Result of SIM4 for
pF1KSDA0355
seq1 = pF1KSDA0355.tfa, 3210 bp
seq2 = pF1KSDA0355/gi568815579f_34200474.tfa (gi568815579f:34200474_34452952), 252479 bp
>pF1KSDA0355 3210
>gi568815579f:34200474_34452952 (Chr19)
1-495 (100001-100495) 99% ->
496-705 (119434-119643) 100% ->
706-846 (126948-127088) 100% ->
847-942 (127298-127393) 100% ->
943-1104 (127517-127678) 100% ->
1105-1263 (129716-129874) 100% ->
1264-1361 (133231-133328) 100% ->
1362-1487 (139394-139519) 100% ->
1488-2521 (140949-141982) 100% ->
2522-2687 (147404-147569) 100% ->
2688-2825 (148543-148680) 100% ->
2826-2904 (151041-151119) 100% ->
2905-3210 (152174-152479) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTATTGCTGCAGTGCCCAGGACAGTAAAATGGACTACAAGCGGCGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTATTGCTGCAGTGCCCAGGACAGTAAAATGGACTACAAGCGGCGCTT
50 . : . : . : . : . :
51 CCTGCTTGGCGGGTCCAAGCAGAAGGTGCAGCAGCACCAGCAATACCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CCTGCTTGGCGGGTCCAAGCAGAAGGTGCAGCAGCACCAGCAATACCCGA
100 . : . : . : . : . :
101 TGCCTGAGCTGGGCCGAGCACTGAGTGCTCCCCTGGCATCCACGGCCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TGCCTGAGCTGGGCCGAGCACTGAGTGCTCCCCTGGCATCCACGGCCACC
150 . : . : . : . : . :
151 ACTGCCCCCCTGGGCAGTCTGACCGCTGCAGGCAGCTGCCACCATGCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 ACTGCCCCCCTGGGCAGTCTGACCGCTGCAGGCAGCTGCCACCATGCCAT
200 . : . : . : . : . :
201 GCCCCACACTACTCCTATCGCCGACATCCAGCAGGGCATCTCCAAGTATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GCCCCACACTACTCCTATCGCCGACATCCAGCAGGGCATCTCCAAGTATC
250 . : . : . : . : . :
251 TGGATGCCCTGAACGTCTTCTGCCGTGCCAGTACTTTCCTCACAGATCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 TGGATGCCCTGAACGTCTTCTGCCGTGCCAGTACTTTCCTCACAGATCTC
300 . : . : . : . : . :
301 TTCAGCACTGTGTTCAGGAACTCTCACTACTCAAAGGCAGCCACACAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 TTCAGCACTGTGTTCAGGAACTCTCACTACTCAAAGGCAGCCACACAGCT
350 . : . : . : . : . :
351 CAAAGATGTGCAGGAGCATGTCATGGAAGTAGCCAGTCGGCTGACCTCGG
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
100351 CAAAGATGTGCAGGAGCATGTCATGGAAGCAGCCAGTCGGCTGACCTCGG
400 . : . : . : . : . :
401 CCATAAAGCCTGAGATCGCCAAGATGCTAATGGAACTTAGTGCTGGGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 CCATAAAGCCTGAGATCGCCAAGATGCTAATGGAACTTAGTGCTGGGGCT
450 . : . : . : . : . :
