Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0029
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0029, 971 aa
1>>>pF1KA0029 971 - 971 aa - 971 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0694+/-0.00127; mu= -15.0043+/- 0.077
mean_var=649.9935+/-135.248, 0's: 0 Z-trim(115.6): 43 B-trim: 429 in 1/52
Lambda= 0.050306
statistics sampled from 16148 (16184) to 16148 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.771), E-opt: 0.2 (0.497), width: 16
Scan time: 4.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS63026.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 ( 971) 6662 499.3 1.6e-140
CCDS63024.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1044) 4351 331.6 5.1e-90
CCDS63025.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1100) 4351 331.6 5.3e-90
CCDS2177.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1099) 4332 330.2 1.4e-89
CCDS81703.1 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 (1010) 2374 188.1 7.8e-47
CCDS2661.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 ( 812) 1494 124.1 1.1e-27
CCDS8937.2 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 ( 976) 1014 89.3 3.9e-17
CCDS58824.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 ( 793) 1004 88.5 5.6e-17
CCDS58823.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 ( 813) 994 87.8 9.4e-17
CCDS81704.1 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 ( 966) 945 84.3 1.3e-15
>>CCDS63026.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (971 aa)
initn: 6662 init1: 6662 opt: 6662 Z-score: 2636.4 bits: 499.3 E(32554): 1.6e-140
Smith-Waterman score: 6662; 99.9% identity (100.0% similar) in 971 aa overlap (1-971:1-971)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRMSDTVTVKDETATMKDLEAEVKDTTRVENLIKSENYGKILVEKNEHCIENNIDLQEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MRMSDTVTVKDETATMKDLEAEVKDTTRVENLIKSENYGKILVEKNEHCIENNIDLQEKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QIQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QIQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VNKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQVRIRLKDDRRSKSIE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS63 VNKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EREEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYIIDKRLQDEDASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 EREEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYIIDKRLQDEDASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 QSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 KTGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQPPLPAPPQQPAANHIFSQQDNLGSQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KTGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQPPLPAPPQQPAANHIFSQQDNLGSQF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SHMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSGYIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SHMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSGYIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 GQPVPTAGYPASGHPVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPSVHYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GQPVPTAGYPASGHPVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPSVHYN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SHLNQPLPQPAQQTGYQVIPNQQQNYQGIVGVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SHLNQPLPQPAQQTGYQVIPNQQQNYQGIVGVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SVPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFPNQSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SVPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFPNQSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GYLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GYLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PQWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSPQLSSPIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PQWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSPQLSSPIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 PPLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLGQPLQYNPPAVLHGHIPNQQGQPGSRHGNRGRRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PPLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLGQPLQYNPPAVLHGHIPNQQGQPGSRHGNRGRRQA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KKAASTDLGAGETVVGKVLEITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KKAASTDLGAGETVVGKVLEITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 PLCCGSGDNTANPERSKPSDLASTYTVLATFPSISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PLCCGSGDNTANPERSKPSDLASTYTVLATFPSISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHY
910 920 930 940 950 960
970
pF1KA0 DFHILERASSQ
:::::::::::
CCDS63 DFHILERASSQ
970
>>CCDS63024.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1044 aa)
initn: 4344 init1: 4344 opt: 4351 Z-score: 1729.6 bits: 331.6 E(32554): 5.1e-90
Smith-Waterman score: 6134; 91.4% identity (91.5% similar) in 1000 aa overlap (57-971:45-1044)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 TRVENLIKSENYGKILVEKNEHCIENNIDLQEKIQIQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 DILADNCEKEPWIILFYFCGTPQSQIQRTHQEKIQIQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASD
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 KLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRK
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDF
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 QKRYILKRDNSSFDKDDNQVRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYI
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYI
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 IDKRLQDEDASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 IDKRLQDEDASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLR
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360
pF1KA0 NLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLSKTG-----------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLSKTGSESSGSVGSSTGSLSHIQQPLPG
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
CCDS63 TALSQSSHGAPVVYPTVSTHSSLSFDGGLNGQVASPSTSFFLLPLEAAGIPPGSILINPQ
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 --QPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQPPLPAPPQQPAANHIFSQQDNLGSQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQPPLPAPPQQPAANHIFSQQDNLGSQFS
440 450 460 470 480 490
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSGYIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSGYIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPG
