Result of SIM4 for
pF1KSDB0234
seq1 = pF1KSDB0234.tfa, 3609 bp
seq2 = pF1KSDB0234/gi568815585r_66204658.tfa (gi568815585r:66204658_67328440), 1123783 bp
>pF1KSDB0234 3609
>gi568815585r:66204658_67328440 (Chr13)
(complement)
1-3036 (100001-103036) 99% ->
3037-3238 (697030-697231) 100% ->
3239-3609 (1023413-1023783) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGACCTGAGGGATTTTTACCTGTTGGCTGCTCTGATTGCCTGTTTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGACCTGAGGGATTTTTACCTGTTGGCTGCTCTGATTGCCTGTTTAAG
50 . : . : . : . : . :
51 GCTGGATTCCGCAATAGCTCAAGAACTTATTTACACTATTAGAGAGGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GCTGGATTCCGCAATAGCTCAAGAACTTATTTACACTATTAGAGAGGAAT
100 . : . : . : . : . :
101 TGCCTGAAAATGTGCCCATAGGAAACATACCAAAGGATCTGAACATTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TGCCTGAAAATGTGCCCATAGGAAACATACCAAAGGATCTGAACATTTCT
150 . : . : . : . : . :
151 CACATCAATGCTGCCACAGGGACCAGCGCCAGCCTTGTCTACAGACTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CACATCAATGCTGCCACAGGGACCAGCGCCAGCCTTGTCTACAGACTGGT
200 . : . : . : . : . :
201 TTCTAAAGCTGGGGATGCCCCTTTGGTGAAAGTATCCAGCAGCACTGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
100201 TTCTAAAGCTGGGGATGCCCCTTTGGTGAAAGTTTCCAGCAGCACTGGGG
250 . : . : . : . : . :
251 AAATTTTCACAACCTCCAACAGAATAGACAGAGAAAAACTCTGTGCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 AAATTTTCACAACCTCCAACAGAATAGACAGAGAAAAACTCTGTGCTGGC
300 . : . : . : . : . :
301 GCCTCATATGCTGAGGAGAATGAGTGTTTCTTTGAACTTGAGGTGGTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 GCCTCATATGCTGAGGAGAATGAGTGTTTCTTTGAACTTGAGGTGGTGAT
350 . : . : . : . : . :
351 CCTCCCCAATGATTTCTTCAGGCTGATCAAAATAAAAATAATTGTCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 CCTCCCCAATGATTTCTTCAGGCTGATCAAAATAAAAATAATTGTCAAGG
400 . : . : . : . : . :
401 ATACCAATGATAATGCCCCCATGTTTCCATCTCCTGTCATCAATATTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 ATACCAATGATAATGCCCCCATGTTTCCATCTCCTGTCATCAATATTTCC
450 . : . : . : . : . :
451 ATTCCAGAAAACACTTTGATCAACAGCCGCTTTCCAATTCCATCAGCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 ATTCCAGAAAACACTTTGATCAACAGCCGCTTTCCAATTCCATCAGCAAC
500 . : . : . : . : . :
501 AGATCCTGACACAGGCTTCAATGGTGTACAGCATTATGAATTGTTAAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 AGATCCTGACACAGGCTTCAATGGTGTACAGCATTATGAATTGTTAAATG
550 . : . : . : . : . :
551 GGCAGAGTGTTTTTGGACTGGATATCGTGGAAACTCCAGAGGGAGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 GGCAGAGTGTTTTTGGACTGGATATCGTGGAAACTCCAGAGGGAGAGAAG
600 . : . : . : . : . :
601 TGGCCACAACTGATTGTTCAGCAAAACTTGGATAGAGAACAGAAAGATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 TGGCCACAACTGATTGTTCAGCAAAACTTGGATAGAGAACAGAAAGATAC
650 . : . : . : . : . :