451 GCAAATTTTACGGATCAGAAGGAATTCAGTCTCCAGGACATTGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
100451 GCAAATTTTACGGATCAGAAGGAATTCAGTCTCCAGGACATTGAGGTA..
500 . : . : . : . : . :
496 GTGTTGGGGCGATGTTTCCTGACTGTGGTGCAAGTCCATTTCCAGT
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 .CAGGTGTTGGGGCGATGTTTCCTGACTGTGGTGCAAGTCCATTTCCAGT
550 . : . : . : . : . :
542 TTTTGACTCATGCGTTACAGAAGGTCCAGCCGGTGGCTCACTCTTGCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119480 TTTTGACTCATGCGTTACAGAAGGTCCAGCCGGTGGCTCACTCTTGCTTT
600 . : . : . : . : . :
592 GCTGAGGTCATCGTGCCAGAAAAAAAGAACAGCGGCAGTGGCGGCGGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119530 GCTGAGGTCATCGTGCCAGAAAAAAAGAACAGCGGCAGTGGCGGCGGCTT
650 . : . : . : . : . :
642 ATCTGGCATGGGCCACACACCTGAAGTAGAGGAAGCTGTGCGGTCCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119580 ATCTGGCATGGGCCACACACCTGAAGTAGAGGAAGCTGTGCGGTCCTGGC
700 . : . : . : . : . :
692 GGGGGGCTGCTGAG GCGACATCTAGACTAAGAGAAAGAGGC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
119630 GGGGGGCTGCTGAGGTA...CAGGCGACATCTAGACTAAGAGAAAGAGGC
750 . : . : . : . : . :
733 TGTGATGGTTGCCTGGCAGGAATTGAAGTTCAACAACTCTTTTGTTCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126975 TGTGATGGTTGCCTGGCAGGAATTGAAGTTCAACAACTCTTTTGTTCTCA
800 . : . : . : . : . :
783 AAGTGCAGCAATTCCTGAGCACCAGCTAAAAGAACTGAACATAAAAATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127025 AAGTGCAGCAATTCCTGAGCACCAGCTAAAAGAACTGAACATAAAAATCG
850 . : . : . : . : . :
833 ACAGTGCTTTGCAA GCATATAAGATAGCTCTGGAAAGCTTA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
127075 ACAGTGCTTTGCAAGTA...CAGGCATATAAGATAGCTCTGGAAAGCTTA
900 . : . : . : . : . :
874 GGACACTGTGAATATGCAATGAAAGCCGGCTTCCACCTGAATCCAAAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127325 GGACACTGTGAATATGCAATGAAAGCCGGCTTCCACCTGAATCCAAAGGC
950 . : . : . : . : . :
924 GATTGAAGCAAGTTTGCAG GGCTGCTGCAGCGAGGCGGAAG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
127375 GATTGAAGCAAGTTTGCAGGTA...CAGGGCTGCTGCAGCGAGGCGGAAG
1000 . : . : . : . : . :
965 CCCAGCAGACGGGGCGGAGGCAGACACCCCCGCAGCCCATGCAGTGTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127539 CCCAGCAGACGGGGCGGAGGCAGACACCCCCGCAGCCCATGCAGTGTGAG
1050 . : . : . : . : . :
1015 CTCCCCACCGTCCCTGTGCAGATAGGATCGCACTTCCTGAAGGGCGTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127589 CTCCCCACCGTCCCTGTGCAGATAGGATCGCACTTCCTGAAGGGCGTCTC
1100 . : . : . : . : . :
1065 CTTTAATGAGTCGGCCGCCGACAATCTGAAACTTAAGACG C
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
127639 CTTTAATGAGTCGGCCGCCGACAATCTGAAACTTAAGACGGTA...TAGC
1150 . : . : . : . : . :
1106 ATACAATGTTACAGCTGATGAAGGAGGCAGGCTGCTATAATGGAATCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129717 ATACAATGTTACAGCTGATGAAGGAGGCAGGCTGCTATAATGGAATCACA
1200 . : . : . : . : . :
1156 TCCAGGGATGATTTTCCTGTGACTGAAGTGCTGAACCAGGTTTGCCCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129767 TCCAGGGATGATTTTCCTGTGACTGAAGTGCTGAACCAGGTTTGCCCTTC
1250 . : . : . : . : . :
1206 CACATGGCGAGGTGCCTGCAAGACGGCGGTGCAGCTGCTGTTTGGCCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129817 CACATGGCGAGGTGCCTGCAAGACGGCGGTGCAGCTGCTGTTTGGCCAGG
1300 . : . : . : . : . :
1256 CTGGACTG GTGGTGGTTGACACAGCACAGATTGAGAATAAA
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
129867 CTGGACTGGTG...TAGGTGGTGGTTGACACAGCACAGATTGAGAATAAA
1350 . : . : . : . : . :
1297 GAAGCCTATGCCCCCCAGATCAGTTTAGAAGGCTCTAGAATCGTGGTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133264 GAAGCCTATGCCCCCCAGATCAGTTTAGAAGGCTCTAGAATCGTGGTTCA
1400 . : . : . : . : . :
