seq1 = pF1KSDB0059.tfa, 3411 bp
seq2 = pF1KSDB0059/gi568815586r_55585061.tfa (gi568815586r:55585061_55807682), 222622 bp

>pF1KSDB0059 3411
>gi568815586r:55585061_55807682 (Chr12)

(complement)

1-206  (100001-100206)   100% ->
207-334  (104505-104632)   100% ->
335-414  (104732-104811)   100% ->
415-670  (106529-106784)   100% ->
671-790  (107694-107813)   100% ->
791-998  (108766-108973)   100% ->
999-1192  (109107-109300)   100% ->
1193-1281  (109657-109745)   100% ->
1282-1409  (109861-109988)   100% ->
1410-1505  (110137-110232)   100% ->
1506-1567  (110406-110467)   100% ->
1568-1737  (110615-110784)   100% ->
1738-1887  (111251-111400)   100% ->
1888-2003  (112046-112161)   100% ->
2004-2196  (112713-112905)   100% ->
2197-2277  (112988-113068)   100% ->
2278-2357  (113161-113240)   100% ->
2358-2432  (113353-113427)   100% ->
2433-2535  (113560-113662)   100% ->
2536-2712  (114366-114542)   100% ->
2713-2844  (114708-114839)   100% ->
2845-2958  (118726-118839)   100% ->
2959-3057  (119383-119481)   100% ->
3058-3183  (119587-119712)   100% ->
3184-3411  (122395-122622)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGGGCTCGGAGCCGCGACCCTTGGGGGGCCTCCGGGATTTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGGGCTCGGAGCCGCGACCCTTGGGGGGCCTCCGGGATTTGCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTTTTGGCTCCCTGCTCGTCGAACTGCTCTTCTCACGGGCTGTCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTTTTGGCTCCCTGCTCGTCGAACTGCTCTTCTCACGGGCTGTCGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAATCTGGACGTGATGGGTGCCTTGCGCAAGGAGGGCGAGCCAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAATCTGGACGTGATGGGTGCCTTGCGCAAGGAGGGCGAGCCAGGCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTTCGGCTTCTCTGTGGCCCTGCACCGGCAGTTGCAGCCCCGACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCTTCGGCTTCTCTGTGGCCCTGCACCGGCAGTTGCAGCCCCGACCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGCTG         GCTGCTGGTGGGTGCTCCCCAGGCCCTGGCTCTTC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAGCTGGTG...CAGGCTGCTGGTGGGTGCTCCCCAGGCCCTGGCTCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGGGCAGCAGGCGAATCGCACTGGAGGCCTCTTCGCTTGCCCGTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104540 CTGGGCAGCAGGCGAATCGCACTGGAGGCCTCTTCGCTTGCCCGTTGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGGAGGAGACTGACTGCTACAGAGTGGACATCGACCAGGGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104590 CTGGAGGAGACTGACTGCTACAGAGTGGACATCGACCAGGGAGGTG...T

