seq1 = pF1KSDA0659.tfa, 3126 bp
seq2 = pF1KSDA0659/gi568815587f_61620156.tfa (gi568815587f:61620156_61844486), 224331 bp

>pF1KSDA0659 3126
>gi568815587f:61620156_61844486 (Chr11)

1-95  (100001-100095)   98% ->
96-307  (100524-100735)   100% ->
308-409  (102704-102805)   100% ->
410-548  (103279-103417)   100% ->
549-636  (105840-105927)   100% ->
637-771  (107998-108132)   100% ->
772-849  (108776-108853)   100% ->
850-974  (111162-111286)   100% ->
975-1128  (114694-114847)   100% ->
1129-1212  (115406-115489)   100% ->
1213-1290  (115584-115661)   100% ->
1291-1371  (116115-116195)   100% ->
1372-1514  (117027-117169)   100% ->
1515-1583  (117532-117600)   98% ->
1584-1656  (117980-118052)   100% ->
1657-1853  (119310-119506)   100% ->
1854-1983  (120308-120437)   100% ->
1984-2171  (121007-121194)   100% ->
2172-3126  (123377-124331)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGGGATCGTGGTGTTCCGGCGGCGCTGGTCTGTGGGCAGTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGGGATCGTGGTGTTCCGGCGGCGCTGGTCTGTGGGCAGTGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCGTCCTACCAGCCATCTTCCTCTTTCTCCTGCATACCACCTG     
        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100051 CCTCGTCCTACCGGCCATCTTCCTCTTTCTCCTGCATACCACCTGGTG..

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     96     GTTTGTGATCCTGTCCGTGGTGCTCTTCGGCCTGGTCTATAACCCG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 .CAGGTTTGTGATCCTGTCCGTGGTGCTCTTCGGCCTGGTCTATAACCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACGAGGCCTGCTCCCTGAACCTGGTGGACCACGGCCGCGGCTACCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100570 CACGAGGCCTGCTCCCTGAACCTGGTGGACCACGGCCGCGGCTACCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCCTGCTGAGCTGCATGATCGCTGAGATGGCCATCATCTGGCTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100620 CATCCTGCTGAGCTGCATGATCGCTGAGATGGCCATCATCTGGCTGAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCGCGGGGGCATCCTCTACACGGAGCCCCGTGACTCCATGCAGTACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100670 TGCGCGGGGGCATCCTCTACACGGAGCCCCGTGACTCCATGCAGTACGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCTACGTGCGCCTGG         CCATCCTGGTGATCGAGTTCATCTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100720 CTCTACGTGCGCCTGGGTA...CAGCCATCCTGGTGATCGAGTTCATCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGCCATCGTGGGCATCGTCTGGCTCACTCAGTACTACACCTCCTGCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102729 CGCCATCGTGGGCATCGTCTGGCTCACTCAGTACTACACCTCCTGCAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCTCACTGCCAAGAATGTCACCCTCG         GAATGGTTGTCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102779 ACCTCACTGCCAAGAATGTCACCCTCGGTA...CAGGAATGGTTGTCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACTGGGTAGTCATCCTCAGTGTGTGCATCACTGTCCTCTGCGTCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103293 AACTGGGTAGTCATCCTCAGTGTGTGCATCACTGTCCTCTGCGTCTTCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCCCACGGGCCGCACCTTTGTCAAGCTGAGAGCCACCAAGAGGAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103343 CCCCACGGGCCGCACCTTTGTCAAGCTGAGAGCCACCAAGAGGAGGCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTAACCTGCGGACCTACAACCTGCG         GCACCGCTTAGAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103393 GTAACCTGCGGACCTACAACCTGCGGTC...CAGGCACCGCTTAGAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGTCAAGCCACCAGCTGGTCGCGCCGGCTCAAAGTGTTCCTCTGCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105856 GGTCAAGCCACCAGCTGGTCGCGCCGGCTCAAAGTGTTCCTCTGCTGCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCGGACGAAGGACTCCCAGTCA         GATGCCTACTCAGAAATCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105906 