Result of FASTA (omim) for
pF1KA0203
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0203, 1591 aa
1>>>pF1KA0203 1591 - 1591 aa - 1591 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9145+/-0.000743; mu= -17.0404+/- 0.045
mean_var=648.2432+/-132.338, 0's: 0 Z-trim(115.6): 367 B-trim: 264 in 1/57
Lambda= 0.050374
statistics sampled from 25883 (26243) to 25883 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 13.500
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016869596 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1591) 10238 761.6 1.2e-218
NP_001077086 (OMIM: 114480,606837) RB1-inducible c (1591) 10238 761.6 1.2e-218
XP_011515945 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1594) 10222 760.5 2.6e-218
NP_055596 (OMIM: 114480,606837) RB1-inducible coil (1594) 10222 760.5 2.6e-218
XP_016869594 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1598) 10214 759.9 3.9e-218
XP_011515947 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1584) 10071 749.5 5.2e-215
XP_011515946 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1587) 10055 748.3 1.2e-214
XP_016869597 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1591) 10047 747.7 1.7e-214
XP_016869595 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1594) 9898 736.9 3.2e-211
XP_016869593 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1601) 9898 736.9 3.2e-211
XP_016869592 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1601) 9898 736.9 3.2e-211
XP_011515948 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1542) 9897 736.8 3.3e-211
XP_016869598 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1549) 9573 713.3 4e-204
XP_011515949 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1479) 9304 693.7 3e-198
XP_011515951 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1277) 8233 615.8 7.2e-175
XP_016869601 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1048) 6528 491.8 1.3e-137
XP_016869600 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1051) 6512 490.7 2.8e-137
XP_016869599 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1- (1058) 6188 467.1 3.5e-130
>>XP_016869596 (OMIM: 114480,606837) PREDICTED: RB1-indu (1591 aa)
initn: 10238 init1: 10238 opt: 10238 Z-score: 4046.7 bits: 761.6 E(85289): 1.2e-218
Smith-Waterman score: 10238; 99.9% identity (99.9% similar) in 1591 aa overlap (1-1591:1-1591)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKLYVFLVNTGTTLTFDTELTVQTVADLKHAIQSKYKIAIQHQVLVVNGGECMAADRRVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKLYVFLVNTGTTLTFDTELTVQTVADLKHAIQSKYKIAIQHQVLVVNGGECMAADRRVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TYSAGTDTNPIFLFNKEMILCDRPPAIPKTTFSTENDMEIKVEESLMMPAVFHTVASRTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TYSAGTDTNPIFLFNKEMILCDRPPAIPKTTFSTENDMEIKVEESLMMPAVFHTVASRTQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LALEMYEVAKKLCSFCEGLVHDEHLQHQGWAAIMANLEDCSNSYQKLLFKFESIYSNYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LALEMYEVAKKLCSFCEGLVHDEHLQHQGWAAIMANLEDCSNSYQKLLFKFESIYSNYLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SIEDIKLKLTHLGTAVSVMAKIPLLECLTRHSYRECLGRLDSLPEHEDSEKAETKRSTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
