seq1 = pF1KSDB0057.tfa, 2379 bp
seq2 = pF1KSDB0057/gi568815596r_25828981.tfa (gi568815596r:25828981_26081917), 252937 bp

>pF1KSDB0057 2379
>gi568815596r:25828981_26081917 (Chr2)

(complement)

1-1545  (100001-101545)   100% ->
1546-1647  (125474-125575)   100% ->
1648-1770  (126255-126377)   100% ->
1771-1889  (127533-127651)   100% ->
1890-2006  (130013-130129)   100% ->
2007-2115  (151855-151963)   100% ->
2116-2288  (152441-152613)   100% ->
2289-2379  (152847-152937)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGTAAGACCAAGGCCAGCGAGGCCCTCAAGGTGGTGGCCCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGTAAGACCAAGGCCAGCGAGGCCCTCAAGGTGGTGGCCCGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCCCCCTCAGCAGGAAGGAGGAGGCTGCTGGTCACGAGCAGATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCCCCCTCAGCAGGAAGGAGGAGGCTGCTGGTCACGAGCAGATCCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCATGGACGTGAAACTGGGCCAGGTGACCCTGCGGAACCCCCGCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCATGGACGTGAAACTGGGCCAGGTGACCCTGCGGAACCCCCGCGCCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGGGGGAGCTGCCCAAGACCTTCACCTTTGACGCCGTGTATGATGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGGGGGAGCTGCCCAAGACCTTCACCTTTGACGCCGTGTATGATGCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCAAGCAGGCCGACCTGTATGACGAAACCGTGAGGCCCCTGATAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCAAGCAGGCCGACCTGTATGACGAAACCGTGAGGCCCCTGATAGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGTGCTCCAGGGTTTCAATGGCACGGTGTTTGCCTATGGCCAGACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGTGCTCCAGGGTTTCAATGGCACGGTGTTTGCCTATGGCCAGACGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTGGCAAGACCTATACCATGCAGGGGACCTGGGTGGAGCCCGAGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACTGGCAAGACCTATACCATGCAGGGGACCTGGGTGGAGCCCGAGCTGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGGGTCATCCCGAATGCCTTTGAGCACATCTTCACCCACATCTCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGGGTCATCCCGAATGCCTTTGAGCACATCTTCACCCACATCTCCCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCAGAACCAACAGTACCTGGTCCGGGCCTCCTATTTGGAGATCTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCAGAACCAACAGTACCTGGTCCGGGCCTCCTATTTGGAGATCTACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAAGAGATTCGAGACCTGCTCTCCAAGGAGCCGGGCAAGAGGCTAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAAGAGATTCGAGACCTGCTCTCCAAGGAGCCGGGCAAGAGGCTAGAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAAGAGAACCCCGAGACTGGCGTCTACATCAAGGACCTCTCCTCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAAGAGAACCCCGAGACTGGCGTCTACATCAAGGACCTCTCCTCCTTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCACCAAGAATGTCAAGGAGATTGAGCATGTGATGAACCTGGGGAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCACCAAGAATGTCAAGGAGATTGAGCATGTGATGAACCTGGGGAACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCCGGGCTGTGGGCAGCACCCACATGAATGAGGTCAGCTCCCGCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCCGGGCTGTGGGCAGCACCCACATGAATGAGGTCAGCTCCCGCTCCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCCATCTTCATCATCACTGTGGAGTGCAGCGAACGTGGCTCTGATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGCCATCTTCATCATCACTGTGGAGTGCAGCGAACGTGGCTCTGATGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGACCACATCCGAGTGGGCAAGCTCAACCTCGTGGACCTGGCTGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGACCACATCCGAGTGGGCAAGCTCAACCTCGTGGACCTGGCTGGCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGAGGCAGAACAAGGCAGGCCCCAACACAGCGGGAGGGGCAGCCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGAGGCAGAACAAGGCAGGCCCCAACACAGCGGGAGGGGCAGCCACACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ATCCTCGGGTGGCGGTGGTGGCGGTGGAGGCAGTGGTGGTGGTGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ATCCTCGGGTGGCGGTGGTGGCGGTGGAGGCAGTGGTGGTGGTGCTGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GAGAGAGGCCTAAGGAAGCCTCCAAAATCAACCTCTCATTATCTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GAGAGAGGCCTAAGGAAGCCTCCAAAATCAACCTCTCATTATCTGCCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GGCAACGTGATTGCTGCCCTGGCGGGCAACAGGAGCACCCACATTCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGCAACGTGATTGCTGCCCTGGCGGGCAACAGGAGCACCCACATTCCCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCGGGACTCCAAGCTGACCCGGCTGCTCCAGGACTCCCTGGGGGGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCGGGACTCCAAGCTGACCCGGCTGCTCCAGGACTCCCTGGGGGGGAATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCAAGACCATCATGGTAGCCACACTGGGGCCAGCTTCTCACAGCTACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCAAGACCATCATGGTAGCCACACTGGGGCCAGCTTCTCACAGCTACGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGAGCCTCTCCACCTTGCGCTTTGCCAACCGAGCCAAGAACATCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGAGCCTCTCCACCTTGCGCTTTGCCAACCGAGCCAAGAACATCAAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CAAGCCCCGGGTGAACGAGGACCCCAAGGACACACTGCTGCGGGAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAAGCCCCGGGTGAACGAGGACCCCAAGGACACACTGCTGCGGGAATTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AAGAGGAGATTGCCCGCCTGAAGGCCCAGCTGGAGAAGAGGGGGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AAGAGGAGATTGCCCGCCTGAAGGCCCAGCTGGAGAAGAGGGGGATGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GGGAAGCGGCCCCGGAGGAAGAGCAGCCGCAGGAAGAAGGCCGTGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GGGAAGCGGCCCCGGAGGAAGAGCAGCCGCAGGAAGAAGGCCGTGTCCGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCCGCCTGGGTACCCTGAGGGCCCAGTGATTGAGGCCTGGGTGGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CCCGCCTGGGTACCCTGAGGGCCCAGTGATTGAGGCCTGGGTGGCAGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGGAGGATGACAACAACAACAACCACCGCCCGCCCCAGCCCATCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGGAGGATGACAACAACAACAACCACCGCCCGCCCCAGCCCATCCTGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCAGCCTTGGAGAAGAACATGGAGAATTACCTGCAGGAACAGAAGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCAGCCTTGGAGAAGAACATGGAGAATTACCTGCAGGAACAGAAGGAGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GCTGGAGGAGGAGAAGGCAGCCATCCAGGATGACCGCAGCCTGGTGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GCTGGAGGAGGAGAAGGCAGCCATCCAGGATGACCGCAGCCTGGTGAGCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGGAGAAGCAGAAGCTGCTGGAGGAGAAGGAGAAGATGCTGGAGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGGAGAAGCAGAAGCTGCTGGAGGAGAAGGAGAAGATGCTGGAGGACCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CGGCGGGAACAGCAGGCCACAGAGCTGCTTGCGGCCAAGTACAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101501 CGGCGGGAACAGCAGGCCACAGAGCTGCTTGCGGCCAAGTACAAGGTA..

