Result of FASTA (omim) for
pF1KA0030
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0030, 904 aa
1>>>pF1KA0030 904 - 904 aa - 904 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0693+/-0.000415; mu= 13.6166+/- 0.026
mean_var=127.9734+/-25.706, 0's: 0 Z-trim(115.1): 40 B-trim: 105 in 1/54
Lambda= 0.113374
statistics sampled from 25347 (25384) to 25347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 13.430
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004517 (OMIM: 116945,616968) DNA replication li ( 904) 5935 982.9 0
NP_002379 (OMIM: 602693) DNA replication licensing ( 853) 1064 186.1 6.1e-46
NP_001257401 (OMIM: 602693) DNA replication licens ( 818) 1008 177.0 3.4e-43
NP_005907 (OMIM: 600592) DNA replication licensing ( 719) 988 173.7 2.9e-42
XP_005250405 (OMIM: 600592) PREDICTED: DNA replica ( 612) 986 173.3 3.2e-42
XP_016867706 (OMIM: 600592) PREDICTED: DNA replica ( 612) 986 173.3 3.2e-42
NP_877577 (OMIM: 600592) DNA replication licensing ( 543) 932 164.4 1.3e-39
NP_001265524 (OMIM: 600592) DNA replication licens ( 543) 932 164.4 1.3e-39
NP_877954 (OMIM: 608187,612885) DNA helicase MCM8 ( 824) 828 147.5 2.5e-34
XP_006724305 (OMIM: 602696) PREDICTED: DNA replica ( 732) 827 147.3 2.5e-34
NP_006730 (OMIM: 602696) DNA replication licensing ( 734) 827 147.3 2.5e-34
NP_060166 (OMIM: 610098,616185) DNA helicase MCM9 (1143) 806 144.0 3.9e-33
NP_005906 (OMIM: 223100,601806) DNA replication li ( 821) 772 138.4 1.4e-31
NP_005905 (OMIM: 602638,609981) DNA replication li ( 863) 752 135.1 1.4e-30
NP_877423 (OMIM: 602638,609981) DNA replication li ( 863) 752 135.1 1.4e-30
XP_016883596 (OMIM: 608187,612885) PREDICTED: DNA ( 557) 635 115.8 5.7e-25
XP_016883595 (OMIM: 608187,612885) PREDICTED: DNA ( 776) 635 115.9 7.5e-25
NP_115874 (OMIM: 608187,612885) DNA helicase MCM8 ( 840) 635 116.0 8e-25
NP_001268449 (OMIM: 608187,612885) DNA helicase MC ( 840) 635 116.0 8e-25
XP_016883594 (OMIM: 608187,612885) PREDICTED: DNA ( 880) 573 105.8 9.4e-22
NP_001268450 (OMIM: 608187,612885) DNA helicase MC ( 880) 573 105.8 9.4e-22
XP_011527689 (OMIM: 608187,612885) PREDICTED: DNA ( 581) 570 105.2 9.4e-22
NP_001268451 (OMIM: 608187,612885) DNA helicase MC ( 793) 427 81.9 1.3e-14
NP_694987 (OMIM: 610098,616185) DNA helicase MCM9 ( 391) 377 73.5 2.2e-12
>>NP_004517 (OMIM: 116945,616968) DNA replication licens (904 aa)
initn: 5935 init1: 5935 opt: 5935 Z-score: 5251.3 bits: 982.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5935; 100.0% identity (100.0% similar) in 904 aa overlap (1-904:1-904)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAESSESFTMASSPAQRRRGNDPLTSSPGRSSRRTDALTSSPGRDLPPFEDESEGLLGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAESSESFTMASSPAQRRRGNDPLTSSPGRSSRRTDALTSSPGRDLPPFEDESEGLLGTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GPLEEEEDGEELIGDGMERDYRAIPELDAYEAEGLALDDEDVEELTASQREAAERAMRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GPLEEEEDGEELIGDGMERDYRAIPELDAYEAEGLALDDEDVEELTASQREAAERAMRQR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DREAGRGLGRMRRGLLYDSDEEDEERPARKRRQVERATEDGEEDEEMIESIENLEDLKGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DREAGRGLGRMRRGLLYDSDEEDEERPARKRRQVERATEDGEEDEEMIESIENLEDLKGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SVREWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SVREWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 HLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPGSCPECQSAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPGSCPECQSAGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 NYDGSLNTANGFPVFATVILANHVAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSKDQQIGEKIFAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NYDGSLNTANGFPVFATVILANHVAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSKDQQIGEKIFAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 HEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDIL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 CVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVEPLPQEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVEPLPQEVL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 HLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFILKQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFILKQLV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 AEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAFYDSELFRMNKFSHDLKRKMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAFYDSELFRMNKFSHDLKRKMI
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LQQF
::::
NP_004 LQQF
>>NP_002379 (OMIM: 602693) DNA replication licensing fac (853 aa)
initn: 872 init1: 699 opt: 1064 Z-score: 945.8 bits: 186.1 E(85289): 6.1e-46
Smith-Waterman score: 1105; 33.2% identity (63.2% similar) in 704 aa overlap (170-830:29-724)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 DEEDEERPARKRRQVERATEDGEEDEEMIESIENLEDLKGHSVREWVSMAGP----RLEI
: : .:. : : ..::: .:.
NP_002 MLPRSPPLPRGNLWWREEFGSFRAGVESSWEPPRDFGGGSSLA-AGMAGTVVLDDVEL
10 20 30 40 50
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 HHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAREHVLAYFLPEAPAEL
.. ...: : . ..... .. .. ..:. :.:: .:: ... : : . :
NP_002 REAQRDYLDFLDDEEDQGIYQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEE
60 70 80 90 100 110
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 LQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEEL--RSLRQLHLNQLIRTSGVVT
: :..: . : .. : . ....: . ... :.: . :. .. . :.::
NP_002 LVAFQRALKDFVASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVT
120 130 140 150 160 170
320 330 340 350 360
pF1KA0 SCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVK-PGSC--P-ECQSAGPFEVNMEETI
.:. : :.. . : . .. .. . : :.: : . . .:.:... ..
NP_002 KCSLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSV
180 190 200 210 220 230
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 YQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHNNYDGSLNTA
:...: : ::: : :. ::.:::: :.:: ::::. ::::.....: :. . . .
NP_002 YKDHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYT
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 NGFPVFATVILANHVAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSK--DQQIGEKIFASIAPSIYG
.: .: ::..: .: :. .: : .. ::. : ..:: ...: ... :.::::.:
NP_002 SG--TFRTVLIACNV-KQMSKDAQPSFSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSLAPSIHG
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 HEDIKRGLALALFGGEPKN-PGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFT
:. .:... :.:: .. .:.: .:::::.:: :::..::::.:.:. .. ::: :
NP_002 HDYVKKAILCLLLGGVERDLENGSH-IRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPT
360 370 380 390 400 410
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 TGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQ
::.:.:.::::: : . : :::::.::::::: :::::::.:.:::.:::.:::
NP_002 TGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQ
420 430 440 450 460 470
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDT
..:.:::: . :.:::.:.:::::. :::: : ::. : . ..::::.: .. :
NP_002 GRVTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQ
480 490 500 510 520 530
670 680 690 700
pF1KA0 VDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAM---PN---------------
.:: ::. .. :. : . :.... ... :::.. ::
NP_002 MDPEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKH
540 550 560 570 580 590
710 720 730 740 750
pF1KA0 ---TYGVEPLPQEV-----LKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLR-KESMATGS
.:.. ... .:::: :: ..: :.: . .:. :: :: ..::.. .
