Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0042
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0042, 1648 aa
1>>>pF1KA0042 1648 - 1648 aa - 1648 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7604+/-0.00186; mu= 2.7725+/- 0.110
mean_var=236.4906+/-47.615, 0's: 0 Z-trim(102.0): 106 B-trim: 64 in 1/51
Lambda= 0.083400
statistics sampled from 6683 (6773) to 6683 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16
Scan time: 4.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30963.1 KIF14 gene_id:9928|Hs108|chr1 (1648) 10602 1291.1 0
CCDS82598.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1266) 1621 210.4 3.1e-53
CCDS13122.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1317) 1621 210.4 3.2e-53
CCDS56178.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1392) 1621 210.4 3.4e-53
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 1456 190.7 4e-47
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 1440 188.7 1.5e-46
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 1440 188.7 1.5e-46
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 1440 188.7 1.5e-46
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 1440 188.7 1.5e-46
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 1225 162.9 9e-39
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 1217 161.8 1.2e-38
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 1202 160.0 4.3e-38
CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690) 1187 158.3 2.1e-37
CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791) 1168 156.0 1.1e-36
CCDS65072.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1304) 750 105.6 1.1e-21
CCDS65071.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1335) 750 105.6 1.1e-21
CCDS6665.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1401) 750 105.6 1.2e-21
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10 (1056) 729 103.0 5.5e-21
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 715 101.4 2e-20
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 712 101.1 2.8e-20
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232) 707 100.4 3.9e-20
CCDS32325.2 KIF7 gene_id:374654|Hs108|chr15 (1343) 674 96.5 6.5e-19
CCDS53935.1 STARD9 gene_id:57519|Hs108|chr15 (4700) 665 95.7 3.8e-18
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 632 91.3 1.3e-17
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 632 91.3 1.4e-17
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 628 90.8 1.9e-17
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 617 89.5 5.6e-17
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 617 89.5 6.1e-17
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 617 89.5 6.1e-17
CCDS34430.1 KIFC1 gene_id:3833|Hs108|chr6 ( 673) 584 85.5 6.8e-16
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 577 84.6 1.3e-15
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 568 83.6 2.6e-15
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 568 83.6 2.7e-15
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 558 82.7 1.8e-14
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 558 82.7 1.8e-14
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 833) 508 76.4 4.6e-13
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 852) 508 76.4 4.6e-13
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 ( 898) 504 75.9 6.8e-13
CCDS6801.1 KIF12 gene_id:113220|Hs108|chr9 ( 513) 461 70.6 1.5e-11
CCDS6427.1 KIFC2 gene_id:90990|Hs108|chr8 ( 838) 451 69.5 5.3e-11
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6 ( 814) 450 69.4 5.6e-11
>>CCDS30963.1 KIF14 gene_id:9928|Hs108|chr1 (1648 aa)