500 510 520 530 540 550
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QPVPTAGYPASGHPVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPSVHYNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QPVPTAGYPASGHPVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPSVHYNS
560 570 580 590 600 610
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 HLNQPLPQPAQQTGYQVIPNQQQNYQGIVGVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HLNQPLPQPAQQTGYQVIPNQQQNYQGIVGVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTS
620 630 640 650 660 670
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 VPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFPNQSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFPNQSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVG
680 690 700 710 720 730
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 YLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 YLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP
740 750 760 770 780 790
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSPQLSSPIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSPQLSSPIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGP
800 810 820 830 840 850
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 PLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLGQPLQYNPPAVLHGHIPNQQGQPGSRHGNRGRRQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLGQPLQYNPPAVLHGHIPNQQGQPGSRHGNRGRRQAK
860 870 880 890 900 910
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KAASTDLGAGETVVGKVLEITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KAASTDLGAGETVVGKVLEITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHP
920 930 940 950 960 970
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LCCGSGDNTANPERSKPSDLASTYTVLATFPSISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LCCGSGDNTANPERSKPSDLASTYTVLATFPSISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHYD
980 990 1000 1010 1020 1030
970
pF1KA0 FHILERASSQ
::::::::::
CCDS63 FHILERASSQ
1040
>>CCDS63025.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1100 aa)
initn: 4693 init1: 4344 opt: 4351 Z-score: 1729.3 bits: 331.6 E(32554): 5.3e-90
Smith-Waterman score: 6134; 91.4% identity (91.5% similar) in 1000 aa overlap (57-971:101-1100)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 TRVENLIKSENYGKILVEKNEHCIENNIDLQEKIQIQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KSSSKLKLVRSLAVCEESPPPPAPEISQENQEKIQIQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASD
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 KLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRK
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDF
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 QKRYILKRDNSSFDKDDNQVRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYI
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYI
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 IDKRLQDEDASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 IDKRLQDEDASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLR
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360
pF1KA0 NLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLSKTG-----------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLSKTGSESSGSVGSSTGSLSHIQQPLPG
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
CCDS63 TALSQSSHGAPVVYPTVSTHSSLSFDGGLNGQVASPSTSFFLLPLEAAGIPPGSILINPQ
440 450 460 470 480 490
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 --QPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQPPLPAPPQQPAANHIFSQQDNLGSQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQPPLPAPPQQPAANHIFSQQDNLGSQFS
500 510 520 530 540 550
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSGYIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSGYIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPG
560 570 580 590 600 610
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QPVPTAGYPASGHPVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPSVHYNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QPVPTAGYPASGHPVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPSVHYNS
620 630 640 650 660 670
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 HLNQPLPQPAQQTGYQVIPNQQQNYQGIVGVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HLNQPLPQPAQQTGYQVIPNQQQNYQGIVGVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTS
680 690 700 710 720 730
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 VPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFPNQSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFPNQSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVG
740 750 760 770 780 790
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 YLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 YLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP
800 810 820 830 840 850
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSPQLSSPIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSPQLSSPIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGP
860 870 880 890 900 910
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 PLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLGQPLQYNPPAVLHGHIPNQQGQPGSRHGNRGRRQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLGQPLQYNPPAVLHGHIPNQQGQPGSRHGNRGRRQAK
920 930 940 950 960 970
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KAASTDLGAGETVVGKVLEITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KAASTDLGAGETVVGKVLEITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHP
980 990 1000 1010 1020 1030
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LCCGSGDNTANPERSKPSDLASTYTVLATFPSISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LCCGSGDNTANPERSKPSDLASTYTVLATFPSISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHYD
1040 1050 1060 1070 1080 1090
970
pF1KA0 FHILERASSQ
::::::::::
CCDS63 FHILERASSQ
1100
>>CCDS2177.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1099 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KA0 TRVENLIKSENYGKILVEKNEHCIENNIDLQEKIQIQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KSSSKLKLVRSLAVCEESPPPPAPEISQENQEKIQIQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASD
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 KLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRK
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDF
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 QKRYILKRDNSSFDKDDNQVRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYI
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 QKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYI
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 IDKRLQDEDASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 IDKRLQDEDASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLR
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360
pF1KA0 NLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLSKTG-----------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLSKTGSESSGSVGSSTGSLSHIQQPLPG
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
CCDS21 TALSQSSHGAPVVYPTVSTHSSLSFDGGLNGQVASPSTSFFLLPLEAAGIPPGSILINPQ
440 450 460 470 480 490
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 --QPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQPPLPAPPQQPAANHIFSQQDNLGSQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS21 TGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQPPLPAPPQQPAANHIFSQ-DNLGSQFS
500 510 520 530 540
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSGYIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 HMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSGYIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPG
550 560 570 580 590 600
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 QPVPTAGYPASGHPVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPSVHYNS
610 620 630 640 650 660
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 HLNQPLPQPAQQTGYQVIPNQQQNYQGIVGVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 HLNQPLPQPAQQTGYQVIPNQQQNYQGIVGVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTS
670 680 690 700 710 720
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 VPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFPNQSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 VPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFPNQSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVG
730 740 750 760 770 780
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 YLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 YLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP
790 800 810 820 830 840
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSPQLSSPIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSPQLSSPIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGP
850 860 870 880 890 900
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 PLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLGQPLQYNPPAVLHGHIPNQQGQPGSRHGNRGRRQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 PLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLGQPLQYNPPAVLHGHIPNQQGQPGSRHGNRGRRQAK
910 920 930 940 950 960
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KAASTDLGAGETVVGKVLEITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KAASTDLGAGETVVGKVLEITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHP
970 980 990 1000 1010 1020
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LCCGSGDNTANPERSKPSDLASTYTVLATFPSISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LCCGSGDNTANPERSKPSDLASTYTVLATFPSISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHYD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
970
pF1KA0 FHILERASSQ
::::::::::
CCDS21 FHILERASSQ
1090
>>CCDS81703.1 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 (1010 aa)
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10 20 30 40
pF1KA0 MRMSDTVTVKDETATMKDLEAEVKDTT-RVENLIKSENYGK
.: . ...: : .::. : :. .. :.:.
CCDS81 SNTTQETLEIMKESEKKLVEESVNKNKFISKTPSKEEIEKECEDTSLRQETQRRTSNHGH
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KA0 I-----------LVEKNEHCIENN-------IDLQEKIQIQLTQSFEKEE-KPSKDEAEK
::.. : :.. .. :. ::.... .::: : .:: .::
CCDS81 ARKRAKSNSKLKLVRSLAVCEESSTPFADGPLETQDIIQLHISCPSDKEEEKSTKDVSEK
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130
pF1KA0 E---KASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFI
: : ..:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::
CCDS81 EDKDKNKEKIPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNPRDRMMLLKLEQEILEFI
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 GNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDQKFNEHI
..:.. :::: :::::::::::::::::.::::::.::.::.:::::::::.:.:.:::
CCDS81 NDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVIINKTSNTRIPEQRFSEHI
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 KDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQVRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIFSQDS
::.:. .::.:.:::::..:.:.::::.
CCDS81 KDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT--------------------------------
250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 LCSQENYIIDKRLQDED-ASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELKYSEPRPWS
.:..:. : ::. : .::...:::::: :... .:...:.::::..::: ::::::
CCDS81 --GQNGYLNDIRLSKEAFSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELKSLEPRPWS
280 290 300 310 320
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 STDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSK--SIGRLSKTGQPFINPDGSPVV
:::::.:.:...: :::::::::::.:::::: :::: : ::.:. :. . :.: :
CCDS81 STDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMAL----GAPEV
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410
pF1KA0 YNPPMTQQPVRSQVPGPPQ----------PPLPAPPQQ--PAANHIFSQQ----------
: ..: ::. .: : : :: ::: : ::..::
CCDS81 CNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQQQQQQQQLPALPPTPQQQPPLNNHMISQPVPALQPSPQP
390 400 410 420 430 440
420 430 440
pF1KA0 ------------------------DNLGSQFSHMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQS
:.:.. :..:::.:: :....:: ::.::. .. :
CCDS81 VQFSPSSCPQVLLPVSPPQQYNMADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTPLISQH
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 PQQSGYIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPGQPVPTAGYPASGH-PVSQPVLQQQGYIQ
:::...::... :::.::..: .:.: : .: :: :::.:
CCDS81 PQQTSFIMAST--------------------GQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQ
510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 QPSPQMPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPS-VHYNSHLNQPLPQPAQQTGYQ-VIPNQQQN-
:. :. . : ::.: .:. ::::. : :. . .: ::::.:: : : ..:::::
CCDS81 PPQ-QIQVSYYPPGQYPNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAA
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 YQGIVGVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTSVPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPV
:::..::::::.:.:.:.: .:.:.:.::.:. :: .:.::: . . ::.. . .:::.
