Result of FASTA (omim) for
pF1KA0260
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0260, 355 aa
1>>>pF1KA0260 355 - 355 aa - 355 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2926+/-0.000518; mu= 16.0633+/- 0.032
mean_var=61.1528+/-12.955, 0's: 0 Z-trim(105.3): 52 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.164008
statistics sampled from 13515 (13554) to 13515 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.493), E-opt: 0.2 (0.159), width: 16
Scan time: 7.410
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055954 (OMIM: 269250,610804) UDP-glucuronic aci ( 355) 2261 544.3 1.6e-154
XP_006710541 (OMIM: 269250,610804) PREDICTED: UDP- ( 382) 1540 373.7 3.8e-103
XP_011539372 (OMIM: 269250,610804) PREDICTED: UDP- ( 382) 1540 373.7 3.8e-103
NP_008932 (OMIM: 609182) UDP-N-acetylglucosamine/U ( 337) 1236 301.7 1.5e-81
XP_005251731 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acety ( 295) 1055 258.9 1.1e-68
XP_005251735 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acety ( 219) 865 213.9 2.8e-55
XP_005251733 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acety ( 259) 839 207.7 2.3e-53
XP_005251730 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acety ( 300) 839 207.8 2.6e-53
XP_005251732 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acety ( 290) 712 177.7 2.8e-44
XP_011516466 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acety ( 280) 547 138.7 1.5e-32
NP_001273919 (OMIM: 609182) UDP-N-acetylglucosamin ( 249) 527 133.9 3.7e-31
XP_006717002 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acety ( 202) 359 94.1 2.9e-19
NP_001008783 (OMIM: 612519) solute carrier family ( 416) 323 85.7 2e-16
NP_001138738 (OMIM: 266265,605881) GDP-fucose tran ( 351) 210 59.0 1.9e-08
NP_001138737 (OMIM: 266265,605881) GDP-fucose tran ( 351) 210 59.0 1.9e-08
NP_060859 (OMIM: 266265,605881) GDP-fucose transpo ( 364) 210 59.0 2e-08
NP_116322 (OMIM: 615430) transmembrane protein 241 ( 296) 139 42.1 0.0019
XP_011524535 (OMIM: 615430) PREDICTED: transmembra ( 330) 139 42.2 0.002
XP_016881533 (OMIM: 615430) PREDICTED: transmembra ( 345) 139 42.2 0.0021
XP_016881532 (OMIM: 615430) PREDICTED: transmembra ( 354) 139 42.2 0.0022
>>NP_055954 (OMIM: 269250,610804) UDP-glucuronic acid/UD (355 aa)
initn: 2261 init1: 2261 opt: 2261 Z-score: 2895.4 bits: 544.3 E(85289): 1.6e-154
Smith-Waterman score: 2261; 100.0% identity (100.0% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAEVHRRQHARVKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MAEVHRRQHARVKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KSVLTNYRFPSSLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KSVLTNYRFPSSLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ITGLFSTKKLNLPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ITGLFSTKKLNLPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LAFDLEGYAFILINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LAFDLEGYAFILINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 AQKAVEFEGWADTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AQKAVEFEGWADTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KA0 MVFGGDYIFTWTNFIGLNISIAGSLVYSYITFTEEQLSKQSEANNKLDIKGKGAV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MVFGGDYIFTWTNFIGLNISIAGSLVYSYITFTEEQLSKQSEANNKLDIKGKGAV
310 320 330 340 350
>>XP_006710541 (OMIM: 269250,610804) PREDICTED: UDP-gluc (382 aa)
initn: 1540 init1: 1540 opt: 1540 Z-score: 1972.9 bits: 373.7 E(85289): 3.8e-103
Smith-Waterman score: 2197; 92.9% identity (92.9% similar) in 382 aa overlap (1-355:1-382)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAEVHRRQHARVKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MAEVHRRQHARVKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KSVLTNYRFPSSLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KSVLTNYRFPSSLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ITGLFSTKKLNLPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ITGLFSTKKLNLPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LAFDLEGYAFILINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LAFDLEGYAFILINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KA0 AQK---------------------------AVEFEGWADTLFLLQFTLSCVMGFILMYAT
::: ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AQKLPVSQDRRFQALWQRACLVLCHTQNDQAVEFEGWADTLFLLQFTLSCVMGFILMYAT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 VLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTWTNFIGLNISIAGSLVYSYITFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTWTNFIGLNISIAGSLVYSYITFT
