Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0226
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0226, 927 aa
1>>>pF1KA0226 927 - 927 aa - 927 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7640+/-0.000985; mu= 5.3068+/- 0.059
mean_var=173.4995+/-34.738, 0's: 0 Z-trim(110.9): 24 B-trim: 5 in 1/52
Lambda= 0.097370
statistics sampled from 11949 (11971) to 11949 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.368), width: 16
Scan time: 3.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46987.1 RUBCN gene_id:9711|Hs108|chr3 ( 927) 6211 885.3 0
CCDS43195.1 RUBCN gene_id:9711|Hs108|chr3 ( 972) 3773 542.9 1.1e-153
CCDS66544.1 RUBCNL gene_id:80183|Hs108|chr13 ( 505) 1216 183.5 8.7e-46
CCDS66542.1 RUBCNL gene_id:80183|Hs108|chr13 ( 527) 1216 183.5 9e-46
CCDS66545.1 RUBCNL gene_id:80183|Hs108|chr13 ( 595) 1216 183.6 1e-45
CCDS31970.2 RUBCNL gene_id:80183|Hs108|chr13 ( 662) 1216 183.6 1.1e-45
CCDS73569.1 RUBCNL gene_id:80183|Hs108|chr13 ( 447) 1156 175.1 2.7e-43
CCDS66543.1 RUBCNL gene_id:80183|Hs108|chr13 ( 635) 747 117.7 7.2e-26
CCDS58496.1 DEF8 gene_id:54849|Hs108|chr16 ( 391) 555 90.6 6.2e-18
CCDS58495.1 DEF8 gene_id:54849|Hs108|chr16 ( 441) 555 90.6 6.9e-18
CCDS58493.1 DEF8 gene_id:54849|Hs108|chr16 ( 451) 555 90.6 7e-18
CCDS10989.1 DEF8 gene_id:54849|Hs108|chr16 ( 512) 555 90.7 7.8e-18
CCDS42808.1 PLEKHM3 gene_id:389072|Hs108|chr2 ( 761) 543 89.1 3.5e-17
CCDS32671.1 PLEKHM1 gene_id:9842|Hs108|chr17 (1056) 485 81.0 1.3e-14
>>CCDS46987.1 RUBCN gene_id:9711|Hs108|chr3 (927 aa)
initn: 6211 init1: 6211 opt: 6211 Z-score: 4723.6 bits: 885.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6211; 100.0% identity (100.0% similar) in 927 aa overlap (1-927:1-927)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQSILYHGLIRDQACRRQTDYWQFVKDIRWLSPHSALHVEKFISVHENDQSSADGASERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MQSILYHGLIRDQACRRQTDYWQFVKDIRWLSPHSALHVEKFISVHENDQSSADGASERA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VAELWLQHSLQYHCLSAQLRPLLGDRQYIRKFYTDAAFLLSDAHVTAMLQCLEAVEQNNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VAELWLQHSLQYHCLSAQLRPLLGDRQYIRKFYTDAAFLLSDAHVTAMLQCLEAVEQNNP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 RLLAQIDASMFARKHESPLLVTKSQSLTALPSSTYTPPNSYAQHSYFGSFSSLHQSVPNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLLAQIDASMFARKHESPLLVTKSQSLTALPSSTYTPPNSYAQHSYFGSFSSLHQSVPNN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 GSERRSTSFPLSGPPRKPQESRGHVSPAEDQTIQAPPVSVSALARDSPLTPNEMSSSTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSERRSTSFPLSGPPRKPQESRGHVSPAEDQTIQAPPVSVSALARDSPLTPNEMSSSTLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SPIEASWVSSQNDSPGDASEGPEYLAIGNLDPRGRTASCQSHSSNAESSSSNLFSSSSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPIEASWVSSQNDSPGDASEGPEYLAIGNLDPRGRTASCQSHSSNAESSSSNLFSSSSSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KPDSAASSLGDQEGGGESQLSSVLRRSSFSEGQTLTVTSGAKKSHIRSHSDTSIASRGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KPDSAASSLGDQEGGGESQLSSVLRRSSFSEGQTLTVTSGAKKSHIRSHSDTSIASRGAP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GGPRNITIIVEDPIAESCNDKAKLRGPLPYSGQSSEVSTPSSLYMEYEGGRYLCSGEGMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GGPRNITIIVEDPIAESCNDKAKLRGPLPYSGQSSEVSTPSSLYMEYEGGRYLCSGEGMF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RRPSEGQSLISYLSEQDFGSCADLEKENAHFSISESLIAAIELMKCNMMSQCLEEEEVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RRPSEGQSLISYLSEQDFGSCADLEKENAHFSISESLIAAIELMKCNMMSQCLEEEEVEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 