seq1 = pF1KSDB0068.tfa, 3096 bp
seq2 = pF1KSDB0068/gi568815586f_57450272.tfa (gi568815586f:57450272_57683176), 232905 bp

>pF1KSDB0068 3096
>gi568815586f:57450272_57683176 (Chr12)

1-129  (100001-100129)   100% ->
130-217  (113168-113255)   100% ->
218-291  (113349-113422)   100% ->
292-396  (113837-113941)   100% ->
397-445  (114189-114237)   100% ->
446-501  (114647-114702)   100% ->
502-589  (116855-116942)   100% ->
590-714  (117223-117347)   100% ->
715-819  (118692-118796)   100% ->
820-968  (118985-119133)   100% ->
969-1117  (119264-119412)   100% ->
1118-1293  (119716-119891)   100% ->
1294-1362  (121050-121118)   100% ->
1363-1569  (121790-121996)   99% ->
1570-1716  (122309-122455)   100% ->
1717-1905  (124813-125001)   100% ->
1906-2023  (125369-125486)   100% ->
2024-2088  (125816-125880)   100% ->
2089-2198  (125998-126107)   100% ->
2199-2300  (126490-126591)   100% ->
2301-2361  (127442-127502)   100% ->
2362-2433  (127738-127809)   100% ->
2434-2538  (127967-128071)   100% ->
2539-2755  (130685-130901)   100% ->
2756-2909  (131144-131297)   100% ->
2910-2992  (131599-131681)   100% ->
2993-3020  (132331-132358)   100% ->
3021-3096  (132830-132905)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGACCAACAACGAATGTAGCATCAAGGTGCTCTGCCGATTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGACCAACAACGAATGTAGCATCAAGGTGCTCTGCCGATTCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCCTGAACCAGGCTGAGATTCTGCGGGGAGACAAGTTCATCCCCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCCTGAACCAGGCTGAGATTCTGCGGGGAGACAAGTTCATCCCCATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCAAGGGGACGACAGCGTCGTTATTGGG         GGGAAGCCATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 TCCAAGGGGACGACAGCGTCGTTATTGGGGTG...CAGGGGAAGCCATAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTTTTGACCGTGTATTCCCCCCAAACACGACTCAAGAGCAAGTTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113180 GTTTTTGACCGTGTATTCCCCCCAAACACGACTCAAGAGCAAGTTTATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCATGTGCCATGCAGATTGTCAAAG         ATGTCCTTGCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 113230 TGCATGTGCCATGCAGATTGTCAAAGGTA...CAGATGTCCTTGCTGGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACAATGGCACCATTTTTGCTTATGGACAGACATCCTCAGGGAAAACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113364 ACAATGGCACCATTTTTGCTTATGGACAGACATCCTCAGGGAAAACACAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCATGGAG         GGAAAGCTGCACGACCCTCAGCTGATGGGAAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 113414 ACCATGGAGGTG...CAGGGAAAGCTGCACGACCCTCAGCTGATGGGAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATTCCTCGAATTGCCCGAGACATCTTCAACCACATCTACTCCATGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113869 CATTCCTCGAATTGCCCGAGACATCTTCAACCACATCTACTCCATGGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAACCTTGAGTTCCACATCAAG         GTTTCTTACTTTGAAATT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 113919 AGAACCTTGAGTTCCACATCAAGGTG...CAGGTTTCTTACTTTGAAATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACCTGGACAAAATTCGTGACCTTCTGGATG         TGACCAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 114207 TACCTGGACAAAATTCGTGACCTTCTGGATGGTG...CAGTGACCAAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AAATCTGTCCGTGCACGAGGACAAGAACCGGGTGCCATTTGTCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 114657 AAATCTGTCCGTGCACGAGGACAAGAACCGGGTGCCATTTGTCAAGGTG.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    502      GGTTGTACTGAACGCTTTGTGTCCAGCCCGGAGGAGATTCTGGAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114707 ..CAGGGTTGTACTGAACGCTTTGTGTCCAGCCCGGAGGAGATTCTGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GTGATTGATGAAGGGAAATCAAATCGTCATGTGGCTGTCACCA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 116900 GTGATTGATGAAGGGAAATCAAATCGTCATGTGGCTGTCACCAGTG...C

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    590   ACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117221 AGACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117271 TCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAG         GTCAGCAAGACTGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 117321 CTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAGGTA...TAGGTCAGCAAGACTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 AGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118706 AGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 118756 CAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACTGTG...CAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 AAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGACAAGGATTCTCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118985 AAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGACAAGGATTCTCCAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119035 CTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 