Result of FASTA (omim) for
pF1KA0003
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0003, 498 aa
1>>>pF1KA0003 498 - 498 aa - 498 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2905+/-0.000619; mu= -1.5082+/- 0.038
mean_var=238.9019+/-47.835, 0's: 0 Z-trim(112.5): 85 B-trim: 246 in 1/53
Lambda= 0.082978
statistics sampled from 21354 (21435) to 21354 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 9.550
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001137 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform 1 ( 498) 3367 417.1 5.9e-116
NP_001186788 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform ( 497) 3347 414.7 3.1e-115
NP_001300980 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform ( 298) 2077 262.5 1.2e-69
NP_001112359 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform ( 495) 2021 256.0 1.9e-67
NP_001138 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform a ( 496) 2017 255.5 2.6e-67
NP_057069 (OMIM: 603705) angiopoietin-4 isoform 1 ( 503) 1571 202.1 3.1e-51
XP_016868807 (OMIM: 601922) PREDICTED: angiopoieti ( 443) 1508 194.5 5.3e-49
NP_001112360 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform ( 444) 1504 194.0 7.4e-49
XP_011527541 (OMIM: 603705) PREDICTED: angiopoieti ( 451) 1231 161.4 5.1e-39
NP_001309738 (OMIM: 603705) angiopoietin-4 isoform ( 410) 1089 144.3 6.3e-34
NP_036230 (OMIM: 605001) angiopoietin-related prot ( 493) 706 98.5 4.6e-20
NP_004664 (OMIM: 603874) angiopoietin-related prot ( 491) 685 96.0 2.6e-19
XP_005245634 (OMIM: 603874) PREDICTED: angiopoieti ( 491) 685 96.0 2.6e-19
NP_114123 (OMIM: 609336) angiopoietin-related prot ( 470) 646 91.3 6.4e-18
XP_016882836 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 646 91.3 6.4e-18
XP_011526649 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 646 91.3 6.4e-18
XP_011526652 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 646 91.3 6.4e-18
NP_001308340 (OMIM: 609336) angiopoietin-related p ( 470) 646 91.3 6.4e-18
XP_011526650 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 537) 646 91.4 7.1e-18
XP_011526651 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 537) 646 91.4 7.1e-18
XP_005260148 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 551) 646 91.4 7.2e-18
NP_001994 (OMIM: 601252) ficolin-1 precursor [Homo ( 326) 641 90.6 7.3e-18
XP_006717078 (OMIM: 601624) PREDICTED: ficolin-2 i ( 264) 620 88.0 3.5e-17
NP_056652 (OMIM: 601624) ficolin-2 isoform b precu ( 275) 620 88.0 3.7e-17
XP_011516694 (OMIM: 601624) PREDICTED: ficolin-2 i ( 302) 620 88.1 3.9e-17
NP_004099 (OMIM: 601624) ficolin-2 isoform a precu ( 313) 620 88.1 4e-17
NP_116232 (OMIM: 613357) fibrinogen C domain-conta ( 461) 622 88.5 4.6e-17
NP_001138578 (OMIM: 613357) fibrinogen C domain-co ( 461) 622 88.5 4.6e-17
NP_115859 (OMIM: 600985,606408,615963) tenascin-X ( 673) 617 88.0 9.4e-17
NP_002395 (OMIM: 600596) microfibril-associated gl ( 255) 601 85.7 1.7e-16
NP_001185624 (OMIM: 600596) microfibril-associated ( 279) 601 85.8 1.8e-16
NP_061978 (OMIM: 600985,606408,615963) tenascin-X (4242) 617 88.6 3.9e-16
NP_006673 (OMIM: 605351) fibroleukin precursor [Ho ( 439) 590 84.6 6.3e-16
NP_775628 (OMIM: 604973,613860) ficolin-3 isoform ( 288) 582 83.5 8.9e-16
NP_003656 (OMIM: 604973,613860) ficolin-3 isoform ( 299) 579 83.2 1.2e-15
NP_055310 (OMIM: 604774,605019) angiopoietin-relat ( 460) 580 83.4 1.5e-15
NP_647475 (OMIM: 605910,615881) angiopoietin-relat ( 406) 577 83.0 1.8e-15
NP_001315564 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 2 [ (1025) 573 82.9 5e-15
XP_011508251 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1199) 573 82.9 5.6e-15
XP_016857707 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1358) 573 82.9 6.2e-15
NP_003276 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 1 prec (1358) 573 82.9 6.2e-15
XP_016857708 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1358) 573 82.9 6.2e-15
XP_005252032 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1564) 570 82.6 8.9e-15
XP_005252031 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 570 82.7 9.3e-15
XP_006717164 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 570 82.7 9.3e-15
XP_011516931 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1746) 570 82.7 9.6e-15
XP_011516930 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1746) 570 82.7 9.6e-15
XP_005252030 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1837) 570 82.7 1e-14
XP_011516928 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1929) 570 82.7 1e-14
XP_011516927 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2019) 570 82.7 1.1e-14
>>NP_001137 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform 1 prec (498 aa)
initn: 3367 init1: 3367 opt: 3367 Z-score: 2202.8 bits: 417.1 E(85289): 5.9e-116
Smith-Waterman score: 3367; 100.0% identity (100.0% similar) in 498 aa overlap (1-498:1-498)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRSPENSGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCRESTTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRSPENSGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCRESTTD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QYNTNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQIQQNAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYNTNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQIQQNAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEKQLLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEKQLLQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQELEKQLNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQELEKQLNRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKEGVLLKGGKREEEKPFRDCADVYQAGFNKSGIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKEGVLLKGGKREEEKPFRDCADVYQAGFNKSGIY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGNPSGEYWLGNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGNPSGEYWLGNE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTGTAGKQSSLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTGTAGKQSSLIL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGKLNGIKWHYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGKLNGIKWHYFK
430 440 450 460 470 480
490
pF1KA0 GPSYSLRSTTMMIRPLDF
::::::::::::::::::
NP_001 GPSYSLRSTTMMIRPLDF
490
>>NP_001186788 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform 2 p (497 aa)
initn: 1733 init1: 1733 opt: 3347 Z-score: 2189.9 bits: 414.7 E(85289): 3.1e-115
Smith-Waterman score: 3347; 99.8% identity (99.8% similar) in 498 aa overlap (1-498:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRSPENSGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCRESTTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRSPENSGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCRESTTD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QYNTNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQIQQNAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYNTNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQIQQNAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEKQLLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEKQLLQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQELEKQLNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQELEKQLNRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKEGVLLKGGKREEEKPFRDCADVYQAGFNKSGIY
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKE-VLLKGGKREEEKPFRDCADVYQAGFNKSGIY
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGNPSGEYWLGNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGNPSGEYWLGNE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTGTAGKQSSLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTGTAGKQSSLIL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGKLNGIKWHYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGKLNGIKWHYFK
420 430 440 450 460 470
490
pF1KA0 GPSYSLRSTTMMIRPLDF
::::::::::::::::::
NP_001 GPSYSLRSTTMMIRPLDF
480 490
>>NP_001300980 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform 3 [ (298 aa)
initn: 2077 init1: 2077 opt: 2077 Z-score: 1371.3 bits: 262.5 E(85289): 1.2e-69
Smith-Waterman score: 2077; 100.0% identity (100.0% similar) in 298 aa overlap (201-498:1-298)
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 YKLEKQLLQQTNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYII
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYII
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 QELEKQLNRATTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKEGVLLKGGKREEEKPFRDCADVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QELEKQLNRATTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKEGVLLKGGKREEEKPFRDCADVY
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 QAGFNKSGIYTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAGFNKSGIYTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGN
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 PSGEYWLGNEFIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSGEYWLGNEFIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTG
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 TAGKQSSLILHGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAGKQSSLILHGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGK
220 230 240 250 260 270
480 490
pF1KA0 LNGIKWHYFKGPSYSLRSTTMMIRPLDF
::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNGIKWHYFKGPSYSLRSTTMMIRPLDF
280 290
>>NP_001112359 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform b p (495 aa)
initn: 1963 init1: 1836 opt: 2021 Z-score: 1332.0 bits: 256.0 E(85289): 1.9e-67
Smith-Waterman score: 2021; 62.0% identity (86.0% similar) in 479 aa overlap (20-498:20-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRSPENSGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCRESTTD
.: :.: .. :.. ..:::.:.:::.::: : ::: :...
NP_001 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMD-NCR-SSSS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QYNTNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQIQQNAV
: .::.::::: .: : : :.:: ::..::: ::::.:::::: .:::.::..::::::
NP_001 PYVSNAVQRDAP-LEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMKLENYIQDNMKKEMVEIQQNAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEKQLLQQ
::.::.:.::::.::.:::::::::::::.::::::.:::.::::.:::: :::::.:.:
NP_001 QNQTAVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQELEKQLNRA
:.:: :...:::.::.:.: :: :: .:...::::..:: ::..:. ::.::::.. :
NP_001 TSEINKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKEGVLLKGGKREEEKPFRDCADVYQAGFNKSGIY
:.::::::::: .::.::.::... . . .::. :::::.:...: . .:::
NP_001 TVNNSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNSKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGIY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGNPSGEYWLGNE
:. . : : :..:.:...:::::.::.:::::.:::: :::::.::::::::::::::
NP_001 TLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTGTAGKQSSLIL
:. .:.:..:.:.:.: :::::.::: :..:....:. :::..::: :::::: ::.
NP_001 FVSQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQ
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HGADFSTKDADNDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGKLNGIKWHYFK
: ::::::.:::.:.:::. :::::::::::::::::::.: :: .:.:::::.:.:
NP_001 PGNDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYWK
420 430 440 450 460 470
490
pF1KA0 GPSYSLRSTTMMIRPLDF
: .:::..::::::: ::
NP_001 GSGYSLKATTMMIRPADF
480 490
>>NP_001138 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform a prec (496 aa)
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Smith-Waterman score: 2017; 62.1% identity (86.5% similar) in 480 aa overlap (20-498:20-496)
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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