Result of SIM4 for
pF1KSDA0977
seq1 = pF1KSDA0977.tfa, 3498 bp
seq2 = pF1KSDA0977/gi568815596r_164585949.tfa (gi568815596r:164585949_164941196), 355248 bp
>pF1KSDA0977 3498
>gi568815596r:164585949_164941196 (Chr2)
(complement)
1-41 (100001-100041) 100% ->
42-230 (197322-197510) 100% ->
231-432 (211082-211283) 100% ->
433-661 (213000-213228) 100% ->
662-759 (218675-218772) 100% ->
760-996 (218886-219122) 100% ->
997-1150 (236092-236245) 100% ->
1151-1225 (236679-236753) 100% ->
1226-1342 (237977-238093) 100% ->
1343-1577 (240441-240675) 100% ->
1578-1672 (241698-241792) 100% ->
1673-3237 (245364-246928) 100% ->
3238-3414 (248800-248976) 100% ->
3415-3498 (255165-255248) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGACGGCCGAACCCCGCGCCCGCAGGACGCCCCAGCCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
100001 ATGGACGGCCGAACCCCGCGCCCGCAGGACGCCCCAGCCAGGTA...TAG
50 . : . : . : . : . :
42 GAGAAAACCAAAAGCCAAGGCACCACTTCCTCCAGCTGAGACCAAATATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197322 GAGAAAACCAAAAGCCAAGGCACCACTTCCTCCAGCTGAGACCAAATATA
100 . : . : . : . : . :
92 CTGATGTCTCTTCAGCTGCTGATTCTGTAGAATCCACTGCTTTCATCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197372 CTGATGTCTCTTCAGCTGCTGATTCTGTAGAATCCACTGCTTTCATCATG
150 . : . : . : . : . :
142 GAACAGAAAGAAAACATGATAGATAAAGACGTTGAACTCTCAGTGGTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197422 GAACAGAAAGAAAACATGATAGATAAAGACGTTGAACTCTCAGTGGTCCT
200 . : . : . : . : . :
192 ACCTGGGGATATTATCAAATCTACTACTGTTCATGGCAG TA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
197472 ACCTGGGGATATTATCAAATCTACTACTGTTCATGGCAGGTA...CAGTA
250 . : . : . : . : . :
233 AACCTATGATGGACTTGTTGATATTCCTTTGTGCACAGTATCACTTAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211084 AACCTATGATGGACTTGTTGATATTCCTTTGTGCACAGTATCACTTAAAT
300 . : . : . : . : . :
283 CCATCAAGTTACACAATCGATCTGTTGTCAGCTGAACAGAACCACATTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211134 CCATCAAGTTACACAATCGATCTGTTGTCAGCTGAACAGAACCACATTAA
350 . : . : . : . : . :
333 ATTTAAGCCAAACACACCAATAGGAATGTTGGAGGTAGAGAAGGTAATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211184 ATTTAAGCCAAACACACCAATAGGAATGTTGGAGGTAGAGAAGGTAATTT
400 . : . : . : . : . :
383 TAAAGCCAAAAATGTTGGATAAGAAAAAACCTACACCTATAATACCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211234 TAAAGCCAAAAATGTTGGATAAGAAAAAACCTACACCTATAATACCAGAG
450 . : . : . : . : . :
433 AAAACTGTGAGAGTAGTGATTAATTTTAAGAAAACACAGAA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211284 GTA...CAGAAAACTGTGAGAGTAGTGATTAATTTTAAGAAAACACAGAA
500 . : . : . : . : . :
474 GACCATAGTGAGAGTGAGTCCACATGCATCGCTTCAAGAGCTTGCCCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213041 GACCATAGTGAGAGTGAGTCCACATGCATCGCTTCAAGAGCTTGCCCCTA
550 . : . : . : . : . :
524 TTATATGTAGCAAATGTGAGTTTGATCCGTTGCATACACTATTGTTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213091 TTATATGTAGCAAATGTGAGTTTGATCCGTTGCATACACTATTGTTGAAA
600 . : . : . : . : . :
574 GATTATCAATCGCAGGAGCCTCTTGACTTGACAAAATCTCTTAATGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213141 GATTATCAATCGCAGGAGCCTCTTGACTTGACAAAATCTCTTAATGACCT
650 . : . : . : . : . :
624 GGGACTAAGAGAATTATATGCGATGGATGTCAACAGAG AGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
213191 GGGACTAAGAGAATTATATGCGATGGATGTCAACAGAGGTA...TAGAGT
700 . : . : . : . : . :
665 CCTGCCAAATATCACAAAACCTAGATATTATGAAGGAGAAAGAAAATAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
218678 CCTGCCAAATATCACAAAACCTAGATATTATGAAGGAGAAAGAAAATAAA
750 . : . : . : . : . :
