seq1 = pF1KSDA0665.tfa, 2268 bp
seq2 = pF1KSDA0665/gi568815582f_326113.tfa (gi568815582f:326113_620836), 294724 bp

>pF1KSDA0665 2268
>gi568815582f:326113_620836 (Chr16)

1-714  (99895-100608)   99% ->
715-808  (135292-135385)   100% ->
809-903  (145183-145277)   100% ->
904-1115  (156413-156624)   100% ->
1116-1265  (162739-162888)   100% ->
1266-1301  (170712-170747)   100% ->
1302-1395  (176892-176985)   100% ->
1396-1499  (179412-179515)   100% ->
1500-1640  (184548-184688)   100% ->
1641-1722  (192831-192912)   100% ->
1723-1860  (193642-193779)   100% ->
1861-2016  (194010-194165)   100% ->
2017-2157  (194347-194487)   100% ->
2158-2268  (194614-194724)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCGGCCCCGCCGGCCTCGCCCCCGGGCTCGGAGCCGCCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99895 ATGGCGTCGGCCCCGCCGGCCTCGCCCCCGGGCTCGGAGCCGCCGGGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACCCGGAGCCGGGCGGGCCGGACGGGCCGGGGGCGGCGCAACTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  99945 CGACCCGGAGCCGGGCGGGCCGGACGGGCCGGGGGCGGCACAACTGGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGCCCTGCGGAGCTACGCCTCGGAGCGCCCGTCGGCGGCCCCGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99995 CGGGCCCTGCGGAGCTACGCCTCGGAGCGCCCGTCGGCGGCCCCGACCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGTCCCCGGGCCTGGATGAGCCTGCGCCCGGGGCCGCTGCAGATGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 CAGTCCCCGGGCCTGGATGAGCCTGCGCCCGGGGCCGCTGCAGATGGCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCGCGTTGGAGCGCCGGGCCGGCCCCGGGGCTGGAGGGAGGCCCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100095 GGCGCGTTGGAGCGCCGGGCCGGCCCCGGGGCTGGAGGGAGGCCCGCGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCCCGGGCCGTCCGCCCCGCCGCCGCGCTCCGGCCCGCGGGGGCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100145 ACCCCGGGCCGTCCGCCCCGCCGCCGCGCTCCGGCCCGCGGGGGCAGCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGAGCCCCGACGCCCCGGGCCCAGGGCCGCGCTCCGAAGCGCCGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100195 GCGAGCCCCGACGCCCCGGGCCCAGGGCCGCGCTCCGAAGCGCCGCTTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAACTCGACCCGTTGTTCTCCTGGACTGAGGAGCCCGAGGAGTGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100245 AGAACTCGACCCGTTGTTCTCCTGGACTGAGGAGCCCGAGGAGTGTGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGCGAGCTGCCCGGAGAGCGCGCCTTTCCGCTTGCAGGGGTCCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100295 CCGCGAGCTGCCCGGAGAGCGCGCCTTTCCGCTTGCAGGGGTCCAGCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCCACCGAGCGCGGGGCGAGGTCGACGTCTTCTCTCCCTTCCCCGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100345 AGCCACCGAGCGCGGGGCGAGGTCGACGTCTTCTCTCCCTTCCCCGCGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACGGCGGGCGAGCTGGCGCTGGAGCAAGGTCCCGGGTCCCCGCCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100395 CACGGCGGGCGAGCTGGCGCTGGAGCAAGGTCCCGGGTCCCCGCCGCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTCGGACCTCAGCCAGACCCACCCCCTTCCGAGCGAGCCCGTGGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100445 