Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0266
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0266, 766 aa
1>>>pF1KA0266 766 - 766 aa - 766 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0877+/-0.00119; mu= -2.3030+/- 0.071
mean_var=239.9761+/-49.858, 0's: 0 Z-trim(109.4): 51 B-trim: 109 in 2/50
Lambda= 0.082792
statistics sampled from 10831 (10860) to 10831 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 3.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31978.1 UTP14C gene_id:9724|Hs108|chr13 ( 766) 4920 601.5 1.6e-171
CCDS14615.1 UTP14A gene_id:10813|Hs108|chrX ( 771) 4450 545.4 1.3e-154
CCDS55489.1 UTP14A gene_id:10813|Hs108|chrX ( 719) 3499 431.8 1.9e-120
>>CCDS31978.1 UTP14C gene_id:9724|Hs108|chr13 (766 aa)
initn: 4920 init1: 4920 opt: 4920 Z-score: 3192.8 bits: 601.5 E(32554): 1.6e-171
Smith-Waterman score: 4920; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNVNQVAENLALSHQEELVDLPKNYPLSENEDEGDSDGERKHQKLLEAIISLDGKNRRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MNVNQVAENLALSHQEELVDLPKNYPLSENEDEGDSDGERKHQKLLEAIISLDGKNRRKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 AERSEASLKVSEFSVSSEGSGEKLGLADLLEPVKTSSSLATVKKQLNRVKSKKVVELPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AERSEASLKVSEFSVSSEGSGEKLGLADLLEPVKTSSSLATVKKQLNRVKSKKVVELPLN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KEKIEQIHREVAFSKTSQVLSKWDPIILKNQQAEQLVFPLGKEQPAIAPIEHALSGWKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KEKIEQIHREVAFSKTSQVLSKWDPIILKNQQAEQLVFPLGKEQPAIAPIEHALSGWKAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TPLEQEIFNLLHKNKQPVTDPLLTPMEKASLQAMSLEEAKMHRAELQRARALQSYYEAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TPLEQEIFNLLHKNKQPVTDPLLTPMEKASLQAMSLEEAKMHRAELQRARALQSYYEAKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 RKEKKIKSKKYHKVVKKGKAKKALKEFEQLQKVNPTVALEEMEKIENARMMERMSLKHQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RKEKKIKSKKYHKVVKKGKAKKALKEFEQLQKVNPTVALEEMEKIENARMMERMSLKHQN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SGKWAKSKAIMAKYDLEARQAMQEQLAKNKELTQKLQVASESEEEEGGTEVEELLVPHVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SGKWAKSKAIMAKYDLEARQAMQEQLAKNKELTQKLQVASESEEEEGGTEVEELLVPHVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NEVQMNVDGPNPWMFRSCTSDTKEAATQEDPEQVPELAAHEVSASEAEERPVAEEEILLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NEVQMNVDGPNPWMFRSCTSDTKEAATQEDPEQVPELAAHEVSASEAEERPVAEEEILLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 EFEERQSLRKRSELNQDAEPASSQETKDSSSQEVLSELRALSQKLKEKHQSRKQKASSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EFEERQSLRKRSELNQDAEPASSQETKDSSSQEVLSELRALSQKLKEKHQSRKQKASSEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 TVPQVQREEPAPEEAEPLLLQRSERVQTLEELEELGKEDCFQNKELPRPVLEGQQSERTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TVPQVQREEPAPEEAEPLLLQRSERVQTLEELEELGKEDCFQNKELPRPVLEGQQSERTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 NNRPDAPKEKKEKEQLINLQNFLTTQSPSVRSLAVPTIIEELEDEEERDQRQMIKEAFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NNRPDAPKEKKEKEQLINLQNFLTTQSPSVRSLAVPTIIEELEDEEERDQRQMIKEAFAG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DDVIRDFLKEKREAVEASKPKDVDLTLPGWGEWGGVGLKPSAKKRRQFLIKAPEGPPRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DDVIRDFLKEKREAVEASKPKDVDLTLPGWGEWGGVGLKPSAKKRRQFLIKAPEGPPRKD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 KNLPNVIISEKRNIHAAAHQVQVLPYPFTHHRQFERTIQTPIGSTWNTQRAFQKLTTPKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KNLPNVIISEKRNIHAAAHQVQVLPYPFTHHRQFERTIQTPIGSTWNTQRAFQKLTTPKV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KA0 VTKPGHIIKPIKAEDVGYQSSSRSDLPVIQRNPKRITTRHNKEEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VTKPGHIIKPIKAEDVGYQSSSRSDLPVIQRNPKRITTRHNKEEKL