CCDS81 YQGMIGVQQPQNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPM
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 MFP-NQSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVGYLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQ
. : .:: ::..:..:.:::::.:::.:::. : :::.:: ::::: :.:.. :::: :
CCDS81 LVPVSQSVQGGLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQ
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 LQGHQCTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP--QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFS
. : .: : : :.:.:::.:::.:: ..: ::.. ::: ::::: ..
CCDS81 MP--QQYSGVSPS-GPGVVVMQLNVPNGPQP-PQNPSMVQWSHCKYYSMDQRGQKPGDLY
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 SVDNIVQHSPQLSS-PIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGPPLSIMPQFSRPFVPGQGDSR
: :. : . :.:: :. ::.:::::. ...:..: . :: .. :: :: :.:::.:
CCDS81 SPDSSPQANTQMSSSPVTSPTQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQFPRPGGPAQGDGR
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850
pF1KA0 YPLLGQPLQYN----PPAVLHGH--IPNQQGQPGSRHGNRGRRQAKKAASTDLGAGETVV
: ::::::::: :: .:::. .::: : .:::::.::: :.::::::....:.
CCDS81 YSLLGQPLQYNLSICPP-LLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVL
850 860 870 880 890
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 GKVLEITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHPLCCGSGDNTANPER
:.:::.:.::.:::: ::.::: .: ::::.::.: :. : :.:::... :
CCDS81 GRVLEVTDLPEGITRTEADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPG-----GGGGDNSGTAEN
900 910 920 930 940 950
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 SKPSDLASTYTVLATFPSISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHYDFHILERASSQ
.. ::::. ::..:.::: ::::: . :::..:::: .::.::..::::::::
CCDS81 GRHSDLAALYTIVAVFPSPLAAQNASLRLNNSVSRFKLRMAKKNYDLRILERASSQ
960 970 980 990 1000 1010
>>CCDS2661.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 (812 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KA0 TRVENLIKSENYGKILVEKNEHCIENNIDLQEKIQIQLTQ--SFEKEEKPSKDEAEKEKA
::.:..::.. :...:.: ::..:.::
CCDS26 KSGAGKGKLTRSLAVCEESSARPGGESLQDQESIHLQLSSFSSLQEEDKSRKDDSEREKE
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130
pF1KA0 SDK-------LPR-KMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILD
.:: :. .:::.: ::::::::::::::::.:::::: ::::.:::.::::.:
CCDS26 KDKNKDKTSEKPKIRMLSKDCSQEYTDSTGIDLHEFLINTLKNNSRDRMILLKMEQEIID
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 FIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDQKFNE
::..:.. :::: :.::.:::.:::::::::::::::.:::::.::::.::::.:.: :
CCDS26 FIADNNNHYKKFPQMSSYQRMLVHRVAAYFGLDHNVDQTGKSVIINKTSSTRIPEQRFCE
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 HIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQV-RIR-LKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIF
:.::.:::. :::.::::::::.::.::: :.. ..:::::::::::::::::.:.:::
CCDS26 HLKDEKGEESQKRFILKRDNSSIDKEDNQQNRMHPFRDDRRSKSIEEREEEYQRVRERIF
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 SQDSLCSQENYIIDKRLQDEDAS---STQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELKYS
..::.::::. .... ::.. : ..::.:: :.:.:::...:.:::.:::::.:
CCDS26 AHDSVCSQESLFVENSRLLEDSNICNETYKKRQLFRGNRDGSGRTSGSRQSSSENELKWS
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360
pF1KA0 E-PRPWSSTDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLSK---------
. : ::::::::: ::::::.::..::.::.:::::::..:..: :.:::
CCDS26 DHQRAWSSTDSDSSNRNLKPAMTKTASFGGITVLTRGDSTSSTRSTGKLSKAGSESSSSA
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
CCDS26 GSSGSLSRTHPPLQSTPLVSGVAAGSPGCVPYPENGIGGQVAPSSTSYILLPLEAATGIP
420 430 440 450 460 470
370 380 390 400
pF1KA0 ---------TGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPG-----PPQ--P-PLPA----P
:::::.::::.:..:::: .:::.:: . : ::: : : : :
CCDS26 PGSILLNPHTGQPFVNPDGTPAIYNPPTSQQPLRSAMVGQSQQQPPQQQPSPQPQQQVQP
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450
pF1KA0 PQQPAANHIFSQQDNLGSQFSHMSLARQPSADGSDPHAA-MFQSTVVLQSPQQSGYIMTA
:: :. . .:.:....::..:.:.:: :.. .: .. .. :... : :: .:....