initn: 10602 init1: 10602 opt: 10602 Z-score: 6907.6 bits: 1291.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10602; 100.0% identity (100.0% similar) in 1648 aa overlap (1-1648:1-1648)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSLHSTHNRNNSGDILDIPSSQNSSSLNALTHSSRLKLHLKSDMSECENDDPLLRSAGKV
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CCDS30 MSLHSTHNRNNSGDILDIPSSQNSSSLNALTHSSRLKLHLKSDMSECENDDPLLRSAGKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 RDINRTYVISASRKTADMPLTPNPVGRLALQRRTTRNKESSLLVSELEDTTEKTAETRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RDINRTYVISASRKTADMPLTPNPVGRLALQRRTTRNKESSLLVSELEDTTEKTAETRLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LQRRAKTDSAEKWKTAEIDSVKMTLNVGGETENNGVSKESRTNVRIVNNAKNSFVASSVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LQRRAKTDSAEKWKTAEIDSVKMTLNVGGETENNGVSKESRTNVRIVNNAKNSFVASSVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LDEDPQVIEMMADKKYKETFSAPSRANENVALKYSSNRPPIASLSQTEVVRSGHLTTKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LDEDPQVIEMMADKKYKETFSAPSRANENVALKYSSNRPPIASLSQTEVVRSGHLTTKPT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QSKLDIKVLGTGNLYHRSIGKEIAKTSNKFGSLEKRTPTKCTTEHKLTTKCSLPQLKSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QSKLDIKVLGTGNLYHRSIGKEIAKTSNKFGSLEKRTPTKCTTEHKLTTKCSLPQLKSPA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 PSILKNRMSNLQVKQRPKSSFLANKQERSAENTILPEEETVVQNTSAGKDPLKVENSQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PSILKNRMSNLQVKQRPKSSFLANKQERSAENTILPEEETVVQNTSAGKDPLKVENSQVT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VAVRVRPFTKREKIEKASQVVFMSGKEITVEHPDTKQVYNFIYDVSFWSFDECHPHYASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VAVRVRPFTKREKIEKASQVVFMSGKEITVEHPDTKQVYNFIYDVSFWSFDECHPHYASQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 TTVYEKLAAPLLERAFEGFNTCLFAYGQTGSGKSYTMMGFSEEPGIIPRFCEDLFSQVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TTVYEKLAAPLLERAFEGFNTCLFAYGQTGSGKSYTMMGFSEEPGIIPRFCEDLFSQVAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 KQTQEVSYHIEMSFFEVYNEKIHDLLVCKDENGQRKQPLRVREHPVYGPYVEALSMNIVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KQTQEVSYHIEMSFFEVYNEKIHDLLVCKDENGQRKQPLRVREHPVYGPYVEALSMNIVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SYADIQSWLELGNKQRATAATGMNDKSSRSHSVFTLVMTQTKTEFVEGEEHDHRITSRIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SYADIQSWLELGNKQRATAATGMNDKSSRSHSVFTLVMTQTKTEFVEGEEHDHRITSRIN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LIDLAGSERCSTAHTNGDRLKEGVSINKSLLTLGKVISALSEQANQRSVFIPYRESVLTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LIDLAGSERCSTAHTNGDRLKEGVSINKSLLTLGKVISALSEQANQRSVFIPYRESVLTW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LLKESLGGNSKTAMIATISPAASNIEETLSTLRYANQARLIVNIAKVNEDMNAKLIRELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLKESLGGNSKTAMIATISPAASNIEETLSTLRYANQARLIVNIAKVNEDMNAKLIRELK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 AEIAKLKAAQRNSRNIDPERYRLCRQEITSLRMKLHQQERDMAEMQRVWKEKFEQAEKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AEIAKLKAAQRNSRNIDPERYRLCRQEITSLRMKLHQQERDMAEMQRVWKEKFEQAEKRK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 LQETKELQKAGIMFQMDNHLPNLVNLNEDPQLSEMLLYMIKEGTTTVGKYKPNSSHDIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LQETKELQKAGIMFQMDNHLPNLVNLNEDPQLSEMLLYMIKEGTTTVGKYKPNSSHDIQL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SGVLIADDHCTIKNFGGTVSIIPVGEAKTYVNGKHILEITVLRHGDRVILGGDHYFRFNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SGVLIADDHCTIKNFGGTVSIIPVGEAKTYVNGKHILEITVLRHGDRVILGGDHYFRFNH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 