Result of SIM4 for
pF1KSDA0332
seq1 = pF1KSDA0332.tfa, 3087 bp
seq2 = pF1KSDA0332/gi568815595f_142901629.tfa (gi568815595f:142901629_143156447), 254819 bp
>pF1KSDA0332 3087
>gi568815595f:142901629_143156447 (Chr3)
1-45 (100001-100045) 97% ->
46-90 (109187-109231) 100% ->
91-222 (110594-110725) 100% ->
223-321 (112683-112781) 100% ->
322-436 (114629-114743) 100% ->
437-570 (115214-115347) 100% ->
571-638 (118341-118408) 100% ->
639-733 (118971-119065) 100% ->
734-769 (119722-119757) 100% ->
770-852 (119845-119927) 100% ->
853-1018 (120869-121034) 100% ->
1019-1230 (121225-121436) 100% ->
1231-1274 (122347-122390) 100% ->
1275-1379 (125521-125625) 100% ->
1380-1450 (126712-126782) 97% ->
1451-1610 (126859-127018) 100% ->
1611-1773 (131156-131318) 100% ->
1774-1853 (131643-131722) 100% ->
1854-1941 (133260-133347) 100% ->
1942-2064 (134354-134476) 100% ->
2065-2221 (135551-135707) 100% ->
2222-2317 (136480-136575) 100% ->
2318-2384 (137266-137332) 100% ->
2385-2544 (141489-141648) 100% ->
2545-2655 (149311-149421) 100% ->
2656-2774 (152048-152166) 100% ->
2775-2951 (153315-153491) 100% ->
2952-3087 (154684-154819) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGGATAAAACGCCAGGCGGATCTCAGAAGGCCAGTTCAAAG
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
100001 ATGGCGGACAAAACGCCAGGCGGATCTCAGAAGGCCAGTTCAAAGGTA..
50 . : . : . : . : . :
46 ACGAGATCATCAGATGTTCATTCATCTGGATCTTCAGATGCACAT
.>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
100051 .TAGACGAGATCATCAGATGTTCATTCATCTGGATCTTCAGATGCACATG
100 . : . : . : . : . :
91 ATGGATGCATCTGGACCCTCAGATAGTGATATGCCAAGTCGG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109233 TG...AAGATGGATGCATCTGGACCCTCAGATAGTGATATGCCAAGTCGG
150 . : . : . : . : . :
133 ACACGACCTAAGAGCCCAAGAAAACATAATTATAGGAATGAAAGTGCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110636 ACACGACCTAAGAGCCCAAGAAAACATAATTATAGGAATGAAAGTGCCCG
200 . : . : . : . : . :
183 TGAAAGCCTTTGTGATTCTCCTCATCAGAATCTCTCAAGA C
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
110686 TGAAAGCCTTTGTGATTCTCCTCATCAGAATCTCTCAAGAGTG...TAGC
250 . : . : . : . : . :
224 CTCTTCTGGAAAACAAACTTAAAGCATTCAGTATTGGAAAAATGAGTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112684 CTCTTCTGGAAAACAAACTTAAAGCATTCAGTATTGGAAAAATGAGTACA
300 . : . : . : . : . :
274 GCTAAGCGAACTTTAAGTAAAAAGGAACAGGAAGAATTAAAGAAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
112734 GCTAAGCGAACTTTAAGTAAAAAGGAACAGGAAGAATTAAAGAAAAAGGT
350 . : . : . : . : . :
322 GAGGATGAAAAGGCAGCTGCTGAGATTTATGAGGAGTTTCTTG
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112784 A...TAGGAGGATGAAAAGGCAGCTGCTGAGATTTATGAGGAGTTTCTTG
400 . : . : . : . : . :
365 CTGCTTTTGAAGGAAGTGATGGTAATAAAGTGAAAACATTTGTGCGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114672 CTGCTTTTGAAGGAAGTGATGGTAATAAAGTGAAAACATTTGTGCGAGGG
450 . : . : . : . : . :
415 GGTGTTGTTAATGCAGCTAAAG AAGAACATGAAACAGATGA
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
114722 GGTGTTGTTAATGCAGCTAAAGGTA...CAGAAGAACATGAAACAGATGA
500 . : . : . : . : . :
456 AAAAAGAGGTAAAATCTATAAGCCATCTTCAAGATTTGCAGATCAAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115233 AAAAAGAGGTAAAATCTATAAGCCATCTTCAAGATTTGCAGATCAAAAAA
550 . : . : . : . : . :
506 ATCCTCCAAATCAGTCTTCCAATGAAAGACCACCATCTCTTCTTGTGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115283 ATCCTCCAAATCAGTCTTCCAATGAAAGACCACCATCTCTTCTTGTGATA
600 . : . : . : . : . :
556 GAAACCAAAAAACCT CCACTTAAAAAAGGAGAGAAAGAAAA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
115333 GAAACCAAAAAACCTGTA...TAGCCACTTAAAAAAGGAGAGAAAGAAAA
650 . : . : . : . : . :
597 GAAAAAAAGCAATTTGGAACTCTTCAAAGAAGAATTAAAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
118367 GAAAAAAAGCAATTTGGAACTCTTCAAAGAAGAATTAAAGCAGTA...CA
700 . : . : . : . : . :
639 AATTCAAGAGGAACGTGATGAGAGACATAAAACAAAAGGCAGATTAAGT
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118970 GAATTCAAGAGGAACGTGATGAGAGACATAAAACAAAAGGCAGATTAAGT
750 . : . : . : . : . :