CCTCGGACCTCAGCCAGACCCACCCCCTTCCGAGCGAGCCCGTGGGGAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGGAGGACGGCCCCCGCCTCCGAGCCGTGTTCGATGCCCTGGACGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100495 CAGGAGGACGGCCCCCGCCTCCGAGCCGTGTTCGATGCCCTGGACGGGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGGGACGGTTTCGTCCGCATCGAGGACTTCATCCAGTTTGCTACGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100545 TGGGGACGGTTTCGTCCGCATCGAGGACTTCATCCAGTTTGCTACGGTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACGGGGCAGAGCAG         GTGAAGGACTTAACTAAGTACTTGGAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100595 ACGGGGCAGAGCAGGTA...CAGGTGAAGGACTTAACTAAGTACTTGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCCAGTGGGCTCGGCGTGATCAGCTTTGAAGACTTCTACCAAGGGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135319 CCCAGTGGGCTCGGCGTGATCAGCTTTGAAGACTTCTACCAAGGGATCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGCCATCAGAAACGGAG         ATCCTGATGGCCAGTGCTACGGTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 135369 AGCCATCAGAAACGGAGGTC...CAGATCCTGATGGCCAGTGCTACGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GTGTCGCTTCTGCCCAAGATGAGGAGCCCCTGGCCTGCCCGGACGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145207 GTGTCGCTTCTGCCCAAGATGAGGAGCCCCTGGCCTGCCCGGACGAGTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GATGACTTCGTCACCTATGAG         GCCAACGAGGTGACGGACAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 145257 GATGACTTCGTCACCTATGAGGCA...TAGGCCAACGAGGTGACGGACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CGCGTACATGGGCTCCGAGAGCACCTACAGTGAGTGTGAGACCTTCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156433 CGCGTACATGGGCTCCGAGAGCACCTACAGTGAGTGTGAGACCTTCACGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ACGAGGACACCAGCACCCTGGTGCACCCTGAGCTGCAACCTGAAGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156483 ACGAGGACACCAGCACCCTGGTGCACCCTGAGCTGCAACCTGAAGGGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GCAGACAGTGCCGGCGGCTCGGCCGTGCCCTCTGAGTGCCTGGACGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156533 GCAGACAGTGCCGGCGGCTCGGCCGTGCCCTCTGAGTGCCTGGACGCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GGAGGAGCCCGACCATGGTGCCCTGCTGCTGCTCCCAGGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 156583 GGAGGAGCCCGACCATGGTGCCCTGCTGCTGCTCCCAGGCAGGTC...CA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1116  GCCTCACCCCCATGGCCAGTCTGTCATCACGGTGATCGGGGGCGAGGAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162738 GGCCTCACCCCCATGGCCAGTCTGTCATCACGGTGATCGGGGGCGAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CACTTTGAGGACTACGGTGAAGGCAGTGAGGCGGAGCTGTCCCCAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162788 CACTTTGAGGACTACGGTGAAGGCAGTGAGGCGGAGCTGTCCCCAGAGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CCTATGCAACGGGCAGCTGGGCTGCAGTGACCCCGCTTTCCTCACGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162838 CCTATGCAACGGGCAGCTGGGCTGCAGTGACCCCGCTTTCCTCACGCCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 G         TCCGACAAAGCGGCTCTCCAGCAAGAAGGTGGCAAG    
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 162888 GGTA...CAGTCCGACAAAGCGGCTCTCCAGCAAGAAGGTGGCAAGGTA.

