Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0055
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0055, 1118 aa
1>>>pF1KA0055 1118 - 1118 aa - 1118 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1246+/-0.00121; mu= -1.9088+/- 0.073
mean_var=395.7844+/-83.345, 0's: 0 Z-trim(112.5): 67 B-trim: 227 in 1/52
Lambda= 0.064468
statistics sampled from 13153 (13216) to 13153 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.406), width: 16
Scan time: 5.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 7401 703.7 6.2e-202
CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 3466 337.6 8.5e-92
CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 929 101.2 4.4e-21
CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 929 101.3 4.7e-21
CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 929 101.5 6.3e-21
CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 952) 664 77.0 2.3e-13
CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 981) 655 76.2 4.2e-13
CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 916) 646 75.3 7.2e-13
CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX ( 963) 645 75.2 7.9e-13
CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 963) 633 74.1 1.7e-12
CCDS53944.1 USP50 gene_id:373509|Hs108|chr15 ( 334) 619 72.4 2e-12
CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1318) 630 74.0 2.6e-12
CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1372) 630 74.0 2.7e-12
CCDS56255.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1384) 630 74.0 2.7e-12
CCDS56254.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1419) 630 74.0 2.7e-12
CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 582 69.5 6e-11
>>CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118 aa)
initn: 7401 init1: 7401 opt: 7401 Z-score: 3738.9 bits: 703.7 E(32554): 6.2e-202
Smith-Waterman score: 7401; 100.0% identity (100.0% similar) in 1118 aa overlap (1-1118:1-1118)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKISTKSYVHSALKIFKTAEECRLDRDEERAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKISTKSYVHSALKIFKTAEECRLDRDEERAY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSILGPGNIKKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSILGPGNIKKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KLEEKDRQEEAQRLQQKRQETGREDGGTLAKGSLENVLDSKDKTQKSNGEKNEKCETKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLEEKDRQEEAQRLQQKRQETGREDGGTLAKGSLENVLDSKDKTQKSNGEKNEKCETKEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 GAITAKELYTMMTDKNISLIIMDARRMQDYQDSCILHSLSVPEEAISPGVTASWIEAHLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GAITAKELYTMMTDKNISLIIMDARRMQDYQDSCILHSLSVPEEAISPGVTASWIEAHLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 DDSKDTWKKRGNVEYVVLLDWFSSAKDLQIGTTLRSLKDALFKWESKTVLRNEPLVLEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DDSKDTWKKRGNVEYVVLLDWFSSAKDLQIGTTLRSLKDALFKWESKTVLRNEPLVLEGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YENWLLCYPQYTTNAKVTPPPRRQNEEVSISLDFTYPSLEESIPSKPAAQTPPASIEVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YENWLLCYPQYTTNAKVTPPPRRQNEEVSISLDFTYPSLEESIPSKPAAQTPPASIEVDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NIELISGQNERMGPLNISTPVEPVAASKSDVSPIIQPVPSIKNVPQIDRTKKPAVKLPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NIELISGQNERMGPLNISTPVEPVAASKSDVSPIIQPVPSIKNVPQIDRTKKPAVKLPEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HRIKSESTNHEQQSPQSGKVIPDRSTKPVVFSPTLMLTDEEKARIHAETALLMEKNKQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HRIKSESTNHEQQSPQSGKVIPDRSTKPVVFSPTLMLTDEEKARIHAETALLMEKNKQEK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ELRERQQEEQKEKLRKEEQEQKAKKKQEAEENEITEKQQKAKEEMEKKESEQAKKEDKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ELRERQQEEQKEKLRKEEQEQKAKKKQEAEENEITEKQQKAKEEMEKKESEQAKKEDKET
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SAKRGKEITGVKRQSKSEHETSDAKKSVEDRGKRCPTPEIQKKSTGDVPHTSVTGDSGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SAKRGKEITGVKRQSKSEHETSDAKKSVEDRGKRCPTPEIQKKSTGDVPHTSVTGDSGSG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 KPFKIKGQPESGILRTGTFREDTDDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPFKIKGQPESGILRTGTFREDTDDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 PITGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDREPSKLKRSYSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PITGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDREPSKLKRSYSSP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 DITQAIQEEEKRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DITQAIQEEEKRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 NLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 QYRYISPKDFKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QYRYISPKDFKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 KCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 KQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRW
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110
pF1KA0 FKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
1090 1100 1110
>>CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012 aa)
initn: 3665 init1: 3350 opt: 3466 Z-score: 1761.5 bits: 337.6 E(32554): 8.5e-92
Smith-Waterman score: 6477; 90.5% identity (90.5% similar) in 1118 aa overlap (1-1118:1-1012)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKISTKSYVHSALKIFKTAEECRLDRDEERAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKISTK--------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSILGPGNIKKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRK
:::::::::
CCDS61 ---------------------------------------------------RYEEAEVRK
40
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KLEEKDRQEEAQRLQQKRQETGREDGGTLAKGSLENVLDSKDKTQKSNGEKNEKCETKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KLEEKDRQEEAQRLQQKRQETGREDGGTLAKGSLENVLDSKDKTQKSNGEKNEKCETKEK
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 GAITAKELYTMMTDKNISLIIMDARRMQDYQDSCILHSLSVPEEAISPGVTASWIEAHLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GAITAKELYTMMTDKNISLIIMDARRMQDYQDSCILHSLSVPEEAISPGVTASWIEAHLP
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 DDSKDTWKKRGNVEYVVLLDWFSSAKDLQIGTTLRSLKDALFKWESKTVLRNEPLVLEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DDSKDTWKKRGNVEYVVLLDWFSSAKDLQIGTTLRSLKDALFKWESKTVLRNEPLVLEGG
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YENWLLCYPQYTTNAKVTPPPRRQNEEVSISLDFTYPSLEESIPSKPAAQTPPASIEVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 YENWLLCYPQYTTNAKVTPPPRRQNEEVSISLDFTYPSLEESIPSKPAAQTPPASIEVDE
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NIELISGQNERMGPLNISTPVEPVAASKSDVSPIIQPVPSIKNVPQIDRTKKPAVKLPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NIELISGQNERMGPLNISTPVEPVAASKSDVSPIIQPVPSIKNVPQIDRTKKPAVKLPEE
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HRIKSESTNHEQQSPQSGKVIPDRSTKPVVFSPTLMLTDEEKARIHAETALLMEKNKQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 HRIKSESTNHEQQSPQSGKVIPDRSTKPVVFSPTLMLTDEEKARIHAETALLMEKNKQEK
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ELRERQQEEQKEKLRKEEQEQKAKKKQEAEENEITEKQQKAKEEMEKKESEQAKKEDKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ELRERQQEEQKEKLRKEEQEQKAKKKQEAEENEITEKQQKAKEEMEKKESEQAKKEDKET
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SAKRGKEITGVKRQSKSEHETSDAKKSVEDRGKRCPTPEIQKKSTGDVPHTSVTGDSGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SAKRGKEITGVKRQSKSEHETSDAKKSVEDRGKRCPTPEIQKKSTGDVPHTSVTGDSGSG
470 480 490 500 510 520
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 KPFKIKGQPESGILRTGTFREDTDDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLD
: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 K-----------------------------AQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLD
530 540 550
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 PITGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDREPSKLKRSYSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PITGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDREPSKLKRSYSSP
560 570 580 590 600 610
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 DITQAIQEEEKRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DITQAIQEEEKRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLR
620 630 640 650 660 670
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 NLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTG
680 690 700 710 720 730
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 QYRYISPKDFKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QYRYISPKDFKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDH
740 750 760 770 780 790
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTS
800 810 820 830 840 850
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 KCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRW
860 870 880 890 900 910
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 KQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRW
920 930 940 950 960 970
1090 1100 1110
pF1KA0 FKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
980 990 1000 1010
>>CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 (362 aa)
initn: 781 init1: 323 opt: 929 Z-score: 492.0 bits: 101.2 E(32554): 4.4e-21
Smith-Waterman score: 929; 43.0% identity (71.5% similar) in 344 aa overlap (772-1111:19-358)
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 RENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHL
:. .:.:::::::::.:::::::: :. .:
CCDS58 MLVPGSTRPYSKKRQNSKSAQGLAGLRNLGNTCFMNSILQCLSNTREL
10 20 30 40
810 820 830 840 850
pF1KA0 ADYFNRNCYQDDINR-SNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYR-YISPKDFKITIGKIND
:: . :. :... :: .: . : :::. .....::.. .::..:: : .