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    335   CTGATATGCAAAAGGAAAGCAAGGAGAACCAGTGGTTGGGAGTCAGTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104730 AGCTGATATGCAAAAGGAAAGCAAGGAGAACCAGTGGTTGGGAGTCAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCGGAGCCAGGGGCCTGGGGGCAAGATTGTT         ACCTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104780 TTCGGAGCCAGGGGCCTGGGGGCAAGATTGTTGTG...CAGACCTGTGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CACCGATATGAGGCAAGGCAGCGAGTGGACCAGATCCTGGAGACGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106538 CACCGATATGAGGCAAGGCAGCGAGTGGACCAGATCCTGGAGACGCGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TATGATTGGTCGCTGCTTTGTGCTCAGCCAGGACCTGGCCATCCGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106588 TATGATTGGTCGCTGCTTTGTGCTCAGCCAGGACCTGGCCATCCGGGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGTTGGATGGTGGGGAATGGAAGTTCTGTGAGGGACGCCCCCAAGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106638 AGTTGGATGGTGGGGAATGGAAGTTCTGTGAGGGACGCCCCCAAGGCCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAACAATTTGGGTTCTGCCAGCAGGGCACAGCTGCCGCCTTCTCCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106688 GAACAATTTGGGTTCTGCCAGCAGGGCACAGCTGCCGCCTTCTCCCCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TAGCCACTACCTCCTCTTTGGGGCCCCAGGAACCTATAATTGGAAGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 106738 TAGCCACTACCTCCTCTTTGGGGCCCCAGGAACCTATAATTGGAAGGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    671       GGTTGCTTTTTGTGACCAACATTGATAGCTCAGACCCCGACCAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106788 ...CAGGGTTGCTTTTTGTGACCAACATTGATAGCTCAGACCCCGACCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGGTGTATAAAACTTTGGACCCTGCTGACCGGCTCCCAGGACCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107738 CTGGTGTATAAAACTTTGGACCCTGCTGACCGGCTCCCAGGACCAGCCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGACTTGGCCCTCAATAGCTACTTAG         GCTTCTCTATTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107788 AGACTTGGCCCTCAATAGCTACTTAGGTT...CAGGCTTCTCTATTGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CGGGGAAAGGTCTGGTGCGTGCAGAAGAGCTGAGCTTTGTGGCTGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108781 CGGGGAAAGGTCTGGTGCGTGCAGAAGAGCTGAGCTTTGTGGCTGGAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCCCGCGCCAACCACAAGGGTGCTGTGGTCATCCTGCGCAAGGACAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108831 CCCCGCGCCAACCACAAGGGTGCTGTGGTCATCCTGCGCAAGGACAGCGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CAGTCGCCTGGTGCCCGAGGTTATGCTGTCTGGGGAGCGCCTGACCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108881 CAGTCGCCTGGTGCCCGAGGTTATGCTGTCTGGGGAGCGCCTGACCTCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCTTTGGCTACTCACTGGCTGTGGCTGACCTCAACAGTGATGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 108931 GCTTTGGCTACTCACTGGCTGTGGCTGACCTCAACAGTGATGGGTG...T

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    999   CTGGCCAGACCTGATAGTGGGTGCCCCCTACTTCTTTGAGCGCCAAGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109105 AGCTGGCCAGACCTGATAGTGGGTGCCCCCTACTTCTTTGAGCGCCAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGAGCTGGGGGGTGCTGTGTATGTGTACTTGAACCAGGGGGGTCACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109155 AGAGCTGGGGGGTGCTGTGTATGTGTACTTGAACCAGGGGGGTCACTGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CTGGGATCTCCCCTCTCCGGCTCTGCGGCTCCCCTGACTCCATGTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109205 CTGGGATCTCCCCTCTCCGGCTCTGCGGCTCCCCTGACTCCATGTTCGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ATCAGCCTGGCTGTCCTGGGGGACCTCAACCAAGATGGCTTTCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 109255 ATCAGCCTGGCTGTCCTGGGGGACCTCAACCAAGATGGCTTTCCAGGTG.

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193      ATATTGCAGTGGGTGCCCCCTTTGATGGTGATGGGAAAGTCTTCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109305 ..CAGATATTGCAGTGGGTGCCCCCTTTGATGGTGATGGGAAAGTCTTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TCTACCATGGGAGCAGCCTGGGGGTTGTCGCCAAACCTTCACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 109702 TCTACCATGGGAGCAGCCTGGGGGTTGTCGCCAAACCTTCACAGGTG...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1282    GTGCTGGAGGGCGAGGCTGTGGGCATCAAGAGCTTCGGCTACTCCCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109858 TAGGTGCTGGAGGGCGAGGCTGTGGGCATCAAGAGCTTCGGCTACTCCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GTCAGGCAGCTTGGATATGGATGGGAACCAATACCCTGACCTGCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109908 GTCAGGCAGCTTGGATATGGATGGGAACCAATACCCTGACCTGCTGGTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GCTCCCTGGCTGACACCGCAGTGCTCTTCAG         GGCCAGACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 109958 GCTCCCTGGCTGACACCGCAGTGCTCTTCAGGTG...CAGGGCCAGACCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ATCCTCCATGTCTCCCATGAGGTCTCTATTGCTCCACGAAGCATCGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110147 ATCCTCCATGTCTCCCATGAGGTCTCTATTGCTCCACGAAGCATCGACCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGAGCAGCCCAACTGTGCTGGCGGCCACTCGGTCTG         TGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110197 GGAGCAGCCCAACTGTGCTGGCGGCCACTCGGTCTGGTG...CAGTGTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 ACCTAAGGGTCTGTTTCAGCTACATTGCAGTCCCCAGCAGCTATAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110411 ACCTAAGGGTCTGTTTCAGCTACATTGCAGTCCCCAGCAGCTATAGCCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ACTGTGG         CCCTGGACTATGTGTTAGATGCGGACACAGACCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110461 ACTGTGGGTG...CAGCCCTGGACTATGTGTTAGATGCGGACACAGACCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GAGGCTCCGGGGCCAGGTTCCCCGTGTGACGTTCCTGAGCCGTAACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110649 GAGGCTCCGGGGCCAGGTTCCCCGTGTGACGTTCCTGAGCCGTAACCTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AAGAACCCAAGCACCAGGCCTCGGGCACCGTGTGGCTGAAGCACCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110699 AAGAACCCAAGCACCAGGCCTCGGGCACCGTGTGGCTGAAGCACCAGCAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GACCGAGTCTGTGGAGACGCCATGTTCCAGCTCCAG         GAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110749 GACCGAGTCTGTGGAGACGCCATGTTCCAGCTCCAGGTG...TAGGAAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TGTCAAAGACAAGCTTCGGGCCATTGTAGTGACCTTGTCCTACAGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111256 TGTCAAAGACAAGCTTCGGGCCATTGTAGTGACCTTGTCCTACAGTCTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AGACCCCTCGGCTCCGGCGACAGGCTCCTGGCCAGGGGCTGCCTCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111306 AGACCCCTCGGCTCCGGCGACAGGCTCCTGGCCAGGGGCTGCCTCCAGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GCCCCCATCCTCAATGCCCACCAGCCCAGCACCCAGCGGGCAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 111356 GCCCCCATCCTCAATGCCCACCAGCCCAGCACCCAGCGGGCAGAGGTG..

