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 SYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVLPVRSLLMMEDTLWAASGGQVFIISVETHAVEGQLEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVLPVRSLLMMEDTLWAASGGQVFIISVETHAVEGQLEAH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 QEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETLKHLQDINIATPVHNMLPGHQRLSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETLKHLQDINIATPVHNMLPGHQRLSVT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 SLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGRGMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGRGMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 KDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDALPSGGAGSSLSQGDPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDALPSGGAGSSLSQGDPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 GSLSLSHGSSSLEHRSEDSTIYDLLKDPVSLRSKARRAKKAKASSALVVCGGQGHRRVHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSLSLSHGSSSLEHRSEDSTIYDLLKDPVSLRSKARRAKKAKASSALVVCGGQGHRRVHR
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340
pF1KA0 KARQPHQEELAPTVMVWQIPLLNI
::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KARQPHQEELAPTVMVWQIPLLNI
1330 1340
>>CCDS78296.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1368 aa)
initn: 6320 init1: 6320 opt: 8887 Z-score: 7269.1 bits: 1357.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8887; 99.9% identity (99.9% similar) in 1345 aa overlap (1-1344:25-1368)
10 20 30
pF1KA0 MDQREPLPPAPAENEMKYDTNNNEEEEGEQFDFDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MRPPGFLSRAPSLNRAERGIWSCSMDQREPLPPAPAENEMKYDTNNNEEEEGEQFDFDSG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 DEIPEADRQAPSAPETGGAGASEAPAPTGGEDGAGAETTPVAEPTKLVLPMKVNPYSVID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DEIPEADRQAPSAPETGGAGASEAPAPTGGEDGAGAETTPVAEPTKLVLPMKVNPYSVID
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 ITPFQEDQPPTPVPSAEEENVGLHVPCGYLVPVPCGYAVPSNLPLLLPAYSSPVIICATS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ITPFQEDQPPTPVPSAEEENVGLHVPCGYLVPVPCGYAVPSNLPLLLPAYSSPVIICATS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 LDEE-ETPEVTEDRQPNSLSSEEPPTSEDQVGREDSALARWAADPANTAWMENPEEAIYD
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LDEEAETPEVTEDRQPNSLSSEEPPTSEDQVGREDSALARWAADPANTAWMENPEEAIYD
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 DVPRENSDSEPDEMIYDDVENGDEGGNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGIPRSFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DVPRENSDSEPDEMIYDDVENGDEGGNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGIPRSFLR
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SNHKKQLSHDLTRLKEHYEKKMRDLMASTVGVVEIQQLRQKHELKMQKLVKAAKDGTKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SNHKKQLSHDLTRLKEHYEKKMRDLMASTVGVVEIQQLRQKHELKMQKLVKAAKDGTKDG
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 LERTRAAVKRGRSFIRTKSLIAQDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LERTRAAVKRGRSFIRTKSLIAQDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQV
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 VRRYILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VRRYILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 FQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFL
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 EFLKQEQEASPDRTTLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELET
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EFLK-EQEASPDRTTLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELET
550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 LAEKLNERKRDADQRCEVKQIAKAINERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LAEKLNERKRDADQRCEVKQIAKAINERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVK
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 TKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSHDSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSHDSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHS
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 RHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNL
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 NQSVAHDWTSGLQRLILKKEDEIRAADCCRIQLQLPGKQDKSGRPTFFTAVFNTFTPAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NQSVAHDWTSGLQRLILKKEDEIRAADCCRIQLQLPGKQDKSGRPTFFTAVFNTFTPAIK
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 ESWVNSLQMAKLALEEENHMGWFCVEDDGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQEFKIECAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ESWVNSLQMAKLALEEENHMGWFCVEDDGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQEFKIECAA
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 YNPEPYLNNESQPDSFSTAHGFLWIGSCTHQMGQIAIVSFQNSTPKVIECFNVESRILCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 YNPEPYLNNESQPDSFSTAHGFLWIGSCTHQMGQIAIVSFQNSTPKVIECFNVESRILCM
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 LYVPVEEKRREPGAPPDPETPAVRASDVPTICVGTEEGSISIYKSSQGSKKVRLQHFFTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LYVPVEEKRREPGAPPDPETPAVRASDVPTICVGTEEGSISIYKSSQGSKKVRLQHFFTP
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 EKSTVMSLACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVLPVRSLLMMEDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EKSTVMSLACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVLPVRSLLMMEDTL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 WAASGGQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 WAASGGQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETL
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 KHLQDINIATPVHNMLPGHQRLSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KHLQDINIATPVHNMLPGHQRLSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGR
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 GMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDALPSGGAGSSLSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDALPSGGAGSSLSQG
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 DPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHGSSSLEHRSEDSTIYDLLKDPVSLRSKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHGSSSLEHRSEDSTIYDLLKDPVSLRSKA
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA0 RRAKKAKASSALVVCGGQGHRRVHRKARQPHQEELAPTVMVWQIPLLNI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RRAKKAKASSALVVCGGQGHRRVHRKARQPHQEELAPTVMVWQIPLLNI
1320 1330 1340 1350 1360
>>CCDS78297.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1306 aa)
initn: 7856 init1: 6762 opt: 6762 Z-score: 5531.9 bits: 1035.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8571; 97.0% identity (97.0% similar) in 1345 aa overlap (1-1344:1-1306)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDQREPLPPAPAENEMKYDTNNNEEEEGEQFDFDSGDEIPEADRQAPSAPETGGAGASEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MDQREPLPPAPAENEMKYDTNNNEEEEGEQFDFDSGDEIPEADRQAPSAPETGGAGASEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PAPTGGEDGAGAETTPVAEPTKLVLPMKVNPYSVIDITPFQEDQPPTPVPSAEEENVGLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PAPTGGEDGAGAETTPVAEPTKLVLPMKVNPYSVIDITPFQEDQPPTPVPSAEEENVGLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KA0 VPCGYLVPVPCGYAVPSNLPLLLPAYSSPVIICATSLDEE-ETPEVTEDRQPNSLSSEEP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS78 VPCGYLVPVPCGYAVPSNLPLLLPAYSSPVIICATSLDEEAETPEVTEDRQPNSLSSEEP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 PTSEDQVGREDSALARWAADPANTAWMENPEEAIYDDVPRENSDSEPDEMIYDDVENGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PTSEDQVGREDSALARWAADPANTAWMENPEEAIYDDVPRENSDSEPDEMIYDDVENGDE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GGNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGIPRSFLRSNHKKQLSHDLTRLKEHYEKKMRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GGNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGIPRSFLRSNHKKQ------------------
250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LMASTVGVVEIQQLRQKHELKMQKLVKAAKDGTKDGLERTRAAVKRGRSFIRTKSLIAQD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ---------------------MQKLVKAAKDGTKDGLERTRAAVKRGRSFIRTKSLIAQD
290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
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CCDS78 HRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVDALKRIL
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
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CCDS78 EQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVA
390 400 410 420 430 440
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CCDS78 SFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQEASPDRTTLYSLMMKPI
450 460 470 480 490 500
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CCDS78 QRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEVKQIAKA
510 520 530 540 550 560
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 INERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSH
570 580 590 600 610 620
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYM
630 640 650 660 670 680
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNLNQSVAHDWTSGLQRLILKKEDEIR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AADCCRIQLQLPGKQDKSGRPTFFTAVFNTFTPAIKESWVNSLQMAKLALEEENHMGWFC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VEDDGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQEFKIECAAYNPEPYLNNESQPDSFSTAHGFLW
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CCDS78 IGSCTHQMGQIAIVSFQNSTPKVIECFNVESRILCMLYVPVEEKRREPGAPPDPETPAVR
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CCDS78 ASDVPTICVGTEEGSISIYKSSQGSKKVRLQHFFTPEKSTVMSLACTSQSLYAGLVNGAV
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pF1KA0 ASYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVLPVRSLLMMEDTLWAASGGQVFIISVETHAVEGQLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ASYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVLPVRSLLMMEDTLWAASGGQVFIISVETHAVEGQLEA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HQEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETLKHLQDINIATPVHNMLPGHQRLSV
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KA0 TSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGRGMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGRGMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEK
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DKDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDALPSGGAGSSLSQGDPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSS
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CCDS78 SGSLSLSHGSSSLEHRSEDSTIYDLLKDPVSLRSKARRAKKAKASSALVVCGGQGHRRVH
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CCDS78 RKARQPHQEELAPTVMVWQIPLLNI
1290 1300
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CCDS18 ADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAERNLLYEDAH
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. . .. . :::::::::: :.: : : . : . : . . .:: :::::::.
CCDS18 RAG-APRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVEVEPAKH-RVSFQPKLSPDLTRLKER
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: . ::..: :: ..:.:..:.. :: .:.::::.:::::::.:: :: : ::..
