seq1 = pF1KSDA1754.tfa, 1641 bp
seq2 = pF1KSDA1754/gi568815588r_104214411.tfa (gi568815588r:104214411_104416051), 201641 bp

>pF1KSDA1754 1641
>gi568815588r:104214411_104416051 (Chr10)

(complement)

1-1641  (100001-101641)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCATGGGGCTCTTCCGCGTGTGTCTGGTGGTGGTGACGGCCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCATGGGGCTCTTCCGCGTGTGTCTGGTGGTGGTGACGGCCATCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACCACCCGCTGCTGTTCCCGCGGGAGAACGCCACAGTCCCCGAGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACCACCCGCTGCTGTTCCCGCGGGAGAACGCCACAGTCCCCGAGAACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGGAGATCATCCGCAAGATGCAGGCGCACCAGGAGAAGCTGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAGGAGATCATCCGCAAGATGCAGGCGCACCAGGAGAAGCTGCAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCAGTTGCGCCTGGAGGAGGAGGTGGCTCGGCTGGCGGCCGAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCAGTTGCGCCTGGAGGAGGAGGTGGCTCGGCTGGCGGCCGAAAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCACTGGAGCAGGTGGCGGAGGAGGGCAGGCAGCAGAACGAGACACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCACTGGAGCAGGTGGCGGAGGAGGGCAGGCAGCAGAACGAGACACGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCTGGGACCTCTGGAGCACCCTCTGCATGATCCTCTTCCTGATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCCTGGGACCTCTGGAGCACCCTCTGCATGATCCTCTTCCTGATGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGTGTGGCGGCAGGACCACCAGGAGGGGCCCTCACCTGAGTGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGTGTGGCGGCAGGACCACCAGGAGGGGCCCTCACCTGAGTGCCTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGTGAGGAGGATGAGCTGCCTGGGCTGGGGGGCGCCCCCTTGCAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGTGAGGAGGATGAGCTGCCTGGGCTGGGGGGCGCCCCCTTGCAGGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCACCCTGCCCAACAAGGCCACGCTTGGCCACTTTTATGAGCGCTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCACCCTGCCCAACAAGGCCACGCTTGGCCACTTTTATGAGCGCTGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGGGGGGCCACGGCCGATGCAGCCCGTACCCGGGAGTTCCTGGAAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGGGGGGCCACGGCCGATGCAGCCCGTACCCGGGAGTTCCTGGAAGGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGTGGATGACTTGCTGGAAGCCCTGAGGAGCCTCTGCAACCGGGACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGTGGATGACTTGCTGGAAGCCCTGAGGAGCCTCTGCAACCGGGACACCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACATGGAGGTGGAGGACTTCATTGGCGTGGACAGCATGTACGAGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACATGGAGGTGGAGGACTTCATTGGCGTGGACAGCATGTACGAGAACTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGGTGGACAGGCCACTGCTGTGCCACCTTTTCGTGCCCTTCACACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAGGTGGACAGGCCACTGCTGTGCCACCTTTTCGTGCCCTTCACACCCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGAGCCCTACCGCTTCCACCCAGAGCTCTGGTGCTCCGGCCGCTCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGAGCCCTACCGCTTCCACCCAGAGCTCTGGTGCTCCGGCCGCTCAGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCCTGGATCGCCAGGGCTACGGCCAGATCAAGGTGGTCCGCGCCGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCCTGGATCGCCAGGGCTACGGCCAGATCAAGGTGGTCCGCGCCGATGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GACACATTGAGCTGCATCTGCGGCAAGACCAAGCTCGGGGAAGACATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GACACATTGAGCTGCATCTGCGGCAAGACCAAGCTCGGGGAAGACATGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTGTCTCCTGCACGGCAGGAACAGCATGGCGCCTCCCTGCGGCGACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTGTCTCCTGCACGGCAGGAACAGCATGGCGCCTCCCTGCGGCGACATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGAACCTGCTGTGTGCCACAGATTCCCTGTACCTGGACACGATGCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGAACCTGCTGTGTGCCACAGATTCCCTGTACCTGGACACGATGCAGGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATGAAGTGGTTCCAGACGGCCCTCACCAGAGCCTGGAAGGGCATCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATGAAGTGGTTCCAGACGGCCCTCACCAGAGCCTGGAAGGGCATCGCCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAGTACGAGTTCGACCTGGCCTTTGGCCAGCTGGACAGCCCGGGGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAGTACGAGTTCGACCTGGCCTTTGGCCAGCTGGACAGCCCGGGGTCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGAAGATCAAGTTCCGTTCAGGGAAGTTCATGCCCTTCAACCTGATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGAAGATCAAGTTCCGTTCAGGGAAGTTCATGCCCTTCAACCTGATTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTGATCCAGTGTGATGACTCGGACCTGTACTTTGTCTCCCACCTTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTGATCCAGTGTGATGACTCGGACCTGTACTTTGTCTCCCACCTTCCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGAGCCCTCTGAGGGCACCCCAGCCTCCAGCACAGACTGGCTCCTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGAGCCCTCTGAGGGCACCCCAGCCTCCAGCACAGACTGGCTCCTGTCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTGCTGTCTATGAGCGACACTTCCTCAGGACGACACTAAAGGCACTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTGCTGTCTATGAGCGACACTTCCTCAGGACGACACTAAAGGCACTGCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAGGGCGCCTGCCACCTCAGCTGCCTGCAGATAGCATCCTTCCTGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GAGGGCGCCTGCCACCTCAGCTGCCTGCAGATAGCATCCTTCCTGCTCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CAAGCAGAGCCGCCTGACCGGTCCCAGCGGGCTCAGCAGCTACCACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CAAGCAGAGCCGCCTGACCGGTCCCAGCGGGCTCAGCAGCTACCACCTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGACGGCCCTACTGCACCTCCTACTCCTCCGGCAGGCCGCCGACTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGACGGCCCTACTGCACCTCCTACTCCTCCGGCAGGCCGCCGACTGGAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCGGGGCAGCTGGACGCTCGTCTGCACGAGTTGCTGTGCTTCCTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GCGGGGCAGCTGGACGCTCGTCTGCACGAGTTGCTGTGCTTCCTGGAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GAGCTTGCTCCAGAAGAAGCTCCACCACTTCTTCATCGGCAACCGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GAGCTTGCTCCAGAAGAAGCTCCACCACTTCTTCATCGGCAACCGCAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TGCCTGAGGCCATGGGACTCCCTGAGGCCGTGCTCAGGGCCGAGCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TGCCTGAGGCCATGGGACTCCCTGAGGCCGTGCTCAGGGCCGAGCCCCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AACCTCTTCCGGCCCTTCGTCCTGCAGCGAAGCCTTTACCGTAAGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AACCTCTTCCGGCCCTTCGTCCTGCAGCGAAGCCTTTACCGTAAGACACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GGACTCCTTCTATGAGATGCTCAAGAATGCCCCAGCGCTCATTAGCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GGACTCCTTCTATGAGATGCTCAAGAATGCCCCAGCGCTCATTAGCGAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ATTCCCTACATGTCCCCTCAGACCAGCCTACCCCAAAAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ATTCCCTACATGTCCCCTCAGACCAGCCTACCCCAAAAAGC