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KA0 EEQLSKQSEANNKLDIKGKGAV
::::::::::::::::::::::
XP_006 EEQLSKQSEANNKLDIKGKGAV
370 380
>>XP_011539372 (OMIM: 269250,610804) PREDICTED: UDP-gluc (382 aa)
initn: 1540 init1: 1540 opt: 1540 Z-score: 1972.9 bits: 373.7 E(85289): 3.8e-103
Smith-Waterman score: 2197; 92.9% identity (92.9% similar) in 382 aa overlap (1-355:1-382)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAEVHRRQHARVKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAEVHRRQHARVKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KSVLTNYRFPSSLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSVLTNYRFPSSLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ITGLFSTKKLNLPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITGLFSTKKLNLPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LAFDLEGYAFILINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAFDLEGYAFILINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KA0 AQK---------------------------AVEFEGWADTLFLLQFTLSCVMGFILMYAT
::: ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AQKLPVSQDRRFQALWQRACLVLCHTQNDQAVEFEGWADTLFLLQFTLSCVMGFILMYAT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 VLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTWTNFIGLNISIAGSLVYSYITFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTWTNFIGLNISIAGSLVYSYITFT
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KA0 EEQLSKQSEANNKLDIKGKGAV
::::::::::::::::::::::
XP_011 EEQLSKQSEANNKLDIKGKGAV
370 380
>>NP_008932 (OMIM: 609182) UDP-N-acetylglucosamine/UDP-g (337 aa)
initn: 1219 init1: 1219 opt: 1236 Z-score: 1585.0 bits: 301.7 E(85289): 1.5e-81
Smith-Waterman score: 1236; 57.7% identity (85.2% similar) in 310 aa overlap (42-350:27-336)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 VKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVNKSVLTNYRFPS
.::.: :::. :::::.:::..::.: :::
NP_008 MTAGGQAEAEGAGGEPGAARLPSRVARLLSALFYGTCSFLIVLVNKALLTTYGFPS
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 SLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQITGLFSTKKLN
. .:.:::.::. .:.:.: ....:::.:...: : ::::::: ::.:.:: ::.::.
NP_008 PIFLGIGQMAATIMILYVSKLNKIIHFPDFDKKIPVKLFPLPLLYVGNHISGLSSTSKLS
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 LPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSDLAFDLEGYAFI
::::::::.:.: .:.. : ..: : .: .: ..:::.:.:::.::.:::::.:::: :.
NP_008 LPMFTVLRKFTIPLTLLLETIILGKQYSLNIILSVFAIILGAFIAAGSDLAFNLEGYIFV
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGDAQKAVEFEGWA
..::..:::::.:.:::.: :::::::.:.::: :::.::: :. ::: :.:.::. :
NP_008 FLNDIFTAANGVYTKQKMDPKELGKYGVLFYNACFMIIPTLIISVSTGDLQQATEFNQWK
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 DTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTW
...:.::: ::: .::.:::.::::. :::::::..:: :::. ..:::...::::::.
NP_008 NVVFILQFLLSCFLGFLLMYSTVLCSYYNSALTTAVVGAIKNVSVAYIGILIGGDYIFSL
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350
pF1KA0 TNFIGLNISIAGSLVYSYITFTEEQLSKQ-SEANNKLDIKGKGAV
::.:::: .::.: ::..:.. . : .: : ::.:
NP_008 LNFVGLNICMAGGLRYSFLTLSSQLKPKPVGEENICLDLKS
300 310 320 330
>>XP_005251731 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acetylglu (295 aa)
initn: 1052 init1: 1052 opt: 1055 Z-score: 1354.4 bits: 258.9 E(85289): 1.1e-68
Smith-Waterman score: 1055; 59.9% identity (87.3% similar) in 252 aa overlap (42-293:27-278)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 VKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVNKSVLTNYRFPS
.::.: :::. :::::.:::..::.: :::
XP_005 MTAGGQAEAEGAGGEPGAARLPSRVARLLSALFYGTCSFLIVLVNKALLTTYGFPS
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 SLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQITGLFSTKKLN
. .:.:::.::. .:.:.: ....:::.:...: : ::::::: ::.:.:: ::.::.
XP_005 PIFLGIGQMAATIMILYVSKLNKIIHFPDFDKKIPVKLFPLPLLYVGNHISGLSSTSKLS
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 LPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSDLAFDLEGYAFI
::::::::.:.: .:.. : ..: : .: .: ..:::.:.:::.::.:::::.:::: :.
XP_005 LPMFTVLRKFTIPLTLLLETIILGKQYSLNIILSVFAIILGAFIAAGSDLAFNLEGYIFV
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGDAQKAVEFEGWA
..::..:::::.:.:::.: :::::::.:.::: :::.::: :. ::: :.:.::. :
XP_005 FLNDIFTAANGVYTKQKMDPKELGKYGVLFYNACFMIIPTLIISVSTGDLQQATEFNQWK
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 DTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTW
...:.::: ::: .::.:::.::::. :::::::..:: ::.