715 GGGTTTTTCAGTTTTTTTCAACGCAGTAAGAAAAAGCGAGACCAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
218728 GGGTTTTTCAGTTTTTTTCAACGCAGTAAGAAAAAGCGAGACCAAGTA..
800 . : . : . : . : . :
760 ACTGCAAGTGCCCCTGCAACCCCTCTAGTAAATAAGCACCGCCCAA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
218778 .TAGACTGCAAGTGCCCCTGCAACCCCTCTAGTAAATAAGCACCGCCCAA
850 . : . : . : . : . :
806 CTTTTACAAGGTCCAATACCATTTCCAAACCATATATTTCCAACACCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
218932 CTTTTACAAGGTCCAATACCATTTCCAAACCATATATTTCCAACACCCTG
900 . : . : . : . : . :
856 CCGTCGGATGCACCCAAGAAGAGGCGGGCTCCACTGCCCCCGATGCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
218982 CCGTCGGATGCACCCAAGAAGAGGCGGGCTCCACTGCCCCCGATGCCAGC
950 . : . : . : . : . :
906 ATCTCAGAGTGTCCCCCAAGACCTTGCACACATCCAGGAGAGGCCTGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
219032 ATCTCAGAGTGTCCCCCAAGACCTTGCACACATCCAGGAGAGGCCTGCTT
1000 . : . : . : . : . :
956 CTTGTATAGTGAAATCCATGAGCGTGGATGAGACAGATAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
219082 CTTGTATAGTGAAATCCATGAGCGTGGATGAGACAGATAAGGTG...CAG
1050 . : . : . : . : . :
997 AGTCCCTGTGAAGCAGGAAGAGTGAGGGCAGGTTCACTGCAGCTCAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
236092 AGTCCCTGTGAAGCAGGAAGAGTGAGGGCAGGTTCACTGCAGCTCAGCAG
1100 . : . : . : . : . :
1047 CATGTCTGCAGGGAATTCATCTTTGAGAAGGACAAAGCGAAAAGCACCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
236142 CATGTCTGCAGGGAATTCATCTTTGAGAAGGACAAAGCGAAAAGCACCTT
1150 . : . : . : . : . :
1097 CCCCACCCTCCAAAATACCCCCGCATCAAAGTGATGAAAATAGTCGTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
236192 CCCCACCCTCCAAAATACCCCCGCATCAAAGTGATGAAAATAGTCGTGTG
1200 . : . : . : . : . :
1147 ACTG CCTTACAGCCAGTAGATGGAGTTCCTCCAGACAGTGC
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
236242 ACTGGTA...TAGCCTTACAGCCAGTAGATGGAGTTCCTCCAGACAGTGC
1250 . : . : . : . : . :
1188 TTCAGAAGCAAACTCTCCTGAGGAGCTATCCAGCCCAG AAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
236716 TTCAGAAGCAAACTCTCCTGAGGAGCTATCCAGCCCAGGTA...CAGAAA
1300 . : . : . : . : . :
1229 CCTTTCACCCTGGGCTTTCCAGTCAGGAGCAGTGCACTGCGCCCAAACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
237980 CCTTTCACCCTGGGCTTTCCAGTCAGGAGCAGTGCACTGCGCCCAAACTG
1350 . : . : . : . : . :
1279 ATGGAGGAAACCTCTGTCTTTGAGTGCCCTGGGACACCTGAGGCAGCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
238030 ATGGAGGAAACCTCTGTCTTTGAGTGCCCTGGGACACCTGAGGCAGCCAT
1400 . : . : . : . : . :
1329 AACATCATTGACAT CTGGAATAAGCTCTGATTATAGCCTTG
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
238080 AACATCATTGACATGTA...TAGCTGGAATAAGCTCTGATTATAGCCTTG
1450 . : . : . : . : . :
1370 AAGAGATAGATGAAAAGGAAGAACTGAGTGAAGTGCCTAAAGTTGAAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