119085 CCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    969         GGCAAAGACCATTAAGAACACTGCCTCAGTAAATTTGGAGTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119135 TC...CAGGGCAAAGACCATTAAGAACACTGCCTCAGTAAATTTGGAGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GACTGCTGAGCAGTGGAAGAAGAAATATGAGAAGGAGAAGGAGAAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119306 GACTGCTGAGCAGTGGAAGAAGAAATATGAGAAGGAGAAGGAGAAGACAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AGGCCCAGAAGGAGACGATTGCGAAGCTGGAGGCTGAGCTGAGCCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119356 AGGCCCAGAAGGAGACGATTGCGAAGCTGGAGGCTGAGCTGAGCCGGTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CGCAATG         GAGAGAATGTGCCTGAGACAGAGCGCCTGGCTGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119406 CGCAATGGTT...CAGGAGAGAATGTGCCTGAGACAGAGCGCCTGGCTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GGAGGAGGCAGCCCTGGGAGCCGAGCTCTGTGAGGAGACCCCTGTGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119750 GGAGGAGGCAGCCCTGGGAGCCGAGCTCTGTGAGGAGACCCCTGTGAATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ACAACTCATCCATCGTGGTGCGCATCGCGCCCGAGGAGCGGCAGAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119800 ACAACTCATCCATCGTGGTGCGCATCGCGCCCGAGGAGCGGCAGAAATAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GAGGAGGAGATCCGCCGTCTCTATAAGCAGCTTGACGACAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 119850 GAGGAGGAGATCCGCCGTCTCTATAAGCAGCTTGACGACAAGGTG...CA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1294  GATGATGAAATCAACCAACAAAGCCAACTCATAGAGAAGCTCAAGCAGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121049 GGATGATGAAATCAACCAACAAAGCCAACTCATAGAGAAGCTCAAGCAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AAATGCTGGACCAGGAAGAG         CTGCTGGTGTCCACCCGAGGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 121099 AAATGCTGGACCAGGAAGAGGTA...AAGCTGCTGGTGTCCACCCGAGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GACAACGAGAAGGTCCAGCGGGAGCTGAGCCACCTGCAATCAGAGAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121811 GACAACGAGAAGGTCCAGCGGGAGCTGAGCCACCTGCAATCAGAGAACGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TGCCGCTAAGGATGAGGTGAAGGAAGTGCTGCAGGTCCTGGAGGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 121861 TGCCGCTAAGGATGAGGTGAAGGAAGTGCTGCAGGCCCTGGAGGAGCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CTGTGAACTATGACCAGAAGTCCCAGGAGGTGGAGGAGAAGAGCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121911 CTGTGAACTATGACCAGAAGTCCCAGGAGGTGGAGGAGAAGAGCCAGCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AACCAGCTTCTGGTGGATGAGCTGTCTCAGAAGGTG         GCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 121961 AACCAGCTTCTGGTGGATGAGCTGTCTCAGAAGGTGGTA...CAGGCCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CATGCTGTCCCTGGAGTCTGAGTTGCAGCGGCTACAGGAGGTCAGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122314 CATGCTGTCCCTGGAGTCTGAGTTGCAGCGGCTACAGGAGGTCAGTGGAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 ACCAGCGAAAACGAATTGCTGAGGTGCTGAACGGGCTGATGAAGGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122364 ACCAGCGAAAACGAATTGCTGAGGTGCTGAACGGGCTGATGAAGGATCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 AGCGAGTTCAGTGTCATTGTGGGCAACGGGGAGATTAAGCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 122414 AGCGAGTTCAGTGTCATTGTGGGCAACGGGGAGATTAAGCTGGTG...TA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1717  CCAGTGGAGATCAGTGGGGCCATCGAGGAGGAGTTCACTGTGGCCCGAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124812 GCCAGTGGAGATCAGTGGGGCCATCGAGGAGGAGTTCACTGTGGCCCGAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TCTACATCAGCAAAATCAAATCAGAAGTCAAGTCTGTGGTCAAGCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124862 TCTACATCAGCAAAATCAAATCAGAAGTCAAGTCTGTGGTCAAGCGGTGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CGGCAGCTGGAGAACCTCCAGGTGGAGTGTCACCGCAAGATGGAAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124912 CGGCAGCTGGAGAACCTCCAGGTGGAGTGTCACCGCAAGATGGAAGTGAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CGGGCGGGAGCTCTCATCCTGCCAGCTCCTCATCTCTCAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 124962 CGGGCGGGAGCTCTCATCCTGCCAGCTCCTCATCTCTCAGGTG...CAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 ATGAGGCCAAGATCCGCTCGCTTACGGAATACATGCAGAGCGTGGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125370 ATGAGGCCAAGATCCGCTCGCTTACGGAATACATGCAGAGCGTGGAGCTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 AAGAAGCGGCACCTGGAAGAGTCCTATGACTCCTTGAGCGATGAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125420 AAGAAGCGGCACCTGGAAGAGTCCTATGACTCCTTGAGCGATGAGCTGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CAAGCTCCAGGCCCAGG         AAACTGTGCATGAAGTGGCCCTGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 125470 CAAGCTCCAGGCCCAGGGTG...TAGAAACTGTGCATGAAGTGGCCCTGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 