seq1 = pF1KSDA1427.tfa, 1278 bp
seq2 = pF1KSDA1427/gi568815587r_45144055.tfa (gi568815587r:45144055_45386207), 242153 bp

>pF1KSDA1427 1278
>gi568815587r:45144055_45386207 (Chr11)

(complement)

1-183  (100001-100183)   100% ->
184-409  (130317-130542)   100% ->
410-544  (131804-131938)   100% ->
545-846  (133486-133787)   100% ->
847-976  (139696-139825)   100% ->
977-1278  (141852-142153)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGCTGTCGGTGCCTGTGATCGCGCTGGGCGCCACGCTGGGCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGCTGTCGGTGCCTGTGATCGCGCTGGGCGCCACGCTGGGCACAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCAGCATCCTCGCGTTGTGCGGGGTCACCTGCCTGTGTCGGCACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCAGCATCCTCGCGTTGTGCGGGGTCACCTGCCTGTGTCGGCACATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCCCAAGAAGGGGCTGCTGCCGCGGGACCAGGACCCCGACCTGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCCCAAGAAGGGGCTGCTGCCGCGGGACCAGGACCCCGACCTGGAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGAAGCCCAGCTTGCTCGGGTCTGCACAACAG         TTCAATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100151 GCGAAGCCCAGCTTGCTCGGGTCTGCACAACAGGTG...CAGTTCAATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAAAAAGTCCACGGAACCTGTTCAGCCCCGTGCCCTCCTCAAGTTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130325 TAAAAAGTCCACGGAACCTGTTCAGCCCCGTGCCCTCCTCAAGTTCCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACATCTATGGACCCAGGCCAGCTGTGACGGCTCCAGAGGTCATCAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130375 ACATCTATGGACCCAGGCCAGCTGTGACGGCTCCAGAGGTCATCAACTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCAGACTATTCACTGAGGTCTACGGAGGAGCCCACTGCACCTGCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130425 GCAGACTATTCACTGAGGTCTACGGAGGAGCCCACTGCACCTGCCAGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCAACCCCCGAATGACAGTCGCCTCAAGAGGCAGGTCACAGAGGAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130475 CCAACCCCCGAATGACAGTCGCCTCAAGAGGCAGGTCACAGAGGAGCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCATCCTCCCTCAGAATG         GTGTGGTGGAGGATGTCTGTGTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 130525 TCATCCTCCCTCAGAATGGTA...CAGGTGTGGTGGAGGATGTCTGTGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGGAGACCTGGAACCCAGAGAAGGCTGCCAGTTGGAACCAGGCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131827 ATGGAGACCTGGAACCCAGAGAAGGCTGCCAGTTGGAACCAGGCCCCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACTCCACTACTGCCTGGACTATGACTGTCAGAAGGCAGAATTGTTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131877 ACTCCACTACTGCCTGGACTATGACTGTCAGAAGGCAGAATTGTTTGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTCGCCTGGAAG         CTGTGACCAGCAACCACGACGGAGGCTGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 131927 CTCGCCTGGAAGGTA...CAGCTGTGACCAGCAACCACGACGGAGGCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACTGCTACGTCCAAGGGAGTGTGGCCAATAGGACCGGCTCTGTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133515 GACTGCTACGTCCAAGGGAGTGTGGCCAATAGGACCGGCTCTGTGGAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCAGACAGCCCTAAAGAAGCGGCAGCTGCACACCACCTGGGAGGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133565 TCAGACAGCCCTAAAGAAGCGGCAGCTGCACACCACCTGGGAGGAGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGGTGCTCCCCCTGGCGGAGGAGGAGCTCCCCACAGCCACCCTGACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133615 TGGTGCTCCCCCTGGCGGAGGAGGAGCTCCCCACAGCCACCCTGACGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACCTTGAGGACCTGCGACCGCTTCTCCCGTCACAGCGTGGCCGGGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133665 ACCTTGAGGACCTGCGACCGCTTCTCCCGTCACAGCGTGGCCGGGGAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCGCCTGGGCCTGGACGGGACATCTGTGCCTCTAGGGGCTGCCCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133715 CCGCCTGGGCCTGGACGGGACATCTGTGCCTCTAGGGGCTGCCCAGTGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCGAGCTGAAGACTTCAGCGAAG         GAGCCATCTGCAGGAGCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 133765 GCGAGCTGAAGACTTCAGCGAAGGTA...CAGGAGCCATCTGCAGGAGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GGAGAGGTCCTACTATCCATCAGCTACCTCCCGGCTGCCAACCGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139714 GGAGAGGTCCTACTATCCATCAGCTACCTCCCGGCTGCCAACCGCCTCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGTGGTGCTGATTAAAGCCAAGAACCTCCACTCTAACCAGTCCAAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139764 GGTGGTGCTGATTAAAGCCAAGAACCTCCACTCTAACCAGTCCAAGGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TCCTGGGGAAGG         ATGTCTCTGTCAAGGTGACCTTGAAGCAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 139814 TCCTGGGGAAGGGTG...CAGATGTCTCTGTCAAGGTGACCTTGAAGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CAGGCTCGGAAGCTGAAGAAGAAGCAGACTAAACGAGCTAAGCACAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141881 CAGGCTCGGAAGCTGAAGAAGAAGCAGACTAAACGAGCTAAGCACAAGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAACCCCGTGTGGAACGAGATGATCATGTTTGAGCTGCCTGACGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141931 CAACCCCGTGTGGAACGAGATGATCATGTTTGAGCTGCCTGACGACCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TGCAGGCCTCCAGTGTGGAGCTGGAAGTGCTGGGCCAGGACGATTCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141981 TGCAGGCCTCCAGTGTGGAGCTGGAAGTGCTGGGCCAGGACGATTCAGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CAGAGCTGTGCGCTTGGCCACTGCAGCCTGGGCCTGCACACCTCGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142031 CAGAGCTGTGCGCTTGGCCACTGCAGCCTGGGCCTGCACACCTCGGGCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TGAGCGCAGCCACTGGGAGGAGATGCTCAAAAACCCTCGCCGGCAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142081 TGAGCGCAGCCACTGGGAGGAGATGCTCAAAAACCCTCGCCGGCAGATTG

   1300     .    :    .    :
   1256 CCATGTGGCACCAGCTGCACCTG
        |||||||||||||||||||||||
 142131 CCATGTGGCACCAGCTGCACCTG