730 740 750 760
>>CCDS14615.1 UTP14A gene_id:10813|Hs108|chrX (771 aa)
initn: 4378 init1: 3026 opt: 4450 Z-score: 2889.4 bits: 545.4 E(32554): 1.3e-154
Smith-Waterman score: 4450; 90.2% identity (97.9% similar) in 767 aa overlap (1-765:1-766)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MNVNQVAENL-ALSHQEELVDLPKNYPLSENEDEGDSDGERKHQKLLEAIISLDGKNRRK
:..:..::.: :::.::::.::::.: :::.:::::.::::::::::::: :::::::::
CCDS14 MTANRLAESLLALSQQEELADLPKDYLLSESEDEGDNDGERKHQKLLEAISSLDGKNRRK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LAERSEASLKVSEFSVSSEGSGEKLGLADLLEPVKTSSSLATVKKQLNRVKSKKVVELPL
::::::::::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::::.::::::.:::::
CCDS14 LAERSEASLKVSEFNVSSEGSGEKLVLADLLEPVKTSSSLATVKKQLSRVKSKKTVELPL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NKEKIEQIHREVAFSKTSQVLSKWDPIILKNQQAEQLVFPLGKEQPAIAPIEHALSGWKA
:::.::.:::::::.::.::::::::..:::.::::::::: ::.::::::::.::::::
CCDS14 NKEEIERIHREVAFNKTAQVLSKWDPVVLKNRQAEQLVFPLEKEEPAIAPIEHVLSGWKA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 RTPLEQEIFNLLHKNKQPVTDPLLTPMEKASLQAMSLEEAKMHRAELQRARALQSYYEAK
::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::.:::::::::::::::::
CCDS14 RTPLEQEIFNLLHKNKQPVTDPLLTPVEKASLRAMSLEEAKMRRAELQRARALQSYYEAK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 ARKEKKIKSKKYHKVVKKGKAKKALKEFEQLQKVNPTVALEEMEKIENARMMERMSLKHQ
::.::::::::::::::::::::::::::::.::::..::::.::::.::::::::::::
CCDS14 ARREKKIKSKKYHKVVKKGKAKKALKEFEQLRKVNPAAALEELEKIEKARMMERMSLKHQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 NSGKWAKSKAIMAKYDLEARQAMQEQLAKNKELTQKLQVASESEEEEGGTE-VEELLVPH
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS14 NSGKWAKSKAIMAKYDLEARQAMQEQLSKNKELTQKLQVASESEEEEGGTEDVEELLVPD
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 VANEVQMNVDGPNPWMFRSCTSDTKEAATQEDPEQVPELAAHEVSASEAEERPVAEEEIL
:.::::::.:::::::.::::::::::::::::::.::: :: :: ::.:::::::::::
CCDS14 VVNEVQMNADGPNPWMLRSCTSDTKEAATQEDPEQLPELEAHGVSESEGEERPVAEEEIL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LREFEERQSLRKRSELNQDAEPASSQETKDSSSQEVLSELRALSQKLKEKHQSRKQKASS
:::::::.::::::::.::::::.:::::::.:::::::::.:::::::.::::::::::
CCDS14 LREFEERRSLRKRSELSQDAEPAGSQETKDSGSQEVLSELRVLSQKLKENHQSRKQKASS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EGTVPQVQREEPAPEEAEPLLLQRSERVQTLEELEELGKEDCFQNKELPRPVLEGQQSER
:::.:::::::::::: ::::::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS14 EGTIPQVQREEPAPEEEEPLLLQRPERVQTLEELEELGKEECFQNKELPRPVLEGQQSER
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 TPNNRPDAPKEKKEKEQLINLQNFLTTQSPSVRSLAVPTIIEELEDEEERDQRQMIKEAF
:::::::::::::.:::.:.:::.::::::::.::::::: :::::::::..::::::::
CCDS14 TPNNRPDAPKEKKKKEQMIDLQNLLTTQSPSVKSLAVPTI-EELEDEEERNHRQMIKEAF
550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 AGDDVIRDFLKEKREAVEASKPKDVDLTLPGWGEWGGVGLKPSAKKRRQFLIKAPEGPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS14 AGDDVIRDFLKEKREAVEASKPKDVDLTLPGWGEWGGVGLKPSAKKRRRFLIKAPEGPPR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 KDKNLPNVIISEKRNIHAAAHQVQVLPYPFTHHRQFERTIQTPIGSTWNTQRAFQKLTTP
::::::::::.::::::::::::.::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KDKNLPNVIINEKRNIHAAAHQVRVLPYPFTHHWQFERTIQTPIGSTWNTQRAFQKLTTP
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760
pF1KA0 KVVTKPGHIIKPIKAEDVGYQSSSRSDLPVIQRNPKRITTRHNKEEKL
::::::::::.:::::::::.::::::: :::::::::::::.:. :
CCDS14 KVVTKPGHIINPIKAEDVGYRSSSRSDLSVIQRNPKRITTRHKKQLKKCSVD
720 730 740 750 760 770
