Result of SIM4 for
pF1KSDA1394
seq1 = pF1KSDA1394.tfa, 2898 bp
seq2 = pF1KSDA1394/gi568815587f_67317356.tfa (gi568815587f:67317356_67524598), 207243 bp
>pF1KSDA1394 2898
>gi568815587f:67317356_67524598 (Chr11)
1-322 (100001-100322) 100% ->
323-412 (101076-101165) 100% ->
413-900 (101401-101888) 100% ->
901-1075 (102132-102306) 100% ->
1076-1161 (102398-102483) 100% ->
1162-1393 (103254-103485) 100% ->
1394-1674 (103584-103864) 100% ->
1675-2898 (106020-107243) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTGCCCACTGGCCCACCCTGCCCAAGACCTACCACTTCTGCCCTCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTGCCCACTGGCCCACCCTGCCCAAGACCTACCACTTCTGCCCTCTCA
50 . : . : . : . : . :
51 GCTCTCCCTGGATCCATCGGGTCCCGAGTGGGATTGCCCACTGGGCTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GCTCTCCCTGGATCCATCGGGTCCCGAGTGGGATTGCCCACTGGGCTCCA
100 . : . : . : . : . :
101 AGGACCTGGAGGAAGAGGGCCCCTGGGGAGGGGGCTCTGGCCTGCCGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 AGGACCTGGAGGAAGAGGGCCCCTGGGGAGGGGGCTCTGGCCTGCCGCCC
150 . : . : . : . : . :
151 ACAGGCTGCTTCCCTGGCTCCTGGCGCCAGGACGTGGGCCTGGACTGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 ACAGGCTGCTTCCCTGGCTCCTGGCGCCAGGACGTGGGCCTGGACTGCAA
200 . : . : . : . : . :
201 GGGATCCCCCGAGGGGGCCGAGGCCCGGGCTTGGACTGTCTACTACTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GGGATCCCCCGAGGGGGCCGAGGCCCGGGCTTGGACTGTCTACTACTACA
250 . : . : . : . : . :
251 GCCTCCTGCAGAGCTGTCTGCAGCAAGCTGGCCTTCCGGAGACTCAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 GCCTCCTGCAGAGCTGTCTGCAGCAAGCTGGCCTTCCGGAGACTCAGGAC
300 . : . : . : . : . :
301 CGCGGCCAGGTGCCCCGCACAG GCTGTCCTGGGGCGGAGGT
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
100301 CGCGGCCAGGTGCCCCGCACAGGTG...GAGGCTGTCCTGGGGCGGAGGT
350 . : . : . : . : . :
342 GACCTTGTGCGTTCTGGGCTCCCCCAGCACCTTTCTGCCTGTGCTGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101095 GACCTTGTGCGTTCTGGGCTCCCCCAGCACCTTTCTGCCTGTGCTGCTGG
400 . : . : . : . : . :
392 AGGGTGGGGTCCAGAGCCCGG GAAACATGCTCCTTTGCCTG
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
101145 AGGGTGGGGTCCAGAGCCCGGGTG...CAGGAAACATGCTCCTTTGCCTG
450 . : . : . : . : . :
433 TCCCCTGCTTGGCTGATGAAGGTGCCAGCACCCGGGCAGCCGGGTGAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101421 TCCCCTGCTTGGCTGATGAAGGTGCCAGCACCCGGGCAGCCGGGTGAGGC
500 . : . : . : . : . :
483 AGCCCTGCTAGTCTCCAAGGCTGTGAGCTTCCACCCTGGGGGCCTGACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101471 AGCCCTGCTAGTCTCCAAGGCTGTGAGCTTCCACCCTGGGGGCCTGACAT
550 . : . : . : . : . :
533 TCCTGGATGACTTTGTCCCCCCGCGCCGTGCCACCTACTTTTTGGCAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101521 TCCTGGATGACTTTGTCCCCCCGCGCCGTGCCACCTACTTTTTGGCAGGC
600 . : . : . : . : . :
583 CTGGGCCTGGGGCCTGGCCGGGGCCGAGAGGCAGCAGAACTCGCCCGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101571 CTGGGCCTGGGGCCTGGCCGGGGCCGAGAGGCAGCAGAACTCGCCCGTGA
650 . : . : . : . : . :