GCGGACGAAGGACTCCCAGTCAGTA...TAGGATGCCTACTCAGAAATCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCTACCTCTTTGCGGAGTTCTTCCGGGACCTTGACATTGTGCCATCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108017 CCTACCTCTTTGCGGAGTTCTTCCGGGACCTTGACATTGTGCCATCCGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATCATTGCTGGCCTGGTGCTGCTCCGGCAGCGGCAGCGGGCCAAGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108067 ATCATTGCTGGCCTGGTGCTGCTCCGGCAGCGGCAGCGGGCCAAGCGCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CGCCGTGCTGGACGAG         GCAAACAATGACATCTTGGCCTTCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 108117 CGCCGTGCTGGACGAGGTG...CAGGCAAACAATGACATCTTGGCCTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGTCTGGGATGCCGGTGACCAGAAACACCAAGTACCTCGACCTCAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108801 TGTCTGGGATGCCGGTGACCAGAAACACCAAGTACCTCGACCTCAAGAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCA         CAAGAGATGCTCCGCTACAAAGAGGTCTGCTACTACAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108851 TCAGTG...TAGCAAGAGATGCTCCGCTACAAAGAGGTCTGCTACTACAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCTCTTTGCCCTGGCTGCCTACGGGTGGCCCATGTACCTGATGCGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111200 GCTCTTTGCCCTGGCTGCCTACGGGTGGCCCATGTACCTGATGCGGAAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCGCCTGCGGCCTCTGCCAACTGGCTCGGTCCTGCTC         GTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 111250 CCGCCTGCGGCCTCTGCCAACTGGCTCGGTCCTGCTCGTG...TAGGTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TGCCTGTGTCCTGCGAGGCCGCGGTTCGCCCCTGGAGTCACCATCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114698 TGCCTGTGTCCTGCGAGGCCGCGGTTCGCCCCTGGAGTCACCATCGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AGACAACTGCTGTGGCTGTAATGCCATTGCCATCCGGCGCCACTTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114748 AGACAACTGCTGTGGCTGTAATGCCATTGCCATCCGGCGCCACTTCCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACGAGAACATGACTGCGGTGGACATCGTCTATACCTCCTGCCATGATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114798 ACGAGAACATGACTGCGGTGGACATCGTCTATACCTCCTGCCATGATGCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129          GTCTATGAAACGCCCTTCTACGTGGCGGTGGACCATGACAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114848 GTG...TAGGTCTATGAAACGCCCTTCTACGTGGCGGTGGACCATGACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GAAGAAAGTGGTGATCAGTATCCGGGGGACCCTGTCCCCCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 115447 GAAGAAAGTGGTGATCAGTATCCGGGGGACCCTGTCCCCCAAGGTA...A

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1213   GATGCCCTGACTGACCTGACGGGTGATGCTGAGCGCCTCCCCGTGGAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115582 AGGATGCCCTGACTGACCTGACGGGTGATGCTGAGCGCCTCCCCGTGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GGGCACCACGGCACCTGGCTGGGCCACAAG         GGTATGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 115632 GGGCACCACGGCACCTGGCTGGGCCACAAGGTA...CAGGGTATGGTCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CTCAGCTGAGTACATCAAGAAGAAACTGGAGCAGGAGATGGTCCTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116126 CTCAGCTGAGTACATCAAGAAGAAACTGGAGCAGGAGATGGTCCTGTCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGGCCTTTGGGCGAGACCTG         GGCCGCGGAACCAAACACTAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 116176 AGGCCTTTGGGCGAGACCTGGTG...CAGGGCCGCGGAACCAAACACTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GGCCTGATTGTGGTGGGCCACTCCCTGGGCGCGGGCACTGCTGCCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117048 GGCCTGATTGTGGTGGGCCACTCCCTGGGCGCGGGCACTGCTGCCATCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CTCCTTCCTTCTGCGCCCACAGTATCCGACCCTCAAGTGCTTTGCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117098 CTCCTTCCTTCTGCGCCCACAGTATCCGACCCTCAAGTGCTTTGCCTACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CCCCGCCAGGGGGCCTGCTGAG         TGAGGATGCAATGGAGTAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| |||||||||
