seq1 = pF1KSDA1138.tfa, 3663 bp
seq2 = pF1KSDA1138/gi568815579r_1716069.tfa (gi568815579r:1716069_1948358), 232290 bp

>pF1KSDA1138 3663
>gi568815579r:1716069_1948358 (Chr19)

(complement)

1-157  (100001-100157)   99% ->
158-1911  (119728-121481)   100% ->
1912-2016  (122416-122520)   100% ->
2017-2230  (124574-124787)   100% ->
2231-2394  (126677-126840)   99% ->
2395-2526  (127964-128095)   100% ->
2527-2650  (128302-128425)   100% ->
2651-2764  (129228-129341)   100% ->
2765-2902  (129516-129653)   100% ->
2903-3016  (129764-129877)   100% ->
3017-3090  (130579-130652)   100% ->
3091-3201  (131030-131140)   100% ->
3202-3317  (131546-131661)   100% ->
3318-3456  (131790-131928)   100% ->
3457-3577  (132014-132134)   100% ->
3578-3663  (132205-132290)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTACGCTCCACTGGCTTCTTCCGGGCCATTGACTGCCCCTATTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTACGCTCCACTGGCTTCTTCCGGGCCATTGACTGCCCCTATTGGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGGCGCCCGGGGGGCCCTGCCGGCGGCCCTACTGCCACTTCCGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGGGCGCCCGGGGGGCCCTGCCGGCGGCCCTACTGCCACTTCCGGCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGGGCCCGGGGCCCCGGCGCGCCCGGTGACGGCGGAGAGGCGCCCCCC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGGGCCCGGGGCTCCGGCGCGCCCGGTGACGGCGGAGAGGCGCCCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGCAG         GGCTGGGTTACGACCCCTACAACCCTGAGCTGCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCAGCAGGTA...CAGGGCTGGGTTACGACCCCTACAACCCTGAGCTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGCCCCCCGCGCAGAGGGAGAATGGCACCCTGGGCCTGGGGGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119762 CAAGCCCCCCGCGCAGAGGGAGAATGGCACCCTGGGCCTGGGGGAGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCGCCCGGATGTGCTGGAGTTGGAGCTGGTCAACCAGGCCATCGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119812 CGCGCCCGGATGTGCTGGAGTTGGAGCTGGTCAACCAGGCCATCGAGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGCGCAGTGAGGTGGAGCTGGAGCAGCGGCGCTACCGGGAGCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119862 GTGCGCAGTGAGGTGGAGCTGGAGCAGCGGCGCTACCGGGAGCTGCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACGACCCGTGAGCACCGCTCCGCCGAGGCCCCCGCCCTGGCGCCCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119912 GACGACCCGTGAGCACCGCTCCGCCGAGGCCCCCGCCCTGGCGCCCCGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCCCCAACGCCAGCCCCACTGTGGGCCCGGACGAGGATGCCTTCCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119962 GCCCCAACGCCAGCCCCACTGTGGGCCCGGACGAGGATGCCTTCCCACTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCTTCGACTACAGCCCCGGCAGCCACGGCCTATTAAGCCCTGATGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120012 GCCTTCGACTACAGCCCCGGCAGCCACGGCCTATTAAGCCCTGATGCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CTACCAGCCCACCCCACTGGCCGCCCCTGCCGAGCCGGGCAGCAAGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120062 CTACCAGCCCACCCCACTGGCCGCCCCTGCCGAGCCGGGCAGCAAGTACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CGCTGGCGTCCCTGGACAGGGGTCAGGGCAGAGGTGGAGGGGGTGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120112 CGCTGGCGTCCCTGGACAGGGGTCAGGGCAGAGGTGGAGGGGGTGGCGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCCCTGGAATACGTCCCCAAGGCTGTGAGCCAGCCCCGGCGGCACAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120162 GCCCTGGAATACGTCCCCAAGGCTGTGAGCCAGCCCCGGCGGCACAGCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCCCGTTCCCAGTGGCAAGTACGTGGTGGACAACTCCAGGCCACCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120212 CCCCGTTCCCAGTGGCAAGTACGTGGTGGACAACTCCAGGCCACCCACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACCTGGAGTATGACCCTCTCTCCAACTACTCGGCCCGGCACCTCAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120262 ACCTGGAGTATGACCCTCTCTCCAACTACTCGGCCCGGCACCTCAGCAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCCAGCTCCCGGGATGAGCGGGCCGCCAAGCGGCCCCGGGGCTCCCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120312 GCCAGCTCCCGGGATGAGCGGGCCGCCAAGCGGCCCCGGGGCTCCCGCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CAGTGAGCCCTACACACCTGCTCCCAAGAAGCTCTGTGACCCCTTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120362 