EDSDREIQELKQKIRLRRQQIRTKNLLPMYQEAEHGSFRVTSSSSQFSSRDSAQLSDSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EDSDREIQELKQKIRLRRQQIRTKNLLPMYQEAEHGSFRVTSSSSQFSSRDSAQLSDSGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ADEVDEFEIQDADIRRNTASSSKSFVSSQSFSHCFLHSTSAEAVAMGLLKQFEGMQLPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ADEVDEFEIQDADIRRNTASSSKSFVSSQSFSHCFLHSTSAEAVAMGLLKQFEGMQLPAA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SELEWLVPEHDAPQKLLPIPDSLPISPDDGQHADIYKLRIRVRGNLEWAPPRPQIIFNVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SELEWLVPEHDAPQKLLPIPDSLPISPDDGQHADIYKLRIRVRGNLEWAPPRPQIIFNVH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 PAPTRKIAVAKQNYRCAGCGIRTDPDYIKRLRYCEYLGKYFCQCCHENAQMAIPSRVLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PAPTRKIAVAKQNYRCAGCGIRTDPDYIKRLRYCEYLGKYFCQCCHENAQMAIPSRVLRK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 WDFSKYYVSNFSKDLLIKIWNDPLFNVQDINSALYRKVKLLNQVRLLRVQLCHMKNMFKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WDFSKYYVSNFSKDLLIKIWNDPLFNVQDINSALYRKVKLLNQVRLLRVQLCHMKNMFKT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 CRLAKELLDSFDTVPGHLTEDLHLYSLNDLTATRKGELGPRLAELTRAGATHVERCMLCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CRLAKELLDSFDTVPGHLTEDLHLYSLNDLTATRKGELGPRLAELTRAGATHVERCMLCQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 AKGFICEFCQNEDDIIFPFELHKCRTCEECKACYHKACFKSGSCPRCERLQARREALARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKGFICEFCQNEDDIIFPFELHKCRTCEECKACYHKACFKSGSCPRCERLQARREALARQ
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KA0 SLESYLSDYEEEPAEALALEAAVLEAT
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLESYLSDYEEEPAEALALEAAVLEAT
910 920
>>CCDS43195.1 RUBCN gene_id:9711|Hs108|chr3 (972 aa)
initn: 6098 init1: 3746 opt: 3773 Z-score: 2872.4 bits: 542.9 E(32554): 1.1e-153
Smith-Waterman score: 6072; 98.4% identity (98.4% similar) in 927 aa overlap (1-927:61-972)
10 20 30
pF1KA0 MQSILYHGLIRDQACRRQTDYWQFVKDIRW
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NLKTTVEGLVSTNSPNVWSKYGGLERLCRDMQSILYHGLIRDQACRRQTDYWQFVKDIRW
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 LSPHSALHVEKFISVHENDQSSADGASERAVAELWLQHSLQYHCLSAQLRPLLGDRQYIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSPHSALHVEKFISVHENDQSSADGASERAVAELWLQHSLQYHCLSAQLRPLLGDRQYIR
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 KFYTDAAFLLSDAHVTAMLQCLEAVEQNNPRLLAQIDASMFARKHESPLLVTKSQSLTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KFYTDAAFLLSDAHVTAMLQCLEAVEQNNPRLLAQIDASMFARKHESPLLVTKSQSLTAL
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 PSSTYTPPNSYAQHSYFGSFSSLHQSVPNNGSERRSTSFPLSGPPRKPQESRGHVSPAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSSTYTPPNSYAQHSYFGSFSSLHQSVPNNGSERRSTSFPLSGPPRKPQESRGHVSPAED
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 QTIQAPPVSVSALARDSPLTPNEMSSSTLTSPIEASWVSSQNDSPGDASEGPEYLAIGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QTIQAPPVSVSALARDSPLTPNEMSSSTLTSPIEASWVSSQNDSPGDASEGPEYLAIGNL
