seq1 = pF1KSDB0058.tfa, 3303 bp
seq2 = pF1KSDB0058/gi568815581r_41767813.tfa (gi568815581r:41767813_42013873), 246061 bp

>pF1KSDB0058 3303
>gi568815581r:41767813_42013873 (Chr17)

(complement)

1-159  (100001-100159)   100% ->
160-282  (101332-101454)   100% ->
283-345  (103590-103652)   100% ->
346-536  (104174-104364)   100% ->
537-616  (104806-104885)   100% ->
617-747  (106302-106432)   100% ->
748-866  (107228-107346)   100% ->
867-1003  (108216-108352)   100% ->
1004-1065  (109084-109145)   100% ->
1066-1183  (112061-112178)   100% ->
1184-1338  (115089-115243)   100% ->
1339-1429  (116035-116125)   100% ->
1430-1459  (117225-117254)   100% ->
1460-1601  (120700-120841)   100% ->
1602-1770  (121427-121595)   99% ->
1771-1875  (126171-126275)   100% ->
1876-2072  (127566-127762)   100% ->
2073-2154  (129600-129681)   100% ->
2155-2265  (130642-130752)   100% ->
2266-2393  (134950-135077)   100% ->
2394-2487  (135678-135771)   100% ->
2488-2642  (139909-140063)   100% ->
2643-2793  (141692-141842)   100% ->
2794-2937  (142042-142185)   100% ->
2938-3051  (144287-144400)   100% ->
3052-3134  (144749-144831)   100% ->
3135-3211  (145089-145165)   100% ->
3212-3303  (145970-146061)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGCCAAGGCAATTTCAGAGCAGACGGGCAAAGAACTCCTTTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGCCAAGGCAATTTCAGAGCAGACGGGCAAAGAACTCCTTTACAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCATCTGTACCACCTCAGCCATCCAGAATCGGTTCAAGTATGCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCATCTGTACCACCTCAGCCATCCAGAATCGGTTCAAGTATGCTCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACTCCTGACACAGACTGGGCCCGCTTGCTGCAGGACCACCCCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACTCCTGACACAGACTGGGCCCGCTTGCTGCAGGACCACCCCTGGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCAGCCAG         AACTTGGTAGTCAAGCCAGACCAGCTGATCAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCAGCCAGGTG...CAGAACTTGGTAGTCAAGCCAGACCAGCTGATCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACGTCGTGGAAAACTTGGTCTCGTTGGGGTCAACCTCACTCTGGATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101364 ACGTCGTGGAAAACTTGGTCTCGTTGGGGTCAACCTCACTCTGGATGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAAGTCCTGGCTGAAGCCACGGCTGGGACAGGAAGCCACA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101414 TCAAGTCCTGGCTGAAGCCACGGCTGGGACAGGAAGCCACAGTG...TAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTGGCAAGGCCACAGGCTTCCTCAAGAACTTTCTGATCGAGCCCTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103590 GTTGGCAAGGCCACAGGCTTCCTCAAGAACTTTCTGATCGAGCCCTTCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCCCACAGTCAG         GCTGAGGAGTTCTATGTCTGCATCTATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103640 CCCCCACAGTCAGGTA...AAGGCTGAGGAGTTCTATGTCTGCATCTATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCACCCGAGAAGGGGACTACGTCCTGTTCCACCACGAGGGGGGTGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104202 CCACCCGAGAAGGGGACTACGTCCTGTTCCACCACGAGGGGGGTGTGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGGGTGATGTGGACGCCAAGGCCCAGAAGCTGCTTGTTGGCGTGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104252 GTGGGTGATGTGGACGCCAAGGCCCAGAAGCTGCTTGTTGGCGTGGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAAACTGAATCCTGAGGACATCAAAAAACACCTGTTGGTCCACGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104302 GAAACTGAATCCTGAGGACATCAAAAAACACCTGTTGGTCCACGCCCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGACAAGAAAGA         AATTCTGGCCAGTTTTATCTCCGGCCTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104352 AAGACAAGAAAGAGTT...TAGAATTCTGGCCAGTTTTATCTCCGGCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTCAATTTCTACGAGGACTTGTACTTCACCTACCTCGAGATCAATCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104834 TTCAATTTCTACGAGGACTTGTACTTCACCTACCTCGAGATCAATCCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TG         TAGTGACCAAAGATGGAGTCTATGTCCTTGACTTGGCGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104884 TGGTA...AAGTAGTGACCAAAGATGGAGTCTATGTCCTTGACTTGGCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCAAGGTGGACGCCACTGCCGACTACATCTGCAAAGTGAAGTGGGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106341 CCAAGGTGGACGCCACTGCCGACTACATCTGCAAAGTGAAGTGGGGTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATCGAGTTCCCTCCCCCCTTCGGGCGGGAGGCATATCCAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 106391 ATCGAGTTCCCTCCCCCCTTCGGGCGGGAGGCATATCCAGAGGTA...CA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    748  