XP_016 SIEDIKLKLTHLGTAVSVMAKIPLLECLTRHSYRECLGRLDSLPEHEDSEKAEMKRSTEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VLSPDMPRTTNESLLTSFPKSVEHVSPDTADAESGKEIRESCQSTVHQQDETTIDTKDGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLSPDMPRTTNESLLTSFPKSVEHVSPDTADAESGKEIRESCQSTVHQQDETTIDTKDGD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LPFFNVSLLDWINVQDRPNDVESLVRKCFDSMSRLDPRIIRPFIAECRQTIAKLDNQNMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPFFNVSLLDWINVQDRPNDVESLVRKCFDSMSRLDPRIIRPFIAECRQTIAKLDNQNMK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 AIKGLEDRLYALDQMIASCGRLVNEQKELAQGFLANQKRAENLKDASVLPDLCLSHANQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AIKGLEDRLYALDQMIASCGRLVNEQKELAQGFLANQKRAENLKDASVLPDLCLSHANQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 MIMLQNHRKLLDIKQKCTTAKQELANNLHVRLKWCCFVMLHADQDGEKLQALLRLVIELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MIMLQNHRKLLDIKQKCTTAKQELANNLHVRLKWCCFVMLHADQDGEKLQALLRLVIELL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ERVKIVEALSTVPQMYCLAVVEVVRRKMFIKHYREWAGALVKDGKRLYEAEKSKRESFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERVKIVEALSTVPQMYCLAVVEVVRRKMFIKHYREWAGALVKDGKRLYEAEKSKRESFGK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LFRKSFLRNRLFRGLDSWPPSFCTQKPRKFDCELPDISLKDLQFLQSFCPSEVQPFLRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFRKSFLRNRLFRGLDSWPPSFCTQKPRKFDCELPDISLKDLQFLQSFCPSEVQPFLRVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LLCDFEPLHQHVLALHNLVKAAQSLDEMSQTITDLLSEQKASVSQTSPQSASSPRMESTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLCDFEPLHQHVLALHNLVKAAQSLDEMSQTITDLLSEQKASVSQTSPQSASSPRMESTA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GITTTTSPRTPPPLTVQDPLCPAVCPLEELSPDSIDAHTFDFETIPHPNIEQTIHQVSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GITTTTSPRTPPPLTVQDPLCPAVCPLEELSPDSIDAHTFDFETIPHPNIEQTIHQVSLD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LDSLAESPESDFMSAVNEFVIEENLSSPNPISDPQSPEMMVESLYSSVINAIDSRRMQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDSLAESPESDFMSAVNEFVIEENLSSPNPISDPQSPEMMVESLYSSVINAIDSRRMQDT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 NVCGKEDFGDHTSLNVQLERCRVVAQDSHFSIQTIKEDLCHFRTFVQKEQCDFSNSLKCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NVCGKEDFGDHTSLNVQLERCRVVAQDSHFSIQTIKEDLCHFRTFVQKEQCDFSNSLKCT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 AVEIRNIIEKVKCSLEITLKEKHQKELLSLKNEYEGKLDGLIKETEENENKIKKLKGELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVEIRNIIEKVKCSLEITLKEKHQKELLSLKNEYEGKLDGLIKETEENENKIKKLKGELV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 CLEEVLQNKDNEFALVKHEKEAVICLQNEKDQKLLEMENIMHSQNCEIKELKQSREIVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLEEVLQNKDNEFALVKHEKEAVICLQNEKDQKLLEMENIMHSQNCEIKELKQSREIVLE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 DLKKLHVENDEKLQLLRAELQSLEQSHLKELEDTLQVRHIQEFEKVMTDHRVSLEELKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLKKLHVENDEKLQLLRAELQSLEQSHLKELEDTLQVRHIQEFEKVMTDHRVSLEELKKE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 NQQIINQIQESHAEIIQEKEKQLQELKLKVSDLSDTRCKLEVELALKEAETDEIKILLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NQQIINQIQESHAEIIQEKEKQLQELKLKVSDLSDTRCKLEVELALKEAETDEIKILLEE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SRAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELRTLMTIEKDQCISEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELRTLMTIEKDQCISEL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 ISRHEEESNILKAELNKVTSLHNQAFEIEKNLKEQIIELQSKLDSELSALERQKDEKITQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISRHEEESNILKAELNKVTSLHNQAFEIEKNLKEQIIELQSKLDSELSALERQKDEKITQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 QEEKYEAIIQNLEKDRQKLVSSQEQDREQLIQKLNCEKDEAIQTALKEFKLEREVVEKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QEEKYEAIIQNLEKDRQKLVSSQEQDREQLIQKLNCEKDEAIQTALKEFKLEREVVEKEL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 LEKVKHLENQIAKSPAIDSTRGDSSSLVAELQEKLQEEKAKFLEQLEEQEKRKNEEMQNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEKVKHLENQIAKSPAIDSTRGDSSSLVAELQEKLQEEKAKFLEQLEEQEKRKNEEMQNV