651 CTATGTGATGAAAATCAAAGTAGAGGATGGAGGCACTCCACAGAAATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 CTATGTGATGAAAATCAAAGTAGAGGATGGAGGCACTCCACAGAAATCCA
700 . : . : . : . : . :
701 GTACGGCCATACTGCAGGTCACAGTAAGTGATGTAAATGACAACAGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 GTACGGCCATACTGCAGGTCACAGTAAGTGATGTAAATGACAACAGGCCA
750 . : . : . : . : . :
751 GTGTTTAAAGAGGGTCAAGTGGAGGTGCATATTCCAGAGAATGCTCCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 GTGTTTAAAGAGGGTCAAGTGGAGGTGCATATTCCAGAGAATGCTCCCGT
800 . : . : . : . : . :
801 AGGTACCTCTGTAATTCAGCTCCATGCCACTGATGCAGATATAGGCAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 AGGTACCTCTGTAATTCAGCTCCATGCCACTGATGCAGATATAGGCAGTA
850 . : . : . : . : . :
851 ATGCTGAAATCCGGTACATTTTTGGTGCCCAGGTCGCCCCTGCAACCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 ATGCTGAAATCCGGTACATTTTTGGTGCCCAGGTCGCCCCTGCAACCAAA
900 . : . : . : . : . :
901 AGACTCTTTGCTTTAAATAATACTACTGGGCTGATTACAGTTCAGAGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 AGACTCTTTGCTTTAAATAATACTACTGGGCTGATTACAGTTCAGAGGTC
950 . : . : . : . : . :
951 CTTAGATAGAGAGGAGACAGCCATTCACAAAGTGACAGTGCTGGCTAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100951 CTTAGATAGAGAGGAGACAGCCATTCACAAAGTGACAGTGCTGGCTAGTG
1000 . : . : . : . : . :
1001 ACGGCAGCTCCACTCCTGCTCGAGCAACGGTTACCATCAATGTCACCGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 ACGGCAGCTCCACTCCTGCTCGAGCAACGGTTACCATCAATGTCACCGAT
1050 . : . : . : . : . :
1051 GTAAATGATAACCCTCCTAATATAGACCTCAGGTACATTATAAGTCCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 GTAAATGATAACCCTCCTAATATAGACCTCAGGTACATTATAAGTCCCAT
1100 . : . : . : . : . :
1101 CAATGGCACCGTGTATTTATCTGAGAAAGATCCTGTCAATACAAAGATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 CAATGGCACCGTGTATTTATCTGAGAAAGATCCTGTCAATACAAAGATTG
1150 . : . : . : . : . :
1151 CCCTAATTACAGTTTCAGATAAGGACACAGATGTGAATGGCAAAGTGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101151 CCCTAATTACAGTTTCAGATAAGGACACAGATGTGAATGGCAAAGTGATC
1200 . : . : . : . : . :
1201 TGTTTTATTGAAAGAGAGGTCCCATTTCATTTGAAGGCGGTATATGACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101201 TGTTTTATTGAAAGAGAGGTCCCATTTCATTTGAAGGCGGTATATGACAA
1250 . : . : . : . : . :
1251 CCAATATTTGTTAGAGACCTCTTCTTTGTTGGACTATGAGGGCACCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101251 CCAATATTTGTTAGAGACCTCTTCTTTGTTGGACTATGAGGGCACCAAAG
1300 . : . : . : . : . :
1301 AATTCAGCTTTAAAATTGTTGCCTCTGATTCTGGGAAGCCCAGTTTAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101301 AATTCAGCTTTAAAATTGTTGCCTCTGATTCTGGGAAGCCCAGTTTAAAT
1350 . : . : . : . : . :
1351 CAGACTGCCCTGGTAAGGGTTAAGCTTGAGGATGAAAATGACAACCCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101351 CAGACTGCCCTGGTAAGGGTTAAGCTTGAGGATGAAAATGACAACCCACC
1400 . : . : . : . : . :