GAAGCCTACATTGCAGACCTCGATGCCAAAAGTGGGGCAAGCCTGAAGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107227 GGAAGCCTACATTGCAGACCTCGATGCCAAAAGTGGGGCAAGCCTGAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGACCTTGCTGAACCCCAAAGGGAGGATCTGGACCATGGTGGCCGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107277 TGACCTTGCTGAACCCCAAAGGGAGGATCTGGACCATGGTGGCCGGGGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGCGCCTCTGTCGTGTACAG         CGATACCATCTGTGATCTAGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 107327 GGCGCCTCTGTCGTGTACAGGTG...CAGCGATACCATCTGTGATCTAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGGTGTCAACGAGCTGGCAAACTATGGGGAGTACTCAGGCGCCCCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108237 GGGTGTCAACGAGCTGGCAAACTATGGGGAGTACTCAGGCGCCCCCAGCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGCAGCAGACCTATGACTATGCCAAGACTATCCTCTCCCTCATGACCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108287 AGCAGCAGACCTATGACTATGCCAAGACTATCCTCTCCCTCATGACCCGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAGAAGCACCCAGATG         GCAAGATCCTCATCATTGGAGGCAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 108337 GAGAAGCACCCAGATGGTG...CAGGCAAGATCCTCATCATTGGAGGCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CATCGCAAACTTCACCAACGTGGCTGCCACGTTCAAG         GGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 109109 CATCGCAAACTTCACCAACGTGGCTGCCACGTTCAAGGTA...CAGGGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TCGTGAGAGCAATTCGAGATTACCAGGGCCCCCTGAAGGAGCACGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112065 TCGTGAGAGCAATTCGAGATTACCAGGGCCCCCTGAAGGAGCACGAAGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ACAATCTTTGTCCGAAGAGGTGGCCCCAACTATCAGGAGGGCTTACGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112115 ACAATCTTTGTCCGAAGAGGTGGCCCCAACTATCAGGAGGGCTTACGGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GATGGGAGAAGTCG         GGAAGACCACTGGGATCCCCATCCATG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 112165 GATGGGAGAAGTCGGTA...CAGGGAAGACCACTGGGATCCCCATCCATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCTTTGGCACAGAGACTCACATGACGGCCATTGTGGGCATGGCCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115116 TCTTTGGCACAGAGACTCACATGACGGCCATTGTGGGCATGGCCCTGGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CACCGGCCCATCCCCAACCAGCCACCCACAGCGGCCCACACTGCAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115166 CACCGGCCCATCCCCAACCAGCCACCCACAGCGGCCCACACTGCAAACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CCTCCTCAACGCCAGCGGGAGCACATCG         ACGCCAGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 115216 CCTCCTCAACGCCAGCGGGAGCACATCGGTA...CAGACGCCAGCCCCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GCAGGACAGCATCTTTTTCTGAGTCCAGGGCCGATGAGGTGGCGCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116048 GCAGGACAGCATCTTTTTCTGAGTCCAGGGCCGATGAGGTGGCGCCTGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AAGAAGGCCAAGCCTGCCATGCCACAAG         ATTCAGTCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 116098 AAGAAGGCCAAGCCTGCCATGCCACAAGGTA...CAGATTCAGTCCCAAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TCCAAGATCCCTGCAAG         GAAAGAGCACCACCCTCTTCAGCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 117238 TCCAAGATCCCTGCAAGGTA...CAGGAAAGAGCACCACCCTCTTCAGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GCCACACCAAGGCCATTGTGTGGGGCATGCAGACCCGGGCCGTGCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120724 GCCACACCAAGGCCATTGTGTGGGGCATGCAGACCCGGGCCGTGCAAGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 ATGCTGGACTTTGACTATGTCTGCTCCCGAGACGAGCCCTCAGTGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120774 ATGCTGGACTTTGACTATGTCTGCTCCCGAGACGAGCCCTCAGTGGCTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CATGGTCTACCCTTTCAC         TGGGGACCACAAGCAGAAGTTTT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 120824 CATGGTCTACCCTTTCACGTG...CAGTGGGGACCACAAGCAGAAGTTTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 ACTGGGGGCACAAAGAGATCCTGATCCCTGTCTTCAAGAACATGGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121450 ACTGGGGGCACAAAGAGATCCTGATCCCTGTCTTCAAGAACATGGCTGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GCCATGAGGAAGCACCCGGAGGTAGATGTGCTCATCAACTTTGCCTCTCT
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121500 GCCATGAGGAAGCATCCGGAGGTAGATGTGCTCATCAACTTTGCCTCTCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 CCGCTCTGCCTATGACAGCACCATGGAGACCATGAACTATGCCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 121550 CCGCTCTGCCTATGACAGCACCATGGAGACCATGAACTATGCCCAGGTA.