AGGACAAGGAGCCTGACACTCAGGATGCAGATGAAGTGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 125840 AGGACAAGGAGCCTGACACTCAGGATGCAGATGAAGTGAAGGTG...CAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 AAGGCTCTGGAGCTGCAGATGGAGAGTCACCGGGAGGCCCATCACCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125998 AAGGCTCTGGAGCTGCAGATGGAGAGTCACCGGGAGGCCCATCACCGGCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 GCTGGCCCGGCTCCGGGACGAGATCAACGAGAAGCAGAAGACCATTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126048 GCTGGCCCGGCTCCGGGACGAGATCAACGAGAAGCAGAAGACCATTGATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 AGCTCAAAGA         CCTAAATCAGAAGCTCCAGTTAGAGCTAGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 126098 AGCTCAAAGAGTA...TAGCCTAAATCAGAAGCTCCAGTTAGAGCTAGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 AAGCTTCAGGCTGACTACGAGAAGCTGAAGAGCGAAGAACACGAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126521 AAGCTTCAGGCTGACTACGAGAAGCTGAAGAGCGAAGAACACGAGAAGAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 CACCAAGCTGCAGGAGCTGAC         ATTTCTGTACGAGCGACATG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 126571 CACCAAGCTGCAGGAGCTGACGTG...CAGATTTCTGTACGAGCGACATG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2321 AGCAGTCCAAGCAGGACCTCAAGGGTCTGGAGGAGACAGTT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 127462 AGCAGTCCAAGCAGGACCTCAAGGGTCTGGAGGAGACAGTTGTG...CAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362 GCCCGGGAACTCCAGACCCTCCACAACCTTCGCAAGCTGTTCGTTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127738 GCCCGGGAACTCCAGACCCTCCACAACCTTCGCAAGCTGTTCGTTCAAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2412 CGTCACGACTCGAGTCAAGAAA         AGTGCAGAAATGGAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 127788 CGTCACGACTCGAGTCAAGAAAGTG...CAGAGTGCAGAAATGGAGCCCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453 AAGACAGTGGGGGGATTCACTCCCAAAAGCAGAAGATTTCCTTTCTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127986 AAGACAGTGGGGGGATTCACTCCCAAAAGCAGAAGATTTCCTTTCTTGAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2503 AACAACCTGGAACAGCTTACAAAGGTTCACAAACAG         CTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 128036 AACAACCTGGAACAGCTTACAAAGGTTCACAAACAGGTA...TAGCTGGT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2544 ACGTGACAATGCAGATCTGCGTTGTGAGCTTCCTAAATTGGAAAAACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130690 ACGTGACAATGCAGATCTGCGTTGTGAGCTTCCTAAATTGGAAAAACGAC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2594 TTAGGGCTACGGCTGAGAGAGTTAAGGCCCTGGAGGGTGCACTGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130740 TTAGGGCTACGGCTGAGAGAGTTAAGGCCCTGGAGGGTGCACTGAAGGAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2644 GCCAAGGAGGGCGCCATGAAGGACAAGCGCCGGTACCAGCAGGAGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130790 GCCAAGGAGGGCGCCATGAAGGACAAGCGCCGGTACCAGCAGGAGGTGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2694 CCGCATCAAGGAGGCCGTTCGCTACAAGAGCTCGGGCAAACGGGGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130840 CCGCATCAAGGAGGCCGTTCGCTACAAGAGCTCGGGCAAACGGGGCCATT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2744 CTGCCCAGATTG         CCAAACCCGTCCGGCCTGGCCACTACCCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 130890 CTGCCCAGATTGGTG...CAGCCAAACCCGTCCGGCCTGGCCACTACCCA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2785 GCATCCTCACCCACCAACCCCTATGGCACCCGGAGCCCTGAGTGCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131173 GCATCCTCACCCACCAACCCCTATGGCACCCGGAGCCCTGAGTGCATCAG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2835 TTACACCAACAGCCTCTTCCAGAACTACCAGAATCTCTACCTGCAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131223 TTACACCAACAGCCTCTTCCAGAACTACCAGAATCTCTACCTGCAGGCCA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2885 CACCCAGCTCCACCTCAGATATGTA         CTTTGCAAACTCCTGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 131273 CACCCAGCTCCACCTCAGATATGTAGTG...CAGCTTTGCAAACTCCTGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2926 ACCAGCAGTGGAGCCACATCTTCTGGCGGCCCCTTGGCTTCCTACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131615 ACCAGCAGTGGAGCCACATCTTCTGGCGGCCCCTTGGCTTCCTACCAGAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2976 GGCCAACATGGACAATG         GAAATGCCACAGATATCAATGACA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 131665 GGCCAACATGGACAATGGTG...CAGGAAATGCCACAGATATCAATGACA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3017 ATAG         GAGTGACCTGCCGTGTGGCTATGAGGCTGAGGACCAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132355 ATAGGTA...CAGGAGTGACCTGCCGTGTGGCTATGAGGCTGAGGACCAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .
   3058 GCCAAGCTTTTCCCTCTCCACCAAGAGACAGCAGCCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132867 GCCAAGCTTTTCCCTCTCCACCAAGAGACAGCAGCCAGC