688 CGATTTGAACCTCCTCAGTCAGATTCTGATGGTCAGCGTCGTTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
119020 CGATTTGAACCTCCTCAGTCAGATTCTGATGGTCAGCGTCGTTCTAGTA.
800 . : . : . : . : . :
734 TGGACGCGCCTTCAAGAAGAAATAGATCATCTGGTG
..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
119070 ..AAGTGGACGCGCCTTCAAGAAGAAATAGATCATCTGGTGGTA...TAG
850 . : . : . : . : . :
770 TTCTTGATGATTACGCACCTGGCTCACATGATGTAGGAGATCCAAGCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119845 TTCTTGATGATTACGCACCTGGCTCACATGATGTAGGAGATCCAAGCACT
900 . : . : . : . : . :
820 ACTAATTTATACCTTGGAAACATTAATCCACAG ATGAATGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
119895 ACTAATTTATACCTTGGAAACATTAATCCACAGGTA...TAGATGAATGA
950 . : . : . : . : . :
861 AGAAATGCTGTGCCAAGAATTTGGAAGATTTGGACCGTTAGCCAGTGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120877 AGAAATGCTGTGCCAAGAATTTGGAAGATTTGGACCGTTAGCCAGTGTGA
1000 . : . : . : . : . :
911 AAATCATGTGGCCTAGAACTGATGAAGAAAGAGCCAGAGAGAGAAATTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120927 AAATCATGTGGCCTAGAACTGATGAAGAAAGAGCCAGAGAGAGAAATTGC
1050 . : . : . : . : . :
961 GGCTTTGTGGCCTTTATGAATAGAAGAGATGCTGAAAGAGCTTTAAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120977 GGCTTTGTGGCCTTTATGAATAGAAGAGATGCTGAAAGAGCTTTAAAAAA
1100 . : . : . : . : . :
1011 TTTGAATG GAAAAATGATTATGTCTTTTGAAATGAAGTTAG
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
121027 TTTGAATGGTA...TAGGAAAAATGATTATGTCTTTTGAAATGAAGTTAG
1150 . : . : . : . : . :
1052 GTTGGGGTAAAGCTGTACCTATTCCTCCACATCCAATATACATTCCGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121258 GTTGGGGTAAAGCTGTACCTATTCCTCCACATCCAATATACATTCCGCCT
1200 . : . : . : . : . :
1102 TCTATGATGGAACATACGCTTCCCCCACCTCCATCCGGACTGCCTTTTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121308 TCTATGATGGAACATACGCTTCCCCCACCTCCATCCGGACTGCCTTTTAA
1250 . : . : . : . : . :
1152 TGCGCAGCCTAGAGAGCGGTTAAAAAACCCTAATGCTCCTATGTTACCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121358 TGCGCAGCCTAGAGAGCGGTTAAAAAACCCTAATGCTCCTATGTTACCGC
1300 . : . : . : . : . :
1202 CACCTAAAAACAAAGAGGATTTTGAGAAG ACTCTGTCGCAA
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
121408 CACCTAAAAACAAAGAGGATTTTGAGAAGGTA...CAGACTCTGTCGCAA
1350 . : . : . : . : . :
1243 GCCATAGTCAAAGTGGTTATCCCAACAGAAAG GAATTTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
122359 GCCATAGTCAAAGTGGTTATCCCAACAGAAAGGTA...TAGGAATTTGCT
1400 . : . : . : . : . :
1284 CGCCCTGATACATCGAATGATAGAGTTTGTTGTACGTGAAGGGCCAATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125530 CGCCCTGATACATCGAATGATAGAGTTTGTTGTACGTGAAGGGCCAATGT
1450 . : . : . : . : . :