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1771      ATCCGGACCATCGCCATCATAGCTGAAGGCATCCCTGAGGCCCTC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121600 ..TAGATCCGGACCATCGCCATCATAGCTGAAGGCATCCCTGAGGCCCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 ACGAGAAAGCTGATCAAGAAGGCGGACCAGAAGGGAGTGACCATCATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126216 ACGAGAAAGCTGATCAAGAAGGCGGACCAGAAGGGAGTGACCATCATCGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 ACCTGCCACT         GTTGGAGGCATCAAGCCTGGGTGCTTTAAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 126266 ACCTGCCACTGTG...CAGGTTGGAGGCATCAAGCCTGGGTGCTTTAAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 TTGGCAACACAGGTGGGATGCTGGACAACATCCTGGCCTCCAAACTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127597 TTGGCAACACAGGTGGGATGCTGGACAACATCCTGGCCTCCAAACTGTAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 CGCCCAGGCAGCGTGGCCTATGTCTCACGTTCCGGAGGCATGTCCAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127647 CGCCCAGGCAGCGTGGCCTATGTCTCACGTTCCGGAGGCATGTCCAACGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 GCTCAACAATATCATCTCTCGGACCACGGATGGCGTCTATGAGGGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127697 GCTCAACAATATCATCTCTCGGACCACGGATGGCGTCTATGAGGGCGTGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CCATTGGTGGGGACAG         GTACCCGGGCTCCACATTCATGGAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 127747 CCATTGGTGGGGACAGGTA...CAGGTACCCGGGCTCCACATTCATGGAT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 CATGTGTTACGCTATCAGGACACTCCAGGAGTCAAAATGATTGTGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129625 CATGTGTTACGCTATCAGGACACTCCAGGAGTCAAAATGATTGTGGTTCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 TGGAGAG         ATTGGGGGCACTGAGGAATATAAGATTTGCCGGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129675 TGGAGAGGTG...CAGATTGGGGGCACTGAGGAATATAAGATTTGCCGGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 GCATCAAGGAGGGCCGCCTCACTAAGCCCATCGTCTGCTGGTGCATCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130676 GCATCAAGGAGGGCCGCCTCACTAAGCCCATCGTCTGCTGGTGCATCGGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 ACGTGTGCCACCATGTTCTCCTCTGAG         GTCCAGTTTGGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 130726 ACGTGTGCCACCATGTTCTCCTCTGAGGTA...CAGGTCCAGTTTGGCCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 TGCTGGAGCTTGTGCCAACCAGGCTTCTGAAACTGCAGTAGCCAAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134964 TGCTGGAGCTTGTGCCAACCAGGCTTCTGAAACTGCAGTAGCCAAGAACC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 AGGCTTTGAAGGAAGCAGGAGTGTTTGTGCCCCGGAGCTTTGATGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135014 AGGCTTTGAAGGAAGCAGGAGTGTTTGTGCCCCGGAGCTTTGATGAGCTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GGAGAGATCATCCA         GTCTGTATACGAAGATCTCGTGGCCAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 135064 GGAGAGATCATCCAGTA...CAGGTCTGTATACGAAGATCTCGTGGCCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 TGGAGTCATTGTACCTGCCCAGGAGGTGCCGCCCCCAACCGTGCCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135705 TGGAGTCATTGTACCTGCCCAGGAGGTGCCGCCCCCAACCGTGCCCATGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 ACTACTCCTGGGCCAGG         GAGCTTGGTTTGATCCGCAAACCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 135755 ACTACTCCTGGGCCAGGGTA...CAGGAGCTTGGTTTGATCCGCAAACCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2512 GCCTCGTTCATGACCAGCATCTGCGATGAGCGAGGACAGGAGCTCATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139933 