FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0178, 1233 aa
1>>>pF1KA0178 1233 - 1233 aa - 1233 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 19.1071+/-0.00075; mu= -45.4949+/- 0.046
mean_var=814.9804+/-167.598, 0's: 0 Z-trim(114.7): 261 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.044926
statistics sampled from 24516 (24730) to 24516 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 12.520
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006297 (OMIM: 300040,300590) structural mainten (1233) 7874 527.6 1.9e-148
NP_001268392 (OMIM: 300040,300590) structural main (1211) 7635 512.1 8.6e-144
NP_683515 (OMIM: 608685) structural maintenance of (1235) 4454 306.0 1e-81
XP_011528446 (OMIM: 608685) PREDICTED: structural (1194) 4245 292.4 1.2e-77
XP_011528447 (OMIM: 608685) PREDICTED: structural (1101) 3741 259.7 7.5e-68
NP_001278430 (OMIM: 608685) structural maintenance (1161) 3741 259.7 7.8e-68
XP_011516455 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1099) 610 56.8 9.2e-07
XP_011516454 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1115) 610 56.8 9.3e-07
XP_011510614 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural (1216) 603 56.4 1.4e-06
NP_001275682 (OMIM: 605575) structural maintenance (1263) 603 56.4 1.4e-06
NP_001002800 (OMIM: 605575) structural maintenance (1288) 603 56.4 1.4e-06
NP_005487 (OMIM: 605575) structural maintenance of (1288) 603 56.4 1.4e-06
XP_011510613 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural (1288) 603 56.4 1.4e-06
XP_006713522 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural (1210) 596 55.9 1.9e-06
XP_016860980 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural ( 952) 585 55.2 2.5e-06
NP_005436 (OMIM: 606062,610759) structural mainten (1217) 421 44.6 0.0049
NP_005723 (OMIM: 604040,613078) DNA repair protein (1312) 422 44.7 0.005
XP_011516453 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 416 44.2 0.0058
XP_016869700 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 416 44.2 0.0058
XP_016869701 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 416 44.2 0.0058
XP_011516452 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 416 44.2 0.0058
XP_016869699 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 416 44.2 0.0058
XP_016869698 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 416 44.2 0.0058
XP_016869697 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 416 44.2 0.006
NP_001252531 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197) 416 44.2 0.006
XP_011516451 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 416 44.2 0.006
XP_011516450 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 416 44.2 0.006
XP_016869695 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 416 44.2 0.006
XP_016869696 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 416 44.2 0.006
NP_001036016 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197) 416 44.2 0.006
XP_006716996 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 416 44.2 0.006
NP_001036015 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197) 416 44.2 0.006
NP_006435 (OMIM: 605576) structural maintenance of (1197) 416 44.2 0.006
>>NP_006297 (OMIM: 300040,300590) structural maintenance (1233 aa)
initn: 7874 init1: 7874 opt: 7874 Z-score: 2786.1 bits: 527.6 E(85289): 1.9e-148
Smith-Waterman score: 7874; 100.0% identity (100.0% similar) in 1233 aa overlap (1-1233:1-1233)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 AKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 IKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 MEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 NMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 EPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 AKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 DSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 AAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 IDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALAL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 LFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230
pF1KA0 IGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ
1210 1220 1230
>>NP_001268392 (OMIM: 300040,300590) structural maintena (1211 aa)
initn: 7635 init1: 7635 opt: 7635 Z-score: 2702.5 bits: 512.1 E(85289): 8.6e-144
Smith-Waterman score: 7635; 100.0% identity (100.0% similar) in 1197 aa overlap (37-1233:15-1211)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 IEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLIH
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLEVSIPTPHRYVRGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLIH
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNY
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 HRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNKELASKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNKELASKN
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 HKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLT
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLR
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 EIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGD
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAII
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 VDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRYEPPHIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRYEPPHIK
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 KALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLKAKARRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLKAKARRW
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 DEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLEQTKTRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLEQTKTRH
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEFCREIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEFCREIGV
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 RNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQTVKKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQTVKKDE
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 NEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKEMT
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 HLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGEDSVSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGEDSVSGS
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 QRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMK
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 AMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYK
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 ALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 YKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1210 1220 1230
pF1KA0 QGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ
:::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ
1190 1200 1210
>>NP_683515 (OMIM: 608685) structural maintenance of chr (1235 aa)
initn: 4457 init1: 3317 opt: 4454 Z-score: 1588.1 bits: 306.0 E(85289): 1e-81
Smith-Waterman score: 4454; 53.7% identity (84.1% similar) in 1225 aa overlap (1-1225:1-1221)
10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
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NP_683 IQELIHGAHIGKPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIAE
70 80 90 100 110 120
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NP_683 AKENTSHHLKKLDVAKKSIKDSEKQCSKQEDDIKALETELADLDAAWRSFEKQIEEEILH
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NP_683 CEEIGVENIREFENKHVKRQQEIDQKRLEFEKQKTRLNVQLEYSRSHLKKKLNKINTLKE
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NP_683 TIQKGSEDIDHLKKAEENCLQTVNELMAKQQQLKDIRVTQNSSAEKVQTQIEEERKKFLA
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NP_683 VDREVGKLQKEVVSIQTSLEQKRLEKHNLLLDCKVQDIEIILLSGSLDDIIEVEMGTEAE
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NP_683 S----TQATIDIYEKEEAFEIDYSSLKEDLKALQSDQEIEAHLRLLLQQVASQEDILLKT
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pF1KA0 AAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATN
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NP_683 AAPNLRALENLKTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQEFEQVKKRRYDLFTQCFEHVSIS
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pF1KA0 IDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALAL
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NP_683 IDQIYKKLCRNNSAQAFLSPENPEEPYLEGISYNCVAPGKRFMPMDNLSGGEKCVAALAL
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NP_683 LFAVHSFRPAPFFVLDEVDAALDNTNIGKVSSYIKEQTQDQFQMIVISLKEEFYSRADAL
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NP_683 IGIYPEYDDCMFSRVLTLDLSQYPDTEGQESSKRHGESR
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20 30 40 50 60 70
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XP_011 MDALSFVMGEKIANLRVKNIQELIHGAHIG
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XP_011 KPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIAELEKIGIIVKAQ
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XP_011 IAAERRQAKLEKEEAERYQSLLEELKMNKIQLQLFQLYHNEKKIHLLNTKLEHVNRDLSV
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XP_011 KRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKELKSVETLLNQKRPQYIKAKENTSHHLKK
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XP_011 LDRYKELKEQVRKKVATMTQQLEKLQWEQKTDEERLAFEKRRHGEVQGNLKQIKEQIEDH
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XP_011 HEGKRQQKRAEVLEHLKRLYPDSVFGRLFDLCHPIHKKYQLAVTKVFGRFITAIVVASEK
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XP_011 VAKDCIRFLKEERAEPETFLALDYLDIKPINERLRELKGCKMVIDVIKTQFPQLKKVIQF
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XP_011 VCGNGLVCETMEEARHIALSGPERQKTVALDGTLFLKSGVISGGSSDLKYKARCWDEKEL
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XP_011 IYEKEEAFEIDYSSLKEDLKALQSDQEIEAHLRLLLQQVASQEDILLKTAAPNLRALENL
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XP_011 KTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQEFEQVKKRRYDLFTQCFEHVSISIDQIYKKLCRN
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XP_011 NSAQAFLSPENPEEPYLEGISYNCVAPGKRFMPMDNLSGGEKCVAALALLFAVHSFRPAP
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pF1KA0 FFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPEQGDCV
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XP_011 FFVLDEVDAALDNTNIGKVSSYIKEQTQDQFQMIVISLKEEFYSRADALIGIYPEYDDCM
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10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
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XP_011 IQELIHGAHIGKPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIAE
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pF1KA0 LEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEE
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XP_011 DAQFNFNKKKNIAAERRQAKLEKEEAERYQSLLEELKMNKIQLQLFQLYHNEKKIHLLNT
190 200 210 220 230 240
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XP_011 KKRDIELEASQLDRYKELKEQVRKKVATMTQQLEKLQWEQKTDEERLAFEKRRHGEVQGN
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XP_011 LKQIKEQIEDHKKRIEKLEEYTKTCMDCLKEKKQQEETLVDEIEKTKSRMSEVNEELNLI
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pF1KA0 MEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGK
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XP_011 RSELQNAGIDTHEGKRQQKRAEVLEHLKRLYPDSVFGRLFDLCHPIHKKYQLAVTKVFGR
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XP_011 FITAIVVASEKVAKDCIRFLKEERAEPETFLALDYLDIKPINERLRELKGCKMVIDVIKT
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:... :::.:.. . . . .: : . .:::: . .. :...: .. .:.::
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pF1KA0 Q
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