Result of SIM4 for pF1KSDA1991

seq1 = pF1KSDA1991.tfa, 2124 bp
seq2 = pF1KSDA1991/gi568815587f_74648881.tfa (gi568815587f:74648881_74936727), 287847 bp

>pF1KSDA1991 2124
>gi568815587f:74648881_74936727 (Chr11)

1-502  (100001-100502)   100% ->
503-576  (140746-140819)   100% ->
577-723  (161304-161450)   100% ->
724-842  (168716-168834)   100% ->
843-942  (185796-185895)   100% ->
943-2124  (186666-187847)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTGCAGGTCCGAGTACTCGGGCCTCTTCCGCGGCGGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTGCAGGTCCGAGTACTCGGGCCTCTTCCGCGGCGGCAGCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCTCTGAGTCGGCGGGGCCGGCGGGGCCGCTGTGACGAGACGGCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCTCTGAGTCGGCGGGGCCGGCGGGGCCGCTGTGACGAGACGGCGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTAAGACTGGGGCCCCAGGCCCGGCTTCTGGACCTTCGCTGTTGGTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTAAGACTGGGGCCCCAGGCCCGGCTTCTGGACCTTCGCTGTTGGTGTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGCCGCCGTTGCTGCAGCCGCCGCTGCCGCCGCGGCCGGAGGAATCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGCCGCCGTTGCTGCAGCCGCCGCTGCCGCCGCGGCCGGAGGAATCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGCGCCGGGTGCCTGGAGCCCCCCGGAGAAGCAGCGGCCCTGCCGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGCGCCGGGTGCCTGGAGCCCCCCGGAGAAGCAGCGGCCCTGCCGTGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCACTCGCTTTGCCGAGGCTGCGCCCAACGCGCCGCCGACGCGGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCACTCGCTTTGCCGAGGCTGCGCCCAACGCGCCGCCGACGCGGCGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGGGTTGCCCTCGCTGCCGCGCCCGCGGCCCAGGCTGGGCCCGCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGGGTTGCCCTCGCTGCCGCGCCCGCGGCCCAGGCTGGGCCCGCCGTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCGCGACGACGGCCAGGCCGACTCAGAGGTGCTGGGCGAGTGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCCGCGACGACGGCCAGGCCGACTCAGAGGTGCTGGGCGAGTGCGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCGCAGCCAACCCGAGCGCTGCCGCCCGCGCCGGGACGGGGGCGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCGCAGCCAACCCGAGCGCTGCCGCCCGCGCCGGGACGGGGGCGCGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCGCGGGGCCCAGGCCAGAGCAGGAGCCGCGTGCCGCGCCTGCGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCGCGGGGCCCAGGCCAGAGCAGGAGCCGCGTGCCGCGCCTGCGGAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AG         ACTTTATATTCAGAGCACCAATCAAATTAAGCAAGCCTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGGTG...CAGACTTTATATTCAGAGCACCAATCAAATTAAGCAAGCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGGAACTTCGTGAGGAATATGAAAGCTTGAGAAAG         CTGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 140785 GGGAACTTCGTGAGGAATATGAAAGCTTGAGAAAGGTA...TAGCTGAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAAGAAAAGTTACAAGAGGAAAAACCCTCTGAAGATCAAATCCACAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161310 GAAGAAAAGTTACAAGAGGAAAAACCCTCTGAAGATCAAATCCACAAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GTTACCAGAGGATACAGAAACAGGGAAAAGGAAAATGGATGAACAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161360 GTTACCAGAGGATACAGAAACAGGGAAAAGGAAAATGGATGAACAGAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AAAGAGATGAACCATTAGTACTGAAAACAAATCTGGAACGT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 161410 AAAGAGATGAACCATTAGTACTGAAAACAAATCTGGAACGTGTA...CAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TGTCCTGCACGTCTCTCAGATTCAGAGAATGAAGAACCTTCTCGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168716 TGTCCTGCACGTCTCTCAGATTCAGAGAATGAAGAACCTTCTCGAGGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GATGACACAGACACATCGCTCGGCATTTGTTTCCAAGAACAACTCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168766 GATGACACAGACACATCGCTCGGCATTTGTTTCCAAGAACAACTCCTACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCTTAGCTTTCCTGGCAGG         GAAGCTAAACTCCAAGGTGGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 168816 CCTTAGCTTTCCTGGCAGGGTA...TAGGAAGCTAAACTCCAAGGTGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGGAGTCAGAGCTGTAGTGACACAGCCCAGGAAAGAGCGAAGAGCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185818 AGGAGTCAGAGCTGTAGTGACACAGCCCAGGAAAGAGCGAAGAGCAGAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CAGAGCAGTTCCAGGCAACAAAGCCAAG         GTCACAACTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 185868 CAGAGCAGTTCCAGGCAACAAAGCCAAGGTA...CAGGTCACAACTATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTCCAGCCTCCAACCCCATCATTGGTGTCCTCTTGTCAACTCAAAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186679 CTCCAGCCTCCAACCCCATCATTGGTGTCCTCTTGTCAACTCAAAACAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CGCTGCGTCTCGGCCCCTGACTTAACCATCGAAAAGCGTCTACCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186729 