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302      GTACCTGCACCAGTCAGGGGCCCTGACCATGGAGGCCCTGGAGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170752 ..TAGGTACCTGCACCAGTCAGGGGCCCTGACCATGGAGGCCCTGGAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CCCTTCCCCCGAGCTCATGGAGGGCCCAGAGGAGGACATTGCTGACAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 176937 CCCTTCCCCCGAGCTCATGGAGGGCCCAGAGGAGGACATTGCTGACAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1396         GTTGTCTTCCTGGAAAGGCGTGTGCTGGAGCTGGAAAAGGAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176987 TA...AAGGTTGTCTTCCTGGAAAGGCGTGTGCTGGAGCTGGAAAAGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 ACGGCAGCCACCGGTGAGCAACACAGCCGCCTGAGGCAGGAGAACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179454 ACGGCAGCCACCGGTGAGCAACACAGCCGCCTGAGGCAGGAGAACCTGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GCTGGTGCACAG         AGCAAACGCCCTGGAGGAGCAGCTGAAGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 179504 GCTGGTGCACAGGTG...AAGAGCAAACGCCCTGGAGGAGCAGCTGAAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 AGCAGGAGCTGAGAGCCTGCGAGATGGTCCTGGAAGAGACCCGGCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184577 AGCAGGAGCTGAGAGCCTGCGAGATGGTCCTGGAAGAGACCCGGCGTCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 AAGGAGCTCCTGTGCAAGATGGAGAGGGAGAAGAGCATTGAGATCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184627 AAGGAGCTCCTGTGCAAGATGGAGAGGGAGAAGAGCATTGAGATCGAGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CCTGCAGACCAG         GCTACAGCAACTGGACGAGGAGAACAGTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 184677 CCTGCAGACCAGGTA...CAGGCTACAGCAACTGGACGAGGAGAACAGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 AACTCCGGTCCTGCACGCCCTGTCTGAAGGCCAACATTGAGCGTCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192860 AACTCCGGTCCTGCACGCCCTGTCTGAAGGCCAACATTGAGCGTCTGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 GAG         GAGAAGCAGAAGCTGTTGGATGAGATAGAGTCGCTGAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192910 GAGGTG...CAGGAGAAGCAGAAGCTGTTGGATGAGATAGAGTCGCTGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GCTGCGGCTCAGTGAAGAGCAGGAGAACAAGAGGAGAATGGGGGACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193680 GCTGCGGCTCAGTGAAGAGCAGGAGAACAAGAGGAGAATGGGGGACAGGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TGAGTCACGAGAGGCACCAGTTCCAGAGGGACAAGGAGGCCACCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193730 TGAGTCACGAGAGGCACCAGTTCCAGAGGGACAAGGAGGCCACCCAGGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861          CTGATCGAGGACCTCCGAAAGCAGCTGGAGCACCTGCAGCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193780 GTG...CAGCTGATCGAGGACCTCCGAAAGCAGCTGGAGCACCTGCAGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CCTCAAGCTGGAGGCCGAGCAGCGGCGGGGCCGCAGCAGCAGCATGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194051 CCTCAAGCTGGAGGCCGAGCAGCGGCGGGGCCGCAGCAGCAGCATGGGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 TGCAGGAGTACCACAGCCGCGCCCGGGAGAGCGAGCTGGAGCAGGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194101 TGCAGGAGTACCACAGCCGCGCCCGGGAGAGCGAGCTGGAGCAGGAGGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 CGCAGGCTGAAGCAG         GACAACCGCAACCTGAAGGAGCAGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 194151 CGCAGGCTGAAGCAGGTG...CAGGACAACCGCAACCTGAAGGAGCAGAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 CGAGGAGCTGAACGGGCAGATCATTACCCTCAGCATCCAGGGCGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194373 CGAGGAGCTGAACGGGCAGATCATTACCCTCAGCATCCAGGGCGCCAAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 GCCTCTTCTCCACAGCCTTCTCTGAGTCCCTGGCTGCAGAGATCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194423 GCCTCTTCTCCACAGCCTTCTCTGAGTCCCTGGCTGCAGAGATCAGCTCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 GTCTCCCGAGATGAG         CTCATGGAGGCGATTCAGAAGCAGGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 194473 GTCTCCCGAGATGAGGTA...CAGCTCATGGAGGCGATTCAGAAGCAGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 GGAGATCAACTTCCGCCTGCAGGACTACATCGACAGGATCATCGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194640 GGAGATCAACTTCCGCCTGCAGGACTACATCGACAGGATCATCGTGGCCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .
   2234 TCATGGAGACCAACCCGTCCATCCTGGAGGTCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194690 TCATGGAGACCAACCCGTCCATCCTGGAGGTCAAG