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 DPRGRTASCQSHSSNAESSSSNLFSSSSSQKPDSAASSLGDQEGGGESQLSSVLRRSSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DPRGRTASCQSHSSNAESSSSNLFSSSSSQKPDSAASSLGDQEGGGESQLSSVLRRSSFS
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 EGQTLTVTSGAKKSHIRSHSDTSIASRGAPGGPRNITIIVEDPIAESCNDKAKLRGPLPY
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS43 EGQTLTVTSGAKKSHIRSHSDTSIASRGAP---------------ESCNDKAKLRGPLPY
400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 SGQSSEVSTPSSLYMEYEGGRYLCSGEGMFRRPSEGQSLISYLSEQDFGSCADLEKENAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SGQSSEVSTPSSLYMEYEGGRYLCSGEGMFRRPSEGQSLISYLSEQDFGSCADLEKENAH
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 FSISESLIAAIELMKCNMMSQCLEEEEVEEEDSDREIQELKQKIRLRRQQIRTKNLLPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FSISESLIAAIELMKCNMMSQCLEEEEVEEEDSDREIQELKQKIRLRRQQIRTKNLLPMY
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 QEAEHGSFRVTSSSSQFSSRDSAQLSDSGSADEVDEFEIQDADIRRNTASSSKSFVSSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QEAEHGSFRVTSSSSQFSSRDSAQLSDSGSADEVDEFEIQDADIRRNTASSSKSFVSSQS
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 FSHCFLHSTSAEAVAMGLLKQFEGMQLPAASELEWLVPEHDAPQKLLPIPDSLPISPDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FSHCFLHSTSAEAVAMGLLKQFEGMQLPAASELEWLVPEHDAPQKLLPIPDSLPISPDDG
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 QHADIYKLRIRVRGNLEWAPPRPQIIFNVHPAPTRKIAVAKQNYRCAGCGIRTDPDYIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QHADIYKLRIRVRGNLEWAPPRPQIIFNVHPAPTRKIAVAKQNYRCAGCGIRTDPDYIKR
680 690 700 710 720 730
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 LRYCEYLGKYFCQCCHENAQMAIPSRVLRKWDFSKYYVSNFSKDLLIKIWNDPLFNVQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LRYCEYLGKYFCQCCHENAQMAIPSRVLRKWDFSKYYVSNFSKDLLIKIWNDPLFNVQDI
740 750 760 770 780 790
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 NSALYRKVKLLNQVRLLRVQLCHMKNMFKTCRLAKELLDSFDTVPGHLTEDLHLYSLNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NSALYRKVKLLNQVRLLRVQLCHMKNMFKTCRLAKELLDSFDTVPGHLTEDLHLYSLNDL
800 810 820 830 840 850
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 TATRKGELGPRLAELTRAGATHVERCMLCQAKGFICEFCQNEDDIIFPFELHKCRTCEEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TATRKGELGPRLAELTRAGATHVERCMLCQAKGFICEFCQNEDDIIFPFELHKCRTCEEC
860 870 880 890 900 910
880 890 900 910 920
pF1KA0 KACYHKACFKSGSCPRCERLQARREALARQSLESYLSDYEEEPAEALALEAAVLEAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KACYHKACFKSGSCPRCERLQARREALARQSLESYLSDYEEEPAEALALEAAVLEAT
920 930 940 950 960 970
>>CCDS66544.1 RUBCNL gene_id:80183|Hs108|chr13 (505 aa)
initn: 1256 init1: 909 opt: 1216 Z-score: 935.5 bits: 183.5 E(32554): 8.7e-46
Smith-Waterman score: 1216; 41.2% identity (68.3% similar) in 461 aa overlap (443-897:46-497)
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LCSGEGMFRRPSEGQSLISYLSEQDFGSCADLEKENAHFSISESLIAAIELMKCNMMSQC
:.::::::: ... .:.:.: ::::..::
CCDS66 REIHTPGAVQVSRRTISSNSFSPEVFVLPVDVEKENAHFYVADMIISAMEKMKCNILSQQ
20 30 40 50 60 70
480 490 500 510 520
pF1KA0 LEEEEVEEED----SDREIQELKQKIRLRRQQIRTKNLLPMYQEAEHGSFRVTSSSSQFS
: .: . ::. .:. ..... . . :. . ..:. . .