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 RTSLIAEQQTNFNTVLTREKMRKENIINDLSDKLKSTMQQQERDKDLIESLSEDRARLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTSLIAEQQTNFNTVLTREKMRKENIINDLSDKLKSTMQQQERDKDLIESLSEDRARLLE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 EKKKLEEEVSKLRSSSFVPSPYVATAPELYGACAPELPGESDRSAVETADEGRVDSAMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EKKKLEEEVSKLRSSSFVPSPYVATAPELYGACAPELPGESDRSAVETADEGRVDSAMET
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SMMSVQENIHMLSEEKQRIMLLERTLQLKEEENKRLNQRLMSQSMSSVSSRHSEKIAIRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SMMSVQENIHMLSEEKQRIMLLERTLQLKEEENKRLNQRLMSQSMSSVSSRHSEKIAIRD
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 FQVGDLVLIILDERHDNYVLFTVSPTLYFLHSESLPALDLKPASGASRRPWVLGKVMEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FQVGDLVLIILDERHDNYVLFTVSPTLYFLHSESLPALDLKPASGASRRPWVLGKVMEKE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590
pF1KA0 YCQAKKAQNRFKVPLGTKFYRVKAVSWNKKV
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YCQAKKAQNRFKVPLGTKFYRVKAVSWNKKV
1570 1580 1590
>>NP_001077086 (OMIM: 114480,606837) RB1-inducible coile (1591 aa)
initn: 10238 init1: 10238 opt: 10238 Z-score: 4046.7 bits: 761.6 E(85289): 1.2e-218
Smith-Waterman score: 10238; 99.9% identity (99.9% similar) in 1591 aa overlap (1-1591:1-1591)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKLYVFLVNTGTTLTFDTELTVQTVADLKHAIQSKYKIAIQHQVLVVNGGECMAADRRVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKLYVFLVNTGTTLTFDTELTVQTVADLKHAIQSKYKIAIQHQVLVVNGGECMAADRRVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TYSAGTDTNPIFLFNKEMILCDRPPAIPKTTFSTENDMEIKVEESLMMPAVFHTVASRTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYSAGTDTNPIFLFNKEMILCDRPPAIPKTTFSTENDMEIKVEESLMMPAVFHTVASRTQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LALEMYEVAKKLCSFCEGLVHDEHLQHQGWAAIMANLEDCSNSYQKLLFKFESIYSNYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LALEMYEVAKKLCSFCEGLVHDEHLQHQGWAAIMANLEDCSNSYQKLLFKFESIYSNYLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SIEDIKLKLTHLGTAVSVMAKIPLLECLTRHSYRECLGRLDSLPEHEDSEKAETKRSTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_001 SIEDIKLKLTHLGTAVSVMAKIPLLECLTRHSYRECLGRLDSLPEHEDSEKAEMKRSTEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VLSPDMPRTTNESLLTSFPKSVEHVSPDTADAESGKEIRESCQSTVHQQDETTIDTKDGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLSPDMPRTTNESLLTSFPKSVEHVSPDTADAESGKEIRESCQSTVHQQDETTIDTKDGD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LPFFNVSLLDWINVQDRPNDVESLVRKCFDSMSRLDPRIIRPFIAECRQTIAKLDNQNMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPFFNVSLLDWINVQDRPNDVESLVRKCFDSMSRLDPRIIRPFIAECRQTIAKLDNQNMK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 AIKGLEDRLYALDQMIASCGRLVNEQKELAQGFLANQKRAENLKDASVLPDLCLSHANQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIKGLEDRLYALDQMIASCGRLVNEQKELAQGFLANQKRAENLKDASVLPDLCLSHANQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 