Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0131
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0131, 946 aa
1>>>pF1KA0131 946 - 946 aa - 946 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8530+/-0.000974; mu= 6.8144+/- 0.059
mean_var=246.2185+/-51.569, 0's: 0 Z-trim(112.8): 131 B-trim: 15 in 1/52
Lambda= 0.081736
statistics sampled from 13401 (13535) to 13401 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX ( 946) 6252 751.2 2.2e-216
CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX ( 986) 4812 581.4 3e-165
CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1099) 2703 332.7 2.4e-90
CCDS8967.1 SRGAP1 gene_id:57522|Hs108|chr12 (1085) 2649 326.3 1.9e-88
CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1075) 1091 142.6 3.9e-33
CCDS76262.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 (1070) 1083 141.7 7.4e-33
CCDS73017.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 (1071) 1083 141.7 7.4e-33
CCDS76261.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 ( 789) 1079 141.1 8.3e-33
CCDS81364.1 SRGAP2C gene_id:653464|Hs108|chr1 ( 459) 987 130.0 1e-29
CCDS81365.1 SRGAP2B gene_id:647135|Hs108|chr1 ( 305) 784 105.9 1.2e-22
>>CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX (946 aa)
initn: 6252 init1: 6252 opt: 6252 Z-score: 3998.2 bits: 751.2 E(32554): 2.2e-216
Smith-Waterman score: 6252; 100.0% identity (100.0% similar) in 946 aa overlap (1-946:1-946)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKCT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 RAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PGSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PGSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 TQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 IFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 AQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERAS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 SDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRPEPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRPEPC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940
pF1KA0 SPGPRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SPGPRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
910 920 930 940
>>CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX (986 aa)
initn: 4812 init1: 4812 opt: 4812 Z-score: 3080.3 bits: 581.4 E(32554): 3e-165
Smith-Waterman score: 6109; 95.9% identity (95.9% similar) in 978 aa overlap (9-946:9-986)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KA0 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEK-------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGATEAGPLRKSSLKKGGRLVEKLWPPQRPVAASSC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KA0 ---------------------------RQAKFMEHKLKCTKARNEYLLSLASVNAAVSNY
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 APVCWLQAGFLVHPPWWGAMCAPSTHQRQAKFMEHKLKCTKARNEYLLSLASVNAAVSNY
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 YLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQGLGSLEEAVEALDPPGDKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQGLGSLEEAVEALDPPGDKAK
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 VLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILPRAQNIQSRLDRQTIETEEVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILPRAQNIQSRLDRQTIETEEVN
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 KTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDPGSRQAGRRRGQQQETETFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDPGSRQAGRRRGQQQETETFY
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 LTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQY
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 NQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFER
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 GEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRL
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 LWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRV
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 NQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELEAEMPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELEAEMPA
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 QEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYI
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 TLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRPEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRPEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPAS
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 PEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSPSPGPRSPKAPPSSRLGRNKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSPSPGPRSPKAPPSSRLGRNKG
910 920 930 940 950 960
930 940
pF1KA0 FSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
970 980
>>CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1099 aa)
initn: 2690 init1: 1124 opt: 2703 Z-score: 1735.6 bits: 332.7 E(32554): 2.4e-90
Smith-Waterman score: 2717; 47.3% identity (74.6% similar) in 924 aa overlap (1-917:1-905)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
:... :..... . ::::.:.::.: :: ::..::: :.: : .:::.: ::.::.::.:
CCDS25 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
:::::.::::::::::. . :::::: :.:. ::::..:: ..:..::..::. :.:
CCDS25 LEYSRSLEKLAERFSSK---IRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
.... . . :::.:.::: :: :::... :...:::.:..:: :. :::. :: ::..
CCDS25 NDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESIS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KA0 AEAKLREAERQEEKRAGRSVPTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQAKFMEHKLKC
::.::.:::.::::. ..: . : : :.::.:: .. ::::::. :.::::
CCDS25 AESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TKARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMDCCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQV
:::::.:::.::..:::.:.::.::: ::.:::: ::: .:....:.: .:: ..:.
CCDS25 TKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 QGLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEIL
.:: .:.::. :: .:: :... ::::::.:...:: :::: .. ... .. :.:
CCDS25 EGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 PRAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSS
: ...:::: ::.::: ::: ::.:.: .... .: :: :.:: : ::::.::..:
CCDS25 MRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAAS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 DPGSRQAG--RRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQE
. . . .::..::::: ::.::..::..: ....::::::. :...: .:.. :
CCDS25 ETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 VSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQ
.. : :: :.::: : :...::.:.:: ::..::: .:::::::::.::: :::
CCDS25 TTRPPCLPPKPQKMRRPRPLSVYSHKLFNGSMEAFIKDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 HEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDL
..::::: :.:..:..:...:::::::::. . .:..:::::::::::.:: :::: .