1401 AATTTTCAACCAGCCTGTAATTGAGCTGTCAGTTTCTGAAAACAACCGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101401 AATTTTCAACCAGCCTGTAATTGAGCTGTCAGTTTCTGAAAACAACCGAC
1450 . : . : . : . : . :
1451 GTGGGTTATACTTAACAACTATTAGTGCCACAGATGAAGACAGTGGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101451 GTGGGTTATACTTAACAACTATTAGTGCCACAGATGAAGACAGTGGGAAA
1500 . : . : . : . : . :
1501 AATGCAGACATTGTTTATCAGCTTGGACCGAATGCCTCCTTCTTTGATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101501 AATGCAGACATTGTTTATCAGCTTGGACCGAATGCCTCCTTCTTTGATCT
1550 . : . : . : . : . :
1551 GGACCGAAAAACAGGAGTTTTGACAGCCTCCAGAGTATTTGACAGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101551 GGACCGAAAAACAGGAGTTTTGACAGCCTCCAGAGTATTTGACAGAGAAG
1600 . : . : . : . : . :
1601 AACAAGAACGATTCATTTTTACAGTAACTGCCAGGGACAATGGGACCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101601 AACAAGAACGATTCATTTTTACAGTAACTGCCAGGGACAATGGGACCCCT
1650 . : . : . : . : . :
1651 CCCCTCCAAAGCCAAGCGGCTGTGATTGTTACTGTTCTGGATGAGAATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101651 CCCCTCCAAAGCCAAGCGGCTGTGATTGTTACTGTTCTGGATGAGAATGA
1700 . : . : . : . : . :
1701 CAATAGCCCCAAGTTTACTCATAATCATTTTCAATTTTTTGTGTCTGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101701 CAATAGCCCCAAGTTTACTCATAATCATTTTCAATTTTTTGTGTCTGAGA
1750 . : . : . : . : . :
1751 ATCTGCCAAAGTATAGTACTGTGGGGGTAATCACAGTGACAGATGCAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101751 ATCTGCCAAAGTATAGTACTGTGGGGGTAATCACAGTGACAGATGCAGAT
1800 . : . : . : . : . :
1801 GCTGGAGAGAATAAAGCTGTGACTCTTTCCATTCTAAATGACAATGATAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101801 GCTGGAGAGAATAAAGCTGTGACTCTTTCCATTCTAAATGACAATGATAA
1850 . : . : . : . : . :
1851 TTTTGTGTTGGATCCCTATTCTGGAGTCATAAAGTCAAATGTCTCATTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101851 TTTTGTGTTGGATCCCTATTCTGGAGTCATAAAGTCAAATGTCTCATTTG
1900 . : . : . : . : . :
1901 ATAGAGAGCAGCAGAGTTCCTACACTTTTGATGTCAAAGCCACTGATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101901 ATAGAGAGCAGCAGAGTTCCTACACTTTTGATGTCAAAGCCACTGATGGA
1950 . : . : . : . : . :
1951 GGACAACCACCTCGTTCCTCTACTGCAAAAGTAACTATCAACGTCATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101951 GGACAACCACCTCGTTCCTCTACTGCAAAAGTAACTATCAACGTCATGGA
2000 . : . : . : . : . :
2001 TGTCAATGACAACAGCCCAGTTGTCATTTCTCCACCGTCTAATACTTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102001 TGTCAATGACAACAGCCCAGTTGTCATTTCTCCACCGTCTAATACTTCCT
2050 . : . : . : . : . :
2051 TTAAGTTGGTGCCCCTCTCAGCCATTCCTGGCTCCGTGGTAGCAGAAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102051 TTAAGTTGGTGCCCCTCTCAGCCATTCCTGGCTCCGTGGTAGCAGAAGTT
2100 . : . : . : . : . :
2101 TTTGCAGTGGATGTTGACACTGGAATGAACGCTGAACTAAAGTATACTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102101 TTTGCAGTGGATGTTGACACTGGAATGAACGCTGAACTAAAGTATACTAT
2150 . : . : . : . : . :