MIMLQNHRKLLDIKQKCTTAKQELANNLHVRLKWCCFVMLHADQDGEKLQALLRLVIELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIMLQNHRKLLDIKQKCTTAKQELANNLHVRLKWCCFVMLHADQDGEKLQALLRLVIELL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ERVKIVEALSTVPQMYCLAVVEVVRRKMFIKHYREWAGALVKDGKRLYEAEKSKRESFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERVKIVEALSTVPQMYCLAVVEVVRRKMFIKHYREWAGALVKDGKRLYEAEKSKRESFGK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LFRKSFLRNRLFRGLDSWPPSFCTQKPRKFDCELPDISLKDLQFLQSFCPSEVQPFLRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFRKSFLRNRLFRGLDSWPPSFCTQKPRKFDCELPDISLKDLQFLQSFCPSEVQPFLRVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LLCDFEPLHQHVLALHNLVKAAQSLDEMSQTITDLLSEQKASVSQTSPQSASSPRMESTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLCDFEPLHQHVLALHNLVKAAQSLDEMSQTITDLLSEQKASVSQTSPQSASSPRMESTA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GITTTTSPRTPPPLTVQDPLCPAVCPLEELSPDSIDAHTFDFETIPHPNIEQTIHQVSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GITTTTSPRTPPPLTVQDPLCPAVCPLEELSPDSIDAHTFDFETIPHPNIEQTIHQVSLD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LDSLAESPESDFMSAVNEFVIEENLSSPNPISDPQSPEMMVESLYSSVINAIDSRRMQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDSLAESPESDFMSAVNEFVIEENLSSPNPISDPQSPEMMVESLYSSVINAIDSRRMQDT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 NVCGKEDFGDHTSLNVQLERCRVVAQDSHFSIQTIKEDLCHFRTFVQKEQCDFSNSLKCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVCGKEDFGDHTSLNVQLERCRVVAQDSHFSIQTIKEDLCHFRTFVQKEQCDFSNSLKCT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 AVEIRNIIEKVKCSLEITLKEKHQKELLSLKNEYEGKLDGLIKETEENENKIKKLKGELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVEIRNIIEKVKCSLEITLKEKHQKELLSLKNEYEGKLDGLIKETEENENKIKKLKGELV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 CLEEVLQNKDNEFALVKHEKEAVICLQNEKDQKLLEMENIMHSQNCEIKELKQSREIVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLEEVLQNKDNEFALVKHEKEAVICLQNEKDQKLLEMENIMHSQNCEIKELKQSREIVLE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 DLKKLHVENDEKLQLLRAELQSLEQSHLKELEDTLQVRHIQEFEKVMTDHRVSLEELKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLKKLHVENDEKLQLLRAELQSLEQSHLKELEDTLQVRHIQEFEKVMTDHRVSLEELKKE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 NQQIINQIQESHAEIIQEKEKQLQELKLKVSDLSDTRCKLEVELALKEAETDEIKILLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQQIINQIQESHAEIIQEKEKQLQELKLKVSDLSDTRCKLEVELALKEAETDEIKILLEE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SRAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELRTLMTIEKDQCISEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELRTLMTIEKDQCISEL
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pF1KA0 ISRHEEESNILKAELNKVTSLHNQAFEIEKNLKEQIIELQSKLDSELSALERQKDEKITQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISRHEEESNILKAELNKVTSLHNQAFEIEKNLKEQIIELQSKLDSELSALERQKDEKITQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEEKYEAIIQNLEKDRQKLVSSQEQDREQLIQKLNCEKDEAIQTALKEFKLEREVVEKEL
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NP_001 LEKVKHLENQIAKSPAIDSTRGDSSSLVAELQEKLQEEKAKFLEQLEEQEKRKNEEMQNV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTSLIAEQQTNFNTVLTREKMRKENIINDLSDKLKSTMQQQERDKDLIESLSEDRARLLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKKKLEEEVSKLRSSSFVPSPYVATAPELYGACAPELPGESDRSAVETADEGRVDSAMET
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SMMSVQENIHMLSEEKQRIMLLERTLQLKEEENKRLNQRLMSQSMSSVSSRHSEKIAIRD
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NP_001 FQVGDLVLIILDERHDNYVLFTVSPTLYFLHSESLPALDLKPASGASRRPWVLGKVMEKE
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NP_001 YCQAKKAQNRFKVPLGTKFYRVKAVSWNKKV
