Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0246
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0246, 2570 aa
1>>>pF1KA0246 2570 - 2570 aa - 2570 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2603+/-0.00146; mu= 24.2532+/- 0.088
mean_var=224.2914+/-41.234, 0's: 0 Z-trim(108.7): 225 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.085638
statistics sampled from 10109 (10356) to 10109 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16
Scan time: 8.570
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33768.1 STAB1 gene_id:23166|Hs108|chr3 (2570) 18695 2325.8 0
CCDS31888.1 STAB2 gene_id:55576|Hs108|chr12 (2551) 3820 488.0 2.6e-136
CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15 (2871) 530 81.6 6.4e-14
CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19 (2809) 498 77.7 9.9e-13
CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs108|chr1 (1541) 490 76.3 1.4e-12
CCDS33178.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1395) 465 73.1 1.1e-11
CCDS54344.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1353) 464 73.0 1.2e-11
CCDS33177.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1721) 465 73.3 1.3e-11
>>CCDS33768.1 STAB1 gene_id:23166|Hs108|chr3 (2570 aa)
initn: 18695 init1: 18695 opt: 18695 Z-score: 12492.9 bits: 2325.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 18695; 99.9% identity (100.0% similar) in 2570 aa overlap (1-2570:1-2570)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAGPRGLLPLCLLAFCLAGFSFVRGQVLFKGCDVKTTFVTHVPCTSCAAIKKQTCPSGWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MAGPRGLLPLCLLAFCLAGFSFVRGQVLFKGCDVKTTFVTHVPCTSCAAIKKQTCPSGWL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 RELPDQITQDCRYEVQLGGSMVSMSGCRRKCRKQVVQKACCPGYWGSRCHECPGGAETPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RELPDQITQDCRYEVQLGGSMVSMSGCRRKCRKQVVQKACCPGYWGSRCHECPGGAETPC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 NGHGTCLDGMDRNGTCVCQENFRGSACQECQDPNRFGPDCQSVCSCVHGVCNHGPRGDGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NGHGTCLDGMDRNGTCVCQENFRGSACQECQDPNRFGPDCQSVCSCVHGVCNHGPRGDGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 CLCFAGYTGPHCDQELPVCQELRCPQNTQCSAEAPSCRCLPGYTQQGSECRAPNPCWPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CLCFAGYTGPHCDQELPVCQELRCPQNTQCSAEAPSCRCLPGYTQQGSECRAPNPCWPSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 CSLLAQCSVSPKGQAQCHCPENYHGDGMVCLPKDPCTDNLGGCPSNSTLCVYQKPGQAFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CSLLAQCSVSPKGQAQCHCPENYHGDGMVCLPKDPCTDNLGGCPSNSTLCVYQKPGQAFC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TCRPGLVSINSNASAGCFAFCSPFSCDRSATCQVTADGKTSCVCRESEVGDGRACYGHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TCRPGLVSINSNASAGCFAFCSPFSCDRSATCQVTADGKTSCVCRESEVGDGRACYGHLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 HEVQKATQTGRVFLQLRVAVAMMDQGCREILTTAGPFTVLVPSVSSFSSRTMNASLAQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HEVQKATQTGRVFLQLRVAVAMMDQGCREILTTAGPFTVLVPSVSSFSSRTMNASLAQQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 CRQHIIAGQHILEDTRTQQTRRWWTLAGQEITVTFNQFTKYSYKYKDQPQQTFNIYKANN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CRQHIIAGQHILEDTRTQQTRRWWTLAGQEITVTFNQFTKYSYKYKDQPQQTFNIYKANN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IAANGVFHVVTGLRWQAPSGTPGDPKRTIGQILASTEAFSRFETILENCGLPSILDGPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IAANGVFHVVTGLRWQAPSGTPGDPKRTIGQILASTEAFSRFETILENCGLPSILDGPGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 