1347 AGTCCCATCCACATG GTGCCTGAAAGAAGACCCTGCTACCA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
133314 AGTCCCATCCACATGGTA...TAGGTGCCTGAAAGAAGACCCTGCTACCA
1450 . : . : . : . : . :
1388 TGTCCCTGCTGCAGAGAAGCCTTGATCCTGAGAAGACCCTGGGTCTAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139420 TGTCCCTGCTGCAGAGAAGCCTTGATCCTGAGAAGACCCTGGGTCTAGTG
1500 . : . : . : . : . :
1438 GACGTGCTCTACACAGCTGTGCTGGACCTAAACCGCTGGAGGGCTGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139470 GACGTGCTCTACACAGCTGTGCTGGACCTAAACCGCTGGAGGGCTGGAAG
1550 . : . : . : . : . :
1488 GGAGCAAGCTTTACCCTGCATACAGATCCAGCTGCAAAGGG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139520 GTT...TAGGGAGCAAGCTTTACCCTGCATACAGATCCAGCTGCAAAGGG
1600 . : . : . : . : . :
1529 AGATCTGTGATTTTGGCAACCAGGCTGACCTGCCTTCTGGAAATGGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140990 AGATCTGTGATTTTGGCAACCAGGCTGACCTGCCTTCTGGAAATGGAAAC
1650 . : . : . : . : . :
1579 AAATCTTCAGGTGGCCTGCAGAAGACATTCTCCAAACTGACATCCCGGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141040 AAATCTTCAGGTGGCCTGCAGAAGACATTCTCCAAACTGACATCCCGGTT
1700 . : . : . : . : . :
1629 CACCAAGAAAGCTTCATGTACCAGCTCCAGCAGCAGCACAAATTATTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141090 CACCAAGAAAGCTTCATGTACCAGCTCCAGCAGCAGCACAAATTATTCCA
1750 . : . : . : . : . :
1679 TCCAAAATACCCCTTCCAAAAACATCTTCATAGCTGGATGTTCCGAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141140 TCCAAAATACCCCTTCCAAAAACATCTTCATAGCTGGATGTTCCGAAGAG
1800 . : . : . : . : . :
1729 AAGGCCAAAATGCCTGGCAATATTGATACAAGGTTACAAAGCATTTTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141190 AAGGCCAAAATGCCTGGCAATATTGATACAAGGTTACAAAGCATTTTGAA
1850 . : . : . : . : . :
1779 CATTGGTAATTTCCCCAGGACTACAGACCCTTCACAGTCAGCTCAGAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141240 CATTGGTAATTTCCCCAGGACTACAGACCCTTCACAGTCAGCTCAGAATT
1900 . : . : . : . : . :
1829 CCAGTAATACAGTGGCCAATGGCTTTCTCATGGAGAGGCGTGAGAACTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141290 CCAGTAATACAGTGGCCAATGGCTTTCTCATGGAGAGGCGTGAGAACTTC
1950 . : . : . : . : . :
1879 CTGCATGGAGATGACGGCAAGGATGAGAAGGGTATGAACTTACCAACTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141340 CTGCATGGAGATGACGGCAAGGATGAGAAGGGTATGAACTTACCAACTGA
2000 . : . : . : . : . :
1929 TCAGGAAATGCAAGAGGTGATAGATTTTCTCTCGGGCTTTAACATGGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141390 TCAGGAAATGCAAGAGGTGATAGATTTTCTCTCGGGCTTTAACATGGGCC
2050 . : . : . : . : . :
1979 AGTCACATCAGGGCTCTCCGTTGGTGACAAGGCATAATTCTGCTGCCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141440 AGTCACATCAGGGCTCTCCGTTGGTGACAAGGCATAATTCTGCTGCCACA
2100 . : . : . : . : . :
2029 GCCATGGTGACTGAGCAGAAGGCAGGAGCCATGCAACCACAGCAGCCGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141490 GCCATGGTGACTGAGCAGAAGGCAGGAGCCATGCAACCACAGCAGCCGTC
2150 . : . : . : . : . :
2079 ACTGCCTGTGCCCCCTCCACCACGGGCACCCCAGGCTGGGGCACACACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141540 ACTGCCTGTGCCCCCTCCACCACGGGCACCCCAGGCTGGGGCACACACAC
2200 . : . : . : . : . :
2129 CTCTGACACCCCAGCCGGGACTGGCACCTCAGCAGCAGTCCCCAAAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141590 CTCTGACACCCCAGCCGGGACTGGCACCTCAGCAGCAGTCCCCAAAGCAG
2250 . : . : . : . : . :
2179 CAACAACCTCAAGTCCAATACTACCAACACCTACTCCAGCCCATTGGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141640 CAACAACCTCAAGTCCAATACTACCAACACCTACTCCAGCCCATTGGACC
2300 . : . : . : . : . :
2229 GCAGCAGCCCCCGCCCCAGCCTCGGGCACCTGGGAAATGGGTACATGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141690 GCAGCAGCCCCCGCCCCAGCCTCGGGCACCTGGGAAATGGGTACATGGCT
2350 . : . : . : . : . :