CCDS18 YARTKRDILALRVGGRDMQELKHKYDCKMTQLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHR
220 230 240 250 260 270
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:..... : ::...:. ..: : : : : ::::::: ::::::.::::.:.:: .
CCDS18 KDVLGD----SEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGS
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::..:::::..:..:: :::::.:: :: ..::.::::::.:::.:::::.:::.::::.
CCDS18 YVESLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDST
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: :::.::::::::::::.::.:::::..:....::.: ::::::::::..: ::::.:
CCDS18 EKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVT
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pF1KA0 LYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQR
::.::.:::::::::::::::::::: .:::::: ::.::::::::::::::.:: :::
CCDS18 LYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQV
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:..:..:....: :::::.::.: :. . . ::::.:::...:.::::::.:::.:.
CCDS18 AEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLV
520 530 540 550 560 570
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::... .:.. .: : . .:..::.. : .:...: :...:: ... : :
CCDS18 CANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHS
580 590 600 610 620 630
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pF1KA0 PESLAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNLNQSVAHD
. : ... ::::.:: .:.:.::.: .:: :. ::: ::..:.:.:::::..::.:
CCDS18 GAKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQD
640 650 660 670 680 690
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pF1KA0 WTSGLQRLILKKEDEIRAADCCRIQLQLPGKQDKSGRPTFFTAVFNTFTPAIKESWVNSL
: .::::. ::.::..:. ::..: :::: :::::: : .:: : .: : :::: :
CCDS18 WCLALQRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRL
700 710 720 730 740 750
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pF1KA0 QMAKLALEEENHMGWFCVEDDGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQEFKIECAAYNPE--P
..::..:.:::. ::.: ..: . :.:. .:.. .. ... ...: :
CCDS18 HLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFWCPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCP
760 770 780 790 800 810
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:. . : : .:.::.:. . : :. : :.. .:.... : . . .::: :.:
CCDS18 LLGFSAV--STSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVKSFPLAAPVLCMEYIP
820 830 840 850 860
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.::. . : :. :. ::::.: ..::: .:.: . . . : .: .
CCDS18 ELEEEAESRDESPTVADPS--ATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQC-LVSCRSPGLQ
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pF1KA0 TVMSLACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGS-WDSE-PQKVIKLGVLPVRSLLMMEDTLW
:. : . : ::: .:..:.: :. : :: : : . .: :::.:: .::..:
CCDS18 PVLCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVW
930 940 950 960 970 980
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:. : .: .. . : . ..::::.:.. ..::. .: :.:.::.::...::::::::.
CCDS18 ASCGPRVTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLE
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KA0 HLQDINIATPVHNMLPGHQRLSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGRG
:::.::::: . .:::...: :::::.:.::: :::. ::.: ::::::.::::.::.:
CCDS18 HLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQGLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKG
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KA0 MVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDA-----LPSGGAGSS
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CCDS18 MVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAE-EDKPDGQAHEPMPDSHVGRE
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KA0 LSQGDPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHGSSSLEHRSEDSTIYDLLKDP-VS
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CCDS18 LTR---KKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAA-LEHSEEDGSIYEMADDPDIW
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KA0 LRSK--ARRAKKAKASSALVVCGGQGHRR----VHRKARQPHQEELAPTVMVWQIPLLNI
.::. :: :.. . :. .. ::::.: . ..:: : :...::.::.
CCDS18 VRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML
1230 1240 1250 1260 1270
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pF1KA0 PTSEDQVGREDSALARWAADPANTAWMENPEEAIYDDVPRENSDS-EPD---EMIYDDVE
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CCDS30 ADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAERNLLYEDAH
100 110 120 130 140 150
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pF1KA0 NGDEGGNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGIPRSFLRSNHKKQLSHDLTRLKEHYEK
. . .. . :::::::::: :.: : : .
CCDS30 RAG-APRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVE-------------------------
160 170 180 190
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pF1KA0 KMRDLMASTVGVVEIQQLRQKHELKMQKLVKAAKDGTKDGLERTRAAVKRGRSFIRTKSL
:: . : . . :: .:.::::.:::::::.:: :: : ::.. :..
CCDS30 ------------VEPAKHRVSFQPKMTQLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDV
200 210 220 230
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pF1KA0 IAQDHRSSLEEEQNLF-IDV-DCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVD
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CCDS30 LGD----SEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVE
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 ALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVSEWDSVEMI
.:::::..:..:: :::::.:: :: ..::.::::::.:::.:::::.:::.::::.: :
CCDS30 SLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKI
300 310 320 330 340 350
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pF1KA0 GDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQEASPDRTTLYS
::.::::::::::::.::.:::::..:....::.: ::::::::::..: ::::.:::.