FTVFAPSNEAVDSLRDGRLIYLFTAGLSKLQELVRYHIYNHGQLTVEKLISKGRILTMAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FTVFAPSNEAVDSLRDGRLIYLFTAGLSKLQELVRYHIYNHGQLTVEKLISKGRILTMAN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QVLAVNISEEGRILLGPEGVPLQRVDVMAANGVIHMLDGILLPPTILPILPKHCSEEQHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QVLAVNISEEGRILLGPEGVPLQRVDVMAANGVIHMLDGILLPPTILPILPKHCSEEQHK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 IVAGSCVDCQALNTSTCPPNSVKLDIFPKECVYIHDPTGLNVLKKGCASYCNQTIMEQGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IVAGSCVDCQALNTSTCPPNSVKLDIFPKECVYIHDPTGLNVLKKGCASYCNQTIMEQGC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 CKGFFGPDCTQCPGGFSNPCYGKGNCSDGIQGNGACLCFPDYKGIACHICSNPNKHGEQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CKGFFGPDCTQCPGGFSNPCYGKGNCSDGIQGNGACLCFPDYKGIACHICSNPNKHGEQC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QEDCGCVHGLCDNRPGSGGVCQQGTCAPGFSGRFCNESMGDCGPTGLAQHCHLHARCVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QEDCGCVHGLCDNRPGSGGVCQQGTCAPGFSGRFCNESMGDCGPTGLAQHCHLHARCVSQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 EGVARCRCLDGFEGDGFSCTPSNPCSHPDRGGCSENAECVPGSLGTHHCTCHKGWSGDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EGVARCRCLDGFEGDGFSCTPSNPCSHPDRGGCSENAECVPGSLGTHHCTCHKGWSGDGR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 VCVAIDECELDVRGGCHTDALCSYVGPGQSRCTCKLGFAGDGYQCSPIDPCRAGNGGCHG
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VCVAIDECELDMRGGCHTDALCSYVGPGQSRCTCKLGFAGDGYQCSPIDPCRAGNGGCHG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LATCRAVGGGQRVCTCPPGFGGDGFSCYGDIFRELEANAHFSIFYQWLKSAGITLPADRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LATCRAVGGGQRVCTCPPGFGGDGFSCYGDIFRELEANAHFSIFYQWLKSAGITLPADRR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 VTALVPSEAAVRQLSPEDRAFWLQPRTLPNLVRAHFLQGALFEEELARLGGQEVATLNPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VTALVPSEAAVRQLSPEDRAFWLQPRTLPNLVRAHFLQGALFEEELARLGGQEVATLNPT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 TRWEIRNISGRVWVQNASVDVADLLATNGVLHILSQVLLPPRGDVPGGQGLLQQLDLVPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TRWEIRNISGRVWVQNASVDVADLLATNGVLHILSQVLLPPRGDVPGGQGLLQQLDLVPA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 FSLFRELLQHHGLVPQIEAATAYTIFVPTNRSLEAQGNSSHLDADTVRHHVVLGEALSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FSLFRELLQHHGLVPQIEAATAYTIFVPTNRSLEAQGNSSHLDADTVRHHVVLGEALSME
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 TLRKGGHRNSLLGPAHWIVFYNHSGQPEVNHVPLEGPMLEAPGRSLIGLSGVLTVGSSRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TLRKGGHRNSLLGPAHWIVFYNHSGQPEVNHVPLEGPMLEAPGRSLIGLSGVLTVGSSRC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 LHSHAEALREKCVNCTRRFRCTQGFQLQDTPRKSCVYRSGFSFSRGCSYTCAKKIQVPDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LHSHAEALREKCVNCTRRFRCTQGFQLQDTPRKSCVYRSGFSFSRGCSYTCAKKIQVPDC
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 CPGFFGTLCEPCPGGLGGVCSGHGQCQDRFLGSGECHCHEGFHGTACEVCELGRYGPNCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CPGFFGTLCEPCPGGLGGVCSGHGQCQDRFLGSGECHCHEGFHGTACEVCELGRYGPNCT