NP_002 DNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKI-IKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDT
600 610 620 630 640 650
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 I---PITVRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRK
:.:.: .:..::.: :::. .. : .:.. :.... ... .: .. ::
NP_002 ARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYF--KKVLEKEKKRK
660 670 680 690 700 710
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 TFARYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHN
.. : .:..:
NP_002 KRSEDESETEDEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKT
720 730 740 750 760 770
>>NP_001257401 (OMIM: 602693) DNA replication licensing (818 aa)
initn: 872 init1: 699 opt: 1008 Z-score: 896.5 bits: 177.0 E(85289): 3.4e-43
Smith-Waterman score: 1048; 36.3% identity (65.4% similar) in 573 aa overlap (295-830:124-689)
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 EVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSM
:.: . :. .. . :.::.:. : :..
NP_001 VASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKVVR
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 VKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVK-PGSC--P-ECQSAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQE
. : . .. .. . : :.: : . . .:.:... ..:...: : :::
NP_001 SVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQE
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 SPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHNNYDGSLNTANGFPVFATVIL
: :. ::.:::: :.:: ::::. ::::.....: :. . . ..: .: ::..
NP_001 MPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSG--TFRTVLI
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490
pF1KA0 ANHVAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSK--DQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALA
: .: :. .: : .. ::. : ..:: ...: ... :.::::.::. .:...
NP_001 ACNV-KQMSKDAQPSFSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSLAPSIHGHDYVKKAILCL
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 LFGGEPKN-PGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLT
:.:: .. .:.: .:::::.:: :::..::::.:.:. .. ::: :::.:.:.::::
NP_001 LLGGVERDLENGSH-IRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTGRGSSGVGLT
340 350 360 370 380
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 AYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIV
: : . : :::::.::::::: :::::::.:.:::.:::.::: ..:.::::
NP_001 AAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAKAGIH
390 400 410 420 430 440
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 TSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLAR
. :.:::.:.:::::. :::: : ::. : . ..::::.: .. : .:: ::. ..
NP_001 ARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDPEQDREISD
450 460 470 480 490 500
680 690 700 710
pF1KA0 FVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAM---PN------------------TYGVEPLP
:. : . :.... ... :::.. :: .:..
NP_001 HVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHDNLLHGTKKKK
510 520 530 540 550 560
720 730 740 750 760
pF1KA0 QEV-----LKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLR-KESMATGSI---PITVRHI
... .:::: :: ..: :.: . .:. :: :: ..::.. . :.:.: .
NP_001 EKMVSAAFMKKYIHVAKI-IKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDTARTSPVTARTL
570 580 590 600 610 620
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 ESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRD
:..::.: :::. .. : .:.. :.... ... .: .. :: .. : .:
NP_001 ETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYF--KKVLEKEKKRKKRSEDESETED
630 640 650 660 670 680
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 NNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAFYDSELFR
..:
NP_001 EEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKTADSQETKESQK
690 700 710 720 730 740
>>NP_005907 (OMIM: 600592) DNA replication licensing fac (719 aa)
initn: 926 init1: 628 opt: 988 Z-score: 879.7 bits: 173.7 E(85289): 2.9e-42
Smith-Waterman score: 1099; 35.2% identity (65.8% similar) in 600 aa overlap (214-798:76-637)
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAR-EH
.: . .... . .: ::: . : . ::
NP_005 VALYVDLDDVAEDDPELVDSICENARRYAKLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEH
50 60 70 80 90 100
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPK--YDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQL
: . : .. : . .. .:: . :. ... :. : : .: .:
NP_005 RL---MMEQRSR-----DPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQGPSSNKPRV--IREVRAD
110 120 130 140 150
310 320 330 340 350
pF1KA0 HLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPG-SCP--ECQ-
...:. . :.:: . : :.. .. :.:..:. . :. : :: :::
NP_005 SVGKLVTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCG--AETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQT
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 --SAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIEL
:.: . .. . . . ..:....:: .: .: .::: ... .. . .:::.. .