PVEVQKGKRPSGRDTPISEGPKDFEFAKNELLMAQRSQLEAEIKEAQLKAKEEMMQGIQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PVEVQKGKRPSGRDTPISEGPKDFEFAKNELLMAQRSQLEAEIKEAQLKAKEEMMQGIQI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 AKEMAQQELSSQKAAYESKIKALEAELREESQRKKMQEINNQKANHKIEELEKAKQHLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AKEMAQQELSSQKAAYESKIKALEAELREESQRKKMQEINNQKANHKIEELEKAKQHLEQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 EIYVNKKRLEMETLATKQALEDHSIRHARILEALETEKQKIAKEVQILQQNRNNRDKTFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EIYVNKKRLEMETLATKQALEDHSIRHARILEALETEKQKIAKEVQILQQNRNNRDKTFT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 VQTTWSSMKLSMMIQEANAISSKLKTYYVFGRHDISDKSSSDTSIRVRNLKLGISTFWSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VQTTWSSMKLSMMIQEANAISSKLKTYYVFGRHDISDKSSSDTSIRVRNLKLGISTFWSL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 EKFESKLAAMKELYESNGSNRGEDAFCDPEDEWEPDITDAPVSSLSRRRSRSLMKNRRIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EKFESKLAAMKELYESNGSNRGEDAFCDPEDEWEPDITDAPVSSLSRRRSRSLMKNRRIS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 GCLHDIQVHPIKNLHSSHSSGLMDKSSTIYSNSAESFLPGICKELIGSSLDFFGQSYDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GCLHDIQVHPIKNLHSSHSSGLMDKSSTIYSNSAESFLPGICKELIGSSLDFFGQSYDEE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 RTIADSLINSFLKIYNGLFAISKAHEEQDEESQDNLFSSDRAIQSLTIQTACAFEQLVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RTIADSLINSFLKIYNGLFAISKAHEEQDEESQDNLFSSDRAIQSLTIQTACAFEQLVVL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 MKHWLSDLLPCTNIARLEDELRQEVKKLGGYLQLFLQGCCLDISSMIKEAQKNAIQIVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKHWLSDLLPCTNIARLEDELRQEVKKLGGYLQLFLQGCCLDISSMIKEAQKNAIQIVQQ
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 AVKYVGQLAVLKGSKLHFLENGNNKAASVQEEFMDAVCDGVGLGMKILLDSGLEKAKELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AVKYVGQLAVLKGSKLHFLENGNNKAASVQEEFMDAVCDGVGLGMKILLDSGLEKAKELQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 HELFRQCTKNEVTKEMKTNAMGLIRSLENIFAESKIKSFRRQVQEENFEYQDFKRMVNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HELFRQCTKNEVTKEMKTNAMGLIRSLENIFAESKIKSFRRQVQEENFEYQDFKRMVNRA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 PEFLKLKHCLEKAIEIIISALKGCHSDINLLQTCVESIRNLASDFYSDFSVPSTSVGSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PEFLKLKHCLEKAIEIIISALKGCHSDINLLQTCVESIRNLASDFYSDFSVPSTSVGSYE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 SRVTHIVHQELESLAKSLLFCFESEESPDLLKPWETYNQNTKEEHQQSKSSGIDGSKNKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SRVTHIVHQELESLAKSLLFCFESEESPDLLKPWETYNQNTKEEHQQSKSSGIDGSKNKG
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640
pF1KA0 VPKRVYELHGSSPAVSSEECTPSRIQWV
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VPKRVYELHGSSPAVSSEECTPSRIQWV
1630 1640
>>CCDS82598.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1266 aa)
initn: 943 init1: 471 opt: 1621 Z-score: 1069.2 bits: 210.4 E(32554): 3.1e-53
Smith-Waterman score: 1650; 40.9% identity (69.1% similar) in 758 aa overlap (357-1075:2-740)
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 ERSAENTILPEEETVVQNTSAGKDPLKVENSQVTVAVRVRPFTKREKIEKASQVVFMSGK
..: :::::::...::: .:. .. : .
CCDS82 MASVKVAVRVRPMNRREKDLEAKFIIQMEKS
10 20 30
390 400 410 420 430
pF1KA0 EITVEH---PD-------TKQVYNFIYDVSFWSFDECHPHYASQTTVYEKLAAPLLERAF
. :. . :. ... .: :: ::.: : : :.:: :.. :.. ... ::
CCDS82 KTTITNLKIPEGGTGDSGRERTKTFTYDFSFYSADTKSPDYVSQEMVFKTLGTDVVKSAF
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 EGFNTCLFAYGQTGSGKSYTMMGFSEEPGIIPRFCEDLFSQVARKQT-QEVSYHIEMSFF
::.:.:.:::::::::::::::: : . :.:::.:: :::.. . .:.:.. :.:..