CAGTGAGCCCTACACACCTGCTCCCAAGAAGCTCTGTGACCCCTTTGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GTTGCGATGCAAGGTTCTCAGACTCAGAAGATGAGGCCGCCACGGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120412 GTTGCGATGCAAGGTTCTCAGACTCAGAAGATGAGGCCGCCACGGTCCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGTAACGAGCCCACCACGGCCAGCACCCCCAAAGCCAGGGCCGACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120462 GGTAACGAGCCCACCACGGCCAGCACCCCCAAAGCCAGGGCCGACCCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GATCAAGGCCACCGGGCAGCCACCCTCCAAAGAGGGCCTGGAGGCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120512 GATCAAGGCCACCGGGCAGCCACCCTCCAAAGAGGGCCTGGAGGCCGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GGGGCGGCCTGCGGGAGACCAAGGAGACGGCCGTGCAGTGCGACGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120562 GGGGCGGCCTGCGGGAGACCAAGGAGACGGCCGTGCAGTGCGACGTGGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GACCTCCAGCCGCCCCCAGCCAAGCCCGCCTCCCCAGCCCAGGTCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120612 GACCTCCAGCCGCCCCCAGCCAAGCCCGCCTCCCCAGCCCAGGTCCAGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CTCACAGGATGGGGGCTGCCCCAAGGAGGGAAAACCCAAGAAGAAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120662 CTCACAGGATGGGGGCTGCCCCAAGGAGGGAAAACCCAAGAAGAAAAAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CCGGGGCCCCACCTGCCCCCAGCTGCAAAGACGGGGCCCAGGGGAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120712 CCGGGGCCCCACCTGCCCCCAGCTGCAAAGACGGGGCCCAGGGGAAGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AAGACCAAGGACAAGGGCCGAGGGCGGCCTGTGGAGAAGCCCCGTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120762 AAGACCAAGGACAAGGGCCGAGGGCGGCCTGTGGAGAAGCCCCGTGCGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CAAGAAGGGCCCGCAGGCCAGCAGCCCCCGGCGCAAGGCAGAGCGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120812 CAAGAAGGGCCCGCAGGCCAGCAGCCCCCGGCGCAAGGCAGAGCGGCCGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AAGGGACCAAGAAGAAGCCATCTTCGGCCACTCCTGTGGCCACCTCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120862 AAGGGACCAAGAAGAAGCCATCTTCGGCCACTCCTGTGGCCACCTCAGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AAAGGGAGGCCTGACCGGCCAGCGCGGCGGCCGAGCCCCACAAGCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120912 AAAGGGAGGCCTGACCGGCCAGCGCGGCGGCCGAGCCCCACAAGCGGGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CTCCCGACCGGCGGCCGGCAGAGGCCCACCCCGCCCCCTCCAGCTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120962 CTCCCGACCGGCGGCCGGCAGAGGCCCACCCCGCCCCCTCCAGCTGCCCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 ACAGGAAGAGCACCAAGGCCCCGTCGGGGAAGCTAGTGGAGCGGAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121012 ACAGGAAGAGCACCAAGGCCCCGTCGGGGAAGCTAGTGGAGCGGAAAGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 CGCTCACTAGACGAGGGCGCCTCCCAGGACGCCCCCAAGCTGAAGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121062 CGCTCACTAGACGAGGGCGCCTCCCAGGACGCCCCCAAGCTGAAGAAGCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 GGCCCTGAGCCACGCCGACCTCTTTGGGGACGAGAGTGAGGACGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121112 GGCCCTGAGCCACGCCGACCTCTTTGGGGACGAGAGTGAGGACGAGGCCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 CAGGGCCAGGGGTGCCGAGCGTGTGGCCCTCTGCCCTCCCCAGCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121162 CAGGGCCAGGGGTGCCGAGCGTGTGGCCCTCTGCCCTCCCCAGCCTCAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 TCGGACTCAGACTCCGACTCAGACTCCAGCCTGGGCTTCCCGGAGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121212 TCGGACTCAGACTCCGACTCAGACTCCAGCCTGGGCTTCCCGGAGGCGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 GGGGCCGCCCAAGCGGCTCAAGGCCTCCCCGCCCCCCTCCCCCGCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121262 GGGGCCGCCCAAGCGGCTCAAGGCCTCCCCGCCCCCCTCCCCCGCCCCAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACCTCCAGCGCGGGGGCGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121312 CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACCTCCAGCGCGGGGGCGGATGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 GACTACTCGGCCCTGGAGAAGGAGGTGGACTTTGACTCCGACCCCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121362 