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 GVCDCAHGLCQEGLQGDGSCVCNVGWQGLRCDQKITSPQCPRKCDPNANCVQDSAGASTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GVCDCAHGLCQEGLQGDGSCVCNVGWQGLRCDQKITSPQCPRKCDPNANCVQDSAGASTC
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 ACAAGYSGNGIFCSEVDPCAHGHGGCSPHANCTKVAPGQRTCTCQDGYMGDGELCQEINS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ACAAGYSGNGIFCSEVDPCAHGHGGCSPHANCTKVAPGQRTCTCQDGYMGDGELCQEINS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 CLIHHGGCHIHAECIPTGPQQVSCSCREGYSGDGIRTCELLDPCSKNNGGCSPYATCKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CLIHHGGCHIHAECIPTGPQQVSCSCREGYSGDGIRTCELLDPCSKNNGGCSPYATCKST
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 GDGQRTCTCDTAHTVGDGLTCRARVGLELLRDKHASFFSLRLLEYKELKGDGPFTIFVPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GDGQRTCTCDTAHTVGDGLTCRARVGLELLRDKHASFFSLRLLEYKELKGDGPFTIFVPH
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 ADLMSNLSQDELARIRAHRQLVFRYHVVGCRRLRSEDLLEQGYATALSGHPLRFSEREGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ADLMSNLSQDELARIRAHRQLVFRYHVVGCRRLRSEDLLEQGYATALSGHPLRFSEREGS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 IYLNDFARVVSSDHEAVNGILHFIDRVLLPPEALHWEPDDAPIPRRNVTAAAQGFGYKIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IYLNDFARVVSSDHEAVNGILHFIDRVLLPPEALHWEPDDAPIPRRNVTAAAQGFGYKIF
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 SGLLKVAGLLPLLREASHRPFTMLWPTDAAFRALPPDRQAWLYHEDHRDKLAAILRGHMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SGLLKVAGLLPLLREASHRPFTMLWPTDAAFRALPPDRQAWLYHEDHRDKLAAILRGHMI
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 RNVEALASDLPNLGPLRTMHGTPISFSCSRTRPGELMVGEDDARIVQRHLPFEGGLAYGI
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RNVEALASDLPNLGPLRTMHGTPISFSCSRTRAGELMVGEDDARIVQRHLPFEGGLAYGI
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 DQLLEPPGLGARCDHFETRPLRLNTCSICGLEPPCPEGSQEQGSPEACWRFYPKFWTSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DQLLEPPGLGARCDHFETRPLRLNTCSICGLEPPCPEGSQEQGSPEACWRFYPKFWTSPP
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 LHSLGLRSVWVHPSLWGRPQGLGRGCHRNCVTTTWKPSCCPGHYGSECQACPGGPSSPCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LHSLGLRSVWVHPSLWGRPQGLGRGCHRNCVTTTWKPSCCPGHYGSECQACPGGPSSPCS
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 DRGVCMDGMSGSGQCLCRSGFAGTACELCAPGAFGPHCQACRCTVHGRCDEGLGGSGSCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DRGVCMDGMSGSGQCLCRSGFAGTACELCAPGAFGPHCQACRCTVHGRCDEGLGGSGSCF
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 CDEGWTGPRCEVQLELQPVCTPPCAPEAVCRAGNSCECSLGYEGDGRVCTVADLCQDGHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CDEGWTGPRCEVQLELQPVCTPPCAPEAVCRAGNSCECSLGYEGDGRVCTVADLCQDGHG
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 GCSEHANCSQVGTMVTCTCLPDYEGDGWSCRARNPCTDGHRGGCSEHANCLSTGLNTRRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GCSEHANCSQVGTMVTCTCLPDYEGDGWSCRARNPCTDGHRGGCSEHANCLSTGLNTRRC
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 ECHAGYVGDGLQCLEESEPPVDRCLGQPPPCHSDAMCTDLHFQEKRAGVFHLQATSGPYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ECHAGYVGDGLQCLEESEPPVDRCLGQPPPCHSDAMCTDLHFQEKRAGVFHLQATSGPYG