2279 CATCCCAGCAGCCAGCGCAGGCTGTTGGAGCAGGTCTGTCTCCTCTTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141740 CATCCCAGCAGCCAGCGCAGGCTGTTGGAGCAGGTCTGTCTCCTCTTGGT
2400 . : . : . : . : . :
2329 CAGTGGCCTGGCATATCTGATCTCAGTTCTGACTTGTACAGCTTGGGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141790 CAGTGGCCTGGCATATCTGATCTCAGTTCTGACTTGTACAGCTTGGGTCT
2450 . : . : . : . : . :
2379 GGTGAGCAGCTATATGGATAATGTGATGTCAGAGGTTCTGGGACAGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141840 GGTGAGCAGCTATATGGATAATGTGATGTCAGAGGTTCTGGGACAGAAGC
2500 . : . : . : . : . :
2429 CGCAGGGACCTAGAAATAACACCTGGCCCAACCGTGACCAAAGTGATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141890 CGCAGGGACCTAGAAATAACACCTGGCCCAACCGTGACCAAAGTGATGGA
2550 . : . : . : . : . :
2479 GTCTTTGGAATGCTGGGAGAGATTCTGCCTTTTGATCCTGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
141940 GTCTTTGGAATGCTGGGAGAGATTCTGCCTTTTGATCCTGCAGGTA...C
2600 . : . : . : . : . :
2522 TGGGCTCAGACCCAGAGTTTGCACGCTATGTGGCAGGAGTGAGCCAGG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147402 AGTGGGCTCAGACCCAGAGTTTGCACGCTATGTGGCAGGAGTGAGCCAGG
2650 . : . : . : . : . :
2570 CGATGCAGCAGAAGCGGCAGGCCCAGCACGGTCGCCGGCCAGGCAACCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147452 CGATGCAGCAGAAGCGGCAGGCCCAGCACGGTCGCCGGCCAGGCAACCCC
2700 . : . : . : . : . :
2620 CGGGGCAACTGGCCGCCTATGGATGACGCGCATCGGACCTGGCCCTTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147502 CGGGGCAACTGGCCGCCTATGGATGACGCGCATCGGACCTGGCCCTTCCC
2750 . : . : . : . : . :
2670 CGAGTTCTTCACAGAAGG GGATGGCCTGCACGGTGGCTGGT
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
147552 CGAGTTCTTCACAGAAGGGTG...CAGGGATGGCCTGCACGGTGGCTGGT
2800 . : . : . : . : . :
2711 CGGGTGCTCAGGGAGACTCTGCCAGCTCGAGTGATGAGACATCCTCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148566 CGGGTGCTCAGGGAGACTCTGCCAGCTCGAGTGATGAGACATCCTCAGCC
2850 . : . : . : . : . :
2761 AACGGGGACAGCTTGTTCTCCATGTTTTCAGGGCCTGACCTCGTTGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148616 AACGGGGACAGCTTGTTCTCCATGTTTTCAGGGCCTGACCTCGTTGCTGC
2900 . : . : . : . : . :
2811 TGTCAAGCAGAGAAG GAAACACAGCAGTGGAGAGCAAGACA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
148666 TGTCAAGCAGAGAAGGTA...CAGGAAACACAGCAGTGGAGAGCAAGACA
2950 . : . : . : . : . :
2852 CCAGCACGCTGCCCTCACCACCTCTCCTCACCACGGTGGAGGATGTGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151067 CCAGCACGCTGCCCTCACCACCTCTCCTCACCACGGTGGAGGATGTGAAC
3000 . : . : . : . : . :
2902 CAG GATAACAAAACCAAAACGTGGCCACCCAAAGCACCCTG
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151117 CAGGTA...CAGGATAACAAAACCAAAACGTGGCCACCCAAAGCACCCTG
3050 . : . : . : . : . :
2943 GCAGCACCCTTCCCCGCTTCCCAGCACGCTGCCCAGCCCCAGCGCACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152212 GCAGCACCCTTCCCCGCTTCCCAGCACGCTGCCCAGCCCCAGCGCACCAC
3100 . : . : . : . : . :
2993 TCTATGCAGTCACCAGCCCTGGCAGCCAGTGGAACGACACCATGCAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152262 TCTATGCAGTCACCAGCCCTGGCAGCCAGTGGAACGACACCATGCAGATG
3150 . : . : . : . : . :
3043 CTGCAGTCCCCAGTGTGGGCCGCAACCAACGACTGCAGTGCCGCTGCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152312 CTGCAGTCCCCAGTGTGGGCCGCAACCAACGACTGCAGTGCCGCTGCCTT
3200 . : . : . : . : . :
3093 CTCCTATGTGCAGACCCCACCCCAGCCCCCACCCCCACCAGCACACAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152362 CTCCTATGTGCAGACCCCACCCCAGCCCCCACCCCCACCAGCACACAAGG
3250 . : . : . : . : . :
3143 CAGCACCCAAGGGCTTCAAGGCCTTCCCTGGGAAGGGTGAGCGCAGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152412 CAGCACCCAAGGGCTTCAAGGCCTTCCCTGGGAAGGGTGAGCGCAGGCCA
3300 . : .
3193 GCCTATCTGCCCCAGTAC
||||||||||||||||||
152462 GCCTATCTGCCCCAGTAC