GCCTCGTTCATGACCAGCATCTGCGATGAGCGAGGACAGGAGCTCATCTA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 CGCGGGCATGCCCATCACTGAGGTCTTCAAGGAAGAGATGGGCATTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139983 CGCGGGCATGCCCATCACTGAGGTCTTCAAGGAAGAGATGGGCATTGGCG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 GGGTCCTCGGCCTCCTCTGGTTCCAGAAAAG         GTTGCCTAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 140033 GGGTCCTCGGCCTCCTCTGGTTCCAGAAAAGGTG...CAGGTTGCCTAAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 TACTCTTGCCAGTTCATTGAGATGTGTCTGATGGTGACAGCTGATCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141702 TACTCTTGCCAGTTCATTGAGATGTGTCTGATGGTGACAGCTGATCACGG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 GCCAGCCGTCTCTGGAGCCCACAACACCATCATTTGTGCGCGAGCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141752 GCCAGCCGTCTCTGGAGCCCACAACACCATCATTTGTGCGCGAGCTGGGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2753 AAGACCTGGTCTCCAGCCTCACCTCGGGGCTGCTCACCATC         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 141802 AAGACCTGGTCTCCAGCCTCACCTCGGGGCTGCTCACCATCGTA...CAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2794 GGGGATCGGTTTGGGGGTGCCTTGGATGCAGCAGCCAAGATGTTCAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142042 GGGGATCGGTTTGGGGGTGCCTTGGATGCAGCAGCCAAGATGTTCAGTAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2844 AGCCTTTGACAGTGGCATTATCCCCATGGAGTTTGTGAACAAGATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142092 AGCCTTTGACAGTGGCATTATCCCCATGGAGTTTGTGAACAAGATGAAGA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2894 AGGAAGGGAAGCTGATCATGGGCATTGGTCACCGAGTGAAGTCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 142142 AGGAAGGGAAGCTGATCATGGGCATTGGTCACCGAGTGAAGTCGGTG...

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2938    ATAAACAACCCAGACATGCGAGTGCAGATCCTCAAAGATTACGTCAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144284 TAGATAAACAACCCAGACATGCGAGTGCAGATCCTCAAAGATTACGTCAG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2985 GCAGCACTTCCCTGCCACTCCTCTGCTCGATTATGCACTGGAAGTAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144334 GCAGCACTTCCCTGCCACTCCTCTGCTCGATTATGCACTGGAAGTAGAGA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3035 AGATTACCACCTCGAAG         AAGCCAAATCTTATCCTGAATGTA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 144384 AGATTACCACCTCGAAGGTA...CAGAAGCCAAATCTTATCCTGAATGTA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3076 GATGGTCTCATCGGAGTCGCATTTGTAGACATGCTTAGAAACTGTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144773 GATGGTCTCATCGGAGTCGCATTTGTAGACATGCTTAGAAACTGTGGGTC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3126 CTTTACTCG         GGAGGAAGCTGATGAATATATTGACATTGGAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 144823 CTTTACTCGGTG...CAGGGAGGAAGCTGATGAATATATTGACATTGGAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3167 CCCTCAATGGCATCTTTGTGCTGGGAAGGAGTATGGGGTTCATTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 145121 CCCTCAATGGCATCTTTGTGCTGGGAAGGAGTATGGGGTTCATTGGTG..

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3212     GACACTATCTTGATCAGAAGAGGCTGAAGCAGGGGCTGTATCGTCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145171 .TAGGACACTATCTTGATCAGAAGAGGCTGAAGCAGGGGCTGTATCGTCA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3258 TCCGTGGGATGATATTTCATATGTTCTTCCGGAACACATGAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146016 TCCGTGGGATGATATTTCATATGTTCTTCCGGAACACATGAGCATG