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA0 LNFSEAEAACEAQGAVLASFPQLSAAQQLGFHLCLMGWLANGSTAHPVVFPVADCGNGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LNFSEAEAACEAQGAVLASFPQLSAAQQLGFHLCLMGWLANGSTAHPVVFPVADCGNGRV
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA0 GIVSLGARKNLSERWDAYCFRVQDVACRCRNGFVGDGISTCNGKLLDVLAATANFSTFYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GIVSLGARKNLSERWDAYCFRVQDVACRCRNGFVGDGISTCNGKLLDVLAATANFSTFYG
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KA0 MLLGYANATQRGLDFLDFLDDELTYKTLFVPVNEGFVDNMTLSGPDLELHASNATLLSAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MLLGYANATQRGLDFLDFLDDELTYKTLFVPVNEGFVDNMTLSGPDLELHASNATLLSAN
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KA0 ASQGKLLPAHSGLSLIISDAGPDNSSWAPVAPGTVVVSRIIVWDIMAFNGIIHALASPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ASQGKLLPAHSGLSLIISDAGPDNSSWAPVAPGTVVVSRIIVWDIMAFNGIIHALASPLL
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KA0 APPQPQAVLAPEAPPVAAGVGAVLAAGALLGLVAGALYLRARGKPMGFGFSAFQAEDDAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 APPQPQAVLAPEAPPVAAGVGAVLAAGALLGLVAGALYLRARGKPMGFGFSAFQAEDDAD
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570
pF1KA0 DDFSPWQEGTNPTLVSVPNPVFGSDTFCEPFDDSLLEEDFPDTQRILTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DDFSPWQEGTNPTLVSVPNPVFGSDTFCEPFDDSLLEEDFPDTQRILTVK
2530 2540 2550 2560 2570
>>CCDS31888.1 STAB2 gene_id:55576|Hs108|chr12 (2551 aa)
initn: 3929 init1: 1450 opt: 3820 Z-score: 2560.6 bits: 488.0 E(32554): 2.6e-136
Smith-Waterman score: 7430; 40.9% identity (67.5% similar) in 2598 aa overlap (8-2554:11-2537)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MAGPRGLLPLCLLAFCLAGFSFVRGQVLFKGCDVKTTFVTHVPCTSCAAIKKQTCPS
: : . :: . . ::. . :: :. .. .. : ::: ::.
CCDS31 MMLQHLVIFCLGLVVQNFCSPAET--TGQA--RRCDRKSLLTIRTECRSCALNLGVKCPD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 GWLRELPDQI-TQDCRYEVQLGGSMVSMSGCRRKCRKQVVQKACCPGYWGSRCHECPGGA
:. .. ..:::: .. .:. :::. :::. .: :::: :: : ::::::
CCDS31 GYTMITSGSVGVRDCRYTFEVRTYSLSLPGCRHICRKDYLQPRCCPGRWGPDCIECPGGA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 ETPCNGHGTCLDGMDRNGTCVCQENFRGSACQECQDPNRFGPDCQSVCSCVHGVCNHGPR
.::::.:.: .::. :::: :::.: :.::. : : : :::.:.:::.::::::: :
CCDS31 GSPCNGRGSCAEGMEGNGTCSCQEGFGGTACETCADDNLFGPSCSSVCNCVHGVCNSGLD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GDGSCLCFAGYTGPHCDQELPVCQELRCPQNTQCSAEAPS-----CRCLPGYTQQGSECR
:::.: :...::::.::. .: : : ::.:..:: . . :.:::.: .:. :
CCDS31 GDGTCECYSAYTGPKCDKPIPECAALLCPENSRCSPSTEDENKLECKCLPNYRGDGKYCD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 APNPCWPSPCSLLAQCSVSPKGQAQCHCPENYHGDGMVCLPKDPCTDNLGGCPSNSTLCV
::: . : :.:. .. .: : :.:.:::.:::: ::: :.:.::..::.:
CCDS31 PINPCLRKICHPHAHCTYLGPNRHSCTCQEGYRGDGQVCLPVDPCQINFGNCPTKSTVCK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 YQKPGQAFCTCRPGLVSINSNASAGCFAFC-SPFSCDRSATCQVTADGKTSCVCRESEVG
:. :::. : :. .. ... . .: : : :.:.: ..: :.: :.:... ::
CCDS31 YDGPGQSHCECKEHYQNFVPGVGCSMTDICKSDNPCHRNANCTTVAPGRTECICQKGYVG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KA0 DGRACYGHLLHEVQKATQTGRVFLQLRVA--VAMMDQGCREILTTAGPFTVLVPSVSSFS
:: .:::........ . : : :.. ....:.. :. ::::::.:. ....
CCDS31 DGLTCYGNIMERLRELNTEPRGKWQGRLTSFISLLDKAYAWPLSKLGPFTVLLPTDKGLK
360 370 380 390 400 410
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. : : : .:. .:: . : :: :... .. .: : ... .