CCDS82 EGYNACVFAYGQTGSGKSYTMMGNSGDSGLIPRICEGLFSRINETTRWDEASFRTEVSYL
100 110 120 130 140 150
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 EVYNEKIHDLLVCKDENGQRKQPLRVREHPVYGPYVEALSMNIVSSYADIQSWLELGNKQ
:.:::...::: : ... ::::::: ::::: :: ..:..:.:.. .. :: .
CCDS82 EIYNERVRDLLRRK---SSKTFNLRVREHPKEGPYVEDLSKHLVQNYGDVEELMDAGNIN
160 170 180 190 200
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 RATAATGMNDKSSRSHSVFTLVMTQTKTEFVEGEEHDHRITSRINLIDLAGSERCSTAHT
:.:::::::: :::::..::. .::.: . : . .:.:.:.::::::: ... .
CCDS82 RTTAATGMNDVSSRSHAIFTIKFTQAKFD----SEMPCETVSKIHLVDLAGSERADATGA
210 220 230 240 250 260
620 630 640 650 660
pF1KA0 NGDRLKEGVSINKSLLTLGKVISALSEQ--------ANQRSVFIPYRESVLTWLLKESLG
.: ::::: .:::::.:::.:::::.. :....::.:::.::::::::.:::
CCDS82 TGVRLKEGGNINKSLVTLGNVISALADLSQDAANTLAKKKQVFVPYRDSVLTWLLKDSLG
270 280 290 300 310 320
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GNSKTAMIATISPAASNIEETLSTLRYANQARLIVNIAKVNEDMNAKLIRELKAEIAKLK
::::: :::::::: : ::::::::::.:. :.: .::: :.::::::.::::.::
CCDS82 GNSKTIMIATISPADVNYGETLSTLRYANRAKNIINKPTINEDANVKLIRELRAEIARLK
330 340 350 360 370 380
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 A--AQRNSRNIDPERYRLCRQEITSLRMKLHQQERDMAEMQRVWKEKFEQAEKRKLQETK
. :: :. . : :.. ::.:.: . :. . : .:...... ..:
CCDS82 TLLAQGNQIAL------LDSPTALSMEEKLQQNEARVQELTKEWTNKWNETQNILKEQTL
390 400 410 420 430
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 ELQKAGIMFQMDNHLPNLVNLNEDPQLSEMLLYMIKEGTTTVGKYKPNSSHDIQLSGVLI
:.: :: .:..::.:.....: . ..:: .::: : ::. .. .:: : :. .
CCDS82 ALRKEGIGVVLDSELPHLIGIDDDLLSTGIILYHLKEGQTYVGRDDASTEQDIVLHGLDL
440 450 460 470 480 490
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 ADDHCTIKNFGGTVSIIPVGEAKTYVNGKHILEITVLRHGDRVILGGDHYFRFNHPVEVQ
..:: ..:.::::..::.. .. ::: .:.: : : .: ..:: ..:::::: :.
CCDS82 ESEHCIFENIGGTVTLIPLSGSQCSVNGVQIVEATHLNQGAVILLGRTNMFRFNHPKEAA
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CCDS55 MDRFSFHSPSAQQRLRQWAEEREATLNNSLMRLREQIVK-ANLLVREANYIAEELDKRTE
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CCDS55 Y---KVTLQIP-ASSLDANRKRGSLL----------SEPAIQVRRKGKG-KQIWSLEKLD
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CCDS55 NRLLDMRDLYQEWKECEEDNPVIRSYFKRADPFYDEQENHSLIGVANVFLESLFYDVKLQ
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CCDS47 NQ-TVLHPPPSNTKQGERKPPKVFAFDYCFWSMDESNTTKYAGQEVVFKCLGEGILEKAF
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CCDS47 QGYNACIFAYGQTGSGKSFSMMGHAEQLGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYME
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CCDS47 IYNEKVRDLL---DPKGSR-QSLKVREHKVLGPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSR
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CCDS47 TVAATNMNEESSRSHAVFNIIITQTLYDLQSGNSGEK--VSKVSLVDLAGSERVSKTGAA
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