CCDS66 QTESWSKEVSGLLGSDQPDSEMTFDTNIKQESGSSTSSYSGYEGC--AVLQVSPVTETRT
80 90 100 110 120 130
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 SRDSAQLSDSGSADEVDEFEIQD-ADIRRNTASSSKSFVSSQSFSHCFLHSTSAEAVAMG
.: .. .:::: : . .:. : . : : ::.: .. .::: .:
CCDS66 YHDVKEICKC----DVDEFVILELGDFNDITETCSCSCSSSKSVTYEP-DFNSAELLAKE
140 150 160 170 180
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 LLKQFEGMQLPAASELEWLVPEHDAPQKLLPIPDSLPISPDDGQHA-DIYKLRIRVRGNL
: . :. . .. . . :. .: ... . . . ...... . :.. :.::.
CCDS66 LYRVFQKCWILSVVNSQ-LAGSLSAAGSIVVNEECVRKDFESSMNVVQEIKFKSRIRGTE
190 200 210 220 230 240
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 EWAPPRPQIIFNVHPAPTRKIAVAKQNYRCAGCGIRTDPDYIKRLRYCEYLGKYFCQCCH
.::::: :::::.:: : ..:: ::. ::::: ..: ..::::::::::::::.:::
CCDS66 DWAPPRFQIIFNIHPPLKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVEPKFVKRLRYCEYLGKYFCDCCH
250 260 270 280 290 300
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 ENAQMAIPSRVLRKWDFSKYYVSNFSKDLLIKIWNDPLFNVQDINSALYRKVKLLNQVRL
:. ::.:.: :::.:::::::::.:: .::..:.::. .:...:: :.: :..:.
CCDS66 SYAESCIPARILMMWDFKKYYVSNFSKQLLDSIWHQPIFNLLSIGQSLYAKAKELDRVKE
310 320 330 340 350 360
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 LRVQLCHMKNMFKTCRLAKELLDSFDTVPGHLTEDLHLYSLNDLTATRKGELGPRLAELT
.. :: :.:...::::.:. : :. ::::::..:::.::.::. .:: :.: : ..
CCDS66 IQEQLFHIKKLLKTCRFANSALKEFEQVPGHLTDELHLFSLEDLVRIKKGLLAPLLKDIL
370 380 390 400 410 420
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 RAGATHVERCMLCQAKGFICEFCQNEDDIIFPFELHKCRTCEECKACYHKACFKSGSCPR
.:. .:: : :::.:::::::::: .::::. :: : :.::.:: ::.:. :::
CCDS66 KASLAHVAGCELCQGKGFICEFCQNTT-VIFPFQTATCRRCSACRACFHKQCFQSSECPR
430 440 450 460 470 480
890 900 910 920
pF1KA0 CERLQARREALARQSLESYLSDYEEEPAEALALEAAVLEAT
: :. :::. :
CCDS66 CARITARRKLLESVASAAT
490 500
>>CCDS66542.1 RUBCNL gene_id:80183|Hs108|chr13 (527 aa)
initn: 1256 init1: 909 opt: 1216 Z-score: 935.2 bits: 183.5 E(32554): 9e-46
Smith-Waterman score: 1222; 39.4% identity (65.0% similar) in 515 aa overlap (389-897:23-519)
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 APGGPRNITIIVEDPIAESCNDKAKLRGPLPYSGQSSEVSTPSSLYMEYEGGRYLCSGEG
:: .: :: : . : :
CCDS66 MVRPGYSHRVSLPTSPGILATSPYPETDSAFFEPSHLTSAADEGAVQVS---
10 20 30 40
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 MFRRPSEGQSLISYLSEQDFGSCADLEKENAHFSISESLIAAIELMKCNMMSQCLEEEEV
:: ..:. : . : .:.::::::: ... .:.:.: ::::..:: :
CCDS66 --RRTISSNSF----SPEVFVLPVDVEKENAHFYVADMIISAMEKMKCNILSQQQTESWS
50 60 70 80 90 100
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EEED----SDREIQELKQKIRLRRQQIRTKNLLPMYQEAEHGSFRVTSSSSQFSSRDSAQ
.: . ::. .:. ..... . . :. . ..:. . . .: .