XP_005 NVVFILQFLLSCFLGFLLMYSTVLCSYYNSALTTAVVGAIKHGRGLEIFLFNTEQPVKT
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350
pF1KA0 TNFIGLNISIAGSLVYSYITFTEEQLSKQSEANNKLDIKGKGAV
>>XP_005251735 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acetylglu (219 aa)
initn: 851 init1: 851 opt: 865 Z-score: 1113.5 bits: 213.9 E(85289): 2.8e-55
Smith-Waterman score: 865; 57.8% identity (84.4% similar) in 218 aa overlap (134-350:1-218)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 NVPRKTFPLPLLYFGNQITGLFSTKKLNLPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIK
::::::.:.: .:.. : ..: : .: .:
XP_005 MFTVLRKFTIPLTLLLETIILGKQYSLNII
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 MTVFAMIIGAFVAASSDLAFDLEGYAFILINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYN
..:::.:.:::.::.:::::.:::: :...::..:::::.:.:::.: :::::::.:.::
XP_005 LSVFAIILGAFIAAGSDLAFNLEGYIFVFLNDIFTAANGVYTKQKMDPKELGKYGVLFYN
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 ALFMILPTLAIAYFTGDAQKAVEFEGWADTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSAL
: :::.::: :. ::: :.:.::. : ...:.::: ::: .::.:::.::::. :::::
XP_005 ACFMIIPTLIISVSTGDLQQATEFNQWKNVVFILQFLLSCFLGFLLMYSTVLCSYYNSAL
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 TTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTWTNFIGLNISIAGSLVYSYITFTEEQLSKQ-SE
::..:: :::. ..:::...::::::. ::.:::: .::.: ::..:.. . : .:
XP_005 TTAVVGAIKNVSVAYIGILIGGDYIFSLLNFVGLNICMAGGLRYSFLTLSSQLKPKPVGE
160 170 180 190 200 210
350
pF1KA0 ANNKLDIKGKGAV
: ::.:
XP_005 ENICLDLKS
>>XP_005251733 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acetylglu (259 aa)
initn: 828 init1: 828 opt: 839 Z-score: 1079.1 bits: 207.7 E(85289): 2.3e-53
Smith-Waterman score: 839; 57.1% identity (84.5% similar) in 219 aa overlap (42-260:27-244)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 VKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVNKSVLTNYRFPS
.::.: :::. :::::.:::..::.: :::
XP_005 MTAGGQAEAEGAGGEPGAARLPSRVARLLSALFYGTCSFLIVLVNKALLTTYGFPS
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 SLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQITGLFSTKKLN
. .:.:::.::. .:.:.: ....:::.:...: : ::::::: ::.:.:: ::.::.
XP_005 PIFLGIGQMAATIMILYVSKLNKIIHFPDFDKKIPVKLFPLPLLYVGNHISGLSSTSKLS
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 LPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSDLAFDLEGYAFI
::::::::.:.: .:.. : ..: : .: .: ..:::.:.:::.::.:::::.:::: :.
XP_005 LPMFTVLRKFTIPLTLLLETIILGKQYSLNIILSVFAIILGAFIAAGSDLAFNLEGYIFV
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGDAQKAVEFEGWA
..::..:::::.:.:::.: :::::::.:.::: :::.::: :. ::: :. : .
XP_005 FLNDIFTAANGVYTKQKMDPKELGKYGVLFYNACFMIIPTLIISVSTGDLQQ-VSADVLH
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 DTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTW
.. ::::.
XP_005 GSVQLLQFSPDDSSGWSHQAWQGA
240 250
>>XP_005251730 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acetylglu (300 aa)
initn: 828 init1: 828 opt: 839 Z-score: 1078.1 bits: 207.8 E(85289): 2.6e-53
Smith-Waterman score: 839; 57.1% identity (84.5% similar) in 219 aa overlap (42-260:27-244)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 VKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVNKSVLTNYRFPS
.::.: :::. :::::.:::..::.: :::
XP_005 MTAGGQAEAEGAGGEPGAARLPSRVARLLSALFYGTCSFLIVLVNKALLTTYGFPS
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 SLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQITGLFSTKKLN
. .:.:::.::. .:.:.: ....:::.:...: : ::::::: ::.:.:: ::.::.
XP_005 PIFLGIGQMAATIMILYVSKLNKIIHFPDFDKKIPVKLFPLPLLYVGNHISGLSSTSKLS
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 LPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSDLAFDLEGYAFI
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XP_005 LPMFTVLRKFTIPLTLLLETIILGKQYSLNIILSVFAIILGAFIAAGSDLAFNLEGYIFV
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGDAQKAVEFEGWA
..::..:::::.:.:::.: :::::::.:.::: :::.::: :. ::: :. : .