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1546     GCCATGGAGAGCAAGCTCCTCATCGGGGGCAGGAACATCATGGATC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 .CAGGCCATGGAGAGCAAGCTCCTCATCGGGGGCAGGAACATCATGGATC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 ACACCAACGAACAGCAGAAGATGTTGGAACTGAAGAGGCAGGAGATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125520 ACACCAACGAACAGCAGAAGATGTTGGAACTGAAGAGGCAGGAGATTGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 GAGCAG         AAACGTCGTGAGCGGGAGATGCAGCAGGAGATGAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125570 GAGCAGGTA...TAGAAACGTCGTGAGCGGGAGATGCAGCAGGAGATGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 GCTCCGGGACGAGGAGACTATGGAGCTCCGGGGCACCTACACATCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126290 GCTCCGGGACGAGGAGACTATGGAGCTCCGGGGCACCTACACATCCCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 AGCAGGAGGTGGAGGTCAAAACCAAGAAACTCAAGAAG         CTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 126340 AGCAGGAGGTGGAGGTCAAAACCAAGAAACTCAAGAAGGTG...CAGCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 TACGCCAAGCTGCAGGCGGTGAAGGCGGAGATCCAGGACCAGCATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127536 TACGCCAAGCTGCAGGCGGTGAAGGCGGAGATCCAGGACCAGCATGATGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 GTATATCCGCGTGCGGCAGGACCTGGAGGAGGCGCAGAACGAGCAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127586 GTATATCCGCGTGCGGCAGGACCTGGAGGAGGCGCAGAACGAGCAGACCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 GCGAACTCAAGCTCAA         GTACCTAATCATCGAGAACTTCATC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 127636 GCGAACTCAAGCTCAAGTA...CAGGTACCTAATCATCGAGAACTTCATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 CCGCCGGAGGAGAAGAACAAGATCATGAACCGGCTTTTCCTGGACTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130038 CCGCCGGAGGAGAAGAACAAGATCATGAACCGGCTTTTCCTGGACTGTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 GGAGGAGCAGTGGAAGTTCCAGCCACTGGTGCCAGCCGGCGT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 130088 GGAGGAGCAGTGGAAGTTCCAGCCACTGGTGCCAGCCGGCGTGTG...CA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007  CAGTAGCAGCCAGATGAAGAAGCGGCCAACATCTGCAGTGGGCTACAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151854 GCAGTAGCAGCCAGATGAAGAAGCGGCCAACATCTGCAGTGGGCTACAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 AGGCCTATCAGCCAGTATGCTCGGGTTGCCATGGCAATGGGGTCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151904 AGGCCTATCAGCCAGTATGCTCGGGTTGCCATGGCAATGGGGTCCCACCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 CAGGTACAGG         GCTGAAAACATAATGTTTCTGGAGTTGGATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 151954 CAGGTACAGGGTA...CAGGCTGAAAACATAATGTTTCTGGAGTTGGATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 TGTCCCCTCCAGCTGTCTTTGAGATGGAATTCTCTCACGACCAAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152472 TGTCCCCTCCAGCTGTCTTTGAGATGGAATTCTCTCACGACCAAGAACAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2197 GACCCTCGTGCGCTACACATGGAGAGGCTCATGCGATTGGACAGCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152522 GACCCTCGTGCGCTACACATGGAGAGGCTCATGCGATTGGACAGCTTTCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2247 GGAAAGACCTTCCACGTCTAAAGTCCGAAAGTCCAGATCCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 152572 GGAAAGACCTTCCACGTCTAAAGTCCGAAAGTCCAGATCCTGGTC...CA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289  GTGCCAGAGTCCTCAGCGGCCTCCACCTTCCACCACACATGCCTCCCTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152846 GGTGCCAGAGTCCTCAGCGGCCTCCACCTTCCACCACACATGCCTCCCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 GCCTCTGCTTCTCTGCGCCCTGCAACAGTGGCGGACCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152896 GCCTCTGCTTCTCTGCGCCCTGCAACAGTGGCGGACCATGAG