seq1 = pF1KSDA1004.tfa, 3486 bp
seq2 = pF1KSDA1004/gi568815587f_67021317.tfa (gi568815587f:67021317_67355052), 333736 bp

>pF1KSDA1004 3486
>gi568815587f:67021317_67355052 (Chr11)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-181  (158763-158901)   100% ->
182-260  (160004-160082)   100% ->
261-307  (160530-160576)   100% ->
308-486  (186194-186372)   100% ->
487-593  (194024-194130)   100% ->
594-687  (194540-194633)   100% ->
688-841  (196415-196568)   100% ->
842-957  (197972-198087)   100% ->
958-1084  (206721-206847)   99% ->
1085-1479  (210250-210644)   100% ->
1480-1563  (221693-221776)   100% ->
1564-1833  (223873-224142)   100% ->
1834-1965  (224669-224800)   100% ->
1966-2055  (226965-227054)   100% ->
2056-2768  (228770-229482)   100% ->
2769-2932  (231378-231541)   100% ->
2933-3091  (232137-232295)   100% ->
3092-3307  (232887-233102)   100% ->
3308-3486  (233558-233736)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAACCCGAAGAAGAAAGGATTCGTTACAGCCAGAGATTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGGAACCCGAAGAAGAAAGGATTCGTTACAGCCAGAGATTGGTT...TA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  CGTGGTACCATGCGACGACGCTATGAAGATGATGGCATTTCAGATGATG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158762 GCGTGGTACCATGCGACGACGCTATGAAGATGATGGCATTTCAGATGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAATTGAAGGAAAAAGAACTTTTGACTTGGAAGAGAAACTGCACACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158812 AAATTGAAGGAAAAAGAACTTTTGACTTGGAAGAGAAACTGCACACCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAATATAATGCCAATTTTGTTACTTTTATGGAAGGAAAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 158862 AAATATAATGCCAATTTTGTTACTTTTATGGAAGGAAAAGGTC...CAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTTTAATGTAGAGTATATTCAGCGGGGTGGCTTGAGAGATCCTCTGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160005 TTTTAATGTAGAGTATATTCAGCGGGGTGGCTTGAGAGATCCTCTGATTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAAGAATTCTGATGGACTCGGAATAAA         AATGCCGGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 160055 TCAAGAATTCTGATGGACTCGGAATAAAGTA...TAGAATGCCGGATCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GACTTCACTGTGAATGATGTCAAAATGTGTGTGG         GGAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 160543 GACTTCACTGTGAATGATGTCAAAATGTGTGTGGGTA...CAGGGAGTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TCGCATGGTGGATGTCATGGACGTGAACACACAGAAAGGCATTGAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186201 TCGCATGGTGGATGTCATGGACGTGAACACACAGAAAGGCATTGAAATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCATGGCTCAGTGGACACGCTACTATGAGACCCCAGAGGAGGAGCGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186251 CCATGGCTCAGTGGACACGCTACTATGAGACCCCAGAGGAGGAGCGAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAACTCTATAATGTCATCAGCCTCGAGTTTAGCCACACCAGGCTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186301 AAACTCTATAATGTCATCAGCCTCGAGTTTAGCCACACCAGGCTGGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TATGGTGCAGAGGCCCTCCACG         GTGGATTTCATTGACTGGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 186351 TATGGTGCAGAGGCCCTCCACGGTT...AAGGTGGATTTCATTGACTGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TAGACAACATGTGGCCAAGGCACTTGAAGGAAAGCCAGACTGAATCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194043 TAGACAACATGTGGCCAAGGCACTTGAAGGAAAGCCAGACTGAATCAACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AATGCCATCTTGGAGATGCAGTACCCTAAAGTGCAGAA         GTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 194093 AATGCCATCTTGGAGATGCAGTACCCTAAAGTGCAGAAGTA...CAGGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTGTCTAATGAGTGTTCGAGGCTGCTATACTGACTTCCATGTGGACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194543 CTGTCTAATGAGTGTTCGAGGCTGCTATACTGACTTCCATGTGGACTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GTGGTACCTCTGTTTGGTATCACATCCATCAAGGGGGAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 194593 GTGGTACCTCTGTTTGGTATCACATCCATCAAGGGGGAAAGGTA...CAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GTCTTCTGGCTCATCCCCCCTACAGCCCACAACCTGGAGCTGTACGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196415 