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. . .: :. . :: : . : . : : . ... . : :. : :
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. .: .:: : .: :. . : : ::..:
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..:. . . ..: : .::: ...:. . ..:: : :: . :. .
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:: :... .: : ::: : . : . ..:.: ::: . . : .:
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:..:: .. .: .: :.:. :: : : : :. .:. : :..:..:
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. :. .: ..: .: :. ..::. :.:. :. :.:: :...: :..:
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pF1KA0 CQEGLQGDGSCVCNVGW---QGLR-CDQKITSPQCPRKCDPNANCVQDSAGASTCACAAG
: :. .:. : :..:. .: :.. ..:: .:.:. . :. .: : :
CCDS12 C-ENTKGSFVCHCQLGYMVRKGATGCSDVDECEVGGHNCDSHASCL-NIPGSFSCRCLPG
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pF1KA0 YSGNGIFCSEVDPCAHGHGGCSPHANCTKVAPGQRTCTCQDGYMGDGELCQEINSCLIHH
. :.:. : ..: :. . :::...: .: ::. :::..:. ::: .:.. . : .
CCDS12 WVGDGFECHDLDECVSQEHRCSPRGDCLNV-PGSYRCTCRQGFAGDGFFCEDRDECAENV
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pF1KA0 GGCHIHAECIPTGPQQVSCSCREGYSG-DGIRTCELLDPCSKNNGGCSPYATCKSTGDGQ
: ...:. ..: : :. :.. . :.:. .: :...: :. ...:.. :.
CCDS12 DLCD-NGQCL-NAPGGYRCECEMGFDPTEDHRACQDVDECAQGNL-CA-FGSCENL-PGM
1380 1390 1400 1410 1420
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pF1KA0 RTCTCDTAHTVGDGLTCRARVGLELLRDKHASFFSLRLLEYKELKGDGPFTIFVPHADLM
: :. .. . :
CCDS12 FRCICNGGYELDRGGGNCTDINECADPVNCINGVCINTPGSYLCSCPQDFELNPSGVGCV
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: :..:..: ::. . .: : . : .. . :: .: : ::..:.
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:. :: . :. : . : .. . ::. . : : .: : : ::::
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: . : .. :.: : :. : :. : .:. :. :.: : :
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. : . : .: .:::.: : . : .: :.: .. : :
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:: :.. . . : : . : : ..: .. . :. ..
CCDS41 YVGPRCEQQCPQGHFGPGCEQ------RCQCQ-----HGAACDHVSGACTCPAGWRGTFC
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: : : . : : .. .:::: : : ::
CCDS41 EHACPAGFFGLDCRSACNCTA---GAACDAVNG------SCLCPA--------GRRGPRC
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: :. .:.. .. : :. . : : . ..: : : ::
CCDS41 AETCPAHTYGHNCSQACACFNGASCDPVHGQCHCAPG---WMGPSCLQACP----AGLYG
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.. : : .. . : : : .: ...: . : . :.:
CCDS41 DNCR---------HSCLCQNGGTCD-PVSGHCACPEGWA-GLACEK----ECL--PRDVR
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:: ..::: . : : : : .: .. :: :. . :: :.
CCDS41 AGCRHSGGCLNGGLCDPHTGRCLCPAGWTGDKC---QSPCLRGWFGEACAQRCSCPPGAA
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CCDS41 CHHVTGAC-RCPPGFTGS------GCEQA--CP-----PGSFGEDCAQMCQCPGENPACH
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1970 1980 1990 2000
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CCDS41 PATGTCSCAAGYHGPSCQQRCPPGRYGPGCEQLCGCLNGGSCDAATGACRCPTGFLGTDC
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pF1KA0 EL-CAPGAFGPHC-QACRCTVHGRCDEGLGGSGSCFCDEGWTGPRCEV---QLELQPVCT
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CCDS41 NLTCPQGRFGPNCTHVCGCGQGAACDPV---TGTCLCPPGRAGVRCERGCPQNRFGVGCE
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pF1KA0 PPCAPE--AVCRAGN-SCECSLGYEGDGRVCTVADLCQDGHGG------CSEHANCSQVG
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CCDS41 HTCSCRNGGLCHASNGSCSCGLGWTG--RHCELA--CPPGRYGAACHLECSCHNNSTCEP
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. :: : : . :. .:. .:: : .: ::. .:. :: .:..