CCDS66 KEVSGLLGSDQPDSEMTFDTNIKQESGSSTSSYSGYEGC--AVLQVSPVTETRTYHDVKE
110 120 130 140 150 160
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 LSDSGSADEVDEFEIQD-ADIRRNTASSSKSFVSSQSFSHCFLHSTSAEAVAMGLLKQFE
. .:::: : . .:. : . : : ::.: .. . ::: .: : . :.
CCDS66 ICKC----DVDEFVILELGDFNDITETCSCSCSSSKSVTYEPDFN-SAELLAKELYRVFQ
170 180 190 200 210
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 GMQLPAASELEWLVPEHDAPQKLLPIPDSLPISPDDGQHA-DIYKLRIRVRGNLEWAPPR
. .. . . :. .: ... . . . ...... . :.. :.::. .:::::
CCDS66 KCWILSVVNSQ-LAGSLSAAGSIVVNEECVRKDFESSMNVVQEIKFKSRIRGTEDWAPPR
220 230 240 250 260 270
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 PQIIFNVHPAPTRKIAVAKQNYRCAGCGIRTDPDYIKRLRYCEYLGKYFCQCCHENAQMA
:::::.:: : ..:: ::. ::::: ..: ..::::::::::::::.::: :.
CCDS66 FQIIFNIHPPLKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVEPKFVKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESC
280 290 300 310 320 330
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 IPSRVLRKWDFSKYYVSNFSKDLLIKIWNDPLFNVQDINSALYRKVKLLNQVRLLRVQLC
::.:.: :::.:::::::::.:: .::..:.::. .:...:: :.: :..:. .. ::
CCDS66 IPARILMMWDFKKYYVSNFSKQLLDSIWHQPIFNLLSIGQSLYAKAKELDRVKEIQEQLF
340 350 360 370 380 390
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 HMKNMFKTCRLAKELLDSFDTVPGHLTEDLHLYSLNDLTATRKGELGPRLAELTRAGATH
:.:...::::.:. : :. ::::::..:::.::.::. .:: :.: : .. .:. .:
CCDS66 HIKKLLKTCRFANSALKEFEQVPGHLTDELHLFSLEDLVRIKKGLLAPLLKDILKASLAH
400 410 420 430 440 450
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 VERCMLCQAKGFICEFCQNEDDIIFPFELHKCRTCEECKACYHKACFKSGSCPRCERLQA
: : :::.:::::::::: .::::. :: : :.::.:: ::.:. :::: :. :
CCDS66 VAGCELCQGKGFICEFCQNTT-VIFPFQTATCRRCSACRACFHKQCFQSSECPRCARITA
460 470 480 490 500 510
900 910 920
pF1KA0 RREALARQSLESYLSDYEEEPAEALALEAAVLEAT
::. :
CCDS66 RRKLLESVASAAT
520
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: . : :.. : ....:: : .: :.. .
CCDS66 MVSNHYFLLCVNLPLREIHTPGPSPSCLGDSLAETTLSEDTTDSVGSASPH
10 20 30 40 50
350 360 370 380 390
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. .. :. :..: . :: . ... . : . :: .:
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400 410 420 430 440 450
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:: : . : : :: ..: .: . : .:.::::::: ... .:.