240468 AAGAGATAGATGAAAAGGAAGAACTGAGTGAAGTGCCTAAAGTTGAAGCT
1500 . : . : . : . : . :
1420 GAAAATATTTCTCCGAAGTCACAAGATATTCCTTTTGTATCTACTGATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
240518 GAAAATATTTCTCCGAAGTCACAAGATATTCCTTTTGTATCTACTGATAT
1550 . : . : . : . : . :
1470 AATAAATACACTGAAAAATGATCCTGACTCAGCCCTTGGCAATGGTAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
240568 AATAAATACACTGAAAAATGATCCTGACTCAGCCCTTGGCAATGGTAGTG
1600 . : . : . : . : . :
1520 GAGAGTTCTCACAAAACTCCATGGAAGAAAAACAAGAAACTAAAAGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
240618 GAGAGTTCTCACAAAACTCCATGGAAGAAAAACAAGAAACTAAAAGCACA
1650 . : . : . : . : . :
1570 GATGGACA AGAACCACACAGTGTAGTATATGATACAAGCAA
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
240668 GATGGACAGTA...CAGAGAACCACACAGTGTAGTATATGATACAAGCAA
1700 . : . : . : . : . :
1611 TGGAAAGAAGGTAGTTGACAGTATAAGAAACTTGAAGTCGTTGGGCCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241731 TGGAAAGAAGGTAGTTGACAGTATAAGAAACTTGAAGTCGTTGGGCCCAA
1750 . : . : . : . : . :
1661 ACCAAGAGAATG TTCAAAATGAAATAATTGTCTATCCAGAG
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
241781 ACCAAGAGAATGGTG...TAGTTCAAAATGAAATAATTGTCTATCCAGAG
1800 . : . : . : . : . :
1702 AACACAGAAGACAATATGAAAAATGGAGTGAAGAAAACAGAAATCAATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245393 AACACAGAAGACAATATGAAAAATGGAGTGAAGAAAACAGAAATCAATGT
1850 . : . : . : . : . :
1752 AGAAGGTGTTGCCAAAAATAACAACATTGATATGGAAGTTGAGAGACCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245443 AGAAGGTGTTGCCAAAAATAACAACATTGATATGGAAGTTGAGAGACCAT
1900 . : . : . : . : . :
1802 CAAACTCTGAGGCACATGAAACTGATACTGCTATAAGTTACAAGGAAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245493 CAAACTCTGAGGCACATGAAACTGATACTGCTATAAGTTACAAGGAAAAC
1950 . : . : . : . : . :
1852 CATCTAGCAGCTTCATCAGTACCAGATCAAAAACTGAATCAACCCAGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245543 CATCTAGCAGCTTCATCAGTACCAGATCAAAAACTGAATCAACCCAGTGC
2000 . : . : . : . : . :
1902 AGAAAAGACAAAAGATGCAGCAATTCAGACAACCCCTTCTTGTAACAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245593 AGAAAAGACAAAAGATGCAGCAATTCAGACAACCCCTTCTTGTAACAGTT
2050 . : . : . : . : . :
1952 TTGATGGGAAACACCAAGATCATAATTTATCTGACTCCAAAGTTGAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245643 TTGATGGGAAACACCAAGATCATAATTTATCTGACTCCAAAGTTGAAGAA
2100 . : . : . : . : . :
2002 TGTGTGCAAACTTCAAATAACAACATATCAACTCAACACTCATGCTTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245693 TGTGTGCAAACTTCAAATAACAACATATCAACTCAACACTCATGCTTAAG
2150 . : . : . : . : . :
2052 TTCACAAGATTCTGTAAATACCTCAAGGGAATTCAGGAGTCAAGGCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245743 TTCACAAGATTCTGTAAATACCTCAAGGGAATTCAGGAGTCAAGGCACCC