GACTACTCGGCCCTGGAGAAGGAGGTGGACTTTGACTCCGACCCCATGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 GGAGTGCCTGCGGATCTTCAACGAGTCCACCAGCGTCAAGACGGAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121412 GGAGTGCCTGCGGATCTTCAACGAGTCCACCAGCGTCAAGACGGAGGACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 GAGGCCGGCTGGCCCGGCAG         CCCCCCAAGGAAGAGAAGAGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 121462 GAGGCCGGCTGGCCCGGCAGGTG...TAGCCCCCCAAGGAAGAGAAGAGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1933 GAGGAGAAGGGGCTTTCGGGTCTGACCACTCTGTTCCCCGGGCAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122437 GAGGAGAAGGGGCTTTCGGGTCTGACCACTCTGTTCCCCGGGCAGAAGAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1983 GAGGATCTCCCACCTTTCCAAGCAAGGCCAGGAG         GTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 122487 GAGGATCTCCCACCTTTCCAAGCAAGGCCAGGAGGTA...CAGGTGGAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 CCCCGAGGAGGGGTCCCGCGGTGCCCCCGGCCCGGCCCCCGACGGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124581 CCCCGAGGAGGGGTCCCGCGGTGCCCCCGGCCCGGCCCCCGACGGCGCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2074 GAGGTGTGCTACCTGCGGGCCCAGCAGGCGCAGAGGGCATCGGCGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124631 GAGGTGTGCTACCTGCGGGCCCAGCAGGCGCAGAGGGCATCGGCGAGCTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2124 GCTGCAGGCCCCCGCCAGGCTGGCAGAGAAGTCGCCCTCCGTCCACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124681 GCTGCAGGCCCCCGCCAGGCTGGCAGAGAAGTCGCCCTCCGTCCACATTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2174 CCGCCCCTGGCGAGAAGAGGAGGATCGCCCACATCCCCAACCCCCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124731 CCGCCCCTGGCGAGAAGAGGAGGATCGCCCACATCCCCAACCCCCGCCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2224 GCTGCAG         CCCCCACAGGTGCCAAGAGGACCCTTGCGGCCAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124781 GCTGCAGGTG...CAGCCCCCACAGGTGCCAAGAGGACCCTTGCGGCCAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2265 CGGCAGCCAGCCCTCCAACGGCCCTGAGCCAGGTGGCCAGCAGCTGAAAA
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126711 CGGCAGCCAGTCCTCCAACGGCCCTGAGCCAGGTGGCCAGCAGCTGAAAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2315 CACGCACATTGTCGGGGATGGCGTCCAAGACTACCACCACCATCATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126761 CACGCACATTGTCGGGGATGGCGTCCAAGACTACCACCACCATCATCCCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2365 AAGCGAATCGCCCACAGTCCATCCTTACAG         AGTTTAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 126811 AAGCGAATCGCCCACAGTCCATCCTTACAGGTA...TAGAGTTTAAAGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2406 ACCCATTATCCCCAAAGAGTTTGGGGGCAAAGTCCCCACCGTCATCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127975 ACCCATTATCCCCAAAGAGTTTGGGGGCAAAGTCCCCACCGTCATCCGCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2456 AGCGCTATCTCAACCTGTTCATCGAGGAGTGTCTCAAGTTCTGTACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128025 AGCGCTATCTCAACCTGTTCATCGAGGAGTGTCTCAAGTTCTGTACCTCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2506 AACCAGGAGGCCATAGAGAAG         GCACTGAACGAGGAGAAGGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128075 AACCAGGAGGCCATAGAGAAGGTG...CAGGCACTGAACGAGGAGAAGGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2547 GGCCTATGACCGCAGCCCCAGCAAGAACATCTACCTGAATGTGGCCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128322 GGCCTATGACCGCAGCCCCAGCAAGAACATCTACCTGAATGTGGCCGTGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2597 ACACCCTCAAGAAGCTCAGGGGCCTGGCCCCCAGCGCTGTGCCCGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128372 ACACCCTCAAGAAGCTCAGGGGCCTGGCCCCCAGCGCTGTGCCCGGCCTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2647 AGCA         AAACCAGTGGCCGCAGGGTTGTGTCCCACGAGGTGGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128422 AGCAGTG...CAGAAACCAGTGGCCGCAGGGTTGTGTCCCACGAGGTGGT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2688 GTTGGGGGGCAGGTTGGCCGCCAAGACCAGCTTCTCGCTCAGCCGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129265 GTTGGGGGGCAGGTTGGCCGCCAAGACCAGCTTCTCGCTCAGCCGTCCAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2738 GCAGCCCCCGGGTGGAGGACCTGAAAG         GGGCTGCCCTGTAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 129315 GCAGCCCCCGGGTGGAGGACCTGAAAGGTA...CAGGGGCTGCCCTGTAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2779 AGCCGCCTCAGGGAGTACCTGCTCACCCAGGACCAGCTCAAGGAGAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129530 AGCCGCCTCAGGGAGTACCTGCTCACCCAGGACCAGCTCAAGGAGAACGG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2829 CTACCCCTTCCCGCACCCAGAGCGGCCCGGGGGCGCAATCATCTTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129580 CTACCCCTTCCCGCACCCAGAGCGGCCCGGGGGCGCAATCATCTTCACAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2879 CTGAGGAGAAGAGGCCCAAGGACT         CTTCCTGCAGGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 129630 CTGAGGAGAAGAGGCCCAAGGACTGTG...CAGCTTCCTGCAGGACCTGC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2920 TGCCGCTGTGGCACCGAGTACCTCGTGTCCTCTTCAGGCCGCTGCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129781 TGCCGCTGTGGCACCGAGTACCTCGTGTCCTCTTCAGGCCGCTGCATCCG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2970 GGACGAGGAGTGTTATTACCACTGGGGACGGCTGCGCCGGAACCGGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 129831 GGACGAGGAGTGTTATTACCACTGGGGACGGCTGCGCCGGAACCGGGGTA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3017       TGGCCGGAGGCTGGGAGACCCAGTACATGTGCTGCTCGGCTGCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129881 ...CAGTGGCCGGAGGCTGGGAGACCCAGTACATGTGCTGCTCGGCTGCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3061 GCCGGCTCTGTCGGCTGCCAAGTCGCAAAG         CAACACGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 130623 GCCGGCTCTGTCGGCTGCCAAGTCGCAAAGGTG...CAGCAACACGTGCA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3102 GGATGGCCGGAAGGAGCGCCTTGAGGGCTTCGTGAAGACCTTTGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131041 GGATGGCCGGAAGGAGCGCCTTGAGGGCTTCGTGAAGACCTTTGAGAAAG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3152 AGCTCTCAGGAGACACCCACCCGGGGATCTACGCCCTGGACTGCGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131091 AGCTCTCAGGAGACACCCACCCGGGGATCTACGCCCTGGACTGCGAGATG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3202          TCCTACACCACATATGGCCTGGAGCTGACGCGCGTCACGGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131141 GTG...CAGTCCTACACCACATATGGCCTGGAGCTGACGCGCGTCACGGT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3243 GGTCGACACGGACGTGCACGTGGTTTATGACACCTTCGTGAAGCCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131587 GGTCGACACGGACGTGCACGTGGTTTATGACACCTTCGTGAAGCCTGACA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3293 ACGAGATCGTGGACTACAACACCAG         GTTTTCGGGGGTGACG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 131637 ACGAGATCGTGGACTACAACACCAGGTG...CAGGTTTTCGGGGGTGACG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3334 GAGGCTGACCTTGCCGACACAAGTGTCACGCTGCGTGACGTCCAGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131806 GAGGCTGACCTTGCCGACACAAGTGTCACGCTGCGTGACGTCCAGGCCGT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3384 TCTGCTGAGCATGTTCAGCGCTGACACCATCCTCATCGGACACAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131856 TCTGCTGAGCATGTTCAGCGCTGACACCATCCTCATCGGACACAGCCTGG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3434 AGAGCGACCTCCTGGCCCTGAAG         GTCATCCACAGCACCGTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 131906 AGAGCGACCTCCTGGCCCTGAAGGTG...CAGGTCATCCACAGCACCGTG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3475 GTGGACACGTCTGTGCTCTTCCCCCACCGCCTGGGCCTCCCCTACAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132032 GTGGACACGTCTGTGCTCTTCCCCCACCGCCTGGGCCTCCCCTACAAGCG

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3525 GTCCCTGCGGAACCTCATGGCCGACTACCTCAGACAGATCATCCAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132082 GTCCCTGCGGAACCTCATGGCCGACTACCTCAGACAGATCATCCAGGACA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3575 ATG         TGGATGGGCACAGCTCCAGCGAGGACGCCGGCGCCTGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132132 ATGGTG...CAGTGGATGGGCACAGCTCCAGCGAGGACGCCGGCGCCTGC

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3616 ATGCACCTGGTGATCTGGAAGGTTCGAGAAGACGCCAAGACCAAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132243 ATGCACCTGGTGATCTGGAAGGTTCGAGAAGACGCCAAGACCAAGCGA