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888     ATCCACTTCCTGAAGCAAGGCTGTGGTGAAGACAAGATCTGCCAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111406 .CAGATCCACTTCCTGAAGCAAGGCTGTGGTGAAGACAAGATCTGCCAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 GCAATCTGCAGCTGGTCCGCGCCCGCTTCTGTACCCGGGTCAGCGACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112092 GCAATCTGCAGCTGGTCCGCGCCCGCTTCTGTACCCGGGTCAGCGACACG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GAATTCCAACCTCTGCCCAT         GGATGTGGATGGAACAACAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 112142 GAATTCCAACCTCTGCCCATGTG...CAGGGATGTGGATGGAACAACAGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CCTGTTTGCACTGAGTGGGCAGCCAGTCATTGGCCTGGAGCTGATGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112734 CCTGTTTGCACTGAGTGGGCAGCCAGTCATTGGCCTGGAGCTGATGGTCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CCAACCTGCCATCGGACCCAGCCCAGCCCCAGGCTGATGGGGATGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112784 CCAACCTGCCATCGGACCCAGCCCAGCCCCAGGCTGATGGGGATGATGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CATGAAGCCCAGCTCCTGGTCATGCTTCCTGACTCACTGCACTACTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112834 CATGAAGCCCAGCTCCTGGTCATGCTTCCTGACTCACTGCACTACTCAGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GGTCCGGGCCCTGGACCCTGCG         GAGAAGCCACTCTGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 112884 GGTCCGGGCCCTGGACCCTGCGGTG...CAGGAGAAGCCACTCTGCCTGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 CCAATGAGAATGCCTCCCATGTTGAGTGTGAGCTGGGGAACCCCATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113007 CCAATGAGAATGCCTCCCATGTTGAGTGTGAGCTGGGGAACCCCATGAAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 AGAGGTGCCCAG         GTCACCTTCTACCTCATCCTTAGCACCTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113057 AGAGGTGCCCAGGTT...TAGGTCACCTTCTACCTCATCCTTAGCACCTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 CGGGATCAGCATTGAGACCACGGAACTGGAGGTAGAGCTGCTGTTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113190 CGGGATCAGCATTGAGACCACGGAACTGGAGGTAGAGCTGCTGTTGGCCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 C         GATCAGTGAGCAGGAGCTGCATCCAGTCTCTGCACGAGCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113240 CGTA...CAGGATCAGTGAGCAGGAGCTGCATCCAGTCTCTGCACGAGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 CGTGTCTTCATTGAGCTGCCACTGTCCATTGCAGG         AATGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 113393 CGTGTCTTCATTGAGCTGCCACTGTCCATTGCAGGGTG...CAGAATGGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 CATTCCCCAGCAACTCTTCTTCTCTGGTGTGGTGAGGGGCGAGAGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113566 CATTCCCCAGCAACTCTTCTTCTCTGGTGTGGTGAGGGGCGAGAGAGCCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 TGCAGTCTGAGCGGGATGTGGGCAGCAAGGTCAAGTATGAGGTCACG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 113616 TGCAGTCTGAGCGGGATGTGGGCAGCAAGGTCAAGTATGAGGTCACGGTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2536       GTTTCCAACCAAGGCCAGTCGCTCAGAACCCTGGGCTCTGCCTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113666 ...CAGGTTTCCAACCAAGGCCAGTCGCTCAGAACCCTGGGCTCTGCCTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 CCTCAACATCATGTGGCCTCATGAGATTGCCAATGGGAAGTGGTTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114410 CCTCAACATCATGTGGCCTCATGAGATTGCCAATGGGAAGTGGTTGCTGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 