633 CCTGACCTGCCCCACAGGAGCTTCGGCTGAGCTGGCCCGGCTGCTGGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101621 CCTGACCTGCCCCACAGGAGCTTCGGCTGAGCTGGCCCGGCTGCTGGAGG
700 . : . : . : . : . :
683 ACCGGCTGCTGACAAGGCAGTTGCTGGCCCAGCAGGGTGGTGTGGCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101671 ACCGGCTGCTGACAAGGCAGTTGCTGGCCCAGCAGGGTGGTGTGGCTGTG
750 . : . : . : . : . :
733 CCAGCAACCCTGGCTTTCACCTACAAGCCGCCGGGGCTGCTGCGGGGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101721 CCAGCAACCCTGGCTTTCACCTACAAGCCGCCGGGGCTGCTGCGGGGAGG
800 . : . : . : . : . :
783 GGATGCCAGCCTAGGGCTACGGCTGGTGGAGCTGAGTGGCAAAGAGGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101771 GGATGCCAGCCTAGGGCTACGGCTGGTGGAGCTGAGTGGCAAAGAGGGCC
850 . : . : . : . : . :
833 AGGAGACGCTGGTGAAAGAGGAAGTGGAGGCTTTTCTGCGCTCCGAGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101821 AGGAGACGCTGGTGAAAGAGGAAGTGGAGGCTTTTCTGCGCTCCGAGGCC
900 . : . : . : . : . :
883 CTGGGTGATATCCTGCAG GTAGCTGTGAAGCTCAGTGGCTG
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
101871 CTGGGTGATATCCTGCAGGTA...CAGGTAGCTGTGAAGCTCAGTGGCTG
950 . : . : . : . : . :
924 GCGCTGGCGGGGGCGGCAGGCATGGCGTCTGCACCCGCGGGCAGAGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102155 GCGCTGGCGGGGGCGGCAGGCATGGCGTCTGCACCCGCGGGCAGAGCTGG
1000 . : . : . : . : . :
974 GTGCAGTGGTGGACACAGTGCTGGCGCTGCTGGAGAAGCTGGAGGAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102205 GTGCAGTGGTGGACACAGTGCTGGCGCTGCTGGAGAAGCTGGAGGAGGAG
1050 . : . : . : . : . :
1024 GAGAGTGTCCTGGTGGAGGCTGTGTACCCACCTGCCCAGCTGCCCTGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102255 GAGAGTGTCCTGGTGGAGGCTGTGTACCCACCTGCCCAGCTGCCCTGCTC
1100 . : . : . : . : . :
1074 AG ATGGTCCTTCACCCGGCCCCGGCCTGGCCGTGCGAATCT
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102305 AGGTG...CAGATGGTCCTTCACCCGGCCCCGGCCTGGCCGTGCGAATCT
1150 . : . : . : . : . :
1115 GTGCTGTGGTGTGTCGGACACAGGGTGATAGGCCACTGCTGAGCAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
102437 GTGCTGTGGTGTGTCGGACACAGGGTGATAGGCCACTGCTGAGCAAGGTG
1200 . : . : . : . : . :
1162 GTGGTGTGCGGCGTGGGCCGCGGGGACCGCCCTCTACGGCACCA
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102487 ...CAGGTGGTGTGCGGCGTGGGCCGCGGGGACCGCCCTCTACGGCACCA
1250 . : . : . : . : . :
1206 CAACTCCCTGCCGAGGACGCTGGAGGTGGCGCTGGCCCAGTGCGGCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103298 CAACTCCCTGCCGAGGACGCTGGAGGTGGCGCTGGCCCAGTGCGGCCTGG
1300 . : . : . : . : . :
1256 GCGAGGAGGCGCAGGTGGCGGCTGTGCGGCAGCGCGTCAAGGCGGCGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103348 GCGAGGAGGCGCAGGTGGCGGCTGTGCGGCAGCGCGTCAAGGCGGCGGCC
1350 . : . : . : . : . :
1306 GAGGCCGCGCTGGCCGCCGTGCTGGCTCTGGAGGCCGGCCTGAGTGCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103398 GAGGCCGCGCTGGCCGCCGTGCTGGCTCTGGAGGCCGGCCTGAGTGCCGA
1400 . : . : . : . : . :
1356 GCAGCGCGGCGGGCGCCGGGCGCACACGGACTTCCTGG GCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