2151 AGTGAGTGGAAACAATAAAGGCTTATTCCGGATTGATCCAGTAACAGGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102151 AGTGAGTGGAAACAATAAAGGCTTATTCCGGATTGATCCAGTAACAGGTA
2200 . : . : . : . : . :
2201 ACATTACTCTGGAAGAAAAACCAGCACCTACTGATGTGGGATTGCATCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102201 ACATTACTCTGGAAGAAAAACCAGCACCTACTGATGTGGGATTGCATCGT
2250 . : . : . : . : . :
2251 TTGGTGGTCAACATAAGTGACCTGGGGTACCCTAAGTCTTTGCACACGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102251 TTGGTGGTCAACATAAGTGACCTGGGGTACCCTAAGTCTTTGCACACGCT
2300 . : . : . : . : . :
2301 TGTGCTTGTATTCCTTTATGTTAACGACACTGCTGGAAATGCCTCCTATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102301 TGTGCTTGTATTCCTTTATGTTAACGACACTGCTGGAAATGCCTCCTATA
2350 . : . : . : . : . :
2351 TCTATGACTTGATCCGCAGGACTATGGAGACCCCGTTGGACAGGAACATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102351 TCTATGACTTGATCCGCAGGACTATGGAGACCCCGTTGGACAGGAACATA
2400 . : . : . : . : . :
2401 GGGGATAGTAGCCAACCCTATCAAAATGAGGACTATCTAACCATCATGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102401 GGGGATAGTAGCCAACCCTATCAAAATGAGGACTATCTAACCATCATGAT
2450 . : . : . : . : . :
2451 TGCCATCATCGCCGGTGCCATGGTGGTCATTGTTGTGATCTTCGTCACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102451 TGCCATCATCGCCGGTGCCATGGTGGTCATTGTTGTGATCTTCGTCACCG
2500 . : . : . : . : . :
2501 TTCTGGTGCGCTGTCGCCATGCATCAAGGTTCAAAGCAGCTCAGAGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102501 TTCTGGTGCGCTGTCGCCATGCATCAAGGTTCAAAGCAGCTCAGAGGAGC
2550 . : . : . : . : . :
2551 AAGCAAGGTGCCGAATGGATGTCCCCAAACCAGGAGAACAAGCAAAACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102551 AAGCAAGGTGCCGAATGGATGTCCCCAAACCAGGAGAACAAGCAAAACAA
2600 . : . : . : . : . :
2601 GAAAAAGAAAAGAAAGAAAAGGAAGTCTCCCAAAAGCTCTCTTTTGAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102601 GAAAAAGAAAAGAAAGAAAAGGAAGTCTCCCAAAAGCTCTCTTTTGAACT
2650 . : . : . : . : . :
2651 TTGTTACTATCGAAGAGTCCAAACCCGATGATGCAGTTCATGAACCTATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102651 TTGTTACTATCGAAGAGTCCAAACCCGATGATGCAGTTCATGAACCTATC
2700 . : . : . : . : . :
2701 AATGGGACAATAAGCCTGCCGGCTGAACTGGAGGAGCAAAGTATAGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102701 AATGGGACAATAAGCCTGCCGGCTGAACTGGAGGAGCAAAGTATAGGAAG
2750 . : . : . : . : . :
2751 ATTTGACTGGGGCCCGGCACCTCCAACAACATTCAAGCCTAACAGTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102751 ATTTGACTGGGGCCCGGCACCTCCAACAACATTCAAGCCTAACAGTCCTG
2800 . : . : . : . : . :
2801 ACCTGGCCAAGCACTACAAATCTGCTTCTCCACAGCCTGCTTTTCATCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102801 ACCTGGCCAAGCACTACAAATCTGCTTCTCCACAGCCTGCTTTTCATCTC
2850 . : . : . : . : . :
2851 AAACCAGACACTCCAGTTTCCGTGAAAAAGCACCACGTGATTCAGGAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102851 AAACCAGACACTCCAGTTTCCGTGAAAAAGCACCACGTGATTCAGGAACT