ACCCAATGCAGGTTGAGCTGGAGGGCGGGCAGGGGCCTGGGCAGAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114460 ACCCAATGCAGGTTGAGCTGGAGGGCGGGCAGGGGCCTGGGCAGAAAGGG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 CTTTGCTCTCCCAGGCCCAACATCCTCCACCTG         GATGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 114510 CTTTGCTCTCCCAGGCCCAACATCCTCCACCTGGTG...CAGGATGTGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 CAGTAGGGATAGGAGGCGGCGGGAGCTGGAGCCACCTGAGCAGCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114716 CAGTAGGGATAGGAGGCGGCGGGAGCTGGAGCCACCTGAGCAGCAGGAGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 CTGGTGAGCGGCAGGAGCCCAGCATGTCCTGGTGGCCAGTGTCCTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114766 CTGGTGAGCGGCAGGAGCCCAGCATGTCCTGGTGGCCAGTGTCCTCTGCT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2821 GAGAAGAAGAAAAACATCACCCTG         GACTGCGCCCGGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 114816 GAGAAGAAGAAAAACATCACCCTGGTG...TAGGACTGCGCCCGGGGCAC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 GGCCAACTGTGTGGTGTTCAGCTGCCCACTCTACAGCTTTGACCGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118743 GGCCAACTGTGTGGTGTTCAGCTGCCCACTCTACAGCTTTGACCGCGCGG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2912 CTGTGCTGCATGTCTGGGGCCGTCTCTGGAACAGCACCTTTCTGGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 118793 CTGTGCTGCATGTCTGGGGCCGTCTCTGGAACAGCACCTTTCTGGAGGTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2959       GAGTACTCAGCTGTGAAGTCCCTGGAAGTGATTGTCCGGGCCAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118843 ...TAGGAGTACTCAGCTGTGAAGTCCCTGGAAGTGATTGTCCGGGCCAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 CATCACAGTGAAGTCCTCCATAAAGAACTTGATGCTCCGAGATGCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119427 CATCACAGTGAAGTCCTCCATAAAGAACTTGATGCTCCGAGATGCCTCCA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3053 CAGTG         ATCCCAGTGATGGTATACTTGGACCCCATGGCTGTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119477 CAGTGGTG...CAGATCCCAGTGATGGTATACTTGGACCCCATGGCTGTG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 GTGGCAGAAGGAGTGCCCTGGTGGGTCATCCTCCTGGCTGTACTGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119623 GTGGCAGAAGGAGTGCCCTGGTGGGTCATCCTCCTGGCTGTACTGGCTGG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3144 GCTGCTGGTGCTAGCACTGCTGGTGCTGCTCCTGTGGAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 119673 GCTGCTGGTGCTAGCACTGCTGGTGCTGCTCCTGTGGAAGGTG...TAGA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3185 TGGGATTCTTCAAACGGGCGAAGCACCCCGAGGCCACCGTGCCCCAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122396 TGGGATTCTTCAAACGGGCGAAGCACCCCGAGGCCACCGTGCCCCAGTAC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3235 CATGCGGTGAAGATTCCTCGGGAAGACCGACAGCAGTTCAAGGAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122446 CATGCGGTGAAGATTCCTCGGGAAGACCGACAGCAGTTCAAGGAGGAGAA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3285 GACGGGCACCATCCTGAGGAACAACTGGGGCAGCCCCCGGCGGGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122496 GACGGGCACCATCCTGAGGAACAACTGGGGCAGCCCCCGGCGGGAGGGCC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3335 CGGATGCACACCCCATCCTGGCTGCTGACGGGCATCCCGAGCTGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122546 CGGATGCACACCCCATCCTGGCTGCTGACGGGCATCCCGAGCTGGGCCCC

   3600     .    :    .    :    .
   3385 GATGGGCATCCAGGGCCAGGCACCGCC
        |||||||||||||||||||||||||||
 122596 GATGGGCATCCAGGGCCAGGCACCGCC