103448 GCAGCGCGGCGGGCGCCGGGCGCACACGGACTTCCTGGGTG...CAGGCG
1450 . : . : . : . : . :
1397 TGGATTTCGCGCTGACAGCGGCCGGCGGCGTGCTGACCCCAGTGGCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103587 TGGATTTCGCGCTGACAGCGGCCGGCGGCGTGCTGACCCCAGTGGCCCTG
1500 . : . : . : . : . :
1447 GAGCTGAACGGCGGCCTGTGTCTGGAGGCGTGCGGCGCGCTGGAGGGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103637 GAGCTGAACGGCGGCCTGTGTCTGGAGGCGTGCGGCGCGCTGGAGGGGCT
1550 . : . : . : . : . :
1497 GTGGGCCGCGCCGCGGCTGGGGCCGGCGGCCGACGAGGCGGTGGCGGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103687 GTGGGCCGCGCCGCGGCTGGGGCCGGCGGCCGACGAGGCGGTGGCGGCGC
1600 . : . : . : . : . :
1547 CGCTGGTGGAGACCATGCTTCGGCGGTCGGCGCGCTGCCTCATGGAGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103737 CGCTGGTGGAGACCATGCTTCGGCGGTCGGCGCGCTGCCTCATGGAGGGA
1650 . : . : . : . : . :
1597 AAACAGCTGCTGGTGGTCGGCGCTGGCGGCGTCAGCAAGAAGTTCGTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103787 AAACAGCTGCTGGTGGTCGGCGCTGGCGGCGTCAGCAAGAAGTTCGTGTG
1700 . : . : . : . : . :
1647 GGAGGCGGCGCGCGACTACGGGCTCCAG CTGCACCTCGTGG
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
103837 GGAGGCGGCGCGCGACTACGGGCTCCAGGTG...CAGCTGCACCTCGTGG
1750 . : . : . : . : . :
1688 AGTCAGACCCCAACCACTTTGCATCCCAGTTGGTACAGACCTTCATCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106033 AGTCAGACCCCAACCACTTTGCATCCCAGTTGGTACAGACCTTCATCCAC
1800 . : . : . : . : . :
1738 TTTGACATGACAGAGCACCGGAGGGATGAGGAGAACGCACGGCTGCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106083 TTTGACATGACAGAGCACCGGAGGGATGAGGAGAACGCACGGCTGCTGGC
1850 . : . : . : . : . :
1788 AGAGTTGGTGCGGGCTCGCGGCCTCAAGCTAGATGGCTGCTTCTCCTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106133 AGAGTTGGTGCGGGCTCGCGGCCTCAAGCTAGATGGCTGCTTCTCCTACT
1900 . : . : . : . : . :
1838 GGGATGACTGCCTGGTGCTCACAGCCCTGCTCTGCCAGGAGCTAGGTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106183 GGGATGACTGCCTGGTGCTCACAGCCCTGCTCTGCCAGGAGCTAGGTCTG
1950 . : . : . : . : . :
1888 CCCTGCAGCTCCCCAGCTGCCATGCGCCTGGCTAAGCAGAAGAGCCTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106233 CCCTGCAGCTCCCCAGCTGCCATGCGCCTGGCTAAGCAGAAGAGCCTCAC
2000 . : . : . : . : . :
1938 CCAGCTGCACCTGTTGCACCACCATGGCCCACCCTGGCCTGCGCCCTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106283 CCAGCTGCACCTGTTGCACCACCATGGCCCACCCTGGCCTGCGCCCTCCC
2050 . : . : . : . : . :
1988 TCCATGCTGTGCCCTGCTGCCCACTGGAGAGTGAGGCTGATGTGGAGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106333 TCCATGCTGTGCCCTGCTGCCCACTGGAGAGTGAGGCTGATGTGGAGAGG
2100 . : . : . : . : . :
2038 GCCGTGCACCAGGTACCCCTGCCAGGTGTCATGAAGCTGGAGTTCGGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106383 GCCGTGCACCAGGTACCCCTGCCAGGTGTCATGAAGCTGGAGTTCGGGGC
2150 . : . : . : . : . :
2088 AGGTGCAGTGGGTGTCCGGCTGGTAGAGGATGCGCCACAGTGCCATGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106433 AGGTGCAGTGGGTGTCCGGCTGGTAGAGGATGCGCCACAGTGCCATGAGC