CCDS41 ATGTCRCGPGFYGQ--ACE--HPCPPGFHGAGCQGLCWCQHGAPCDPISGRCLCPAGFHG
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. :: :. : :.: . : .. : : : :: .: : :
CCDS41 HFCERGCEPGSFGEGCHQRCDCDGGAPCDPVTGLCLCPPGRSGATCNLDCRRGQFGPSCT
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CCDS41 LHCDCGGGADCDPVSGQCHCVDGYMGPTCREGGPLRLPENPSLAQGSAGTLPASSRPTSR
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. ::: ..: . : . . : . :. .: .:. : : .: .:. .. :
CCDS33 -KALPGLSKQEDCCGTVGTSWGFNKCQ---KCPKKPSYHGYNQMMECLPGYKRVNNTFCQ
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CCDS33 DINECQLQ-GVCPNGECLNTM---GSYRCTCKIGF------GPDPTFSSCVP-------D
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: .. : : :..:: : .: . ... . . :. : . . :
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.. : . :. .. :... .. ..:. : ... :: .. . : .
CCDS33 PGTAAFKEICPGGMGY---TVSGVHRRRPIHHHVGKGPVFVKPKNTQPVAKSTHPPPLPA
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CCDS33 KEEPVEALTFSREHGPGVAEPE----------VATAPPEKEIPSLDQEKTKLEPGQPQLS
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: ... . .: ...:. . : .. .: : :.::. :: . :
CCDS33 PG--ISTIHLHPQFPVVIEKTSPPVPVEVAPEASTSSASQVIAPTQVTEINECTVNPDIC
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:. : : .: : ...: : . :..: :.:: . .. : .
CCDS33 GAGHCINLPVRYTCICYEGY-RFSEQQRKCVDIDECTQVQHLCSQGRCENTEGSFLCICP
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pF1KA0 ----ISEEGRILLGPEGVPLQRVDVMAANGVIHMLDGILLP--PTILPILPK-HCSEEQH
:::: . . : :: . . .. . .. . . . .: . ..
CCDS33 AGFMASEEGTNCIDVD--ECLRPDVCGEGHCVNTVGAFRCEYCDSGYRMTQRGRCEDIDE
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pF1KA0 KIVAGSCVDCQALNTS---TCPPNSVKLDIFPKECVYIHDPTGLNVLKKGCASYCNQTIM
. ..: : : .:. : : . . . .:. . . :: .: : . . :
CCDS33 CLNPSTCPDEQCVNSPGSYQCVPCTEGFRGWNGQCLDVDECLEPNVCANGDCSNLEGSYM
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. : ::. :: : .: : : : . :.:.. .:. : : :. . :
CCDS33 CS-CHKGYTRTPDHKHCRDIDECQQG--NLCVN-GQCKN-TEGSFRCTCGQGYQLSAAKD
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pF1KA0 ICSNPNKHGEQCQEDCGCVHGLCDNRPGS-GGVCQQGTCAPGFSGRFCNESMGDCGPTGL
: . . .::. :.:: : : :: ::.:: : :. : : :....:
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. :. .. :.. : : : :::. :. .: : : :: : :. ..::. .. :.