>>CCDS55489.1 UTP14A gene_id:10813|Hs108|chrX (719 aa)
initn: 4053 init1: 2088 opt: 3499 Z-score: 2275.9 bits: 431.8 E(32554): 1.9e-120
Smith-Waterman score: 4027; 84.5% identity (91.3% similar) in 767 aa overlap (1-765:1-714)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MNVNQVAENL-ALSHQEELVDLPKNYPLSENEDEGDSDGERKHQKLLEAIISLDGKNRRK
:..:..::.: :::.::::.::::.: :::.:::::.::::::::::::: :::::::::
CCDS55 MTANRLAESLLALSQQEELADLPKDYLLSESEDEGDNDGERKHQKLLEAISSLDGKNRRK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LAERSEASLKVSEFSVSSEGSGEKLGLADLLEPVKTSSSLATVKKQLNRVKSKKVVELPL
::::::::::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::::.::::::.:::::
CCDS55 LAERSEASLKVSEFNVSSEGSGEKLVLADLLEPVKTSSSLATVKKQLSRVKSKKTVELPL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NKEKIEQIHREVAFSKTSQVLSKWDPIILKNQQAEQLVFPLGKEQPAIAPIEHALSGWKA
:::.:: .:
CCDS55 NKEEIE----------------------------------------------------RA
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 RTPLEQEIFNLLHKNKQPVTDPLLTPMEKASLQAMSLEEAKMHRAELQRARALQSYYEAK
::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::.:::::::::::::::::
CCDS55 RTPLEQEIFNLLHKNKQPVTDPLLTPVEKASLRAMSLEEAKMRRAELQRARALQSYYEAK
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 ARKEKKIKSKKYHKVVKKGKAKKALKEFEQLQKVNPTVALEEMEKIENARMMERMSLKHQ
::.::::::::::::::::::::::::::::.::::..::::.::::.::::::::::::
CCDS55 ARREKKIKSKKYHKVVKKGKAKKALKEFEQLRKVNPAAALEELEKIEKARMMERMSLKHQ
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 NSGKWAKSKAIMAKYDLEARQAMQEQLAKNKELTQKLQVASESEEEEGGTE-VEELLVPH
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS55 NSGKWAKSKAIMAKYDLEARQAMQEQLSKNKELTQKLQVASESEEEEGGTEDVEELLVPD
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 VANEVQMNVDGPNPWMFRSCTSDTKEAATQEDPEQVPELAAHEVSASEAEERPVAEEEIL
:.::::::.:::::::.::::::::::::::::::.::: :: :: ::.:::::::::::
CCDS55 VVNEVQMNADGPNPWMLRSCTSDTKEAATQEDPEQLPELEAHGVSESEGEERPVAEEEIL
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LREFEERQSLRKRSELNQDAEPASSQETKDSSSQEVLSELRALSQKLKEKHQSRKQKASS
:::::::.::::::::.::::::.:::::::.:::::::::.:::::::.::::::::::
CCDS55 LREFEERRSLRKRSELSQDAEPAGSQETKDSGSQEVLSELRVLSQKLKENHQSRKQKASS
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EGTVPQVQREEPAPEEAEPLLLQRSERVQTLEELEELGKEDCFQNKELPRPVLEGQQSER
:::.:::::::::::: ::::::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 EGTIPQVQREEPAPEEEEPLLLQRPERVQTLEELEELGKEECFQNKELPRPVLEGQQSER
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 TPNNRPDAPKEKKEKEQLINLQNFLTTQSPSVRSLAVPTIIEELEDEEERDQRQMIKEAF
:::::::::::::.:::.:.:::.::::::::.::::::: :::::::::..::::::::
CCDS55 TPNNRPDAPKEKKKKEQMIDLQNLLTTQSPSVKSLAVPTI-EELEDEEERNHRQMIKEAF
490 500 510 520 530 540
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 AGDDVIRDFLKEKREAVEASKPKDVDLTLPGWGEWGGVGLKPSAKKRRQFLIKAPEGPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS55 AGDDVIRDFLKEKREAVEASKPKDVDLTLPGWGEWGGVGLKPSAKKRRRFLIKAPEGPPR
550 560 570 580 590 600
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 KDKNLPNVIISEKRNIHAAAHQVQVLPYPFTHHRQFERTIQTPIGSTWNTQRAFQKLTTP
::::::::::.::::::::::::.::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KDKNLPNVIINEKRNIHAAAHQVRVLPYPFTHHWQFERTIQTPIGSTWNTQRAFQKLTTP
610 620 630 640 650 660
720 730 740 750 760
pF1KA0 KVVTKPGHIIKPIKAEDVGYQSSSRSDLPVIQRNPKRITTRHNKEEKL
::::::::::.:::::::::.::::::: :::::::::::::.:. :
CCDS55 KVVTKPGHIINPIKAEDVGYRSSSRSDLSVIQRNPKRITTRHKKQLKKCSVD
670 680 690 700 710
766 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 18:27:17 2016 done: Wed Nov 2 18:27:17 2016
Total Scan time: 3.610 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]