2200 . : . : . : . : . :
2138 ACTTTTCCCGGATTACCCGAGACTTGCAGGGCGAGGCCGACCACCCAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106483 ACTTTTCCCGGATTACCCGAGACTTGCAGGGCGAGGCCGACCACCCAGGC
2250 . : . : . : . : . :
2188 ATTGGGCTGGGCTGGGGCAATGCCATGCTGCTGATGGAGTTTGTGGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106533 ATTGGGCTGGGCTGGGGCAATGCCATGCTGCTGATGGAGTTTGTGGAGGG
2300 . : . : . : . : . :
2238 CACCGAGCACGACGTGGACCTGGTGTTGTTTGGTGGGCGGTTGCTGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106583 CACCGAGCACGACGTGGACCTGGTGTTGTTTGGTGGGCGGTTGCTGGCTG
2350 . : . : . : . : . :
2288 CCTTTGTCTCCGACAATGGCCCTACGAGGCTGCCTGGCTTCACTGAGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106633 CCTTTGTCTCCGACAATGGCCCTACGAGGCTGCCTGGCTTCACTGAGACG
2400 . : . : . : . : . :
2338 GCGGCCTGCATGCCCACCGGGCTGGCACCAGAGCAGGAGGCACAGATGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106683 GCGGCCTGCATGCCCACCGGGCTGGCACCAGAGCAGGAGGCACAGATGGT
2450 . : . : . : . : . :
2388 TCAGGCAGCCTTCCGCTGTTGCCTGGGCTGCGGGTTGCTCGATGGAGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106733 TCAGGCAGCCTTCCGCTGTTGCCTGGGCTGCGGGTTGCTCGATGGAGTCT
2500 . : . : . : . : . :
2438 TCAACGTGGAGCTCAAGCTGACCGGGGCTGGGCCTCGGCTTATCGAGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106783 TCAACGTGGAGCTCAAGCTGACCGGGGCTGGGCCTCGGCTTATCGAGATC
2550 . : . : . : . : . :
2488 AACCCCCGCATGGGTGGCTTCTACCTGCGTGATTGGATCCTGGAGCTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106833 AACCCCCGCATGGGTGGCTTCTACCTGCGTGATTGGATCCTGGAGCTCTA
2600 . : . : . : . : . :
2538 TGGTGTTGACCTGCTGCTGGCTGCTGTTATGGTGGCCTGTGGCTTGCGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106883 TGGTGTTGACCTGCTGCTGGCTGCTGTTATGGTGGCCTGTGGCTTGCGTC
2650 . : . : . : . : . :
2588 CTGCCCTGCCCACCCGCCCACGTGCTCGTGGCCATCTGGTGGGCGTCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106933 CTGCCCTGCCCACCCGCCCACGTGCTCGTGGCCATCTGGTGGGCGTCATG
2700 . : . : . : . : . :
2638 TGCCTTGTGTCCCAGCACCTGCAGGCCCTGAGTTCCACCGCCAGCCGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106983 TGCCTTGTGTCCCAGCACCTGCAGGCCCTGAGTTCCACCGCCAGCCGTGA
2750 . : . : . : . : . :
2688 GACCCTGCAGGCCCTGCACGACCGTGGACTGCTACGCCTCAATCTGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107033 GACCCTGCAGGCCCTGCACGACCGTGGACTGCTACGCCTCAATCTGCTGG
2800 . : . : . : . : . :
2738 AGGAGGCCCTGGTGCCTGGCGAGTATGAGGAGCCCTACTGCAGTGTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107083 AGGAGGCCCTGGTGCCTGGCGAGTATGAGGAGCCCTACTGCAGTGTGGCC
2850 . : . : . : . : . :
2788 TGTGCCGGACCCAGCCCCACCGAGGCCCGTCTCCGCCTGCTGGGCCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107133 TGTGCCGGACCCAGCCCCACCGAGGCCCGTCTCCGCCTGCTGGGCCTCTG
2900 . : . : . : . : . :
2838 CCAGGGCCTGGGCATCGATGGGCCCAGCTACCCTGTTGCCCACTTCCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107183 CCAGGGCCTGGGCATCGATGGGCCCAGCTACCCTGTTGCCCACTTCCTGT
2950 . :
2888 CTCACTTCAAA
|||||||||||
107233 CTCACTTCAAA