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XP_011 TYSAGTDTNPIFLFNKEMILCDRPPAIPKTTFSTENDMEIKVEESLMMPAVFHTVASRTQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLKKLHVENDEKLQLLRAELQSLEQSHLKELEDTLQVRHIQEFEKVMTDHRVSLEELKKE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NQQIINQIQESHAEIIQEKEKQLQELKLKVSDLSDTRCKLEVELALKEAETDEIKILLEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELRTLMTIEKDQCISEL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISRHEEESNILKAELNKVTSLHNQAFEIEKNLKEQIIELQSKLDSELSALERQKDEKITQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEKVKHLENQIAKSPAIDSTRGDSSSLVAELQEKLQEEKAKFLEQLEEQEKRKNEEMQNV
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pF1KA0 RTSLIAEQQTNFNTVLTREKMRKENIINDLSDKLKSTMQQQERDKDLIESLSEDRARLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTSLIAEQQTNFNTVLTREKMRKENIINDLSDKLKSTMQQQERDKDLIESLSEDRARLLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKKKLEEEVSKLRSSSFVPSPYVATAPELYGACAPELPGESDRSAVETADEGRVDSAMET
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KA0 SMMSVQENIHMLSEEKQRIMLLERTLQLKEEENKRLNQRLMSQSMSSVSSRHSEKIAIRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SMMSVQENIHMLSEEKQRIMLLERTLQLKEEENKRLNQRLMSQSMSSVSSRHSEKIAIRD
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1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 FQVGDLVLIILDERHDNYVLFTVSPTLYFLHSESLPALDLKP---ASGASRRPWVLGKVM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
XP_011 FQVGDLVLIILDERHDNYVLFTVSPTLYFLHSESLPALDLKPGEGASGASRRPWVLGKVM
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pF1KA0 EKEYCQAKKAQNRFKVPLGTKFYRVKAVSWNKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKEYCQAKKAQNRFKVPLGTKFYRVKAVSWNKKV
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>>NP_055596 (OMIM: 114480,606837) RB1-inducible coiled-c (1594 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TYSAGTDTNPIFLFNKEMILCDRPPAIPKTTFSTENDMEIKVEESLMMPAVFHTVASRTQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LALEMYEVAKKLCSFCEGLVHDEHLQHQGWAAIMANLEDCSNSYQKLLFKFESIYSNYLQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_055 SIEDIKLKLTHLGTAVSVMAKIPLLECLTRHSYRECLGRLDSLPEHEDSEKAEMKRSTEL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VLSPDMPRTTNESLLTSFPKSVEHVSPDTADAESGKEIRESCQSTVHQQDETTIDTKDGD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LPFFNVSLLDWINVQDRPNDVESLVRKCFDSMSRLDPRIIRPFIAECRQTIAKLDNQNMK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MIMLQNHRKLLDIKQKCTTAKQELANNLHVRLKWCCFVMLHADQDGEKLQALLRLVIELL
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pF1KA0 ERVKIVEALSTVPQMYCLAVVEVVRRKMFIKHYREWAGALVKDGKRLYEAEKSKRESFGK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLCDFEPLHQHVLALHNLVKAAQSLDEMSQTITDLLSEQKASVSQTSPQSASSPRMESTA
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pF1KA0 GITTTTSPRTPPPLTVQDPLCPAVCPLEELSPDSIDAHTFDFETIPHPNIEQTIHQVSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GITTTTSPRTPPPLTVQDPLCPAVCPLEELSPDSIDAHTFDFETIPHPNIEQTIHQVSLD
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pF1KA0 LDSLAESPESDFMSAVNEFVIEENLSSPNPISDPQSPEMMVESLYSSVINAIDSRRMQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LDSLAESPESDFMSAVNEFVIEENLSSPNPISDPQSPEMMVESLYSSVINAIDSRRMQDT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NVCGKEDFGDHTSLNVQLERCRVVAQDSHFSIQTIKEDLCHFRTFVQKEQCDFSNSLKCT
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pF1KA0 AVEIRNIIEKVKCSLEITLKEKHQKELLSLKNEYEGKLDGLIKETEENENKIKKLKGELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AVEIRNIIEKVKCSLEITLKEKHQKELLSLKNEYEGKLDGLIKETEENENKIKKLKGELV
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pF1KA0 CLEEVLQNKDNEFALVKHEKEAVICLQNEKDQKLLEMENIMHSQNCEIKELKQSREIVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CLEEVLQNKDNEFALVKHEKEAVICLQNEKDQKLLEMENIMHSQNCEIKELKQSREIVLE