CCDS26 PQPQMAGPLVTQRDDVATQFGQMTLSRQSSGETPEPPSGPVYPSSLMPQPAQQPSYVIAS
540 550 560 570 580 590
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 APPPHPPPPPPPPPPPPPLPPGQPVPTAGYPASGHPVSQPVLQQ----QGYIQQPSP-QM
. :: .::.:. .:: :.:: ::: ::..::: : ::
CCDS26 T--------------------GQQLPTGGFSGSGPPISQQVLQPPPSPQGFVQQPPPAQM
600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 PACYCAPGHYHSSQPQ-YRPVPSVHYNSHLNQPLPQPAQQTGYQVIPNQQQNYQGIVGVQ
:. : :.: .: : :::. :.::.. .: .:: :::.::: . . ::..::..:::
CCDS26 PVYYYPSGQYPTSTTQQYRPMAPVQYNAQRSQQMPQAAQQAGYQPVLSGQQGFQGLIGVQ
640 650 660 670 680 690
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 QP-QSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTSVPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFPNQSN
:: :::.....: :. .:.:.. : .. .::: . :::::.:.:.::::.:.:::..
CCDS26 QPPQSQNVINNQQ---GTPVQSVMVSYPTMSSYQVPMTQGSQGLPQQSYQQPIMLPNQAG
700 710 720 730 740 750
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 QGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVGYLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTA
:::.:.:::::: .: :: :::: .: .. :. . :.:.. : :
CCDS26 QGSLPATGMPVYCNVTPPTPQNNLRL-IGPHCPSSTVPVMSASCRTNCASMSNAGWQVKF
760 770 780 790 800 810
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 GPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPPQWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSP
>>CCDS8937.2 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 (976 aa)
initn: 2157 init1: 809 opt: 1014 Z-score: 421.1 bits: 89.3 E(32554): 3.9e-17
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10 20 30 40
pF1KA0 MRMSDTVTVKDETATMKDLEAEVKDTT-RVENLIKSENYGK
.: . ...: : .::. : :. .. :.:.
CCDS89 SNTTQETLEIMKESEKKLVEESVNKNKFISKTPSKEEIEKECEDTSLRQETQRRTSNHGH
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KA0 I-----------LVEKNEHCIENN-------IDLQEKIQIQLTQSFEKEE-KPSKDEAEK
::.. : :.. .. :. ::.... .::: : .:: .::
CCDS89 ARKRAKSNSKLKLVRSLAVCEESSTPFADGPLETQDIIQLHISCPSDKEEEKSTKDVSEK
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130
pF1KA0 E---KASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFI
: : ..:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::
CCDS89 EDKDKNKEKIPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNPRDRMMLLKLEQEILEFI
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 GNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDQKFNEHI
..:.. :::: :::::::::::::::::.::::::.::.::.:::::::::.:.:.:::
CCDS89 NDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVIINKTSNTRIPEQRFSEHI
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 KDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQVRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIFSQDS
::.:. .::.:.:::::..:.:.::::.
CCDS89 KDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT--------------------------------
250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 LCSQENYIIDKRLQDED-ASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELKYSEPRPWS
.:..:. : ::. : .::...:::::: :... .:...:.::::..::: ::::::
CCDS89 --GQNGYLNDIRLSKEAFSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELKSLEPRPWS
280 290 300 310 320
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 STDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSK--SIGRLSKTGQPFINPDGSPVV
:::::.:.:...: :::::::::::.:::::: :::: : ::.:. :. . :.: :
CCDS89 STDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMAL----GAPEV
330 340 350 360 370 380
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CCDS89 LKDAQGLPG-----GGGGDNSGTAENGRHSDLAALYTIVAVFPSPLAAQNASLRLNNSVS
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CCDS89 RFKLRMAKKNYDLRILERASSQ
960 970
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CCDS58 LSRTHPPLQSTPLVSGVAAGSPGCVPYPENGIGGQVAPSSTSYILLPLEAATGIPPGSIL
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CCDS58 AGPLVTQSVQGLQASSQSV-QYPAVSFPPQHLLPVSPTQHFPMRDDVATQFGQMTLSRQS
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CCDS58 SGETPEPPSGPVYPSSLMPQPAQQPSYVIASTGQQLPTGGFSGSGPPISQQVLQPPPSPQ
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CCDS58 QQPIMLPNQAGQGSLPATGMPVYCNVTPPTPQNNLRL-IGPHCPSSTVPVMSASCRTNCA
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:.. : :
CCDS58 SMSNAGWQVKF
790
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CCDS58 KDKNKDKTSEKPKIRMLSKDCSQEYTDSTGIDLHEFLINTLKNNSRDRMILLKMEQEIID
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140 150 160 170 180 190
pF1KA0 FIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDQKFNE
::..:.. :::: :.::.:::.:::::::::::::::.:::::.::::.::::.:.: :
CCDS58 FIADNNNHYKKFPQMSSYQRMLVHRVAAYFGLDHNVDQTGKSVIINKTSSTRIPEQRFCE
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200 210 220 230 240 250
pF1KA0 HIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQVRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIFSQ
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CCDS58 HLKDEKGEESQKRFILKRDNSSIDKEDNQ-------------------------------
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260 270 280 290 300 310
pF1KA0 DSLCSQENYIIDKRLQDEDAS---STQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELKYSE-
:.::::. .... ::.. : ..::.:: :.:.:::...:.:::.:::::.:.
