seq1 = pF1KSDA0945.tfa, 2337 bp
seq2 = pF1KSDA0945/gi568815583f_40358465.tfa (gi568815583f:40358465_40566127), 207663 bp

>pF1KSDA0945 2337
>gi568815583f:40358465_40566127 (Chr15)

1-1432  (100001-101432)   99% ->
1433-1812  (103451-103830)   100% ->
1813-1972  (105397-105556)   100% ->
1973-2049  (106007-106083)   100% ->
2050-2150  (106871-106971)   100% ->
2151-2337  (107477-107663)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACACACACTCGGAGAAAGTCCCTTCCCATGCTGAGTTCGGGCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACACACACTCGGAGAAAGTCCCTTCCCATGCTGAGTTCGGGCCTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCCGCCGAGAGCCCCTGCAGATGGAAGACAGCAACATGGAGCAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCCGCCGAGAGCCCCTGCAGATGGAAGACAGCAACATGGAGCAGGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGAGGGTGTGGAGCCAGGCATGCCCGAGAGCCCAGGTCACCTCACAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGAGGGTGTGGAGCCAGGCATGCCCGAGAGCCCAGGTCACCTCACAGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCCGCAAGAATTACCCACTTCGTAAGCGCCCATTGGTTCCTGAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCCGCAAGAATTACCCACTTCGTAAGCGCCCATTGGTTCCTGAGAAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGGCCTGCAAAGTGCTGCTGACTCGCCTGGAGAATGTGGCCGGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAGGCCTGCAAAGTGCTGCTGACTCGCCTGGAGAATGTGGCCGGTCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGAGTGCAGATGAGGCTGATGAGCTACCGCCTGACCTGCCCAAGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGAGTGCAGATGAGGCTGATGAGCTACCGCCTGACCTGCCCAAGCCCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCCGGCCCCATCCAGTGAAGACCCTGGCCTTGCCCAGCCCCGCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCCCGGCCCCATCCAGTGAAGACCCTGGCCTTGCCCAGCCCCGCAAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCGCCTGGCCTCCCTCAATGCTGAAGCTCTCAATAACCTGCTGCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCGCCTGGCCTCCCTCAATGCTGAAGCTCTCAATAACCTGCTGCTGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAGAGGACACCAGCAGCCTGGCAGGCACCCGCCGCAGTCGAGCAGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GAGAGGACACCAGCAGCCTGGCAGGCACCCGCCGCAGTCGAGCAGGGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCCACCGCAGCCGTGACCGTGATCGTGCTACTGGGGGCTGGTCCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCCACCGCAGCCGTGACCGTGATCGTGCTACTGGGGGCTGGTCCTCCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAAGAAGCGGCCCCGGCTGGGGGACCTTGGAGGAGGAAGTCGGGACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAAGAAGCGGCCCCGGCTGGGGGACCTTGGAGGAGGAAGTCGGGACCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCCAGAGCCAGCACCCGATGAAGGTCCCCGCCGAGATGGAGACCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTCCAGAGCCAGCACCCGATGAAGGTCCCCGCCGAGATGGAGACCCAGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCAAGAGACTGGCTAGCCTGAACGCAGCTGCTTTCCTAAAACTGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCAAGAGACTGGCTAGCCTGAACGCAGCTGCTTTCCTAAAACTGAGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAGCGGGAGCTACCCCTGCGGCTGCCTCGTGCCCATGCAGAAGTAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGAGCGGGAGCTACCCCTGCGGCTGCCTCGTGCCCATGCAGAAGTAGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGCGCTCCACTGAGCCCCCAGCACCCAAGGCCCCGAGGCCAAAGTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGCGCTCCACTGAGCCCCCAGCACCCAAGGCCCCGAGGCCAAAGTGGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGGTCAATGGCAAGAACTATCCCAAGGCTTGGCAGGGGGCCAGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGGTCAATGGCAAGAACTATCCCAAGGCTTGGCAGGGGGCCAGCTCTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAGGCTGCAGGCCCACCTGGCTGGCAAGGCTGCCCTGATGAACCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAGGCTGCAGGCCCACCTGGCTGGCAAGGCTGCCCTGATGAACCATGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CATCTGCAACTCCTTGTGGGCCATCCGTCCAGCCATCTCATAAGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100851 CATCTGCAACTCCTTGTGGGCCATCCGTCCAGCCATCTCATCAGCCCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCAAGGCTCTGGAGAGCCCTTTGGGGCTGCGCCCTCACCTGCCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCAAGGCTCTGGAGAGCCCTTTGGGGCTGCGCCCTCACCTGCCCCTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GATGGGTGGACAGGCGGCTCTGAAGCCGGAGCCTGGGCGCCCAGGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GATGGGTGGACAGGCGGCTCTGAAGCCGGAGCCTGGGCGCCCAGGCGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGTCACCTGCCCCTAAGCAGGAACTGCATCAGCCCTCTTTCCCCACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGTCACCTGCCCCTAAGCAGGAACTGCATCAGCCCTCTTTCCCCACACCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGCTGTCGCCGCTGCCGATGCCTGGCAACCCCGCCGACTACAATGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGCTGTCGCCGCTGCCGATGCCTGGCAACCCCGCCGACTACAATGGCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GTGTGTTGGGCCTGAGCTCACTGCACTAGGCAGCTTCTACCTGTACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GTGTGTTGGGCCTGAGCTCACTGCACTAGGCAGCTTCTACCTGTACTGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCCAAGAGGGGCTGCAGTGTGGGGGCTACTCGCCCTGCCCCATGCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCCAAGAGGGGCTGCAGTGTGGGGGCTACTCGCCCTGCCCCATGCTTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAGGGCAAGCTGTCCCCAGTGGCTGCACCTCACGAGGAGGGGCTCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GAGGGCAAGCTGTCCCCAGTGGCTGCACCTCACGAGGAGGGGCTCCTCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AGCTCCGAGCTCAGTGCCCTCAGGCACCCCTTTCCAGCACCCTCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGCTCCGAGCTCAGTGCCCTCAGGCACCCCTTTCCAGCACCCTCCCTGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GCTCCTCTCGCTACTGCTCTAGCGAGGACACTGGAGTGAATGGCTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GCTCCTCTCGCTACTGCTCTAGCGAGGACACTGGAGTGAATGGCTACAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ATCTGCGGAGTGTTGCCCCTGTCTGTTACCCACGCTGGCACTACCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ATCTGCGGAGTGTTGCCCCTGTCTGTTACCCACGCTGGCACTACCTGTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CGGCTGCCCATACAAAATGCCTTTTGCAGCAG         GCTGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101401 CGGCTGCCCATACAAAATGCCTTTTGCAGCAGGTG...AAGGCTGCAGAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 CCCTGGGCCAGTTGGAATTTCCTCTCCCGGAAGCTGGCCACCCAGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103460 CCCTGGGCCAGTTGGAATTTCCTCTCCCGGAAGCTGGCCACCCAGCCTCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 CCCGCCCACCCACTCCTGGGGTGCCCTGTACCCAGTGTGCCACCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103510 CCCGCCCACCCACTCCTGGGGTGCCCTGTACCCAGTGTGCCACCTGCAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 AGAGCCCGTCCCCCATCTTCAGACACCCACCTCGGAGCCCCAGACAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103560 AGAGCCCGTCCCCCATCTTCAGACACCCACCTCGGAGCCCCAGACAGTAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 CCCGTGCGTGCCCTCAGAGCGCCAAACCTCCCAGCGGTTCTAAGTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103610 CCCGTGCGTGCCCTCAGAGCGCCAAACCTCCCAGCGGTTCTAAGTCAGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 CTGCGCACAGGCTCCAGCTGCAGGCACACTGCAAGGAGCAAGGCTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103660 CTGCGCACAGGCTCCAGCTGCAGGCACACTGCAAGGAGCAAGGCTGCCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 CAGGCCTAGCCACCCCAAGCAGCCACGTGTCCAGCGCCCACGCCCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103710 CAGGCCTAGCCACCCCAAGCAGCCACGTGTCCAGCGCCCACGCCCTCGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 GCCGCCGTCGCCGCCGCACTAATGGCTGGGTACCTGTTGGGGCTGCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103760 GCCGCCGTCGCCGCCGCACTAATGGCTGGGTACCTGTTGGGGCTGCGTGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 GAGAAGGCTGTGTATGTCTTG         GATGAGCCGGAGCCAGCCAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 103810 GAGAAGGCTGTGTATGTCTTGGTA...TAGGATGAGCCGGAGCCAGCCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1833 CCGAAAGAGCTACCAGGCGGTAGAGCGGCATGGGGAGACAATCCGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105417 CCGAAAGAGCTACCAGGCGGTAGAGCGGCATGGGGAGACAATCCGAGTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1883 GGGACACCGTCCTTCTCAAATCAGGCCCACGAAAGACCTCCACACCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105467 GGGACACCGTCCTTCTCAAATCAGGCCCACGAAAGACCTCCACACCTTAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1933 GTGGCCAAGATCTCTGCCCTCTGGGAGAACCCCGAGTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 105517 GTGGCCAAGATCTCTGCCCTCTGGGAGAACCCCGAGTCAGGTA...CAGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1974 AGAGCTGATGATGAGCCTCCTGTGGTATTACAGACCTGAGCACTTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106008 AGAGCTGATGATGAGCCTCCTGTGGTATTACAGACCTGAGCACTTACAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 GAGGCCGCAGTCCCAGCATGCACGAG         CCCTTGCAGAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 106058 GAGGCCGCAGTCCCAGCATGCACGAGGTG...GAGCCCTTGCAGAATGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2065 GTGTTTGCATCGCGACATCAGGACCAGAACAGTGTGGCCTGCATTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106886 GTGTTTGCATCGCGACATCAGGACCAGAACAGTGTGGCCTGCATTGAGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2115 GAAGTGCTATGTGCTGACTTTTGCCGAGTACTGCAG         GTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 106936 GAAGTGCTATGTGCTGACTTTTGCCGAGTACTGCAGGTA...CAGGTTCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 GTGCCATGGCCAAGCGCCGAGGTGAAGGCCTCCCCAGCCGAAAGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107482 GTGCCATGGCCAAGCGCCGAGGTGAAGGCCTCCCCAGCCGAAAGACAGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 CTGGTTCCCCCCTCTGCAGACTATTCCACCCCACCCCACCGCACAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107532 CTGGTTCCCCCCTCTGCAGACTATTCCACCCCACCCCACCGCACAGTGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 AGAGGACACGGACCCTGAGCTGGTGTTCCTTTGCCGCCATGTCTATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107582 AGAGGACACGGACCCTGAGCTGGTGTTCCTTTGCCGCCATGTCTATGACT

   2350     .    :    .    :    .    :
   2306 TCCGCCACGGGCGCATCCTTAAGAACCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 107632 TCCGCCACGGGCGCATCCTTAAGAACCCCCAG