NP_005 NRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSV
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460
pF1KA0 TGIYHNNY-DGSLNTANGFPVFATVILANHVAK----KDNKVAVGELTDEDVKMITSLSK
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NP_005 TGIFLPILRTGFRQVVQGL-LSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREELRQIA----
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pF1KA0 DQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAK
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pF1KA0 SQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEF
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NP_005 SQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEF
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pF1KA0 DKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDL
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NP_005 DKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQL
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pF1KA0 TEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNT
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pF1KA0 YGVEPLPQEVLKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPIT-VRHIE
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NP_005 F--EPLDMKLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLL
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pF1KA0 SMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDN
...:.. : ::... : : ..::: :::.:
NP_005 AILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRE
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Smith-Waterman score: 1097; 37.5% identity (68.4% similar) in 525 aa overlap (286-798:36-530)
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. : :.. .. :.:..:. . :. : :: ::: :.: . .. . .
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pF1KA0 YQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHNNY-DGSLNT
. ..:....:: .: .: .::: ... .. . .:::.. .:::. : ..
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..:. . : . :....: .:.. ..:::: :....:. .... ::. :::::
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:::.:::.::::.:.:.:::...::::: :::.: .. .:..: ..::::.: ...
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pF1KA0 IYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPIT-VRHIESMIRMAEAHARIHLR
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XP_005 AMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMV
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: : ..::: :::.:
XP_005 DVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQ
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>>XP_016867706 (OMIM: 600592) PREDICTED: DNA replication (612 aa)
initn: 926 init1: 628 opt: 986 Z-score: 878.9 bits: 173.3 E(85289): 3.2e-42
Smith-Waterman score: 1097; 37.5% identity (68.4% similar) in 525 aa overlap (286-798:36-530)
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 LQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSC
:. : : .: .: ...:. . :.::
XP_016 SRDPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQGPSSNKPRV--IREVRADSVGKLVTVRGIVTRV
10 20 30 40 50 60
320 330 340 350 360
pF1KA0 TGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPG-SCP--ECQ---SAGPFEVNMEETI
. : :.. .. :.:..:. . :. : :: ::: :.: . .. . .
XP_016 SEVKPKMVVATYTCDQCG--AETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSR
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pF1KA0 YQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHNNY-DGSLNT
. ..:....:: .: .: .::: ... .. . .:::.. .:::. : ..
XP_016 FIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSVTGIFLPILRTGFRQV
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pF1KA0 ANGFPVFATVILANHVAK----KDNKVAVGELTDEDVKMITSLSKDQQIGEKIFASIAPS
..:. . : . :....: .:.. ..:::: :....:. .... ::. :::::
XP_016 VQGL-LSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREELRQIA----EEDFYEKLAASIAPE
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pF1KA0 IYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAI
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XP_016 IYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRG-MKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQ
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pF1KA0 FTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAM
.:::.:.:.::::: : : :: : :::.:::::::.::: ::::::: . :::.:::.:
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XP_016 DRPDRDNDLRLAQHI--TYVHQH-------------SRQP--PSQF--EPLDMKLMRRYI
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pF1KA0 IYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPIT-VRHIESMIRMAEAHARIHLR
. .:. .: . . : .. : ..:.:. :. . : .: . ...:.. : ::...
XP_016 AMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMV
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pF1KA0 DYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQ
: : ..::: :::.:
XP_016 DVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQ
520 530 540 550 560 570
>>NP_877577 (OMIM: 600592) DNA replication licensing fac (543 aa)
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NP_877 MVVATYTCDQCG--AETYQPIQSPTFMPLI
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pF1KA0 SCP--ECQ---SAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDS
:: ::: :.: . .. . . . ..:....:: .: .: .::: ... .. .
NP_877 MCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRI
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.:::.. .:::. : ....:. . : . :....: .:.. ..:::: :.
NP_877 AQPGDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGL-LSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREE
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pF1KA0 VKMITSLSKDQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVL
...:. .... ::. ::::: ::::::.:..: : : :: ..: : :.::.::.