1334 TTGAAGCTATGATTATGAACAGAGAAATCAACAATCCTATGTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
125580 TTGAAGCTATGATTATGAACAGAGAAATCAACAATCCTATGTTCAGGTG.
1500 . : . : . : . : . :
1380 GTTCTTATTTGAAAACCAGACACCAGCCCATGTTTACTATAGGTG
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125630 ..TAGGTTCTTATTTGAAAACCAGACACCAGCCCATGTTTACTATAGGTG
1550 . : . : . : . : . :
1425 GAAGCTTTATTCTATTCTGCAGGGAG ATTCTCCAACTAAAT
||||||||||||||||||||||| | >>>...>>>|||||||||||||||
126757 GAAGCTTTATTCTATTCTGCAGGCAAGTA...GAGATTCTCCAACTAAAT
1600 . : . : . : . : . :
1466 GGCGGACGGAAGATTTTCGTATGTTCAAAAATGGATCTTTTTGGAGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126874 GGCGGACGGAAGATTTTCGTATGTTCAAAAATGGATCTTTTTGGAGGCCA
1650 . : . : . : . : . :
1516 CCACCATTAAATCCGTACTTGCATGGAATGTCAGAAGAGCAAGAAACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126924 CCACCATTAAATCCGTACTTGCATGGAATGTCAGAAGAGCAAGAAACAGA
1700 . : . : . : . : . :
1566 AGCTTTTGTAGAGGAACCTAGTAAAAAGGGAGCACTTAAGGAAGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
126974 AGCTTTTGTAGAGGAACCTAGTAAAAAGGGAGCACTTAAGGAAGAGTA..
1750 . : . : . : . : . :
1611 ACAGAGGGATAAATTGGAAGAAATCTTGCGGGGATTAACTCCAAGG
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127024 .CAGACAGAGGGATAAATTGGAAGAAATCTTGCGGGGATTAACTCCAAGG
1800 . : . : . : . : . :
1657 AAAAATGATATTGGAGATGCAATGGTTTTCTGTCTTAATAATGCTGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131202 AAAAATGATATTGGAGATGCAATGGTTTTCTGTCTTAATAATGCTGAAGC
1850 . : . : . : . : . :
1707 TGCTGAAGAAATAGTGGATTGCATTACTGAGTCGTTGTCCATCTTAAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131252 TGCTGAAGAAATAGTGGATTGCATTACTGAGTCGTTGTCCATCTTAAAGA
1900 . : . : . : . : . :
1757 CACCCCTTCCTAAAAAG ATTGCCAGATTATATTTGGTTTCT
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
131302 CACCCCTTCCTAAAAAGGTA...TAGATTGCCAGATTATATTTGGTTTCT
1950 . : . : . : . : . :
1798 GATGTTTTGTACAACTCTTCAGCCAAAGTTGCTAATGCTTCATATTATAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131667 GATGTTTTGTACAACTCTTCAGCCAAAGTTGCTAATGCTTCATATTATAG
2000 . : . : . : . : . :
1848 AAAATT TTTTGAAACAAAGTTATGTCAGATATTTTCAGACC
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
131717 AAAATTGTA...CAGTTTTGAAACAAAGTTATGTCAGATATTTTCAGACC
2050 . : . : . : . : . :
1889 TCAATGCCACCTATCGTACAATTCAAGGCCATTTACAATCTGAAAACTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133295 TCAATGCCACCTATCGTACAATTCAAGGCCATTTACAATCTGAAAACTTT
2100 . : . : . : . : . :
1939 AAG CAACGGGTAATGACTTGCTTCAGAGCATGGGAAGATTG
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133345 AAGGTA...TAGCAACGGGTAATGACTTGCTTCAGAGCATGGGAAGATTG
2150 . : . : . : . : . :
1980 GGCAATTTATCCAGAACCATTTTTGATCAAACTACAAAATATTTTCTTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134392 GGCAATTTATCCAGAACCATTTTTGATCAAACTACAAAATATTTTCTTAG
2200 . : . : . : . : . :
2030 GACTTGTAAATATTATTGAAGAAAAGGAAACAGAG GATGTT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
134442 GACTTGTAAATATTATTGAAGAAAAGGAAACAGAGGTA...TAGGATGTT
2250 . : . : . : . : . :
2071 CCAGATGACCTTGATGGTGCCCCCATCGAGGAAGAGCTTGATGGTGCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135557 CCAGATGACCTTGATGGTGCCCCCATCGAGGAAGAGCTTGATGGTGCACC
2300 . : . : . : . : . :
2121 TCTGGAAGATGTAGATGGAATTCCTATTGATGCTACTCCCATCGATGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135607 TCTGGAAGATGTAGATGGAATTCCTATTGATGCTACTCCCATCGATGATC
2350 . : . : . : . : . :
2171 TTGATGGAGTCCCTATAAAAAGTCTTGATGATGATCTTGATGGAGTGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135657 TTGATGGAGTCCCTATAAAAAGTCTTGATGATGATCTTGATGGAGTGCCT