2200 . : . : . : . : . :
2102 TAATTATACATTCAGAAGATCCGCTTACCGTAAAAGATCCAATTTGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245793 TAATTATACATTCAGAAGATCCGCTTACCGTAAAAGATCCAATTTGTGCA
2250 . : . : . : . : . :
2152 CATGGTAATGATGATCTTTTGCCTCCTGTAGATAGGATTGACAAAAATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245843 CATGGTAATGATGATCTTTTGCCTCCTGTAGATAGGATTGACAAAAATTC
2300 . : . : . : . : . :
2202 CACTGCTTCTTACCTAAAGAATTACCCACTTTATAGACAGGACTACAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245893 CACTGCTTCTTACCTAAAGAATTACCCACTTTATAGACAGGACTACAATC
2350 . : . : . : . : . :
2252 CCAAGCCAAAACCTTCAAATGAAATTACACGAGAGTATATACCCAAAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245943 CCAAGCCAAAACCTTCAAATGAAATTACACGAGAGTATATACCCAAAATT
2400 . : . : . : . : . :
2302 GGCATGACTACTTATAAAATAGTGCCTCCCAAATCCTTGGAAATATCGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245993 GGCATGACTACTTATAAAATAGTGCCTCCCAAATCCTTGGAAATATCGAA
2450 . : . : . : . : . :
2352 AGACTGGCAATCAGAAACCATAGAGTATAAAGATGATCAGGACATGCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246043 AGACTGGCAATCAGAAACCATAGAGTATAAAGATGATCAGGACATGCATG
2500 . : . : . : . : . :
2402 CTTTAGGGAAAAAGCACACTCATGAGAATGTGAAAGAAACTGCCATCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246093 CTTTAGGGAAAAAGCACACTCATGAGAATGTGAAAGAAACTGCCATCCAA
2550 . : . : . : . : . :
2452 ACAGAAGATTCTGCTATTTCTGAAAGCCCAGAAGAGCCACTGCCAAACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246143 ACAGAAGATTCTGCTATTTCTGAAAGCCCAGAAGAGCCACTGCCAAACCT
2600 . : . : . : . : . :
2502 TAAACCGAAGCCTAACCTGAGAACAGAGCATCAAGTGCCCAGTTCTGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246193 TAAACCGAAGCCTAACCTGAGAACAGAGCATCAAGTGCCCAGTTCTGTGA
2650 . : . : . : . : . :
2552 GCTCACCTGATGATGCCATGGTTAGTCCTCTGAAACCTGCTCCCAAAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246243 GCTCACCTGATGATGCCATGGTTAGTCCTCTGAAACCTGCTCCCAAAATG
2700 . : . : . : . : . :
2602 ACAAGAGACACTGGCACAGCTCCTTTTGCACCAAATTTGGAAGAAATAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246293 ACAAGAGACACTGGCACAGCTCCTTTTGCACCAAATTTGGAAGAAATAAA
2750 . : . : . : . : . :
2652 CAATATTTTGGAATCAAAATTTAAATCTCGGGCTTCAAATGCCCAGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246343 CAATATTTTGGAATCAAAATTTAAATCTCGGGCTTCAAATGCCCAGGCCA
2800 . : . : . : . : . :
2702 AACCCAGCTCTTTTTTTTTGCAGATGCAGAAGAGAGTATCGGGTCACTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246393 AACCCAGCTCTTTTTTTTTGCAGATGCAGAAGAGAGTATCGGGTCACTAT
2850 . : . : . : . : . :
2752 GTGACATCTGCAGCTGCCAAGAGTGTCCATGCTGCCCCTAATCCTGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246443 GTGACATCTGCAGCTGCCAAGAGTGTCCATGCTGCCCCTAATCCTGCTCC
2900 . : . : . : . : . :