CCDS66 PSHLTSAADEGAVQVS-----RRTISSNS----FSPEVFVLPVDVEKENAHFYVADMIIS
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:.: ::::..:: : .: . ::. .:. ..... . . :.
CCDS66 AMEKMKCNILSQQQTESWSKEVSGLLGSDQPDSEMTFDTNIKQESGSSTSSYSGYEGC--
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520 530 540 550 560 570
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. ..:. . . .: .. .:::: : . .:. : . : : ::.: ..
CCDS66 AVLQVSPVTETRTYHDVKEICKC----DVDEFVILELGDFNDITETCSCSCSSSKSVTYE
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pF1KA0 FLHSTSAEAVAMGLLKQFEGMQLPAASELEWLVPEHDAPQKLLPIPDSLPISPDDGQHA-
.::: .: : . :. . .. . . :. .: ... . . . ......
CCDS66 P-DFNSAELLAKELYRVFQKCWILSVVNSQ-LAGSLSAAGSIVVNEECVRKDFESSMNVV
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. :.. :.::. .::::: :::::.:: : ..:: ::. ::::: ..: ..:::::
CCDS66 QEIKFKSRIRGTEDWAPPRFQIIFNIHPPLKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVEPKFVKRLRY
330 340 350 360 370 380
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pF1KA0 CEYLGKYFCQCCHENAQMAIPSRVLRKWDFSKYYVSNFSKDLLIKIWNDPLFNVQDINSA
:::::::::.::: :. ::.:.: :::.:::::::::.:: .::..:.::. .:...
CCDS66 CEYLGKYFCDCCHSYAESCIPARILMMWDFKKYYVSNFSKQLLDSIWHQPIFNLLSIGQS
390 400 410 420 430 440
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 LYRKVKLLNQVRLLRVQLCHMKNMFKTCRLAKELLDSFDTVPGHLTEDLHLYSLNDLTAT
:: :.: :..:. .. :: :.:...::::.:. : :. ::::::..:::.::.::.
CCDS66 LYAKAKELDRVKEIQEQLFHIKKLLKTCRFANSALKEFEQVPGHLTDELHLFSLEDLVRI
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820 830 840 850 860 870
pF1KA0 RKGELGPRLAELTRAGATHVERCMLCQAKGFICEFCQNEDDIIFPFELHKCRTCEECKAC
.:: :.: : .. .:. .:: : :::.:::::::::: .::::. :: : :.::
CCDS66 KKGLLAPLLKDILKASLAHVAGCELCQGKGFICEFCQNTT-VIFPFQTATCRRCSACRAC
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880 890 900 910 920
pF1KA0 YHKACFKSGSCPRCERLQARREALARQSLESYLSDYEEEPAEALALEAAVLEAT
.:: ::.:. :::: :. :::. :
CCDS66 FHKQCFQSSECPRCARITARRKLLESVASAAT
570 580 590
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CCDS31 MVSQSTVRQDSPVEPWE-GISDHSGIIDGSP
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250 260 270 280 290 300
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..: : : : : . .. . :.. .. .:. .:.. :.
CCDS31 RLLNTDHP------PCQLDIRLMRHKAVWINPQDVQQQPQDLQSQVPAAGNSGTHFVTDA
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pF1KA0 AASSLGDQEGGGESQLSSVLRRSSFSEGQTLTVTSGAKKSHIRSHSDTSIASRGA----P
:. : : . : :.. : ....:: : .: :.. .. .. :. :..: . :
CCDS31 ASPS-----GPSPSCLGDSLAETTLSEDTTDSVGSASPHGSSEKSSSFSLSSTEVHMVRP
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pF1KA0 GGPRNITIIVEDPIAESCNDKAKLRGPLPYSGQSSEVSTPSSLYMEYEGGRYLCSGEGMF
: . ... . : . :: .: :: : . : :
CCDS31 GYSHRVSLPTSPGILATS----------PYPETDSAFFEPSHLTSAADEGAVQVS-----
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pF1KA0 RRPSEGQSLISYLSEQDFGSCADLEKENAHFSISESLIAAIELMKCNMMSQCLEEEEVEE
:: ..:. : . : .:.::::::: ... .:.:.: ::::..:: : .:
CCDS31 RRTISSNSF----SPEVFVLPVDVEKENAHFYVADMIISAMEKMKCNILSQQQTESWSKE
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. ::. .:. ..... . . :. . ..:. . . .: ..