CCDS33 V--CQ-RGDCINTAGSYDCTCPDGFQLDDNKTCQDINECEHP--GLCGPQGECL-NTEGS
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::.:..:.: .:::.: :::: .. : . ..:. .. :. :: : :: . ::
CCDS33 FHCVCQQGFSISADGRTCEDIDECVNNTV--CDSHGFCDNTA-GSFRCLCYQGFQAPQDG
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: .. :. .: : : : :. : :. .:.:
CCDS33 QGCVDVNECELLSGVC-GEAFCENVEGS-FLCVCADENQEYSPMTGQCRSRTSTDLDVDV
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pF1KA0 IFYQWLKSAGITLPADRRVTALVPSEAAVRQLSPEDRAFWLQPRTLPNLVRAHFLQGALF
CCDS33 DQPKEEKKECYYNLNDASLCDNVLAPNVTKQECCCTSGVGWGDNCEIFPCPVLGTAEFTE
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pF1KA0 EDCGCVHGLCDNRPGSGGVCQQGTCAPGFSGRFCNESMGD-CGPT--GLAQHCHLHARCV
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CCDS54 TSWGFNKCQ----------KC-PKKPSYH----GYNQMMECLPGYKRVNNTFCQD-----
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CCDS54 ------INECQL--QGVC-PNGECLNTM-GSYRCTCKIGFGPDPTFSSCVPDPPVISEEK
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CCDS54 GPCY-----RLVSSG-RQCMHP-------LSVH--LTKQLCC---CSVGKAW----G---
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pF1KA0 PADRRVTALVPSEAAVRQLSPEDRAFWLQP--RTLPNLVRAHFLQGALFEEELARLGGQE
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CCDS54 PHCEKCP--LPGTAAFKEICPGGMGYTVSGVHRRRP--IHHHVGKGPVFVKPK---NTQP
390 400 410 420 430
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pF1KA0 VA--TLNPTTRWEIRNISGRVWVQNASVDVAD-LLATNGVLHILSQVLLPPRGDVPGGQG
:: : : . . . . .. .. . ::. .:: . . .. ::
CCDS54 VAKSTHPPPLPAKEEPVEALTFSREHGPGVAEPEVATAPPEKEIPSLDQEKTKLEPGQPQ
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pF1KA0 L---LQQLDLVPAFSLFRELLQHH---GLVPQIEAATAYTIFVPTNRSLEAQGNSSHLDA
: .. . : : : . : . ..:. ...: ...::. . : . . . :
CCDS54 LSPGISTIHLHPQFPVVIEKTSPPVPVEVAPEASTSSASQVIAPTQVT-EINECTVNPDI
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pF1KA0 DTVRHHVVLG---EALSMETLRKGGHRNSLLGPAHWIVFYNHSGQPEVNHVPLEGPMLEA
. : . : . .: : . .. . . . . .: . ... :: .:
CCDS54 CGAGHCINLPVRYTCICYEGYRFSEQQRKCVDIDECTQVQHLCSQGRCENT--EGSFLCI
560 570 580 590 600 610
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pF1KA0 -PGRSLIGLSGVLTVGSSRCLHSHAEALREKCVNCTRRFRCT---QGFQLQDTPR----K
:. . . :. . ..::. . . . .::: . ::: .:... . :
CCDS54 CPAGFMASEEGTNCIDVDECLRPDVCG-EGHCVNTVGAFRCEYCDSGYRMTQRGRCEDID
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pF1KA0 SCVYRSGFSFSRGCSYTCAKKIQVPDCCPGFFG--TLCEPCPGGL-GGVCSGHGQCQDRF
:. : .. : . .. :: : :: : : : .::. .:.:.. .
CCDS54 ECLNPSTCP-DEQCVNSPGSYQCVP-CTEGFRGWNGQCLDVDECLEPNVCA-NGDCSN-L
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pF1KA0 LGSGECHCHEGFHGTA-CEVCELGRYGPNCTGVCDCAHGLCQEGLQGDGSCVCNVGWQ-G
:: : ::.:. : . : : .: :..: :.. .:. :.:. :.: .
CCDS54 EGSYMCSCHKGYTRTPDHKHC---RDIDECQQGNLCVNGQCKN-TEGSFRCTCGQGYQLS
740 750 760 770 780
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pF1KA0 LRCDQKITSPQCPRK--CDPNANCVQDSAGASTCACAAGY--SGNGIFCSEVDPCAHGHG
:: .: .. : ...: ... :. :.: :: :: : : ... : . ..
CCDS54 AAKDQCEDIDECQHRHLC-AHGQC-RNTEGSFQCVCDQGYRASGLGDHCEDINECLEDKS
790 800 810 820 830 840
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KA0 GCSPHANCTKVAPGQRTCTCQDGY-MGDGELCQEINSCLIHHGGCHIHAECIPTGPQQVS
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CCDS54 VCQ-RGDCINTA-GSYDCTCPDGFQLDDNKTCQDINECE-HPGLCGPQGECLNT-EGSFH
850 860 870 880 890 900
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