2802 AAAAGAACTGACAAATAAAGAGGCAGAAAGGGATATGCTGCCTTCTCCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246493 AAAAGAACTGACAAATAAAGAGGCAGAAAGGGATATGCTGCCTTCTCCGG
2950 . : . : . : . : . :
2852 AGCAGACTCTTTCTCCCTTAAGTAAAATGCCTCACTCTGTTCCACAACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246543 AGCAGACTCTTTCTCCCTTAAGTAAAATGCCTCACTCTGTTCCACAACCC
3000 . : . : . : . : . :
2902 CTTGTTGAAAAAACTGATGATGATGTCATCGGTCAGGCTCCTGCTGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246593 CTTGTTGAAAAAACTGATGATGATGTCATCGGTCAGGCTCCTGCTGAAGC
3050 . : . : . : . : . :
2952 CTCCCCTCCTCCCATAGCTCCAAAACCTGTGACAATTCCTGCTAGTCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246643 CTCCCCTCCTCCCATAGCTCCAAAACCTGTGACAATTCCTGCTAGTCAGG
3100 . : . : . : . : . :
3002 TATCCACACAAAATCTGAAGACTTTGAAAACTTTTGGTGCCCCACGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246693 TATCCACACAAAATCTGAAGACTTTGAAAACTTTTGGTGCCCCACGACCA
3150 . : . : . : . : . :
3052 TACTCAAGTTCTGGTCCTTCACCGTTTGCTCTTGCTGTAGTGAAAAGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246743 TACTCAAGTTCTGGTCCTTCACCGTTTGCTCTTGCTGTAGTGAAAAGGTC
3200 . : . : . : . : . :
3102 ACAGTCTTTCAGTAAAGAGCGCACCGAGTCACCTAGTGCCAGTGCATTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246793 ACAGTCTTTCAGTAAAGAGCGCACCGAGTCACCTAGTGCCAGTGCATTGG
3250 . : . : . : . : . :
3152 TCCAACCTCCAGCCAACACAGAGGAAGGGAAGACTCATTCTGTAAATAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246843 TCCAACCTCCAGCCAACACAGAGGAAGGGAAGACTCATTCTGTAAATAAA
3300 . : . : . : . : . :
3202 TTTGTGGACATCCCACAGCTTGGTGTGTCTGATAAG GAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
246893 TTTGTGGACATCCCACAGCTTGGTGTGTCTGATAAGGTA...TAGGAAAA
3350 . : . : . : . : . :
3243 TAACTCTGCACATAATGAACAGAATTCCCAAATACCAACTCCAACTGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
248805 TAACTCTGCACATAATGAACAGAATTCCCAAATACCAACTCCAACTGATG
3400 . : . : . : . : . :
3293 GCCCATCATTCACTGTTATGAGACAAAGTTCTTTAACATTCCAAAGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
248855 GCCCATCATTCACTGTTATGAGACAAAGTTCTTTAACATTCCAAAGCTCT
3450 . : . : . : . : . :
3343 GACCCAGAACAGATGCGACAGAGTTTGCTGACTGCAATCCGTTCGGGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
248905 GACCCAGAACAGATGCGACAGAGTTTGCTGACTGCAATCCGTTCGGGAGA
3500 . : . : . : . : . :
3393 GGCTGCTGCCAAATTGAAAAGG GTTACCATTCCATCAAATA
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
248955 GGCTGCTGCCAAATTGAAAAGGGTA...TAGGTTACCATTCCATCAAATA
3550 . : . : . : . : . :
3434 CAATATCTGTGAATGGAAGGTCAAGACTCAGCCATTCCATGTCCCCTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
255184 CAATATCTGTGAATGGAAGGTCAAGACTCAGCCATTCCATGTCCCCTGAT
3600 . : .
3484 GCCCAGGACGGCCAT
|||||||||||||||
255234 GCCCAGGACGGCCAT