seq1 = pF1KSDA0792.tfa, 2421 bp
seq2 = pF1KSDA0792/gi568815597r_225747043.tfa (gi568815597r:225747043_225977580), 230538 bp

>pF1KSDA0792 2421
>gi568815597r:225747043_225977580 (Chr1)

(complement)

1-186  (100001-100186)   100% ->
187-266  (103214-103293)   100% ->
267-333  (105528-105594)   100% ->
334-371  (106468-106505)   100% ->
372-514  (109551-109693)   99% ->
515-566  (110418-110469)   100% ->
567-675  (110899-111007)   99% ->
676-746  (111614-111684)   100% ->
747-827  (114730-114810)   100% ->
828-951  (115003-115126)   100% ->
952-1085  (115230-115363)   100% ->
1086-1223  (116584-116721)   100% ->
1224-1377  (118232-118385)   100% ->
1378-1484  (120564-120670)   100% ->
1485-1571  (120843-120929)   100% ->
1572-1634  (121641-121703)   100% ->
1635-1797  (123790-123952)   100% ->
1798-1903  (124812-124917)   100% ->
1904-2071  (127502-127669)   100% ->
2072-2187  (128569-128684)   100% ->
2188-2250  (129027-129089)   100% ->
2251-2421  (130368-130538)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGACTCCCCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGACTCCCCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGACCGGCCCAACGACTCCTATTGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGACCGGCCCAACGACTCCTATTGCTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCACTGTCCTGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTG         TTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100151 CCCACTGTCCTGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTGGTG...TAGTTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGATTCTGGGACTATGGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103219 AATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGATTCTGGGACTATGGCCGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAG         CGAGTCCAGATTTCAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103269 TTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAGGTA...TAGCGAGTCCAGATTTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGATTGTCATCGACTTCCTCCTCAGGTCAACAAGACTTTGAAAATGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105544 AGATTGTCATCGACTTCCTCCTCAGGTCAACAAGACTTTGAAAATGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 G         GGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGCA  
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105594 GGTT...CAGGGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGCAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    372        TGATGACCAGATCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106508 G...CAGTGATGACCAGATCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTCCTGTTGGTGGTGGTCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109594 TACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTCCTGTTGGTGGTGGTCAGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGATTTGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 109644 TTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515          ACAAAGACCCGTATAGTTTTGGGAGGACAACAATAGCAAAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109694 GTA...CAGACAAAGACCCGTATAGTTTTGGGAGGACAACAATAGCAAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTACAGACTGA         CAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCATCTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 110459 CTACAGACTGAGTG...CAGCAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCATCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TGCTGTCATTTACCTCTTCTTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTC
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 110929 TGCTGTCATTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGTCCATTAAGTACAAAGAGGAGAACCTG         GTGAGGCGGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 110979 AGTCCATTAAGTACAAAGAGGAGAACCTGGTG...CAGGTGAGGCGGACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111626 CTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCACTTCCG         GGACGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 111676 CCACTTCCGGTA...CAGGGACGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACCTGTGCAAGGAGAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 114762 TGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACCTGTGCAAGGAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    828         AAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114812 TG...CAGAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GGTGAAGACAGGCCAGCGGACCCTCATCAACCCCAAGCCCTGTGGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115045 GGTGAAGACAGGCCAGCGGACCCTCATCAACCCCAAGCCCTGTGGCCAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGG         GAAGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 115095 TTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGTA...CAGGAAGACGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 ATCTCTTACTACACACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115239 ATCTCTTACTACACACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGCCCCTGGGAATGGCCTTCGTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115289 GGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGCCCCTGGGAATGGCCTTCGTCACCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTA         CATCCTGAAAGATTTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 115339 TCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTAGTG...CAGCATCCTGAAAGATTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AATGCCTGCAAGTGTCAGAGCCTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116600 AATGCCTGCAAGTGTCAGAGCCTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 CTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTGGACAGTCACCTTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116650 CTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTGGACAGTCACCTTTGCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CTGACCCTGAGGACATCTGCTG         GAAGAACCTCTCTATCCAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 116700 CTGACCCTGAGGACATCTGCTGGTA...CAGGAAGAACCTCTCTATCCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GGCCTCCGCTGGTGGCTACAGTGGCTGGGCATCAACTTCACCCTCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118251 GGCCTCCGCTGGTGGCTACAGTGGCTGGGCATCAACTTCACCCTCTTCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 GGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCCACCATGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118301 GGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCCACCATGGACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AGTTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAAT         AACCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 118351 AGTTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATGTG...TAGAACCCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 ATCATCAGCCAGTTCTTCCCCACCCTCCTGCTCTGGTCCTTCTCGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120570 ATCATCAGCCAGTTCTTCCCCACCCTCCTGCTCTGGTCCTTCTCGGCCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 GCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120620 GCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGACCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 A         GTCGGGGGAAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120670 AGTG...CAGGTCGGGGGAAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 TTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCCTCCCTGGGTCTCACCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 120883 TTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCCTCCCTGGGTCTCACCAGGTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1572       TCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120933 ...CAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 AGGCCTCCATCAGGTTGGA         GTGCGTCTTCCTGCCTGACCAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 121685 AGGCCTCCATCAGGTTGGAGTG...CAGGTGCGTCTTCCTGCCTGACCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123812 GGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCAATGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 CATGGAGCTGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123862 CATGGAGCTGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 TCATGGCCAAGACGGCTGCTGACCGCAGGAATGTCAAGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 123912 TCATGGCCAAGACGGCTGCTGACCGCAGGAATGTCAAGCAGGTG...CAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 AACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124812 AACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 TGTCTTCACTGTCATCGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124862 TGTCTTCACTGTCATCGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 CATTTG         GCCTCATCTACATCCTGCTCAAGCACATGGTGGAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124912 CATTTGGTG...CAGGCCTCATCTACATCCTGCTCAAGCACATGGTGGAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 CGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127537 CGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 CCACTTTGCCGCTGTGAACCAGGCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127587 CCACTTTGCCGCTGTGAACCAGGCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 TCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGG         GTATGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 127637 TCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGGTG...CAGGTATGAAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2080 GCCCCCGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128577 GCCCCCGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 CTGCCTGGCTCACACCTGCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128627 CTGCCTGGCTCACACCTGCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCTCTGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 ACTACAAA         ACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 128677 ACTACAAAGTA...CAGACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2221 GCAGAGGCCCACATGCCCCCACCGTTCACA         CCCTACGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 129060 GCAGAGGCCCACATGCCCCCACCGTTCACAGTA...CAGCCCTACGTGCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 TCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGACAGCACTGTCTCCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130379 TCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGACAGCACTGTCTCCGCAGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 AGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130429 AGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362 CCTGGACAGTGCTTGGCGCAGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130479 CCTGGACAGTGCTTGGCGCAGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCC

   2600     .    :
   2412 CCAGGAGGCC
        ||||||||||
 130529 CCAGGAGGCC