CCDS25 QQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKER
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 FGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLA
: .:... .:: ::::......: :: :.::.::::.:::::.::::::::::::::
CCDS25 FQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLA
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 VCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASC
.::::::. .: :::::. :...:....:.:.. . .:: : ::::::::: :
CCDS25 ICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYC
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 LGDAQLESLGADNEPELE-AEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLH
:. :: .: . . . : :. .::.: : : ::. .::::..: : :.
CCDS25 --DSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLY
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 ERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHR
.::: :::.:.:::. :::::.::.. . . . .. .:..:.: :: .. .
CCDS25 HRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGP--LLDDKASSK
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 PEPCTSPEAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKT-SVRQGLGPA
. . : .. : . . . ... : :. : : : : .::::.
CCDS25 NDLQSPTEHISDYG-----FGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRSG-----GDTHSPPRGLGPS
840 850 860 870 880
900 910 920 930 940
pF1KA0 STTSPSPG--PRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
: : . : ::. : .: ::
CCDS25 IDTPPRAAACPSSPHKIPLTR-GRIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTC
890 900 910 920 930 940
>>CCDS8967.1 SRGAP1 gene_id:57522|Hs108|chr12 (1085 aa)
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Smith-Waterman score: 2649; 47.1% identity (76.1% similar) in 858 aa overlap (1-854:1-847)
10 20 30 40 50 60
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CCDS89 TEYSRNLEKLAERFMA---KTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATL
70 80 90 100 110
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::.::.:::.::::. ::: . : :.::.:: .. ::::::. :.:::
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CCDS89 RYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSE
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CCDS89 TRPPNVPPKPQKHRKSRPRSQYNTKLFNGDLETFVKDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQH
480 490 500 510 520 530
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pF1KA0 EGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLF
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CCDS89 QGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERF
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600 610 620 630 640 650
pF1KA0 GELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAV
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CCDS89 NDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAI
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CCDS89 CFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDY-C-
660 670 680 690 700 710
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pF1KA0 GDAQLESLGADNEPELEA--EMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLH
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CCDS89 -DSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPI-EAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLY
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pF1KA0 ERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHR
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CCDS89 HRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGP----VTEDKSS
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CCDS89 SKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSL
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
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CCDS33 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
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CCDS33 LEYSRSLEKLAERFSSK---IRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATL
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CCDS33 NDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESIS
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CCDS33 AESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKC
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CCDS33 TKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRH
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CCDS33 EGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELL
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CCDS33 MRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAAS
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CCDS33 ETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTL--GEGERAE
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CCDS33 CGTTR--GRRNARTRN--------------------QDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQ
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pF1KA0 HEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDL
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CCDS33 FQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLA
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CCDS33 ICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYC
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pF1KA0 LGDAQLESLGADNEPELE-AEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLH
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CCDS33 --DSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLY
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CCDS33 HRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGP--LLDDKASSK
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CCDS33 NDLQSPTEHISDYG-----FGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRSG-----GDTHSPPRGLGPS
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CCDS33 IDTPPRAAACPSSPHKIPLTR-GRIESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTC
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
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CCDS76 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
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pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
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CCDS76 MDYSRNLEKLAERFLAKT----RSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTL
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CCDS76 AKYTENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLS
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:: . :. .:: ..:.::: :: .:: ...:.. .:::::..:...:: :: ....:
CCDS76 AELNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLC
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CCDS76 AQQPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSN
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CCDS76 SMESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKT
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CCDS76 LGESQRTDCSLARRSSTVRK--------------------------QDSSQAIPLVVESC
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pF1KA0 IRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRS
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CCDS76 IRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRG
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pF1KA0 LEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSD
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CCDS76 LEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSE
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pF1KA0 ENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYE
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CCDS76 ENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYS
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pF1KA0 KCMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSF
. . . : . . :. .. :: ...:. : . ::.: : :.::::.::::
CCDS76 RGGSMEDY-CDSPHGETTSVEDSTQDVTAEHHTSDDECEPI-EAIAKFDYVGRTARELSF
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pF1KA0 RRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEG
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CCDS76 KKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQYIVVQ-DTEDGVV---------ERSSPKS
750 760 770 780 790
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pF1KA0 LLASELVHRP--EPCTSPE-AMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLG
. :.. .: : :. : ::: . . :. ... . . . .. ..:.
CCDS76 EI--EVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRK--RPESGSIRKTFR----
800 810 820 830 840 850
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 KTSVRQGLGPASTTSPSPGPRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPK
: .::. . : : ::: . : :. . .. ..::
CCDS76 --SDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGSLNSISRHSS
860 870 880 890 900
pF1KA0 PH
CCDS76 LKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELRELERQSSVKHT
910 920 930 940 950 960
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
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CCDS73 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
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CCDS73 MDYSRNLEKLAERFLAKT----RSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTL
70 80 90 100 110
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CCDS73 SDIYLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSIS
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 AEAKLREAERQEEKRAGRSV----------PTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQ
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CCDS73 AQSKLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQ
180 190 200 210 220 230
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