CCDS58 RDYCLQRLYMRDLHHGSN--AHTALV-EEFAKLIQTIWTSSPNDVVSPSEFKTQIQRYAP
50 60 70 80 90 100
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 QFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNE
.:.::.:::.::.: ::.::::...:.. : . . :: ::: : . ... :.:. . ..
CCDS58 RFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTLRPKSNPENLDHLPDDEKGRQMWRKYLERED
110 120 130 140 150 160
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 SIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTS--KCTLQDCLRLFSKEEKL
: : :: ::.::.. : : : .:. : ::::.:. . . ::.::.:::.::. :
CCDS58 SRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTVFDPFWDLSLPIAKRGYPEVTLMDCMRLFTKEDVL
170 180 190 200 210 220
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 TDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDL
... : .::.:. .::. : ..: .:..:::::: . .:: : :.:::..:::
CCDS58 DGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQRFPKILVLHLKRFSESRIRTSKLTTFVNFPLRDLDL
230 240 250 260 270 280
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 SQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVK
... . ..: :::..:::: : ::::::::.. . .: :.: :. .: :.:.
CCDS58 REFA-SENTNHAVYNLYAVSNHSGTTMGGHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVTPMSSSQVR
290 300 310 320 330 340
1100 1110
pF1KA0 SSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
.: ::.::: .:
CCDS58 TSDAYLLFYELASPPSRM
350 360
>>CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 (396 aa)
initn: 781 init1: 323 opt: 929 Z-score: 491.5 bits: 101.3 E(32554): 4.7e-21
Smith-Waterman score: 929; 43.0% identity (71.5% similar) in 344 aa overlap (772-1111:53-392)
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 RENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHL
:. .:.:::::::::.:::::::: :. .:
CCDS84 KELRPRSPLSPSLLLSTFVGLLLNKAKNSKSAQGLAGLRNLGNTCFMNSILQCLSNTREL
30 40 50 60 70 80
810 820 830 840 850
pF1KA0 ADYFNRNCYQDDINR-SNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYR-YISPKDFKITIGKIND
:: . :. :... :: .: . : :::. .....::.. .::..:: : .
CCDS84 RDYCLQRLYMRDLHHGSN--AHTALV-EEFAKLIQTIWTSSPNDVVSPSEFKTQIQRYAP
90 100 110 120 130
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 QFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNE
.:.::.:::.::.: ::.::::...:.. : . . :: ::: : . ... :.:. . ..
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... : .::.:. .::. : ..: .:..:::::: . .:: : :.:::..:::
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... . ..: :::..:::: : ::::::::.. . .: :.: :. .: :.:.
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CCDS84 RFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTLRPKSNPENLDHLPDDEKGRQMWRKYLERED
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CCDS84 SRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTVFDPFWDLSLPIAKRGYPEVTLMDCMRLFTKEDVL
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pF1KA0 TDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDL
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CCDS84 DGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQRFPKILVLHLKRFSESRIRTSKLTTFVNFPLRDLDL
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pF1KA0 SQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVK
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CCDS84 REFA-SENTNHAVYNLYAVSNHSGTTMGGHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVTPMSSSQVR
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1100 1110
pF1KA0 SSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
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CCDS84 TSDAYLLFYELASPPSRM
590 600
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CCDS89 PECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTA
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CCDS58 YKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYV
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CCDS27 VQDAGLYQGQVL-VIEPQNEDGTWPRQTLQSNGSGFSASY-NCQEPPSSHIQPGLCGLGN
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...:. :: .:.. ::.::.:::::::: ::.::::::::.. .. . .. .
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CCDS14 GICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLV
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CCDS14 LCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSV
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:: . : .:.
CCDS14 PLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVF
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CCDS27 CGMHSSGVSRGGSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTD
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CCDS27 DTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVT
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pF1KA0 YCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIG
CCDS27 VPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVC
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1118 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Thu Nov 3 09:05:30 2016 done: Thu Nov 3 09:05:31 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]