GTCTTCTGGCTCATCCCCCCTACAGCCCACAACCTGGAGCTGTACGAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TTGGCTGCTGTCAGGGAAACAGGGAGACATCTTTCTGGGTGACCGGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196465 TTGGCTGCTGTCAGGGAAACAGGGAGACATCTTTCTGGGTGACCGGGTAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CAGATTGTCAGCGCATTGAGCTCAAGCAGGGCTATACCTTCGTCATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196515 CAGATTGTCAGCGCATTGAGCTCAAGCAGGGCTATACCTTCGTCATTCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TCAG         GCTGGATTCATGCTGTGTATACTCCTACAGACACATT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196565 TCAGGTA...TAGGCTGGATTCATGCTGTGTATACTCCTACAGACACATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGTGTTTGGGGGCAATTTTTTGCATAGCTTCAACATCCCTATGCAGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198009 AGTGTTTGGGGGCAATTTTTTGCATAGCTTCAACATCCCTATGCAGTTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AAATATACAACATTGAAGATCGGACACGG         GTTCCAAATAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 198059 AAATATACAACATTGAAGATCGGACACGGGTA...TAGGTTCCAAATAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TTTCGCTATCCATTCTACTATGAGATGTGTTGGTATGTGTTGGAGCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206733 TTTCGCTATCCATTCTACTATGAGATGTGTTGGTATGTGTTGGAGCGCTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGTGTACTGCATAACCAACCGTTCCCACCTAACCAAGGAATTTCAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 206783 TGTGTACTGCATAACCAACCGTTCCCACCTAACTAAGGAATTTCAGAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGTCCCTCAGCATGG         ATTTGGAGTTAAATGGGTTGGAGTCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 206833 AGTCCCTCAGCATGGGTA...TAGATTTGGAGTTAAATGGGTTGGAGTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GGGAATGGGGATGAGGAAGCAGTGGATCGAGAACCCCGACGCTTGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210276 GGGAATGGGGATGAGGAAGCAGTGGATCGAGAACCCCGACGCTTGAGCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CAGGCGTTCTGTCCTCACTAGCCCTGTAGCGAATGGAGTCAACCTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210326 CAGGCGTTCTGTCCTCACTAGCCCTGTAGCGAATGGAGTCAACCTGGATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ATGATGGACTGGGCAAAACCTGCCGAAGTCTTCCAAGTCTGAAGAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210376 ATGATGGACTGGGCAAAACCTGCCGAAGTCTTCCAAGTCTGAAGAAAACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TTGGCTGGGGACTCATCTTCTGACTGTAGCCGGGGCTCCCACAATGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210426 TTGGCTGGGGACTCATCTTCTGACTGTAGCCGGGGCTCCCACAATGGACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AGTGTGGGATCCCCAGTGTGCTCCCCGAAAGGACAGGCAAGTGCATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210476 AGTGTGGGATCCCCAGTGTGCTCCCCGAAAGGACAGGCAAGTGCATCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CCCATTTTGAGCTTGAAGGCCTTCGCTGCCTTGTAGATAAGTTGGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210526 CCCATTTTGAGCTTGAAGGCCTTCGCTGCCTTGTAGATAAGTTGGAGTCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CTGCCACTGCACAAGAAATGTGTCCCCACAGGGATAGAAGATGAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210576 CTGCCACTGCACAAGAAATGTGTCCCCACAGGGATAGAAGATGAAGATGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TCTCATTGCTGATGTAAAG         ATTTTGCTGGAGGAGCTTGCCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 210626 TCTCATTGCTGATGTAAAGGTA...TAGATTTTGCTGGAGGAGCTTGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ACAGCGATCCCAAGTTAGCCCTCACTGGAGTTCCTATAGTACAGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221715 ACAGCGATCCCAAGTTAGCCCTCACTGGAGTTCCTATAGTACAGTGGCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AAAAGGGATAAG         CTTAAATTCCCCACTCGGCCAAAGGTGCG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 221765 AAAAGGGATAAGGTA...CAGCTTAAATTCCCCACTCGGCCAAAGGTGCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GGTTCCTACCATCCCCATTACGAAGCCTCACACTATGAAACCAGCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223902 