XP_005 FLNDIFTAANGVYTKQKMDPKELGKYGVLFYNACFMIIPTLIISVSTGDLQQ-VSADVLH
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 DTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTW
.. ::::.
XP_005 GSVQLLQFSPDDSSGWSHQECIRCLHWDINRWRLHFLFVKLCRVKYLHGRGLEIFLFNTE
240 250 260 270 280 290
>>XP_005251732 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acetylglu (290 aa)
initn: 1041 init1: 698 opt: 712 Z-score: 915.9 bits: 177.7 E(85289): 2.8e-44
Smith-Waterman score: 962; 49.7% identity (71.9% similar) in 310 aa overlap (42-350:27-289)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 VKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVNKSVLTNYRFPS
.::.: :::. :::::.:::..::.: :::
XP_005 MTAGGQAEAEGAGGEPGAARLPSRVARLLSALFYGTCSFLIVLVNKALLTTYGFPS
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 SLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQITGLFSTKKLN
. .:.:::.::. .:.:.: ....:::.:...: : ::::::: ::.:.:: ::.::
XP_005 PIFLGIGQMAATIMILYVSKLNKIIHFPDFDKKIPVKLFPLPLLYVGNHISGLSSTSKLR
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 LPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSDLAFDLEGYAFI
:::::.:::: :.
XP_005 -----------------------------------------------SDLAFNLEGYIFV
120
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGDAQKAVEFEGWA
..::..:::::.:.:::.: :::::::.:.::: :::.::: :. ::: :.:.::. :
XP_005 FLNDIFTAANGVYTKQKMDPKELGKYGVLFYNACFMIIPTLIISVSTGDLQQATEFNQWK
130 140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 DTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTW
...:.::: ::: .::.:::.::::. :::::::..:: :::. ..:::...::::::.
XP_005 NVVFILQFLLSCFLGFLLMYSTVLCSYYNSALTTAVVGAIKNVSVAYIGILIGGDYIFSL
190 200 210 220 230 240
320 330 340 350
pF1KA0 TNFIGLNISIAGSLVYSYITFTEEQLSKQ-SEANNKLDIKGKGAV
::.:::: .::.: ::..:.. . : .: : ::.:
XP_005 LNFVGLNICMAGGLRYSFLTLSSQLKPKPVGEENICLDLKS
250 260 270 280 290
>>XP_011516466 (OMIM: 609182) PREDICTED: UDP-N-acetylglu (280 aa)
initn: 769 init1: 531 opt: 547 Z-score: 705.1 bits: 138.7 E(85289): 1.5e-32
Smith-Waterman score: 667; 40.3% identity (64.5% similar) in 310 aa overlap (42-350:27-279)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 VKGEAPAKSSTLRDEEELGMASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFLIVVVNKSVLTNYRFPS
.::.: :::. :::::.:::..::.: :::
XP_011 MTAGGQAEAEGAGGEPGAARLPSRVARLLSALFYGTCSFLIVLVNKALLTTYGFPS
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 SLCVGLGQMVATVAVLWVGKALRVVKFPDLDRNVPRKTFPLPLLYFGNQITGLFSTKKLN
. .:.:::.::. .:.:.: ....:::.:...: : : : . .....
XP_011 PIFLGIGQMAATIMILYVSKLNKIIHFPDFDKKIPVK--P----------TDVHRAQEIH
60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 LPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSDLAFDLEGYAFI
:... : . .: .::. . .
XP_011 HS------------TYLTSG----NHHTW---EAVFT-----------------QHHPQC
110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGDAQKAVEFEGWA
: . : . .: ::::::.:.::: :::.::: :. ::: :.:.::. :
XP_011 LCH---------YSRGFHSSWELGKYGVLFYNACFMIIPTLIISVSTGDLQQATEFNQWK
130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 DTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTW
...:.::: ::: .::.:::.::::. :::::::..:: :::. ..:::...::::::.
XP_011 NVVFILQFLLSCFLGFLLMYSTVLCSYYNSALTTAVVGAIKNVSVAYIGILIGGDYIFSL
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350
pF1KA0 TNFIGLNISIAGSLVYSYITFTEEQLSKQ-SEANNKLDIKGKGAV
::.:::: .::.: ::..:.. . : .: : ::.:
XP_011 LNFVGLNICMAGGLRYSFLTLSSQLKPKPVGEENICLDLKS
240 250 260 270 280
355 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:16:00 2016 done: Thu Nov 3 09:16:01 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]