2400 . : . : . : . : . :
2221 T TGGATGCAACTGAAGACTCAAAAAAGAATGAGCCTATATT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135707 TGTA...TAGTGGATGCAACTGAAGACTCAAAAAAGAATGAGCCTATATT
2450 . : . : . : . : . :
2262 TAAAGTTGCCCCATCAAAATGGGAAGCTGTGGATGAATCTGAATTGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136520 TAAAGTTGCCCCATCAAAATGGGAAGCTGTGGATGAATCTGAATTGGAAG
2500 . : . : . : . : . :
2312 CACAGG CTGTTACAACTTCTAAATGGGAATTATTTGACCAG
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
136570 CACAGGGTG...CAGCTGTTACAACTTCTAAATGGGAATTATTTGACCAG
2550 . : . : . : . : . :
2353 CATGAAGAATCAGAAGAAGAAGAAAATCAAAA TCAAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
137301 CATGAAGAATCAGAAGAAGAAGAAAATCAAAAGTA...AAGTCAAGAAGA
2600 . : . : . : . : . :
2394 AGAAAGTGAAGATGAAGAAGATACTCAAAGTTCCAAATCTGAAGAACATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141498 AGAAAGTGAAGATGAAGAAGATACTCAAAGTTCCAAATCTGAAGAACATC
2650 . : . : . : . : . :
2444 ATTTGTACTCTAATCCAATCAAAGAAGAAATGACTGAGTCTAAGTTCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141548 ATTTGTACTCTAATCCAATCAAAGAAGAAATGACTGAGTCTAAGTTCTCT
2700 . : . : . : . : . :
2494 AAGTACTCTGAAATGAGTGAGGAAAAACGAGCCAAACTTCGTGAAATTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141598 AAGTACTCTGAAATGAGTGAGGAAAAACGAGCCAAACTTCGTGAAATTGA
2750 . : . : . : . : . :
2544 G CTCAAAGTTATGAAGTTTCAGGATGAATTGGAATCTGGGA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141648 GGTT...CAGCTCAAAGTTATGAAGTTTCAGGATGAATTGGAATCTGGGA
2800 . : . : . : . : . :
2585 AAAGACCTAAAAAACCAGGCCAGAGTTTTCAGGAGCAAGTAGAACACTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149351 AAAGACCTAAAAAACCAGGCCAGAGTTTTCAGGAGCAAGTAGAACACTAC
2850 . : . : . : . : . :
2635 AGAGATAAACTTCTTCAACGA GAGAAAGAGAAAGAGTTAGA
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
149401 AGAGATAAACTTCTTCAACGAGTA...CAGGAGAAAGAGAAAGAGTTAGA
2900 . : . : . : . : . :
2676 AAGAGAACGAGAAAGAGACAAGAAAGATAAAGAAAAATTGGAATCTCGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152068 AAGAGAACGAGAAAGAGACAAGAAAGATAAAGAAAAATTGGAATCTCGCT
2950 . : . : . : . : . :
2726 CCAAAGACAAGAAGGAAAAAGATGAGTGTACTCCGACAAGGAAGGAAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
152118 CCAAAGACAAGAAGGAAAAAGATGAGTGTACTCCGACAAGGAAGGAAAGG
3000 . : . : . : . : . :
2775 GAAGAGGCGACACAGTACATCCCCCAGCCCATCTCGCAGTAG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152168 TA...TAGGAAGAGGCGACACAGTACATCCCCCAGCCCATCTCGCAGTAG
3050 . : . : . : . : . :
2817 CAGTGGTAGACGAGTGAAATCCCCATCACCAAAATCGGAGCGATCAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153357 CAGTGGTAGACGAGTGAAATCCCCATCACCAAAATCGGAGCGATCAGAGC
3100 . : . : . : . : . :
2867 GTTCAGAAAGATCTCATAAAGAGAGCTCACGGTCCAGGTCATCTCACAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153407 GTTCAGAAAGATCTCATAAAGAGAGCTCACGGTCCAGGTCATCTCACAAA
3150 . : . : . : . : . :
2917 GATTCTCCTAGAGATGTTAGCAAAAAAGCCAAAAG ATCACC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
153457 GATTCTCCTAGAGATGTTAGCAAAAAAGCCAAAAGGTA...TAGATCACC
3200 . : . : . : . : . :
2958 ATCTGGTTCAAGGACACCTAAAAGGTCTAGGCGATCACGGTCTAGATCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154690 ATCTGGTTCAAGGACACCTAAAAGGTCTAGGCGATCACGGTCTAGATCTC
3250 . : . : . : . : . :
3008 CTAAAAAATCAGGAAAGAAGTCCAGATCCCAGTCCAGATCTCCACACAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154740 CTAAAAAATCAGGAAAGAAGTCCAGATCCCAGTCCAGATCTCCACACAGG
3300 . : . : . :
3058 TCTCATAAAAAGTCAAAGAAAAACAAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||
154790 TCTCATAAAAAGTCAAAGAAAAACAAACAC