 117148 CCCCGCCAGGGGGCCTGCTGAGGTG...CAGTGAGGATGCGATGGAGTAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 TCCAAGGAGTTCGTGACTGCTGTGGTTCTGGGCAAAGACCTCGTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117551 TCCAAGGAGTTCGTGACTGCTGTGGTTCTGGGCAAAGACCTCGTCCCCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584          GATTGGCCTCTCTCAGCTGGAAGGCTTCCGCAGACAGCTCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117601 GTG...CAGGATTGGCCTCTCTCAGCTGGAAGGCTTCCGCAGACAGCTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TGGATGTCCTGCAGCGAAGCACCAAGCCCAAA         TGGCGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118021 TGGATGTCCTGCAGCGAAGCACCAAGCCCAAAGTG...CAGTGGCGGATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 ATCGTGGGGGCCACCAAATGCATCCCCAAGTCGGAGCTGCCTGAGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119319 ATCGTGGGGGCCACCAAATGCATCCCCAAGTCGGAGCTGCCTGAGGAGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 AGAGGTGACCACCCTGGCCAGCACGCGGCTCTGGACCCACCCCAGCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119369 AGAGGTGACCACCCTGGCCAGCACGCGGCTCTGGACCCACCCCAGCGACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TAACTATAGCCCTCTCAGCCAGCACTCCACTCTACCCGCCCGGCCGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119419 TAACTATAGCCCTCTCAGCCAGCACTCCACTCTACCCGCCCGGCCGCATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 ATCCACGTGGTCCACAACCACCCTGCAGAGCAGTGCTG         CTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 119469 ATCCACGTGGTCCACAACCACCCTGCAGAGCAGTGCTGGTA...CAGCTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 CTGTGAGCAGGAGGAGCCCACATACTTTGCCATCTGGGGCGACAACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120311 CTGTGAGCAGGAGGAGCCCACATACTTTGCCATCTGGGGCGACAACAAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 CCTTCAATGAGGTGATCATCTCGCCAGCCATGCTGCATGAGCACCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120361 CCTTCAATGAGGTGATCATCTCGCCAGCCATGCTGCATGAGCACCTGCCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 TATGTGGTCATGGAGGGGCTCAACAAG         GTGCTGGAGAACTA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 120411 TATGTGGTCATGGAGGGGCTCAACAAGGTG...CAGGTGCTGGAGAACTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 CAACAAGGGGAAGACCGCTCTGCTCTCTGCAGCCAAGGTCATGGTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121021 CAACAAGGGGAAGACCGCTCTGCTCTCTGCAGCCAAGGTCATGGTGAGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 CTACCGAGGTGGACCTGACTCCTGAGCTCATCTTCCAGCAGCAGCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121071 CTACCGAGGTGGACCTGACTCCTGAGCTCATCTTCCAGCAGCAGCCACTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 CCCACGGGGCCGCCCATGCCCACTGGCCTTGCCCTGGAGCTGCCGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121121 CCCACGGGGCCGCCCATGCCCACTGGCCTTGCCCTGGAGCTGCCGACTGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 AGACCACCGCAACAGCAGCGTCAG         GAGCAAGTCCCAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 121171 AGACCACCGCAACAGCAGCGTCAGGTG...CAGGAGCAAGTCCCAGTCTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 AGATGAGCCTGGAGGGCTTCTCGGAGGGGCGGCTGCTGTCGCCAGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123394 AGATGAGCCTGGAGGGCTTCTCGGAGGGGCGGCTGCTGTCGCCAGTGGTT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 