CCDS31 VSGLLGSDQPDSEMTFDTNIKQESGSSTSSYSGYEGC--AVLQVSPVTETRTYHDVKEIC
250 260 270 280 290
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pF1KA0 DSGSADEVDEFEIQD-ADIRRNTASSSKSFVSSQSFSHCFLHSTSAEAVAMGLLKQFEGM
.:::: : . .:. : . : : ::.: .. . ::: .: : . :.
CCDS31 KC----DVDEFVILELGDFNDITETCSCSCSSSKSVTYEPDFN-SAELLAKELYRVFQKC
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600 610 620 630 640 650
pF1KA0 QLPAASELEWLVPEHDAPQKLLPIPDSLPISPDDGQHA-DIYKLRIRVRGNLEWAPPRPQ
. .. . . :. .: ... . . . ...... . :.. :.::. .::::: :
CCDS31 WILSVVNSQ-LAGSLSAAGSIVVNEECVRKDFESSMNVVQEIKFKSRIRGTEDWAPPRFQ
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pF1KA0 IIFNVHPAPTRKIAVAKQNYRCAGCGIRTDPDYIKRLRYCEYLGKYFCQCCHENAQMAIP
::::.:: : ..:: ::. ::::: ..: ..::::::::::::::.::: :. ::
CCDS31 IIFNIHPPLKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVEPKFVKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESCIP
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pF1KA0 SRVLRKWDFSKYYVSNFSKDLLIKIWNDPLFNVQDINSALYRKVKLLNQVRLLRVQLCHM
.:.: :::.:::::::::.:: .::..:.::. .:...:: :.: :..:. .. :: :.
CCDS31 ARILMMWDFKKYYVSNFSKQLLDSIWHQPIFNLLSIGQSLYAKAKELDRVKEIQEQLFHI
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pF1KA0 KNMFKTCRLAKELLDSFDTVPGHLTEDLHLYSLNDLTATRKGELGPRLAELTRAGATHVE
:...::::.:. : :. ::::::..:::.::.::. .:: :.: : .. .:. .::
CCDS31 KKLLKTCRFANSALKEFEQVPGHLTDELHLFSLEDLVRIKKGLLAPLLKDILKASLAHVA
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CCDS31 GCELCQGKGFICEFCQNTT-VIFPFQTATCRRCSACRACFHKQCFQSSECPRCARITARR
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. :
CCDS31 KLLESVASAAT
660
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::. .:. ..... . . :. . ..:. . . .: ..
CCDS73 SDQPDSEMTFDTNIKQESGSSTSSYSGYEGC--AVLQVSPVTETRTYHDVKEICKC----
40 50 60 70 80
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pF1KA0 EVDEFEIQD-ADIRRNTASSSKSFVSSQSFSHCFLHSTSAEAVAMGLLKQFEGMQLPAAS
.:::: : . .:. : . : : ::.: .. .::: .: : . :. . ..