CCDS58 -SVCSQESLFVENSRLLEDSNICNETYKKRQLFRGNRDGSGRTSGSRQSSSENELKWSDH
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CCDS58 QRAWSSTDSDSSNRNLKPAMTKTASFGGITVLTRGDSTSSTRSTGKLSKAGSESSSSAGS
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CCDS58 SGSLSRTHPPLQSTPLVSGVAAGSPGCVPYPENGIGGQVAPSSTSYILLPLEAATGIPPG
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: . :. : : : .:. . :... : . : :. : :..
CCDS58 PQMAGPLVTQSVQGLQASSQSV-QYPAVSFPPQHLLPVSPTQHFPMRDDVATQFGQMTLS
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CCDS58 RQSSGETPEPPSGPVYPSSLMPQPAQQPSYVIASTGQQLPTGGFSGSGPPISQQVLQPPP
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CCDS58 SPQGFVQQPPPAQMPVYYYPSGQYPTSTTQQYRPMAPVQYNAQRSQQMPQAAQQAGYQPV
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pF1KA0 PNQQQNYQGIVGVQQP-QSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTSVPTYQVSLPQGSQGIPH
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CCDS58 LSGQQGFQGLIGVQQPPQSQNVINNQQ---GTPVQSVMVSYPTMSSYQVPMTQGSQGLPQ
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pF1KA0 QTYQQPVMFPNQSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVGYLQHPGSEQVQFPRTTS
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CCDS58 QSYQQPIMLPNQAGQGSLPATGMPVYCNVTPPTPQNNLRL-IGPHCPSSTVPVMSASCRT
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pF1KA0 PCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPPQWKQNKYYCDHQRGQKC
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CCDS58 NCASMSNAGWQVKF
800 810
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CCDS81 KRRTSNHGHARKRAKSNSKLKLVRSLAVCEESSTPFADGPLETQDIIQLHISCPSDKEEE
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pF1KA0 KPSKDEAEKE---KASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLK
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CCDS81 KSTKDVSEKEDKDKNKEKIPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNPRDRMMLLK
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130 140 150 160 170 180
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::::::.::..:.. :::: :::::::::::::::::.::::::.::.::.::::::::
CCDS81 LEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVIINKTSNTRI
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190 200 210 220 230 240
pF1KA0 PDQKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQVRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRA
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CCDS81 PEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT-----------------------
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250 260 270 280 290 300
pF1KA0 RDRIFSQDSLCSQENYIIDKRLQDEDASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSHQSSTENELK
.:..:. : .: :... .:...:.::::..:::
CCDS81 -----------GQNGYLND-----------------IRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELK
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CCDS81 SLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMAL-
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CCDS81 ---GAPEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQQQQQQQQLPALPPTPQQQPPLNNHMISQADD
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CCDS81 LSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTPLISQHPQQTSFIMAST---------------
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CCDS81 -----GQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQ-QIQVSYYPPGQYPNSNQQYRPL
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CCDS81 SHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLLSSQRSSMGGQ
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CCDS81 MQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQGGLPAAGVPVYYSMIPP
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CCDS81 TVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTEADKLFTQLA
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CCDS81 MSGAKIQWLKDAQGLPGG-----GGGDNSGTAENGRHSDLAALYTIVAVFPSPLAAQNAS
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CCDS81 LRLNNSVSRFKLRMAKKNYDLRILERASSQ
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971 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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