CCDS30 GDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYG
360 370 380 390 400 410
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pF1KA0 LMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEV
::.:::::::::::::::::::: .:::::: ::.::::::::::::::.:: ::: :.
CCDS30 LMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEI
420 430 440 450 460 470
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pF1KA0 KQIAKAINERY-LNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLMCAT
.:..:....: :::::.::.: :. . . ::::.:::...:.::::::.:::.:.::.
CCDS30 QQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCAN
480 490 500 510 520 530
660 670 680 690 700
pF1KA0 VSSRPSH-------DSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPES
.. .:.. .: : . .:..::.. : .:...: :...:: ... : : .
CCDS30 INFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAK
540 550 560 570 580 590
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pF1KA0 LAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNLNQSVAHDWTS
: ... ::::.:: .:.:.::.: .:: :. ::: ::..:.:.:::::..::.::
CCDS30 KASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCL
600 610 620 630 640 650
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pF1KA0 GLQRLILKKEDEIRAADCCRIQLQLPGKQDKSGRPTFFTAVFNTFTPAIKESWVNSLQMA
.::::. ::.::..:. ::..: :::: :::::: : .:: : .: : :::: :..:
CCDS30 ALQRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLA
660 670 680 690 700 710
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pF1KA0 KLALEEENHMGWFCVEDDGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQEFKIECAAYNPE--PYLN
:..:.:::. ::.: ..: . :.:. .:.. .. ... ...: : :.
CCDS30 KIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFWCPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLG
720 730 740 750 760 770
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pF1KA0 NESQPDSFSTAHGFLWIGSCTHQMG-QIAIVSFQNSTPKVIECFNVESRILCMLYVP-VE
. : : .:.::.:. . : :. : :.. .:.... : . . .::: :.: .:
CCDS30 FSAV--STSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVKSFPLAAPVLCMEYIPELE
780 790 800 810 820 830
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pF1KA0 EKRREPGAPPDPETPAVRASDVPTICVGTEEGSISIYKSSQGSKKVRLQHFFTPEKSTVM
:. . : :. :. ::::.: ..::: .:.: . . . : .: . :.
CCDS30 EEAESRDESPTVADPS--ATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQC-LVSCRSPGLQPVL
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: . : ::: .:..:.: :. : :: : : . .: :::.:: .::..::.
CCDS30 CLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASC
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: .: .. . : . ..::::.:.. ..::. .: :.:.::.::...::::::::.:::
CCDS30 GPRVTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQ
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pF1KA0 DINIATPVHNMLPGHQRLSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGRGMVS
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pF1KA0 YHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDA-----LPSGGAGSSLSQ
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CCDS30 LNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAE-EDKPDGQAHEPMPDSHVGRELTR
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CCDS30 ---KKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAA-LEHSEEDGSIYEMADDPDIWVRS
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CCDS30 RPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML
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. .. .: .. . ..: .. :: ... :: . . .:
CCDS82 QALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDP
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CCDS82 IAVCSARILCIGAVPGLQPRCHREPPPSLRSPPETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEP
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CCDS82 GPQPCLHISIAGSGLEMTPG-LGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTIS
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pF1KA0 ECFNVE---SRILCMLYVPVEEKRREPG--------APPDP--ETP----AVRAS-----
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CCDS82 SSFGNEETPSSKEATAETTSSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSF
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pF1KA0 ------DV----P-----TICVGTEEGSISIYKSSQGSK----KVRLQHFFTPEKSTVMS
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CCDS82 TRGSLEDLLSVDPEAYQSSVWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQH-----AASVTC
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CCDS82 ILYLNNQVFVSLANGELVVYQREAGHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQ
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CCDS82 NRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAE
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CCDS82 VDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCP
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CCDS82 RAPLSPTGLG----QGHTGHVRFLA---AVQLPD---GFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSL
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CCDS58 SAEHSLSIGSLLDISNTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVP----SKQSARWQVAKELY
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CCDS58 --LFLFNDCLEIARKRHKVIGTFRSPHGQTRPPASLKHIHL--MPLSQIKKVLDIRETED
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CCDS58 CHNAFALLVRPPTEQANVLLSFQMTSDELPKENWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADP
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]