2900 . : . : . : . : . :
2901 CCCTTTGGACAACACCTTTGTTGGGGGTTGTGACACCCTTTCTAAACGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102901 CCCTTTGGACAACACCTTTGTTGGGGGTTGTGACACCCTTTCTAAACGCT
2950 . : . : . : . : . :
2951 CTTCCACTAGTTCAGATCACTTCAGTGCCTCAGAGTGCAGTTCCCAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102951 CTTCCACTAGTTCAGATCACTTCAGTGCCTCAGAGTGCAGTTCCCAAGGA
3000 . : . : . : . : . :
3001 GGCTTCAAGACAAAGGGCCCCTTACACACCAGACAG TCGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
103001 GGCTTCAAGACAAAGGGCCCCTTACACACCAGACAGGTA...TAGTCGCA
3050 . : . : . : . : . :
3042 GCGCCGTGTTACGTTTCATCTCCCTGATGGCTCCCAGGAAAGCTGCAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
697035 GCGCCGTGTTACGTTTCATCTCCCTGATGGCTCCCAGGAAAGCTGCAGTG
3100 . : . : . : . : . :
3092 ACAGTGGTCTAGGAGACCATGAGCCGGTGGGTAGTGGAACCCTGATCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
697085 ACAGTGGTCTAGGAGACCATGAGCCGGTGGGTAGTGGAACCCTGATCTCA
3150 . : . : . : . : . :
3142 CACCCTCTTCCTCTGGTTCAGCCACAGGACGAATTCTATGACCAGGCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
697135 CACCCTCTTCCTCTGGTTCAGCCACAGGACGAATTCTATGACCAGGCCTC
3200 . : . : . : . : . :
3192 TCCGGACAAGAGGACTGAAGCAGATGGCAACTCTGATCCCAACTCTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
697185 TCCGGACAAGAGGACTGAAGCAGATGGCAACTCTGATCCCAACTCTGGTG
3250 . : . : . : . : . :
3239 ATGGGCCTTTGGGTCCCCGAGGATTAGCTGAAGCTACAGAGATG
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
697235 ...CAGATGGGCCTTTGGGTCCCCGAGGATTAGCTGAAGCTACAGAGATG
3300 . : . : . : . : . :
3283 TGCACTCAAGAGTGCTTGGTTTTGGGTCACTCTGATAATTGCTGGATGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1023457 TGCACTCAAGAGTGCTTGGTTTTGGGTCACTCTGATAATTGCTGGATGCC
3350 . : . : . : . : . :
3333 TCCTGGCTTGGGTCCATATCAACACCCCAAATCTCCTCTCTCAACCTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1023507 TCCTGGCTTGGGTCCATATCAACACCCCAAATCTCCTCTCTCAACCTTTG
3400 . : . : . : . : . :
3383 CACCCCAGAAAGAATGGGTGAAGAAGGACAAGCTTGTGAATGGGCACACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1023557 CACCCCAGAAAGAATGGGTGAAGAAGGACAAGCTTGTGAATGGGCACACC
3450 . : . : . : . : . :
3433 CTGACCAGAGCCTGGAAAGAAGACAGCAACAGGAACCAGTTCAATGACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1023607 CTGACCAGAGCCTGGAAAGAAGACAGCAACAGGAACCAGTTCAATGACCG
3500 . : . : . : . : . :
3483 TAAGCAGTATGGCTCCAATGAAGGCCATTTCAACAATGGCAGCCACATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1023657 TAAGCAGTATGGCTCCAATGAAGGCCATTTCAACAATGGCAGCCACATGA
3550 . : . : . : . : . :
3533 CAGACATTCCTCTGGCAAATCTGAAGTCTTATAAGCAAGCAGGAGGTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1023707 CAGACATTCCTCTGGCAAATCTGAAGTCTTATAAGCAAGCAGGAGGTGCT
3600 . : . : .
3583 ACTGAGAGTCCTAAGGAGCACCAACTC
|||||||||||||||||||||||||||
1023757 ACTGAGAGTCCTAAGGAGCACCAACTC