GCGGCGGCGGCCCGCCAGGACCCGGTGGAGCTGCTGCTGCTGTCTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123444 GCGGCGGCGGCCCGCCAGGACCCGGTGGAGCTGCTGCTGCTGTCTACCCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GGAGCGGCTGGCGGCGGAGCTGCAGGCCCGGCGGGCACCACTGGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123494 GGAGCGGCTGGCGGCGGAGCTGCAGGCCCGGCGGGCACCACTGGCCACCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 TGGAGAGCCTCTCGGACACTGAGTCCCTGTACAGCTTCGACTCGCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123544 TGGAGAGCCTCTCGGACACTGAGTCCCTGTACAGCTTCGACTCGCGCCGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 TCCTCAGGCTTCCGCAGCATCCGGGGCTCCCCCAGCCTCCACGCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123594 TCCTCAGGCTTCCGCAGCATCCGGGGCTCCCCCAGCCTCCACGCTGTGCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 GGAGCGTGATGAAGGCCACCTCTTCTACATTGACCCTGCCATCCCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123644 GGAGCGTGATGAAGGCCACCTCTTCTACATTGACCCTGCCATCCCCGAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 AAAACCCATCCCTGAGCTCGCGCACTGAGCTGCTGGCGGCCGACAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123694 AAAACCCATCCCTGAGCTCGCGCACTGAGCTGCTGGCGGCCGACAGCCTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 TCCAAGCACTCACAGGACACGCAGCCCCTGGAGGCGGCCCTGGGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123744 TCCAAGCACTCACAGGACACGCAGCCCCTGGAGGCGGCCCTGGGCAGTGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 CGGCGTCACTCCTGAGCGGCCCCCCAGTGCTGCGGCCAATGACGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123794 CGGCGTCACTCCTGAGCGGCCCCCCAGTGCTGCGGCCAATGACGAGGAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 AAGAGGTTGGCGGTGGGGGTGGCGGGCCGGCCTCCCGCGGGGAGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123844 AAGAGGTTGGCGGTGGGGGTGGCGGGCCGGCCTCCCGCGGGGAGCTGGCG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 CTGCACAATGGGCGCCTGGGGGACTCGCCCAGTCCTCAGGTGCTGGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123894 CTGCACAATGGGCGCCTGGGGGACTCGCCCAGTCCTCAGGTGCTGGAATT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 CGCCGAGTTCATCGACAGCCTCTTCAACCTGGACAGCAAGAGCAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123944 CGCCGAGTTCATCGACAGCCTCTTCAACCTGGACAGCAAGAGCAGCTCCT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 TCCAAGACCTCTACTGCATGGTGGTGCCCGAGAGCCCCACCAGTGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123994 TCCAAGACCTCTACTGCATGGTGGTGCCCGAGAGCCCCACCAGTGACTAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 GCTGAGGGCCCCAAGTCCCCCAGCCAGCAAGAGATCCTGCTCCGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124044 GCTGAGGGCCCCAAGTCCCCCAGCCAGCAAGAGATCCTGCTCCGTGCCCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 GTTCGAGCCCAACCTGGTGCCCAAGCCCCCACGGCTCTTTGCCGGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124094 GTTCGAGCCCAACCTGGTGCCCAAGCCCCCACGGCTCTTTGCCGGCTCAG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2939 CCGACCCCTCCTCGGGCATCTCACTCTCGCCCTCCTTCCCGCTCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124144 CCGACCCCTCCTCGGGCATCTCACTCTCGCCCTCCTTCCCGCTCAGCTCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2989 TCGGGTGAGCTCATGGACCTGACGCCCACGGGCCTCAGTAGCCAGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124194 TCGGGTGAGCTCATGGACCTGACGCCCACGGGCCTCAGTAGCCAGGAATG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3039 CCTGGCGGCTGACAAGATCCGGACTTCTACCCCCACTGGCCACGGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124244 CCTGGCGGCTGACAAGATCCGGACTTCTACCCCCACTGGCCACGGAGCCA

   3250     .    :    .    :    .    :    .
   3089 GCCCCGCCAAGCAAGATGAGCTGGTCATCTCAGCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124294 GCCCCGCCAAGCAAGATGAGCTGGTCATCTCAGCACGC