GGTTCCTACCATCCCCATTACGAAGCCTCACACTATGAAACCAGCTCCAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GGTTAACACCTGTGAGGCCAGCTGCTGCCTCCCCGATTGTGTCAGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223952 GGTTAACACCTGTGAGGCCAGCTGCTGCCTCCCCGATTGTGTCAGGAGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AGACGGAGACGAGTGCGATGTCGAAAATGCAAAGCCTGTGTGCAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224002 AGACGGAGACGAGTGCGATGTCGAAAATGCAAAGCCTGTGTGCAAGGAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GTGTGGTGTTTGCCACTACTGCAGAGACATGAAGAAGTTTGGGGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224052 GTGTGGTGTTTGCCACTACTGCAGAGACATGAAGAAGTTTGGGGGGCCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 GACGCATGAAGCAGTCCTGTGTCCTCCGACAGTGCTTGGCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 224102 GACGCATGAAGCAGTCCTGTGTCCTCCGACAGTGCTTGGCAGTG...TAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CCCAGACTGCCTCACTCAGTCACATGTTCCCTCTGTGGAGAGGTGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224669 CCCAGACTGCCTCACTCAGTCACATGTTCCCTCTGTGGAGAGGTGGATCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GAATGAAGAGACACAAGACTTTGAGAAGAAACTCATGGAATGCTGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224719 GAATGAAGAGACACAAGACTTTGAGAAGAAACTCATGGAATGCTGTATCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 GCAATGAGATTGTTCATCCTGGCTGCCTCCAG         ATGGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 224769 GCAATGAGATTGTTCATCCTGGCTGCCTCCAGGTG...TAGATGGACGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GAGGGGTTGCTTAACGAAGAATTGCCAAATTGCTGGGAATGTCCAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226974 GAGGGGTTGCTTAACGAAGAATTGCCAAATTGCTGGGAATGTCCAAAGTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CTACCAGGAGGACAGCTCGGAGAAAGCCCAG         AAGCGGAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 227024 CTACCAGGAGGACAGCTCGGAGAAAGCCCAGGTA...CAGAAGCGGAAAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TGGAAGAGAGTGACGAAGAAGCTGTGCAAGCCAAAGTCCTGCGGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228780 TGGAAGAGAGTGACGAAGAAGCTGTGCAAGCCAAAGTCCTGCGGCCCCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 CGGAGCTGCGATGAGCCTCTCACGCCCCCGCCTCATTCACCCACTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228830 CGGAGCTGCGATGAGCCTCTCACGCCCCCGCCTCATTCACCCACTTCCAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 GCTGCAGCTCATCCATGACCCGGTTTCCCCCCGGGGTATGGTGACTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228880 GCTGCAGCTCATCCATGACCCGGTTTCCCCCCGGGGTATGGTGACTCGGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 CATCCCCTGGGGCTGGCCCCAGCGACCACCACAGTGCCAGCCGCGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228930 CATCCCCTGGGGCTGGCCCCAGCGACCACCACAGTGCCAGCCGCGATGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 CGCTTCAAACGGCGGCAGTTGCTGCGGCTGCAGGCCACAGAGCGCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228980 CGCTTCAAACGGCGGCAGTTGCTGCGGCTGCAGGCCACAGAGCGCACCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GGTACGGGAAAAGGAGAACAATCCCAGCGGCAAAAAGGAGCTGTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229030 GGTACGGGAAAAGGAGAACAATCCCAGCGGCAAAAAGGAGCTGTCTGAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TTGAGAAAGCCAAGATCCGGGGATCGTACCTCACTGTCACGCTACAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229080 TTGAGAAAGCCAAGATCCGGGGATCGTACCTCACTGTCACGCTACAGAGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 CCCACCAAAGAGCTCCACGGGACATCCATTGTGCCCAAGCTGCAGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229130 CCCACCAAAGAGCTCCACGGGACATCCATTGTGCCCAAGCTGCAGGCCAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 CACGGCCTCCTCTGCCAACCTTCGCCATTCCCCCCGTGTGCTAGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229180 CACGGCCTCCTCTGCCAACCTTCGCCATTCCCCCCGTGTGCTAGTGCAGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 ACTGCCCAGCCCGAACCCCCCAGCGTGGGGATGAGGAGGGGCTGGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229230 ACTGCCCAGCCCGAACCCCCCAGCGTGGGGATGAGGAGGGGCTGGGGGGA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2566 GAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGATGACAGTGCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229280 GAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGATGACAGTGCAGAGGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2616 GGGGGGTGCAGCCAGGCTGAATGGCCGGGGCAGTTGGGCTCAGGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229330 GGGGGGTGCAGCCAGGCTGAATGGCCGGGGCAGTTGGGCTCAGGATGGAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2666 ACGAAAGCTGGATGCAGCGGGAGGTCTGGATGTCTGTCTTCCGCTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229380 ACGAAAGCTGGATGCAGCGGGAGGTCTGGATGTCTGTCTTCCGCTACCTC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2716 AGCCGCAGAGAACTTTGTGAATGTATGCGAGTGTGCAAGACGTGGTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229430 AGCCGCAGAGAACTTTGTGAATGTATGCGAGTGTGCAAGACGTGGTATAA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2766 ATG         GTGCTGCGACAAGAGACTTTGGACAAAAATTGACTTGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229480 ATGGTG...CAGGTGCTGCGACAAGAGACTTTGGACAAAAATTGACTTGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2807 GTAGGTGTAAGGCCATTGTGCCCCAGGCCCTCAGTGGCATCATCAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231416 GTAGGTGTAAGGCCATTGTGCCCCAGGCCCTCAGTGGCATCATCAAGAGG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2857 CAGCCAGTCAGCCTTGACCTCAGTTGGACCAACATCTCTAAAAAGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231466 CAGCCAGTCAGCCTTGACCTCAGTTGGACCAACATCTCTAAAAAGCAACT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2907 GACATGGCTCGTCAATAGGCTGCCAG         GACTGAAAGACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 231516 GACATGGCTCGTCAATAGGCTGCCAGGTA...CAGGACTGAAAGACCTCC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 TCCTAGCAGGCTGCTCCTGGTCTGCAGTCTCTGCCCTCAGCACCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232152 TCCTAGCAGGCTGCTCCTGGTCTGCAGTCTCTGCCCTCAGCACCTCCAGC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 TGCCCCCTTCTCAGGACCCTTGATCTTCGGTGGGCAGTAGGAATCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232202 TGCCCCCTTCTCAGGACCCTTGATCTTCGGTGGGCAGTAGGAATCAAGGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 CCCTCAAATTCGGGACTTGCTTACTCCACCGGCTGATAAACCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 232252 CCCTCAAATTCGGGACTTGCTTACTCCACCGGCTGATAAACCAGGTA...

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3092    GTCAGGACAATCGCAGCAAGCTCCGGAACATGACCGACTTCCGGCTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232884 CAGGTCAGGACAATCGCAGCAAGCTCCGGAACATGACCGACTTCCGGCTG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3139 GCAGGCCTTGACATCACAGATGCCACGCTTCGCCTCATAATTCGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232934 GCAGGCCTTGACATCACAGATGCCACGCTTCGCCTCATAATTCGCCACAT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3189 GCCCCTCCTGTCTCGACTCGACCTCAGTCACTGCAGCCACCTTACAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232984 GCCCCTCCTGTCTCGACTCGACCTCAGTCACTGCAGCCACCTTACAGATC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3239 AGTCCTCCAATCTACTCACTGCTGTCGGGTCTTCCACTCGCTACTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233034 AGTCCTCCAATCTACTCACTGCTGTCGGGTCTTCCACTCGCTACTCTCTC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3289 ACAGAGCTCAATATGGCAG         GTTGCAATAAATTGACAGACCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 233084 ACAGAGCTCAATATGGCAGGTA...CAGGTTGCAATAAATTGACAGACCA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3330 GACCCTGATCTACCTACGGCGCATTGCCAACGTCACCTTGATCGACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233580 GACCCTGATCTACCTACGGCGCATTGCCAACGTCACCTTGATCGACCTTC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3380 GAGGATGCAAGCAGATCACTCGAAAAGCCTGCGAGCACTTCATCTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233630 GAGGATGCAAGCAGATCACTCGAAAAGCCTGCGAGCACTTCATCTCAGAC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3430 TTGTCCATCAACAGCCTCTACTGCCTGTCTGACGAGAAGCTGATACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233680 TTGTCCATCAACAGCCTCTACTGCCTGTCTGACGAGAAGCTGATACAGAA

   3650     .
   3480 GATCAGC
        |||||||
 233730 GATCAGC