CGCTGCGTCTCGGCCCCTGACTTAACCATCGAAAAGCGTCTACCCTTCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CTCCCTTTCATCCTTGGCTTCCCTGCATAAGCCAGAGCGTTCTGTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186779 CTCCCTTTCATCCTTGGCTTCCCTGCATAAGCCAGAGCGTTCTGTCAGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CTGAGAGCAATGACAGCATCTCCGAAGAACTAAACCATTTCAAGCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186829 CTGAGAGCAATGACAGCATCTCCGAAGAACTAAACCATTTCAAGCCCATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GTCTGCTCACCATGTACTCCTCCCAAGAGACTCCCTGATGGCCGTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186879 GTCTGCTCACCATGTACTCCTCCCAAGAGACTCCCTGATGGCCGTGTGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 AAGTCCTCTCATCATCAAATCAACTCCACGCAACCTAAACAGAAGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186929 AAGTCCTCTCATCATCAAATCAACTCCACGCAACCTAAACAGAAGCCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 AAAAGCAGACTTCTTATGAGGCCAGTCCACGGATCCTCAAAAAGTGGGAA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186979 AGAAGCAGACTTCTTATGAGGCCAGTCCACGGATCCTCAAAAAGTGGGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 CAGATCTTTCAGGAGCGGCAGATCAAAAAGACCCTTTCAAAAGCCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187029 CAGATCTTTCAGGAGCGGCAGATCAAAAAGACCCTTTCAAAAGCCACTCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 TACCTCTCTGGCTCCTGAAATGGGGGAAGAGTTACTAGGCTCTGAAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187079 TACCTCTCTGGCTCCTGAAATGGGGGAAGAGTTACTAGGCTCTGAAGGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TCCATTCTAGCAAGGAGAAGCCACTTGTGGCTGTAAATACAAGATTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187129 TCCATTCTAGCAAGGAGAAGCCACTTGTGGCTGTAAATACAAGATTATCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GGTGGGCAGGTCCTCTCTGAGTATACTGGACCCACCTCTGCTGATCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187179 GGTGGGCAGGTCCTCTCTGAGTATACTGGACCCACCTCTGCTGATCTTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TCATTTCCCCTCTGTTAGCCAAACAAAAGCAGAACAGGACAGTGATAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187229 TCATTTCCCCTCTGTTAGCCAAACAAAAGCAGAACAGGACAGTGATAATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 AAAGTAGCACTGAGATCCCACTGGAAACCTGCTGTTCCTCAGAACTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187279 AAAGTAGCACTGAGATCCCACTGGAAACCTGCTGTTCCTCAGAACTCAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 GGGGGAGGCAGTGGGACTTCTTTGGAGAGGGAGCAGTTTGAGGGGTTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187329 GGGGGAGGCAGTGGGACTTCTTTGGAGAGGGAGCAGTTTGAGGGGTTAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 GTCAACTCCAGATGCCAAGTTAGACAAAACCTGTATAAGCAGAGCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187379 GTCAACTCCAGATGCCAAGTTAGACAAAACCTGTATAAGCAGAGCCATGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 AAATCACCACAGTTAATTCAGTGCTACCCCAAAACAGTGTTTTGGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187429 AAATCACCACAGTTAATTCAGTGCTACCCCAAAACAGTGTTTTGGGTGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 GTCCTCAAAACAAAGCAACAATTGAAGACATTAAATCATTTTGATCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187479 GTCCTCAAAACAAAGCAACAATTGAAGACATTAAATCATTTTGATCTGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 TAATGGTGTTCTAGTTGAGAGCCTAAGTGAAGAGCCACTTCCTTCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187529 TAATGGTGTTCTAGTTGAGAGCCTAAGTGAAGAGCCACTTCCTTCTTTGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 GTCGAGGCCGGAAAAGACACTGCAAGACCAAGCACTTAGAACAAAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187579 GTCGAGGCCGGAAAAGACACTGCAAGACCAAGCACTTAGAACAAAATGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 TCCCTTAAAAAACTGCGACAAACCAGTGGGGAGGTGGGTCTGGCCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187629 TCCCTTAAAAAACTGCGACAAACCAGTGGGGAGGTGGGTCTGGCCCCAAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 AGACCCAGTCCTGCGAGAGATGGAGCAGAAGCTTCAGCAAGAGGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187679 AGACCCAGTCCTGCGAGAGATGGAGCAGAAGCTTCAGCAAGAGGAAGAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 ACCGACAGTTGGCTCTGCAGTTGCAGCGCATGTTCGACAATGAGAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187729 ACCGACAGTTGGCTCTGCAGTTGCAGCGCATGTTCGACAATGAGAGGCGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 ACTGTGAGCCGGCGAAAAGGAAGTGTGGATCAGTATCTCCTACGGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187779 ACTGTGAGCCGGCGAAAAGGAAGTGTGGATCAGTATCTCCTACGGTCCAG

   2150     .    :    .
   2106 CAACATGGCCGGGGCCAAG
        |||||||||||||||||||
 187829 CAACATGGCCGGGGCCAAG

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