CCDS73 DVDEFVILELGDFNDITETCSCSCSSSKSVTYEP-DFNSAELLAKELYRVFQKCWILSVV
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. . :. .: ... . . . ...... . :.. :.::. .::::: :::::.:
CCDS73 NSQ-LAGSLSAAGSIVVNEECVRKDFESSMNVVQEIKFKSRIRGTEDWAPPRFQIIFNIH
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pF1KA0 PAPTRKIAVAKQNYRCAGCGIRTDPDYIKRLRYCEYLGKYFCQCCHENAQMAIPSRVLRK
: : ..:: ::. ::::: ..: ..::::::::::::::.::: :. ::.:.:
CCDS73 PPLKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVEPKFVKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESCIPARILMM
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pF1KA0 WDFSKYYVSNFSKDLLIKIWNDPLFNVQDINSALYRKVKLLNQVRLLRVQLCHMKNMFKT
:::.:::::::::.:: .::..:.::. .:...:: :.: :..:. .. :: :.:...::
CCDS73 WDFKKYYVSNFSKQLLDSIWHQPIFNLLSIGQSLYAKAKELDRVKEIQEQLFHIKKLLKT
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pF1KA0 CRLAKELLDSFDTVPGHLTEDLHLYSLNDLTATRKGELGPRLAELTRAGATHVERCMLCQ
::.:. : :. ::::::..:::.::.::. .:: :.: : .. .:. .:: : :::
CCDS73 CRFANSALKEFEQVPGHLTDELHLFSLEDLVRIKKGLLAPLLKDILKASLAHVAGCELCQ
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pF1KA0 AKGFICEFCQNEDDIIFPFELHKCRTCEECKACYHKACFKSGSCPRCERLQARREALARQ
.:::::::::: .::::. :: : :.::.:: ::.:. :::: :. :::. :
CCDS73 GKGFICEFCQNTT-VIFPFQTATCRRCSACRACFHKQCFQSSECPRCARITARRKLLESV
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910 920
pF1KA0 SLESYLSDYEEEPAEALALEAAVLEAT
CCDS73 ASAAT
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CCDS66 MVSQSTVRQDSPVEPWE-GISDHSGIIDGSP
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250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VSSQNDSPGDASEGPEYLAIGNLDPRG---RTASCQSHSSNAESSSSNLFSSSSSQKPDS
..: : : : : . .. . :.. .. .:. .:.. :.
CCDS66 RLLNTDHP------PCQLDIRLMRHKAVWINPQDVQQQPQDLQSQVPAAGNSGTHFVTDA
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pF1KA0 AASSLGDQEGGGESQLSSVLRRSSFSEGQTLTVTSGAKKSHIRSHSDTSIASRGA----P
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CCDS66 ASPS-----GPSPSCLGDSLAETTLSEDTTDSVGSASPHGSSEKSSSFSLSSTEVHMVRP
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: . ... . : . :: .: :: : . : :
CCDS66 GYSHRVSLPTSPGILATS----------PYPETDSAFFEPSHLTSAADEGAVQVS-----
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CCDS66 RRTISSNSF----SPEVFVLPVDVEKENAHFYVADMIISAMEKMKCNILSQQQTESWSKE
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CCDS66 VSGLLGSDQPDSEMTFDTNIKQESGSSTSSYSGYEGC--AVLQVSPVTETRTYHDVKEIC
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CCDS66 KC----DVDEFVILELGDFNDITETCSCSCSSSKSVTYEP-DFNSAELLAKELYRVFQKC
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CCDS66 WILSVVNSQ-LAGSLSAAGSIVVNEECVRKDFESSMNVVQEIKFKSRIRGTEDWAPPRFQ
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CCDS66 IIFNIHPPLKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVEPKFVKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESCIP
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pF1KA0 SRVLRKWDFSKYYVSNFSKDLLIKIWNDPLFNVQDINSALYRKVKLLNQVRLLRVQLCHM
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CCDS66 ARILMMWDFKKYYVSNFSKQLLDSIWHQPIFNLLSIGQSLYAKAKELDRVKEIQEQLFHI
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:...::::.:
CCDS66 KKLLKTCRFANSCVKERALFVNFARIRLSSSHFRQQHVEDVQRAGLAFTNSASSPPSAPG
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CCDS58 VEELVEIRKLRQDILLMKPYFITCREAMEARLLLQLQDR--QHFVENDEMYSVQDLLDVH
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CCDS58 AGRLGCSLTEIHTLFAKHIKLDCERCQAKGFVCELCR-EGDVLFPFDSHTS-VCADCSAV
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CCDS58 FHRDCYYDNSTTCPKCARLSLRKQSLFQEPGPDVEA
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CCDS58 NLISKPCVSSKVSHQAEYELNICPETGLDSQDYRCAECRAPISLRGVP---SEARQCDYT
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CCDS58 GQYYCSHCHWNDLAVIPARVVHNWDFEPRKVSRCSMRYLALMVSRPVLRLREINPLLFSY
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