NP_877 LRQIA----EEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRG-MKIRGNINIC
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pF1KA0 LCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLAD
: ::::.::::.:.::.... :. .:::.:.:.::::: : : :: : :::.:::::::
NP_877 LMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLAD
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.::: ::::::: . :::.:::.::::.:::.::::.:.:.:::...::::: :::.:
NP_877 QGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPR
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.. .:..: ..::::.: ...: : .: ::. . ..:..:
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330 340 350 360
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pF1KA0 AAEPAMPNTYGVEPLPQEVLKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSI
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NP_877 SRQP--PSQF--EPLDMKLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDA
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pF1KA0 PIT-VRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFA
: .: . ...:.. : ::... : : ..::: :::.:
NP_877 TYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPA
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pF1KA0 RYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSA
NP_877 DVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITF
490 500 510 520 530 540
>>NP_001265524 (OMIM: 600592) DNA replication licensing (543 aa)
initn: 926 init1: 628 opt: 932 Z-score: 831.9 bits: 164.4 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 1043; 38.0% identity (68.9% similar) in 489 aa overlap (322-798:1-461)
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pF1KA0 EELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPG-
. .. :.:..:. . :. :
NP_001 MVVATYTCDQCG--AETYQPIQSPTFMPLI
10 20
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pF1KA0 SCP--ECQ---SAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDS
:: ::: :.: . .. . . . ..:....:: .: .: .::: ... .. .
NP_001 MCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRI
30 40 50 60 70 80
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pF1KA0 CKPGDEIELTGIYHNNY-DGSLNTANGFPVFATVILANHVAK----KDNKVAVGELTDED
.:::.. .:::. : ....:. . : . :....: .:.. ..:::: :.
NP_001 AQPGDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGL-LSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREE
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...:. .... ::. ::::: ::::::.:..: : : :: ..: : :.::.::.
NP_001 LRQIA----EEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRG-MKIRGNINIC
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: ::::.::::.:.::.... :. .:::.:.:.::::: : : :: : :::.:::::::
NP_001 LMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLAD
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NP_001 QGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPR
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pF1KA0 LTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGS
.. .:..: ..::::.: ...: : .: ::. . ..:..:
NP_001 RSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHI--TYVHQH-------------
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pF1KA0 AAEPAMPNTYGVEPLPQEVLKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSI
. .: :. . ::: ......:: . .:. .: . . : .. : ..:.:. :. .
NP_001 SRQP--PSQF--EPLDMKLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDA
370 380 390 400 410 420
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pF1KA0 PIT-VRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFA
: .: . ...:.. : ::... : : ..::: :::.:
NP_001 TYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPA
430 440 450 460 470 480
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pF1KA0 RYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSA
NP_001 DVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITF
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Smith-Waterman score: 1056; 29.6% identity (60.0% similar) in 820 aa overlap (125-856:7-807)
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:::.:: : :: . . .: :.
NP_877 MNGEYRGRGFGRGRFQSWKRGRGGGNFSGKWREREH
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pF1KA0 RPARKRRQVERATEDGEE-------DEEMIESIENLEDLKGHSVR--EWVSMAGPRLEIH
:: .. .:..:. . . : ... . :: .. : : ..: .:
NP_877 RPDLSKTTGKRTSEQTPQFLLSTKTPQSMQSTLDRFIPYKGWKLYFSEVYSDSSPLIEKI
40 50 60 70 80 90
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pF1KA0 HRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAREHV------LAYFLPE
. :..:. :.: . :..: : . :..:....:. .: .: : .
NP_877 QAFEKFFTRHIDLYD----KDEI-----ERKGSILVDFKELTEGGEVTNLIPDIATELRD
100 110 120 130 140
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pF1KA0 APAELL--------QIFDE------AALEVVLAMYPKYDRITN--HIHVRISHLPLVEEL
:: . : :.. . : :.. .. . ..: :::.:. . . .:
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