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pF1KA0 DLKKLHVENDEKLQLLRAELQSLEQSHLKELEDTLQVRHIQEFEKVMTDHRVSLEELKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DLKKLHVENDEKLQLLRAELQSLEQSHLKELEDTLQVRHIQEFEKVMTDHRVSLEELKKE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NQQIINQIQESHAEIIQEKEKQLQELKLKVSDLSDTRCKLEVELALKEAETDEIKILLEE
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pF1KA0 SRAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELRTLMTIEKDQCISEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SRAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELRTLMTIEKDQCISEL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KA0 ISRHEEESNILKAELNKVTSLHNQAFEIEKNLKEQIIELQSKLDSELSALERQKDEKITQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ISRHEEESNILKAELNKVTSLHNQAFEIEKNLKEQIIELQSKLDSELSALERQKDEKITQ
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pF1KA0 QEEKYEAIIQNLEKDRQKLVSSQEQDREQLIQKLNCEKDEAIQTALKEFKLEREVVEKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QEEKYEAIIQNLEKDRQKLVSSQEQDREQLIQKLNCEKDEAIQTALKEFKLEREVVEKEL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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NP_055 EKEYCQAKKAQNRFKVPLGTKFYRVKAVSWNKKV
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XP_016 EKKKLEEEVSKLRSSSFVPSPYVATAPELYGACAPELPGESDRSAVETADEGRVDSAMET
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XP_016 GKVMEKEYCQAKKAQNRFKVPLGTKFYRVKAVSWNKKV
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XP_011 CLEEVLQNKDNEFALVKHEKEAVICLQNEKDQKLLEMENIMHSQNCEIKELKQSREIVLE
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XP_011 DLKKLHVENDEKLQLLRAELQSLEQSHLKELEDTLQVRHIQEFEKVMTDHRVSLEELKKE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEKVKHLENQIAKSPAIDSTRGDSSSLVAELQEKLQEEKAKFLEQLEEQEKRKNEEMQNV
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KA0 RTSLIAEQQTNFNTVLTREKMRKENIINDLSDKLKSTMQQQERDKDLIESLSEDRARLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTSLIAEQQTNFNTVLTREKMRKENIINDLSDKLKSTMQQQERDKDLIESLSEDRARLLE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KA0 EKKKLEEEVSKLRSSSFVPSPYVATAPELYGACAPELPGESDRSAVETADEGRVDSAMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKKKLEEEVSKLRSSSFVPSPYVATAPELYGACAPELPGESDRSAVETADEGRVDSAMET
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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XP_011 SMMSVQENIHMLSEEKQRIMLLERTLQLKEEENKRLNQRLMSQSMSSVSSRHSEKIAIRD
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XP_016 MKLYVFLVNTGTTLTFDTELTVQTVADLKHAIQSKYKIAIQHQVLVVNGGECMAADRRVC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QEEKYEAIIQNLEKDRQKLVSSQEQDREQLIQKLNCEKDEAIQTALKEFKLEREVVEKEL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEKVKHLENQIAKSPAIDSTRGDSSSLVAELQEKLQEEKAKFLEQLEEQEKRKNEEMQNV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTSLIAEQQTNFNTVLTREKMRKENIINDLSDKLKSTMQQQERDKDLIESLSEDRARLLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EKKKLEEEVSKLRSSSFVPSPYVATAPELYGACAPELPGESDRSAVETADEGRVDSAMET
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XP_016 SMMSVQENIHMLSEEKQRIMLLERVSFFHLQTLQLKEEENKRLNQRLMSQSMSSVSSRHS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
XP_016 EKIAIRDFQVGDLVLIILDERHDNYVLFTVSPTLYFLHSESLPALDLKPGEGASGASRRP
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XP_016 WVLGKVMEKEYCQAKKAQNRFKVPLGTKFYRVKAVSWNKKV
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1591 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 18:21:51 2016 done: Wed Nov 2 18:21:53 2016
Total Scan time: 13.500 Total Display time: 0.920
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]